農(nóng)林院校生物信息學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程教學(xué)改革芻議

農(nóng)林院校生物信息學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程教學(xué)改革芻議

鄭珂暉,溫永仙*

(福建農(nóng)林大學(xué)計(jì)算機(jī)與信息學(xué)院,福州 350002)

摘要：生物信息學(xué)是一門交叉學(xué)科，對(duì)于現(xiàn)代生物學(xué)研究具有重要的意義。數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)是生物信息學(xué)的基礎(chǔ)之一。本文對(duì)農(nóng)林院校的生物信息學(xué)專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程的教學(xué)現(xiàn)狀做了一些介紹，對(duì)目前生物信息專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué)存在的問(wèn)題進(jìn)行了分析 。結(jié)合教學(xué)的實(shí)踐，有針對(duì)性的提出了一些教學(xué)改革的具體措施。

關(guān)鍵詞：生物信息學(xué)；數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué);教學(xué)改革

中圖分類號(hào)：TP392;R318.04;H191文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A

收稿日期：2015-01-13;修回日期：2015-03-12.

基金項(xiàng)目：浙江省教育廳科研項(xiàng)目(Y201328526)。

作者簡(jiǎn)介：黃方亮，男,博士，研究方向：細(xì)菌基因組測(cè)序；E-mail:huangfl@zju.edu.cn.

doi:10.3969/j.issn.1672-5565.2015.02.07

Discussion about reform of database teaching of bioinformatics in the university

of agriculture and forestry

ZHENG Kehui,WEN Yongxian*

(ComputerandInformationCollegeFujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou350002,China)

Abstract：Bioinformatics is an interdisciplinary subject which is important and significant for the modern biological research. Database technology is one of the basic content of bioinformatics. In this article, we introduce the situation of teaching bioinformatics database in agriculture and Forestry University, and discuss some problems in teaching database. Combining with the practice in teaching, We put forward some detailed methods of teaching reform.

Keywords：Bioinformatics;Database teaching ; Reform in Education

21世紀(jì)是生物學(xué)的世紀(jì)，傳統(tǒng)的生物學(xué)是以實(shí)驗(yàn)觀察作為基本的研究手段，已經(jīng)不能滿足現(xiàn)代生物學(xué)的需求；利用計(jì)算機(jī)、數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)作為工具對(duì)生物學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析、解讀和挖掘已成為現(xiàn)代生物學(xué)研究不可缺少的手段[1]。自上個(gè)世紀(jì)末生物信息學(xué)作為一門新興交叉學(xué)科出現(xiàn)至今，對(duì)生物學(xué)的研究和發(fā)展起了重要的作用[2]。近些年來(lái)，生物信息學(xué)發(fā)展迅速，產(chǎn)生了許多研究方向，產(chǎn)生了大量的數(shù)據(jù)庫(kù)，如美國(guó)NCBI管理的genebank，歐洲建立的EBI和日本建立的DDBJ等。由此可見(jiàn)，數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)是生物信息學(xué)研究的重要基礎(chǔ)，現(xiàn)代生物學(xué)產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù)只有利用數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)才能進(jìn)行有效的管理，才能挖掘出隱藏在大量數(shù)據(jù)背后的規(guī)律。

1農(nóng)林院校生物信息專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程教學(xué)的現(xiàn)狀分析

一些歐美先進(jìn)國(guó)家生物信息學(xué)研究起步較早，生物信息相關(guān)產(chǎn)業(yè)鏈發(fā)展成熟，人材培養(yǎng)機(jī)制也較完善。我國(guó)生物信息學(xué)的發(fā)展相對(duì)先進(jìn)國(guó)家而言稍晚起步，但是這幾年發(fā)展勢(shì)頭很好，如近年來(lái)在國(guó)際知名刊物上發(fā)表的有關(guān)生物信息的論文數(shù)量和質(zhì)量都有大幅的提升，相關(guān)科研機(jī)構(gòu)陸續(xù)發(fā)布了一些重要的、有影響力的數(shù)據(jù)庫(kù)，如大熊貓基因組、毛竹基因組、小菜蛾基因組數(shù)據(jù)庫(kù)等，而一些企業(yè)如華大公司已經(jīng)成世界上有名的基因組測(cè)序中心。

