A和863C>A多態(tài)性與廣西壯族原發(fā)性高血壓(EH)的相關(guān)性。方法采用ELISA法檢測(cè)152例廣西壯族EH患者(EH組)和50例廣西壯族健康者(對(duì)照組)血清TNFα、血脂、血糖(FBG)水平,用PCRSBT(PCRSequenc"/>
趙艷英 黃照河 潘興壽 李天資 梁燁
【摘要】目的探討腫瘤壞死因子α(TNFα)基因238G>A和863C>A多態(tài)性與廣西壯族原發(fā)性高血壓(EH)的相關(guān)性。方法采用ELISA法檢測(cè)152例廣西壯族EH患者(EH組)和50例廣西壯族健康者(對(duì)照組)血清TNFα、血脂、血糖(FBG)水平,用PCRSBT(PCR Sequencing Based Typing)方法檢測(cè)TNFα基因238G>A和863C>A多態(tài)性,探討血壓、血脂、FBG、TNFα水平與TNFα基因238G>A和863C>A的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果EH組收縮壓(SBP)、舒張壓(DBP)、FBG、TNFα、總膽固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)、體重指數(shù)(BMI)與對(duì)照組比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<005或0.01 );與對(duì)照組比較,EH組TNFα863C>A GG基因型和等位基因頻率更高(P<0.05或0.01),TNFα238G>A AA基因型和等位基因頻率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>005)。結(jié)論 廣西壯族原發(fā)性高血壓患者血清TNFα水平增高可能與TNFα238G>A有關(guān)聯(lián),與863C>A基因多態(tài)性無(wú)明確關(guān)聯(lián)。
【關(guān)鍵詞】原發(fā)性高血壓; 腫瘤壞死因子α;基因多態(tài)性
中圖分類號(hào):R544.1文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:ADOI:10.3969/j.issn.10031383.2014.04.001
原發(fā)性高血壓(essential hypertension,EH)是導(dǎo)致腦卒中、冠心病、心功能不全、腎臟疾病等重要疾病的主要危險(xiǎn)因素之一[1],近年來(lái)的研究表明,EH患者的患病率和病死率有逐年增高趨勢(shì)[2]。中國(guó)疾病預(yù)防控制中心(CDC)的橫斷面研究表明[3],2010年我國(guó)成年人高血壓患病率為33.5%,估計(jì)患病人數(shù)為3.3億,每年有45萬(wàn)人死于高血壓。EH的發(fā)病機(jī)制還在探索之中,目前認(rèn)為遺傳和環(huán)境因素的交互作用與EH的發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)歸密切相關(guān)[4]。研究表明,腫瘤壞死因子α(TNFα)基因啟動(dòng)區(qū)基因多態(tài)性與TNFα的轉(zhuǎn)錄和分泌相關(guān)[5~9],為了解TNFα基因多態(tài)性與EH的關(guān)聯(lián)性,本文探討TNFα238G>A及TNFα863C>A多態(tài)性與廣西壯族EH的相關(guān)性。1對(duì)象與方法1.1研究對(duì)象EH組選擇雙親均為壯族的原發(fā)性高血壓患者152例(樣本來(lái)源于廣西百色地區(qū))作為觀察對(duì)象,均簽署知情同意書(shū),其中男93例,女59例,平均年齡為(55.9±13.7)歲。中國(guó)高血壓防治指南(2010年修訂本)診斷標(biāo)準(zhǔn),EH為:收縮壓(SBP)≥140 mmHg和/或舒張壓(DBP)≥90 mmHg;或者既往有高血壓史,正在服用降壓藥者,雖血壓<140/90 mmHg,也可入選。排除繼發(fā)性高血壓、糖尿病、冠心病、自身免疫性疾病、腦梗死、心力衰竭、泌尿系統(tǒng)疾病、感染性疾病、腫瘤、嚴(yán)重的肝腎功能不全及應(yīng)用抗炎藥物、免疫抑制劑,不能耐受檢查者。對(duì)照組為正常血壓受試者50人,男30人,女20人,平均年齡為(52.9±12.7)歲,常規(guī)檢查均無(wú)高血壓、糖尿病、高血脂、腎病等。入選者雙親均為壯族,對(duì)象之間無(wú)血緣關(guān)系,年齡、性別構(gòu)成與EH組比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>005)。
1.2研究方法
