單細胞
- 醫(yī)學(xué)生單細胞轉(zhuǎn)錄組測序分析課程的教學(xué)探索
術(shù)的迅猛發(fā)展，單細胞轉(zhuǎn)錄組測序已成為研究復(fù)雜生物系統(tǒng)和個體差異的強大工具。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的應(yīng)用不僅幫助我們理解疾病的發(fā)生機制和進展過程，還有助于揭示個體細胞之間的異質(zhì)性和亞群表達特征，實現(xiàn)對單個細胞基因表達的高分辨率測量，為精準醫(yī)學(xué)的實現(xiàn)提供了新的可能性[1]。了解和掌握單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的原理和應(yīng)用，對于醫(yī)學(xué)生增強科研能力和臨床實踐具有重要意義。通過單細胞轉(zhuǎn)錄組測序分析，我們可以深入了解疾病發(fā)生過程中細胞的表觀遺傳和轉(zhuǎn)錄調(diào)控變化，從而發(fā)現(xiàn)新的生物
科教導(dǎo)刊 2023年24期2023-11-17
- 單細胞基因測序在腫瘤研究中的應(yīng)用
合細胞的特征，單細胞測序從一定程度上解決了傳統(tǒng)測序固有的缺陷，包括單細胞基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序及表觀遺傳組測序，單細胞基因組測序可用來分析單細胞水平的點突變和拷貝數(shù)變異，用于揭示細胞群體差異、細胞進化關(guān)系等，可最真實的獲得單克隆癌細胞的具體突變來源及精準的突變頻率，單細胞轉(zhuǎn)錄組測序可對單細胞中mRNA 進行基因表達定量、功能富集、代謝通路等分析，可以解決傳統(tǒng)轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在各研究領(lǐng)域中的樣品量極低或細胞異質(zhì)性的問題，表觀遺傳組測序可從單細胞水平獲得全基因組
分子診斷與治療雜志 2023年1期2023-03-22
- 單細胞組學(xué)相關(guān)技術(shù)的研究進展*
織的分析介紹，單細胞分析技術(shù)從單個細胞層面對細胞的結(jié)構(gòu)和功能進行分析從而得到更加全面的信息[1]，這有效地彌補由細胞異質(zhì)性導(dǎo)致個體或組織平均數(shù)值引起的誤差[2-3]，為更加充分地了解疾病發(fā)生、發(fā)展的機制以及個體差異化的研究提供了補充。了解單細胞層面的研究方法有很多，如質(zhì)譜、單細胞測序、微流控芯片、流式細胞術(shù)等技術(shù)[4]。利用這些技術(shù)從“組學(xué)”角度探討單個細胞內(nèi)基因、蛋白等分子的分布、動態(tài)變化并揭示其中的關(guān)聯(lián)以發(fā)現(xiàn)未知基因或新的細胞類型等信息[5]。依據(jù)遺傳
廣東醫(yī)學(xué) 2022年7期2023-01-06
- 單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法的應(yīng)用進展
要作用［1］。單細胞基因測序技術(shù)能直觀反映細胞基因間的差異性，但其仍無法具體闡述細胞在生物體復(fù)雜環(huán)境中的表型和功能。蛋白質(zhì)是細胞內(nèi)所有功能的直接執(zhí)行者，可提供結(jié)構(gòu)支持、復(fù)制基因組信息、調(diào)節(jié)基因表達、控制信號傳導(dǎo)、催化代謝反應(yīng)并在細胞內(nèi)轉(zhuǎn)運分子等［2］。因此，對單細胞蛋白質(zhì)組的定性和定量分析，是揭示細胞類型及其狀態(tài)的重要工具，在腫瘤異質(zhì)性、干細胞分化、生殖細胞發(fā)育、循環(huán)腫瘤細胞等領(lǐng)域具有重要應(yīng)用價值。單細胞蛋白質(zhì)組學(xué)可通過研究單個細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的功能信息，揭示
山東醫(yī)藥 2022年30期2022-12-06
- 幽門螺桿菌單細胞精準診療技術(shù)問世
明了幽門螺桿菌單細胞精準診療技術(shù)。研究依托原創(chuàng)的臨床單細胞拉曼藥敏快檢系統(tǒng)（CASTR），建立了單個細菌細胞精度、“鑒定—藥敏—溯源”全流程一體化的幽門螺桿菌診療技術(shù)CAST-R-HP，具有快速病原鑒定、精確藥敏表型檢測、基于單細胞全基因組支撐耐藥機制研究與精準溯源等優(yōu)勢。（趙衛(wèi)華、李忠明、何沛蓯）摘自《科技日報》
