黎猛 陳躍 胡鳳榮
(1. 南京林業(yè)大學(xué)風(fēng)景園林學(xué)院,南京 210037;2. 浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝所,杭州 310000)
microRNA(miRNA)是一類在動植物中廣泛存在和在進(jìn)化上保守的一段不具有開放性閱讀框、不編碼蛋白質(zhì)的長度為20-24 nt的非編碼小分子RNA[1]。microRNA的生物合成通過轉(zhuǎn)錄、加工成熟和功能復(fù)合體裝配3個步驟完成,先后形成初級miRNA(pri-miRNA)、前 體miRNA(pre-miRNA)和雙鏈片段miRNA(miRNA/miRNA*),最后miRNA與AGO蛋白結(jié)合成RISC沉默復(fù)合物來完成功能調(diào)控[2]。microRNA主要通過調(diào)控下游的靶基因來發(fā)揮作用,其與靶基因的mRNA互補(bǔ)配對來切割mRNA或者抑制mRNA翻譯[3],此外microRNA還可以調(diào)控基因的甲基化[4-5]。眾多研究表明,microRNA廣泛參與植物生長發(fā)育、信號傳導(dǎo)、逆境脅迫響應(yīng)等多個生命過程[6],因此研究microRNA的機(jī)理、生物學(xué)功能等具有重要意義。
microRNA159(miR159)家族是一類普遍存在于雙子葉植物和單子葉植物中的長度為21 nt的古老microRNA家族[7]。作為一類高度保守的microRNA,大量植物的小RNA測序?qū)嶒?yàn)揭示,miR159是植物中表達(dá)量最多的一類microRNA[7]。MYB轉(zhuǎn)錄因子家族是最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,具有MYB結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子叫做MYB轉(zhuǎn)錄因子,其N端是高度保守的MYB結(jié)構(gòu)域,根據(jù)該結(jié)構(gòu)域R結(jié)構(gòu)的個數(shù)和重復(fù)種類分為4類:(1)1R-MYB(R1/2,R3),(2)R2R3-MYB,(3)3R-MYB(R1R2R3-MYB)和(4)4R-MYB[8-9],其中R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子是MYB轉(zhuǎn)錄因子家族中數(shù)量最多的[10]。研究表明一類編碼R2R3 MYB轉(zhuǎn)錄因子的GAMYB基因是miR159主要的靶基因,因?yàn)檫@類MYB基因在大麥種子糊粉中響應(yīng)GA信號,該基因編碼的MYB轉(zhuǎn)錄因子可以激活GA信號下游的α-淀粉酶基因和水解酶基因等基因的表達(dá),所以這類MYB基因又叫“GAMYB”[11]。
miR159調(diào)控GAMYB在植物營養(yǎng)生長、開花誘導(dǎo)、雄性生殖、花器官發(fā)育、植物育性、果實(shí)發(fā)育和脅迫響應(yīng)中有著重要作用,目前基于miR159-GAMYB途徑的研究在擬南芥中較為深入,在水稻、黃瓜、葡萄、大麥、草莓、大巖桐、煙草等植物中也有進(jìn)展,本文總結(jié)了近些年來miR159-GAMYB途徑調(diào)控植物生長發(fā)育和脅迫響應(yīng)的相關(guān)研究,為今后相關(guān)研究提供參考。
在模式植物擬南芥(Arabidopsis thaliana)中,MIR159基 因 家 族 包 括MIR159a、MIR159b、MIR159c三種,其編碼的3種成熟miR159(miR159a、miR159b、miR159c)序列相差1-2個堿基,其中,miR159a與miR159b相 差1個 堿 基,miR159a與miR159c相差2個堿 基[12]。研 究表明miR159a和miR159b是擬南芥miR159家族成員中表達(dá)量最高的,有著相同的表達(dá)模式且廣泛分布于植株各部位,尤其是在芽和根部分生組織中,但是在花藥中缺乏,在種子中表達(dá)較弱;miR159c表達(dá)非常弱,主要分布在花藥和頂芽區(qū)域[12-14]。
在 擬 南 芥 中 有7個GAMYB-like基 因,包括MYB33、MYB65、MYB81、MYB97、MYB101、MYB104、MYB120[15-16],其 中 除MYB104尚 沒 有功能報道外,其余的GAMYB-like基因在擬南芥生命活動中有著重要作用,這些GAMYB-like基因有著保守的miR159結(jié)合位點(diǎn),生物信息學(xué)分析和5'-RACE分析表明它們是miR159的靶基因[14],而降解組測序表明MYB33和MYB65是miR159的主要靶 基 因[16-17],對MYB33和MYB65的mRNA結(jié) 構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)MYB33/65的miR159結(jié)合位點(diǎn)旁有獨(dú)特的二級結(jié)構(gòu)[18],而其他GAMYB-like基因沒有,這種結(jié)構(gòu)有助于miR159沉默MYB33/65。組織表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)MYB33和MYB65在全株都有大量表達(dá),MYB81/97/101/120主 要 在 花 藥 中 表 達(dá)[13,19],而miR159在花藥中表達(dá)很弱,miR159和GAMYB的這種組織表達(dá)差異[20]對于擬南芥生長發(fā)育有著重要意義。
在水稻中,Os-miR159a和Os-miR159b有著相同的成熟序列,其靶基因包括1個GAMYB基因和2個GAMYB-like(OsGAMYBL1和OsGAMYBL2)基因,Os-miR159在葉子和花中都表達(dá),3個OsGAMYB同源基因在葉中的表達(dá)顯著高于花中,且OsGAMYB和OsGAMYBL1的 表 達(dá) 顯 著 高 于OsGAMYBL2[21]。5'-RACE表 明Os-miR159裂 解OsGAMYB和OsGAMYBL1,不 裂 解OsGAMYBL2,miR159調(diào) 控GAMYB機(jī)制存在于水稻葉和花中[21]。
miR159裂解靶基因GAMYB來發(fā)揮調(diào)控功能的機(jī)制廣泛存在于植物中,miR159-GAMYB途徑在植物中高度保守,miR159調(diào)控其他靶基因途徑在植物中并不具有保守性[22]。
