王政 丁小云
(1浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院 浙江 杭州 310000)
(2寧波市第一醫(yī)院 浙江 寧波 315000)
據(jù)《全球癌癥報(bào)告2018》顯示,胃癌是全球第三大最常見(jiàn)的癌癥死亡原因[1],其病死率與癌癥診斷及治療的早晚密切相關(guān)[2]。早期胃癌患者術(shù)后5年生存率高達(dá)90%~95%,相比之下,進(jìn)展期胃癌患者即便接受了根治性手術(shù),其5年生存率只有16%[3]。
環(huán)狀最早于1976年由Sanger[4]等人在高等植物的類病毒RNA中發(fā)現(xiàn)并命名,因其缺乏3’帽子結(jié)構(gòu)和5’多聚腺苷酸尾而形成的特有的閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)區(qū)別于長(zhǎng)鏈非編碼RNA和微小RNA[5]。近來(lái),得益于RNA測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)分析技術(shù)的發(fā)展,環(huán)狀RNA被證實(shí)廣泛存在于真核細(xì)胞中[6]。DNA的序列轉(zhuǎn)錄可剪切出多種環(huán)狀RNA,剪切出的環(huán)狀RNA在轉(zhuǎn)錄本中占有較大比重[7]。現(xiàn)已證實(shí),環(huán)狀RNA具有多種生物學(xué)功能,可調(diào)控基因表達(dá)[8],具有潛在的診斷癌癥及輔助治療價(jià)值[9]。因此,本綜述將從環(huán)狀RNA的來(lái)源、分類、功能及在胃癌中的作用加以研討。
老三的話說(shuō)得孔老一沒(méi)了主意,剛經(jīng)過(guò)一場(chǎng)惡戰(zhàn),五連死傷剩下不到三、四十號(hào)人,自己因?yàn)橛芯褤魧iL(zhǎng),加上又是師部下來(lái)的,底柱把自己當(dāng)了寶貝,沒(méi)讓自己露過(guò)一回頭,從感情上,自己欠著底柱和五連的情份自己欠著底柱和五連的情分,特別是這當(dāng)兒,鬼子說(shuō)什么時(shí)候打過(guò)來(lái)就什么時(shí)候打過(guò)來(lái),如果這個(gè)時(shí)候提出回去奔喪,別說(shuō)底柱作不了主,怕是自己也說(shuō)服不了自己。
起初,環(huán)狀RNA被認(rèn)為是低豐度的基因拼接錯(cuò)誤的副產(chǎn)物[10,11]。隨著實(shí)驗(yàn)技術(shù)的逐步成熟,環(huán)狀RNA被證實(shí)是具有高度組織特異性、高豐度及穩(wěn)定性的基因形式,按來(lái)源可分為外顯子來(lái)源的環(huán)狀RNA;內(nèi)含子來(lái)源的環(huán)狀;外顯子-內(nèi)含子來(lái)源的環(huán)狀RNA;轉(zhuǎn)運(yùn)RNA來(lái)源的環(huán)狀RNA。
外顯子環(huán)狀RNA主要分布于細(xì)胞質(zhì)中,可以分為兩種形式:套索驅(qū)動(dòng)環(huán)化和內(nèi)含子配對(duì)環(huán)化。套索驅(qū)動(dòng)環(huán)化是下游3’跳躍到上游5’端以“跳讀”方式連接,其中部分內(nèi)含子與外顯子3’,5’端連接成套索結(jié)構(gòu),隨之被剪切,形成反向剪接的包含3’-5’磷酸二酯鍵的外顯子環(huán)狀RNA。內(nèi)含子配對(duì)環(huán)化是由外顯子側(cè)翼的內(nèi)含子區(qū)短散在元件發(fā)生互補(bǔ)配對(duì),促使外顯子環(huán)化,環(huán)中內(nèi)含子被剪切而形成外顯子環(huán)狀RNA。
環(huán)狀RNA具有miRNA(microRNA,微小RNA)海綿作用、調(diào)控親本基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄本剪接、參與蛋白質(zhì)翻譯等作用。
