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      4種熒光原位雜交探針檢測(cè)隱匿易位急性早幼粒細(xì)胞白血病的比較

      2023-02-01 03:24:08楊慧姜潤(rùn)秋郭睿時(shí)雨喬純錢思軒李建勇仇海榮
      關(guān)鍵詞:基因座易位探針

      楊慧, 姜潤(rùn)秋, 郭睿, 時(shí)雨, 喬純, 錢思軒, 李建勇, 仇海榮

      (1. 南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院血液科,江蘇 南京 210029; 2. 南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院,江蘇 南京 210008)

      急性早幼粒細(xì)胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)以 t(15;17)(q24;q21)易位形成PML-RARα融合基因?yàn)樘卣鱗1],具有該融合基因的APL患者對(duì)全反式維甲酸及三氧化二砷均敏感,獨(dú)特的生物學(xué)和臨床特征使其成為急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)中一類高治愈性亞型。據(jù)報(bào)道,有98%的APL通過t(15;17)(q24;q21)平衡或插入易位形成PML-RARα融合基因,1%~2%的APL病例通過涉及RARα的其他融合表現(xiàn)為少見的APL亞型[2-3]。本研究報(bào)道3例臨床熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)檢測(cè)中容易漏診的一類少見隱匿插入易位APL病例,并對(duì)比4家不同公司基因探針對(duì)此型異常的檢測(cè)能力。

      1 資料與方法

      1.1 研究對(duì)象

      選取3例經(jīng)細(xì)胞形態(tài)學(xué)、免疫學(xué)、細(xì)胞遺傳學(xué)、分子生物學(xué)綜合診斷為APL的罕見插入PML-RARα易位患者。本研究通過醫(yī)院倫理委員會(huì)審查,3例患者均已簽署知情同意書。

      1.2 常規(guī)染色體核型分析

      取骨髓液采用短期培養(yǎng)法制備染色體并采用R顯帶技術(shù)進(jìn)行核型分析。染色體異常按照《人類細(xì)胞遺傳學(xué)國(guó)際命名體制(ISCN2016)》的相關(guān)規(guī)定識(shí)別和描述。

      1.3 FISH檢測(cè)PML-RARα融合基因

      雙色雙融合PML-RARα探針分別購(gòu)自美國(guó)Abbott公司、英國(guó)Cytocell公司、武漢康錄公司、廣州安必平公司。除安必平探針采用紅色標(biāo)記RARα基因,綠色標(biāo)記PML基因外,其余探針均為紅色標(biāo)記PML基因,綠色標(biāo)記RARα基因。Abbott探針跨越大小為515 kb的PML基因座和大小為700 kb的RARα基因座。在Cytocell探針中,PML基因座和RARα基因座大小分別為325 kb和331 kb。安必平探針跨越的基因座是最大的,其PML基因座大小為578 kb,RARα基因座大小為1 000 kb??典浱结樋缭酱笮?30 kb的PML基因座和大小為320 kb的RARα基因座。FISH檢測(cè)步驟根據(jù)制造商提供的方案進(jìn)行,至少計(jì)數(shù)300個(gè)間期細(xì)胞。正常細(xì)胞信號(hào)為兩紅兩綠(2R2G);出現(xiàn)黃色融合信號(hào)(F)表明發(fā)生易位,超過閾值(≥3%),則判定PML-RARα融合基因檢測(cè)陽(yáng)性,典型信號(hào)模式為一紅一綠兩融合(1R1G2F)。

      1.4 細(xì)胞形態(tài)學(xué)檢測(cè)

      對(duì)骨髓涂片進(jìn)行瑞氏染色、過氧化物酶染色和高碘酸-希夫染色,并在顯微鏡下檢查細(xì)胞形態(tài)。對(duì)于過氧化物酶染色,陽(yáng)性結(jié)果是細(xì)胞質(zhì)中出現(xiàn)棕色和黑色顆粒。對(duì)于高碘酸-希夫染色,細(xì)胞質(zhì)染成紅色表示陽(yáng)性反應(yīng),陽(yáng)性反應(yīng)物呈顆粒狀、塊狀或彌漫性。

      1.5 RT-PCR檢測(cè)PML-RARα融合基因

      從骨髓樣本中分離細(xì)胞并根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)方案提取總RNA。PML-RARα熒光定量PCR檢測(cè)采用基因擴(kuò)增儀StepOnePlusTMRT-PCR系統(tǒng)(美國(guó)ABI公司),反應(yīng)體系包括8 μL反應(yīng)液和12 μL RNA,反應(yīng)條件:42 ℃ 30 min,94 ℃ 5 min,95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min;共40個(gè)循環(huán)。擴(kuò)增曲線在40個(gè)循環(huán)前超過閾值被認(rèn)為PML-RARα融合基因?yàn)殛?yáng)性。為進(jìn)一步量化樣本并了解實(shí)驗(yàn)效率,使用1×103、1×104、1×105和1×106拷貝的ABL基因參考制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。

