滕海英,歐余航,肖建平
(1.福建中醫(yī)藥大學(xué)附屬康復(fù)醫(yī)院,福建 福州350003;2.福建中醫(yī)藥大學(xué)附屬第三人民醫(yī)院,福建 福州350108)
糖尿病腎?。╠iabetic nephropathy,DN),約占糖尿病患者的40%,是糖尿病常見的慢性并發(fā)癥之一,可致腎功能不可逆的損傷,是終末期腎?。‥SRD)的主要病因[1]。現(xiàn)代中醫(yī)認(rèn)為:糖尿病腎病與“腎消”“消腎”“下消”密切相關(guān),且歸經(jīng)定位以腎為主,病機(jī)以“本虛”為主,治療以補(bǔ)氣藥為主,利水滲濕藥、收斂固澀藥等為佐[2]?!包S芪-茯苓-五味子”組方(HFW)作為中醫(yī)常見治療糖尿病腎病的組合,其中黃芪補(bǔ)中益氣,茯苓滲濕健脾,五味子收斂固澀,補(bǔ)腎止遺,兼可補(bǔ)腎氣。馬居里教授[3]治療糖尿病腎病的經(jīng)驗(yàn)方中,用HFW以益氣固表,健脾益腎,祛風(fēng)散邪。王靜[2]在探討糖尿病腎病的古籍文獻(xiàn)用藥規(guī)律后發(fā)現(xiàn):在錄入的203首方劑中,黃芪、茯苓、五味子的使用頻次最高。HFW能夠有效降低糖尿病腎病患者的尿蛋白和相關(guān)炎癥因子[4],但其具體的作用機(jī)制尚不明確。本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討HFW治療糖尿病腎病的作用機(jī)制,為糖尿病腎病的中醫(yī)臨床治療和實(shí)驗(yàn)研究提供方向和理論支持。
1.1 HFW的活性成分篩選 以“黃芪”“茯苓”“五味子”作為檢索詞在TCMSP數(shù)據(jù)庫[5](https://tcmspw.com/tcmsp.php)檢索,獲得這3味藥的化學(xué)成分信息,按照生物利用度(OB)≥30%且類藥性(DL)≥0.18為篩選條件[6],篩選出HFW的活性成分。
1.2 HFW的作用靶點(diǎn)篩選 采用TCMSP數(shù)據(jù)庫[5]檢索獲得黃芪、茯苓、五味子中活性成分對(duì)應(yīng)的作用靶點(diǎn),并查詢UniProt數(shù)據(jù)庫[7](https://www.uniprot.org)對(duì)獲得的作用靶點(diǎn)進(jìn)行基因名轉(zhuǎn)換。
1.3 糖尿病腎病的作用靶點(diǎn)篩選 以“diabetic nephropathy”“diabetic kidney disease”作為檢索詞在DisGeNET數(shù)據(jù)庫[8](https://www.disgenet.org/)和GeneCards數(shù)據(jù)庫[9](https://www.genecards.org/)檢索出糖尿病腎病作用靶點(diǎn)。將DisGeNET數(shù)據(jù)庫中相關(guān)性得分(Score)≥0.2[10]和GeneCards數(shù)據(jù)庫中Score≥20[11]的基因整理匯總,獲得糖尿病腎病的作用靶點(diǎn)。
1.4 構(gòu)建HFW活性成分-糖尿病腎病共同靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò) 將HFW活性成分作用靶點(diǎn)和糖尿病腎病作用靶點(diǎn)導(dǎo)入Venny 2.1.0軟件(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny),獲得HFW和糖尿病腎病的共同靶點(diǎn);通過Cytoscape 3.8.0軟件進(jìn)行可視化分析,構(gòu)建“HFW活性成分-糖尿病腎病共同靶點(diǎn)”關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。
