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      不同冷藏時間牦牛乳中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)比較

      2022-07-29 12:11:00宋雪梅馬安娜劉炫妍張炎邱婷張衛(wèi)兵
      現(xiàn)代食品科技 2022年7期
      關(guān)鍵詞:桿菌屬菌門冷藏

      宋雪梅,馬安娜,劉炫妍,張炎,邱婷,張衛(wèi)兵*

      (1.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,甘肅蘭州 730070)

      (2.甘肅省功能乳品工程實驗室,甘肅蘭州 730070)

      原料乳富含蛋白質(zhì)、脂肪,pH 接近中性,同時也含有源自健康乳房、擠乳以及運(yùn)輸過程中外界環(huán)境所侵入的許多微生物,生產(chǎn)加工前采用的貯藏條件如不恰當(dāng)時,原料乳微生物結(jié)構(gòu)和營養(yǎng)成分將發(fā)生變化,對干酪、酸奶、乳粉等生產(chǎn)、品質(zhì)、質(zhì)量安全產(chǎn)生影響[1]。牦牛乳年產(chǎn)量達(dá)84.5 萬t,近6 年來,產(chǎn)量復(fù)合增長率為3.07%[2]。然而,我國擁有的1621 萬頭牦牛,主要分布在以青藏高原為中心的青海、西藏、四川、甘肅、新疆和云南等高山、亞高山地帶。牦牛日泌乳量為3.3 kg[3],只有普通奶牛的14%。牦牛產(chǎn)奶季節(jié)性強(qiáng),主要集中在溫度較高的暖季[4]。因此,牦牛分布以及產(chǎn)乳等特點易于導(dǎo)致牦牛乳面臨較長時間的貯藏。

      低溫貯藏由于能夠抑制嗜溫微生物的生長繁殖而被廣泛地運(yùn)用于乳品工業(yè)。原料乳低溫貯藏效果取決于冷藏條件。一般而言,低溫貯藏溫度為4~6 ℃,冷藏時間的長短與原料乳收集間隔、運(yùn)送距離等相關(guān)。但是研究發(fā)現(xiàn),隨著冷藏時間的延長,原料乳中嗜冷菌如假單胞菌屬、不動桿菌屬等大量繁殖[5],產(chǎn)生了耐熱性蛋白酶、脂肪酶等。乳品生產(chǎn)加工前使用的巴氏殺菌雖能殺滅原料乳中絕大多數(shù)微生物,但殘留的蛋白酶、脂肪酶依然具有活性,能夠分解乳蛋白質(zhì)和脂肪,導(dǎo)致乳產(chǎn)生酸味、苦味,甚至乳發(fā)生腐敗變質(zhì),因此,了解不同冷藏時間原料乳微生物組成變化對于乳品工業(yè)發(fā)展具有重要意義。

      不同學(xué)者對冷藏過程中山羊乳、牛乳、綿羊乳等菌群特征以及相關(guān)性質(zhì)進(jìn)行了研究[6-8]。原料乳微生物結(jié)構(gòu)組成不僅受環(huán)境差異影響,還與宿主動物來源直接相關(guān)。牦牛生長于高寒、缺氧、枯草期和冰封期長達(dá)半年左右的環(huán)境中,牦牛乳含有3.7%~6.5%乳蛋白,高于荷斯坦牛乳、駝乳和山羊乳。脂肪含量為5.3%~8.8%,高出荷斯坦牛乳近1 倍[9],鈣含量達(dá)154~180 mg/g,營養(yǎng)價值高。馬靜等[10]研究了青海省不同海拔地區(qū)牦牛乳的微生物多樣性,但關(guān)于不同冷藏時間牦牛乳微生物群落比較的研究鮮有報道。因此,鑒于原料乳群落的復(fù)雜性、重要性,本研究對不同冷藏時間牦牛乳細(xì)菌群落特性和理化性質(zhì)進(jìn)行了比較,為提高牦牛乳及其制品質(zhì)量安全性提供理論依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 材料與試劑