      1.6 免疫表型分析

      通過流式細(xì)胞儀(美國(guó)貝克曼庫(kù)爾特公司)檢測(cè)新鮮的骨髓樣本,至少分析50 000個(gè)細(xì)胞。本研究所使用的抗體包括CD34、CD117、HLA-DR、CD13、CD33、CD11b、CD15、CD19、CD58、CD10、CD20、CD22、CD81、CD66c、CD38、CD64、CD14、CD56、CD11c、cMPO、cCD3、cCD79a、CD2、CD5、CD7、CD3、CD8、CD4、CD45。陰性對(duì)照采用相應(yīng)的同型對(duì)照抗體,陽(yáng)性細(xì)胞群≥20%被定義為陽(yáng)性。

      2 結(jié)果

      2.1 細(xì)胞形態(tài)學(xué)及免疫表型特征

      3例APL患者白血病細(xì)胞形態(tài)學(xué)特征和免疫表型模式均較典型。經(jīng)瑞氏染色可見異常早幼粒細(xì)胞胞質(zhì)內(nèi)充滿大量的紫色顆粒,胞質(zhì)內(nèi)外部顏色不同,細(xì)胞核形狀不規(guī)則、扭曲或折疊。一些白血病細(xì)胞含有多個(gè)柴捆狀棒狀小體。異常早幼粒細(xì)胞的過氧化物酶染色為強(qiáng)陽(yáng)性反應(yīng),而高碘酸-希夫染色顯示出弱陽(yáng)性反應(yīng)。CD34、CD117、HLA-DR、CD13、CD33、CD11b、CD11c、CD15和CD38等免疫表型標(biāo)志物檢測(cè)發(fā)現(xiàn),3例病例均表現(xiàn)出典型的免疫表型,即患者不表達(dá)CD34、HLA-DR和CD11b,而表達(dá)CD13、CD33、CD117、CD38。

      2.2 細(xì)胞及分子遺傳學(xué)結(jié)果

      3例插入易位APL病例的常規(guī)染色體核型分析均表現(xiàn)為正常男性核型46,XY,而未能檢測(cè)到t(15;17)易位存在。FISH研究結(jié)果顯示,Abbott探針在此3例PML-RARα融合基因檢測(cè)均為陰性;Cytocell檢測(cè)到2例陽(yáng)性,1例陰性;康錄和安必平探針3例均成功檢測(cè)到融合信號(hào),詳見表1。所有FISH探針檢測(cè)到的融合信號(hào)均為微弱的融合信號(hào),如圖1所示,箭頭所指分別為安必平及Cytocell探針?biāo)就换颊撸?7號(hào)RARα部分片段易位至15號(hào)PML處形成的弱融合信號(hào)。圖1中安必平PML-RARα探針顯示2R1G1F信號(hào)模式,箭頭所示的融合信號(hào)是17號(hào)染色體部分RARα片段(紅色)易位到15號(hào)染色體PML(綠色)處形成弱的PML-RARα融合信號(hào);而Cytocell的PML-RARα探針顯示1R2G1F信號(hào)模式,箭頭所示融合信號(hào)由位于17號(hào)染色體的部分RARα片段(綠色)易位至位于15號(hào)染色體的PML(紅色)處形成弱的PML-RARα融合信號(hào)。而應(yīng)用RT-PCR方法在3例中均檢測(cè)到PML-RARα融合基因,如圖2所示,灰色箭頭指的是PML-RARα擴(kuò)增曲線。

      表1 4種不同F(xiàn)ISH探針檢測(cè)插入性PML-RARα易位病例的比較

      圖1 安必平及Cytocell探針檢測(cè)到弱PML-RARα融合(DAPI染色,×1 000)

      圖2 健康人和3例APL患者PML-RARα融合基因的RT-PCR擴(kuò)增圖

      3 討論

      FISH技術(shù)對(duì)診斷經(jīng)典型t(15;17)易位形成的PML-RARα融合基因準(zhǔn)確性非常高,是臨床血液病診斷中的常用技術(shù)。然而,在檢測(cè)小片段隱匿PML-RARα易位時(shí),F(xiàn)ISH出現(xiàn)了少有的假陰性情況,F(xiàn)ISH陰性的罕見病例文獻(xiàn)也偶見報(bào)道,Kim等[4]總結(jié)1995至2010年共計(jì)13例個(gè)案報(bào)道,均為常規(guī)核型分析未見t(15;17),F(xiàn)ISH檢測(cè)PML-RARα陰性,而分子生物學(xué)方法如RT-PCR或RNA測(cè)序檢測(cè)到融合基因。由于PML-RARα融合基因的存在,此型患者對(duì)全反式維甲酸治療與經(jīng)典型t(15;17)患者具有相似的反應(yīng)和預(yù)后。表2為作者總結(jié)的1995至2021年文獻(xiàn)報(bào)道的20例此類少見病例[4-20],均為染色體及FISH檢測(cè)陰性APL病例,其中用于檢測(cè)的FISH探針除2例所用探針未知,2例來自O(shè)ncor以外,其余16例均為Abbott探針。

