李麗麗+郎敬+楊洪一+邰飛飛+來永才
摘要:利用PVK平板,從大豆根際土壤中分離出8株解磷菌。培養(yǎng)分析結(jié)果顯示,這8株解磷菌的溶磷圈均較大。其中,海倫Ⅲ號(hào)為革蘭氏陰性菌,其余均為革蘭氏陽性菌。形態(tài)學(xué)觀察結(jié)果顯示,北安Ⅰ號(hào)為鏈球菌,海倫Ⅱ號(hào)、海倫Ⅲ號(hào)為球菌,海倫Ⅳ號(hào)、北安Ⅲ號(hào)為桿菌?;诩?xì)菌核糖體16S rDNA序列對(duì)北安Ⅲ號(hào)菌株進(jìn)行鑒定,結(jié)合形態(tài)特征確認(rèn)該菌株為巨大芽孢桿菌,經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)該菌株是一種重要的微生物資源,可進(jìn)一步開發(fā)為生物磷肥。
關(guān)鍵詞:解磷菌;溶磷圈;16S rDNA;大豆;生物磷肥
中圖分類號(hào):S154.3 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
文章編號(hào):1002-1302(2014)08-0363-03
土壤中存在一些特定的微生物,能夠?qū)⒅参镫y以吸收利用的磷轉(zhuǎn)化為可吸收利用的形態(tài),這些微生物被稱為解磷菌,以細(xì)菌為主[1]。將解磷菌作為肥料施入土壤,通過其生長代謝可以在作物根際形成一個(gè)磷供應(yīng)較充分的微區(qū),從而改善作物磷元素的供應(yīng),增加作物磷素吸收量,提高作物產(chǎn)量,同時(shí)還可以增進(jìn)土壤肥力、增強(qiáng)植物抗病和抗旱能力[2]。因此,解磷菌的篩選及鑒定是當(dāng)前微生物學(xué)研究的熱點(diǎn)。土壤中解磷微生物種類豐富、數(shù)量較多[2],目前報(bào)道的具有解磷作用的細(xì)菌有芽孢桿菌屬(Bacillus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、土壤桿菌屬(Agrobacterium)、固氮菌屬(Azotobacte)、根瘤菌屬(Bradxrkizobium)、硫桿菌屬(Thiobacillus)、腸細(xì)菌屬(Enterbacter)、微球菌屬(Microeoccus)、沙門氏菌屬(Salmonella)、色桿菌屬(Clromobacterium)、產(chǎn)堿菌屬(Alcaligenes)、節(jié)細(xì)菌屬(Arthrobacte)、大腸桿菌屬(Escherichia)等[3]。解磷微生物在我國應(yīng)用較早,有較好的應(yīng)用前景,但發(fā)展不快,應(yīng)用還不普遍。篩選高效微生物肥料菌株手段單一、菌種種類少是影響微生物肥料發(fā)展的重要因素,因而有必要對(duì)土壤中的解磷菌進(jìn)行大規(guī)模篩選,并進(jìn)行系統(tǒng)鑒定,豐富菌種資源,但土壤中的細(xì)菌種類極為豐富,通過常規(guī)的形態(tài)學(xué)和生理生化方法難以進(jìn)行有效的鑒定。筆者所在的實(shí)驗(yàn)室在前期研究中獲得了8株解磷菌,本研究對(duì)這些分離到的解磷菌進(jìn)行了形態(tài)觀察及分子鑒定,為豐富解磷微生物菌種資源打下基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 染色及顯微觀察
利用革蘭氏染色法[4]對(duì)篩選到的高效解磷菌進(jìn)行染色,將菌液涂布于載玻片上,干燥,固定,結(jié)晶紫初染1 min,水洗至無色;碘液媒染1 min,水洗至無色;95%乙醇脫色30 s,水洗至無色;最后沙黃復(fù)染1 min,水洗至無色,干燥,鏡檢。
1.2 細(xì)菌總DNA的提取