我國(guó)農(nóng)林產(chǎn)業(yè)在世界上還處在較低的水平，目前，在生物信息學(xué)等新興生物學(xué)方向的推動(dòng)下，農(nóng)林生產(chǎn)將會(huì)發(fā)生翻天覆地的變化，農(nóng)林院校擔(dān)負(fù)著為國(guó)家培養(yǎng)農(nóng)林人才的重任。在當(dāng)前我國(guó)生物信息學(xué)基礎(chǔ)研究和相關(guān)產(chǎn)業(yè)都在高速發(fā)展的新形勢(shì)下，就要求各農(nóng)林院校能培養(yǎng)大量?jī)?yōu)秀的生物信息學(xué)人才，為我國(guó)的農(nóng)林生產(chǎn)和科研作貢獻(xiàn)。

目前，全國(guó)共有22所高校開(kāi)設(shè)了本科生物信息學(xué)專業(yè)，其中農(nóng)林院校有4所[3]；有16所高校開(kāi)設(shè)了生物信息碩士專業(yè)，其中有7所是農(nóng)林院校。各開(kāi)設(shè)生物信息專業(yè)的農(nóng)林院校根據(jù)自身的特點(diǎn)，構(gòu)建了相應(yīng)的課程體系，在各農(nóng)林院校生物信息專業(yè)的課程體系中，可以分成生物學(xué)和信息學(xué)兩大部份，在各學(xué)校的課程體系中，數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)均是主要課程，是一門核心基礎(chǔ)課。

在計(jì)算機(jī)專業(yè)，數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)已經(jīng)是一門較為成熟的課程，已經(jīng)有了大量的好教材、好的教學(xué)方法和教學(xué)理念。由于生物信息學(xué)是一門新興的交叉學(xué)科，在對(duì)該專業(yè)學(xué)生的數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程教學(xué)時(shí)，具有其自身的特點(diǎn)。教學(xué)目標(biāo)、掌握程度等均與計(jì)算機(jī)專業(yè)有所不同。但是目前，我國(guó)農(nóng)林院校生物信息學(xué)專業(yè)中的數(shù)據(jù)庫(kù)課程的教學(xué)組織、教學(xué)方法、教材建設(shè)才剛剛起步，并沒(méi)有太多現(xiàn)成的經(jīng)驗(yàn)可供任課教師借鑒。

在實(shí)際教學(xué)過(guò)程中，生物信息學(xué)專業(yè)的課程中有關(guān)信息科學(xué)的部份課程常常借鑒計(jì)算機(jī)專業(yè)的課程來(lái)設(shè)置，數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程也是這種情況。目前，大多數(shù)農(nóng)林院校的生物信息專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程從教材、教學(xué)手段、教學(xué)理念和教學(xué)素材上借鑒計(jì)算機(jī)專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué)。例如：在福建農(nóng)林大學(xué)，生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程的學(xué)時(shí)設(shè)置為60學(xué)時(shí)，其中理論課40學(xué)時(shí)，上機(jī)實(shí)驗(yàn)20學(xué)時(shí)，就是借鑒了計(jì)算機(jī)專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)課程的學(xué)時(shí)進(jìn)行設(shè)置的，在教材選用、教學(xué)大綱編寫上也和計(jì)算機(jī)專業(yè)相近。

在生物信息學(xué)專業(yè)設(shè)立的初期，數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程的設(shè)置和教學(xué)由于缺少教學(xué)經(jīng)驗(yàn)和教學(xué)材料而不得不借鑒計(jì)算機(jī)專業(yè)。雖然這種課程的組織和教學(xué)也為農(nóng)林院校生物信息學(xué)專業(yè)學(xué)生掌握數(shù)據(jù)庫(kù)基本操作技能、了解數(shù)據(jù)庫(kù)基本原理、運(yùn)用數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)解決實(shí)際問(wèn)題起了積極的作用，但隨著生物信息學(xué)的學(xué)科發(fā)展，也發(fā)現(xiàn)完全借鑒計(jì)算機(jī)專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)課程的教學(xué)模式存在著一些問(wèn)題[4-6]。

(1)教學(xué)過(guò)程中強(qiáng)調(diào)理論知識(shí)過(guò)多，數(shù)據(jù)庫(kù)在生物信息學(xué)的具體應(yīng)用介紹較少

