吳長(zhǎng)偉,弓新國(guó),張 勃,李 仙,鄭 琳
(常德華馥生物技術(shù)有限公司,湖南 常德 415900)
纖維素、半纖維素、木質(zhì)素和果膠等細(xì)胞壁物質(zhì)是煙梗的主要組成部分,其在卷煙燃燒熱解過(guò)程中產(chǎn)生較多低級(jí)醛類(lèi),增加了卷煙木質(zhì)氣和刺激性,降低了煙草感官抽吸質(zhì)量[1,2]。微生物降解木質(zhì)纖維素的研究主要集中在真菌(青霉、漆斑霉、脈胞霉、白腐霉、里氏木霉、曲霉等)和細(xì)菌(纖維單胞菌、假單胞菌、芽孢桿菌等)[3-7]。然而,細(xì)菌以其適應(yīng)性強(qiáng),分泌的酶通常具有更好的熱穩(wěn)定性以及更廣的pH耐受范圍的特性,越來(lái)越受到人們的重視[8-12]。
貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)是芽孢桿菌屬的一個(gè)新種,具有促進(jìn)植物生長(zhǎng)和抗病蟲(chóng)害的作用[13-16]。目前,利用貝萊斯芽孢桿菌降解木質(zhì)纖維素的研究較少。Chen等[13]從杜仲樹(shù)皮內(nèi)分離一株芽孢桿菌157,經(jīng)16SrRNA分子生物學(xué)鑒定為貝萊斯芽孢桿菌,對(duì)秸稈和豆粕混合物進(jìn)行固態(tài)發(fā)酵,纖維素降解率為9.06%,半纖維素降解率為43.61%。崔家榮等[17]從牲畜糞便中分離篩選出對(duì)檸條木質(zhì)素具有降解作用的菌株D-11,經(jīng)微生物形態(tài)學(xué)和16SrDNA鑒定為地衣芽孢桿菌(Baclicuslincheniformis),該菌株對(duì)檸條木質(zhì)素降解率為18.21%,半纖維素降解率為16.11%,纖維素降解率為13.19%。然而利用細(xì)菌降解煙草木質(zhì)纖維素的研究較少,尤其是貝萊斯芽孢桿菌降解煙梗木質(zhì)纖維素的研究少見(jiàn)報(bào)道。為此,從煙草栽培土壤中分離1株高效降解煙草細(xì)胞壁物質(zhì)的細(xì)菌HF-09,通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察結(jié)合16SrRNA測(cè)序和系統(tǒng)進(jìn)化分析對(duì)該菌株鑒定,并研究HF-09降解煙梗細(xì)胞壁物質(zhì)的特性。
樣品:煙葉來(lái)源于云南昆明紅云紅河集團(tuán),品種為紅大,等級(jí)為C3F;土壤來(lái)源于昆明市附近煙田。
培養(yǎng)基:①LB液體培養(yǎng)基[10]。蛋白胨10 g/L、氯化鈉10 g/L、酵母提取物5 g/L,pH 7.0;②纖維素酶篩選培養(yǎng)基[8,11]。羧甲基纖維素鈉10 g/L、酵母提取物3 g/L、硫酸鎂0.5 g/L、磷酸氫二鉀3 g/L、磷酸二氫鉀1 g/L、瓊脂20 g/L,pH 7.0;③木質(zhì)素過(guò)氧化物酶篩選培養(yǎng)基[8,11]。1%的苯胺藍(lán)母液,過(guò)濾除菌,以1%的濃度添加到LB培養(yǎng)基中,制備LB平板;④產(chǎn)酶發(fā)酵培養(yǎng)基[8,11]。羧甲基纖維素鈉10 g/L、酵母提取物5 g/L、蛋白胨10 g/L、氯化鈉10 g/L,pH 7.0。
KDM型調(diào)溫電熱套(山東鄄城華魯電熱儀器有限公司);PX223ZH/E型精密電子秤[奧豪斯儀器(上海)有限公司];UV-9100型紫外-可見(jiàn)分光光度計(jì)(北京瑞利分析儀器公司);BHS-6電熱恒溫水浴鍋(群安實(shí)驗(yàn)儀器有限公司);SKY-211B大容量恒溫培養(yǎng)搖床(上海蘇坤實(shí)業(yè)有限公司);RE-5250型旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(上海亞榮生化儀表廠);同時(shí)蒸餾提取器(上海楚柏實(shí)驗(yàn)室設(shè)備有限公司);6890N/5973N氣相色譜/質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC/MS,美國(guó)安捷倫科技公司)。