      1.1.1 樣品采集

      2020 年10 月,選取甘南藏族自治州卓尼縣木耳鄉(xiāng)自然放牧狀態(tài)的10 頭牦牛,凌晨開始擠乳。在擠乳之前,拴住牦牛的后腿,清洗雙手,然后用雙手快速、有力地上下擠壓。最后,將乳樣混合后,保存于冰袋箱中(4~6 ℃),6 h 內(nèi)運(yùn)送到實驗室。

      1.1.2 試劑

      E.Z.N.A? Mag-Bind Soil DNA Kit 試劑盒,美國OMEGA 公司;Qubit3.0 DNA 檢測試劑盒,美國Life公司。

      1.2 試驗儀器

      BCD-539WF 電冰箱,青島海爾股份有限公司;FOSS MikeScanFT120 乳成分分析儀,丹麥福斯公司;DYY-6C 電泳儀電源、DYCZ-21 電泳槽,北京市六一儀器廠;FR-1000 凝膠成像系統(tǒng),上海復(fù)日科技有限公司;ETC 811PCR 儀,北京東勝創(chuàng)新生物科技有限公司;Q32866Qubit? 3.0 熒光計,美國Invitrogen 公司。

      1.3 試驗方法

      1.3.1 樣品處理

      新鮮牦牛乳無菌分裝后,4 ℃下貯藏24、72 h,編號為S1、S2,每個時間點取樣3 個,編號為S11、S12、S13、S21、S22、S23,冷藏結(jié)束后,提取細(xì)菌DNA 以及測定乳的理化指標(biāo)。

      1.3.2 DNA 提取、PCR 擴(kuò)增和高通量測定

      將一定原料乳樣在13000 r/min、4 ℃下離心5 min,除去上清液和脂肪后,取適量沉淀。按照操作說明,使用DNA 試劑盒,提取樣品中DNA。瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA 完整性,Qubit 定量檢測DNA 樣本濃度。擴(kuò)增16S rRNA 基因V3-V4 高變異區(qū)。通用引物分別為341F(5'-CCTACGGGNGGCWGCAG-3')和805R(5'-GACTACHVGGGTATCTAATCC-3')。所得PCR 產(chǎn)物純化回收后,構(gòu)建文庫,利用Illumina Miseq 測序平臺開展高通量測序及后續(xù)分析(生工生物工程(上海)股份有限公司協(xié)助完成)。

      1.3.3 高通量測序數(shù)據(jù)處理

      cutadapt 去除引物接頭序列后,根據(jù)PE reads 之間的overlap 關(guān)系,將成對的reads 拼接成一條序列,再按照barcode 標(biāo)簽序列識別并區(qū)分樣品得到各樣本數(shù)據(jù),最后使用PRINSEQ 切除reads 尾部質(zhì)量值20以下的堿基,最終過濾掉低復(fù)雜度序列,得到各樣本有效數(shù)據(jù)。

      1.3.4 OTU 聚類和物種注釋

      使用Usearch 軟件,按照97%相似性對非重復(fù)序列(不含單序列)進(jìn)行OTU 聚類,聚類過程中去除嵌合體,得到OTU 代表序列,然后使用RDP classifier比對 RDP 數(shù)據(jù)庫(http://rdp.cme.msu.edu/misc/resources.jsp),對每個OTU 對應(yīng)的物種分類注釋,最終分別在門、綱、目、科、屬等分類水平上統(tǒng)計樣本群落組成。

      1.3.5 牦牛乳理化指標(biāo)測定

      取50 mL 原料乳樣品于離心管中,預(yù)熱至40± 1℃,充分振蕩后,測定其蛋白質(zhì)、脂肪、總固性物、非脂乳固體、乳糖、酸度、酪蛋白等。

      1.4 數(shù)據(jù)處理與分析

      每個處理重復(fù)3 次,平均值±標(biāo)準(zhǔn)偏差表示結(jié)果,利用SPSS 19.0 軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行顯著性分析,Mothur軟件計算和分析微生物多樣性。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 樣品細(xì)菌序列特征

