段平成,鄭凱,張宇宏,張國(guó)麗 ,孫國(guó)清
1.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,棉花教育部工程研究中心,烏魯木齊 830052;2.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所,北京 100081;3.新疆農(nóng)墾科學(xué)院,新疆 石河子 832000
棉花是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)作物,但棉花黃萎病為害嚴(yán)重,導(dǎo)致棉花大面積減產(chǎn)和品質(zhì)下降[1]。棉花黃萎病是由大麗輪枝菌(Verticillium dahliae)引起的土傳維管束病害,被稱為棉花的“癌癥”,可造成棉花植株萎蔫甚至枯死,該病原菌寄主廣泛,易變異,危害嚴(yán)重[2]。當(dāng)前生產(chǎn)上采用的化學(xué)防治可以起到一定的防治效果,但是會(huì)對(duì)生態(tài)環(huán)境造成嚴(yán)重的破壞。隨著人們對(duì)生態(tài)環(huán)境的保護(hù)愈加重視,在棉花黃萎病的防治方面,亟需尋求一種對(duì)環(huán)境友好的防治方法[3]。已有研究發(fā)現(xiàn),芽孢桿菌可作為拮抗菌使用,其對(duì)于動(dòng)植物和自然環(huán)境無(wú)污染,而且防治效果更好。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,通過(guò)基因改良技術(shù)能夠進(jìn)一步增強(qiáng)芽孢桿菌的抗病效果,有效抑制和防治黃萎病的發(fā)生。這種高效的生物防治方法,更安全有效,對(duì)環(huán)境無(wú)污染,具有廣泛的應(yīng)用前景。
本研究擬通過(guò)篩選、開(kāi)發(fā)高效拮抗菌來(lái)防治棉花黃萎病,從而遏制病菌的危害,保護(hù)環(huán)境,以此來(lái)保障我國(guó)棉花產(chǎn)業(yè)健康可持續(xù)發(fā)展[4]。為了尋找最佳的生防菌劑,本研究對(duì)從棉花試驗(yàn)田病圃中鑒定到的高抗棉花植株中獲得的拮抗菌進(jìn)行篩選、鑒定,并對(duì)其防治黃萎病的效果進(jìn)行評(píng)價(jià)[5-7],以期為棉花黃萎病的防治提供參考方法。
1.1.1 試驗(yàn)菌株 拮抗菌BJB01 和大麗輪枝菌VD592菌種均來(lái)源于中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所。
1.1.2 試驗(yàn)作物 供試棉花品種為‘新陸早36號(hào)’,種子由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所提供。
1.1.3 試驗(yàn)試劑 通用細(xì)菌DNA 提取試劑盒購(gòu)自天根公司;過(guò)氧化氫酶試劑盒、硝酸鹽試劑盒、吲哚乙酸試劑盒、27F/1492R 細(xì)菌通用引物均購(gòu)自索萊寶公司;碘液、甲基紅、氫氧化鈉、3%次氯酸鈉購(gòu)自國(guó)藥集團(tuán);溴麝香草酚藍(lán)水溶液購(gòu)自雷根生物公司。
1.1.4 試驗(yàn)培養(yǎng)基配方 LB 培養(yǎng)基:10 g 胰蛋白胨,5 g酵母膏,10 g NaCl,1 000 mL ddH2O(若配制為固定培養(yǎng)基需加入15 g瓊脂);葡萄糖蛋白胨液體培養(yǎng)基:0.5 g 葡萄糖,0.5 g 蛋白胨,0.5 g K2HPO4,100 mL ddH2O;牛奶固體培養(yǎng)基:取50 mL脫脂牛奶,再稱1.5 g瓊脂溶于50 mL ddH2O中,將兩液分開(kāi)滅菌,滅菌取出后將兩液倒在一起混勻;淀粉固體培養(yǎng)基:1 g 胰蛋白胨,0.5 g 酵母膏,1 g NaCl,2 g 淀粉,100 mL ddH2O,8 g 瓊脂;葡萄糖液體培養(yǎng)基:1 g胰蛋白胨,0.5 g酵母膏,1 g NaCl,2 g葡萄糖,100 mL ddH2O,8 g 瓊脂;木糖液體培養(yǎng)基:1 g 胰蛋白胨,0.5 g 酵母膏,1 g NaCl,2 g 木糖,100 mL ddH2O,8 g 瓊脂;檸檬酸鹽利用培養(yǎng)基:0.5 g NaCl,0.02 g 硫酸鎂,0.1 g 硫酸二氫銨,0.1 g磷酸氫二鉀,0.5 g 檸檬酸銨,8 g 瓊脂,100 mL ddH2O,0.2%溴麝香草酚藍(lán)溶液4 mL;YEB液體培養(yǎng)基:2.5 g 胰蛋白胨,5 g 酵母膏,5 g NaCl,2 g 葡萄糖,500 mL ddH2O;PDA 固體培養(yǎng)基:5 g 馬鈴薯浸膏,2.5 g胰蛋白胨,2.5 g葡萄糖,5 g NaCl,7.5 g瓊脂,500 mL ddH2O。
