王迪
【摘要】目的:核酸檢測結(jié)果是臨床確診SARS-CoV-2感染的重要依據(jù),實驗室檢測結(jié)果的準確性和及時性尤為重要。方法:通過國家發(fā)布的一系列診療依據(jù)、實驗室準則、生物安全法等相關(guān)內(nèi)容,結(jié)合本實驗室核酸檢測的經(jīng)驗及本人培訓(xùn)學(xué)習的知識體系,從整個實驗室流程分析實驗室檢測存在的關(guān)鍵問題,質(zhì)量控制的關(guān)鍵,從而降低實驗室核酸檢測存在的漏檢、假陰性的情況。結(jié)果:多方面的因素影響SARS-CoV-2的核酸檢測的質(zhì)量,但是樣本采集、運輸、人員是注意的影響因素。結(jié)論:綜合因素影響核酸檢測的質(zhì)量,從人員培訓(xùn)、樣本采集、室間質(zhì)控多方面加強實驗室管理,降低實驗室漏檢、假陰性的結(jié)果。
【關(guān)鍵詞】新冠病毒;核酸檢測;質(zhì)量控制;人員培訓(xùn)
2019新型冠狀病毒(2019-nCoV/SARS-CoV-2,以下簡稱新冠病毒)屬于冠狀病毒科,β冠狀病毒屬,是一種單股正鏈RNA病毒。SARS-CoV-2對紫外線和熱敏感,在56℃加熱30分鐘即可失活,對乙醚、75%乙醇、氯、過氧乙酸和氯仿等脂溶性消毒劑敏感,但氯己定不能有效滅活病毒。核酸檢測作為病毒感染的直接證據(jù)在疾病的診斷、治療和防控中起到關(guān)鍵作用。國家衛(wèi)健委15日發(fā)布《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第八版)》,其中明確,新型冠狀病毒核酸檢測陽性為確診的首要標準。
實驗室工作的質(zhì)量保證應(yīng)覆蓋整個SARA-Cov-2核酸檢測流程,結(jié)果的準確性依賴于分析前、分子中和分析后階段的質(zhì)量控制,對于SARA-Cov-2核酸檢測來說,分析前過程尤為重要,如果沒有有效的采集到標本或運輸和保存不當使得標本質(zhì)量降低,后續(xù)核酸檢測的質(zhì)量就無從談起。
1.分析前質(zhì)量控制
1.1樣本的采集
1.1.1采集標本的種類
根據(jù)《新冠病毒樣本采集和檢測技術(shù)指南》,每個病例必須采集急性期呼吸道標本,重癥病例優(yōu)先采集下呼吸道標本;根據(jù)臨床需要,采集便標本、全血標本、血清標本和尿標本。物品和環(huán)境標本根據(jù)檢測需求采集,不同類型標本核酸檢測陽性率和病毒載量不同。臨床實際中約2/3的患者表現(xiàn)為干咳、無痰,因此目前最常用的標本仍為鼻咽拭子。
1.1.2鼻咽拭子的采集
在選擇恰當?shù)牟蓸訒r機和標本類型的同時,必須采集到含有病毒的細胞,這是正確檢出RNA的前提。不恰當?shù)臉吮静杉菍?dǎo)致核酸檢測假陰性的一個非常重要的因素,如果沒有采集到合格的標本,即使后續(xù)過程中檢測試劑合格、實驗操作規(guī)范和質(zhì)量管理嚴格,也不可能得到準確可靠的結(jié)果。
鼻咽拭子采集的部位不不準確、力度和深度不夠、停留時間不夠等都是影響后續(xù)檢測結(jié)果準確性的重要因素。咽拭子采集需要在兩側(cè)咽扁桃體來回擦拭至少3次,由于個人敏感度不同,容易引起強烈的生理反應(yīng)導(dǎo)致咳嗽噴嚏,產(chǎn)生氣溶膠對采樣人員產(chǎn)生危險,采樣者心理素質(zhì)不強導(dǎo)致采樣不到位,核酸標本質(zhì)量差,容易產(chǎn)生假陰性結(jié)果。
因此要求采樣人員接受技術(shù)規(guī)范與操作規(guī)程、生物安全防護知識和實際操作技能培訓(xùn),熟練掌握鼻咽拭子、口咽拭子等的規(guī)范采集方法,并且考核合格后才能進行標本的采集,后期仍需多次復(fù)訓(xùn),強調(diào)規(guī)范采樣。
1.2樣本的保存與運輸
由于SARA-Cov-2屬于RNA病毒,核酸容易發(fā)生自降解和生物酶介導(dǎo)的降解,高溫、反復(fù)凍融或標本保存不當都會造成核酸降解,影響標本質(zhì)量,因此對標本的保存和運輸提出了更高的要求。《新冠病毒樣本采集和檢測技術(shù)指南》中指出,可在24小時內(nèi)檢測的標本可4℃保存,24小時內(nèi)無法檢測的標本應(yīng)-70℃或以下保存(如無-70℃保存條件,則-20℃暫存)。如需運輸,標本采集后室溫(25℃)放置不宜超過4小時。如需長途運輸建議采用干冰等制冷方式進行保藏。標本運送期間應(yīng)當避免反復(fù)凍融。
1.3實驗室設(shè)備與試劑的選擇
核酸提取是檢測結(jié)果精密度的保證,提取使用的標本量和檢測過程應(yīng)按照試劑說明書進行,因為這些因素都可能對核酸的提取成功與否產(chǎn)生影響。在提取儀器使用過程中應(yīng)嚴格按照要求進行設(shè)備的清潔與維護,并做好記錄,確保檢測結(jié)果的準確性。
