耿 陽,牟小東,劉 然,邊葶藶,廖 敏,周繼勇
(浙江大學(xué) 農(nóng)業(yè)部動物病毒學(xué)重點實驗室,杭州 310058)
雞的傳染性支氣管炎由傳染性支氣管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)感染引起,是一種高度接觸性傳染病,IBV可侵害雞的呼吸系統(tǒng)、泌尿生殖系統(tǒng)、消化系統(tǒng)及生殖系統(tǒng)等[1]。由于IBV特殊的轉(zhuǎn)錄機制導(dǎo)致該病毒容易發(fā)生變異,造成的臨床特征越來越復(fù)雜。目前IBV的變異株廣泛分布于世界各地,給養(yǎng)禽業(yè)帶來嚴重的經(jīng)濟損失。
傳染性支氣管炎病毒與引起嚴重急性呼吸綜合癥(severe acute respiratory syndrome,SARS)的冠狀病毒(SARS-coronary virus, SARS-CoV)同屬于冠狀病毒科冠狀病毒屬的成員。這兩種病毒具有相似的基因組結(jié)構(gòu),其基因組編碼四種結(jié)構(gòu)蛋白:纖突蛋白(S)、小膜蛋白(E)、膜蛋白(M)、核衣殼蛋白(N)和15或16種非結(jié)構(gòu)蛋白(nonstructural protein),在IBV沒有nsp1蛋白[2]。已有的研究表明,冠狀病毒的非結(jié)構(gòu)蛋白與病毒的復(fù)制、增殖和致病力有關(guān)[3-6]。
nsp5是冠狀病毒的主要蛋白酶(main protease,Mpro), 又稱 3C樣 蛋白酶(3C-like proteinase,3CLpro),對多聚蛋白的水解起關(guān)鍵作用,因此,nsp5成為抗SARS和其他冠狀病毒藥物研究的重要靶點[7]。目前對IBV非結(jié)構(gòu)蛋白的研究幾乎是一片空白,開展IBV非結(jié)構(gòu)蛋白研究對于揭示IBV的致病機制和尋求IBV新的檢測方法具有重要意義。本試驗利用基因工程技術(shù)重組表達了IBV nsp5蛋白,并證實其具有良好的免疫原性和反應(yīng)原性。
1.1.1 病毒、細胞及宿主菌 傳染性支氣管炎病毒SC021202毒株[8]、Sf9細胞、E.coliTOP10、E.coliDH5α、E.coliBL21(DE3)、E.coliDH10Bac由本實驗室保存。
1.1.2 載體與試劑 桿狀病毒表達載體pFastBac HTA、CellfectinⅡ轉(zhuǎn)染試劑以及TRIzol試劑購自Invitrogen公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒購自Fermentas公司;T4 DNA連接酶及限制性核酸內(nèi)切酶購自TaKaRa公司;DNA凝膠回收試劑盒購自于AxyGen公司;Ni-NTA親和純化試劑盒購自QIAGEN公司;鼠抗His單克隆抗體由本實驗室制備并保存;兔抗GST多抗血清、HRP標記羊抗鼠IgG以及HRP標記羊抗兔IgG均購自于KPL公司。
1.2.1nsp5基因的擴增 根據(jù)IBV SC021202的基因組序列(GeneBank 登錄號: EU714029),設(shè)計擴增IBV SC021202nsp5上下游引物:IBVnsp5-F,5′-GGAATTCGCTGGTTTTAAGAAGCTAGTT TC-3′;IBVnsp5-R,5′-AGCGTCGACTCACTGT AGTCTGACAC-3′,引物分別帶有EcoR I和SalI酶切位點。以Trizol試劑從IBV SC021202感染的雞胚尿囊液中提取的RNA為模板反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。以cDNA為模板進行PCR反應(yīng),PCR程序:95 ℃預(yù)變性4 min;然后進入94 ℃變性1 min,58℃退火30 s,72 ℃延伸1 min的循環(huán),共進行30個循環(huán);72 ℃再延伸6 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1.5%的瓊脂糖凝膠電泳后,用試劑盒進行純化回收目的基因片段。將回收到的基因片段連接到pMD18-T質(zhì)粒載體、轉(zhuǎn)化TOP10感受態(tài)細胞,經(jīng)PCR和限制性內(nèi)切酶分析后送測序公司進行目的片段的測序分析,確定目的基因片段擴增的正確性。將序列測定正確的重組T質(zhì)粒命名為IBVnsp5-T。