因?yàn)橛?jì)算機(jī)專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)課程對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)的基本原理和理論知識(shí)介紹的較多，這和計(jì)算機(jī)專業(yè)的教學(xué)要求是相符的。而生物信息學(xué)專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)知識(shí)更多的應(yīng)該是體現(xiàn)在“如何用，如何用好”上，而不能過(guò)多強(qiáng)調(diào)數(shù)據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)理論和基本原理[7]。在教學(xué)實(shí)踐過(guò)程中，筆者發(fā)現(xiàn)，在學(xué)過(guò)一學(xué)期的數(shù)據(jù)庫(kù)課程以后，有些同學(xué)對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)的基本概念雖有所了解，但是卻不會(huì)具體的應(yīng)用，例如：筆者曾讓同學(xué)們?cè)贜CBI網(wǎng)站上用綜合檢索的方法查找一些信息，大多數(shù)同學(xué)完成不了，更不用說(shuō)一些生物信息學(xué)中常用的數(shù)據(jù)庫(kù)的查找、下載和本地化建庫(kù)等。這樣，就對(duì)學(xué)生后續(xù)的課程和科研、實(shí)驗(yàn)造成了一定的影響，如筆者就曾遇到其它課程的老師反映他們?cè)诤罄m(xù)課程還要給學(xué)生補(bǔ)上生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)具體使用的知識(shí)。

(2)對(duì)現(xiàn)有的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)介紹相對(duì)簡(jiǎn)單，教材上的內(nèi)容相對(duì)滯后

由于生物信息學(xué)正處于高速發(fā)展期，生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)和更新速度都很快，而教材的編寫和出版周期相對(duì)較長(zhǎng)[8]。所以，實(shí)際教學(xué)中發(fā)現(xiàn)：學(xué)生經(jīng)常反映按教材上介紹的步驟進(jìn)行操作，卻難得要領(lǐng)，甚至有的教材上介紹的數(shù)據(jù)庫(kù)在實(shí)際中已經(jīng)較少應(yīng)用或是更換了網(wǎng)址、整合到其它的數(shù)據(jù)庫(kù)之中。這時(shí)，學(xué)生就會(huì)認(rèn)為老師的教學(xué)內(nèi)容過(guò)于陳舊，不能反應(yīng)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)展的現(xiàn)狀，覺(jué)得學(xué)了沒(méi)意義，從而失去了學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)的興趣。

(3)實(shí)踐環(huán)節(jié)相對(duì)薄弱，難以較好的解決生物信息學(xué)研究的實(shí)際問(wèn)題

現(xiàn)有的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程多采用課堂教學(xué)配以少量的上機(jī)練習(xí)，上機(jī)練習(xí)也多以計(jì)算機(jī)專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)上機(jī)練習(xí)內(nèi)容為主，主要是：SQL語(yǔ)言的操作、查詢和完整性約束等，和生物信息學(xué)的實(shí)踐要求差距較大，學(xué)生在學(xué)習(xí)過(guò)程中常常感到所學(xué)所用有所脫節(jié)，實(shí)驗(yàn)課程學(xué)習(xí)的內(nèi)容不鮮活，較少反應(yīng)出生物信息學(xué)課程的特色，距離生物信息學(xué)研究的實(shí)際問(wèn)題太遠(yuǎn)，不能解決這些實(shí)際問(wèn)題。

(4)教學(xué)課程對(duì)學(xué)科發(fā)展的前沿介紹較少，難以捕捉最新的研究進(jìn)展

生物信息學(xué)的研究發(fā)展很快，可以說(shuō)是日新月異，但是在進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué)時(shí)，難以對(duì)生物信息學(xué)研究中出現(xiàn)的新數(shù)據(jù)庫(kù)和一些新的使用數(shù)據(jù)庫(kù)的工具軟件，使用方法介紹較少，難以讓學(xué)生了解到學(xué)科發(fā)展的最新動(dòng)態(tài)，從而使學(xué)生感覺(jué)到學(xué)習(xí)的內(nèi)容不能緊跟生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)展的實(shí)際，很多教學(xué)內(nèi)容都是些過(guò)時(shí)或即將過(guò)時(shí)的內(nèi)容。