新農(nóng)村(浙江) 2022年9期2022-11-22
- 單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)進展及其在生物醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用革新
009年第一個單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（Single-cell RNA sequenc ing，sc RNA-seq）技術(shù)問世以來[1]，對單個細胞的遺傳物質(zhì)進行測序已日漸成為生物醫(yī)學(xué)研究的新范式?；谡麄€轉(zhuǎn)錄組的大量數(shù)據(jù)，scRNA-seq以極高的分辨率提供了有關(guān)基因表達及其調(diào)控的全面信息，從而能夠精準地描述細胞類型和狀態(tài)。近幾年，隨著單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在靈敏度和精確性方面不斷被改良，不僅可以更高效、更低成本地提供全面的生物信息，同時也使更精確地解析單個細胞的
科技與創(chuàng)新 2022年16期2022-08-15
- 單細胞測序技術(shù)在腫瘤中的研究進展
細胞的異質(zhì)性。單細胞測序技術(shù)通過單個細胞檢測腫瘤細胞的異質(zhì)性、鑒定稀有細胞、劃分細胞亞群、追蹤細胞譜系、定位突變基因、發(fā)現(xiàn)新的腫瘤生物標記物等。本文將從測序技術(shù)的進展、單細胞測序技術(shù)的方法及其在腫瘤中的應(yīng)用等3方面進行綜述，并對其發(fā)展前景進行展望。1 測序技術(shù)的進展自20世紀70年代第一代測序技術(shù)(雙脫氧鏈終止法)問世以來，目前測序技術(shù)已經(jīng)發(fā)展到第四代(原位測序法)。原位測序法可用來驗證已知的腫瘤分子生物標記物從而實現(xiàn)組織異質(zhì)性的可視化，但原位測序法通常是
中南醫(yī)學(xué)科學(xué)雜志 2022年5期2022-08-02
- 單細胞組學(xué)數(shù)據(jù)庫的研究進展
群體水平轉(zhuǎn)移到單細胞水平,單細胞測序技術(shù)應(yīng)運而生.在近10多年里,二代測序、顯微鏡和微流控技術(shù)的改進促使具有單細胞分辨率的各種復(fù)雜數(shù)據(jù)集迅速增加[3-4],在腫瘤學(xué)、免疫學(xué)、發(fā)育生物學(xué)甚至植物學(xué)研究領(lǐng)域,單細胞測序技術(shù)已經(jīng)逐漸普及,極大地推動了不同生物學(xué)領(lǐng)域的研究.因而單細胞測序數(shù)據(jù)呈現(xiàn)指數(shù)級的增長,例如張澤民等[5]組建的“新冠肺炎單細胞中國聯(lián)盟(SC4)”把單細胞測序技術(shù)應(yīng)用在新冠病毒的研究中,共收集到196個新冠病人的284個樣本,超過25 T近15
四川師范大學(xué)學(xué)報（自然科學(xué)版） 2022年4期2022-07-01
- 單細胞測序方法研究進展
8071)1 單細胞測序原理單細胞測序從單個細胞水平上對DNA或RNA進行擴增和測序，主要包括單細胞分選、核酸提取和文庫構(gòu)建、高通量測序和數(shù)據(jù)分析等。單細胞分選是單細胞測序的第一步，如何低成本的獲取大批量高質(zhì)量完整的單細胞對于單細胞測序非常重要。Gross等[1]詳細介紹了5種單細胞分選方法，即有限稀釋法(Limiting Dilution)、顯微操作法(Micromanipulator)、熒光激活細胞分選(Fluorescence activated c
生物信息學(xué) 2022年2期2022-06-13
- 單細胞測序技術(shù)在胃癌研究中的應(yīng)用*
入研究[8]。單細胞測序技術(shù)能更精準地從細胞、基因以及分子層面揭示GC的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移機制，提高GC的診斷和個體化治療以及預(yù)后評估水平。1 單細胞測序技術(shù)隨著流式細胞術(shù)(fluorescence activated cell sorting，F(xiàn)ACS)[9-10]、激光捕獲顯微切割(laser capture microdissection, LCM)[11-12]以及微流控(microfluidics)[13]等單細胞分離技術(shù)的出現(xiàn)以及新一代測序平臺的
臨床檢驗雜志 2022年3期2022-05-05
