尤冬梅
天津市薊縣人民醫(yī)院檢驗(yàn)科 301900
循環(huán)微小RNA的研究進(jìn)展
尤冬梅
天津市薊縣人民醫(yī)院檢驗(yàn)科301900
摘要微小RNA(microRNA,miR)在體液中可穩(wěn)定存在,其表達(dá)譜和表達(dá)量的變化與腫瘤、心腦血管疾病、免疫性疾病等多種疾病相關(guān),可以作為疾病診斷、病理分型、預(yù)后判斷以及個(gè)體化治療的生物標(biāo)志分子。miR的檢測(cè)手段和檢驗(yàn)流程還需要標(biāo)準(zhǔn)化,以保證檢測(cè)結(jié)果的重復(fù)性,達(dá)到較好的檢驗(yàn)靈敏度、特異度和重復(fù)性。已有部分miR表達(dá)譜被證實(shí)可以作為各種惡性疾病診斷和預(yù)后評(píng)估的生物標(biāo)志物,有望應(yīng)用于常規(guī)臨床疾病診斷。
關(guān)鍵詞微小RNA
microRNAs(miRNAs)是一類非編碼的內(nèi)源性小RNA,在細(xì)胞生長(zhǎng)發(fā)育、分化、凋亡過程中發(fā)揮重要的作用。研究發(fā)現(xiàn)miRNAs可從細(xì)胞內(nèi)釋放,廣泛而穩(wěn)定地存在于細(xì)胞外液,統(tǒng)稱為循環(huán)miRNAs。miR自身表達(dá)具有高度保守性、時(shí)序性和組織特異性。研究表明,miR幾乎參與了所有生命活動(dòng),包括細(xì)胞發(fā)育、造血、脂肪代謝、器官生成、凋亡和細(xì)胞增殖。miR既可作為抑癌基因下調(diào)原癌基因活性也可作為癌基因下調(diào)抑癌基因活性,還可調(diào)節(jié)腫瘤相關(guān)基因的表達(dá),其自身突變、缺失、易位及相互調(diào)控異常等還可導(dǎo)致相關(guān)基因異常表達(dá)[1]。自被發(fā)現(xiàn)以來,miR一直是近20年,尤其是近5年來生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)界的明星分子[2]。本文對(duì)miR的特點(diǎn)及作為疾病診斷標(biāo)志物的研究應(yīng)用現(xiàn)狀綜述如下。
1miR的特點(diǎn)與功能
miR具有調(diào)控細(xì)胞周期、分化細(xì)胞等基本功能,并參與多種疾病的發(fā)生和發(fā)展[3]。計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)表明,超過60%的人類蛋白編碼基因至少受1個(gè)miR的調(diào)控[4]。miR與靶mRNA序列完全或幾乎完全配對(duì)時(shí),引起靶mRNA降解;而不完全配對(duì)時(shí),則抑制靶基因翻譯[5]。除了上述作用模式,后續(xù)研究表明,miR也可以和靶mRNA的任何互補(bǔ)序列結(jié)合,并發(fā)揮其調(diào)控作用。除了抑制靶mRNA的功能,miR也能作用于啟動(dòng)子誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄激活,甚至隨著細(xì)胞周期的改變,miR的功能可以在抑制轉(zhuǎn)錄和激活轉(zhuǎn)錄間進(jìn)行切換[6]。miR表達(dá)(譜)發(fā)生改變通常與各種疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。miR不同的表達(dá)譜,甚至是單個(gè)miR的改變都可能成為輔助疾病早期診斷、分類、預(yù)后和預(yù)測(cè)的指標(biāo)。盡管目前報(bào)道的miR大部分源自于細(xì)胞內(nèi)的研究,研究者們?cè)诟鞣N體液中也發(fā)現(xiàn)越來越多的細(xì)胞外miR[7]。研究證實(shí)血清和血漿miR穩(wěn)定性較高,在4℃保存、室溫保存、反復(fù)凍融、長(zhǎng)期存儲(chǔ),甚至是煮沸或酸堿處理情況下都可以保持穩(wěn)定[8]。目前認(rèn)為體液中miR常與蛋白質(zhì)等構(gòu)成復(fù)合物存在,因此具有良好的抗RNA酶降解能力,能穩(wěn)定地發(fā)揮生物學(xué)作用[9]。miR可在血清和血漿等體液中穩(wěn)定存在,使得篩選循環(huán)miR作為疾病的新一代無創(chuàng)性實(shí)驗(yàn)室診斷標(biāo)志物成為可能。