在擬南芥營養(yǎng)組織中,MYB33和MYB65大量轉(zhuǎn)錄,miR159通過裂解MYB33和MYB65來保證擬南芥的正常生長,研究表明MYB33和MYB65的表達(dá)會帶來多種生長缺陷,包括生長延緩、株型矮小、葉子卷曲等。在擬南芥T-DNA功能缺失突變 體mir159ab中,MYB33和MYB65的 表 達(dá) 量 上升[13],出現(xiàn)了多種表型缺陷包括生長延緩、葉子卷曲、角果和種子變小、種子畸形等[13-14,19],通過突變MYB33的miR159結(jié)合位點(diǎn)構(gòu)建mMYB33擬南芥,發(fā)現(xiàn)mMYB33擬南芥也出現(xiàn)了與mir159ab擬南芥相似的表型缺陷[13,23]。在更進(jìn)一步的研究中構(gòu)建了T-DNA myb33myb65mir159ab四突變體,結(jié)果表明所有mir159ab雙突變體的表型缺陷在myb33myb65mir159ab四突變體中都受到抑制[13]。細(xì)胞學(xué)上觀察mir159ab擬南芥的莖尖組織和葉組織發(fā)現(xiàn),mir159ab擬南芥莖尖分生組織變得肥大,葉片的葉肉細(xì)胞數(shù)量顯著減少,葉表皮細(xì)胞尺寸變小和數(shù)量減少,說明MYB33和MYB65的表達(dá)抑制了細(xì)胞的增殖[13]。分子層面分析表明mir159ab擬南芥中MYB33和MYB65的解除導(dǎo)致蓮座葉和花組織中與糊粉相關(guān)的基因上升,包括一些水解酶和細(xì)胞程序性死亡(PCD)相關(guān)的基因,如CP1(CYS PROTEINASE1),GASA1(GA-REGULATED GENE1),DMC1(DISRUPTED MEIOTIC CONTROL1),BLX1(BETAXYLOSIDASE1)和BXL2,但是利用臺盼藍(lán)染色發(fā)現(xiàn)蓮座葉中MYB33和MYB65的表達(dá)并沒有促進(jìn)細(xì)胞程序性死亡[13]。這些研究表明MYB33和MYB65的表達(dá)對擬南芥營養(yǎng)生長有害[13],而miR159通過裂解MYB33、MYB65來維持?jǐn)M南芥正常營養(yǎng)生長。同樣,利用人工microRNA靶基因模擬技術(shù)構(gòu)建抑制miR159活性的MIMIC159(MIM159)擬南芥,結(jié)果MIM159擬南芥出現(xiàn)植株矮小、葉子上卷變圓、節(jié)間縮短等營養(yǎng)生長缺陷[24-26],說明miR159的表達(dá)對擬南芥營養(yǎng)生長至關(guān)重要。
在 水 稻(Oryza sativa)中miR159-GAMYB調(diào)控水稻營養(yǎng)生長。Zhao等[27]利用STTM(short tandem target mimic)技術(shù)構(gòu)建了抑制miR159活性的STTM159水稻,結(jié)果表明在STTM159水稻中2個miR159的 靶 基 因OsGAMYB1和OsGAMYBL1(GAMYB-LIKE 1)表達(dá)上升,STTM159水稻表現(xiàn)一系列生長缺陷包括植株高度變小,葉、圓錐花序尺寸變小、節(jié)間縮短等。對莖和葉脈橫截面觀察發(fā)現(xiàn),野生型水稻莖比STTM159水稻莖具有更多的小維管束細(xì)胞,葉具有更多的小葉脈。GO(gene ontology)富集分析表明在STTM159水稻7 000多個基因中,關(guān)于細(xì)胞周期、生長、信號傳導(dǎo)等基因受到負(fù)調(diào)控,關(guān)于生物脅迫、細(xì)胞程序性死亡、營養(yǎng)素水平反應(yīng)的基因受到正調(diào)控。在MIM159水稻中,OsGAMYB1和OsGAMYBL1的表達(dá)上升,出現(xiàn)了與MIM159擬南芥相似的表型缺陷,包括植株矮小,生長延緩,劍葉短小等[21]。
Zheng等[21]對另一種模式植物煙草(Nicotiana tabacum)進(jìn) 行 探 究 發(fā) 現(xiàn),MIM159煙 草 中3個NtGAMYB(NtGAMYB1、NtGAMYB2、NtGAMYB3)同源基因表達(dá)量上升,出現(xiàn)了與MIM159擬南芥相似的表型缺陷,包括株型矮小、葉子更小更皺等,對NtGAMYB基因進(jìn)行煙草遺傳轉(zhuǎn)化發(fā)現(xiàn),35S-NtGAMYB2煙草無明顯發(fā)育表型缺陷,而35S-mNtGAMYB2(miR159結(jié)合位點(diǎn)突變)煙草出現(xiàn)了與MIM159煙草相似的表型缺陷,表明miR159裂解調(diào)控NtGAMYB來發(fā)揮作用。利用GO富集分析發(fā)現(xiàn)MIM159煙草中有關(guān)脅迫響應(yīng)、細(xì)胞程序性死亡的基因表達(dá)上升,有關(guān)形態(tài)學(xué)、細(xì)胞周期、細(xì)胞大小相關(guān)的基因表達(dá)下降。這些實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了GAMYB對營養(yǎng)生長的抑制功能,表明miR159通過裂解NtGAMYB來保證煙草正常的營養(yǎng)生長。
Kim等[28]對楊樹(Populus alba×P.tremula var.Glandulosa)GAMYB-like基 因PtrMYB012進(jìn) 行 擬 南芥異源表達(dá)轉(zhuǎn)化,結(jié)果表明35S:PtrMYB012過表達(dá)的擬南芥蓮座葉上卷、矮小和雄性不育,這與mMYB33擬南芥和mir159ab擬南芥的表型缺陷相似,但是35S:PtrMYB012楊樹沒有明顯的表型缺陷,說明PtrMYB012被楊樹的miR159裂解但是不被擬南芥的miR159裂解。對煙草、水稻和日本落葉松(Larix kaempferi)GAMYB基因進(jìn)行擬南芥異源過表達(dá)轉(zhuǎn)化,發(fā)現(xiàn)mNtGAMYB2擬南芥、mOsGAMYB擬南芥和mLaMYB33擬南芥這些過表達(dá)株系同樣出現(xiàn)了與mMYB33擬南芥一樣的表型缺陷,包括生長嚴(yán)重遲緩、植物矮小、葉子卷曲等[21],在這些株系中,CP1的表達(dá)顯著上升,表明了GAMYB在不同植物中激活了相似的下游基因。