      表2 分子遺傳陽(yáng)性而細(xì)胞遺傳(FISH及核型)檢測(cè)陰性的20例病例

      初診APL患者FISH檢測(cè)失敗,除了RT-PCR[21]或測(cè)序技術(shù)有更高的敏感性以外,PML/RARα探針本身的設(shè)計(jì)是否會(huì)影響到檢測(cè)敏感性,值得進(jìn)一步探討。國(guó)外報(bào)道一組少見插入易位病例[22]采用Abbott及Cytocell探針對(duì)比研究發(fā)現(xiàn),Abbott探針在一些隱匿性PML-RARα融合檢測(cè)中出現(xiàn)假陰性主要跟探針大小有關(guān),Abbott探針大小和其標(biāo)記覆蓋面積是Cytocell的2倍左右,這使得小片段插入部分與被插染色體信號(hào)強(qiáng)度差異較大,大片段信號(hào)遮蓋住小片段信號(hào),以致融合信號(hào)不可見。表2中總結(jié)的20例少見病例,16例使用的是Abbott探針,這一方面與其在國(guó)際上廣泛使用有關(guān),另一方面與探針檢測(cè)的敏感性相關(guān)。從產(chǎn)生機(jī)制上來說,臨床少見的隱匿性PML-RARα融合,大多由插入易位引起,其中以ins(15;17)即17號(hào)小片段RARα成分插入至15號(hào)染色體PML處形成PML-RARα融合最為常見,而15號(hào)插入17號(hào)則相對(duì)少見[23-24],本研究中例3即為這種罕見型。

      FISH檢測(cè)中,探針的大小、覆蓋范圍以及熒光強(qiáng)度對(duì)異常的檢出率均有影響。Abbott探針:PML探針覆蓋了該基因兩側(cè)180 kb和335 kb,包含了所有PML的斷裂點(diǎn)區(qū)域;RARα探針覆蓋了該基因700 kb范圍,包含了所有RARA的斷裂點(diǎn)區(qū)域。Cytocell探針:PML探針覆蓋了該基因兩側(cè)151 kb和174 kb;RARα探針覆蓋了該基因兩側(cè)167 kb和164 kb。本文中例1、例2為RARα小片段插入至PML處形成融合基因。Abbott的PML探針片段比較長(zhǎng),紅色熒光強(qiáng)度比較強(qiáng),小片段的RARα綠色熒光比較弱,插入后,綠色熒光被紅色熒光湮滅了,未能形成肉眼可見的黃色融合信號(hào),故判為陰性結(jié)果。而Cytocell的PML探針片段比較小,紅色熒光強(qiáng)度比較弱,小片段的綠色RARα信號(hào)插入后,也能夠形成肉眼可見的黃色融合信號(hào)。康錄探針全長(zhǎng)(PML330 kb,RARα320 kb)與Cytocell長(zhǎng)度相仿,同理也能被識(shí)別。例3為PML小片段插入至RARα形成融合基因,Abbott探針判為陰性,其原因跟上述例1、例2分析的一致??典浱结槼晒z測(cè)到融合信號(hào)也是因?yàn)槠湓O(shè)計(jì)的RARα僅為320 kb,因而未將插入而來的小片段PML完全湮滅。與康錄探針大小類似的Cytocell探針結(jié)果卻判為陰性,這可能跟另一個(gè)因素有關(guān),即該探針設(shè)計(jì)的PML位點(diǎn)未能覆蓋例3中插入片段斷裂位點(diǎn),導(dǎo)致檢測(cè)結(jié)果出現(xiàn)假陰性。至于安必平探針,從大小上來說,PML基因座大小578 kb,RARα1 000 kb,其探針設(shè)計(jì)總體長(zhǎng)度與Abbott探針相似,但與此相反,在3例APL中均成功檢測(cè)到融合信號(hào)。這可能與影響檢測(cè)的第3個(gè)因素即熒光強(qiáng)度有關(guān),雖然小片段插入信號(hào)被一定程度湮滅,但由于探針整體熒光強(qiáng)度偏強(qiáng),因此小片段插入信號(hào)仍然保留了下來從而能被觀測(cè)到。

      對(duì)于檢測(cè)APL中少見的隱匿插入PML-RARα易位病例,國(guó)產(chǎn)安必平及康錄探針因熒光強(qiáng)度強(qiáng),檢測(cè)時(shí)表現(xiàn)出一定的優(yōu)勢(shì)。但由于信號(hào)細(xì)弱,無(wú)論采用何種探針,若不仔細(xì)觀察都可能出現(xiàn)漏診的情況。本研究旨在提高對(duì)FISH方法檢測(cè)此類少見異常的認(rèn)識(shí),以利于及時(shí)發(fā)現(xiàn)這部分隱匿易位病例。同時(shí)應(yīng)該意識(shí)到敏感性高的探針其特異性會(huì)有一定程度的下降,希望臨床及實(shí)驗(yàn)室醫(yī)生認(rèn)識(shí)到診斷方法各有其局限性。由于方法學(xué)不同,RT-PCR及測(cè)序技術(shù)對(duì)此類插入易位檢測(cè)更為敏感。但各種檢測(cè)方法各有利弊,建議RT-PCR和FISH檢測(cè)綜合使用作為最實(shí)用、最敏感的診斷策略。

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