2篩選具有疾病診斷價(jià)值的miR的主要方法
由于miR在病理組織中常發(fā)生差異表達(dá),并在疾病的發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮一定的作用。因此,發(fā)現(xiàn)表達(dá)失調(diào)的miR是提出新的疾病診斷標(biāo)志物的主要思路。目前高通量篩選差異表達(dá)miR的方法主要為miR芯片(miRNA microarray)和MPSS(Massive parallel signature sequencing)兩種,兩者各有優(yōu)勢(shì)。miR芯片主要針對(duì)已知序列的miR基因進(jìn)行表達(dá)檢測(cè),其可以較為敏感、精確地檢測(cè)已知miR的表達(dá)差異。MPSS主要用于miR組的主要成分以及其中富集表達(dá)的miR,及其在不同組織中的表達(dá)差異。通過檢測(cè)患者體液標(biāo)本中miR亦可實(shí)現(xiàn)疾病診斷的目的,而發(fā)現(xiàn)體液標(biāo)本中的miR通常只能通過MPSS檢測(cè)以獲得其序列以及拷貝數(shù),隨后通過定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)等低通量方法加以驗(yàn)證,這是目前發(fā)現(xiàn)體液中的miR以及明確其作為疾病診斷分子靶標(biāo)價(jià)值的主要思路和技術(shù)手段。
3循環(huán)miR在疾病診治中的臨床應(yīng)用
miR在疾病的發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮了重要作用,可以作為疾病診斷、病理分型、預(yù)后判斷以及個(gè)體化治療的生物標(biāo)志分子,也是多種疾病基因治療的潛在靶點(diǎn)[10]。miR還可用于多種腫瘤預(yù)后的判斷以及藥物治療、放療和化療效果的預(yù)測(cè)[11]。
3.1腫瘤miR作為腫瘤標(biāo)志物用于臨床疾病的無創(chuàng)診斷預(yù)警在國(guó)內(nèi)外均備受關(guān)注。許多人類miR定位于基因組腫瘤相關(guān)區(qū)域或脆性位點(diǎn),控制著細(xì)胞增殖、黏附、凋亡、血管形成等重要生物進(jìn)程。研究表明,多種腫瘤患者體內(nèi)均存在循環(huán)miR的異常變化,特異性循環(huán)miR表達(dá)變化可以提供多種疾病相關(guān)信息。如:早期診斷惡性腫瘤;區(qū)別原發(fā)瘤和轉(zhuǎn)移瘤,輔助選擇合適治療方案[12];用于腫瘤的病理分期;用于腫瘤病理分型(miR-205)在鱗癌中高表達(dá),在輔助非小細(xì)胞肺癌的鱗癌和腺癌分型中具有很高的敏感度、特異性和重復(fù)性[13]。李雪峰等建立了一種SYBR Green I熒光定量PCR檢測(cè)血清miR-21的方法,探討其對(duì)乳腺癌診斷的應(yīng)用價(jià)值[14],為開展腫瘤血清中miR-21診斷與預(yù)后研究提供了技術(shù)平臺(tái)。理想的循環(huán)miR標(biāo)志物在腫瘤患者外周血中呈中等或高水平表達(dá),在健康人血漿中檢測(cè)不到或低水平存在[15]。
3.2心腦血管疾病miR參與多種心血管系統(tǒng)早期病理改變,缺血性心肌病、擴(kuò)張性心肌病、心力衰竭以及主動(dòng)脈狹窄患者中均存在miR的差異表達(dá)。AMI急性期有多種心臟特異性miR表達(dá)異常,其中檢測(cè)miR-208a在血漿中升高的敏感度與心肌肌鈣蛋白I(cTnI)相當(dāng),而miR-1的血漿水平與AMI的嚴(yán)重程度以及致死性心律失常密切相關(guān),是反映疾病進(jìn)展和治療效果的新的血液標(biāo)志物。血漿miR-423-5p是慢性充血性心力衰竭患者較好的預(yù)測(cè)指標(biāo)[16]。
