劉占利 陳岳明 盛文彬 黃先玫 楊一華 馮亞男 黃暉 鄭緒陽
ALOX5基因啟動子SP-1結(jié)合位點多態(tài)性與兒童哮喘的相關(guān)性研究
劉占利 陳岳明 盛文彬 黃先玫 楊一華 馮亞男 黃暉 鄭緒陽
目的 探討ALOX5基因啟動子SP-1結(jié)合位點多態(tài)性和漢族兒童支氣管哮喘發(fā)生的關(guān)聯(lián)。 方法 選取88例支氣管哮喘兒童為病例組,124例健康兒童為對照組。用聚合酶鏈反應(yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性(PCR-SSCP)分析ALOX5基因啟動子SP-1結(jié)合位點多態(tài)性,采用實時熒光逆轉(zhuǎn)PCR檢測病例組和對照組ALOX5各基因型兒童外周血ALOX5 mRNA表達(dá)量。 結(jié)果 臨床資料顯示有家族史、非母乳喂養(yǎng)、有過敏史和被動吸煙與兒童支氣管哮喘發(fā)病相關(guān)(P<0.05),性別、年齡差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。經(jīng)PCR-SSCP鑒定ALOX5有6種基因型,包括4/4、4/5、4/6、5/5、5/6和6/6;ALOX5基因多態(tài)性在漢族兒童中分布符合Hardy-Weinberg平衡(χ2=0.361,P>0.05)。等位基因4及基因型(4/4+4/5)在病例組和對照組中分布差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(均P<0.05)。健康兒童ALOX5 mRNA表達(dá)量(0.20±0.14)顯著低于哮喘兒童(0.28±0.15)(P<0.05);基因型(4/4+4/5)個體ALOX5 mRNA表達(dá)量高于基因型(5/5+5/6)個體(P<0.05),其余各基因型組間差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(均P>0.05)。 結(jié)論 ALOX5基因啟動子SP-1結(jié)合位點多態(tài)性可能與漢族兒童支氣管哮喘相關(guān),該位點調(diào)控ALOX5 mRNA表達(dá)。
支氣管哮喘 ALOX5基因 單核苷酸多態(tài)性
支氣管哮喘是由遺傳和環(huán)境因素引起的下呼吸道慢性炎癥性失調(diào)。半胱胺酰白三烯(cys-LTs)是參與炎癥反應(yīng)的關(guān)鍵介質(zhì),可引起支氣管阻塞、組織水腫、嗜酸粒細(xì)胞遷移和刺激氣道分泌增加。哮喘患者尿液、呼出氣體凝結(jié)物、痰和血清中均顯示cys-LTs水平顯著增高[1-4]。ALOX5基因編碼的花生四烯酸5-脂氧合酶(5-LO)是白三烯(LTs)和脂氧素(LXs)生成旁路的起始催化酶。在炎癥和過敏等疾病中5-LO表達(dá)通常升高,可能最終使cys-LTs類代謝產(chǎn)物增加。ALOX5基因啟動子區(qū)SP-1結(jié)合位點(-GGGCGG-)呈現(xiàn)一個插入/缺失多態(tài)性,野生型基因轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(-GGGCGG-)為5個(n=5),而突變型基因則增加1、2或3個鋅指結(jié)構(gòu)或者減少1或2個鋅指結(jié)構(gòu)(non-5),該多態(tài)性可引起5-LO表達(dá)的改變[5-6],提示ALOX5基因啟動子區(qū)插入/缺失多態(tài)性可能與炎癥和過敏性疾病發(fā)生相關(guān)。
關(guān)于ALOX5基因啟動子區(qū)插入/缺失多態(tài)性與哮喘的關(guān)聯(lián)研究結(jié)果目前不盡相同[7-9],可能主要由于不同人群基因型分布以及不同地區(qū)環(huán)境因素,研究樣本量大小等因素引起。此外,涉及漢族兒童的研究資料更是少見。
因此,本研究以支氣管哮喘漢族兒童為病例組,以健康漢族兒童為正常對照組,通過檢測兩組間等位基因頻率、基因型分布及不同基因型個體間ALOX5表達(dá)差異,旨在能夠初步闡明ALOX5基因啟動子區(qū)插入/缺失多態(tài)性與漢族兒童支氣管哮喘發(fā)生的關(guān)聯(lián)。