以上研究表明,GAMYB的表達(dá)對植物營養(yǎng)生長有諸多害處包括生長遲緩矮小、葉子卷曲等且這種功能是保守的[21],miR159通過裂解調(diào)控GAMYB來保證植物的正常營養(yǎng)生長。但是這種功能在一些植物中還存在差異:在MIM159番茄(Solanum lycopersicum)中,miR159的 靶 基 因SlGAMYB1和SlGAMYB2表達(dá)量上升,MIM159番茄比野生型番茄植株更高,推測GAMYB可能促進(jìn)莖的伸長[29],這與之前水稻[30-31]中研究相似;在35S:MIM159大巖桐(Sinningia speciosa)中,SsGAMYB表達(dá)量顯著上升,但并沒有表現(xiàn)出營養(yǎng)生長上的缺陷[32];Hou等[33]從青菜(Brassica rapa ssp. Chinensis)中分離1個GAMYB基因BcMYB101,BcMYB101在青菜葉、葉柄、根和花器官中高表達(dá),BcMYB101異源過表達(dá)擬南芥表現(xiàn)為擬南芥葉子下卷、蓮葉數(shù)變多,而通過病毒誘導(dǎo)基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)技術(shù)沉默BcMYB101導(dǎo)致青菜葉子上卷。
在 擬 南 芥 根 中,MYB65促 進(jìn) 細(xì) 胞 增 殖[34]。mir159ab雙突變體中,MYB33、MYB65、MYB101表達(dá)量上升,mir159ab雙突變體比野生型的根更長、分生組織更大、分生區(qū)和伸長區(qū)的細(xì)胞更多更長,且mMYB33/mMYB65/mMYB101擬南芥都表現(xiàn)出與mir159ab擬南芥根相似的特征,這些表明miR159通過裂解MYB33、MYB65、MYB101進(jìn)而抑制主根生長[34]。
擬南芥GAMYB對根生長具有促進(jìn)作用,包括促進(jìn)根伸長生長和細(xì)胞增殖;而在其他營養(yǎng)組織中GAMYB具有強(qiáng)烈的抑制作用,包括抑制植株生長和莖葉細(xì)胞增殖,這其中的機(jī)理還需要進(jìn)一步探究,同時miR159-GAMYB途徑在根中的功能研究還需在其他植物中擴(kuò)展。
花藥是雄蕊的重要組成,位于花絲頂端,膨大呈囊狀。植物花藥發(fā)育主要分為兩個階段,第一階段由雄蕊原基開始發(fā)育,經(jīng)過組織特化、減數(shù)分裂形成完整的花粉囊壁,從外到內(nèi)依次是表皮層、纖維層、中層和絨氈層,在藥室中心分布著小孢子的四分體結(jié)構(gòu);第二階段花藥繼續(xù)膨大,花絲伸長,小孢子由四分體結(jié)構(gòu)發(fā)育成花粉粒,花粉囊開裂釋放花粉,進(jìn)而完成授粉受精過程[35]?;ㄋ幖盎ǚ勰芊裾0l(fā)育關(guān)系到植物是否可育,因此花藥和花粉對植物生命過程有著至關(guān)重要的作用。
2.2.1 miR159-GAMYB調(diào)控擬南芥花藥和花粉發(fā)育 在擬南芥花藥中,miR159家族中只有miR159c在花藥中少量表達(dá),研究表明MIR159c不是1個假基因,但是活性非常弱其作用可以忽略[14],而GAMYB-like基因主要在花藥中表達(dá)[13,19],這種組織表達(dá)差異對擬南芥花藥發(fā)育至關(guān)重要。
絨氈層是花粉囊最內(nèi)層的由花藥次級壁細(xì)胞分化而成的特殊體細(xì)胞,包圍著小孢子,絨氈層在小孢子從四分體釋放后開始降解,在花粉成熟時期完全降解。它在花藥和花粉的發(fā)育中發(fā)揮著重要作用:為孢子母細(xì)胞提供營養(yǎng)物質(zhì);合成分泌孢粉素到花粉壁上,增強(qiáng)花粉的穩(wěn)定性;合成并分泌可以分解四分體的胼胝體外壁的胼胝體酶,從而四分體釋放小孢子。絨氈層的降解是一個細(xì)胞程序性死亡的過程,調(diào)控絨氈層細(xì)胞程序性死亡的一些基因的突變常會使絨氈層不能正常降解,從而使花藥不能正常發(fā)育,最終導(dǎo)致雄性不育。
Millar等[23]發(fā)現(xiàn)擬南芥MYB33和MYB65調(diào)控絨氈層細(xì)胞程序性死亡,myb33myb65雙突變體在花粉母細(xì)胞階段花藥的絨氈層腫大導(dǎo)致花粉減數(shù)分裂前的敗育,但是在高光強(qiáng)和低溫條件會減少敗育,myb33或myb65單突變體沒有花藥表型缺陷,說明MYB33和MYB65在花藥發(fā)育上功能冗余。在35S:miR159a過表達(dá)擬南芥中也出現(xiàn)了雄蕊不育表型缺陷,花藥不能釋放花粉。
胞質(zhì)分裂同時植物在雄性減數(shù)分裂末期Ⅱ以后,子核胞質(zhì)區(qū)域會形成輻射狀微管系統(tǒng)(radial microtubule arrays,RMAs),調(diào)節(jié)胞質(zhì)向心收縮進(jìn)而促進(jìn)細(xì)胞分裂。研究表明擬南芥MYB33和MYB65還可以影響雄性減數(shù)分裂Ⅱ時期的輻射狀微管排列的形成和胞質(zhì)分離,在myb33myb65雙突變體中,減數(shù)分裂胞質(zhì)分離異常并產(chǎn)生二倍體花粉粒和缺少富含蛋白的細(xì)胞外壁,導(dǎo)致花粉壁形態(tài)異常,而myb33或myb65單突變體并無此表型缺陷,說明MYB33和MYB65雄性減數(shù)分裂上功能冗余[36]。
植物的精細(xì)胞譜系發(fā)育過程是一個獨(dú)特重要的生命過程,在此過程中,單倍體小孢子經(jīng)過不對稱有絲分裂產(chǎn)生一個較大的營養(yǎng)細(xì)胞和一個包裹其中的較小的生殖細(xì)胞,然后生殖細(xì)胞繼續(xù)分裂形成兩個精細(xì)胞。最近的研究表明MYB81可以促進(jìn)雄性小孢子發(fā)育,Oh等[37]發(fā)現(xiàn)擬南芥myb81突變體的花粉有一半異常,其小孢子不能進(jìn)行有絲分裂第一階段過程,在極化階段就中止了,進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)MYB81作為GAMYB轉(zhuǎn)錄因子促進(jìn)有絲分裂第一階段和兩個雄性細(xì)胞譜系形成,對擬南芥的雄性小孢子發(fā)育和性成熟至關(guān)重要。