3.3免疫性疾病miR與機(jī)體的免疫功能存在著重要的聯(lián)系,miR通過影響免疫細(xì)胞的發(fā)育、細(xì)胞亞群的分化及功能,參與機(jī)體固有免疫與獲得性免疫活動(dòng),在免疫系統(tǒng)中發(fā)揮著重要調(diào)控作用,并與自身免疫性疾病的病理、生理密切相關(guān)。近年來研究人員在許多自身免疫性疾病中都找到異常表達(dá)的miR。Keller等[17]先研究miR在MS中的診斷效能,發(fā)現(xiàn)單個(gè)miR-145在所有異常表達(dá)的miR中具有最好的效能。多發(fā)性硬化癥患者PBMC中miR-18b、miR-599表達(dá)異常改變可能與疾病復(fù)發(fā)密切相關(guān),而miR-96則可能在疾病緩解中發(fā)揮功能作用[18],循環(huán)miR是對(duì)自身免疫性疾病診斷、預(yù)后判斷、疾病活動(dòng)度和嚴(yán)重程度評(píng)估都很有希望的非侵襲性候選標(biāo)志物。
3.4其他疾病miR是代謝活躍組織發(fā)育和維持的重要調(diào)節(jié)因子,miR的表達(dá)改變將導(dǎo)致糖和脂質(zhì)代謝穩(wěn)態(tài)受損。多個(gè)不同研究均發(fā)現(xiàn)妊娠婦女血漿中存在特異的miR,提示miR可能作為妊娠周期以及妊娠相關(guān)疾病的診斷標(biāo)志物。miR-526、miR-527能夠準(zhǔn)確診斷妊娠。血漿miR-122表達(dá)升高對(duì)于病毒、酒精以及化學(xué)物質(zhì)引起的肝損傷診斷價(jià)值較高,具有很好的敏感度和特異度。張霞等建立了SYBR Green I FQ-PCR檢測(cè)人外周血單個(gè)核細(xì)胞中miR-202表達(dá)的方法,發(fā)現(xiàn)miR-202在多發(fā)性骨髓瘤(MM)患者中表達(dá)普遍上調(diào),與健康對(duì)照組相比差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,說明miR-202與MM的發(fā)生和發(fā)展關(guān)系密切。
4miR的檢測(cè)方法及影響因素
循環(huán)miR的檢測(cè)方法主要包括:RNA印記分析法(Northern blot)、芯片方法、熒光定量PCR、液相單分子檢測(cè)、高通量測(cè)序、電化學(xué)檢測(cè)、生物發(fā)光檢測(cè)等。每種方法都不是很完美,都存在一定的內(nèi)缺陷,需要根據(jù)特定的實(shí)驗(yàn)環(huán)境選擇最合適的檢測(cè)方法?,F(xiàn)有的大量研究結(jié)果采用了多種不同的研究平臺(tái)和定量方法。近期,國(guó)內(nèi)多個(gè)實(shí)驗(yàn)室在這方面進(jìn)行了有效的探索,加快了循環(huán)miR檢測(cè)走向臨床的步伐。陳必成等建立了改良通用莖環(huán)引物法結(jié)合熒光定量PCR對(duì)miR進(jìn)行篩選和定量檢測(cè)技術(shù)。與傳統(tǒng)莖環(huán)引物RT-PCR檢測(cè)相比,該方法快速、穩(wěn)定、靈敏、省時(shí)、經(jīng)濟(jì),提高了miR的篩選效率。
近年來,已有很多研究證明miR在多種疾病的發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮著重要作用,因此,通過檢測(cè)miR的表達(dá)進(jìn)而實(shí)現(xiàn)疾病的診斷、病理分型和預(yù)后判斷,以及作為疾病基因治療的潛在靶點(diǎn),將展示出廣闊的臨床應(yīng)用前景。miR可能成為疾病診斷新的生物學(xué)標(biāo)志,還可能使其成為藥靶,或是模擬這一分子進(jìn)行新藥開發(fā),這將可能給人類疾病的治療提供一種新手段。相信隨著研究的不斷深入,miR檢測(cè)和研究將會(huì)為疾病診斷及預(yù)后判斷帶來新的發(fā)展。
參考文獻(xiàn)
[1]焦志軍.循環(huán)microRNA:潛在的疾病診斷生物標(biāo)志物〔J〕.臨床檢驗(yàn)雜志,2012,30(10):850-856.
