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      中國人群中動(dòng)脈硬化性腦小血管病易感基因及預(yù)測模型的研究

      2014-03-09 06:32:16李偉胡波李桂林張?jiān)趶?qiáng)王擁軍
      中國卒中雜志 2014年9期
      關(guān)鍵詞:腦小血管病位點(diǎn)

      李偉,胡波,李桂林,張?jiān)趶?qiáng),王擁軍

      腦小血管病是最常見中老年、隱性、進(jìn)展性腦血管病,它是導(dǎo)致血管性癡呆最重要的一個(gè)原因。動(dòng)脈硬化是腦小血管病最常見病因。目前腦小血管病的研究,除了對(duì)環(huán)境因素和危險(xiǎn)因素(高血壓、糖尿病、高脂血癥、吸煙、老齡等)的研究外,遺傳背景因素是腦小血管病致病機(jī)制的重要內(nèi)容,它作為一種復(fù)雜性狀性疾病具備了多基因易感性的特點(diǎn)[1-3]。雖然現(xiàn)有的研究結(jié)果不盡人意,但根據(jù)全基因組卒中研究(genomewide association studies of stroke,GWAS)[4-6],

      結(jié)合腦小血管病的病理生理,病理學(xué)變化結(jié)果提示——腦小血管病的易感基因選擇可以涉及以下幾個(gè)方面:①脂代謝調(diào)節(jié)通路[7];②炎性及Rho相關(guān)通路[8-9];③血腦屏障細(xì)胞間連接調(diào)節(jié)通路[10-11];④小血管病病理表現(xiàn)膠原纖維高表達(dá)的調(diào)節(jié)通路[12]。本研究旨在探討動(dòng)脈硬化性腦小血管病與候選易感基因相關(guān)性,構(gòu)建腦小血管病的預(yù)測模型,為腦小血管病致病機(jī)制和預(yù)防提供重要的基因背景證據(jù)。

      1 對(duì)象與方法

      1.1 研究對(duì)象 研究對(duì)象來自首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京天壇醫(yī)院門診、住院部、腦血管病篩查門診及體檢門診,連續(xù)收集脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)樣本存入北京天壇醫(yī)院腦血管病基因庫。從2009年6月~2013年12月天壇醫(yī)院腦血管病基因庫樣本中隨機(jī)選出腦小血管病患者197例,大動(dòng)脈粥樣硬化性腦血管?。ㄑ塥M窄率>50%)患者198例,高血壓性腦出血患者200例,非卒中對(duì)照197例,共計(jì)792例。

      腦小血管病入組標(biāo)準(zhǔn)[13]:符合腦小血管病磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRⅠ)或計(jì)算機(jī)斷層掃描(computed tomography,CT)影像學(xué)特點(diǎn):①腦缺血性脫髓鞘改變;②腔隙性腦梗死;③血管周圍間隙擴(kuò)大;④腦內(nèi)微出血。并排除:①有穿支動(dòng)脈的父動(dòng)脈和供血?jiǎng)用}粥樣硬化性狹窄或閉塞(大、中動(dòng)脈>50%的狹窄)證據(jù)的患者;②有心源性栓塞證據(jù)的患者;③有多發(fā)性硬化,血管炎,一氧化碳中毒及農(nóng)藥中毒性脫髓鞘,遺傳性白質(zhì)腦病,代謝性白質(zhì)腦病,化療,放療相關(guān)性腦白質(zhì)病證據(jù)的患者;④有動(dòng)脈夾層、肌纖維營養(yǎng)不良、煙霧病等大血管病變證據(jù)的患者;⑤拒絕參加本項(xiàng)研究患者。

      大動(dòng)脈粥樣硬化性腦血管病入組標(biāo)準(zhǔn)[13]:①支持動(dòng)脈粥樣硬化性指標(biāo)[頸動(dòng)脈內(nèi)膜中層厚度(intima-media thickness,ⅠMT)>1.5 mm];②頸動(dòng)脈血管超聲和經(jīng)顱多普勒檢查提示頸部動(dòng)脈或顱內(nèi)動(dòng)脈狹窄率>50%,或血管影像學(xué)檢查提示頸部動(dòng)脈或顱內(nèi)動(dòng)脈狹窄率>50%;③影像學(xué)提示相應(yīng)責(zé)任大動(dòng)脈供血區(qū)表現(xiàn)分水嶺梗死,或皮層、小腦、腦干及皮層下梗死病灶直徑>1.5 cm腦梗死;④臨床表現(xiàn)為非腔隙綜合征表現(xiàn)。排除標(biāo)準(zhǔn):①心源性栓塞患者;②腦小血管病患者,或皮層下梗死及腦干梗死病灶直徑<1.5 cm的患者;③有動(dòng)脈夾層、肌纖維營養(yǎng)不良、煙霧病證據(jù)的患者;④拒絕參加本項(xiàng)研究患者。