1.2.1 致病菌的生理生化分析 利用從新疆石河子棉花重病田里篩選獲得的菌株,用LB固體培養(yǎng)基做平板劃線對(duì)提取到的菌株做活性鑒定;再選取活性強(qiáng)的單菌落大量搖菌,做革蘭氏染色試驗(yàn)與生理生化分析。根據(jù)芽孢桿菌可能對(duì)大麗輪枝菌產(chǎn)生作用的生化方式,選取乙酰甲基甲醇試驗(yàn)(VP試驗(yàn))、葡萄糖利用試驗(yàn)、木糖利用試驗(yàn)、酪素水解試驗(yàn)、淀粉分解試驗(yàn)、吲哚產(chǎn)生試驗(yàn)、過(guò)氧化氫分解試驗(yàn)、硝酸鹽還原試驗(yàn)、甲基紅實(shí)驗(yàn)(MR試驗(yàn))、檸檬酸鹽利用試驗(yàn)以及鹽濃度存活測(cè)試作為生理生化試驗(yàn)項(xiàng)目。其中吲哚產(chǎn)生試驗(yàn)、過(guò)氧化氫分解試驗(yàn)、硝酸鹽還原試驗(yàn)由于涉及危險(xiǎn)化學(xué)品的使用,故選用由索萊寶公司生產(chǎn)的試劑盒進(jìn)行試驗(yàn);VP試驗(yàn)、葡萄糖利用試驗(yàn)、木糖利用試驗(yàn)、酪素水解試驗(yàn)、淀粉分解試驗(yàn)、MR 試驗(yàn)、檸檬酸鹽利用試驗(yàn)以及鹽濃度存活測(cè)試,通過(guò)對(duì)相應(yīng)培養(yǎng)基的配制來(lái)進(jìn)行生理生化測(cè)試[3]。
1.2.2 拮抗菌BJB01的生長(zhǎng)曲線 將提取到活性強(qiáng)并純化后的BJB01 菌液1 000 μL 加入50 mL 的LB 液體培養(yǎng)基中,每隔2 h 測(cè)一次OD600值;當(dāng)出現(xiàn)衰退現(xiàn)象后每隔6~8 h 測(cè)1 次。匯總每個(gè)生長(zhǎng)階段的結(jié)果并制作菌株生長(zhǎng)曲線。
1.2.3 拮抗菌株分子生物學(xué)鑒定 使用通用細(xì)菌DNA 提取試劑盒提取拮抗菌BJB01 DNA,采用27F/1492R細(xì)菌通用引物對(duì)菌株的16S rRNA基因進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,將產(chǎn)物送北京擎科生物公司測(cè)序。測(cè)序所得結(jié)果在NCBI 上進(jìn)行BLAST 比對(duì),并構(gòu)建分子進(jìn)化樹(shù)。
1.2.4 菌株拮抗效果初篩 將大麗輪枝菌VD592
菌種接種于PDA 培養(yǎng)基上,置于27 ℃恒溫光培養(yǎng)箱培養(yǎng)5 d。5 d 后取出,挑取在LB 固體培養(yǎng)基上的拮抗菌單菌落接種于PDA 培養(yǎng)基4 個(gè)角落,后繼續(xù)置于27 ℃恒溫光培養(yǎng)箱培養(yǎng)3~5 d。培養(yǎng)完成后觀察抑菌圈的大小,并按公式(1)計(jì)算抑菌率[7]。
1.2.5 溫室盆栽防效試驗(yàn) 設(shè)置3 種濃度梯度的拮抗菌液,即OD600為0.1、0.6、1.0,分別做浸種處理12 h,在27 ℃恒溫溫室種植,每個(gè)處理設(shè)3次重復(fù),后于棉花長(zhǎng)出2~4 片真葉時(shí)接種大麗輪枝菌進(jìn)行侵染,并在接菌后第7天進(jìn)行二次接種以確保發(fā)病率。全部接種完成后,于第14 天進(jìn)行防效數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)。統(tǒng)計(jì)病值,0 級(jí):0 片真葉被感染;1 級(jí):1 片真葉被感染;2 級(jí):2 片真葉被感染;3 級(jí):3 片真葉被感染;4 級(jí):4 片真葉及以上被感染或感染后死亡。統(tǒng)計(jì)完成后根據(jù)對(duì)應(yīng)病級(jí)的數(shù)量計(jì)算感病情況,以此確定防效[3,8-10]。同時(shí)使用菌拌土與噴灑菌劑的方式進(jìn)行防效測(cè)試,試驗(yàn)重復(fù)3 次,試驗(yàn)方法按如下步驟進(jìn)行。①菌拌土處理,利用濃度為OD=0.6 的BJB01 芽孢桿菌均勻拌土(微生物菌劑10 mL·kg-1土),再種植棉花(20 盆),在棉花長(zhǎng)出2 片真葉時(shí)接種黃萎病病原菌。②噴灑菌劑處理,直接種植棉花(分兩組,一組20盆),后接種芽孢桿菌,設(shè)置2組芽孢桿菌噴灑時(shí)間(分別選擇棉花長(zhǎng)出兩片真葉后的第7、14 天接種),噴灑時(shí)使用噴壺均勻噴灑在棉花種植土壤上,同樣也在棉花長(zhǎng)出2 片真葉時(shí)接種黃萎病病原菌。按公式(2)~(4)測(cè)試計(jì)算溫室防效。