稱(chēng)取采集的土壤樣品,加入適量的滅菌生理鹽水,充分振蕩,置于恒溫水浴鍋中(75℃)處理30 min。用10倍連續(xù)稀釋法進(jìn)行稀釋?zhuān)?0-4、10-5、10-6、10-7、10-8),菌懸液分別在LB固體培養(yǎng)基平板上劃平板,37℃靜止培養(yǎng),3次重復(fù)。
將純化菌株接種于纖維素酶篩選培養(yǎng)基平板,于37℃培養(yǎng)12~36 h,染色(剛果紅)30 min,再用1 mol/L的NaCl溶液脫色30 min,測(cè)量透明圈直徑與菌落直徑的比值(SI)。
以檸檬酸緩沖液(0.05 mol/L,pH 5.5)作為溶劑,配制CMC-Na底物(1%)溶液。取100μL粗酶液與200μL底物混合,充分振蕩后,50℃水浴30 min,之后加入400μL DNS溶液(3,5-二硝基水楊酸)終止反應(yīng),煮沸10 min,自然冷卻,加入2 mL去離子水,充分混勻,取300μL至酶標(biāo)板,用酶標(biāo)儀測(cè)定540 nm下吸光度。
1.5.1 形態(tài)觀察及生理生化試驗(yàn) 對(duì)分離得到的菌株進(jìn)行革蘭氏染色和形態(tài)學(xué)觀察。生理生化試驗(yàn)參照文獻(xiàn)[18]的方法。
1.5.2 16SrRNA序列擴(kuò)增和系統(tǒng)進(jìn)化分析 提取細(xì)菌基因組后,用通用引物[19](16S上游引物:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′;16S下游引物:5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)進(jìn)行基因擴(kuò)增。取2μL PCR反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳檢測(cè),利用瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行回收。并通過(guò)NCBIBlast比對(duì),從Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)中下載親緣關(guān)系較近的菌株基因序列,測(cè)序結(jié)果經(jīng)Clustal W軟件比對(duì)分析,并構(gòu)建Neighbor-jioning進(jìn)化樹(shù)[13]。
1.6.1 HF-09菌株生物學(xué)特性分析
1)生長(zhǎng)曲線(xiàn)。將BacillusvelezensisHF-09在LB固體培養(yǎng)基上過(guò)夜培養(yǎng),調(diào)整菌液濃度,轉(zhuǎn)接至100 mL液體LB培養(yǎng)基中(接種量1%),測(cè)定菌液最初吸光度(OD600nm),于180 r/min、37℃搖床培養(yǎng),每間隔1 h取樣,測(cè)定OD600nm(重復(fù)3次),然后繪制生長(zhǎng)曲線(xiàn)。
2)耐受試驗(yàn)[8]。①溫度耐受。HF-09菌株培養(yǎng)于LB液體培養(yǎng)基,37℃、180 r/min培養(yǎng)12 h,75℃水浴20 min,即為芽孢體(洗滌菌3次),取1 mL菌液到EP管中,置于不同溫度的水浴中處理20 min,自然冷卻至常溫,以芽孢體為對(duì)照樣;②pH耐受性。HF-09芽孢體制備同上述方法,取1 mL菌液到EP管中,接種到不同pH的緩沖液(pH 2~12)中,37℃水浴處理3 h。存活率=(處理后的細(xì)菌數(shù)/處理前的細(xì)菌數(shù))×100%。