- 單細胞測序技術(shù)及其在畜牧科學(xué)研究中的應(yīng)用
的作用[1]。單細胞測序的基本原理是將分離得到的單個細胞進行微量RNA擴增，然后通過高通量測序得到單個細胞的表達量，鑒定細胞類型，分析細胞發(fā)育的時空歷程[2]。第1個單細胞RNA測序結(jié)果于2009年，由北京大學(xué)的湯富酬教授[3]發(fā)表在NatureMethods上，首次探索了小鼠單細胞轉(zhuǎn)錄范圍的異質(zhì)性。此后，單細胞測序技術(shù)不斷應(yīng)用于各種科學(xué)研究中。Navin等[4]在2011年發(fā)表了第1篇關(guān)于單細胞核測序(SNS，一種單細胞測序)在乳腺癌中應(yīng)用的文章。Kim
中國牛業(yè)科學(xué) 2022年4期2022-04-08
- 第一個病毒是怎么來的？
成細菌、真菌和單細胞生物等，而一部分則演化成了病毒。根據(jù)這一理論，病毒最早誕生自4.6億年前。第二種理論是“縮減理論”。這種理論認為病毒由具有寄生功能的單細胞有機體“退化”而來。單細胞有機體由DNA生物縮減成RNA生物。如果病毒是這樣誕生的，那么科學(xué)家估計病毒最早誕生自3.7億年前。第三種則是“脫離理論”。根據(jù)脫離理論，原來自然界里只有細菌、真菌和單細胞生物等。因某種原因，它們一些遺傳物質(zhì)脫離并存活了下來，然后逐漸演化成病毒。如果病毒是這么來的話，那么病毒
科學(xué)之謎 2021年4期2021-07-09
- 單細胞基因組測序技術(shù)新進展及其在生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用
，施奇惠綜 述單細胞基因組測序技術(shù)新進展及其在生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用王卓，申笑涵，施奇惠復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院, 上海 201100隨著單細胞基因組測序技術(shù)的建立與發(fā)展，對細胞基因組特征的分析進入了單細胞水平。單細胞的基因組分辨率不但使研究人員能夠在單細胞尺度上分析腫瘤細胞的異質(zhì)性，也使得傳統(tǒng)上難以檢測的稀有細胞的基因組研究成為可能。這些稀有細胞往往具有重要的生物學(xué)意義或臨床價值，如癌癥患者血液中循環(huán)腫瘤細胞(circulating tumor cell, CT
遺傳 2021年2期2021-02-26
- 萬乘基因：打造單細胞測序“全方位閉環(huán)”
文/俞靈琦讓單細胞測序技術(shù)更簡單易用，價格更加可負擔(dān)，并且更快地推動這項技術(shù)走向標準化，成為施威揚教授創(chuàng)辦萬乘基因的初衷。在新冠肺炎疫情的沖擊下，生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)獲得了更多的重視。其中，單細胞測序技術(shù)在此次防控疫情的過程中發(fā)揮了重要的作用。那么，何為單細胞測序技術(shù)？單細胞測序技術(shù)于2009年首次被應(yīng)用于胚胎細胞研究當(dāng)中，2013年《自然》將其評選為“Method of the Year”。但是，一直以來，相對昂貴的成本和復(fù)制的實驗流程限制了其應(yīng)用。隨著測序變得
華東科技 2021年1期2021-01-20
- 單細胞測序及其在寄生蟲學(xué)研究中的應(yīng)用
116081)單細胞測序(single-cell sequencing，SCS)是指在單個細胞水平上，對基因組、轉(zhuǎn)錄組或表觀組進行的高通量測序技術(shù)[1]．在先前的研究中，常常認為生物體同一組織中的群體細胞具有相同功能．然而，組織細胞間的異質(zhì)性導(dǎo)致了同型細胞在基因功能和表達之間存在不同程度的差異．傳統(tǒng)的測序技術(shù)只能檢測生物體群體細胞的整體表達水平，而非單個細胞水平．隨著單細胞測序的出現(xiàn)，在單細胞水平上分析同型細胞基因功能與表達之間的差異性成為可能．近年來，單
遼寧師范大學(xué)學(xué)報（自然科學(xué)版） 2020年4期2020-12-29
- 下呼吸道感染銅綠假單胞菌流行和耐藥現(xiàn)狀分析
460）銅綠假單細胞是一種分布廣泛的病原菌，是引起下呼吸道感染的元兇之一。并且由于其自身復(fù)雜的耐藥機制，很容易對各種類型的抗生素產(chǎn)生耐藥性，加之呼吸道的防御機制很難將其殺滅，使得由于銅綠假單細胞菌引起的下呼吸道感染的治療難度增大。對于當(dāng)前下呼吸道感染銅綠假單細胞菌的流行現(xiàn)狀，以及其對于各種抗生素的耐藥性情況進行研究，對于很利用藥與治療具有重要的意義。1 下呼吸道感染銅綠假單細胞菌的流行情況分析銅綠假單細胞菌是一種條件致病菌，在諸多報到中，其主要的定植與感染