1.1 對象 選擇2010-08—2012-10在我院兒科急診、門診及住院的漢族患兒。依據(jù)2008年中華醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會呼吸學(xué)組修訂的兒童哮喘防治常規(guī)[10]確診為支氣管哮喘的急性發(fā)作期兒童患者88例為病例組,年齡6個月~8歲,中位年齡3.2歲;其中男49例,女39例,病程6月~7年,中位數(shù)2.8年;選擇124例健康兒童為對照組,年齡在6個月~8歲,中位年齡3.2歲;其中男67例,女57例,無呼吸道及其它部位感染以及過敏反應(yīng)史。各組均除外并發(fā)有呼吸衰竭、心力衰竭、先天性心臟病等明顯疾病患者;詳細(xì)記錄患者各項臨床資料。所有研究對象均對本研究知情同意,簽署知情同意書并獲得我院醫(yī)學(xué)倫理委員會審核批準(zhǔn)。
1.2 方法
1.2.1 血標(biāo)本收集及基因組DNA提取 采集全部對象清晨空腹靜脈血3ml,EDTA.K3抗凝,置-20℃冷凍備用?;蚪MDNA提取采用全血基因組DNA提取試劑盒(北京TIANGEN BIOTECH),按照說明書進(jìn)行操作,提取的DNA樣本采用紫外分光光度法(260/280比值)確定DNA的純度,OD260測定DNA的濃度。
1.2.2 PCR擴增 ALOX5基因擴增上游引物為5'-AGGACCAGACACCTCGCTGAGGAGA GAC-3',下游引物為5'-GAGCAGCGAGCGCCGGGAGCCTCGGC-3'。反應(yīng)體系為15μl,含50ng基因組DNA,10.0pmol每種引物,0.2mM每種單核苷酸,10×PCR緩沖液(50mM KCl,10mM Tris HCl和0.1%Triton X-100,1.5mM MgCl2和1.0U Taq酶)(大連TAKARA)。PCR擴增條件如下:95℃5min,(95℃ 30s,64℃ 30s,72℃ 40s)×40循環(huán),72℃10min。
1.2.3 ALOX5基因型檢測 采用SSCP方法。配制10.0%丙烯酰胺凝膠,每個樣品用6×上樣緩沖液混合,最終上樣量為20μl,1×TAE為電泳緩沖液,以恒定電壓為60V電泳2.5h。電泳結(jié)束后,膠膜銀氨染色后用凝膠成像儀(美國BioRad)觀察條帶并保存圖像。電泳后可以產(chǎn)生的片段分別為255 bp(12bp缺失)、261bp(6bp缺失)、267bp(野生型)和273bp(6 bp插入),相對應(yīng)于3、4、5和6個SP1結(jié)合位點。針對261 bp、267 bp和273 bp條帶分別回收凝膠,純化DNA后以ALOX5基因PCR擴增引物進(jìn)行雙向測序進(jìn)行基因型確認(rèn)。
1.2.4 ALOX5 mRNA表達(dá)檢測 按照基因分型結(jié)果,在病例組中選擇4/4基因型9例,4/5基因型20例,5/5基因型20例和5/6基因型10例;在對照組中選擇4/4基因型9例,4/5基因型25例,5/5基因型25例和5/6基因型10例。用TRIzol(美國英維捷)提取全血總RNA,按照RevertAidTMFirst Strand cDNA Synthesis Kit(Fermentas,EU)說明書操作合成cDNA。SYBR Green I實時熒光PCR檢測ALOX5 mRNA相對表達(dá)量,PCR擴增引物分別為:上游5'-ACTGGAAACACGGCAAAAAC-3',下游5'-TCACGGGGTAAATCCTTGTG-3';以β-actin基因作為內(nèi)參照,上游5'-CTACAATGAGCTGCGTGTGG-3',下游5'-AAGGAAGGCTGGAAGAGTGC-3'。PCR反應(yīng)的循環(huán)參數(shù)為:95℃3min,(95℃10s,60℃45s)×40循環(huán),60℃時收集熒光。根據(jù)2-ΔΔCt法來計算ALOX5 mRNA表達(dá)量[11]。