1.6.2 煙梗木質(zhì)纖維素降解效果評(píng)價(jià)
1)木質(zhì)纖維素含量檢測(cè)。經(jīng)HF-09固態(tài)發(fā)酵10 d(接總量:1%;種子菌液OD600nm=2.0)的降解煙梗(C3F)送至云南同創(chuàng)檢測(cè)技術(shù)有限公司進(jìn)行檢測(cè)。采用聚酯纖維濾網(wǎng)袋法測(cè)得纖維素、半纖維素、木質(zhì)素的含量,計(jì)算其降解率。降解率[8](DR)=(接種前某成分含量-接種后某成分含量)/接種前某成分含量×100%。
2)掃描電鏡觀察。將紅大(C3F)煙梗經(jīng)HF-09固態(tài)發(fā)酵10 d的降解產(chǎn)物于50℃條件下烘干至恒重,采用掃描電鏡對(duì)其表面結(jié)構(gòu)進(jìn)行觀察。
通過(guò)培養(yǎng)基的富集、分離及篩選,得到12株具有降解木質(zhì)纖維素的菌株,通過(guò)對(duì)其SI、羧甲基纖維素酶(CM Case)和濾紙纖維素酶(FPAse)檢測(cè)分析,12株菌SI均大于3,其中HF-09菌株CMCase和FPAse的酶活性最高,其降解木質(zhì)纖維素的能力最強(qiáng)(圖1)。為此,選擇HF-09為出發(fā)菌株進(jìn)行研究。
對(duì)HF-09菌株進(jìn)行菌落形態(tài)特征、芽孢染色法、革蘭氏染色法鑒定(圖2)。該菌株為短桿菌,乳白色,菌落表面不規(guī)則,革蘭氏染色呈陽(yáng)性,產(chǎn)芽孢,有運(yùn)動(dòng)性。
圖2 菌株HF-09的菌落形態(tài)(a)和菌體的革蘭氏染色顯微照片(b)(放大1 000倍)
菌株HF-09的16SrRNA基因擴(kuò)增序列全長(zhǎng)為1 424 bp。同源性序列分析表明,HF-09的16SrRNA序列與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中貝萊斯芽孢桿菌(Bacillusvelezensis)的同源性達(dá)93%~99%,且與已報(bào)道的Bacillus velezensis157(KY630544)和Bacillus velezensisNAU-B3(NC 022530.1)序列的同源性最高,達(dá)99%。Neighbor-jioning進(jìn)化樹(shù)(圖3)結(jié)果表明,菌株HF-09同貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)屬于同一個(gè)分支。其中,已報(bào)道的貝萊斯芽孢桿菌Bacillus velezensis157(KY630544)是從杜仲樹(shù)皮內(nèi)分離得到的,具有明顯降解秸稈和豆粕中木質(zhì)纖維素的能力。綜合菌株形態(tài)特征觀察、生理生化特性及16SrRNA分子鑒定結(jié)果,確定木質(zhì)纖維素降解菌HF-09為貝萊斯芽孢桿菌。
圖3 菌株HF-09的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
2.3.1 菌株HF-09的生長(zhǎng)曲線(xiàn)和耐受性研究 貝萊斯芽孢桿菌HF-09在LB液體培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)曲線(xiàn)表明(圖4a),7~20 h達(dá)對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,20 h之后達(dá)到穩(wěn)定生長(zhǎng)期。pH耐受結(jié)果表明,菌株HF-09在pH 5~9區(qū)間的存活率均在94%以上;溫度耐受結(jié)果表明,菌株HF-09在75℃以下的存活率在92%以上(圖4b),表明該菌株具有良好的pH和溫度耐受性。