      提取樣品DNA,通過對16S rRNA 基因擴(kuò)增、測序后,產(chǎn)生了473270 個序列數(shù),經(jīng)質(zhì)量過濾后,最終序列數(shù)為469676。樣品細(xì)菌序列特征如表1 所示,序列平均長度為428.43,樣品中最少有效序列數(shù)達(dá)65200。

      表1 樣品序列基本特征Table 1 Sample sequencing information

      2.2 牦牛乳中微生物多樣性分析

      Alpha 多樣性指數(shù)包含Chao、Ace、Shannon、Simpson、Shannoneven,常被用來表示樣品中微生物群落多樣性和分布豐度,不同冷藏時間牦牛乳細(xì)菌多樣性結(jié)果見表2。

      從表2 可知,S1、S2 樣品的Chao 指數(shù)差異不明顯。由于Chao 指數(shù)評價樣品的物種豐度,因此,說明S1、S2 中物種總數(shù)接近。S2 樣品的Shannon 和Shannoneven 指數(shù)略高于S1,說明冷藏72 h 牦牛乳中細(xì)菌多樣性呈現(xiàn)增加趨勢。

      表2 牦牛乳樣品中細(xì)菌Alpha 多樣性Table 2 Alpha diversity of bacteria in yak milk samples

      2.3 牦牛乳門水平細(xì)菌群落組成分析

      相對豐度0.01%以上的門類10 個。現(xiàn)對相對豐度1%以上的細(xì)菌門類進(jìn)行分析,其結(jié)果見圖1。

      從圖1 可知,冷藏24、72 h 牦牛乳樣品中優(yōu)勢菌為厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和變形菌門(Proteobacteria),這3 類微生物占到樣品中細(xì)菌的99%以上。其中,厚壁菌門為第一優(yōu)勢菌門,它在S1、S2 樣品中相對豐度分別為46.23%、46.05%,S1、S2 樣品中擬桿菌門相對豐度為28.91%和29.9%,為第二優(yōu)勢菌門。變形菌門是S1、S2 樣品中的第三優(yōu)勢菌門。

      馬靜等[10]發(fā)現(xiàn)不同海拔牦牛乳中微生物主要屬于變形菌門和厚壁菌門。Liu 等[11]發(fā)現(xiàn)西藏地區(qū)自然發(fā)酵牦牛乳酸奶中99%微生物由厚壁菌門、變形菌門、擬桿菌門和放線菌門組成。本試驗注釋的微生物門類與此相同。其它細(xì)菌門類還包含相對豐度在0.05%~0.1% 的放線菌門(Actibobacteria)和Candidatus_Saccharibacteria,相對豐度0.01%~0.03%的酸桿菌門(Acidobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)、浮霉菌門(Planctomycetes)、互養(yǎng)菌門(Synergistetes)和熱袍菌門(Thermotogae)。

      2.4 牦牛乳中屬水平細(xì)菌群落組成分析

      不同冷藏時間牦牛乳中相對豐度0.01%以上細(xì)菌屬類27 個。相對豐度1%以上細(xì)菌屬類7 個,分別為乳球菌屬(Lactococcus)、金黃桿菌屬(Chryseobacterium)、棲水菌屬(Enhydrobacter)、鏈球菌屬(Streptococcus)、不動桿菌屬(Acinetobacter)、假單胞菌屬(Pseudomonas)和明串珠菌屬(Leuconostoc)。

      如圖2 顯示,乳球菌屬為冷藏牦牛乳中第一優(yōu)勢菌屬,S1 樣品中乳球菌屬相對豐度為30.75%,S2 樣品中乳球菌屬相對豐度比S1 增加了22.74%。金黃桿菌屬是S1、S2 樣品中第二優(yōu)勢菌屬,S1 樣品中金黃桿菌屬相對豐度為28.73%,冷藏72 h 后,上升到29.72%。乳球菌屬和金黃桿菌屬分別占到S1、S2 樣品中細(xì)菌的59.48%和67.51%。鏈球菌屬是S1 的第三優(yōu)勢菌屬,而棲水菌屬是S2 的第三優(yōu)勢菌屬。S1、S2 樣品中第四優(yōu)勢菌屬為不動桿菌屬。

