李海濤 摘譯 楊蓉婭 校

阿薩希毛孢子菌（Trichosporon asahii, T. asahii）是一種重要的酵母樣真菌，廣泛存在于自然環(huán)境和定植于人體的部分組織器官中。在醫(yī)學(xué)上，T. asahii 作為一種條件致病性真菌，可通過吸入、破損皮膚、污染食物或水源等途徑進(jìn)入人體內(nèi)或在人體內(nèi)易位而使人類致病，特別是腫瘤和人免疫缺陷病毒（HIV）感染晚期患者、器官移植、免疫抑制、免疫缺陷或免疫低下宿主更易感。在人類主要引起皮膚淺表感染、夏季超敏性肺炎以及內(nèi)臟器官的深部感染。近年來在免疫正常人群也開始不斷有該菌播散性感染的報(bào)道。目前的體外藥敏試驗(yàn)和臨床治療顯示，除了唑類藥物外，該菌對(duì)大多數(shù)一線抗真菌藥均耐藥，一旦在機(jī)體造成了播散性、系統(tǒng)性的深部感染，治療難度大，病死率較高。

在農(nóng)業(yè)上，T. asahii 是一些發(fā)酵食物發(fā)酵過程中的重要酵母菌，如烏干達(dá)酥油、中國大曲酒、非洲和巴西的一些木薯發(fā)酵食物、西非的可可豆、加納的可可粉、意大利奶酪等。在工業(yè)上，由T. asahii 產(chǎn)生或從T. asahii 分離的一些酶可作為工業(yè)用酶、工業(yè)廢水的處理、清洗油漬的洗滌劑、煙草香氣的產(chǎn)生等多個(gè)方面。

本課題組從2010 年8 月～2012 年5 月，歷時(shí)22 個(gè)月，解開了T. asahii 標(biāo)準(zhǔn)株（CBS 2479）與環(huán)境株（CBS 8904）的全基因組序列，包括核染色體基因組測序和線粒體基因組測序；測序采用的是第2 代測序技術(shù)Solexa+454聯(lián)合應(yīng)用的策略，結(jié)果如下：

CBS 2479 的核染色體基因組共包含了24271268bp 堿基（24.27Mb），線粒體基因組包含了32568bp 堿基；核染色體GC 含量平均56%，線粒體28.9%；核基因組共包括8300 個(gè)蛋白編碼基因，509 個(gè)tRNA 編碼基因；線粒體基因組包括11 個(gè)蛋白編碼基因，14 個(gè)tRNA 編碼基因。COG 分析預(yù)測并將3131 個(gè)蛋白編碼基因歸為23 個(gè)功能分類中，其中722 個(gè)基因具有一般的功能，713 個(gè)基因功能未知。該菌株的基因組數(shù)據(jù)已提交美國國立生物技術(shù)信息中心（NCBI），并獲得序列號(hào)：ALBS00000000。

CBS 8904 的核染色體基因組共包含了25015122bp 堿基（24.27 Mb），線粒體基因組包含了32568bp 堿基；核染色體GC 含量平均59%，線粒體29%；核基因組共包括8507 個(gè)蛋白編碼基因，530 個(gè)tRNA 編碼基因；線粒體基因組包括22 個(gè)蛋白編碼基因，25 個(gè)tRNA 編碼基因。COG 分析預(yù)測并將3307 個(gè)蛋白編碼基因歸為23 個(gè)功能分類中，其中703 個(gè)基因具有一般的功能，709 個(gè)基因功能未知。該菌株的基因組數(shù)據(jù)已提交NCBI，并獲得序列號(hào)：AMBO 00000000。

對(duì)這兩株菌的基因組進(jìn)行了初步比較發(fā)現(xiàn)：核基因組的相似度為99.59%，線粒體基因組的相似度為99.99%。CBS2479 和CBS8904 有8161 個(gè)同源編碼序列，CBS8904有368 個(gè)特異基因，但絕大多數(shù)功能未知。