何飛剛
(陜西教育學(xué)院 化學(xué)系,陜西 西安 710061)
科研與開發(fā)
2-(2-羥苯基)苯并咪唑的新穎合成和晶體結(jié)構(gòu)*
何飛剛
(陜西教育學(xué)院 化學(xué)系,陜西 西安 710061)
基于2-(2-1羥苯基)苯并咪唑(HPBI)在生物學(xué)、藥理學(xué)及光電材料等方面的性質(zhì)和應(yīng)用意義,查閱大量文獻(xiàn),報(bào)道了配體HPBI新穎的合成方法,采用單晶衍射進(jìn)行表征,并進(jìn)行了該配體的晶體結(jié)構(gòu)測定。結(jié)果表明,晶體屬于單斜晶系,空間群 P2(1),晶胞參數(shù):a=3.8541(10),b=2.2170(6),c=5.8638(15),α=90°,β=95.642(4),γ=90°,V=0.4986(2)nm3,Z=2,Dc=1.400g·cm-3,F(000)=220,GOF=1.053,R1=0.0430,wR2=0.0918(I>2σ(I))。
2-(2-羥苯基)苯并咪唑;制備方法;晶體結(jié)構(gòu)
Abstract:A novel synthesismethod of 2-(2-hydroxyphenyl)benzimidazole(HPBI)was studied on the base of consulting many relating literatures.The structure of title compound prepared have been comfirmed by X-ray diffraction analysis for 2-(2-hydroxyphenyl)benzimidazole.The results showed that HPBI:monoclinic system,space group P2(1),a=3.8541(10),b=2.2170(6),c=5.8638(15),α=90°,β=95.642(4),γ=90°,V=0.4986(2)nm3,Z=2,Dc=1.400g/cm3,F(000)=220,GOF=1.053,R1=0.0430,wR2=0.0918(I>2σ(I))。
Key words:2-(2-hydroxyphenyl)benzimidazole(HPBI);synthesismethod;crystal structure
近年來,熒光探針技術(shù)在生命科學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域應(yīng)用越來越廣泛,發(fā)揮著越來越重要的作用。因此,開發(fā)出新型更靈敏的,同時(shí)要避免生物熒光背景干擾的熒光探針已成為目前研究的熱點(diǎn)[1]。2-(2-羥苯基)苯并咪唑(HPBI)具有較大的離域π電子體系,是非常有意義的熒光化合物[2-5],通過激發(fā)態(tài)分子內(nèi)質(zhì)子轉(zhuǎn)移(ESIPT),產(chǎn)生互變異構(gòu)體[6],發(fā)射具有大的斯托克斯位移的特征熒光,并且熒光量子產(chǎn)率高、光穩(wěn)定性好,在新型熒光探針的開發(fā)、生物領(lǐng)域的分子開關(guān)、聚合物紫外穩(wěn)定劑等方面有著重要意義,應(yīng)用前景也十分廣泛,同時(shí)由于它含有苯酚基和苯并咪唑基這兩個(gè)類生物體內(nèi)金屬配位環(huán)境中的酪氨酸和組氨酸基團(tuán),因此,以該化合物為配體合成配合物具有生物學(xué)意義。
HPBI傳統(tǒng)的合成方法是用水楊酸和鄰苯二胺在多聚磷酸溶劑中,190~210℃加熱條件下合成,產(chǎn)率很低,后來TakashiFukuta和他的合作者采用光解單核席夫堿錳化合物[7]得到該化合物,產(chǎn)率為40%左右,但條件較為苛刻。而后,Yuka Kawashita和他的合作者[8]采用被O2活化的活性炭做催化劑,二甲苯溶劑中,120℃回流26h,得到目標(biāo)產(chǎn)物,產(chǎn)率可觀,約為64%。在本實(shí)驗(yàn)中,我們成功的在醇溶劑中,水浴加熱回流條件下,得到了鄰苯二胺與水楊醛的關(guān)環(huán)產(chǎn)物及其可測單晶,產(chǎn)率約為60%。相比較而言,該合成方法兼顧了條件溫和、操作簡便、產(chǎn)率可觀以及環(huán)境友好等幾個(gè)優(yōu)點(diǎn)。
1.1 試劑和儀器
水楊醛化學(xué)純;鄰苯二胺、甲醇、無水乙醇均為分析純。
X射線四圓衍射儀。
1.2 HPBI的合成
1.2.1 合成路線
1.2.2 合成方法 按1∶1的摩爾比稱取鄰苯二胺與水楊醛,分別溶于適量無水乙醇中,將鄰苯二胺的乙醇溶液轉(zhuǎn)入三頸燒瓶中,在水浴,攪拌下,水楊醛的乙醇溶液被緩緩滴入,回流1 h,得到一均相桔色溶液,將該溶液置于-4℃的環(huán)境下,1 d后有少量黃色晶粒產(chǎn)生(副產(chǎn)物),過濾,濾液中加入少許乙醚,室溫條件下放置兩天后有大量黃色針狀晶體析出,抽濾,少量無水乙醇洗滌,甲醇重結(jié)晶,產(chǎn)率60%,熔點(diǎn)為250~251℃。
HPBI的晶體結(jié)構(gòu)