      S2 樣品中金黃桿菌屬、棲水菌屬相對豐度比S1增加了3.56%、12.19%。說明延長冷藏時間,牦牛乳中金黃桿菌屬、棲水菌屬呈現(xiàn)增長趨勢。S1 樣品中鏈球菌屬、不動桿菌屬相對豐度分別比S2 高出52.64%、59.41%,說明隨著冷藏時間的延長,其鏈球菌、不動桿菌屬呈現(xiàn)較快減少趨勢。S1 和S2 樣品中假單胞菌屬相對豐度較低,分別為1.69%和1.78%,呈現(xiàn)較小增加趨勢。

      馬靜等[10]發(fā)現(xiàn)不同海拔牦牛乳中棲水菌屬、金黃桿菌屬、乳桿菌屬等相對豐度較高。乳球菌屬、腸球菌屬、乳桿菌屬和明串珠菌屬也是普通牛乳中的主要菌屬[12]。本試驗也注釋到了其它原料乳中存在的乳球菌屬、棲水菌屬、金黃桿菌屬等,但是不同原料乳中微生物優(yōu)勢菌屬存在差異。郭小杰等[13]從冬春季原料乳中分離的嗜冷菌包含25.5%假單胞菌屬、10.5%乳球菌屬、9.8%不動桿菌屬、8.8%金黃桿菌屬以及6.7%葡萄球菌屬。王媛媛等[14]發(fā)現(xiàn)在72 h 冷藏過程中,原料乳中優(yōu)勢菌屬為不動桿菌屬,其相對豐度達(dá)50%以上。原料乳中微生物優(yōu)勢菌屬受原料乳種類、地理環(huán)境、采樣季節(jié)等因素影響。

      原料乳中優(yōu)勢菌屬的差異也決定了原料乳貯藏過程中菌落結(jié)構(gòu)的變化。假單胞菌屬被普遍認(rèn)為是原料乳冷藏過程中的優(yōu)勢嗜冷菌[9],它們產(chǎn)生的耐熱胞外蛋白酶、脂肪酶對乳品質(zhì)影響較大。然而冷藏24、72 h 牦牛乳中假單胞菌屬的相對豐度較低,這主要因為假單胞菌屬一般來源于飼料、飲水、擠奶設(shè)備以及與牧場環(huán)境有關(guān)[15],而牦牛主要以自然放牧為主。不動桿菌屬也是與乳相關(guān)的腐敗菌,普遍存在于自然界,但是冷藏24、72 h 牦牛乳中相對豐度較低,因此,假單胞菌屬、不動桿菌屬對牦牛乳品質(zhì)影響較小。

      乳球菌屬、金黃桿菌屬是牦牛乳冷藏過程中的優(yōu)勢菌屬。Ribeiro 等[16]發(fā)現(xiàn)巴西地區(qū)原料乳中具有潛在致腐能力的嗜冷菌中革蘭氏陽性菌占58.2%,其中大多數(shù)為乳酸乳球菌。金黃桿菌屬具有一定蛋白質(zhì)、脂肪分解能力,對原料乳具有致腐能力。不同學(xué)者已從原料乳中分離出金黃桿菌屬菌種如Chryseobacterium mulctraesp[17]、Chryseobacterium vaccaesp[18]等。Charimba 等[19]認(rèn)為乳品中由酶分解導(dǎo)致的缺陷不僅是假單胞菌屬,還與金黃桿菌屬有關(guān)。本試驗發(fā)現(xiàn)冷藏72 h 牦牛乳中乳球菌屬、金黃桿菌屬相對豐度雖高于冷藏24 h 牦牛乳,但其相對豐度變化不太明顯,因此,低溫貯藏延緩了乳球菌屬和金黃桿菌屬快速繁殖,確保了原料乳質(zhì)量。然而,這也提醒當(dāng)牦牛乳冷藏時間進(jìn)一步延長時,乳球菌屬和金黃桿菌屬可能對牦牛乳品質(zhì)產(chǎn)生影響。