接種菌株置于LB液體培養(yǎng)基中,于130 r/min下振蕩,37 ℃過夜培養(yǎng)。取1.5 mL新鮮菌液于EP管中,于 4 000 r/min 下離心30 s,棄上清,收集菌體;加100 μg/mL 溶菌酶50 μL,于37 ℃下處理1 h輔助裂解;加入預(yù)熱的CTAB溶液500 μL,充分混合,于65 ℃水浴30 min,混勻;冷卻后,加入等體積的三氯甲烷/異戊醇(24 ∶1)抽提,顛倒充分混合,10 000 r/min離心10 min;取上清液,加入等體積三氯甲烷/異戊醇(24 ∶1),輕輕顛倒混勻,10 000 r/min離心5 min;取上清,加入2倍體積的無水乙醇,沉淀30 min,8 000 r/min離心10 min;棄上清,用70%乙醇洗滌沉淀2次;在超凈工作臺(tái)上風(fēng)干DNA,溶于20 μL去離子水中。
1.3 PCR擴(kuò)增
利用細(xì)菌核糖體16S rDNA通用引物27F/1492R[5]進(jìn)行PCR反應(yīng),其反應(yīng)體系20 μL,包括10×PCR Buffer 2.0 μL、dNTP mix 1.6 μL、25 μmol/mL引物27F/1492R各0.4 μL、Taq DNA 聚合酶 1 U、模板DNA 1 μL,去離子水補(bǔ)足至 20 μL。PCR 反應(yīng)條件為:94 ℃ 4 min;94 ℃ 30 s,52 ℃30 s,72 ℃ 1.5 min,30 次循環(huán);72 ℃ 7 min;4 ℃保溫。
1.4 回收及測序
利用瓊脂糖凝膠回收試劑盒對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收純化,將純化產(chǎn)物送至大連寶生物公司進(jìn)行測序。利用BLAST工具在GenBank中對(duì)獲得的序列進(jìn)行分析[6]。經(jīng)過NCBI比對(duì)后下載相關(guān)菌株的細(xì)菌核糖體16S rDNA序列,所得序列用Clustal X 1.81程序進(jìn)行多序列比對(duì),并經(jīng)手工校正;然后用軟件MEGA 3.1構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
2 結(jié)果與分析
利用PVK平板,從大豆根際土壤中篩選出8株解磷菌,并將這8株解磷菌接種在固體LB培養(yǎng)基上,37 ℃恒溫培養(yǎng)條件下菌株的溶磷圈均較大,菌落邊緣呈規(guī)則的圓形,表面光滑,中心突起,分別編號(hào)為北安Ⅰ、北安Ⅱ、北安Ⅲ、北安Ⅳ、海倫Ⅰ、海倫Ⅱ、海倫Ⅲ、海倫Ⅳ(部分菌株菌落形態(tài)見圖1至圖4)。由于培養(yǎng)基中加入了溴酚藍(lán),菌落吸附了染料呈藍(lán)色,但一些菌株具有降解溴酚藍(lán)的能力,如菌株海倫Ⅱ號(hào)(圖4),藍(lán)色較淡。
革蘭氏染色結(jié)果顯示,海倫Ⅲ號(hào)為革蘭氏陰性菌,其余均為革蘭氏陽性菌。在光學(xué)顯微鏡下可有效觀察到菌株的形態(tài)(部分菌株形態(tài)見圖5至圖10),其中北安Ⅰ號(hào)為鏈球菌,海倫Ⅱ號(hào)、海倫Ⅲ號(hào)為球菌,海倫Ⅳ號(hào)、北安Ⅲ號(hào)為桿菌。
3 結(jié)論
利用PVK平板對(duì)解磷菌進(jìn)行分離是一種簡單有效的手段[7],一些菌株(如芽孢桿菌屬)在其生長過程中可產(chǎn)酸,將培養(yǎng)基中的磷酸鈣溶解產(chǎn)生溶磷圈,通過分析溶磷圈的大小可對(duì)微生物的溶磷能力進(jìn)行初步估測。本研究中的菌株皆產(chǎn)生了較大的溶磷圈,說明它們可能具有較強(qiáng)的溶磷潛力。本研究獲得的解磷菌既有球菌,又有桿菌,但已有研究中分離及初步應(yīng)用的解磷菌主要是桿菌,因而本研究重點(diǎn)選擇了一種桿菌——北安Ⅲ號(hào)進(jìn)行細(xì)菌核糖體16S rDNA序列鑒定。結(jié)合形態(tài)學(xué)特點(diǎn)及細(xì)菌核糖體16S rDNA序列,確定該菌為巨大芽孢桿菌。該菌是土壤中的重要菌群,對(duì)農(nóng)作物無害,且可能具有一些有益生物學(xué)作用,因而該菌株是一種重要的微生物資源,可進(jìn)一步開發(fā)為生物磷肥。
參考文獻(xiàn):
[1]李曉婷. 解磷細(xì)菌K3的GFP標(biāo)記與在土壤中定殖及對(duì)玉米生長效應(yīng)研究[D]. 南京:南京農(nóng)業(yè)大學(xué),2009:1-5.