花粉管是從花粉萌發(fā)孔伸出而形成的管狀結(jié)構(gòu),花粉粒的內(nèi)壁通過花粉外壁上的萌發(fā)孔或溝向外伸出的細(xì)管進(jìn)而形成花粉管,其主要作用是將其攜帶的精子和其他內(nèi)容物運(yùn)至卵器或卵細(xì)胞內(nèi),來完成受精作用。研究表明擬南芥MYB97、MYB101、MYB120影響花粉管感應(yīng)雄配子,MYB97、MYB101、MYB120主要在成熟花粉粒中表達(dá),在成熟花粉中,MYB97、MYB101、MYB120的表達(dá)量明顯高于其他幾類GAMYB基因且它們有著相同的表達(dá)模式[38],三 突 變 體(myb97-1 myb101-1 myb120-3,myb97-1 myb101-2 myb120-3 和myb97-1 myb101-3 myb120-3)擬南芥比野生型擬南芥有著更小的角果(這些角果中有許多不育的胚珠)和更低的結(jié)實(shí)率,雄配子有缺陷[35],且其花粉管不能釋放精細(xì)胞到胚中,進(jìn)一步的研究表明MYB97、MYB101、MYB120調(diào)控下游花粉管基因的表達(dá)(這些基因有關(guān)于糖類活性酶、小蛋白、轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的合成[39]),進(jìn)而影響花粉管感應(yīng)雄配子和花粉管細(xì)胞促進(jìn)花粉管分化釋放精細(xì)胞[38-39],任何一個單突變體或者雙突變體都沒有出現(xiàn)花粉表型缺陷,說明MYB101、MYB104、MYB120在花藥發(fā)育上功能冗余[38-39]。
植物受精是植物有性生殖的核心環(huán)節(jié),miR159-GAMYB途徑在這一過程中對中央細(xì)胞受精發(fā)育有著重要的作用,影響植物的育性和種子發(fā)育。中央細(xì)胞是胚囊的組成細(xì)胞之一,是一個大型的液泡化細(xì)胞,內(nèi)含二核叫做極核,受精的中央細(xì)胞又稱“受精極核”,中央細(xì)胞在受精后發(fā)育為胚乳。Zhao等[40]發(fā)現(xiàn)mir159abc擬南芥的中央細(xì)胞不能正常分裂而導(dǎo)致結(jié)實(shí)率降低,在受精前,擬南芥胚囊中央細(xì)胞的MYB33和MYB65表達(dá)量很高;在受精后,野生型擬南芥中央細(xì)胞MYB33和MYB65表達(dá)很低,mir159abc擬南芥中央細(xì)胞MYB33和MYB65表達(dá)依舊很高,且mir159abc擬南芥與mMYB33擬南芥一樣,胚乳核分裂受到明顯抑制。這些說明花粉中的miR159傳輸?shù)街醒爰?xì)胞來降解MYB33和MYB65進(jìn)而促進(jìn)胚乳核分裂。
2.2.2 miR159-GAMYB調(diào)控其他植物花藥和花粉發(fā)育 在其他植物花藥中,GAMYB的正常表達(dá)對于花藥的正常發(fā)育有著重要作用,miR159通過調(diào)控GAMYB進(jìn)而調(diào)控花藥發(fā)育。
在水稻花藥中,miR159和OsGAMYB共表達(dá),miR159對OsGAMYB的表達(dá)起著微調(diào)(fine-tune)的作用,在花藥發(fā)育期間miR159a水平下降導(dǎo)致其2個靶基因OsGAMYB和OsGAMYBL1表達(dá)上升[30]。水稻花藥中,miR159-GAMYB影響烏氏體和外孢壁的發(fā)育。烏氏體是花藥絨氈層內(nèi)表面上的一種僅數(shù)微米大小的顆粒物,烏氏體參與絨氈層壁的降解、花粉外壁的形成、識別蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)等,對花粉的發(fā)育有著重要作用。研究表明水稻gamyb突變體花器官發(fā)育異常尤其是花藥,表現(xiàn)為絨氈層不能正常程序性死亡、烏氏體和外孢壁有缺陷,從而導(dǎo)致雄蕊不育,更進(jìn)一步的分析表明GAMYB結(jié)合在CYP703A3基因的啟動子上來促進(jìn)其在花藥發(fā)育中的表達(dá),從而保證烏氏體和外孢壁的正常形成[41]。
植物花藥的開裂保證成熟花粉的釋放,以完成授粉受精過程。花藥壁組織的脫水、酶解和花藥藥室內(nèi)壁的次生加厚等過程都會影響花藥的開裂,其中藥室內(nèi)壁的次生加厚為花藥開裂提供一種機(jī)械力量,對花藥開裂至關(guān)重要。侯丹[42]對毛竹(Phyllostachys edulis)的PhemiR159進(jìn) 行 擬 南芥過表達(dá)發(fā)現(xiàn)過表達(dá)擬南芥花藥內(nèi)皮層缺乏次生加厚、裂口區(qū)缺少機(jī)械外力而無法開裂,qRT-PCR結(jié)果表明與擬南芥花藥開裂相關(guān)的MYB26、NST1(NAC SECONDARY WALL THICKENING PROMOTING FACTOR1)、NST2 等基因的表達(dá)量在超表達(dá)株系中均發(fā)生顯著變化,推測毛竹PhemiR159可能通過負(fù)調(diào)控擬南芥AtMYB33來調(diào)節(jié)這些次生加厚相關(guān)基因的表達(dá),從而影響PhemiR159過表達(dá)擬南芥株系的花藥開裂。
糖是植物光合作用的產(chǎn)物和呼吸作用的底物,葉片光合作用產(chǎn)生的碳水化合物通過韌皮部轉(zhuǎn)運(yùn)到植物的各個部分,為其生長發(fā)育提供碳和能量,如花藥發(fā)育、花粉管萌發(fā)、種子果實(shí)的膨大成熟等。研究表明在番茄中GAMYB可以調(diào)控糖類代謝基因進(jìn)而調(diào)控花藥發(fā)育,Zhang等[43]利用RNAi技術(shù)沉默番茄中的GAMYB-like基因SlMYB33,發(fā)現(xiàn)SlMYB33-RNAi番茄出現(xiàn)花粉成熟異常并導(dǎo)致低育性,進(jìn)一步分析表明SlMYB33-RNAi番茄花粉中有關(guān)于蔗糖、淀粉代謝和糖類運(yùn)輸?shù)幕虮磉_(dá)受到抑制。
胡 紫 蔚[44]構(gòu) 建 了 白 菜(Brassica campestris)MIR159a和MIR159c過表達(dá)載體,遺傳轉(zhuǎn)化菜心,結(jié)果發(fā)現(xiàn)過表達(dá)35S:MIR159a白菜和35S:MIR159c白菜都會引起花粉敗育,且花粉敗育都是由于花粉粒內(nèi)含物降解導(dǎo)致花粉內(nèi)壁消失,進(jìn)而引起花粉皺縮,不過白菜過表達(dá)MIR159a和 MIR159c植株花粉出現(xiàn)敗育的時期不同,過表達(dá)MIR159a白菜產(chǎn)生的花粉敗育比例要高于過表達(dá)MIR159c白菜,且過表達(dá)MIR159a白菜的花粉管萌發(fā)異常[44-45]。
在黃瓜中,GAMYB可以調(diào)控雌雄花的比例,利用RNAi技術(shù)沉默黃瓜中的CsGAMYB1,結(jié)果為CsGAMYB1-RNAi黃瓜雄花和雌花的比例降低[46],黃瓜CsGAMYB1在擬南芥中異源過表達(dá)會導(dǎo)致擬南芥雄性不育[46]。
過表達(dá)HvGAMYB會導(dǎo)致大麥花粉不育,花藥體型變大、顏色更亮[47]。在小麥Ubi∷TamiR159異源過表達(dá)水稻中,表現(xiàn)為育性降低,花藥中無花粉,但Ubi∷TamiR159水稻中絨氈層能夠正常分解,其雄性不孕花粉不能正常產(chǎn)生的原因還不清楚[48]。