1.2.2 重組表達載體的構(gòu)建 純化回收經(jīng)EcoR I和SalI酶切載體IBVnsp5-T的目的基因片段連接到經(jīng)EcoR I和SalI酶切的pFastBac HTA轉(zhuǎn)移載體,轉(zhuǎn)化TOP10感受態(tài)細胞,經(jīng)PCR和酶切分析正確的陽性重組轉(zhuǎn)移載體pFastBac HTA-IBVnsp5轉(zhuǎn)化含有桿狀病毒基因組Bacmid的E.coliDH10Bac感受態(tài)細胞,使轉(zhuǎn)移載體與桿狀病毒基因組發(fā)生同源重組。在選擇性LB平板(含50 μg/mL卡那霉素、7 μg/mL慶大霉素、10 μg/mL四環(huán)素、100 μg/mL X-gal和40 μg/mL IPTG)上進行藍白斑篩選。挑取白色克隆經(jīng)LB培養(yǎng)基培養(yǎng)后,提取質(zhì)粒DNA,分別用特異性引物和M13通用引物(M13上游引物:5'-GTTTTCCCAGTCACGAC-3';M13下游引物:5'-CAGGAAACAGCTATGAC-3'),PCR鑒定帶目的片段陽性克隆。獲得的陽性質(zhì)粒命名為IBVnsp5-Bacmid。同樣方法構(gòu)建增強型綠熒光蛋白(enhanced green fluorescene protein,EGFP)重組質(zhì)粒EGFP-Bacmid作為參照。
1.2.3 重組蛋白表達 參照Invitrogen 公司CellfectinⅡ轉(zhuǎn)染試劑說明書操作方法。將IBV nsp5-Bacmid和EGFP-Bacmid質(zhì)粒同時分別轉(zhuǎn)染Sf9細胞,待在熒光顯微鏡下可以觀察到大量綠色熒光蛋白表達時收集IBVnsp5-Bacmid質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細胞上清液作為P0代重組病毒。P0代毒在Sf9細胞中傳代2次后,用間接免疫熒光試驗(indirect immunofluorescence assay, IFA)鑒定傳代過程中目的蛋白的表達情況,并收獲上清作為重組病毒于4℃保存,備大量接種細胞用。
1.2.4 重組蛋白鑒定 收獲重組桿狀病毒感染72 h后的Sf9細胞,經(jīng)PBS洗滌3次后,用適量的PBS懸浮細胞,超聲波裂解細胞后,加入等體積的2 ×SDS-PAGE上樣緩沖液進行SDS-PAGE,轉(zhuǎn)膜后,以抗His單抗作為一抗,HRP標記的抗鼠IgG為二抗,按常規(guī)的Western blot檢測表達的蛋白。
1.2.5 重組蛋白的純化 重組桿狀病毒原液與Sf9細胞感作1 h后,棄去病毒液,加入新鮮培養(yǎng)液繼續(xù)在37 ℃下孵育3~4 d后收獲細胞。按QIAGEN公司蛋白純化試劑盒純化His融合蛋白的方法純化重組蛋白。純化后的蛋白經(jīng)SDS-PAGE和Western blot分析鑒定。用BCA蛋白檢測試劑盒(Pierce Biotechnology)測定蛋白的濃度。
1.2.6 抗nsp5小鼠多抗血清的制備 純化的重組蛋白與等體積弗氏完全佐劑混合,充分乳化,按100 μg/只蛋白的量經(jīng)腹腔免疫6~8周齡BALB/c小鼠(購自中國科學(xué)院上海實驗動物中心)。此后每隔2周,相同的蛋白與弗氏不完全佐劑充分乳化后,以相同的劑量和方法加強免疫。免疫4次后,采血分離血清,通過IFA、(enzyme linked immunosorbene assay, ELISA)、Western blot鑒定抗體的產(chǎn)生。