[2]Gyaneshwar P,Naresh K G,Parekh L J,et al. Role of soil microorganisms in improving P nutrition of plants[J]. Plant and Soil,2002,245:83-93.
[3]Rodríguez H,F(xiàn)raga R. Phosphate solubilizing bacteria and their role in plant growth promotion[J]. Biotechnology Advances,1999,17:319-339.
[4]萬翠番,章昭琳,王報(bào)貴,等. 高黏附力雙歧桿菌的篩選與鑒定[J]. 中國乳品工業(yè),2012(5):13-15.
[5]Moreno C,Romero J,Romilio T E. Polymorphism in repeated 16S rRNA genes is a common property of type strains and environmental isolates of the genus Vibrio[J]. Microbiology,2002,148:1233-1239.
[6]Altschul S F,Madden TL,Chffer A A,et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST:a new generation of protein database search programs[J]. Nucleic Acids Res,1997,25(17):3389-3402.
[7]Kucey R M N,Janzen H H,Legett M E. Microbially mediated increases in plant available phosphorus[J]. Advances in Agronomy,1989,42:199-228.endprint
摘要:利用PVK平板,從大豆根際土壤中分離出8株解磷菌。培養(yǎng)分析結(jié)果顯示,這8株解磷菌的溶磷圈均較大。其中,海倫Ⅲ號(hào)為革蘭氏陰性菌,其余均為革蘭氏陽性菌。形態(tài)學(xué)觀察結(jié)果顯示,北安Ⅰ號(hào)為鏈球菌,海倫Ⅱ號(hào)、海倫Ⅲ號(hào)為球菌,海倫Ⅳ號(hào)、北安Ⅲ號(hào)為桿菌?;诩?xì)菌核糖體16S rDNA序列對(duì)北安Ⅲ號(hào)菌株進(jìn)行鑒定,結(jié)合形態(tài)特征確認(rèn)該菌株為巨大芽孢桿菌,經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)該菌株是一種重要的微生物資源,可進(jìn)一步開發(fā)為生物磷肥。
關(guān)鍵詞:解磷菌;溶磷圈;16S rDNA;大豆;生物磷肥
中圖分類號(hào):S154.3 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
文章編號(hào):1002-1302(2014)08-0363-03
土壤中存在一些特定的微生物,能夠?qū)⒅参镫y以吸收利用的磷轉(zhuǎn)化為可吸收利用的形態(tài),這些微生物被稱為解磷菌,以細(xì)菌為主[1]。將解磷菌作為肥料施入土壤,通過其生長代謝可以在作物根際形成一個(gè)磷供應(yīng)較充分的微區(qū),從而改善作物磷元素的供應(yīng),增加作物磷素吸收量,提高作物產(chǎn)量,同時(shí)還可以增進(jìn)土壤肥力、增強(qiáng)植物抗病和抗旱能力[2]。因此,解磷菌的篩選及鑒定是當(dāng)前微生物學(xué)研究的熱點(diǎn)。