1.2.1血壓的測(cè)量方法受檢者均于早晨6:00~7:00進(jìn)行,取臥位,采用校正水銀血壓計(jì),以Korotkoff法測(cè)量右上臂SBP、DBP,每次間隔5 min,連續(xù)測(cè)量3次,取平均值為血壓值,并測(cè)量身高和體重。
1.2.2生化指標(biāo)的檢測(cè)受檢者于采血前夜22:00后禁食,于早晨6:00~7:00抽取靜脈血約7 ml,其中2 ml用EDTA抗凝,置于4℃冰箱中,于3天內(nèi)提取DNA;5 ml置于促凝管,凝固后離心3000 r/min 20 min分裝血清,一部分直接送檢空腹血糖(FBG)、總膽固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)和尿酸(UA)等生化指標(biāo),一部分置于-80℃冰箱中以備檢測(cè)TNFα血清水平。
1.2.3血清TNFα的測(cè)定采用酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定法(ELISA),操作步驟嚴(yán)格按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,試劑盒購(gòu)自武漢華美生物工程有限公司。使用美國(guó)BIORAD680酶標(biāo)儀450 nm波長(zhǎng)下測(cè)量各孔OD值,用專業(yè)軟件Curve Expert 1.3繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,r=0.99987,根據(jù)樣本OD值計(jì)算出相應(yīng)的濃度,即為對(duì)應(yīng)樣本的血清濃度。
1.2.4基因組DNA的制備采用離心柱型提取血液基因組DNA,操作方法嚴(yán)格按照人血液基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,試劑盒購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司。經(jīng)超微量分光光度計(jì)NanoVue檢測(cè)OD260/OD280比值均在1.6~1.9。分裝后放置-80℃冰箱備用。
1.2.5TNFα238G>A及TNFα863C>A多態(tài)性檢測(cè)PCR擴(kuò)增: PCR擴(kuò)增儀為BioRadPTC200,PCR試劑Premix Ex TaqTMVersion 2.0購(gòu)自日本TAKARA。引物(Primer)由寶生物工程(大連)有限公司設(shè)計(jì)及合成。TNFα238G>A上游引物(Forward Primer,F(xiàn)P):AGCCCCTCCCAGTTCTAG,下游引物(Reverse Primer,RP):TCTGTCTCGGTTTCTTCTCC。TNFα863C>A FP:AGCCCCTCCCAGTTCTAG,RP:AGCCCCTCCCAGTTCTAG。PCR總反應(yīng)體系為50 μl,其中 Premix Ex TaqTMVersion 2.0 25 μl,模板3 μl(濃度0.5~1.0 μg),滅菌蒸餾水20 μl,上下游引物各1 μl,樣品混合后置PCR儀30個(gè)循環(huán)。TNFα238G>A反應(yīng)條件:98℃變性10 s, 591 ℃退火 30 s,72 ℃延伸20 s;TNFα863C>A反應(yīng)條件:98 ℃變性10 s,62.6 ℃ 退火30 s,72 ℃ 延伸19 s。TNFα238G>A擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為321 bp,TNFα863C>A擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為302 bp。反應(yīng)完成后取PCR產(chǎn)物5 μl用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為2%的瓊脂糖凝膠垂直電泳觀察PCR產(chǎn)物情況,電壓90 mV時(shí)間30 min,電泳液為0.5×TBE液,若相應(yīng)位置有清晰擴(kuò)增單一條帶,則純化后行測(cè)序反應(yīng)。
1.2.6PCR產(chǎn)物純化及測(cè)序使用2%瓊脂糖凝膠電泳鑒定PCR產(chǎn)物條帶和濃度,對(duì)PCR產(chǎn)物濃度進(jìn)行過(guò)膜純化或者切膠純化以及定量,采用sanger法進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序分析儀為3730XL測(cè)序分析儀,測(cè)序膠是POP7,均購(gòu)自美國(guó)AB公司。測(cè)定結(jié)果出現(xiàn)雙峰, 則該位點(diǎn)為雜合子型, 出現(xiàn)單峰為純合子型。使用chromatogram file 軟件分析測(cè)序結(jié)果,采用直接基因計(jì)數(shù)法對(duì)基因型及等位基因頻率進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。
