黃嫻 李立新 李雙玉 吳麗娜 解金輝
Rh血型系統(tǒng)(ISBT004)包含RHD和RHCE兩個同源連鎖基因,分別編碼D抗原和CcEe抗原,是最重要的紅細(xì)胞血型系統(tǒng)之一。RHAG血型系統(tǒng)(ISBT030)由RHAG基因編碼Rh相關(guān)蛋白RhAG,RhAG蛋白對RhD/CE抗原在紅細(xì)胞膜上的正確連接定位十分重要[1]。RHAG基因變異可導(dǎo)致Rh血型抗原顯著減少,稱為Rhmod[2]。我們通過1例由于RHAG新復(fù)合雜合突變導(dǎo)致的Rhmod家系進(jìn)行血清學(xué)與基因檢測,并采用生物信息學(xué)方法和蛋白結(jié)構(gòu)模型,初步探討這例新的復(fù)合突變導(dǎo)致Rhmod型的分子基礎(chǔ)。
1 研究對象 Rhmod型家系來自天津,先證者父親已故,無兄弟姐妹子女,直系親屬僅現(xiàn)存母親。先證者,女,18歲,無輸血史和妊娠史,因溶血性黃疸收住入院,總膽紅素51 μmol/L,間接膽紅素27 μmol/L,血紅蛋白93 g/L。醫(yī)院初檢為Rh陰性,送檢血液中心進(jìn)行交叉配血,為切脾手術(shù)備血。
2 試劑與儀器 抗C、c、E、e(CE-IMMUNODIAGN OSTIKA公司),抗D試劑4種(上海血液生物,加拿大宜美康,CE-IMMUNODIAGNOSTIKA,Sanquin),DNA提取試劑盒(Magen公司),Taq DNA聚合酶(Takara公司)。微柱凝膠抗球蛋白檢測卡、孵育器、卡式離心機(jī)(BIO-RAD公司),離心機(jī)(KUBOTA公司),分光光度計(jì)(IMPLEN公司),PCR儀(ABI公司),電泳儀(Thermo公司),凝膠成像儀(北京東訊天地)。所有試劑與儀器均在有效期內(nèi)使用。
3 方法
3.1 Rh抗原檢測:采用試管鹽水法、微柱凝膠卡法,使用4種克隆株的抗D試劑檢測先證者RhD抗原。用吸收放散試驗(yàn)檢測其紅細(xì)胞是否表達(dá)微量的D抗原,放散法使用Sanquin公司的酸放散試劑盒。由于樣本量所限,未進(jìn)行RhCE抗原的吸收放散試驗(yàn)。采用試管鹽水法和微柱凝膠卡法檢測所有受試者的RhCE抗原、不規(guī)則抗體篩查和直抗。
3.2 DNA提取及PCR擴(kuò)增:采用蛋白酶K法抽提所有受試者的外周靜脈血DNA,檢測抽提DNA的濃度和純度。自行設(shè)計(jì)RHD、RHCE、RHAG基因所有外顯子的PCR引物(由Invitrogen公司合成),尋最適條件進(jìn)行PCR-SSP。
3.3 DNA測序分析:RHD、RHCE、RHAG的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送Invitrogen公司測序,測序引物使用擴(kuò)增引物。測序結(jié)果用Choromas軟件與ISBT公布的RHD(NG_007494)、RhCE(RhCE*ce,NM_020485)、RHAG(NG_011704)基因序列進(jìn)行比對。先證者母親進(jìn)行相同的PCR擴(kuò)增和RHAG基因測序。
3.4 生物信息學(xué)分析:使用PolyPhen-2和Provean兩個在線生物信息學(xué)軟件,分析氨基酸變異對蛋白質(zhì)功能的影響。運(yùn)用PyMOL軟件,對變異氨基酸進(jìn)行空間定位,并分析其與周圍氨基酸的氫鍵作用。
1 血清學(xué)檢測結(jié)果 先證者D、C、c、E、e抗原鹽水法、微柱凝膠卡法均為陰性,分析可能為Rh抗原系統(tǒng)抗原不表達(dá)(Rhnull表型)或弱表達(dá)(Rhmod表型)。吸收放散試驗(yàn)顯示D抗原為陽性,先證者符合Rhmod表型。其母親Rh抗原未見明顯異常,Rh血型為ccDEE。先證者和母親抗篩、直抗均陰性。
2RHD和RHCE基因變異檢測結(jié)果 先證者RHD基因1-10外顯子及剪切點(diǎn)區(qū)域未發(fā)現(xiàn)突變,RHCE*01.01第1外顯子存在48G>C(Trp16Cys),是常見的RHCE等位基因。
3RHAG基因變異檢測結(jié)果 如圖1所示,先證者RHAG基因第3外顯子編碼第142位氨基酸的堿基發(fā)生c.425T>C,使亮氨酸轉(zhuǎn)為脯氨酸(p.Leu142Pro),第8外顯子編碼第376位氨基酸的堿基發(fā)生c.1126G>A,使甘氨酸轉(zhuǎn)為蘇氨酸(p.Gly376Ser),兩處變異均為雜合錯義突變。先證者母親RHAG基因第8外顯子也存在c.1126G>A。