      其余細(xì)菌主要包含相對豐度1%以下的20 個菌屬,分別為相對豐度為0.01%~0.38%的沙雷氏菌屬(Serratia),相對豐度 0.06%~0.17% 的Saccharibacteria_genera_incertae_sedis、羅河桿菌屬(Rhodanobacter)和腸球菌屬(Enterococcus)。相對豐度0.01%~0.06%的水球菌屬(Aquisphaera)、慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)、叢毛單胞菌屬(Comamonas)、脫氟維托加菌屬(Defluviitoga)、德沃斯氏菌屬(Devosia)、獨(dú)鳥菌屬(Dokdonella)、生絲微菌屬(Hyphomicrobium)、考古氏菌屬(Kocuria)、韓國生工菌屬(Kribbella)、亞硝化螺菌屬(Nitrosospira)、根微菌屬(Rhizomicrobium)、鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、鞘氨醇盒菌屬(Sphingopyxis)、發(fā)球菌屬(Trichococcus)、巨型球菌屬(Macrococcus)、中生根瘤菌(Mesorhizobium)。羅河桿菌屬曾發(fā)現(xiàn)于牧場草地和土壤中[20],鞘氨醇單胞菌屬、慢生根瘤菌屬也是土壤根際菌。因此,不同冷藏牦牛乳樣品中羅河桿菌屬,慢生根瘤菌屬、考古氏菌屬、鞘氨醇單胞菌屬、巨型球菌屬以及金黃桿菌屬、鏈球菌屬、不動桿菌屬等可能源自環(huán)境、乳頭表面等[21]。冷藏牦牛乳中未發(fā)現(xiàn)與乳制品緊密相關(guān)的耐熱性致病菌梭菌[22]和芽孢桿菌屬等[23]。

      2.5 牦牛乳理化性質(zhì)分析

      乳的理化性質(zhì)對乳制品加工和品質(zhì)具有重要影響,其理化性質(zhì)結(jié)果見表3。

      表3 不同冷藏時間牦牛乳的理化性質(zhì)Table 3 The physicochemical property of yak milk under different refrigerated storage period

      從表3 可知,牦牛乳S2 樣品中酪蛋白含量比S1顯著低4.43%(p<0.05),S2 樣品中脂肪含量比S1 顯著低了67.51%(p<0.05)。申倩等[24]也發(fā)現(xiàn)生鮮牛乳4℃貯藏3 d 后乳脂率顯著降低。牦牛乳S2 樣品中酸度高于S1。Mankai 等[25]發(fā)現(xiàn)牛乳在4 ℃下貯藏時間從24 h 延長到96 h 時,乳的酸度呈現(xiàn)增加趨勢。

      原料乳理化性質(zhì)的改變與其微生物活動、內(nèi)源性酶活性等有關(guān)。嗜冷菌所分泌的蛋白酶對酪蛋白具有降解作用[26],金黃桿菌屬、假單胞菌屬和不動桿菌屬等具有脂肪分解能力[27]。本試驗發(fā)現(xiàn),與冷藏24 h 牦牛乳相比,冷藏72 h 牦牛乳中乳球菌屬、棲水菌屬、金黃桿菌屬和明串珠菌屬相對豐度呈現(xiàn)增長趨勢。另外,降解β-酪蛋白的內(nèi)源性纖維溶酶在低溫下具有較強(qiáng)活性[28],因此,冷藏時間延長72 h 后,牦牛乳中酪蛋白和脂肪含量降低。但是,冷藏72 h 牦牛乳的理化指標(biāo)仍然高于國家標(biāo)準(zhǔn)中對生乳的要求,酸度也未超過18 °T[29],因此,冷藏72 h 牦牛乳品質(zhì)有保障。

      2.6 牦牛乳中微生物菌屬之間以及與理化指標(biāo)的相關(guān)性分析

      不同冷藏時間牦牛乳中相對豐度為1%的微生物菌屬之間以及與理化指標(biāo)進(jìn)行了相關(guān)性分析,其結(jié)果見表4、5。

      表4 牦牛乳中細(xì)菌菌屬之間的Pearson 相關(guān)性分析Table 4 Pearson correlation coefficients of relative abundance of bacteria in yak milk