1.3 統(tǒng)計學(xué)處理 采用SPSS 11.0統(tǒng)計軟件。正態(tài)分布的計量資料以表示,非正態(tài)分布的計量資料以中位數(shù)表示。Hardy-Weinberg平衡吻合度檢驗用χ2檢驗。病例組和對照組間性別、年齡以及基因型和等位基因頻率比較采用χ2檢驗或Fisher精確概率法。ALOX5 mRNA表達(dá)量兩組間比較采用t檢驗,3組間比較采用ANOVA檢驗。關(guān)聯(lián)分析用帶有95%可信區(qū)間(CI)的比值比(OR)表示。
2.1 研究對象一般臨床特點 經(jīng)過對各項資料分析,結(jié)果顯示有家族史、非母乳喂養(yǎng)、有過敏史和被動吸煙與兒童支氣管哮喘發(fā)病相關(guān)(P<0.05),而在性別、年齡方面差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。哮喘患兒中有83.0%顯示過敏原陽性,其中吸入性過敏原陽性占絕大多數(shù)(81.4%),詳見表1。
表1 支氣管哮喘患兒和健康兒童一般臨床資料[例(%)]
2.2 ALOX5基因多態(tài)性在支氣管哮喘兒童組和健康兒童組中等位基因及基因型分布 經(jīng)PCR-SSCP鑒定可見6種基因型,包括4/4、4/5、4/6、5/5、5/6和6/6;其中4/4、5/5和6/6條帶經(jīng)膠回收、純化后測序確認(rèn),結(jié)果完全一致,見圖1。ALOX5基因多態(tài)性在漢族健康兒童和支氣管哮喘兒童中分布情況見表2,該基因等位基因頻率及基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(χ2=0.361,P>0.05)。
由表2可見,等位基因4以及基因型(4/4+4/5)在病例和對照組中分布差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(均P<0.05)。2.3 ALOX5 mRNA表達(dá)量 ALOX5 mRNA在各組表達(dá)量見表3。健康兒童ALOX5 mRNA表達(dá)量(0.20±0.14)顯著低于哮喘兒童(0.28±0.15)(F=9.639,P<0.05);在病例組和對照組中,基因型(4/4+4/5)個體ALOX5 mRNA表達(dá)量均高于基因型(5/5+5/6)個體(F=4.194、5.178,均P<0.05),其余各基因型組間比較均無明顯差異(均P>0.05)。
圖1 ALOX5基因多態(tài)性鑒定 [A.ALOX5基因PCR-SSCP基因型結(jié)果(a:5/6基因型;b:5/5基因型;c:4/5基因型;d:4/4基因型;e:4/6基因型;f:6/6基因型);B.ALOX5基因4/4基因型測序結(jié)果(對應(yīng)于圖A中條帶d);C.ALOX5基因5/5基因型測序結(jié)果(對應(yīng)于圖A中條帶b);D.ALOX5基因6/6基因型測序結(jié)果(對應(yīng)于圖A中條帶f)]
表2 ALOX5基因多態(tài)性在支氣管哮喘兒童組和健康兒童組中分布[例(%)]
兒童支氣管哮喘是西方發(fā)達(dá)國家最常見的兒童疾病之一,其在我國兒童人群中發(fā)病率約達(dá)3%,且近些年呈上升趨勢。哮喘是一種復(fù)雜的多基因疾病,同時受遺傳因素和環(huán)境因素的雙重影響。慢性呼吸道炎癥是兒童支氣管哮喘的典型特征之一,而且在哮喘患者血清、尿液和呼出氣體凝結(jié)物中LTs C4、D4和E4水平增高[1-4]。ALOX5是上述產(chǎn)物生物合成途徑中的首個催化酶,其基因啟動子區(qū)SP1結(jié)合位點缺失1個或2個(-GGGCGG-)序列可能減少ALOX5 mRNA表達(dá)[6]。國內(nèi)外大量研究證實,在過敏性哮喘、運動性哮喘、阿司匹林哮喘患者中應(yīng)用ALOX5抑制劑或白三烯受體拮抗劑可明顯緩解哮喘癥狀,提高患者肺功能水平[12-13]。
表3 ALOX5 mRNA表達(dá)量