土壤中解磷微生物種類豐富、數(shù)量較多[2],目前報(bào)道的具有解磷作用的細(xì)菌有芽孢桿菌屬(Bacillus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、土壤桿菌屬(Agrobacterium)、固氮菌屬(Azotobacte)、根瘤菌屬(Bradxrkizobium)、硫桿菌屬(Thiobacillus)、腸細(xì)菌屬(Enterbacter)、微球菌屬(Microeoccus)、沙門氏菌屬(Salmonella)、色桿菌屬(Clromobacterium)、產(chǎn)堿菌屬(Alcaligenes)、節(jié)細(xì)菌屬(Arthrobacte)、大腸桿菌屬(Escherichia)等[3]。解磷微生物在我國應(yīng)用較早,有較好的應(yīng)用前景,但發(fā)展不快,應(yīng)用還不普遍。篩選高效微生物肥料菌株手段單一、菌種種類少是影響微生物肥料發(fā)展的重要因素,因而有必要對(duì)土壤中的解磷菌進(jìn)行大規(guī)模篩選,并進(jìn)行系統(tǒng)鑒定,豐富菌種資源,但土壤中的細(xì)菌種類極為豐富,通過常規(guī)的形態(tài)學(xué)和生理生化方法難以進(jìn)行有效的鑒定。筆者所在的實(shí)驗(yàn)室在前期研究中獲得了8株解磷菌,本研究對(duì)這些分離到的解磷菌進(jìn)行了形態(tài)觀察及分子鑒定,為豐富解磷微生物菌種資源打下基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 染色及顯微觀察
利用革蘭氏染色法[4]對(duì)篩選到的高效解磷菌進(jìn)行染色,將菌液涂布于載玻片上,干燥,固定,結(jié)晶紫初染1 min,水洗至無色;碘液媒染1 min,水洗至無色;95%乙醇脫色30 s,水洗至無色;最后沙黃復(fù)染1 min,水洗至無色,干燥,鏡檢。
1.2 細(xì)菌總DNA的提取
接種菌株置于LB液體培養(yǎng)基中,于130 r/min下振蕩,37 ℃過夜培養(yǎng)。取1.5 mL新鮮菌液于EP管中,于 4 000 r/min 下離心30 s,棄上清,收集菌體;加100 μg/mL 溶菌酶50 μL,于37 ℃下處理1 h輔助裂解;加入預(yù)熱的CTAB溶液500 μL,充分混合,于65 ℃水浴30 min,混勻;冷卻后,加入等體積的三氯甲烷/異戊醇(24 ∶1)抽提,顛倒充分混合,10 000 r/min離心10 min;取上清液,加入等體積三氯甲烷/異戊醇(24 ∶1),輕輕顛倒混勻,10 000 r/min離心5 min;取上清,加入2倍體積的無水乙醇,沉淀30 min,8 000 r/min離心10 min;棄上清,用70%乙醇洗滌沉淀2次;在超凈工作臺(tái)上風(fēng)干DNA,溶于20 μL去離子水中。
1.3 PCR擴(kuò)增
利用細(xì)菌核糖體16S rDNA通用引物27F/1492R[5]進(jìn)行PCR反應(yīng),其反應(yīng)體系20 μL,包括10×PCR Buffer 2.0 μL、dNTP mix 1.6 μL、25 μmol/mL引物27F/1492R各0.4 μL、Taq DNA 聚合酶 1 U、模板DNA 1 μL,去離子水補(bǔ)足至 20 μL。PCR 反應(yīng)條件為:94 ℃ 4 min;94 ℃ 30 s,52 ℃30 s,72 ℃ 1.5 min,30 次循環(huán);72 ℃ 7 min;4 ℃保溫。
1.4 回收及測序
利用瓊脂糖凝膠回收試劑盒對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收純化,將純化產(chǎn)物送至大連寶生物公司進(jìn)行測序。利用BLAST工具在GenBank中對(duì)獲得的序列進(jìn)行分析[6]。經(jīng)過NCBI比對(duì)后下載相關(guān)菌株的細(xì)菌核糖體16S rDNA序列,所得序列用Clustal X 1.81程序進(jìn)行多序列比對(duì),并經(jīng)手工校正;然后用軟件MEGA 3.1構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