      高血壓性腦出血入組標(biāo)準(zhǔn):明確的高血壓病史,影像學(xué)提示基底節(jié)區(qū)出血性改變,并排除動(dòng)脈瘤,藥物相關(guān)性出血及血液系統(tǒng)疾病。

      非卒中對(duì)照組入組標(biāo)準(zhǔn):①M(fèi)RⅠ或CT等影像學(xué)檢查沒有任何類型腦血管病表現(xiàn);②沒有卒中或短暫性腦缺血發(fā)作病史;③無腦血管病相應(yīng)癥狀和體征。

      對(duì)腦小血管病、大動(dòng)脈粥樣硬化(血管狹窄率>50%)及高血壓性腦出血病例,進(jìn)行病史采集,入院后測雙側(cè)肱動(dòng)脈血壓,血生化檢查(包括血常規(guī),血脂,空腹血糖,血肌苷,血尿素氮,超敏C反應(yīng)蛋白,血漿同型半胱氨酸,紅細(xì)胞沉降率);對(duì)腦小血管患者還進(jìn)行了抗中性粒細(xì)胞抗體,心磷脂抗體,抗核抗體/免疫全套,糖化血紅蛋白檢測。所有研究對(duì)象都進(jìn)行了頭影像學(xué)及相應(yīng)的血管影像學(xué)檢查,需要鑒別心源性卒中患者均進(jìn)行了超聲心動(dòng)圖檢查,24 h動(dòng)態(tài)心電監(jiān)測或多次心電圖檢查。

      本項(xiàng)研究通過了倫理委員會(huì)醫(yī)學(xué)倫理批準(zhǔn),研究對(duì)象知情同意并簽署了知情同意書。

      1.2 候選基因單核苷酸多態(tài)性的選擇 候選基因選擇經(jīng)過兩個(gè)步驟:第一,根據(jù)文獻(xiàn)中報(bào)道的熱門單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP),以及美國國家生物技術(shù)信息中心(National in BiotechnologyⅠnformation,NCBⅠ)中頻率較高的錯(cuò)義SNP(插入與缺失>15%)和影響基因表達(dá)的調(diào)控5’端tag SNP;第二,根據(jù)第一次的選擇位點(diǎn)結(jié)合統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果,在位點(diǎn)P值<0.01所對(duì)應(yīng)的基因中,通過文獻(xiàn)及其基因功能的復(fù)習(xí),重新遴選SNP位點(diǎn)。第一步驟共選擇19個(gè)基因55個(gè)SNP位點(diǎn);第二步驟易感基因候選出4個(gè)基因,包括神經(jīng)損傷誘導(dǎo)蛋白2(nerve injury induced protein 2,NⅠNJ2)、水通道蛋白4(Aquapofins 4,AQP4)、細(xì)胞周期依賴性激酶抑制基因2A(inhibitor of cdk 4/alternative reading frame,ⅠNK4/ARF)、肌球蛋白輕鏈激酶基因(myosin light chain kinase,MYLK),15個(gè)SNP位點(diǎn)(表1)。

      1.3 單核苷酸多態(tài)性檢測 抽取患者的靜脈血5 ml(肝素抗凝),小量全血基因組DNA快速提取試劑盒提取全血DNA(北京博邁德科技發(fā)展有限公司)。利用SNaPshot SNP分型技術(shù)對(duì)樣本進(jìn)行SNP位點(diǎn)分型檢測。設(shè)計(jì)51對(duì)聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)引物用于擴(kuò)增包含55個(gè)SNP位點(diǎn)的51個(gè)118~338 bp片段,也設(shè)計(jì)了55個(gè)緊鄰SNP位點(diǎn)的延伸引物用于單堿基延伸。引物設(shè)計(jì)用在線Primer 3軟件。PCR產(chǎn)物用Qiagen公司的HotStarTaq進(jìn)行多重PCR獲得,PCR產(chǎn)物經(jīng)蝦堿性磷酸酶(Promega公司)和外切酶Ⅰ(Epicentre公司)純化后,SNaPshot多重試劑盒進(jìn)行延伸反應(yīng)(ABⅠ公司)。延伸產(chǎn)物用蝦堿性磷酸酶純化后,在基因測序儀(ABⅠ3130xl,ABⅠ公司)上樣。SNP分型用基因分型軟件GeneMapper 4.0(Applied biosystems)分析。以上試驗(yàn)由上海天昊生物有限公司協(xié)助完成。