2.3.1 miR159-GAMYB調(diào)控種子萌發(fā) 糊粉粒是植物細(xì)胞內(nèi)儲藏蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),每個糊粉粒是一個液泡,其中儲藏大量蛋白質(zhì)。糊粉??梢赞D(zhuǎn)運(yùn)養(yǎng)分和積累營養(yǎng)物質(zhì),在種子萌發(fā)中,糊粉開始細(xì)胞程序性死亡,為種子萌發(fā)提供營養(yǎng)和水解酶,禾本科植物種子的糊粉粒集中在胚乳的外層細(xì)胞中,形成糊粉層。GAMYB早期被發(fā)現(xiàn)在大麥糊粉中調(diào)控細(xì)胞程序性死亡[26,49],這一功能后來在擬南芥、水稻都被證實(shí)。
在擬南芥種子中,MYB33、MYB65、MYB101促進(jìn)糊粉的細(xì)胞程序性死亡,研究表明在myb33myb65myb101三突變體中出現(xiàn)了糊粉細(xì)胞空泡化,同時對mir159ab雙突變體擬南芥營養(yǎng)組織中進(jìn)行深入探究,發(fā)現(xiàn)MYB33和MYB65的解除導(dǎo)致了有關(guān)糊粉的基因表達(dá)上升,包括一些水解酶和細(xì)胞程序性死亡相關(guān)的基因,如CP1、CP、GASA1、BXL1和BXL2,這些基因在myb33myb65myb101三突變體的種子中表達(dá)都下降了[19]。值得注意的是,miR159在擬南芥種子和GAMYB共表達(dá),研究表明隨著種子萌發(fā)MYB33的表達(dá)水平逐漸降低,miR159的活性處于衰減狀態(tài),miR159對MYB33的表達(dá)只是微調(diào)的作用[50]。在水稻種子中,OsGAMYB促進(jìn)糊粉細(xì)胞的細(xì)胞程序性死亡,不過在水稻中,miR159的表達(dá)很低并不參與調(diào)控OsGAMYB[14]。番茄的GAMYB-like基因LeGAMYBL1在種子的胚和胚乳中表達(dá),并且在種子萌發(fā)中表達(dá)量上升[51]。
2.3.2 miR159-GAMYB 調(diào)控果實(shí)發(fā)育 miR159-GAMYB在番茄和葡萄中可以促進(jìn)單性結(jié)實(shí)。在番茄中,miR59和SlGAMYB在開花前的子房中共同表達(dá),SlMIR159過表達(dá)導(dǎo)致SlGAMYB表達(dá)下降,并致使果實(shí)早熟單性結(jié)實(shí)[29]。在葡萄中,外源GA處理促進(jìn)葡萄單性結(jié)實(shí),并且GA處理使VvmiR159c受到正調(diào)控,VvGAMYB受到負(fù)調(diào)控[52]。
miR159-GAMYB可以調(diào)控草莓花托的發(fā)育。在草莓花托發(fā)育不同階段,草莓的Fa-MIR159a、Fa-MIR159b表現(xiàn)為不同程度的表達(dá),且與它們的靶基因FaGAMYB呈負(fù)相關(guān)[53]。Vallarino等[54]用RNAi沉默草莓中的FaGAMYB,發(fā)現(xiàn)FaGAMYB-RNAi草莓中FaGAMYB下降并且花托成熟中止,顏色形成受到抑制。
在番茄中,GAMYB可以促進(jìn)果實(shí)增大。研究表明,SlMYB33-RNAi番茄比野生型的番茄果實(shí)更?。?3]。對番茄SlGAMYB進(jìn)行過表達(dá)轉(zhuǎn)化,發(fā)現(xiàn)SlMYB33過表達(dá)番茄的果實(shí)更大[55]。
植物開花誘導(dǎo)受內(nèi)源因素和外源因素共同影響,主要受光周期途徑、春化作用、自主途徑和赤霉素途徑四大途徑的影響,這些途徑最后都匯 聚 于LFY(LEAFY)、SOC1(SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CO1)、FT(FLOWERING LOCUS T)等調(diào)節(jié)因子的轉(zhuǎn)錄上。miR159-GAMYB途徑在植物開花誘導(dǎo)上的功能目前還尚有爭論[18]。
在擬南芥中,MYB33可以結(jié)合在LFY的啟動子上來激活其表達(dá)并促進(jìn)開花[56],35S:miR159a過表達(dá)擬南芥(Landsberg型)在短日照(SD)下延遲開花,花中的MYB33和LFY表達(dá)下降,推測是MYB33調(diào)控LFY下降從而延遲開花[57];小麥Ubi∷TamiR159異源過表達(dá)水稻開花延遲[48];在葡萄中通過外源性GA處理實(shí)驗(yàn)表明miR159裂解VvGAMYB進(jìn)而抑制VvGAMYB下游的VvLFY的表達(dá)來抑制開花[58];在大巖桐中miR159調(diào)控GAMYB影響了其下游有關(guān)開花的SsLEAFY和3個MADS-box基因即SsAP1(APETALA1),SsAP3,SsAG基因的表達(dá),在短日照條件下35S:miR159a過表達(dá)導(dǎo)致大巖桐開花延遲,35S:MIM159中miR159被抑制則導(dǎo)致大巖桐開花提前[32];在番茄中,SlMYB33-RNAi番茄表現(xiàn)為開花延遲[43]。這些表明GAMYB促進(jìn)植物開花,而miR159通過抑制GAMYB進(jìn)而抑制植物開花。
然而,Schwab等[59]發(fā)現(xiàn)35S:miR159a過 表達(dá)擬南芥(Columbia型)花中沒有表現(xiàn)MYB33、MYB65的水平降低,且沒有開花時期的變化。在短日照下mir159ab擬南芥(Columbia型)表現(xiàn)為開花延遲(可能有mir159ab擬南芥營養(yǎng)生長缺陷的影響),myb33myb65擬南芥開花時間與野生型一樣,這些說明MYB33和MYB65并不會促進(jìn)或者是抑制開花[19]。MIM159煙草與mir159ab擬南芥一樣表現(xiàn)為植株矮小、葉片又小又皺等營養(yǎng)生長缺陷和開花延遲[21]。mMYB33擬南芥和外源性赤霉素處理野生擬南芥(Landsberg型)導(dǎo)致的MYB33過表達(dá)只是輕微提前開花[57]。張波等[55]對番茄SlGAMYB進(jìn)行過表達(dá)轉(zhuǎn)化,發(fā)現(xiàn)SlGAMYB過表達(dá)番茄開花延遲,推測可能是因?yàn)閯┝啃?yīng),即SlGAMYB的過量會起到反效果。以上這些說明GAMYB可能抑制開花,這與GAMYB普遍表現(xiàn)為促進(jìn)開花相矛盾。
miR159-GAMYB在開花調(diào)控中存在較大差異,尤其是GAMYB的功能差異,這可能是亞型的差異、其他調(diào)控機(jī)制[60]的影響或是其他原因還尚不得知。植物開花誘導(dǎo)是一個及其復(fù)雜的調(diào)控過程,miR159-GAMYB調(diào)控植物開花誘導(dǎo)的分子機(jī)理還需進(jìn)一步研究。