2 結(jié)果與分析
利用PVK平板,從大豆根際土壤中篩選出8株解磷菌,并將這8株解磷菌接種在固體LB培養(yǎng)基上,37 ℃恒溫培養(yǎng)條件下菌株的溶磷圈均較大,菌落邊緣呈規(guī)則的圓形,表面光滑,中心突起,分別編號(hào)為北安Ⅰ、北安Ⅱ、北安Ⅲ、北安Ⅳ、海倫Ⅰ、海倫Ⅱ、海倫Ⅲ、海倫Ⅳ(部分菌株菌落形態(tài)見圖1至圖4)。由于培養(yǎng)基中加入了溴酚藍(lán),菌落吸附了染料呈藍(lán)色,但一些菌株具有降解溴酚藍(lán)的能力,如菌株海倫Ⅱ號(hào)(圖4),藍(lán)色較淡。
革蘭氏染色結(jié)果顯示,海倫Ⅲ號(hào)為革蘭氏陰性菌,其余均為革蘭氏陽性菌。在光學(xué)顯微鏡下可有效觀察到菌株的形態(tài)(部分菌株形態(tài)見圖5至圖10),其中北安Ⅰ號(hào)為鏈球菌,海倫Ⅱ號(hào)、海倫Ⅲ號(hào)為球菌,海倫Ⅳ號(hào)、北安Ⅲ號(hào)為桿菌。
3 結(jié)論
利用PVK平板對(duì)解磷菌進(jìn)行分離是一種簡單有效的手段[7],一些菌株(如芽孢桿菌屬)在其生長過程中可產(chǎn)酸,將培養(yǎng)基中的磷酸鈣溶解產(chǎn)生溶磷圈,通過分析溶磷圈的大小可對(duì)微生物的溶磷能力進(jìn)行初步估測。本研究中的菌株皆產(chǎn)生了較大的溶磷圈,說明它們可能具有較強(qiáng)的溶磷潛力。本研究獲得的解磷菌既有球菌,又有桿菌,但已有研究中分離及初步應(yīng)用的解磷菌主要是桿菌,因而本研究重點(diǎn)選擇了一種桿菌——北安Ⅲ號(hào)進(jìn)行細(xì)菌核糖體16S rDNA序列鑒定。結(jié)合形態(tài)學(xué)特點(diǎn)及細(xì)菌核糖體16S rDNA序列,確定該菌為巨大芽孢桿菌。該菌是土壤中的重要菌群,對(duì)農(nóng)作物無害,且可能具有一些有益生物學(xué)作用,因而該菌株是一種重要的微生物資源,可進(jìn)一步開發(fā)為生物磷肥。
參考文獻(xiàn):
[1]李曉婷. 解磷細(xì)菌K3的GFP標(biāo)記與在土壤中定殖及對(duì)玉米生長效應(yīng)研究[D]. 南京:南京農(nóng)業(yè)大學(xué),2009:1-5.
[2]Gyaneshwar P,Naresh K G,Parekh L J,et al. Role of soil microorganisms in improving P nutrition of plants[J]. Plant and Soil,2002,245:83-93.
[3]Rodríguez H,F(xiàn)raga R. Phosphate solubilizing bacteria and their role in plant growth promotion[J]. Biotechnology Advances,1999,17:319-339.
[4]萬翠番,章昭琳,王報(bào)貴,等. 高黏附力雙歧桿菌的篩選與鑒定[J]. 中國乳品工業(yè),2012(5):13-15.
[5]Moreno C,Romero J,Romilio T E. Polymorphism in repeated 16S rRNA genes is a common property of type strains and environmental isolates of the genus Vibrio[J]. Microbiology,2002,148:1233-1239.
[6]Altschul S F,Madden TL,Chffer A A,et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST:a new generation of protein database search programs[J]. Nucleic Acids Res,1997,25(17):3389-3402.