【摘要】目的探討腫瘤壞死因子α(TNFα)基因238G>A和863C>A多態(tài)性與廣西壯族原發(fā)性高血壓(EH)的相關(guān)性。方法采用ELISA法檢測(cè)152例廣西壯族EH患者(EH組)和50例廣西壯族健康者(對(duì)照組)血清TNFα、血脂、血糖(FBG)水平,用PCRSBT(PCR Sequencing Based Typing)方法檢測(cè)TNFα基因238G>A和863C>A多態(tài)性,探討血壓、血脂、FBG、TNFα水平與TNFα基因238G>A和863C>A的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果EH組收縮壓(SBP)、舒張壓(DBP)、FBG、TNFα、總膽固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)、體重指數(shù)(BMI)與對(duì)照組比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<005或0.01 );與對(duì)照組比較,EH組TNFα863C>A GG基因型和等位基因頻率更高(P<0.05或0.01),TNFα238G>A AA基因型和等位基因頻率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>005)。結(jié)論 廣西壯族原發(fā)性高血壓患者血清TNFα水平增高可能與TNFα238G>A有關(guān)聯(lián),與863C>A基因多態(tài)性無(wú)明確關(guān)聯(lián)。
【關(guān)鍵詞】原發(fā)性高血壓; 腫瘤壞死因子α;基因多態(tài)性
中圖分類號(hào):R544.1文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:ADOI:10.3969/j.issn.10031383.2014.04.001
原發(fā)性高血壓(essential hypertension,EH)是導(dǎo)致腦卒中、冠心病、心功能不全、腎臟疾病等重要疾病的主要危險(xiǎn)因素之一[1],近年來(lái)的研究表明,EH患者的患病率和病死率有逐年增高趨勢(shì)[2]。中國(guó)疾病預(yù)防控制中心(CDC)的橫斷面研究表明[3],2010年我國(guó)成年人高血壓患病率為33.5%,估計(jì)患病人數(shù)為3.3億,每年有45萬(wàn)人死于高血壓。EH的發(fā)病機(jī)制還在探索之中,目前認(rèn)為遺傳和環(huán)境因素的交互作用與EH的發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)歸密切相關(guān)[4]。研究表明,腫瘤壞死因子α(TNFα)基因啟動(dòng)區(qū)基因多態(tài)性與TNFα的轉(zhuǎn)錄和分泌相關(guān)[5~9],為了解TNFα基因多態(tài)性與EH的關(guān)聯(lián)性,本文探討TNFα238G>A及TNFα863C>A多態(tài)性與廣西壯族EH的相關(guān)性。1對(duì)象與方法1.1研究對(duì)象EH組選擇雙親均為壯族的原發(fā)性高血壓患者152例(樣本來(lái)源于廣西百色地區(qū))作為觀察對(duì)象,均簽署知情同意書(shū),其中男93例,女59例,平均年齡為(55.9±13.7)歲。中國(guó)高血壓防治指南(2010年修訂本)診斷標(biāo)準(zhǔn),EH為:收縮壓(SBP)≥140 mmHg和/或舒張壓(DBP)≥90 mmHg;或者既往有高血壓史,正在服用降壓藥者,雖血壓<140/90 mmHg,也可入選。排除繼發(fā)性高血壓、糖尿病、冠心病、自身免疫性疾病、腦梗死、心力衰竭、泌尿系統(tǒng)疾病、感染性疾病、腫瘤、嚴(yán)重的肝腎功能不全及應(yīng)用抗炎藥物、免疫抑制劑,不能耐受檢查者。對(duì)照組為正常血壓受試者50人,男30人,女20人,平均年齡為(52.9±12.7)歲,常規(guī)檢查均無(wú)高血壓、糖尿病、高血脂、腎病等。入選者雙親均為壯族,對(duì)象之間無(wú)血緣關(guān)系,年齡、性別構(gòu)成與EH組比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>005)。
1.2研究方法
1.2.1血壓的測(cè)量方法受檢者均于早晨6:00~7:00進(jìn)行,取臥位,采用校正水銀血壓計(jì),以Korotkoff法測(cè)量右上臂SBP、DBP,每次間隔5 min,連續(xù)測(cè)量3次,取平均值為血壓值,并測(cè)量身高和體重。
