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      南美白對(duì)蝦肝胰腺超氧化物歧化酶和酚氧化酶的熒光定量PCR檢測

      2015-10-20 01:16劉莉等
      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年9期
      關(guān)鍵詞:熒光定量PCR南美白對(duì)蝦

      劉莉等

      摘要:試驗(yàn)設(shè)計(jì)了南美白對(duì)蝦超氧岐化酶和酚氧化酶的熒光定量PCR檢測的特異性引物,用于檢測肝胰腺中超氧化物歧化酶(SOD)和酚氧化酶(PO)的表達(dá)。該方法避免了血清學(xué)檢測免疫指標(biāo)的不穩(wěn)定性、測定值波動(dòng)性較大的缺點(diǎn),可作為評(píng)估南美白對(duì)蝦免疫狀態(tài)的一種分子檢測方法。

      關(guān)鍵詞:南美白對(duì)蝦;肝胰腺;SOD;PO;熒光定量PCR

      中圖分類號(hào): S945.4+9文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2015)09-0290-02

      南美白對(duì)蝦屬甲殼類動(dòng)物,其免疫主要為非特異性免疫。包括體液免疫中的一些非特異性的酶或因子來進(jìn)行的[1-2]??寡趸甘菬o脊椎動(dòng)物機(jī)體非特異性免疫的一個(gè)重要方面,其中SOD是一種能夠催化超氧化物通過歧化反應(yīng)轉(zhuǎn)化為O2和H2O2的酶。超氧化物歧化酶(SOD)是抗氧化系統(tǒng)中起關(guān)鍵作用的酶,不僅具有清除體內(nèi)自由基的作用,而且在機(jī)體免疫調(diào)節(jié)中具有重要的作用[3-4]。酚氧化酶(PO)是一種含銅的氧化還原酶,能夠催化單酚羥化成二酚,再把二酚氧化成醌,醌在非酶促條件下形成反應(yīng)終產(chǎn)物黑色素。其反應(yīng)鏈的短暫中間產(chǎn)物擁有很高的生物毒性,能夠抑制病原體胞外蛋白酶以及幾丁質(zhì)酶的活性,屬于一種酶級(jí)聯(lián)反應(yīng)系統(tǒng),在南美白對(duì)蝦抵抗病原菌侵襲過程中具有重要作用[5-9]。

      目前檢測南美白對(duì)蝦免疫活性因子通常是通過采集血清,采用生化反應(yīng)方法檢測免疫相關(guān)酶。由于采集過程及檢測過程,酶活性極易受外界環(huán)境的影響,常導(dǎo)致檢測結(jié)果波動(dòng)性很大,檢測的可靠性受影響。酶的產(chǎn)生是通過基因的轉(zhuǎn)錄、翻譯及后加工形成的,其轉(zhuǎn)錄水平也可反映機(jī)體的免疫狀態(tài)。蝦肝胰腺是其血細(xì)胞產(chǎn)生的主要場所,肝胰腺組織免疫因子的轉(zhuǎn)錄表達(dá)也可作為評(píng)價(jià)機(jī)體免疫能力的指標(biāo)之一。熒光定量PCR檢測技術(shù)已經(jīng)成為國際上檢測基因表達(dá)通用的方法,能對(duì)低豐度mRNA水平進(jìn)行定量分析[10]。設(shè)計(jì)特異性強(qiáng)的引物以及合適的反應(yīng)條件是利用熒光定量PCR檢測南美白對(duì)蝦免疫相關(guān)因子的關(guān)鍵。本發(fā)明設(shè)計(jì)的引物及反應(yīng)條件可同時(shí)用于檢測南美白對(duì)蝦肝胰腺SOD和PO的轉(zhuǎn)錄相對(duì)定量表達(dá)檢測,為今后準(zhǔn)確分析其南美白對(duì)蝦免疫狀態(tài)提供新的方法。

      1材料與方法

      1.1材料

      南美白對(duì)蝦來自浙江省紹興縣某養(yǎng)殖場,SYBGreen反應(yīng)預(yù)混液購自Bio-Rad公司,M-MLV酶、dNTP、RNase抑制劑購自TaKaRa(大連)公司,Trizol購自Invotrigen公司。

      1.2肝胰腺總 RNA的提取

      取南美白對(duì)蝦完整肝胰腺組織,加入500 μL Trizol裂解液,用研磨棒研磨,等徹底勻漿后,取50 μL勻漿液加入1 mL Trizol 繼續(xù)裂解5 min。其余勻漿液置-80 ℃保存?zhèn)溆茫驅(qū)⑼暾我认僭谝旱兴賰龊笾糜谟?80 ℃下保存。使用時(shí)將組織全部碾磨后,取100 mg加入1 mL Trizol裂解,其余組織粉末置-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

      取出的50 μL勻漿液或100 mg組織粉末繼續(xù)裂解5 min后,12 000 r/min條件下離心2 min,吸取上清至新的離心管。加入200 μL三氯甲烷,渦旋混勻,12 000 r/min條件下離心15 min,吸取上清。加入等體積異丙醇,顛倒混勻數(shù)次,靜置10 min,12 000 r/min 條件下離心10 min,棄上清。用500 μL DEPC水配制的70%乙醇洗滌沉淀,12 000 r/min 條件下離心 5 min,棄去上清。100 μL DEPC水溶解RNA。 測定RNA濃度和純度后,-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.3引物設(shè)計(jì)與合成