[7]Kucey R M N,Janzen H H,Legett M E. Microbially mediated increases in plant available phosphorus[J]. Advances in Agronomy,1989,42:199-228.endprint
摘要:利用PVK平板,從大豆根際土壤中分離出8株解磷菌。培養(yǎng)分析結(jié)果顯示,這8株解磷菌的溶磷圈均較大。其中,海倫Ⅲ號(hào)為革蘭氏陰性菌,其余均為革蘭氏陽性菌。形態(tài)學(xué)觀察結(jié)果顯示,北安Ⅰ號(hào)為鏈球菌,海倫Ⅱ號(hào)、海倫Ⅲ號(hào)為球菌,海倫Ⅳ號(hào)、北安Ⅲ號(hào)為桿菌?;诩?xì)菌核糖體16S rDNA序列對(duì)北安Ⅲ號(hào)菌株進(jìn)行鑒定,結(jié)合形態(tài)特征確認(rèn)該菌株為巨大芽孢桿菌,經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)該菌株是一種重要的微生物資源,可進(jìn)一步開發(fā)為生物磷肥。
關(guān)鍵詞:解磷菌;溶磷圈;16S rDNA;大豆;生物磷肥
中圖分類號(hào):S154.3 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
文章編號(hào):1002-1302(2014)08-0363-03
土壤中存在一些特定的微生物,能夠?qū)⒅参镫y以吸收利用的磷轉(zhuǎn)化為可吸收利用的形態(tài),這些微生物被稱為解磷菌,以細(xì)菌為主[1]。將解磷菌作為肥料施入土壤,通過其生長代謝可以在作物根際形成一個(gè)磷供應(yīng)較充分的微區(qū),從而改善作物磷元素的供應(yīng),增加作物磷素吸收量,提高作物產(chǎn)量,同時(shí)還可以增進(jìn)土壤肥力、增強(qiáng)植物抗病和抗旱能力[2]。因此,解磷菌的篩選及鑒定是當(dāng)前微生物學(xué)研究的熱點(diǎn)。土壤中解磷微生物種類豐富、數(shù)量較多[2],目前報(bào)道的具有解磷作用的細(xì)菌有芽孢桿菌屬(Bacillus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、土壤桿菌屬(Agrobacterium)、固氮菌屬(Azotobacte)、根瘤菌屬(Bradxrkizobium)、硫桿菌屬(Thiobacillus)、腸細(xì)菌屬(Enterbacter)、微球菌屬(Microeoccus)、沙門氏菌屬(Salmonella)、色桿菌屬(Clromobacterium)、產(chǎn)堿菌屬(Alcaligenes)、節(jié)細(xì)菌屬(Arthrobacte)、大腸桿菌屬(Escherichia)等[3]。解磷微生物在我國應(yīng)用較早,有較好的應(yīng)用前景,但發(fā)展不快,應(yīng)用還不普遍。篩選高效微生物肥料菌株手段單一、菌種種類少是影響微生物肥料發(fā)展的重要因素,因而有必要對(duì)土壤中的解磷菌進(jìn)行大規(guī)模篩選,并進(jìn)行系統(tǒng)鑒定,豐富菌種資源,但土壤中的細(xì)菌種類極為豐富,通過常規(guī)的形態(tài)學(xué)和生理生化方法難以進(jìn)行有效的鑒定。筆者所在的實(shí)驗(yàn)室在前期研究中獲得了8株解磷菌,本研究對(duì)這些分離到的解磷菌進(jìn)行了形態(tài)觀察及分子鑒定,為豐富解磷微生物菌種資源打下基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 染色及顯微觀察
利用革蘭氏染色法[4]對(duì)篩選到的高效解磷菌進(jìn)行染色,將菌液涂布于載玻片上,干燥,固定,結(jié)晶紫初染1 min,水洗至無色;碘液媒染1 min,水洗至無色;95%乙醇脫色30 s,水洗至無色;最后沙黃復(fù)染1 min,水洗至無色,干燥,鏡檢。
1.2 細(xì)菌總DNA的提取