臨床醫(yī)藥文獻雜志(電子版) 2020年13期2020-12-14
- 單細胞蛋白替代魚粉對斷奶仔豬生長性能和腸道形態(tài)的影響
422000）單細胞蛋白是指酵母、細菌、真菌和微藻等微生物的干燥細胞，在大型培養(yǎng)系統(tǒng)中生長，用作人類食品或動物飼料的蛋白質(zhì)來源。與魚粉相比，大多數(shù)來自細菌和酵母的單細胞蛋白具有相似的賴氨酸、蛋氨酸和半胱氨酸含量，以及較高比例的色氨酸和蘇氨酸（聶琴等，2017）。單細胞報道中不僅含有蛋白質(zhì)，還含有游離氨基酸、脂類、碳水化合物、維生素和礦物質(zhì)。利用廢棄材料作為基質(zhì)生產(chǎn)蛋白質(zhì)，提供一種經(jīng)濟可行的蛋白質(zhì)來源，可用于動物飼料和人類消費的產(chǎn)品，因為它通?？梢詽M足日糧蛋
中國飼料 2020年18期2020-11-18
- 單細胞測序技術(shù)在微生物生態(tài)領(lǐng)域中的應(yīng)用
100049）單細胞測序技術(shù)是指在單細胞水平上，通過全基因組或轉(zhuǎn)錄組擴增，對核酸分子進行高通量測序的技術(shù)。該技術(shù)能夠揭示單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達水平，反映細胞間的異質(zhì)性，剖析單個細胞對生態(tài)系統(tǒng)或有機體的貢獻［1-2］。1990 年，Iscove等［3］首次提出對單細胞進行轉(zhuǎn)錄組分析的構(gòu)想，并用 PCR技術(shù)實現(xiàn)了對 cDNA 分子的指數(shù)級擴增。1992年，Telenius等［4］開發(fā)出寡核苷酸引物PCR（Degenerate oligonucleotid
生物技術(shù)通報 2020年10期2020-11-02
- 巴西橡膠樹小孢子單細胞顯微分離研究
試驗材料來獲取單細胞，利用5%纖維素酶、5%果膠酶、5% β-葡聚糖酶、5%纖維素酶與4%果膠酶混合酶4種酶液，探索酶解四分體胼胝質(zhì)的最佳方案。結(jié)果表明：在37 ℃條件下酶解1 h，5%纖維素酶與4%果膠酶混合酶的酶解效果最佳，可得到品質(zhì)良好的小孢子單細胞。通過對拉制針尖細長度、磨針斜口直徑以及顯微操作分離體系的不斷探索與試驗，成功建立一套適合巴西橡膠樹‘熱研7-33-97小孢子單細胞的顯微分離技術(shù)體系。小孢子單細胞是減數(shù)分裂的直接產(chǎn)物，對小孢子單細胞進行
熱帶作物學(xué)報 2020年8期2020-09-26
- 美國Calico公司開發(fā)出新型單細胞測序數(shù)據(jù)分析工具（2020.6.28 Plant Biotechnology Journal ）
隨著單細胞測序技術(shù)的不斷開發(fā)，目前可實現(xiàn)在單細胞中研究基因轉(zhuǎn)錄和表觀遺傳調(diào)控等相關(guān)生物學(xué)過程，單細胞基因組可以用于分類樣本中細胞類型，檢測樣本之間細胞類型組成和基因表達的變化，并跟蹤細胞譜系以及在發(fā)育和衰老階段狀態(tài)的變化等。最近利用微流控液滴或微孔來分離單個細胞的實驗方法使得單細胞基因組學(xué)的通量有了數(shù)量級提升。其基本原理為用單個液滴包裹單個細胞，在對每個細胞的mRNA測序前做逆轉(zhuǎn)錄時，為其加上獨一無二的標簽（barcode）序列。但其中會存在多個細胞被單個
三農(nóng)資訊半月報 2020年12期2020-07-31
- 基于單細胞靶向測序探究基因堿基突變的方法
技術(shù)與方法基于單細胞靶向測序探究基因堿基突變的方法趙利楠1，王娜1，楊國良2，蘇現(xiàn)斌1，韓澤廣11. 上海交通大學(xué)，系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院，系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)教育部重點實驗室，上海 200240 2. 上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟醫(yī)院泌尿科，上海 200127分析基因堿基突變是探究腫瘤細胞克隆演化的研究方法之一。目前，常取組織不同區(qū)域的群體細胞測序，基于群體水平的基因堿基突變頻率等信息繪制出腫瘤的克隆演化過程。但是，該方法易遺失低頻突變，并且組織群體細胞類型不單一，不