本研究結(jié)果顯示ALOX5基因在漢族兒童中等位基因、基因型分布與韓國兒童基本相近,在我們的樣本中同樣未發(fā)現(xiàn)3等位基因,東亞黃種人5/5基因型分布低于白種人[8,14],表明ALOX5基因多態(tài)性在人種間分布差異較大。通過關(guān)聯(lián)分析,我們發(fā)現(xiàn)攜帶等位基因4的漢族兒童發(fā)生支氣管哮喘的風(fēng)險高于攜帶等位基因5個體(OR=1.600,95%CI:1.018~2.519),基因型(4/4+4/5)兒童發(fā)生支氣管哮喘的風(fēng)險高于基因型5/5個體(OR= 1.903,95%CI:0.989~3.674)。在韓國學(xué)者的研究中,攜帶突變型(non-5)的阿司匹林不耐受哮喘(AIA)患者比野生型具有更嚴(yán)重的氣道高反應(yīng)性,但并未顯示突變型是AIA的危險因素。Galván等[14]研究了西班牙人群中ALOX5基因啟動子SP-1結(jié)合位點多態(tài)性與哮喘的關(guān)聯(lián),結(jié)果提示該位點與哮喘發(fā)生無關(guān)聯(lián)。造成以上這些矛盾結(jié)果,可能與人種、研究方案或樣本大小等因素有關(guān)。
本研究還分析了病例組、對照組以及不同基因型個體間全血ALOX5表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)健康兒童ALOX5 mRNA表達(dá)顯著低于哮喘兒童(P<0.05);無論是病例組還是對照組,基因型(4/4+4/5)個體表達(dá)ALOX5均高于基因型(5/5+5/6)個體(P<0.05)。該結(jié)果表明ALOX5高表達(dá)與漢族兒童哮喘可能相關(guān),同時提示ALOX5基因啟動子SP-1結(jié)合位點可能是一個能影響其表達(dá)的功能性位點。Vikman等[15]的研究也表明,在淋巴細(xì)胞中3、4等位基因與ALOX5基因高表達(dá)相關(guān),通過分析ALOX5基因啟動子及第一內(nèi)含子區(qū)域4個CpG島甲基化情況,發(fā)現(xiàn)差異性甲基化的CpG島位于ALOX5基因啟動子SP1結(jié)合位點內(nèi),進(jìn)而調(diào)控ALOX5基因表達(dá)。
因此,本研究提示ALOX5基因啟動子SP-1結(jié)合位點多態(tài)性可能與漢族兒童支氣管哮喘相關(guān),該位點能調(diào)控ALOX5 mRNA表達(dá)。
[1]Rabinovitch N,Zhang L,Gelfand E W.Urine leukotriene E4 levels are associated with decreased pulmonary function in children with persistent airway obstruction[J].J Allergy Clin Immunol,2006,118 (3):635-640.
[2]Shibata A,Katsunuma T,Tomikawa M,et al.Increased leukotriene E4 in the exhaled breath condensate of children with mild asthma [J].Chest,2006,130(6):1718-1722.
[3]Kostikas K,Gaga M,Papatheodorou G,et al.Leukotriene B4 in exhaled breath condensate and sputum supernatant in patients with COPD and asthma[J].Chest,2005,127(5):1553-1559.
[4]Koshino T,TakanoS,Houjo T,etal.Expression of 5-lipoxy-genase (5-LO)and 5-lipoxygenase-activating protein(FLAP)mRNAs in the peripheral blood leukocytes of asthma[J].Biochem Biophys Res Commun,1998,247(2):510-513.
[5]Drazen J M,Silverman E S.Genetic determinants of 5-lipoxygenase transcription[J].Int Arch Allergy Immunol,1999,118(2-4): 275-278.