(5)教學(xué)手段較為單一，難以引發(fā)學(xué)生的興趣

數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)理論教學(xué)目前在各農(nóng)林高校中一般均是采用計(jì)算機(jī)專業(yè)的上課模式，由主講教師在課堂上利用課件或黑板進(jìn)行理論基礎(chǔ)的介紹，在實(shí)驗(yàn)室上機(jī)掌握一些基本的操作。這種教學(xué)手段較為單一，不能很好的激發(fā)學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣。學(xué)生反應(yīng)較為枯燥。

2農(nóng)林院校生物信息學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程教學(xué)改革的思路和具體措施

筆者在參考了國(guó)內(nèi)兄弟院校生物信息學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué)的有益經(jīng)驗(yàn)并在網(wǎng)上查找國(guó)外有關(guān)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué)的相關(guān)資料結(jié)合自身的教學(xué)實(shí)踐，在經(jīng)歷了幾輪的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程教學(xué)后，提出在農(nóng)林院校生物信息專業(yè)進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué)改革的思路和幾點(diǎn)具體措施。

2.1農(nóng)林院校生物信息專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)課程教學(xué)改革的思路

隨著社會(huì)的進(jìn)步，教育理念也在不斷發(fā)展：從傳統(tǒng)的傳授學(xué)生知識(shí)發(fā)展成培養(yǎng)學(xué)生能力、從傳統(tǒng)的填鴨式教學(xué)轉(zhuǎn)變?yōu)楝F(xiàn)在的啟發(fā)式教學(xué)、從重課堂教學(xué)發(fā)展為課堂內(nèi)外并重、從以課程考試為考核轉(zhuǎn)化為綜合能力為考核。

在這種形勢(shì)下，農(nóng)林院校的生物信息學(xué)專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué)改革的方向應(yīng)該是提倡以人為本，重在培養(yǎng)學(xué)生的自主學(xué)習(xí)和解決問(wèn)題的能力。在教學(xué)過(guò)程中，教學(xué)內(nèi)容強(qiáng)調(diào)與時(shí)俱進(jìn)，選擇合適的教學(xué)方法以激發(fā)學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣。課程的考核不應(yīng)再以考試成績(jī)論高低，而應(yīng)該以綜合能力作為考核標(biāo)準(zhǔn)，以解決實(shí)際問(wèn)題作為培養(yǎng)的基本目標(biāo)。

2.2農(nóng)林院校生物信息學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)課程教學(xué)改革的具體措施

在經(jīng)歷了數(shù)輪的生物信息學(xué)專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)課程教學(xué)實(shí)踐，筆者在教材選用、實(shí)踐環(huán)節(jié)、教學(xué)手段、考核模式等方面采取了一些具體的教學(xué)改革措施，經(jīng)過(guò)實(shí)踐證明具有一定的效果。

(1)教材的選用借鑒歐美國(guó)家的先進(jìn)經(jīng)驗(yàn)，采用經(jīng)典教材加最新論文的模式

因?yàn)樯镄畔W(xué)的發(fā)展十分迅速，所以在進(jìn)行教材選擇上，采用經(jīng)典的教材來(lái)講授原理，而有選擇性的選取一些最新的研究性論文或綜述來(lái)使學(xué)生們即能知道某些基本概念的準(zhǔn)確定義，又能了解學(xué)科發(fā)展的現(xiàn)狀[9]。在具體實(shí)踐中，經(jīng)典教材選用歐美的有關(guān)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)的經(jīng)典教材，如《Bioinformatics Databases: Design, Implementation, and Usage》，而論文一般選擇Nucleic Acid Research雜志每年的第1期中有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)的綜述。此外，鑒于當(dāng)前慕課(MOOC)在當(dāng)前發(fā)展迅速，網(wǎng)上有許多世界名校的公開(kāi)課，在教學(xué)過(guò)程中鼓勵(lì)學(xué)生多去網(wǎng)上看些與本課程有關(guān)的公開(kāi)課視頻，并在課堂上進(jìn)行討論[10]。