圖1 nsp5基因的RT-PCR擴增Fig.1 Amplif i cation of nsp5 gene by RT-PCR
1.2.7 IBV感染細胞中nsp5蛋白的IFA檢測 IBV SC021202毒株感染96孔板培養(yǎng)的DF-1細胞48 h后,用4%甲醛固定30 min。經(jīng)含5%脫脂奶粉的PBS封閉1 h后,用1:100稀釋的抗nsp5的小鼠多抗血清與細胞于37℃孵育1 h,之后再用1:500稀釋的FITC標記的抗鼠IgG于37℃孵育1 h。反應(yīng)結(jié)束后熒光顯微鏡觀察并記錄結(jié)果。設(shè)未感染的DF-1細胞作對照。
2.1 nsp5基因的擴增、克隆與重組質(zhì)粒的鑒定 以IBV SC021202 毒株感染的雞胚尿囊液抽提的RNA為模板,以IBVnsp5-F和IBVnsp5-R為引物,RT-PCR擴增出約900 bp的片斷(圖1)。將該片斷連接到pMD18-T載體,經(jīng)測序證明為921bp的IBV nsp5基因。
將純化獲得的nsp5亞克隆于桿狀病毒表達系統(tǒng)的pFastBac HTA載體,獲得重組轉(zhuǎn)移載體pFastBac HTA-IBVnsp5。此重組轉(zhuǎn)移載體轉(zhuǎn)化含有桿狀病毒基因組Bacmid的E.coliDH10Bac感受態(tài)細胞,通過同源重組獲得桿狀病毒重組質(zhì)粒IBVnsp5-Bacmid。構(gòu)建好的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化相應(yīng)E.coli后,挑取單菌落培養(yǎng)后,提取重組質(zhì)粒,經(jīng)酶切、PCR和測序鑒定,表明nsp5基因插入的位置、大小和閱讀框均正確。圖2為重組質(zhì)粒PCR鑒定結(jié)果。同樣的方法也成功構(gòu)建了作為參照用的EGFP重組質(zhì)粒(數(shù)據(jù)未顯示)。
圖2 重組質(zhì)粒的PCR鑒定Fig.2 Identif i cation of recombinant plasmids by PCR
2.2 重組桿狀病毒的獲得及表達蛋白的純化和鑒定將IBVnsp5-Bacmid轉(zhuǎn)染Sf9細胞,同時EGFPBacmid也染轉(zhuǎn)Sf9細胞作為插入基因蛋白表達的參照。轉(zhuǎn)染的細胞培養(yǎng)上清作為傳代病毒在Sf9細胞傳2代后,再接種Sf9細胞,接毒后72 h,在顯微鏡下觀察到明顯的細胞病變。通過參照的重組EGFP桿狀病毒感染Sf9細胞的觀察,可見在轉(zhuǎn)染后12 h有微弱熒光,轉(zhuǎn)染24 h后熒光稍有加強,轉(zhuǎn)染48 h后可見熒光信號明顯加強,等到轉(zhuǎn)染96 h后,大約70%細胞內(nèi)可見到較強的綠色熒光(圖3A)。
根據(jù)EGFP表達的情況,IBVnsp5-Bacmid轉(zhuǎn)染細胞獲得的重組桿狀病毒接種Sf9細胞后96 h收獲感染的細胞。收獲的細胞固定后,以His單抗作為一抗,通過IFAT檢測感染細胞中目的蛋白的表達。結(jié)果觀察到IBVnsp5-Bacmid接毒的Sf9細胞出現(xiàn)了明顯的熒光反應(yīng),而未接毒的Sf9細胞無熒光反應(yīng),表明IBVnsp5-Bacmid轉(zhuǎn)染的Sf9細胞成功表達了His/His融合蛋白(圖3B)。
為了進一步確定重組病毒感染的細胞表達了重組的目的蛋白,將收獲的IBVnsp5-Bacmid重組病毒感染的Sf9細胞用超聲波裂解后,裂解產(chǎn)物進行SDS-PAGE電泳,轉(zhuǎn)膜后經(jīng)Western blot檢測,結(jié)果裂解產(chǎn)物與His單抗起特異性反應(yīng),并在37 kDa左右的位置出現(xiàn)了反應(yīng)帶(圖3C),與預(yù)期的His和nsp5融合蛋白的分子量大小相符,說明了nsp5在Sf9獲得了順利表達。