1.5 構(gòu)建蛋白互作關(guān)系網(wǎng)絡(luò)(PPI)網(wǎng)絡(luò) 將獲得的共同靶點(diǎn)導(dǎo)入String 11.0數(shù)據(jù)庫[12](https://stringdb.org/),設(shè)定物種為“Homo sapiens”,其他參數(shù)選擇默認(rèn)參數(shù),構(gòu)建HFW治療糖尿病腎病共同靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò),以分析共同靶點(diǎn)之間的相互作用關(guān)系。
1.6 GO和KEGG富集分析 通過DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫[13](https://david.ncifcrf.gov)在線將共同靶點(diǎn)進(jìn)行基因ID轉(zhuǎn)換,利用R語言3.6.1軟件和Bioconductor數(shù)據(jù)庫的org.Hs.eg.db包和clusterProfiler包[14]對(duì)共同靶點(diǎn)進(jìn)行生物學(xué)過程(BP)、細(xì)胞成分(CC)及分子功能(MF)的GO注釋分析和KEGG通路富集分析,以校正后P值<0.05為條件進(jìn)行篩選,以分析HFW治療糖尿病腎病潛在作用靶點(diǎn)可能參與的生物學(xué)過程和信號(hào)通路。
2.1 HFW的作用靶點(diǎn) 利用TCMSP數(shù)據(jù)庫對(duì)HFW化學(xué)成分進(jìn)行篩選,根據(jù)設(shè)定的DL、OB參數(shù),篩選出43個(gè)活性成分,其中黃芪20個(gè),茯苓15個(gè),五味子8個(gè),剔除重復(fù)項(xiàng),獲得42個(gè)活性成分。通過TCMSP數(shù)據(jù)庫檢索獲得HFW的活性成分對(duì)應(yīng)的作用靶點(diǎn),進(jìn)行基因名轉(zhuǎn)換后,剔除重復(fù)項(xiàng),獲得185個(gè)活性成分作用靶點(diǎn)。
2.2 糖尿病腎病的作用靶點(diǎn) 通過檢索DisGeNET和GeneCards數(shù)據(jù)庫,根據(jù)設(shè)定的Score參數(shù),檢索出糖尿病腎病的作用靶點(diǎn)分別為153個(gè)和225個(gè),剔除重復(fù)項(xiàng)后,獲得糖尿病腎病的作用靶點(diǎn)334個(gè)。
2.3 活性成分-共同靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 將篩選得到的334個(gè)糖尿病腎病作用靶點(diǎn)與185個(gè)HFW活性成分作用靶點(diǎn)取交集,獲得48個(gè)共同靶點(diǎn)。48個(gè)共同靶點(diǎn)基因?qū)?yīng)的HFW活性成分有17個(gè),見表1。由此推測(cè)HFW的17個(gè)活性成分通過這48個(gè)共同靶點(diǎn)治療糖尿病腎病。將17個(gè)活性成分和48個(gè)共同靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape3.8.0軟件,構(gòu)建“HFW活性成分-糖尿病腎病共同靶點(diǎn)”可視化網(wǎng)絡(luò),見圖1。
表1 HFW的活性成分
圖1 “HFW活性成分-糖尿病腎病共同靶點(diǎn)”可視化網(wǎng)絡(luò)圖
2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 通過String數(shù)據(jù)庫在線構(gòu)建的HFW治療糖尿病腎病共同靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò),包含48個(gè)節(jié)點(diǎn)和584條邊,見圖2。結(jié)果發(fā)現(xiàn):在48個(gè)共同靶點(diǎn)中自由度(degree)值排名前10位分別是AKT1、IL6、VEGFA、CASP3、PTGS2、MMP9、EGF、NOS3、CCL2、IL1B,其中自由度值最高的是AKT1,自由度值為45,其次是IL6,自由度值為44。提示這些靶點(diǎn)在PPI網(wǎng)絡(luò)中占有重要地位,是HFW治療糖尿病腎病的關(guān)鍵靶點(diǎn)。