1.2.2生化指標(biāo)的檢測(cè)受檢者于采血前夜22:00后禁食,于早晨6:00~7:00抽取靜脈血約7 ml,其中2 ml用EDTA抗凝,置于4℃冰箱中,于3天內(nèi)提取DNA;5 ml置于促凝管,凝固后離心3000 r/min 20 min分裝血清,一部分直接送檢空腹血糖(FBG)、總膽固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)和尿酸(UA)等生化指標(biāo),一部分置于-80℃冰箱中以備檢測(cè)TNFα血清水平。
1.2.3血清TNFα的測(cè)定采用酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定法(ELISA),操作步驟嚴(yán)格按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,試劑盒購(gòu)自武漢華美生物工程有限公司。使用美國(guó)BIORAD680酶標(biāo)儀450 nm波長(zhǎng)下測(cè)量各孔OD值,用專業(yè)軟件Curve Expert 1.3繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,r=0.99987,根據(jù)樣本OD值計(jì)算出相應(yīng)的濃度,即為對(duì)應(yīng)樣本的血清濃度。
1.2.4基因組DNA的制備采用離心柱型提取血液基因組DNA,操作方法嚴(yán)格按照人血液基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,試劑盒購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司。經(jīng)超微量分光光度計(jì)NanoVue檢測(cè)OD260/OD280比值均在1.6~1.9。分裝后放置-80℃冰箱備用。
1.2.5TNFα238G>A及TNFα863C>A多態(tài)性檢測(cè)PCR擴(kuò)增: PCR擴(kuò)增儀為BioRadPTC200,PCR試劑Premix Ex TaqTMVersion 2.0購(gòu)自日本TAKARA。引物(Primer)由寶生物工程(大連)有限公司設(shè)計(jì)及合成。TNFα238G>A上游引物(Forward Primer,F(xiàn)P):AGCCCCTCCCAGTTCTAG,下游引物(Reverse Primer,RP):TCTGTCTCGGTTTCTTCTCC。TNFα863C>A FP:AGCCCCTCCCAGTTCTAG,RP:AGCCCCTCCCAGTTCTAG。PCR總反應(yīng)體系為50 μl,其中 Premix Ex TaqTMVersion 2.0 25 μl,模板3 μl(濃度0.5~1.0 μg),滅菌蒸餾水20 μl,上下游引物各1 μl,樣品混合后置PCR儀30個(gè)循環(huán)。TNFα238G>A反應(yīng)條件:98℃變性10 s, 591 ℃退火 30 s,72 ℃延伸20 s;TNFα863C>A反應(yīng)條件:98 ℃變性10 s,62.6 ℃ 退火30 s,72 ℃ 延伸19 s。TNFα238G>A擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為321 bp,TNFα863C>A擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為302 bp。反應(yīng)完成后取PCR產(chǎn)物5 μl用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為2%的瓊脂糖凝膠垂直電泳觀察PCR產(chǎn)物情況,電壓90 mV時(shí)間30 min,電泳液為0.5×TBE液,若相應(yīng)位置有清晰擴(kuò)增單一條帶,則純化后行測(cè)序反應(yīng)。
1.2.6PCR產(chǎn)物純化及測(cè)序使用2%瓊脂糖凝膠電泳鑒定PCR產(chǎn)物條帶和濃度,對(duì)PCR產(chǎn)物濃度進(jìn)行過(guò)膜純化或者切膠純化以及定量,采用sanger法進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序分析儀為3730XL測(cè)序分析儀,測(cè)序膠是POP7,均購(gòu)自美國(guó)AB公司。測(cè)定結(jié)果出現(xiàn)雙峰, 則該位點(diǎn)為雜合子型, 出現(xiàn)單峰為純合子型。使用chromatogram file 軟件分析測(cè)序結(jié)果,采用直接基因計(jì)數(shù)法對(duì)基因型及等位基因頻率進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。