[2]唐古生,沈茜. 臨床實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)循環(huán)微小RNA中應(yīng)關(guān)注的問題〔J〕.中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2011,34(10):865-870.
[3]秦保東,梁艷,楊再興,等.微小RNA在免疫系統(tǒng)中作用機(jī)制的研究進(jìn)展〔J〕.中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2011,34(10):953-956.
[4] Friendman RC, Farh KK,Burge CB,etal.Most mammalian mRNAs are conserved targets of microRNAs〔J〕.Genome Res,2009,19(1):92-105.
[5]Fabian MR, Sonenberg N, Filipowicz W. Regulation of mRNA translation and stability by microRANs〔J〕.Annu Rev Biochem,2010, 79:351-379.
[6] de Planell-Saguer M,Rodicio MC. Analytical aspects of microRNA in diagnostics:a review〔J〕.Anal Chim Acta,2011,699(2):134-152.
[7]Etheridge A,Lee I, Hood L,etal.Extracellular microRNA: a new source of biomarkers〔J〕.Mutat Res,2011,717(1-2).
[8]Reid G, Kirschner MB, van Zandwijk N. Circulating microRNAs: association with disease and potential use as biomarkers〔J〕.Crit Rev Oncol Hamatol,2010,80(2):193-208.
[9]陳旭,史菊,蔣敏,等.miRNA定量檢測(cè)中內(nèi)參基因的選擇〔J〕.國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2012,33(11):1338-1340.
[10]周燁,向俊宇,侯晉,等. 微小RNA作為疾病標(biāo)志物的研究進(jìn)展〔J〕.中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2011,34(2):871-876.
[11] Hummel R,Hussey DJ,Haier J. MicroRNAs:predictors and modifiers of chemo-and radiotherapy in different tumour types〔J〕.Eur J Cancer,2010,46(2):298-311.
[12]Barshack I,Lithwick-Yanai G, Afek A,etal. MicroRNA expression differentiates between primary lung tumors and metastases to the lung〔J〕.Pathol Res Pract, 2010, 206(8):578-584.
[13]Bishop JA, Benjamin H, Cholakh H,etal.Accurate classification of non-small cell lung carcinoma using a novel microRNA-based approach〔J〕.Clin Cancer Res,2010,16(2):610-619.
[14]李雪峰,徐建軍,張青云. 熒光定量PCR檢測(cè)血清微小R NA-21方法的建立及對(duì)乳腺癌診斷的初步應(yīng)用〔J〕.中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2011,34(10):920-925.
[15]謝麗,錢曉萍,劉寶瑞.新的腫瘤標(biāo)志物——循環(huán)微小RNA〔J〕.中華腫瘤雜志,2011,33(9):641-642.
[16]Tijsen AJ, Creemers EE, Moerland PD,etal.MiR423-5p as a circulating biomarker for heart failure〔J〕.Circ Res,2010,106(6): 1035-1039.
[17]Keller A,Leidinger P, Lange J,etal.Multiple sclerosis: mircroRNA expression profiles accurately differentiate patients with relapsing-remitting disease from healthy controls〔J〕.PloS ONE, 2009,4: e7440.
[18]Furer V,Greenberg JD,Attur M,etal.The role of microRNA in rheumatoid arthritis and other autoimmune diseases〔J〕.Clin Immunol,2010,136(1): 1-15.
(編輯楊陽)
◎致作者◎
本刊對(duì)文章作者署名的要求
1. 作者署名書寫要正確無誤,不可含糊。前后順序應(yīng)無爭(zhēng)議。
2. 在稿件處理期間,若作者署名需作變動(dòng),應(yīng)由第一作者(對(duì)文章負(fù)全責(zé)的作者)親筆寫信說明(不要打印件), 以便編輯部存檔備查。
3. 文章一旦交付印刷,不再予以變更。
收稿日期2014-11-18
中圖分類號(hào):R446.9
文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
文章編號(hào):1001-7585(2015)13-1722-03