圖1 先證者RHAG基因測序結(jié)果
4 生物信息學(xué)分析結(jié)果
4.1 蛋白影響力評估:如圖2所示,p.Leu142Pro變異PolyPhen-2評分結(jié)果為0.999分,Provean評分結(jié)果為-6.220分;p.Gly376Ser變異PolyPhen-2評分結(jié)果為1.000分,Provean評分結(jié)果為-5.580分,預(yù)示這兩處變異均為有害變異,可影響蛋白質(zhì)功能。
圖2 2種生物信息學(xué)軟件對氨基酸變異預(yù)測結(jié)果
4.2 變異位點(diǎn)空間結(jié)構(gòu)分析結(jié)果:PyMOL模型分析顯示,RhAG蛋白有12個α-螺旋,p.Leu142Pro位于第5個α-螺旋跨膜區(qū)域接近胞內(nèi)處,p.Gly376Ser位于第12個α-螺旋跨膜區(qū)域,如圖3所示。圖4為氨基酸變異前后氫鍵的比較,p.Leu142變?yōu)閜.Pro142后,與p.Pro138的氫鍵作用消失;p.Gly376變?yōu)閜.Ser376后,增加p.Ala372、p.Val373、p.Leu377位之間的3個氫鍵。分析顯示2處變異均可能改變氨基酸間氫鍵的聯(lián)系。
圖3 RhAG蛋白三維空間結(jié)構(gòu)模型
圖4 氨基酸變異前后氫鍵比較
RHAG基因位于6號染色體長臂6p11-p21. 1,它編碼的RhAG抗原蛋白含409個氨基酸,12次穿膜,N端和C端都在膜內(nèi)[3]。RhAG蛋白是膜上多聚體的主要成分之一,與RhD、RhCE、GPB、GPA、CD47、LW、帶3蛋白和帶4.2蛋白組成蛋白復(fù)合物[4]。如果RhAG抗原不能正常表達(dá),不僅造成RhD/CE蛋白不能正常穿膜,還會造成紅細(xì)胞塌陷,口形和球形紅細(xì)胞增多[5],細(xì)胞水分過多和陽離子外流[6],紅細(xì)胞在體內(nèi)存活期縮短,個體易發(fā)生輕到中度的代償性溶血性貧血[7-8],少數(shù)重度病例在脾切除術(shù)后仍有溶血癥狀[9]。本文中先證者患有溶血性黃疸,可能與RHAG基因變異有關(guān),脾切除手術(shù)未輸血,術(shù)后溶血和貧血癥狀減輕。
Rh缺失型可分為無效等位基因型(amorph type)及調(diào)節(jié)型(regulator type)。Rhmod屬于調(diào)節(jié)型,RHD/CE基因正常,但RHAG是無活性的突變純合子或雙雜合子[10]。本文中先證者的RHAG基因外顯子存在425T>C和1126G>A兩處變異,均為雜合錯義突變,導(dǎo)致Rh抗原表達(dá)顯著減少的Rhmod型。Rhmod型案例罕見,目前國際上報(bào)道的Rhmod型有RHAG1183delA、RHAG3G>T、236G>A[11]、 398T>C、572G>A[12]和707A>C等,比對國內(nèi)外文獻(xiàn)和NCBI、ISBT數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站,未發(fā)現(xiàn)本文中RHAG兩處位點(diǎn)變異的報(bào)道,為新的基因變異。
先證者的兩處變異,1126G>A遺傳自母親,先證者父親已故無法測序且無兄弟姐妹子女,推測425T>C可能遺傳自父親。而先證者母親Rh抗原未見明顯異常,母親應(yīng)為攜有一條正常RHAG基因,一條變異基因。進(jìn)一步試驗(yàn)可檢測先證者及母親RhAG及其它相關(guān)蛋白的表達(dá)水平,還可構(gòu)建突變細(xì)胞體外分析變異對蛋白表達(dá)的影響。本文三維模型顯示先證者1處變異氨基酸位于α-螺旋跨膜區(qū)域接近胞內(nèi)區(qū),2處變異均可能改變氨基酸分子間作用,蛋白功能預(yù)測軟件預(yù)測為有害,推測其可能影響其與RhD/CE蛋白在胞內(nèi)結(jié)合形成多聚體而不利于RhD/CE蛋白跨膜,為探索Rhmod的分子機(jī)制提供啟示。
利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突