      引物是根據(jù)GenBank公布的南美白對(duì)蝦SOD(登錄號(hào):AY486424.1)、PO(登錄號(hào):JN393011.1)及β-actin內(nèi)參基因序列(登錄號(hào):JF288784.1),由軟件Primer Premier 5.0設(shè)計(jì)和手工修改后獲得(表1),均由蘇州金維智生物科技有限公司合成。

      1.4cDNA合成

      取1 μg 總RNA為模板,加入1 μL 10 mmol/L dNTP、1 μL 50 mmol/L Oligo(dT)15,加DEPC水至總體積6.25 μL,65 ℃變性5 min,冰上驟冷2 min。上述反應(yīng)液加入2 μL 5× M-MLV buffer、0.25 μL RNA酶抑制劑、0.5 μL MMLV逆轉(zhuǎn)錄酶、1 μL 10 mmol/L二硫蘇糖醇,使最終反應(yīng)總體積達(dá) 10 μL。42 ℃反應(yīng)1 h后,65 ℃孵育10 min,cDNA合成完畢。表1熒光定量PCR所用引物

      檢測基因名稱引物序列(5′→3′)擴(kuò)增長度(bp)SOD SOD-F:CGCCCTTGAACCTCACATCT;SOD-R:ATTGCGCTTACGTCATTGGC135POPO-F:AATGACCGCGTTGAGGAGTT;PO-R:AGTGGGATCTTCAGCTTGCC134β-actin(內(nèi)參)β-actin-F:CGAGCGAGAAATCGTTCGTG;β-actin-R:GAATGAGGGCTGGAACAGGG187

      合成的cDNA加入90 μL無菌雙蒸水,用于后續(xù)熒光定量PCR擴(kuò)增。1.5熒光定量的反應(yīng)體系及條件

      取5 μL上述合成的cDNA稀釋液作為擴(kuò)增模板,加入2×Sybgreen反應(yīng)預(yù)混液12.5 μL,分別加入5 μmol/L相應(yīng)特異性上、下游引物各0.5 μL,加6.5 μL無菌雙蒸水,使反應(yīng)總體系達(dá)25 μL,置于熒光定量PCR儀上進(jìn)行PCR反應(yīng)。PCR反應(yīng)條件為:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,60 ℃退火15 s,72 ℃延伸30 s,40個(gè)循環(huán);60~90 ℃熔解曲線。

      2結(jié)果與分析

      2.1熒光定量PCR擴(kuò)增效果

      從擴(kuò)增曲線可以看出,SOD、PO及內(nèi)參基因β-actin的擴(kuò)增曲線均較好,曲線拐點(diǎn)清楚,基線平,無上揚(yáng)現(xiàn)象;SOD的CT值為23.85,PO的CT值為28.33,能較好地反映各基因的表達(dá)差異(圖1)。通過CT值計(jì)算該樣品中SOD和PO表達(dá)量相對(duì)于β-actin的表達(dá)量分別為0.140 63、0.006 30倍。

      2.2熒光定量PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的熔解曲線

      從擴(kuò)增產(chǎn)物的熔解曲線看,SOD、PO及內(nèi)參基因β-actin均為單峰,且峰值較高(圖2),表明各擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性較好,且擴(kuò)增效率較高。

      2.3熒光定量PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的瓊脂糖電泳檢測

      將熒光定量PCR的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖電泳檢測,結(jié)果顯示SOD、PO及內(nèi)參基因β-actin的各擴(kuò)增產(chǎn)物的條帶單一,亮度較好,并能一定程度上看出各基因的表達(dá)差異(圖3)。進(jìn)一步證實(shí)了其較好的擴(kuò)增效率和較高的擴(kuò)增特異性。

      3結(jié)論與討論

      非特異性免疫因子的測定是評(píng)估南美白對(duì)蝦免疫狀態(tài)的主要指標(biāo),建立可靠的檢測方法對(duì)于南美白對(duì)蝦的免疫學(xué)研究、抗病育種研究等都具有重要意義。傳統(tǒng)的體液免疫指標(biāo)的測定常采用酶法檢測,但易受多種因素干擾,測定值偏差較大。近幾年,隨著分子生物學(xué)迅猛發(fā)展,熒光定量PCR方法開始被廣泛應(yīng)用于多種免疫因子定量檢測[11-12]。熒光定量PCR檢測方法的可靠性與所設(shè)計(jì)引物的特異性和擴(kuò)增有效性密切相關(guān)。本方法針對(duì)SOD和PO等2個(gè)重要的非特異免疫指標(biāo)設(shè)計(jì)了特異性較好、擴(kuò)增效率較高的引物,建立了利用熒光定量PCR方法對(duì)南美白對(duì)蝦肝胰腺SOD、PO的檢測方法。該方法特異性強(qiáng),敏感性高,克服了酶法測定易波動(dòng)的問題,適合南美白對(duì)蝦免疫活力的評(píng)估。

      與酶法檢測技術(shù)比較,本方法所提供的南美白對(duì)蝦肝胰腺SOD、PO的熒光定量PCR檢測方法具有以下優(yōu)點(diǎn):(1)所采用的肝胰腺組織較對(duì)蝦血液采集更容易。(2)所采集的組織直接用Trizol處理或通過速凍方式保存,可有效減少RNA降解;較血清采集過程可能發(fā)生的溶血或其他導(dǎo)致酶失活的因素更易于控制,保證結(jié)果的可靠性。(3)設(shè)計(jì)的引物特異性好,擴(kuò)增效率高,提高了檢測的準(zhǔn)確性。(4)采用相對(duì)定量方式,通過與內(nèi)參基因表達(dá)量的對(duì)比,可同時(shí)測定多個(gè)免疫相關(guān)因子。

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