圖2 共同靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò)圖
2.5 GO富集分析 GO功能富集分析共涉及1 324個(gè)BP、19種CC、78個(gè)MF,根據(jù)富集基因數(shù)目,選擇排名前10位的功能注釋信息,并繪制柱狀圖,見圖3。結(jié)果顯示:HFW治療糖尿病腎病可能與營養(yǎng)水平反應(yīng)、氧水平反應(yīng)、抗氧化應(yīng)激反應(yīng)等BP有關(guān);CC涉及到膜筏、膜微結(jié)構(gòu)域、膜區(qū)域等多細(xì)胞成分;MF涉及到細(xì)胞因子受體結(jié)合、泛素樣蛋白連接酶結(jié)合、整合素結(jié)合等。
圖3 共同靶點(diǎn)的GO富集分析圖
2.6 KEGG通路富集分析 KEGG通路富集分析共獲得105條富集通路,列出富集基因最多的前10條信號(hào)通路,見表2。KEGG富集的信號(hào)通路主要包括AGE-RAGE信號(hào)通路、液體剪切應(yīng)力和動(dòng)脈粥樣硬化、卡波西肉瘤相關(guān)皰疹病毒感染、癌癥蛋白聚糖、TNF信號(hào)通路等。
表2 KEGG通路富集分析中富集基因最多的前10名富集通路
糖尿病腎病主要病因是繼發(fā)于糖尿病,其自然病史包括腎小球超濾、進(jìn)行性白蛋白尿、GFR下降以及最終出現(xiàn)的ESRD[1],炎癥反應(yīng)、免疫反應(yīng)和氧化應(yīng)激在糖尿病腎病的發(fā)生和發(fā)展中起著核心作用[15]。目前研究認(rèn)為:與糖尿病腎病中炎癥反應(yīng)機(jī)制密切相關(guān)的因子包括轉(zhuǎn)錄因子、促炎細(xì)胞因子、趨化因子[16]。機(jī)體在糖尿病特殊環(huán)境下,免疫細(xì)胞、細(xì)胞因子以及自身抗體等免疫因素相互影響,造成腎功能的損害[17]。氧化應(yīng)激可改變腎臟血流動(dòng)力學(xué),損傷腎小球內(nèi)皮細(xì)胞,導(dǎo)致基質(zhì)在系膜細(xì)胞外沉積及增厚腎小球基底膜[18]。本研究通過對(duì)HFW活性成分與糖尿病腎病的共同靶點(diǎn)進(jìn)行PPI網(wǎng)絡(luò)和富集分析,發(fā)現(xiàn)HFW治療糖尿病腎病主要與炎癥反應(yīng)、免疫反應(yīng)和氧化應(yīng)激相關(guān),同時(shí)還和細(xì)胞增殖與凋亡的過程有關(guān)。
本研究通過構(gòu)建“HFW活性成分-糖尿病腎病共同靶點(diǎn)”關(guān)系網(wǎng)絡(luò),顯示HFW通過17種化合物靶向48個(gè)共同靶點(diǎn)。其中,作用較多靶點(diǎn)的活性成分有槲皮素、山奈酚、異鼠李素、毛蕊異黃酮、芒柄花黃素,這些化合物可能是HFW治療糖尿病腎病的關(guān)鍵藥物。
近年來,槲皮素和山奈酚作為治療糖尿病腎病的藥物已引起了廣泛關(guān)注。研究發(fā)現(xiàn):糖尿病腎病C57BL/6J模型小鼠口服低劑量槲皮素治療顯示出抗氧化、抗凋亡和腎保護(hù)作用[19],另有研究發(fā)現(xiàn)槲皮素可通過激活Hippo途徑抑制高糖誘導(dǎo)的小鼠腎小球系膜細(xì)胞的增殖[20];山奈酚可通過增加GLP-1、胰島素的釋放和抑制RhoA/Rho激酶來改善糖尿病引起的腎臟損傷和纖維化[21];異鼠李素抑制NFκB信號(hào)傳導(dǎo)活性,降低炎癥介質(zhì)的產(chǎn)生和減輕氧化應(yīng)激反應(yīng),起到對(duì)糖尿病大鼠的腎臟保護(hù)作用[22];毛蕊異黃酮通過體內(nèi)和體外NF-κB途徑改善糖尿病誘導(dǎo)的腎臟炎癥[23];芒柄花黃素可增加SIRT1在2型糖尿病大鼠腎組織中的表達(dá)而減輕腎臟損害[24]。