遺傳 2020年7期2020-07-21
- 核心素養(yǎng)背景下生物重要概念課例
生物重要概念;單細胞;初中生物新課程改革背景下，學(xué)校要想開展有效的初中生物教學(xué)活動，教師既要讓學(xué)生建立生物學(xué)核心概念，以達成對生命觀念的理解;又要讓學(xué)生參與科學(xué)探索的實踐，體驗生物學(xué)知識的形成過程、感悟生物學(xué)思想和方法，從而提升學(xué)生的科學(xué)思維和科學(xué)探究精神。因此，學(xué)生要想學(xué)好生物概念需要有豐富的學(xué)習(xí)經(jīng)歷和生活經(jīng)驗，尤其是對重要概念的理解和生命觀念的建立不能通過死記硬背來實現(xiàn)。本文將以“觀察單細胞生物草履蟲”這一課為例，探討如何有效開展生物重要概念的教學(xué)。一
教育界·上旬 2020年8期2020-06-27
- 單細胞拉曼分選技術(shù)在大腸桿菌分離中的應(yīng)用
態(tài)功能[6]。單細胞技術(shù)能夠可逐一表征微生物在其原生群落中的特性，建立表型與基因型的關(guān)聯(lián)，為微生物研究提供新思路[3,7]。單細胞技術(shù)包括特征細胞的識別、單細胞分選以及單細胞測序等分析過程。單細胞拉曼光譜作為一種非標記、原位的識別方法，能夠表征細胞的核酸、蛋白質(zhì)、脂肪等代謝物質(zhì)的組成與含量，并依據(jù)這些細胞固有生化信息來區(qū)分不同種屬的微生物。傳統(tǒng)單細胞分離方法有流式細胞術(shù)[8-9]、激光顯微切割[10]等，但由于微生物通常尺寸很小，難以使用這些方法實現(xiàn)準確分
生物化工 2020年2期2020-05-18
- 昭通市藻類植物資源研究（Ⅷ）
lla。植物體單細胞，細胞呈圓盤狀，殼面邊緣有一環(huán)放射狀排列的線紋。色素體顆粒狀充滿整個細胞。標本采集地：大關(guān)羅漢壩。庫氏小環(huán)藻C.Kutzingiana：小環(huán)藻屬Cyclotella。植物體單細胞，細胞呈圓盤狀，殼面邊緣有一環(huán)放射狀結(jié)構(gòu)。色素體位于細胞邊緣，中央圓形五色素體。標本采集地：大關(guān)羅漢壩；昭陽區(qū)省耕公園。星形庫氏小環(huán)藻C.kützingiana var.planetophora Fricke：小環(huán)藻屬Cyclotella。藻體呈扁柱形，單細胞，
昭通學(xué)院學(xué)報 2020年5期2020-02-24
- 激光剝蝕-電感耦合等離子體質(zhì)譜定量分析單細胞中的銀納米顆粒
建立了定量分析單細胞中銀納米顆粒（AgNP）的方法。利用噴墨打印機制備出與細胞基體相似的皮升級液滴， 作為單細胞定量標準， 再利用LAICPMS定量分析暴露AgNP的小鼠巨噬細胞。結(jié)果表明， 95個單細胞中AgNP含量為19.1～1682 fg， 呈對數(shù)正態(tài)分布， 平均值為（166±188） fg， 與酸消解分析得到的細胞群體AgNP平均含量（（175±2） fg）相符。LAICPMS在單細胞分析方面具有巨大潛力， 有望進一步應(yīng)用于單細胞水平的金屬納米顆粒
分析化學(xué) 2019年9期2019-10-09
- 單細胞蛋白定量檢測方法綜述*
]。這意味著在單細胞水平測得的數(shù)據(jù)更能夠精確地反映生命事件的真實情況，單細胞蛋白定量檢測技術(shù)對于深入理解生命活動過程具有重要意義[7]。除此之外，單細胞蛋白定量檢測技術(shù)對于珍貴樣本、稀有細胞的分析也具有重要意義。例如，對循環(huán)腫瘤細胞(circulating cumor cell,CTC)的蛋白定量檢測能夠直接得到腫瘤細胞的表型信息，有助于病情判斷和藥物研發(fā)[8]，然而每7.5 mL血液中僅有1～500個CTC，數(shù)量極其有限，傳統(tǒng)的針對宏觀大量細胞分析的技術(shù)
傳感器與微系統(tǒng) 2019年10期2019-03-19
- 哺乳動物單細胞研究技術(shù)的現(xiàn)狀與未來
一個體中，不同單細胞都有其獨特的基因組。多細胞研究的結(jié)果僅體現(xiàn)出這些多細胞的總體情況，而不能體現(xiàn)單個細胞之間的差異。單個體細胞基因組的變異，諸如單核苷酸變異(SNVs)、拷貝數(shù)變異 (CNVs) 和結(jié)構(gòu)變異，可能導(dǎo)致癌癥及其他疾病的產(chǎn)生[5-7]。為了打破多細胞研究的局限性，人們越來越關(guān)注單細胞研究。單細胞研究有助于我們研究癌癥等相關(guān)疾病。無論是增殖或休眠的腫瘤組織，單個細胞都是支配癌癥生物學(xué)各方面的決定因素[8]。對腫瘤組織單細胞水平的分析能了解腫瘤內(nèi)遺