【摘要】目的探討腫瘤壞死因子α(TNFα)基因238G>A和863C>A多態(tài)性與廣西壯族原發(fā)性高血壓(EH)的相關(guān)性。方法采用ELISA法檢測(cè)152例廣西壯族EH患者(EH組)和50例廣西壯族健康者(對(duì)照組)血清TNFα、血脂、血糖(FBG)水平,用PCRSBT(PCR Sequencing Based Typing)方法檢測(cè)TNFα基因238G>A和863C>A多態(tài)性,探討血壓、血脂、FBG、TNFα水平與TNFα基因238G>A和863C>A的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果EH組收縮壓(SBP)、舒張壓(DBP)、FBG、TNFα、總膽固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)、體重指數(shù)(BMI)與對(duì)照組比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<005或0.01 );與對(duì)照組比較,EH組TNFα863C>A GG基因型和等位基因頻率更高(P<0.05或0.01),TNFα238G>A AA基因型和等位基因頻率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>005)。結(jié)論 廣西壯族原發(fā)性高血壓患者血清TNFα水平增高可能與TNFα238G>A有關(guān)聯(lián),與863C>A基因多態(tài)性無(wú)明確關(guān)聯(lián)。
【關(guān)鍵詞】原發(fā)性高血壓; 腫瘤壞死因子α;基因多態(tài)性
中圖分類號(hào):R544.1文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:ADOI:10.3969/j.issn.10031383.2014.04.001
原發(fā)性高血壓(essential hypertension,EH)是導(dǎo)致腦卒中、冠心病、心功能不全、腎臟疾病等重要疾病的主要危險(xiǎn)因素之一[1],近年來(lái)的研究表明,EH患者的患病率和病死率有逐年增高趨勢(shì)[2]。中國(guó)疾病預(yù)防控制中心(CDC)的橫斷面研究表明[3],2010年我國(guó)成年人高血壓患病率為33.5%,估計(jì)患病人數(shù)為3.3億,每年有45萬(wàn)人死于高血壓。EH的發(fā)病機(jī)制還在探索之中,目前認(rèn)為遺傳和環(huán)境因素的交互作用與EH的發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)歸密切相關(guān)[4]。研究表明,腫瘤壞死因子α(TNFα)基因啟動(dòng)區(qū)基因多態(tài)性與TNFα的轉(zhuǎn)錄和分泌相關(guān)[5~9],為了解TNFα基因多態(tài)性與EH的關(guān)聯(lián)性,本文探討TNFα238G>A及TNFα863C>A多態(tài)性與廣西壯族EH的相關(guān)性。1對(duì)象與方法1.1研究對(duì)象EH組選擇雙親均為壯族的原發(fā)性高血壓患者152例(樣本來(lái)源于廣西百色地區(qū))作為觀察對(duì)象,均簽署知情同意書(shū),其中男93例,女59例,平均年齡為(55.9±13.7)歲。中國(guó)高血壓防治指南(2010年修訂本)診斷標(biāo)準(zhǔn),EH為:收縮壓(SBP)≥140 mmHg和/或舒張壓(DBP)≥90 mmHg;或者既往有高血壓史,正在服用降壓藥者,雖血壓<140/90 mmHg,也可入選。排除繼發(fā)性高血壓、糖尿病、冠心病、自身免疫性疾病、腦梗死、心力衰竭、泌尿系統(tǒng)疾病、感染性疾病、腫瘤、嚴(yán)重的肝腎功能不全及應(yīng)用抗炎藥物、免疫抑制劑,不能耐受檢查者。對(duì)照組為正常血壓受試者50人,男30人,女20人,平均年齡為(52.9±12.7)歲,常規(guī)檢查均無(wú)高血壓、糖尿病、高血脂、腎病等。入選者雙親均為壯族,對(duì)象之間無(wú)血緣關(guān)系,年齡、性別構(gòu)成與EH組比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>005)。
1.2研究方法
1.2.1血壓的測(cè)量方法受檢者均于早晨6:00~7:00進(jìn)行,取臥位,采用校正水銀血壓計(jì),以Korotkoff法測(cè)量右上臂SBP、DBP,每次間隔5 min,連續(xù)測(cè)量3次,取平均值為血壓值,并測(cè)量身高和體重。