HFW治療糖尿病腎病的共同靶點(diǎn)主要富集在AGE-RAGE、TNF、HIF-1、IL-17、VEGF等信號(hào)通路和液體剪切應(yīng)力和動(dòng)脈粥樣硬化、卡波西肉瘤相關(guān)皰疹病毒感染、癌癥蛋白聚糖上。AGE-RAGE信號(hào)通路在糖尿病并發(fā)癥中發(fā)揮著重要的作用,也是糖尿病腎病發(fā)生發(fā)展的重要一環(huán)[25]。有研究認(rèn)為:AGE受體和RAGE受體與其配體的結(jié)合在腎臟組織中引起氧化應(yīng)激和慢性炎癥反應(yīng)將導(dǎo)致腎功能喪失,可通過阻斷AGE-RAGE信號(hào)通路改善糖尿病腎病進(jìn)展[26]。KEGG分析結(jié)果顯示富集在AGE-RAGE信號(hào)通路上的AKT1、IL6、VEGFA、CASP3、NOS3、CCL2、IL1B在PPI網(wǎng)絡(luò)中有較高的自由度值,可見這些靶點(diǎn)是HFW治療糖尿病腎病的關(guān)鍵靶點(diǎn)。其中AKT1參與多種生物學(xué)過程,其過度激活可影響葡萄糖體內(nèi) 穩(wěn) 定[27],也 可 發(fā) 揮 抗 凋 亡 及 抗 氧 化 應(yīng) 激 作 用[28];NOS3可能會(huì)造成一氧化氮合成的異常,影響糖尿病 腎 病 的 進(jìn) 程[29];IL6、VEGFA、CASP3、CCL2、IL1B均為參與指導(dǎo)或者介導(dǎo)炎癥反應(yīng)和免疫反應(yīng)的潛在核心靶點(diǎn)[30-33]。TNF信號(hào)通路在炎癥反應(yīng)、細(xì)胞增殖和細(xì)胞死亡中具有至關(guān)重要的作用,TNF受體誘導(dǎo)NF-κB信號(hào)傳導(dǎo)異常導(dǎo)致慢性炎癥,從而促使糖尿病腎損傷的發(fā)生[34]。HIF-1作為氧穩(wěn)態(tài)的主要調(diào)節(jié)劑,主要參與循環(huán)系統(tǒng)疾病的缺氧代償反應(yīng)、免疫反應(yīng)、新生血管的生成與調(diào)節(jié)等[35],HIF-1信號(hào)通路上的關(guān)鍵靶點(diǎn)HIF-1α可介導(dǎo)與腎間質(zhì)細(xì)胞纖維化有關(guān)的多種細(xì)胞因子的表達(dá)。研究表明可通過抑制HIF-1α的表達(dá),進(jìn)而抑制高糖培養(yǎng)的大鼠腎小球系膜細(xì)胞的炎癥和纖維化[36]。IL-17信號(hào)通路被認(rèn)為與多種免疫疾病和慢性炎癥有關(guān)[37],研究發(fā)現(xiàn)IL-17A可抑制信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活劑的磷酸化,可有效治療、預(yù)防和逆轉(zhuǎn)糖尿病遺傳模型中已建立的腎?。?8]。血管生成的過度和不足都與糖尿病并發(fā)癥的進(jìn)展有關(guān),VEGF是參與新血管形成的關(guān)鍵介質(zhì)。研究表明通過抑制VEGF信號(hào)傳導(dǎo)可降低腎臟的脂毒性,使足細(xì)胞對(duì)胰島素信號(hào)傳導(dǎo)重新敏感,抑制糖尿病腎病的發(fā)展,并預(yù)防腎功能不全[39]。這些信號(hào)通路在糖尿病腎病的發(fā)生發(fā)展中均占有重要的位置。本研究KEGG富集分析結(jié)果表明HFW可能通過介導(dǎo)炎癥反應(yīng)、免疫反應(yīng)、氧化應(yīng)激、細(xì)胞增殖和細(xì)胞死亡,從而起到治療糖尿病腎病作用。
綜上所述,本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討HFW治療糖尿病腎病的潛在作用機(jī)制,結(jié)果表明:HFW發(fā)揮糖尿病腎病的治療作用可能通過介導(dǎo)炎癥反應(yīng)、免疫反應(yīng)、氧化應(yīng)激、細(xì)胞增殖和細(xì)胞凋亡。本研究為進(jìn)一步研究HFW治療糖尿病腎病提供臨床和實(shí)驗(yàn)的參考依據(jù),但不足之處是未考慮中藥的提取方法、劑型劑量等因素的影響。