溫室盆栽防效試驗(yàn)后需從侵染過(guò)的健康未感病植株根部提取菌株,對(duì)得到的菌株提取基因組DNA,進(jìn)行PCR 擴(kuò)增并將產(chǎn)物送樣測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果在NCBI 上進(jìn)行BLAST 比對(duì)以確認(rèn)是否為同一種菌株。
2.1.1 拮抗菌種生理生化及革蘭氏染色鑒定 研究用到的拮抗菌種BJB01,是從大田健康棉花植株的下胚軸中分離到的47 種菌中,經(jīng)過(guò)篩選后獲得的活性最強(qiáng)的菌株。
先對(duì)該菌進(jìn)行革蘭氏染色,染色發(fā)現(xiàn)為藍(lán)紫色,即其為革蘭氏陽(yáng)性菌。再針對(duì)該菌進(jìn)行生理生化試驗(yàn),進(jìn)行反復(fù)多次測(cè)試后,發(fā)現(xiàn)該菌的VP試驗(yàn)、葡萄糖利用試驗(yàn)、木糖利用試驗(yàn)、酪素水解試驗(yàn)、淀粉分解試驗(yàn)、吲哚產(chǎn)生試驗(yàn)、過(guò)氧化氫分解試驗(yàn)、硝酸鹽還原試驗(yàn)為陽(yáng)性,MR 試驗(yàn)、檸檬酸鹽利用試驗(yàn)為陰性。并且該菌在鹽濃度為5%、7%時(shí)板上有明顯的大量菌落存活,而超過(guò)10%時(shí)未發(fā)現(xiàn)明顯的菌落。
2.1.2 拮抗菌生長(zhǎng)曲線 通過(guò)繪制拮抗菌BJB01的生長(zhǎng)曲線可進(jìn)一步確定該菌在不同利用情況下獲得最佳濃度的菌液的培養(yǎng)時(shí)間。由圖1 分析發(fā)現(xiàn),該菌在14 h后生長(zhǎng)趨于穩(wěn)定,在24 h后培養(yǎng)基中的營(yíng)養(yǎng)成分耗盡,相應(yīng)的菌濃度隨之下降,但在測(cè)試時(shí)間內(nèi)菌不會(huì)消亡。
圖1 BJB01生長(zhǎng)曲線Fig. 1 BJB01 growth curve
2.1.3 拮抗菌的分子生物學(xué)鑒定 圖2 觀察到BJB01 的菌落呈乳白色、橢圓形,邊緣整齊,向上凸起,表面光滑不透明。將提取到的BJB01 菌種涂布后進(jìn)行16S rRNA 測(cè)序,測(cè)序得到的16S rRNA 拼接結(jié)果在NCBI 系統(tǒng)上進(jìn)行BLAST 比對(duì),利用MEGA-X 中的NJ 法構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)(圖3),發(fā)現(xiàn)該菌與貝萊斯芽孢桿菌相似度極高,為99.71%,由此可確定該菌為貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus belleiensis)。
圖2 BJB01的菌落圖Fig. 2 Colony map of BJB01
圖3 BJB01分子進(jìn)化樹(shù)Fig. 3 BJB01 molecular evolutionary tree
將接菌后的PDA 平板在27 ℃恒溫光培養(yǎng)箱培養(yǎng)21 d 后的結(jié)果如圖4 所示。圖4A 顯示,直接接種大麗輪枝菌VD592 第25 天長(zhǎng)滿整個(gè)PDA 平板,與圖4A 對(duì)照相比,圖4B 的抑菌圈明顯擴(kuò)大,表明BJB01對(duì)大麗輪枝菌VD592具有明顯的拮抗效應(yīng)。結(jié)合圖4的對(duì)峙情況和表1的結(jié)果分析,在接菌第21 天時(shí),抑菌圈增大速度較快,因此可得到貝萊斯芽孢桿菌BJB01 在此時(shí)對(duì)大麗輪枝菌VD592的抑制效果最強(qiáng)。
表1 菌株平板對(duì)峙結(jié)果Table 1 The results of the strain plate confrontation