接種菌株置于LB液體培養(yǎng)基中,于130 r/min下振蕩,37 ℃過夜培養(yǎng)。取1.5 mL新鮮菌液于EP管中,于 4 000 r/min 下離心30 s,棄上清,收集菌體;加100 μg/mL 溶菌酶50 μL,于37 ℃下處理1 h輔助裂解;加入預(yù)熱的CTAB溶液500 μL,充分混合,于65 ℃水浴30 min,混勻;冷卻后,加入等體積的三氯甲烷/異戊醇(24 ∶1)抽提,顛倒充分混合,10 000 r/min離心10 min;取上清液,加入等體積三氯甲烷/異戊醇(24 ∶1),輕輕顛倒混勻,10 000 r/min離心5 min;取上清,加入2倍體積的無水乙醇,沉淀30 min,8 000 r/min離心10 min;棄上清,用70%乙醇洗滌沉淀2次;在超凈工作臺(tái)上風(fēng)干DNA,溶于20 μL去離子水中。
1.3 PCR擴(kuò)增
利用細(xì)菌核糖體16S rDNA通用引物27F/1492R[5]進(jìn)行PCR反應(yīng),其反應(yīng)體系20 μL,包括10×PCR Buffer 2.0 μL、dNTP mix 1.6 μL、25 μmol/mL引物27F/1492R各0.4 μL、Taq DNA 聚合酶 1 U、模板DNA 1 μL,去離子水補(bǔ)足至 20 μL。PCR 反應(yīng)條件為:94 ℃ 4 min;94 ℃ 30 s,52 ℃30 s,72 ℃ 1.5 min,30 次循環(huán);72 ℃ 7 min;4 ℃保溫。
1.4 回收及測序
利用瓊脂糖凝膠回收試劑盒對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收純化,將純化產(chǎn)物送至大連寶生物公司進(jìn)行測序。利用BLAST工具在GenBank中對(duì)獲得的序列進(jìn)行分析[6]。經(jīng)過NCBI比對(duì)后下載相關(guān)菌株的細(xì)菌核糖體16S rDNA序列,所得序列用Clustal X 1.81程序進(jìn)行多序列比對(duì),并經(jīng)手工校正;然后用軟件MEGA 3.1構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
2 結(jié)果與分析
利用PVK平板,從大豆根際土壤中篩選出8株解磷菌,并將這8株解磷菌接種在固體LB培養(yǎng)基上,37 ℃恒溫培養(yǎng)條件下菌株的溶磷圈均較大,菌落邊緣呈規(guī)則的圓形,表面光滑,中心突起,分別編號(hào)為北安Ⅰ、北安Ⅱ、北安Ⅲ、北安Ⅳ、海倫Ⅰ、海倫Ⅱ、海倫Ⅲ、海倫Ⅳ(部分菌株菌落形態(tài)見圖1至圖4)。由于培養(yǎng)基中加入了溴酚藍(lán),菌落吸附了染料呈藍(lán)色,但一些菌株具有降解溴酚藍(lán)的能力,如菌株海倫Ⅱ號(hào)(圖4),藍(lán)色較淡。
革蘭氏染色結(jié)果顯示,海倫Ⅲ號(hào)為革蘭氏陰性菌,其余均為革蘭氏陽性菌。在光學(xué)顯微鏡下可有效觀察到菌株的形態(tài)(部分菌株形態(tài)見圖5至圖10),其中北安Ⅰ號(hào)為鏈球菌,海倫Ⅱ號(hào)、海倫Ⅲ號(hào)為球菌,海倫Ⅳ號(hào)、北安Ⅲ號(hào)為桿菌。
3 結(jié)論
利用PVK平板對(duì)解磷菌進(jìn)行分離是一種簡單有效的手段[7],一些菌株(如芽孢桿菌屬)在其生長過程中可產(chǎn)酸,將培養(yǎng)基中的磷酸鈣溶解產(chǎn)生溶磷圈,通過分析溶磷圈的大小可對(duì)微生物的溶磷能力進(jìn)行初步估測。本研究中的菌株皆產(chǎn)生了較大的溶磷圈,說明它們可能具有較強(qiáng)的溶磷潛力。本研究獲得的解磷菌既有球菌,又有桿菌,但已有研究中分離及初步應(yīng)用的解磷菌主要是桿菌,因而本研究重點(diǎn)選擇了一種桿菌——北安Ⅲ號(hào)進(jìn)行細(xì)菌核糖體16S rDNA序列鑒定。結(jié)合形態(tài)學(xué)特點(diǎn)及細(xì)菌核糖體16S rDNA序列,確定該菌為巨大芽孢桿菌。該菌是土壤中的重要菌群,對(duì)農(nóng)作物無害,且可能具有一些有益生物學(xué)作用,因而該菌株是一種重要的微生物資源,可進(jìn)一步開發(fā)為生物磷肥。
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