取一粒0.14mm×0.11mm×0.27mm的晶體置于Brucker SMARTAPEX CCD型單晶衍射儀,用經(jīng)過石墨單色器的Mo Kα作為入射線,在1.84°≤θ≤29°范圍內(nèi)收集到 3063 個(gè)衍射數(shù)據(jù),I>2σ(I)衍射點(diǎn)1862個(gè)用于結(jié)構(gòu)的解析和修正,晶體結(jié)構(gòu)由直接法解出。全部非氫原子經(jīng)Fourier合成及差值電子密度函數(shù)修正,從差值電子密度函數(shù)并結(jié)合幾何分析獲得氫原子坐標(biāo)。全部非氫原子坐標(biāo)、各向異性溫度因子、氫原子坐標(biāo)及各向同性溫度因子經(jīng)全矩陣最小二乘法修正。
圖1 HPBI的晶體結(jié)構(gòu),虛線表示分子間氫鍵Fig 1 An crystal structure of HPBI,the dash line denote the intramolecular hydrogen bond
氫鍵圖示見圖2。
圖2 由分子間氫鍵構(gòu)成的一維'Z'字鏈Fig.2 The one-dimensional zigzag chain structure of HPBI formed by intermolecular hydrogen bonded
圖3 HPBI的晶胞Fig.3 The crystal cell of HPBI
由圖1可見,2-(羥苯基)苯并咪唑分子結(jié)構(gòu)中,苯并咪唑環(huán)與酚羥基基本共面,其二面角為2.2°。咪唑環(huán)上的N原子與酚羥基上的氧原子之間存在分子內(nèi)氫鍵,O1…N2鍵距為2.5779(19) 。同時(shí),咪唑環(huán)上的另一個(gè)N原子與相鄰的另一分子的酚羥基上的氧原子之間存在較強(qiáng)的分子間氫鍵[N(1A)…O(1B)2.9093(19) ],見圖 2,從而形成一條“Z”字型一維鏈。由化合物2-(羥苯基)苯并咪唑的堆積結(jié)構(gòu)(圖3)我們可以看出,在空間結(jié)構(gòu)上該化合物以一維鏈為結(jié)構(gòu)單元,層層排列,層與層之間的距離約為6.52,遠(yuǎn)大于存在π…π堆積相互作用的距離(3.3~4.0),因此,可認(rèn)為并不存在π…π堆積相互作用。
原子坐標(biāo)及各向同性熱參數(shù)列于表1,鍵長鍵角列于表2。
表 1 HPBI的部分原子坐標(biāo)(104)和等效位移參數(shù)(2×103)Tab.1 Atomic coordinates(104)and isotropic thermal parameters(2×103)of Hpbm
表 1 HPBI的部分原子坐標(biāo)(104)和等效位移參數(shù)(2×103)Tab.1 Atomic coordinates(104)and isotropic thermal parameters(2×103)of Hpbm
atom X y z B(eq)C(1)C(2)C(3)C(4)C(5)C(6)C(7)C(8)C(9)C(10)C(11)C(12)C(13)N(1)N(2)O(1)6474(5)7530(5)6988(5)5331(6)4223(5)4722(4)3528(5)1051(4)-641(5)-828(5)612(6)2286(6)2529(5)1732(4)4059(4)7114(4)9099(1)8512(1)8068(1)8202(1)8782(1)9240(1)9855(1)10644(1)11054(1)11638(1)11811(1)11403(1)10807(1)10037(1)10304(1)9526(1)4571(3)5048(3)3423(3)1289(3)796(3)2414(3)1949(3)144(3)-1359(3)-605(3)1573(3)3061(3)2333(3)-62(2)3426(2)6209(2)43(1)52(1)55(1)54(1)47(1)39(1)39(1)41(1)50(1)55(1)56(1)51(1)42(1)43(1)43(1)57(1)
表2 化合物HPBI的主要鍵長( )和鍵角(°)及氫鍵( )Tab.2 Selected bond lengths( )and bond angles(°)and hydrogen bonds HPBI
本文在查閱大量資料基礎(chǔ)上,報(bào)道了化合物2-(2-羥苯基)苯并咪唑(HPBI)的一種新型合成方法,該法合成條件溫和、產(chǎn)率較高并且環(huán)境友好,對該化合物傳統(tǒng)的合成方法和一些新型的合成方法是一種新的嘗試與挑戰(zhàn)。同時(shí)培養(yǎng)得到了該化合物的可測單晶,通過X-射線單晶衍射法測定得到其晶體結(jié)構(gòu),并對其晶體結(jié)構(gòu)進(jìn)行了詳細(xì)的描述與討論。
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Synthesis and crystal structure of 2-(2-hydroxyphenyl)benzim idazole(HPBI)*
HE Fei-gang
(Department of Chemistry Shannxi Institute of Education,Xi′an 710061,China)
TQ460.31
A
1002-1124(2011)02-0004-03
2010-12-18
陜西省科技計(jì)劃項(xiàng)目資助(2009JM2014)
何飛剛(1978-),男,碩士,講師,研究方向:配合物的合成。