EIci-RNA主要分布于細(xì)胞核。研究發(fā)現(xiàn)環(huán)化外顯子中,內(nèi)含子穩(wěn)定存留下來(lái),形成了外顯子-內(nèi)含子來(lái)源的環(huán)狀RNA。
隨著跨境電商政策紅利不斷被釋放,義烏逐步形成出口跨境電商產(chǎn)業(yè)集聚的生態(tài),提升全球價(jià)值鏈地位,但增速有所放緩,回落原因有多方面,缺乏領(lǐng)軍企業(yè)是重要因素之一。從企業(yè)實(shí)力來(lái)看,義烏跨境電商企業(yè)小而散的狀態(tài)突出,國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)力和品牌影響力難以提升,缺乏如賽維電商、有棵樹(shù)、通拓這樣的領(lǐng)軍型跨境電商企業(yè)對(duì)產(chǎn)業(yè)內(nèi)外部資源進(jìn)行有效整合,致使在開(kāi)拓新興市場(chǎng)、創(chuàng)新模式、規(guī)范發(fā)展等方面能力薄弱。從調(diào)查數(shù)據(jù)來(lái)看,80%以上的跨境電商團(tuán)隊(duì)表示人員不足,對(duì)資深運(yùn)營(yíng)人員、項(xiàng)目策劃人員、知識(shí)產(chǎn)權(quán)管理人員的渴望尤為迫切,人才緊缺、人才結(jié)構(gòu)與產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)吻合度不夠緊密限制了義烏中小跨境電商企業(yè)成長(zhǎng)。
內(nèi)含子環(huán)狀RNA主要分布于細(xì)胞核中,其形成依賴于兩側(cè)特異反向互補(bǔ)序列。5’端存有一段7nt富含GU堿基的序列,分支點(diǎn)存在富含C堿基的序列,二者互補(bǔ)配對(duì)形成反向剪接結(jié)構(gòu),多余的外顯子及內(nèi)含子被剪接體去除,而形成包含2’-5’磷酸二酯鍵的內(nèi)含子RNA[6]。
環(huán)狀RNA可通過(guò)與轉(zhuǎn)錄復(fù)合體結(jié)合位點(diǎn)結(jié)合調(diào)控親本基因的表達(dá)[13]。也可通過(guò)順式作用模式,與RNA聚合酶Ⅱ復(fù)合體相互作用,調(diào)控其轉(zhuǎn)錄活性[14]。此外,研究顯示部分EIci-RNA在細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄點(diǎn)以外的其他區(qū)域富集,推測(cè)EIci-RNA可發(fā)揮反式調(diào)控作用。
環(huán)狀RNA含有miRNA應(yīng)答反應(yīng)元件可通過(guò)MRE與miRNA的結(jié)合,從而抑制miRNA發(fā)揮其調(diào)節(jié)mRNA功能的作用。例如,circHIPK3可結(jié)合腫瘤抑制因子miR-124從而調(diào)控癌細(xì)胞的表達(dá)[12]。
由于前體mRNA主要由3’,5’端競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合完成剪接,若外顯子出現(xiàn)“跳讀”現(xiàn)象則導(dǎo)致反向剪接,致使原本前體mRNA正常剪接發(fā)生變化或直接降解,同時(shí)在前體mRNA加工后過(guò)程中發(fā)生反向剪接的RNA與正常剪接的RNA存在競(jìng)爭(zhēng)作用,即環(huán)狀RNA的產(chǎn)生將導(dǎo)致正常線性RNA的減少。
環(huán)狀RNA可直接結(jié)合蛋白質(zhì)或與RNA結(jié)合蛋白(RNA-binding protein,RBP)結(jié)合,調(diào)節(jié)相關(guān)蛋白質(zhì)活性[18]。此外環(huán)狀RNA還可以作為某些混合物的載體,從而轉(zhuǎn)移這些混合物至特定亞細(xì)胞位置。