在 擬 南 芥[24-25]和 大 巖 桐[32]中,miR159-GAMYB途徑還調(diào)控植物花器官發(fā)育。這些說明,miR159-GAMYB途徑對植物生長發(fā)育的各個過程有著重要作用(表1),因此研究miR159-GAMYB的調(diào)控機(jī)理、生物功能等有著極高的價值、意義和廣泛的前景。
表1 miR159-GAMYB途徑調(diào)控植物生長發(fā)育研究進(jìn)展Table 1 Research progress of miR159-GAMYB pathway regulating plants growth and development
miR159-GAMYB途徑響應(yīng)病原菌感染。最近的研究發(fā)現(xiàn)在百合(Lilium regale)中,Lre-miR159a抑制其靶基因LrGAMYB來響應(yīng)植株抵御灰霉菌(Botrytis elliptica),對擬南芥進(jìn)行異源過表達(dá)發(fā)現(xiàn)Lre-MIR159a擬南芥比野生型和LrGAMYB擬南芥(比野生型對灰霉菌感染更敏感)對灰霉菌有更強(qiáng)的抵御能力,Lre-MIR159a擬南芥中MYB33/65的水平下降,進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)Lre-MIR159a擬南芥中茉莉酸和水楊酸相關(guān)的基因表達(dá)上升,包括AtPR1(ATHOGENESIS-RELATED PROTEINS),AtPR2,AtNPR1(NONEXPRESSOR OF PATHOGENESISRELATED),AtPDF1.2(PLANT DEFFINSIN1.2)和AtLOX(LIPOXYGENASE)[61]。在煙草中,miR159-GAMYB響應(yīng)疫霉菌(Phytophthora parasitica)感染,Zheng等[21]發(fā)現(xiàn)MIM159煙草比野生型顯著增強(qiáng)了對疫霉菌的抵抗力,進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)MIM159煙草和mNtGAMYB煙草葉片中關(guān)于防御響應(yīng)的PRs等基因顯著上升,但是在MIM159擬南芥、MIM159水稻和mGAMYB(mAtMYB33、mOsGAMYB、mLaGAMYB和mNtGAMYB)擬南芥中PRs基因并沒有明顯變化,說明這種脅迫的分子調(diào)控機(jī)制并不具有保守性。
miR159-GAMYB途徑響應(yīng)根結(jié)線蟲。植物受病原刺激或蟲害而出現(xiàn)的局部增生叫做蟲癭,感染根結(jié)線蟲擬南芥的根部蟲癭中miR159表達(dá)上升,MYB33∷GUS只在蟲癭早期表達(dá)而在后期則無表達(dá),說明了miR159調(diào)控MYB33響應(yīng)根結(jié)線蟲,并且擬南芥mir159abc三突變體能顯著增強(qiáng)對根結(jié)線蟲的抵抗力[62]。miR159-GAMYB響應(yīng)根結(jié)線蟲的機(jī)理還需深入研究。
病毒感染可以破壞擬南芥miR159的活性并造成與mir159ab擬南芥相似的生長缺陷。研究表明非洲木薯(Manihot esculenta)花葉病毒編碼的AC4蛋白[63]和黃瓜花葉病毒編碼的CMV(Cucumber mosaic virus)2b蛋白[64]可以與擬南芥miR159相結(jié)合,阻 止miR159對MYB33和MYB65的 調(diào) 控,MYB33和MYB65的表達(dá)上升。Li等[65]用編碼沉默抑制蛋白P0的病毒構(gòu)建了35S-P0過表達(dá)擬南芥,發(fā)現(xiàn)35S-P0擬南芥表型與mir159ab相似,進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)蓮座葉中MYB33/65表達(dá)上升,但是表達(dá)量只有幾倍上升,說明病毒蛋白的沉默效果不是很強(qiáng)。
miR159-GAMYB響應(yīng)干旱脅迫。在種子萌發(fā)中,ABA水平下降來促進(jìn)種子萌發(fā)成苗,研究表明ABA-miR159-GAMYB通路影響種子萌發(fā),在干旱條件下,擬南芥種子中miR159響應(yīng)ABA并且表達(dá)量上升,MYB33和MYB101水平下降,進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)MYB33和MYB101對ABA敏 感,而miR159通過抑制MYB33和MYB101來響應(yīng)非生物脅迫,進(jìn)而影響種子萌發(fā)[66]。在馬鈴薯(Solanum tuberosum)中,干旱脅迫下miR159表達(dá)下降GAMYB表達(dá)上升[67]。對 小 麥 的miR159和TaGAMYB1進(jìn) 行 水 稻異源過表達(dá),發(fā)現(xiàn)Ubi∷miR159水稻比野生型對干旱脅迫更敏感,表現(xiàn)為植株枯萎和生長緩慢,而Ubi∷mTaGAMYB1水稻無明顯變化,說明小麥
miR159裂解水稻OsGAMYB參與干旱脅迫響應(yīng),進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),myb33myb65擬南芥在干旱脅迫下與Ubi∷miR159水稻的表型相似,對干旱脅迫敏感[48]。這些說明miR159-GAMYB途徑響應(yīng)干旱脅迫在植物間并不具有功能保守性。在鹽脅迫下,miR159的響應(yīng)在不同植物間也出現(xiàn)了差異[68],這其中的機(jī)理尚不清楚。
miR159在擬南芥營養(yǎng)組織中強(qiáng)烈沉默MYB33/65,且這種機(jī)制不受任何脅迫的影響。在ABA、干旱、寒冷、高溫等脅迫下,mir159abmyb-33myb65擬南芥與野生型一樣無響應(yīng),而且進(jìn)一步研究表明這些脅迫無法抑制野生型擬南芥miR159從而使MYB33和MYB65表達(dá)[65]。擬南芥營養(yǎng)組織中miR159-GAMYB途徑響應(yīng)非生物脅迫的機(jī)理還尚不清楚。