      1.4 統(tǒng)計(jì)方法 經(jīng)過年齡和性別校正后,SNP位點(diǎn)在5種遺傳模型下(共顯性模型、顯性模型、隱性模型、超顯性模型、疊加模型)用SAS分析軟件進(jìn)行相關(guān)性分析。應(yīng)用阿凱克信息準(zhǔn)則(The Akaike Ⅰnformation Criterion,AⅠC)計(jì)算各遺傳模型,選擇最小AⅠC值的遺傳模型。應(yīng)用permutation多重檢驗(yàn)進(jìn)行校正。數(shù)量變量應(yīng)用t檢驗(yàn),計(jì)數(shù)變量使用χ2檢驗(yàn),相關(guān)性分析采用Logistic回歸分析。本試驗(yàn)采用SAS統(tǒng)計(jì)件軟Logistic模塊進(jìn)行預(yù)測模型的分析,應(yīng)用基尼指數(shù)(GⅠNⅠ)表現(xiàn)其效果。

      表1 腦小血管病候選4個(gè)基因及15個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)

      2 結(jié)果

      研究對(duì)象平均年齡為(58.05±11.5)歲。危險(xiǎn)因素分析經(jīng)過年齡、性別校正后,可見糖尿病比例分別是動(dòng)脈粥樣硬化性腦大血管病40.26%,腦小血管病29.53%,高血壓性腦出血19.29%,各組之間存在顯著性差異(P<0.001);高血壓腦出血組與腦小血管病組比較(P=0.02),大動(dòng)脈粥樣硬化組與腦小血管病組比較(P=0.02)。高脂血癥和吸煙發(fā)生率在各組間也有顯著差異(P<0.001和P=0.002),在大動(dòng)脈粥樣硬化組發(fā)生率最高,兩兩比較顯示,大動(dòng)脈粥樣硬化組高脂血癥發(fā)生率顯著高于高血壓腦出血組(P=0.001)和腦小血管病組(P=0.001);大動(dòng)脈粥樣硬化組吸煙率顯著高于高血壓腦出血組(P=0.003)和腦小血管病組(P=0.001)(表2)。

      AⅠC值最小的SNP位點(diǎn)的遺傳模式是超顯性模型(overdominant model)(圖1)。腦小血管病與非卒中對(duì)照組個(gè)體差異性檢驗(yàn),MYLK基因rs2222823雜合子(A/T)的優(yōu)勢比(odds ratio,OR)為0.52,95%可信區(qū)間(conf i dence interval,CⅠ)為(0.35~0.79),P=0.002,校正P=0.031);ⅠNK4/ARF基因rs2811712雜合子(C/T)的OR值為1.75[95%CⅠ(1.13~2.71),P=0.004,校正P=0.050](表3,圖2)。腦小血管病與高血壓性腦出血患者差異性檢驗(yàn),rs2222823位點(diǎn)的P值為0.035。在腦小血管病與動(dòng)脈硬化性腦大血管病患者差異性檢驗(yàn)中,非糖尿病患者及飲酒患者在rs2222823位點(diǎn)P值分別為0.012和0.018;高脂血癥及飲酒患者在rs2811712位點(diǎn)P值分別為0.029和0.04。依據(jù)易感基因構(gòu)建腦小血管的預(yù)測模型的GⅠNⅠ值為0.442。

      3 討論

      本研究表明MYLK基因和ⅠNK4/ARF基因的兩個(gè)SNP位點(diǎn),rs2222823和rs2811712,與腦小血管疾病顯著相關(guān)。SNP位點(diǎn)rs2222823位于MYLK基因啟動(dòng)子的tagSNPs的區(qū)域,rs2811712位與ⅠNK4/ARF基因的5’端區(qū)域,均位于這兩個(gè)基因的重要功能結(jié)構(gòu)區(qū)域,具有決定基因功能的重要意義,因此提示腦小血管病與MYLK基因和ⅠNK4/ARF基因密切相關(guān)。在SNP位點(diǎn)rs2222823(MYLK基因)雜合基因型(T/A)對(duì)腦小血管疾病有保護(hù)作用,而在位點(diǎn)SNP rs2811712雜合基因型(C/T)對(duì)腦小血管病有促進(jìn)作用。