生物工程學(xué)報 2019年1期2019-01-30
- 單細胞測序技術(shù)在實體瘤研究中的應(yīng)用進展
質(zhì)性。近年來，單細胞測序技術(shù)的出現(xiàn)為進一步鑒別腫瘤的異質(zhì)性提供了新的手段。對實體瘤及其微環(huán)境中單個細胞的基因組、轉(zhuǎn)錄組及表觀遺傳學(xué)進行測序分析，不僅能揭示瘤內(nèi)細胞異質(zhì)性，還能有效區(qū)分腫瘤微環(huán)境中的各細胞亞群，從而有利于研究腫瘤發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移、耐藥和免疫逃逸的相關(guān)機制。1 單細胞測序技術(shù)概述單細胞測序技術(shù)主要包括單細胞基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序和表觀遺傳學(xué)測序（圖1），它們各有優(yōu)勢和特點，能夠從不同角度揭示細胞的功能狀態(tài)。與以往樣本測序不同，我們需要先將實體組
中國癌癥雜志 2019年7期2019-01-08
- 單細胞分析研究進展
序技術(shù)的提高，單細胞分析逐漸受到關(guān)注。單細胞分析即是通過相應(yīng)的技術(shù)對單個靶細胞進行分離提取，并通過全基因組擴增及二代測序等技術(shù)對靶細胞內(nèi)的基因組信息、蛋白信息進行分析的過程。通過單細胞分析，會將腫瘤進展過程中的細胞變化、單個CTC的遺傳狀態(tài)、細胞與細胞間的異質(zhì)性、利用胎兒細胞遺傳疾病等問題迎刃而解[2]。本文將從近年來單個細胞的分離與提取手段、全基因組擴增及下游組學(xué)分析等研究進展作一綜述。1 單細胞的分離與提取單個細胞的分離與提取是進行單細胞分析的前提條件
檢驗醫(yī)學(xué)與臨床 2018年7期2018-02-12
- 一種快速分離蘋果果肉單細胞的方法
劉成連摘要：單細胞是生物體的基本單位，提取具有活性的單細胞是研究果實發(fā)育的基礎(chǔ)。以蘋果為材料，研究不同酶液組合和酶解時間對蘋果果肉單細胞分離的影響。結(jié)果表明，蘋果果肉在01%離析酶、暗酶解05 h時，為理想的蘋果果肉單細胞分離條件。關(guān)鍵詞：蘋果；單細胞；離析酶；酶解濃度；酶解時間中圖分類號： S661101文獻標志碼：文章編號：1002-1302（2017）16-0138-02[HJ14mm]收稿日期：2016-03-29基金項目：山東省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年16期2017-10-27
- 基于可開啟微流控芯片的循環(huán)腫瘤細胞捕獲及單個細胞的提取
啟微流控芯片；單細胞；轉(zhuǎn)印中圖分類號：TP311 文獻標識碼：A 文章編號：1009-3044（2017）03-0229-03Circulating Tumor Cell Capture and Single Cell Extraction Based on an Openable Microfluidic ChipsFANG Yi，QIN Lu-man，LIU Kan，ZHANG Nan-gang（Wuhan Textile University，Wuh
電腦知識與技術(shù) 2017年3期2017-03-27
- 美、英及我國政府對單細胞測序研究及應(yīng)用領(lǐng)域的基金資助
科技領(lǐng)域之一。單細胞測序(Single-Cell Sequencing)即從單個細胞水平上對基因組進行測序，把基因測序應(yīng)用到單個細胞層面，對于識別細胞的類型、功能，特定細胞健康或狀態(tài)的變化、變異至關(guān)重要[1]。隨著靈敏度不斷提升，單細胞測序逐步成熟。2012年謝曉亮及其團隊發(fā)明的單細胞基因組擴增新技術(shù)(MALBAC)使單細胞精準測序成為可能，極大地推動了單細胞測序甚至基因測序的進展。2013年，Science雜志將單細胞測序評選為“2013年最具發(fā)展前景的
中華醫(yī)學(xué)圖書情報雜志 2017年9期2017-03-22
- 單細胞水平原鈣黏蛋白基因簇的轉(zhuǎn)錄分析