miR159-GAMYB途徑在植物中高度保守,miR159通過裂解靶基因GAMYB在植物生長發(fā)育、逆境脅迫、信號傳導(dǎo)等有著重要作用。然而越來越多的研究表明,miR159-GAMYB還與其他眾多途徑相互影響,比如脫落酸(ABA)[66]、赤霉素(GA)等激素的調(diào)控,與其他microRNAs間的聯(lián)合互作,GAMYB-likes間的二級調(diào)控[14]等。這對全面了解miR159-GAMYB途徑的功能和機(jī)理有著重要作用。
赤霉素(gibberellins,GAs)是一種普遍存在于高等植物的二萜羧酸類化合物,是一類重要的植物激素,目前發(fā)現(xiàn)的100余種赤霉素中只有少量具有活性,如GA1、GA3、GA4、GA7等[69]。赤霉素幾乎參與植物所有的生長發(fā)育過程,包括種子萌發(fā)、幼苗生長、根莖葉的伸長生長、花期、花器官發(fā)育和果實(shí)成熟等[70]。近些年分子生物學(xué)的發(fā)展表明GA信號通路的主要調(diào)控路徑為GA-GID1-DELLA[71-72],這種模式在維管束植物中是高度保守的[71],其中GID1(GIBBERELLIN INSENSITIVE DWARF1) 是GA的受體蛋白,DELLA蛋白是一類阻遏蛋白,屬于GRAS蛋白家族且廣泛分布于植物中,是GA信號中的抑制子。擬南芥基因組中含有5個DELLA蛋 白 成 員,分 別 是GA-INSENSI-TIVE(GAI)、REPRESSOR-OF-GAL-3(RGA)、RGA-LIKE1(RGL1)、RGL2和RGL3,水稻中只有1個DELLA成員,即SLENDER RICE1(SLR1)[73]。GA通 過GID1蛋 白和DELLA蛋白結(jié)合成GA-GID1-DELLA三聚體復(fù)合物,從而調(diào)控植物生長發(fā)育。當(dāng)GA濃度較低時,受體GID1不與GA結(jié)合,DELLA蛋白則與調(diào)控植物生長發(fā)育的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,抑制植物生長發(fā)育。當(dāng)GA濃度較高時,GA-GID1-DELLA形成三聚體來抑制DELLA蛋白的阻遏作用,同時促進(jìn)DELLA蛋白與泛素E3連接酶復(fù)合體(SCFSLY1/GID2)結(jié)合,導(dǎo)致DELLA蛋白泛素化,隨之被26S蛋白酶降解掉,從而消除DELLA蛋白對植物生長的抑制作用[74]。
4.1.1 GA-GAMYB信號通路 GAMYB與GA有著緊密的關(guān)系,因?yàn)樵诖篼湻N子中這類MYB基因編碼的MYB轉(zhuǎn)錄因子可以結(jié)合在GA信號下游基因(包括細(xì)胞程序性死亡、水解酶等相關(guān)基因)啟動子GARE元件中的TAACAA/GA序列上,進(jìn)而激活這些基因的表達(dá),所以命名為GAMYB[9]。GA-GAMYB途徑還存在擬南芥[19]和水稻[30,41]種子糊粉中,番茄種子胚、胚乳[51]和子房[29]中,擬南芥[36]、水稻[30,41]、大麥[47]等植物花藥中,黃瓜花芽[46]中,青菜[33]中等。但是在擬南芥營養(yǎng)組織中,GAMYB不響應(yīng)GA信號,GAMYB不參與擬南芥GA信號調(diào)控開花[19]。
在種子糊粉細(xì)胞和花藥絨氈層中,GAMYB響應(yīng)GA信號促進(jìn)細(xì)胞程序性死亡。GA通過DELLA類蛋白進(jìn)而調(diào)控種子和花藥中的GAMYB,包括擬南芥RGA、GAI蛋白[36],水稻SLR1蛋白[30,41],大麥SLN1(SLENDER1)蛋 白[47]等,GA-DELLAGAMYB通路表現(xiàn)為GA通過解除DELLA蛋白的抑制作用進(jìn)而促進(jìn)GAMYB的表達(dá)。在番茄子房中,GA可能通過生長素來調(diào)控SlGAMYB[29]。
Aya等[75]分析進(jìn)化起源中GA與GAMYB的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)GA調(diào)控通路可能起源于GAMYB調(diào)控通路,在苔蘚(Physcomitrella patens)(缺少GA信號通路)中,其GAMYB同源基因的敲除產(chǎn)生了不正常的孢子,不能形成雄性器官,而是形成異常的雄性器官;在中國石松(Selaginella moellendorffii)中,GA處理能夠促進(jìn)小孢子外壁的形成,通過GA合成抑制則干擾其發(fā)育,由這種功能的相似性推測出GAMYB調(diào)控系統(tǒng)先于GA感應(yīng)系統(tǒng)。
4.1.2 GA-miR159信號通路 miR159響應(yīng)GA信號通路目前還存在很多差異,這其中包括不同種和不同品種間的差異和同一物種不同種類miR159的響應(yīng)差異。
在水稻[30]和擬南芥[19]中,miR159不響應(yīng)GA信號,但是葡萄[52,58,76-77]、草莓[53]、大麥[57]等植物的miR159響應(yīng)GA信號。在葡萄品種(Vitis vinifera L.‘Wink’)中,GA處 理 導(dǎo) 致VvmiR159水平下降,VvGAMYB水平上升[77],而在葡萄品種“醉金香”中,GA處理導(dǎo)致VvmiR159c水平上升,VvGAMYB水平顯著下降[52]。這些說明miR159響應(yīng)GA信號存在物種間和品種間的差異。在‘白羅莎里奧’葡萄(Rosario Bianco)中,外源赤霉素處理后除VvmiR159b在果肉中被GA3上調(diào)表達(dá)外,VvmiR159a/c在果皮、果肉中被GA3處理后均下調(diào)其表達(dá)[76]?!白斫鹣恪逼咸阎?,外源赤霉素處理發(fā)現(xiàn)VvmiR159c在整個開花期間表達(dá)上升,但是VvmiR159a/b卻無明顯變化[52]。在草莓花托中,VvGAMYB受到miR159b的調(diào)控,外源性GA處理導(dǎo)致Fa-MIR159a顯著降低,而Fa-MIR159b無明顯變化,VvGAMYB無明顯變化[53]。這些表明在同一物種中不同miR159響應(yīng)GA信號有差異。
研究發(fā)現(xiàn)GA通過DELLA類蛋白調(diào)控miR159,這其中包括葡萄、大麥等植物。在葡萄中,外源赤霉素處理導(dǎo)致VvmiR159c表達(dá)上升,兩類編碼DELLA類 蛋 白 的VvSLR1和VvRGL1基 因 表 達(dá) 顯著下降,說明GA通過解除DELLA類蛋白來促進(jìn)VvmiR159c表達(dá)[52]。在大麥中,GA解除DELLA蛋白SLN1的抑制作用來促進(jìn)大麥miR159的表達(dá)[57]。