[6]Silverman E S,Drazen J M.Genetic variations in the 5-lipoxygenase core promoter[J].Am J Respir Crit Care Med,2000,161(2): 77-80.
[7]Kalayci O,Birben E,Sackesen C,et al.ALOX5 promoter genotype,asthma severity and LTC4 production by eosinophils[J].Allergy,2006,61(1):97-103.
[8]Kim S H,Bae J S,Suh C H,et al.Polymorphism of tandem repeat in promoter of 5-lipoxygenase in ASA-intolerant asthma:a positive association with airway hyperresponsiveness[J].Allergy,2005, 60(6):760-765.
[9]Kedda M A,Worsley P,Shi J,et al.Polymorphisms in the 5-lipoxygenase activating protein(ALOX5AP)gene are not associated with asthma in an Australian population[J].Clin Exp Allergy.2005,35(3):332-338.
[10]中華醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會呼吸學(xué)組.兒童支氣管哮喘防治常規(guī)(試行) [J].中華兒科雜志,2004,42(2):100-106.
[11]Livak K J,Schmittgen T D.Analysis of relative gene expression data using real time quantitative PCR and the 2-ΔΔCtmethod[J].Methods,2001,25:402-408.
[12]孫鐵英,郭巖斐,張洪勝.白三烯在運動性哮喘發(fā)病機制中作用的初步探討[J].中華醫(yī)學(xué)雜志,2002,82(1):54-56.
[13]Obase Y,Shimoda T,Tomari S,et al.Effects of pranlukast on aspirin-induced bronchoconstriction:differences in chemical mediators between aspirin-intolerant and tolerant asthmatic patients[J].Ann Allergy Asthma Immunol,2001,87(1):74-79.
[14]Torres-Galván S M,Cumplido J A,Buset N,et al.5-Lipoxygenase Pathway Gene Polymorphisms:Lack of Association With Asthma in a Spanish Population.J Investig Allergol Clin Immunol, 2009,19(6):453-458.
[15]Vikmanl S,Brena M M,Armstrong P,et al.Functional analysis of 5-lipoxygenase promoter repeat variants[J].Hum Mol Genet, 2009,18(23):4521-4529.
Polymorphism of SP-1 binding motif in ALOX5 promoter may be associated with bronchial asthma susceptibility in Chinese Han children
Objective To investigate the association between polymorphism of SP-1 binding motif in ALOX5 promoter and bronchial asthma susceptibility in Chinese Han children. Methods Eighty-nine children with bronchial asthma(case group)and 124 healthy children (control group)were enrolled in the study.Polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism(PCR-SSCP)were applied to detect the polymorphism of ALOX5.Expression ALOX5 mRNA in peripheral blood was analyzed by real-time PCR in different genotypes of case and control groups. Results Clinical data revealed that family history,non-breastfeeding,history of allergies and passive smoking were the risk factors for bronchial asthma in Han children(P<0.05).Six genotypes of ALOX5 were identified by PCR-SSCP,including 4/4,4/5,4/6,5/5,5/6 and 6/6 genotypes.ALOX5 polymorphism in Han children was fitted with Hardy-Weinberg balance(χ2=0.361,P>0.05).The distributions of Allele 4 and genotypes(4/4+4/5)in the case and control groups showed significant differences(P<0.05).Relative expression levels of ALOX5 mRNA in healthy children(0.20±0.14)was significantly lower than that in asthmatic children(0.28±0.15)(P<0.05).The expression level of ALOX5 mRNA in genotypes(4/4+4/5)individuals was higher than those in genotypes(5/5+5/6)(P<0.05). Conclusion The polymorphism of SP-1 binding motif in ALOX5 promoter may be associated with the occurrence of bronchial asthma in Chinese Han children,which modulates ALOX5 mRNA expression.
Bronchial asthma ALOX5 gene Single nucleotide polymorphism
2014-05-22)
(本文編輯:田云鵬)
杭州市科技發(fā)展計劃項目(20110833B06)
310006 杭州市第一人民醫(yī)院兒科(劉占利、盛文彬、黃先玫、楊一華、馮亞男、黃暉、鄭緒陽),基因室(陳岳明)
盛文彬,E-mail:swb8825@163.com