利用融合蛋白帶有His標簽的特性,從感染細胞中純化了重組蛋白,純化的重組蛋白大小為預(yù)期的37 kDa左右(圖4A),并與His單抗發(fā)生反應(yīng)(圖4B)。
圖3 nsp5真核表達及鑒定Fig.3 Expression and identif i cation of nsp5 expressed in Sf9 cells
圖4 nsp5蛋白真核表達Fig.4 Expression of nsp5 in Sf9 cells
2.4 nsp5天然蛋白的檢測 IBV SC021202毒株感染DF-1細胞后,用純化的重組蛋白制備的nsp5多抗血清通過IFAT檢測感染的DF-1細胞是否表達天然的nsp5蛋白。結(jié)果可觀察到感染了IBV SC021202的DF-1細胞中出現(xiàn)了明顯的綠色熒光(圖5)。表明制備的抗血清可與天然的nsp5蛋白有良好的反應(yīng)性。
圖5 nsp5天然蛋白IFAT檢測Fig.5 Detection of native nsp5 by IFAT
本研究選取高效的Bac-to-Bac桿狀病毒表達系統(tǒng)成功表達了IBV的nsp5蛋白,在構(gòu)建nsp5重組病毒的同時也構(gòu)建EGFP重組病毒作為指示系統(tǒng)。EGFP的表達能容易通過熒光顯微鏡觀察到。EGFP成功表達一方面指示同時進行的目的基因的操作系統(tǒng)可行,另一方面,通過EGFP重組病毒感染細胞后的病變和蛋白表達情況也可以給nsp5重組病毒和感染細胞收獲時間以及表達蛋白檢測時間作參考。通過IFAT檢測發(fā)現(xiàn),nsp5重組病毒感染的細胞與EGFP重組病毒感染的細胞類似,在感染96 h后,大部分的細胞都表達了目的蛋白,而且此時收獲細胞純化蛋白獲得的量也比較高。Western blot在鑒定感染細胞裂解物的蛋白時,出現(xiàn)兩條約37 kDa左右的反應(yīng)帶,可能是表達蛋白被糖基化,造成蛋白在SDS-PAGE膠中遷移率差異的結(jié)果。
Bac-to-Bac桿狀病毒表達系統(tǒng)能在真核細胞表達與天然蛋白結(jié)構(gòu)接近的重組蛋白[9]。我們在真核細胞成功表達nsp5前,用原核系統(tǒng)表達了nsp5蛋白,但原核表達的蛋白制備的抗血清不能順利檢測到感染細胞的天然nsp5蛋白,而本研究中真核表達的蛋白制備的抗血清可檢測到天然的nsp5蛋白,表明了Bac-to-Bac表達系統(tǒng)的優(yōu)越性。nsp5在Sf9細胞的成功表達和純化為進一步研究nsp5的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。目前對冠狀病毒nsp5的研究多集中在SARS冠狀病毒,小鼠肝炎病毒(MHV)等冠狀病毒的生物信息學(xué)、蛋白晶體結(jié)構(gòu)及其與其他蛋白相互作用的研究上[10,11]。對IBVnsp5蛋白功能的進一步研究可為SARS冠狀病毒等的研究提供借鑒。
目前在對IBV的基因分型、診斷以及致病機制研究等方面,主要基于對IBV的結(jié)構(gòu)蛋白尤其是S1基因的研究上。很少見到有應(yīng)用IBV的非結(jié)構(gòu)蛋白建立IBV診斷方法的報道。然而相對于S1基因,非結(jié)構(gòu)蛋白在不同的IBV變異株間更保守。序列分析表明IBV nsp5與經(jīng)典呼吸型毒株M41、H52以及腎型株SAIBK的氨基酸的同源性在90%~94%之間(數(shù)據(jù)未顯示)。因此,建立基于非結(jié)構(gòu)蛋白的檢測方法對IBV的檢測更具普遍性。本文純化的蛋白制備的血清不僅與重組的nsp5蛋白起反應(yīng),而且能檢測到IBV感染細胞中特異的nsp5蛋白,表明nsp5蛋白具有良好的免疫原性和反應(yīng)性,可用于IBV抗原或抗體檢測方法的建立。
綜上所述,本文利用真核系統(tǒng)成功表達了nsp5蛋白,為病毒診斷抗原、抗體的開發(fā)以及nsp5蛋白的生物學(xué)研究提供了物質(zhì)基礎(chǔ)。
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