200240)單細胞水平原鈣黏蛋白基因簇的轉(zhuǎn)錄分析陳志鋒1， 彭 萊2， 吳 強1，2(1.上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院，上海 200240；2.上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院比較生物醫(yī)學(xué)中心/系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)教育部重點實驗室，上海 200240)原鈣黏蛋白(protocadherin，Pcdh)基因簇由緊密相連的3個基因簇(Pcdhα、Pcdhβ和Pcdhγ)組成，其中α、β基因簇包含可變區(qū)外顯子(C型和非C型)和恒定區(qū)外顯子。這種獨特的基因排列方式使Pcd
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年2期2017-03-01
- 微流控芯片下的單細胞輪廓定位與提取
微流控芯片下的單細胞輪廓定位與提取夏海英1，肖雯靜1，薛茗月2(1.廣西師范大學(xué)電子工程學(xué)院，廣西桂林541004； 2.廣西師范大學(xué)化學(xué)與藥學(xué)學(xué)院，廣西桂林541004)摘要：微流控芯片可實現(xiàn)單細胞分析，而對單個細胞分析，能夠掌握更準確更全面的細胞信息，可以克服以往群體分析中平均結(jié)果對個別信息掩蓋的局限性，對疾病的早期預(yù)防和診斷具有重要的科學(xué)意義。本文根據(jù)早期癌癥細胞通過微流控芯片中的彎道時變形與正常細胞不同的理論，采用Grabcut和Snake相融合的
廣西師范大學(xué)學(xué)報（自然科學(xué)版） 2016年2期2016-08-08
- 基因組網(wǎng)絡(luò)分析與功能模塊設(shè)計—2013年度科技報告
了元件與模塊的單細胞拉曼表征平臺，并利用該平臺成功開發(fā)了一種不需外加標記的活體單細胞油脂和淀粉的定量分析技術(shù)，為產(chǎn)油和產(chǎn)淀粉相關(guān)元件與模塊在難培養(yǎng)微生物中的發(fā)掘提供了新的方法，同時為針對其他目標化合物的單細胞分析與分選技術(shù)的開發(fā)奠定了基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：合成生物學(xué) 細胞工廠 生物元件 單細胞Abstract：The main objectives for year 2013 have been completed. In year 2013， we have s
科技創(chuàng)新導(dǎo)報 2016年17期2016-05-30
- 單細胞分析技術(shù)研究進展
10023)?單細胞分析技術(shù)研究進展劉 佳, 劉 震*(南京大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院, 生命分析化學(xué)國家重點實驗室, 江蘇 南京 210023)細胞是生命結(jié)構(gòu)和生命活動的基本單位,基于單細胞的研究是生命研究的基礎(chǔ)。由于細胞體積極小、細胞微環(huán)境復(fù)雜并且起到關(guān)鍵作用的組分含量往往較低,因此在很多方面單細胞分析仍然是一項具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)。該文對現(xiàn)有的單細胞分析技術(shù)進行歸納、總結(jié),重點介紹了不同單細胞分析技術(shù)的特點及其應(yīng)用的最新進展。單細胞分析;毛細管電泳;微流控芯片;質(zhì)
色譜 2016年12期2016-04-10
- 單細胞蛋白的開發(fā)與利用
婷 劉相春 ?單細胞蛋白的開發(fā)與利用孔祥霞 高婷婷 劉相春（山東省莒縣動物疫病預(yù)防控制中心 276500）（山東省莒縣動物衛(wèi)生監(jiān)督所）（山東省莒縣畜牧獸醫(yī)局）文章概述了單細胞蛋白的基本特性、生產(chǎn)原理，生產(chǎn)單細胞蛋白的微生物種類，以及單細胞蛋白的營養(yǎng)成分和單細胞蛋白飼料的原料，介紹了單細胞蛋白生產(chǎn)的一般工藝，探討了單細胞蛋白飼料的安全性評價、營養(yǎng)性評價和應(yīng)用效果及應(yīng)用中存在的問題及解決辦法，最后展望了單細胞蛋白在飼料加工中的應(yīng)用前景。單細胞蛋白 (singl
山東畜牧獸醫(yī) 2016年9期2016-04-05
- 單細胞測序技術(shù)的研究與應(yīng)用進展