根據(jù)平板對(duì)峙試驗(yàn)中第21 天達(dá)到最大抑菌效果的結(jié)果,于接菌第21 天進(jìn)行溫室防效結(jié)果統(tǒng)計(jì),并針對(duì)統(tǒng)計(jì)結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。圖5 左圖為棉花健康植株,右圖為棉花感染大麗輪枝菌VD592后的感病植株。溫室抑菌試驗(yàn)生防效果試驗(yàn)結(jié)果數(shù)據(jù)見(jiàn)表2。
表2 溫室防效結(jié)果統(tǒng)計(jì)表Table 2 Statistical table of greenhouse control effect results
圖5 溫室棉花植株感病效果示意圖Fig. 5 Diagram of disease susceptibility effect of different plants in greenhouse
由表2 可知,比較不同芽孢桿菌浸種處理種子得到的數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)直接對(duì)種子接菌的防效較為突出,菌拌土與菌液噴灑的防護(hù)效果較低。分析3 種接菌濃度處理結(jié)果,發(fā)現(xiàn)當(dāng)浸種用的菌液濃度即OD600值接近0.6時(shí),菌的拮抗效果最優(yōu),且溫室防效大于60%。
前期溫室驗(yàn)證試驗(yàn)結(jié)束后,利用溫室防效試驗(yàn)對(duì)OD600=0.6 時(shí)得到的最優(yōu)菌株進(jìn)行防效驗(yàn)證。根據(jù)表3 的測(cè)試結(jié)果可知,該濃度下的溫室防效依舊最佳為85.91%。
表3 最優(yōu)菌株溫室防效結(jié)果統(tǒng)計(jì)表able 3 Statistical table of optimal strains in greenhouse control effect
注:表中數(shù)據(jù)均為3次重復(fù)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)差。
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本研究利用LB 液體培養(yǎng)基對(duì)拮抗菌進(jìn)行反復(fù)的純化培養(yǎng),并做稀釋涂布以觀察菌落特征,觀察發(fā)現(xiàn)菌落為乳白色、不透明、圓形、表面干燥、邊緣不整齊、有褶皺、菌落中間凹陷。將菌株進(jìn)行大量培養(yǎng)并進(jìn)行生理生化鑒定,然后將該菌提取DNA送樣進(jìn)行16S rRNA測(cè)序,將得到的測(cè)序結(jié)果進(jìn)行BLAST 比對(duì),發(fā)現(xiàn)該菌與貝萊斯芽孢桿菌相似度達(dá)99.71%,初步鑒定該菌為貝萊斯芽孢桿菌[11-13]。
平板對(duì)峙試驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)試驗(yàn)于第21 天拮抗效果更為明顯;通過(guò)連續(xù)48 h測(cè)定細(xì)菌生長(zhǎng)曲線,可以得到最佳的菌株培養(yǎng)時(shí)間,避免因?yàn)榕囵B(yǎng)時(shí)間不足或培養(yǎng)時(shí)間超時(shí)導(dǎo)致菌株失效,試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)14 h 后菌的活性濃度達(dá)到最佳狀態(tài),可以利用該濃度下的菌液進(jìn)行種子處理[14]。
通過(guò)大量溫室防效測(cè)試分析,當(dāng)使用的BJB01菌液濃度接近OD600=0.6 時(shí)進(jìn)行浸種處理的防效最佳,為89.35%,大于60%,符合防效有效值,表明BJB01 的防效明顯。同時(shí),根據(jù)平板對(duì)峙的結(jié)果,發(fā)現(xiàn)于侵染V. dahlia21 d 后,芽孢桿菌對(duì)V.dahliae的拮抗效果達(dá)到最佳。將獲得的最優(yōu)菌株進(jìn)行再次防效測(cè)試,BJB01 的最優(yōu)菌株防效為85.91%,測(cè)試結(jié)果表明獲得的最優(yōu)菌株可以有效防治黃萎病的發(fā)生。試驗(yàn)還發(fā)現(xiàn)使用菌拌土與噴灑菌劑的方式,抗病率較低,不如對(duì)種子進(jìn)行浸種處理防效高。本研究得到了拮抗菌BJB01對(duì)棉花黃萎病防效較好,后續(xù)有望用于生物菌劑的開(kāi)發(fā),為黃萎病的防治提供了更安全有效且環(huán)境友好的防治方法。