1.2.2生化指標(biāo)的檢測(cè)受檢者于采血前夜22:00后禁食,于早晨6:00~7:00抽取靜脈血約7 ml,其中2 ml用EDTA抗凝,置于4℃冰箱中,于3天內(nèi)提取DNA;5 ml置于促凝管,凝固后離心3000 r/min 20 min分裝血清,一部分直接送檢空腹血糖(FBG)、總膽固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)和尿酸(UA)等生化指標(biāo),一部分置于-80℃冰箱中以備檢測(cè)TNFα血清水平。
1.2.3血清TNFα的測(cè)定采用酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定法(ELISA),操作步驟嚴(yán)格按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,試劑盒購(gòu)自武漢華美生物工程有限公司。使用美國(guó)BIORAD680酶標(biāo)儀450 nm波長(zhǎng)下測(cè)量各孔OD值,用專業(yè)軟件Curve Expert 1.3繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,r=0.99987,根據(jù)樣本OD值計(jì)算出相應(yīng)的濃度,即為對(duì)應(yīng)樣本的血清濃度。
1.2.4基因組DNA的制備采用離心柱型提取血液基因組DNA,操作方法嚴(yán)格按照人血液基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,試劑盒購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司。經(jīng)超微量分光光度計(jì)NanoVue檢測(cè)OD260/OD280比值均在1.6~1.9。分裝后放置-80℃冰箱備用。
1.2.5TNFα238G>A及TNFα863C>A多態(tài)性檢測(cè)PCR擴(kuò)增: PCR擴(kuò)增儀為BioRadPTC200,PCR試劑Premix Ex TaqTMVersion 2.0購(gòu)自日本TAKARA。引物(Primer)由寶生物工程(大連)有限公司設(shè)計(jì)及合成。TNFα238G>A上游引物(Forward Primer,F(xiàn)P):AGCCCCTCCCAGTTCTAG,下游引物(Reverse Primer,RP):TCTGTCTCGGTTTCTTCTCC。TNFα863C>A FP:AGCCCCTCCCAGTTCTAG,RP:AGCCCCTCCCAGTTCTAG。PCR總反應(yīng)體系為50 μl,其中 Premix Ex TaqTMVersion 2.0 25 μl,模板3 μl(濃度0.5~1.0 μg),滅菌蒸餾水20 μl,上下游引物各1 μl,樣品混合后置PCR儀30個(gè)循環(huán)。TNFα238G>A反應(yīng)條件:98℃變性10 s, 591 ℃退火 30 s,72 ℃延伸20 s;TNFα863C>A反應(yīng)條件:98 ℃變性10 s,62.6 ℃ 退火30 s,72 ℃ 延伸19 s。TNFα238G>A擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為321 bp,TNFα863C>A擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為302 bp。反應(yīng)完成后取PCR產(chǎn)物5 μl用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為2%的瓊脂糖凝膠垂直電泳觀察PCR產(chǎn)物情況,電壓90 mV時(shí)間30 min,電泳液為0.5×TBE液,若相應(yīng)位置有清晰擴(kuò)增單一條帶,則純化后行測(cè)序反應(yīng)。
1.2.6PCR產(chǎn)物純化及測(cè)序使用2%瓊脂糖凝膠電泳鑒定PCR產(chǎn)物條帶和濃度,對(duì)PCR產(chǎn)物濃度進(jìn)行過(guò)膜純化或者切膠純化以及定量,采用sanger法進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序分析儀為3730XL測(cè)序分析儀,測(cè)序膠是POP7,均購(gòu)自美國(guó)AB公司。測(cè)定結(jié)果出現(xiàn)雙峰, 則該位點(diǎn)為雜合子型, 出現(xiàn)單峰為純合子型。使用chromatogram file 軟件分析測(cè)序結(jié)果,采用直接基因計(jì)數(shù)法對(duì)基因型及等位基因頻率進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。