tricRNA于細(xì)胞核中形成,釋放至細(xì)胞質(zhì)中。在轉(zhuǎn)運(yùn)RNA形成的過(guò)程中,前體轉(zhuǎn)運(yùn)RNA中被剪掉的內(nèi)含子序列通過(guò)連接酶RtcB酶作用形成閉合穩(wěn)定的環(huán)狀RNA,即tricRNA。
隨著研究進(jìn)展,科學(xué)家們?cè)谌斯侨饬黾?xì)胞U20S中[15]、肝炎病毒、大腸桿菌[16]等發(fā)現(xiàn)了可以翻譯蛋白質(zhì)的環(huán)狀RNA。環(huán)狀RNA在某些特定條件下可通過(guò)滾環(huán)擴(kuò)增原理(rolling circle amplification,RCA)翻譯出功能性蛋白。此外,位于細(xì)胞質(zhì)中的環(huán)狀RNA一旦核糖體進(jìn)入位點(diǎn)被啟動(dòng),也可翻譯并合成蛋白質(zhì)[17]。
讓我來(lái)說(shuō)一下這個(gè)島。這里叫東極島,是這個(gè)國(guó)家最東面的一個(gè)島嶼,是這個(gè)陸地最遙遠(yuǎn)的一粒餅干屑,是這只公雞上最不起眼的一粒雞米花。太平洋的風(fēng)率先撲到我們島上,我的房子矗立在這個(gè)島東邊最平坦的泥土上。我的窗口比我的門(mén)大,和你們不同的是,我的窗永遠(yuǎn)打開(kāi),只有起風(fēng)的時(shí)候,我才關(guān)上;但你們的窗永遠(yuǎn)關(guān)著,只有起風(fēng)的時(shí)候,你們才打開(kāi)。
在胃癌中,環(huán)狀RNA多結(jié)合微小RNA發(fā)生miRNA海綿作用,或通過(guò)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)影響胃癌的發(fā)生發(fā)展。研究者們利用基因芯片技術(shù)及二代測(cè)序技術(shù)可以觀察到許多在胃癌組織中差異表達(dá)的環(huán)狀RNA,這些環(huán)狀RNA可作為生物標(biāo)志物,對(duì)胃癌的早期診斷提供了一定價(jià)值?,F(xiàn)已較多文獻(xiàn)報(bào)道了在胃癌中低表達(dá)的環(huán)狀RNA,如Li等發(fā)現(xiàn)hsa_circ_002059在胃癌組織及胃癌患者血漿中顯著低表達(dá);Quan等發(fā)現(xiàn)circHIAT1可以影響上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化起到抑癌基因的作用[19]。與此同時(shí),部分環(huán)狀RNA在胃癌中呈現(xiàn)高表達(dá),Wang等發(fā)現(xiàn)CircRBM33在胃癌組織中上調(diào)表達(dá),并且可以結(jié)合miR-149/IL-6對(duì)胃癌細(xì)胞的生物學(xué)功能起到調(diào)節(jié)作用[20];Sun等人發(fā)現(xiàn)circMAN2B2在胃癌中通過(guò)抑制miR-145,從而促進(jìn)胃癌細(xì)胞的生長(zhǎng)及侵襲,發(fā)揮癌基因作用[21]。部分環(huán)狀RNA有望成為胃癌新的治療靶點(diǎn)。如hsa_circ_0005556[22]。此外,部分環(huán)狀RNA可作為胃癌患者預(yù)后的指標(biāo),如circ-RanGAP1[23]。
從表6可以看出, 沙荒地蘋(píng)果樹(shù)體大小差異明顯,行間清耕的株高、樹(shù)冠大小明顯高于間作小麥,與自然生草的株高差異不明顯。分枝數(shù)量是果樹(shù)成花的基礎(chǔ),間作小麥單株分枝、長(zhǎng)枝、短枝數(shù)量明顯小于行間清耕、自然生草。
綜上所述,環(huán)狀RNA有多種合成方式,然而不同環(huán)狀RNA合成過(guò)程中參與的酶及詳細(xì)剪接過(guò)程仍有待完善。現(xiàn)已證實(shí)多種環(huán)狀RNA在胃癌中差異表達(dá),但是否具有較高的臨床診治價(jià)值,仍需后續(xù)研究。