miR159-GAMYB途 徑 與 另 一 種microRNA即miR319及其靶基因TCP(TEOSINTE BRANCHED1、CINCINNATA、PROLIFERATING CELL FATOR)有聯(lián)合互作關(guān)系。在擬南芥中miR159與miR319有高度的相似性,其21個核苷酸有17個核苷酸相同,miR319可以調(diào)控miR159的靶基因GAMYB,但是miR159卻不能調(diào)控miR319的靶基因TCP,不過miR319調(diào)控GAMYB的作用非常弱,而且相對于miR159在植株中廣泛大量表達(dá),miR319在植株中表達(dá)豐度低且范圍小[14,78-79],這也表明miR159在進(jìn)化上與miR319的緊密關(guān)系[22,45]。在MIM159擬南芥中除植株矮小、葉子上卷變圓、節(jié)間縮短等表型缺陷外,還出現(xiàn)了花萼花瓣小發(fā)育不完整,花小,花藥發(fā)育不完整,并且這與MIM319擬南芥的表型缺陷相似[24-25],進(jìn)一步研究表明,TCP4和MYB33轉(zhuǎn)錄因子可以獨(dú)立或者互作形成異源二聚體激活MIR167A的啟動子,miR159和miR319通過抑制MYB33和TCP4進(jìn)而抑制miR167的表達(dá),從而促進(jìn)miR167與花發(fā)育相關(guān)的靶基因ARF6/8(AUXIN RESPONSE FACTOR)的表達(dá),進(jìn)而調(diào)控植物花器官發(fā)育[25],這說明了miR159-miR319-miR167聯(lián)合調(diào)控植物花器官發(fā)育。在番茄中,miR159-SlGAMYBmiR167-SlARF8調(diào)控子房發(fā)育和坐果[29]。
植物營養(yǎng)生長幼年向成年轉(zhuǎn)變是植物發(fā)育的重要過程之一,是植物開花生殖生長的基礎(chǔ),植物的營養(yǎng)階段轉(zhuǎn)變受到保守的miR156-SPLs(SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN-LIKE)途 徑 的 調(diào)控。研究表明miR156-SPL-miR172聯(lián)合調(diào)控植物營養(yǎng)階段轉(zhuǎn)變,在幼苗時期,miR156的表達(dá)非常高,miR172的表達(dá)非常低,隨著植物生長,miR156的表達(dá)逐漸降低,其靶基因SPL9和SPL10的表達(dá)上升,SPL9/10轉(zhuǎn)錄因子可以結(jié)合在miR172的啟動子上來激活其表達(dá),miR172的表達(dá)上升,進(jìn)而完成營養(yǎng)生長從幼年到成年的轉(zhuǎn)變[80]。Guo等[60]發(fā)現(xiàn)mir159ab擬南芥延遲了營養(yǎng)生長且miR156的表達(dá)量上升,進(jìn)一步的研究表明miR159的靶基因MYB33可以結(jié)合在MIR159A、MIR159C及它們的靶基因SPL9的啟動子上來促進(jìn)這些基因的表達(dá)進(jìn)而調(diào)控植物的營養(yǎng)生長轉(zhuǎn)化,這些說明了miR159-MYB33可以調(diào)控下游的miR156和SPL基因發(fā)育來調(diào)控營養(yǎng)生長轉(zhuǎn)化。miR156-SPL途徑還可以調(diào)控植物由營養(yǎng)生長向生殖生長轉(zhuǎn)變[81]。這些為miR159-GAMYB途徑調(diào)控花期提供參考,比如mir159ab擬南芥花期延遲。
miR159-GAMYB途徑對植物生長發(fā)育(圖1)和脅迫響應(yīng)有著重要意義,其中營養(yǎng)生長、雄性生殖、種子育性和萌發(fā)、果實(shí)發(fā)育和脅迫響應(yīng)方面的調(diào)控對農(nóng)作物高產(chǎn)和抗逆培育有著重要參考價值,花期調(diào)控、花器官發(fā)育和營養(yǎng)生長方面的調(diào)控為觀賞植物培育提供了新思路。目前基于此類的研究多在模式植物中開展,受限于轉(zhuǎn)基因遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù)等條件的制約,在其他一些經(jīng)濟(jì)作物和園藝觀賞植物中研究緩慢,這是今后研究的一個重要方向。
圖1 miR159-GAMYB途徑調(diào)控植物生長發(fā)育功能分析Fig.1 Function analysis of miR159-GAMYB pathway regulating plants growth and development
當(dāng)下研究中miR159-GAMYB調(diào)控途徑還有很多爭論和問題:(1)擬南芥營養(yǎng)組織(不包括根)中MYB33/65的表達(dá)抑制營養(yǎng)生長,這其中引起了什么下游事件?激活了什么下游基因?miR159強(qiáng)烈裂解沉默MYB33/65來保證正常營養(yǎng)生長發(fā)育,這種看似多余的調(diào)控機(jī)制有何生物學(xué)意義?GAMYB在擬南芥根和莖葉中功能完全相反,這其中的機(jī)理是什么?(2)雖然眾多研究表明GAMYB抑制植物營養(yǎng)生長,但是GAMYB這種功能是否具有保守性?為什么MIM159番茄的植株更高、MIM159大巖桐無明顯營養(yǎng)生長缺陷?目前miR159-GAMYB調(diào)控植物開花還尚有很多爭論,GAMYB在開花誘導(dǎo)上的功能是什么?(3)miR159和GAMYB在擬南芥種子中共表達(dá),miR159對GAMYB微調(diào)的機(jī)理是什么(這種微調(diào)作用也存在眾多其他植物組織中)?mir159ab擬南芥產(chǎn)生了畸形種子,miR159-GAMYB對畸形種子形成的調(diào)控機(jī)理是什么?(4)MYB33/65的mRNA獨(dú)特二級結(jié)構(gòu)是如何讓miR159沉默MYB33/65?這其中的作用機(jī)制是什么?(5)目前miR159-GAMYB響應(yīng)逆境脅迫的研究多是集中在形態(tài)學(xué)和簡單的分子學(xué)分析上,其中miR159響應(yīng)逆境脅迫的機(jī)理還尚不明確。(6)miR159響應(yīng)GA信號表現(xiàn)出巨大的差異,包括不同miR159的響應(yīng)差異及組織和物種間差異,這種差異的分子機(jī)理是什么?有何生物學(xué)意義?
miR159-GAMYB調(diào)控途徑需要很多完善和補(bǔ)充,其中了解更多的miR159-GAMYB上下游基因、更多層次的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和完善準(zhǔn)確的調(diào)控機(jī)理尤為重要。