市場上試劑品牌眾多,試劑盒的質(zhì)量和性能參數(shù)設(shè)置難免會有瑕疵,不同的試劑盒檢測靶標、靈敏度、特異性與穩(wěn)定性都存在差異,不能排除個別樣本基因組變異等原因?qū)е碌募訇幮缘目赡?,因此在結(jié)果判定時需要謹慎,采取兩種以上的不同試劑盒進行判定。
1.4 人員培訓(xùn)
符合核酸檢測規(guī)定資質(zhì)(PCR上崗證)的實驗室工作人員經(jīng)過生物安全培訓(xùn)考試合格方能上崗。定期針對新型冠狀病毒開展專項培訓(xùn)和考核。實驗人員在檢測過程中,嚴格按照標準操作規(guī)程執(zhí)行,強化生物安全意識,規(guī)范操作,注意實驗過程中的操作細節(jié),提高數(shù)據(jù)分析能力。
2.分析中質(zhì)量控制
2.1 試劑準備
根據(jù)試劑配制使用說明書嚴格配置,從冰箱冷凍取出的試劑要常溫融化,一定要混勻離心,如果試劑融化沒有混勻,這時候配置的試劑狀態(tài)是不均一的,會影響后期擴增,影響結(jié)果。
2.2 核酸提取與擴增
核酸提取是檢測結(jié)果的精密度的保證?,F(xiàn)核酸提取使用最多的方法為磁珠分離法,提取使用的標本量和檢測的過程嚴格按照說明書進行。為避免造成批次間和批次內(nèi)的污染,核酸提取過程中采用3個陰性對照隨機放置在樣本中共同參與提取,此過程用來監(jiān)控可能發(fā)生的環(huán)境污染。另外實驗室要采用帶有濾芯的槍頭,加樣的順序依次為樣本、陰性對照、陽性對照,防止污染。
目前核酸擴增使用最廣泛和技術(shù)成熟度最高的方法為實時熒光RT-PCR。參照試劑說明書設(shè)置核酸擴增的實驗程序,多人檢查保證時間、溫度、循環(huán)次數(shù)等設(shè)置正確。為盡量避免光學(xué)混勻現(xiàn)象,PCR預(yù)混液與核酸提取物一定要混勻,上機時的反應(yīng)體系不要有大的氣泡,氣泡形成折射,干擾熒光的采集,可以采用適當?shù)碾x心機混勻去除氣泡,最后在上機前,一定要檢查密封是否完整,防止擴增時液體的蒸發(fā),導(dǎo)致實驗失敗,又造成實驗室核酸污染。擴增完成后反應(yīng)體系不可打開,直接至于垃圾袋中封口,不可高壓,按一般醫(yī)療廢棄物移出實驗室處理。
2.3 室間質(zhì)量評價
室內(nèi)質(zhì)量控制和室間質(zhì)量控制是檢測質(zhì)量保證的重要部分。每批次檢測至少一份弱陽性質(zhì)控品(第三方質(zhì)控品)、3份陰性質(zhì)控品(生理鹽水)、3份環(huán)境質(zhì)控品(開蓋過夜生理鹽水),質(zhì)控品隨機放在標本中,參與從提取到擴增的全過程(采集和技術(shù)指南)。弱陽性質(zhì)控定為陽性,3份陰性質(zhì)控品全部測定為陰性,視為在控,反之則為失控,應(yīng)立即停止實驗分析原因,在分析和確定失敗原因后,必須使用儲存或信采集的樣本進行重新檢測。
3分析后質(zhì)量控制
3.1結(jié)果的判定
SARA-Cov-2核酸檢測數(shù)據(jù)分析是獲得核酸檢測結(jié)果的重要環(huán)節(jié)。新型冠狀病毒肺炎防控方案 (第八版)核酸檢測方法主要針對新冠病毒基因組中開放讀碼框1ab(open reading frame 1ab,ORF1ab)和核殼蛋白(nucleocapsid protein,N)。
無Ct值、無S形擴增曲線判陰性。Ct值小于等于檢出限,且有S形擴增曲線,判陽性。Ct值位于灰區(qū),建議重復(fù)實驗,若重做Ct值仍處于灰區(qū),但出現(xiàn)明顯的S形擴增曲線,該樣本判斷為陽性,否則為陰性。
3.2實驗室維護
防止污染是貫徹PCR實驗室的準則定律。每次實驗結(jié)束要采取有效措施保證樣本的安全,用75%的酒精擦拭提取儀臺面、操作臺面、垃圾桶等,開啟移動紫外燈、屋頂紫外燈、生物安全柜紫外燈照射有效時間,所有垃圾采用雙層垃圾袋避免液體泄露,最后進行高壓滅菌處理。
4.總結(jié)
影響SARA-Cov-2核酸檢出率的因素涉及各個環(huán)節(jié),實驗室的質(zhì)量保證覆蓋到整個檢測流程,做好每一個環(huán)節(jié)的質(zhì)量把控,規(guī)范實驗室操作,嚴格的室內(nèi)質(zhì)量控制,積極參加室間質(zhì)評,避免實驗室產(chǎn)生假陰性的結(jié)果。同時,采樣人員應(yīng)與實驗室密切配合,加強對標本的采集、保存、運輸?shù)确矫娴馁|(zhì)量把控,規(guī)避風險。
參考文獻:
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