(2)實(shí)踐環(huán)節(jié)的設(shè)計(jì)要貼近生物信息學(xué)專業(yè)的實(shí)際

實(shí)踐環(huán)節(jié)在生物信息學(xué)專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)課程中很重要。所以，實(shí)踐環(huán)節(jié)的設(shè)計(jì)要貼近生物信息專業(yè)的要求，以培養(yǎng)學(xué)生解決實(shí)際問(wèn)題的能力為主要目標(biāo)[11]。在實(shí)踐內(nèi)容的設(shè)計(jì)上，一般是根據(jù)生物學(xué)問(wèn)題作為出發(fā)點(diǎn)，以如何解決這些問(wèn)題作為主線。例如：在進(jìn)行基因組研究時(shí)，Blast是一項(xiàng)基本的工作，可以給出一段具體的序列，要求學(xué)生利用Blast工具進(jìn)行基本的比對(duì)分析，并得出正確的結(jié)果。在這個(gè)過(guò)程中，有關(guān)Blast的基本原理所做的介紹相對(duì)較少，重點(diǎn)是在“用”字上下功夫。經(jīng)過(guò)實(shí)踐，發(fā)現(xiàn)同學(xué)們?cè)趯W(xué)的過(guò)程中興趣相對(duì)較高，掌握也較好。在“會(huì)用”的基礎(chǔ)上，在給出一些相對(duì)較難的題目作為課后作業(yè)，讓同學(xué)們嘗試解決，力圖在“會(huì)用”的基礎(chǔ)上實(shí)現(xiàn)“用好”。若有部份同學(xué)對(duì)具體的原理感興趣的，再向他們推薦參考網(wǎng)頁(yè)或文檔，鼓勵(lì)他們的學(xué)習(xí)興趣，有一些學(xué)生在了解理論的原理后，甚至能夠提出一些現(xiàn)有的生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)中的一些不足，會(huì)來(lái)和教師討論解決某一生物信息學(xué)問(wèn)題時(shí)，用什么數(shù)據(jù)庫(kù)好，好在哪；而不用什么數(shù)據(jù)庫(kù)，缺點(diǎn)在哪，教學(xué)效果較好。

(3)在教學(xué)過(guò)程中做到以人為本，合理組織教學(xué)并運(yùn)用多媒體教學(xué)等先進(jìn)的教學(xué)手段

大多數(shù)農(nóng)林院校生源相對(duì)于985、211學(xué)校而言基礎(chǔ)稍弱，不同生源地的學(xué)生的基礎(chǔ)也參差不齊。所以，在教學(xué)的過(guò)程中，要根據(jù)學(xué)生的實(shí)際情況來(lái)進(jìn)行教學(xué)的組織，引導(dǎo)學(xué)生、鼓勵(lì)學(xué)生、服務(wù)學(xué)生，最終使學(xué)生學(xué)有所得，學(xué)有所成。

在課程開(kāi)始前，應(yīng)對(duì)班級(jí)學(xué)生對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)知識(shí)了解的情況有一個(gè)大體的掌握。例如學(xué)生的數(shù)學(xué)基礎(chǔ)如何、計(jì)算機(jī)實(shí)際操作能力如何。了解了這些基本情況以后，在組織教學(xué)時(shí)就可以心中有數(shù)。例如：生物信息專業(yè)的學(xué)生有的計(jì)算機(jī)和數(shù)學(xué)基礎(chǔ)好、有的生物學(xué)基礎(chǔ)好。這時(shí)，可以將不同特長(zhǎng)的同學(xué)編排在一個(gè)小組里。讓這些小組的同學(xué)們?cè)趯W(xué)習(xí)過(guò)程中間，一起討論，互相幫助。任課教師要常和學(xué)生溝通，了解他們?cè)趯W(xué)習(xí)過(guò)程中遇到的問(wèn)題并給他們點(diǎn)撥一下，提出一些解決問(wèn)題的方法或思路。

在教學(xué)手段上可以采用多媒體教學(xué)，對(duì)一些較難理解的抽象概念可以綜合運(yùn)用動(dòng)畫、視頻來(lái)演示，使學(xué)生較好的理解[12-13]。例如：數(shù)據(jù)庫(kù)中的三層模式的概念較為抽象，初讀起來(lái)不好理解，通過(guò)多媒體課件并借用建筑學(xué)中蓋房子的例子對(duì)三層模式進(jìn)行形象化的比喻，使學(xué)生有了一定的感性認(rèn)識(shí)，而后再進(jìn)行系統(tǒng)的理論介紹，學(xué)生學(xué)習(xí)起來(lái)就較容易理解。