圖4 菌株HF-09的生長(zhǎng)曲線(xiàn)(a)及對(duì)p H和溫度的耐受性(b)
2.3.2 菌株HF-09固體發(fā)酵降解紅大煙梗(C3F)中的木質(zhì)纖維素 菌株HF-09對(duì)煙梗纖維素、半纖維素和木質(zhì)素具有不同程度的降解能力,其對(duì)半纖維素的降解能力尤為顯著(圖5)。其中,菌株HF-09對(duì)纖維素的降解在最初2 d內(nèi)能力較弱(降解率為0.24%),但發(fā)酵6 d后纖維素含量由12.68%下降到10.82%(降解率為14.67%),發(fā)酵10 d后含量下降到10.04%(降解率為20.82%);菌株HF-09對(duì)半纖維素的降解速率較為穩(wěn)定,發(fā)酵6 d后半纖維素含量由7.53%下降到5.85%(降解率為22.31%),發(fā)酵10 d后含量下降到5.25%(降解率為30.28%);木質(zhì)素發(fā)酵6 d后,含量由6.05%下降到5.25%(降解率為13.22%),發(fā)酵10 d后含量下降到4.88%(降解率為19.34%)。結(jié)果表明,該菌分泌多種酶系,并在多種酶系的復(fù)合作用下具有明顯的降解煙梗細(xì)胞壁物質(zhì)的能力。
圖5 菌株HF-09降解煙梗木質(zhì)纖維素含量變化
2.3.3 紅大煙梗(C3F)掃描電鏡觀察 菌株HF-09對(duì)紅大煙梗(C3F)進(jìn)行固體發(fā)酵10 d,利用掃描電鏡對(duì)煙梗進(jìn)行組織結(jié)構(gòu)觀察,結(jié)果(圖6)表明,菌株HF-09能夠在煙梗表皮組織層良好生長(zhǎng),使原本因富含果膠、蠟質(zhì)不易被單一酶進(jìn)行分解的表皮組織層在其作用下破壞明顯,出現(xiàn)明顯的縫隙,有利于HF-09分泌的纖維素降解酶、半纖維素降解酶、木質(zhì)素酶、淀粉酶等滲入到煙梗組織內(nèi)部。煙梗橫切面和縱切面電鏡顯示,煙梗組織結(jié)構(gòu)疏松,空隙增大,細(xì)胞間連接物質(zhì)和細(xì)胞壁變薄,細(xì)胞結(jié)構(gòu)降解明顯。
從煙草栽培土壤中分離得到1株具有高效降解煙梗木質(zhì)纖維素的細(xì)菌HF-09,經(jīng)過(guò)形態(tài)學(xué)、生理生化性質(zhì)和16SrRNA擴(kuò)增序列的系統(tǒng)進(jìn)化分析,該菌株為貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)。該細(xì)菌在培養(yǎng)7~20 h達(dá)對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,在pH 5~9區(qū)間HF-09的存活率均在94%以上;在75℃以下HF-09的存活率均在92%以上。該細(xì)菌擁有生長(zhǎng)速度快和耐受性強(qiáng)的特征。同時(shí),該菌株可以降解煙梗纖維素、半纖維素、木質(zhì)素等煙梗細(xì)胞壁物質(zhì)組分,3種物質(zhì)降解率最低為19.34%,其中煙梗半纖維素的降解率達(dá)30.28%。細(xì)菌HF-09對(duì)煙梗表皮組織和細(xì)胞結(jié)構(gòu)具有明顯的分解破壞能力,表明HF-09在卷煙加工和煙草廢棄物資源利用方面具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。此外,作為一種耐酸堿和分泌多種酶系的益生菌,菌株HF-09可能有利于煙草原料中還原糖轉(zhuǎn)化及產(chǎn)香物質(zhì)的衍生,對(duì)加速煙草原料醇化和品質(zhì)提升可能具有重要應(yīng)用價(jià)值。