      從表4 可知,金黃桿菌屬除與棲水菌屬具有較強(qiáng)正相關(guān)性之外,與其它菌屬之間存在負(fù)相關(guān)性。乳球菌屬與明串珠菌屬存在較弱正相關(guān)性,與不動桿菌屬、鏈球菌屬、棲水菌屬存在負(fù)相關(guān)性。鏈球菌屬與棲水菌屬、金黃桿菌屬和乳球菌屬之間也存在負(fù)相關(guān)性,而與不動桿菌屬存在較強(qiáng)正相關(guān)性(p<0.05)。

      從表5 可知,乳球菌屬與原料酸度、乳糖含量呈現(xiàn)正相關(guān)性,與脂肪含量呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)。原料乳中酸度與鏈球菌屬呈現(xiàn)極顯著負(fù)相關(guān)性(p<0.01),與不動桿菌屬也存在負(fù)相關(guān)性,與金黃桿菌屬呈現(xiàn)較弱正相關(guān)性,與明串珠菌屬呈現(xiàn)較強(qiáng)正相關(guān)性。以上相關(guān)性分析表明由于代謝產(chǎn)物或者環(huán)境的改變導(dǎo)致不同微生物生長繁殖之間可能存在協(xié)同或者拮抗作用。

      表5 牦牛乳中細(xì)菌相對豐度與其理化指標(biāo)的Pearson 相關(guān)性分析Table 5 Pearson correlation coefficients of relative abundance of bacterial and physicochemical indices in yak milk

      原料乳中豐富的營養(yǎng)物質(zhì)有利于微生物的生長繁殖,但是由于微生物自身代謝產(chǎn)物以及原料乳理化性質(zhì)的改變,使得對微生物的生長繁殖產(chǎn)生不同影響。乳酸菌具有產(chǎn)細(xì)菌素的能力,它產(chǎn)生的細(xì)菌素對其它微生物具有抑制作用,已有不同學(xué)者從原料奶[30]、新疆巴音布魯克牧區(qū)鮮乳和酸奶疙瘩[31]中篩選出具有抗乳房炎致病菌、金黃色葡萄球菌等的乳酸乳球菌。Hanu 等[32]發(fā)現(xiàn)由嗜冷菌作用所產(chǎn)生的脂肪酸具有較強(qiáng)抑菌作用,而游離脂肪酸的增加對乳酸菌生長具有抑制作用[33,34]。乳酸菌耐酸能力較強(qiáng),能夠忍耐酸度較強(qiáng)的環(huán)境。因此,原料乳在冷藏過程中,微生物相互之間,微生物與原料乳理化性質(zhì)之間相互影響,最終導(dǎo)致原料乳品質(zhì)的改變。

      3 結(jié)論

      冷藏24、72 h 牦牛乳中厚壁菌門、擬桿菌門和變形菌門占到微生物相對豐度的99%以上。冷藏24、72 h 牦牛乳中第一、二優(yōu)勢菌屬為乳球菌屬、金黃桿菌屬,分別占到冷藏24、72 h 牦牛乳中細(xì)菌相對豐度的59.48%和67.51%。冷藏72 h 牦牛乳中乳球菌屬、金黃桿菌屬相對豐度比冷藏24 h 牦牛乳高出22.74%、3.56%,但是冷藏72 h 牦牛乳中鏈球菌、不動桿菌屬呈現(xiàn)降低趨勢。冷藏24、72 h 牦牛乳中假單胞菌屬相對豐度較低,分別為1.69%和1.78%。冷藏72 h 牦牛乳中酪蛋白、脂肪含量低于冷藏24 h 牦牛乳,酸度增加到14.66 °T。72 h 的低溫冷藏有助于控制牦牛乳細(xì)菌繁殖,維持乳品質(zhì)。該研究為牦牛乳貯藏,干酪等乳制品加工,確保其品質(zhì)和質(zhì)量安全提供了理論依據(jù)。

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