學(xué)生命科學(xué)學(xué)院單細胞測序技術(shù)的研究與應(yīng)用進展韓悅 河南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院傳統(tǒng)的測序方法是對細胞群體的總平均反應(yīng)進行分析，而細胞間存在異質(zhì)性。單細胞測序是在單個細胞水平上進行的高通量測序技術(shù)，可準確測出單個細胞的基因結(jié)構(gòu)及表達狀態(tài)，分析同一表型細胞間的遺傳異質(zhì)性，在癌癥、微生物學(xué)等領(lǐng)域有舉足輕重的地位。本文對單細胞測序主要流程及該技術(shù)在不同領(lǐng)域的應(yīng)用進展進行闡述，為這一技術(shù)的研究與發(fā)展提供參考。單細胞分離；基因組擴增；應(yīng)用隨著科技水平的發(fā)展，DNA測序技術(shù)
科學(xué)中國人 2016年20期2016-01-28
- 舌癌單細胞培養(yǎng)建系與癌干細胞相關(guān)標志的檢測
13M1細胞系單細胞培養(yǎng)建系為基礎(chǔ)，觀察Tca8113M1細胞系中舌癌干細胞存在的現(xiàn)象及其相關(guān)標志的變化規(guī)律。方法 選取Tca8113M1細胞系，以有限稀釋法進行體外單細胞培養(yǎng)并建立細胞亞系，在證實其成瘤性的基礎(chǔ)上，進一步采用流式細胞術(shù)檢測癌干細胞相關(guān)標志CD44、CD184、細胞外可溶性抗原（ESA）的表達情況，著重觀察單個細胞培養(yǎng)形成細胞克隆的形態(tài)與時間。結(jié)果 以有限稀釋法獲取192個Tca8113M1舌癌單個細胞，在96孔板中進行體外培養(yǎng)，獲取12個
華西口腔醫(yī)學(xué)雜志 2013年1期2013-05-10
- 研磨法和組織分離器制備乳腺癌腋窩淋巴結(jié)單細胞懸液的比較
腺癌腋窩淋巴結(jié)單細胞懸液的比較陳相彪，楊偉明，陸 婧,王春林,唐 聃,賀新媛,駱禮波,石 磊(遵義醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院 甲狀腺乳腺外科，貴州 遵義 563099)目的比較研磨法和Gentle MACS組織分離器制備乳腺癌患者腋窩淋巴結(jié)單細胞懸液在活細胞率、絲狀物及細胞團塊方面的優(yōu)缺點，為淋巴組織細胞培養(yǎng)和流式分析找到一種更為可靠的方法。方法分別用研磨法和Gentle MACS組織分離器制備單細胞懸液，臺盼蘭染色后計數(shù)活細胞、死細胞、細胞團塊和絲狀物，并比較兩種方
遵義醫(yī)科大學(xué)學(xué)報 2012年5期2012-11-14
- 單細胞蛋白的優(yōu)點及應(yīng)用
765001 單細胞蛋白概念1966年，在麻省理工學(xué)院召開的會議上，第一次給單細胞蛋白下了定義，把單細胞蛋白叫做菌體蛋白、微生物蛋白。緊接著在次年的召開的全世界單細胞蛋白會議上，又將微生物菌體蛋白統(tǒng)稱為單細胞蛋白，把單細胞蛋白進行分類。按不同的標準來進行分類，例如：按產(chǎn)生菌的類別不同，又可以分為真菌蛋白、細菌蛋白等；按生產(chǎn)原料的不同，可以分為甲烷蛋白、甲醇蛋白、石油蛋白等。單細胞蛋白具有極為豐富的營養(yǎng)價值。其中，各種氨基酸的組成較為齊全，富含有人體所必需的
中國衛(wèi)生產(chǎn)業(yè) 2012年13期2012-08-15
- 單細胞組分分析的研究進展
250014單細胞組分分析的研究進展聶素娟 山東師范大學(xué)化學(xué)化工與材料科學(xué)學(xué)院， 山東濟南 250014單細胞內(nèi)組分的分析和測定對疾病的治療和藥物篩選具有重要的意義。本文比較了兩種單細胞組分分析的方法即毛細管電泳和微流控芯片，并敘述了微流控芯片在單細胞研究方面的進展。單細胞組分分析；毛細管電泳；微流控芯片the analysis of intracellular components in individual cells; capillary elec
中國科技信息 2011年16期2011-11-15
- “單細胞”體征的輿論場建構(gòu)——以新疆“7·5”事件報道為例
□ 關(guān)琮嚴“單細胞”體征的輿論場建構(gòu) ——以新疆“7·5”事件報道為例□ 關(guān)琮嚴“場域”是布爾迪厄社會學(xué)中的一個關(guān)鍵的空間隱喻，即“位置之間客觀關(guān)系的網(wǎng)絡(luò)或圖式”。①在2009年新疆“7·5”事件的報道過程中，國內(nèi)媒體積極構(gòu)建社會輿論的過程可以被看做是對國內(nèi)媒體進行整合，與國外媒體進行斗爭的過程。其間反映出的真實信息與虛假信息、國內(nèi)媒體與國外媒體以及正面輿論與負面輿論之間的斗爭對抗，其實映射出了一種社會權(quán)力的結(jié)構(gòu)關(guān)系，而這恰恰是布爾迪厄“場域”概念的關(guān)鍵所
聲屏世界 2010年1期2010-11-16