另外，在教材中選擇了部份和實(shí)踐較為接近的章節(jié)，不在課堂和實(shí)驗(yàn)室教學(xué)，而是通過(guò)參觀、座談的方式來(lái)進(jìn)行教學(xué)。例如：邀請(qǐng)了電信和醫(yī)藥行業(yè)的企業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)管理人員來(lái)給學(xué)生們介紹大數(shù)據(jù)如何進(jìn)行有效管理；數(shù)據(jù)庫(kù)在醫(yī)藥研發(fā)和管理工作中的應(yīng)用等專項(xiàng)講座，同學(xué)們聽(tīng)了后，回頭再結(jié)合課堂所學(xué)，實(shí)驗(yàn)室所練，可以知道自己學(xué)了什么，是不是懂了，學(xué)的東西能做什么。

(4)考核模式進(jìn)行了一些改革，激發(fā)學(xué)生平時(shí)學(xué)習(xí)的積極性

生物信息學(xué)專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué)過(guò)程中，學(xué)生平時(shí)學(xué)習(xí)積極性不高，總想著在期末通過(guò)突擊復(fù)習(xí)通過(guò)期末考試就行。筆者在教學(xué)過(guò)程中，筆者對(duì)這種情況做了分析，認(rèn)為：平時(shí)學(xué)習(xí)的積極性不高，原因有很多，但是平時(shí)學(xué)習(xí)的情況未能作為考核評(píng)價(jià)的一部份也許是一個(gè)重要的原因。所以，在課程考核的模式上，做了一些變革，將平時(shí)的課堂學(xué)習(xí)、課后作業(yè)，實(shí)驗(yàn)環(huán)節(jié)、課程論文等均作為考核的內(nèi)容，從而提高了學(xué)生學(xué)習(xí)的積極性[14-15]。例如：在學(xué)校的規(guī)章制度范圍內(nèi)，不采取傳統(tǒng)的期末考成績(jī)就是課程最終成績(jī)的作法，將期末成績(jī)的比例降至30%，其它部分為70%，這平時(shí)的70%的分?jǐn)?shù)包含了同學(xué)們?cè)趯?shí)驗(yàn)課上完成的情況的考核、課程小論文的考核和課程內(nèi)的小討論會(huì)的發(fā)言等方面。通過(guò)這樣的評(píng)價(jià)機(jī)制的變更，學(xué)生平時(shí)學(xué)習(xí)的積極性和主動(dòng)性都增加了，例如：同學(xué)們?cè)趯?shí)驗(yàn)課前會(huì)認(rèn)真準(zhǔn)備，課程小論文也積極主動(dòng)的上網(wǎng)找資料，在小討論會(huì)上也積極發(fā)言，形成了比較好的學(xué)習(xí)氛圍，學(xué)習(xí)成績(jī)自然上去了，學(xué)習(xí)效果也好了。

(5)鼓勵(lì)學(xué)生多渠道了解數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)在生物信息學(xué)應(yīng)用的前沿進(jìn)展

因?yàn)樯镄畔W(xué)的數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)和相關(guān)的工具的研發(fā)正處在一個(gè)高速的發(fā)展期，在教學(xué)中，鼓勵(lì)學(xué)生多渠道了解數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)在生物信息學(xué)應(yīng)用的前沿對(duì)于培養(yǎng)學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣、提高學(xué)生解決問(wèn)題的能力大有益處[16]。根據(jù)筆者所在單位的實(shí)際情況，向?qū)W生推薦使用學(xué)校圖書館提供中國(guó)知網(wǎng)、維普和萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)，鼓勵(lì)他們?cè)诶锩嬲乙恍┡c生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)相關(guān)的較新的綜述或研究性文章，以拓展視野、了解前沿，提高學(xué)習(xí)興趣，甚至在教師上課時(shí)，介紹教材上的相關(guān)內(nèi)容時(shí)，學(xué)生還能提示一下老師教材上一些內(nèi)容已經(jīng)有最新的研究進(jìn)展，課堂教學(xué)氣氛也活絡(luò)了，同學(xué)們也了解到了一些新進(jìn)展。

3結(jié)束語(yǔ)

農(nóng)林院校開(kāi)設(shè)生物信息學(xué)專業(yè)的時(shí)間大都在近十年之內(nèi)，教學(xué)的方法和模式仍在不斷的探索和發(fā)展。數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)作為生物信息專業(yè)的核心課程，如何教、如何教得更好、如何讓學(xué)生學(xué)到東西都是教師要考慮和探索的內(nèi)容，在今后的教學(xué)工作中，仍需要進(jìn)一步的探索和提高。

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