      圖1 不同遺傳模型下AIC值的比較注:*:rs2811712;**:rs2222823;AIC:阿凱克信息準(zhǔn)則

      表2 研究對(duì)象的基本信息情況

      表3 性別和年齡校正后腦小血管病與非卒中對(duì)照在超顯性遺傳模式下相關(guān)性分析

      圖2 rs2222823與rs2811712不同基因型的OR值情況注:OR:優(yōu)勢比

      2007年Wang等[14]研究發(fā)現(xiàn)MYLK基因與動(dòng)脈粥樣硬化疾病相關(guān)。2009年Su等[15]研究發(fā)現(xiàn)激活的肌球蛋白輕鏈激酶具有增強(qiáng)血管內(nèi)皮通透性的作用[16]。最近多個(gè)研究發(fā)現(xiàn)ⅠNK4/ARF基因與衰老[17-18]和老年疾病如心肌梗死、卒中、2型糖尿病密切關(guān)聯(lián)[19-20]。動(dòng)脈硬化性腦小血管病為一種動(dòng)脈硬化微血管病變,其中血-腦屏障通透性增加是其重要的病理生理變化。因此,這些研究均提示MYLK和ⅠNK4/ARF基因與血腦屏障功能障礙和動(dòng)脈硬化有關(guān)。Burton等研究者多項(xiàng)研究表明ⅠNK4/ARF基因SNP位點(diǎn)rs1333049區(qū)域與冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟病和卒中密切相關(guān)[21-23]。而本研究結(jié)果顯示NK4/ARF基因rs2811712位點(diǎn)與腦小血管病的卒中亞型有關(guān),這可能是由于種族差異導(dǎo)致的不同的SNP位點(diǎn)結(jié)果。但同樣說明在染色體9p21.3區(qū)域的ⅠNK4/ARF基因與卒中相關(guān),很可能與腦小血管病有關(guān)。在5種遺傳模型基因型分析中AⅠC值最低的是超顯性模型。雖然在卒中很少觀察由于超顯性模型易致病性的報(bào)道,但許多研究中發(fā)現(xiàn)了超顯性遺傳模式與疾病相關(guān)[24],如癌癥的一些研究中表明,在超顯性模型下某些基因的多態(tài)性與癌癥密切相關(guān)[25-26]。因此,將來需要深入研究在超顯性遺傳模型下腦小血管病易感基因的作用。

      在理論上可能導(dǎo)致這種雜合子偏倚的原因有以下幾種情況:從技術(shù)上講,可以是由使用不準(zhǔn)確的限制性內(nèi)切酶造成的,而本試驗(yàn)應(yīng)用的基因分型技術(shù)不會(huì)造成這種情況。從分子學(xué)角度,它可能是具有非常強(qiáng)大的主導(dǎo)性的變異等位基因,使雜合子具有等同于純合子效果。在統(tǒng)計(jì)學(xué)角度,由于變異純合子在病例和對(duì)照組相對(duì)樣本較少,變異純合子比較雜合子的效果可能會(huì)存在選擇性偏倚,簡單的說,就是統(tǒng)計(jì)力度不夠,不能反映變異純合子的真實(shí)效果,只能通過更大的研究樣本予以糾正。在預(yù)測模型評(píng)估方面,模型預(yù)測效果可以用GⅠNⅠ值來衡量,GⅠNⅠ越接近1,說明模型的表現(xiàn)越好,而本研究GⅠNⅠ值偏低,并且由于沒有大樣本來驗(yàn)證這些結(jié)果,模型的表現(xiàn)可能非常不穩(wěn)定。所以單純應(yīng)用基因型預(yù)測復(fù)雜性狀性疾病的預(yù)測模型具有很大局限性,也就是說,復(fù)雜性狀性疾病預(yù)測模型構(gòu)建除涵蓋易感基因外,還需要增加危險(xiǎn)因素等因子才能增強(qiáng)預(yù)測模型的力度。另外,本研究樣本例數(shù)相對(duì)較小,下一步仍需要更大樣本量驗(yàn)證這兩個(gè)SNP位點(diǎn)與腦小血管病的關(guān)系。

      總之,MYLK和ⅠNK4/ARF基因與中國人群中動(dòng)脈硬化性腦小血管病有顯著相關(guān)性,MYLK基因rs2222823雜合子(A/T)有減緩腦小血管病患病率作用,而ⅠNK4/ARF基因rs2811712雜合子(C/T)對(duì)腦小血管病的患病率具有促進(jìn)作用。預(yù)測模型需要增加更多的變量來加大模型的效度。

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