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      現(xiàn)場大量生物檢材的自動化提取應用

      2017-01-12 05:30:39王永清林彬輝蔡劍偉張琪陳曉燕
      法醫(yī)學雜志 2016年6期
      關鍵詞:檢材磁珠物證

      王永清,林彬輝,蔡劍偉,張琪,陳曉燕

      (漳州市公安局刑偵支隊,福建漳州 363000)

      ·經驗交流·

      現(xiàn)場大量生物檢材的自動化提取應用

      王永清,林彬輝,蔡劍偉,張琪,陳曉燕

      (漳州市公安局刑偵支隊,福建漳州 363000)

      法醫(yī)遺傳學;提取法;自動化;微量物證

      隨著司法訴訟進程對證據(jù)質量要求的不斷提高,重特大案件的現(xiàn)場重建直接導致生物檢材的送檢量大幅度提升,時效要求也越來越高。而現(xiàn)場送檢的生物檢材種類繁多,以往應用Chelex-100法手工操作耗時長、易污染,手工磁珠法無法批量進行,傳統(tǒng)方式已無法適應形勢的要求[1],尋求高通量的生物檢材DNA自動化提取應用已迫在眉睫。本研究通過采用AutoLys STAR自動化工作站結合微量檢材DNA提取試劑盒建立生物檢材DNA自動化檢驗體系,以實現(xiàn)批量的自動化操作,杜絕交叉污染,有效提升檢案的效率和質量。

      1 材料與方法

      1.1 樣本

      本實驗室日常受理檢驗的案件生物檢材1552份,其中包括血痕813份,煙蒂237份,混合斑78份,肋軟骨27份,帶毛囊毛發(fā)11份,頭套、手套、口罩、衣服、帽子、瓶口、杯口、果核、牙刷、觸摸類(含工具、把手、線頭、印痕)等接觸細胞檢材386份。

      1.2 儀器和試劑

      AutoLys STAR自動化工作站(瑞士Hamilton公司),9700型PCR擴增儀、3130xl型遺傳分析儀、Gene-Mapper ID v3.2軟件(美國AB公司)。Identifiler?Plus試劑盒(美國AB公司),脫落細胞提取儀(公安部物證鑒定中心),EZ-tape脫落細胞粘取器(公安部物證鑒定中心,以下簡稱EZ-tape),微量檢材DNA提取試劑盒(煙臺澳斯邦生物研發(fā)有限公司)。

      1.3 方法

      1.3.1 檢材處理

      血痕、煙蒂、肋軟骨、帶毛囊毛發(fā)、口罩:剪取或切取適量檢材,置入AutoLys Tube管(AutoLys STAR自動化工作站專用裂解管)。

      混合斑:剪取檢材適量,使用差異裂解法去除女性物質,將沉渣用50μL純水混勻后加入1mol/L DTT 10μL,置入AutoLys Tube管。

      頭套、手套、帽子:用EZ-tape粘取,揭下基座上的膠帶置入AutoLys Tube管。

      衣服:用脫落細胞提取儀吸取衣領和袖口處,剪取第二層濾膜置入AutoLys Tube管。

      瓶口、杯口、果核、牙刷:采用干濕兩步法,直接用棉簽提至AutoLys Tube管中。

      觸摸類:先用棉簽干濕兩步法擦拭,再用EZ-tape粘取,揭下基座上的膠帶置入AutoLys Tube管。1.3.2 DNA提取

      編寫檢材登記表,掃描裂解管底部二維碼,登記對應的樣本編號,填寫樣本的洗脫體積和PCR建立時需要分配的對應樣本的DNA溶液模板體積。將裝有檢材的AutoLys Tube管依次放入對應載架上。

      1.3.3 PCR擴增及其分型

      采用10 μL體系的Identifiler?Plus試劑盒在9700型PCR擴增儀上按標準程序29個循環(huán)進行復合擴增,其中Master Mix 4μL、Primer Set 2μL、模板2μL、超純水2μL。在3130xl型遺傳分析儀上進行電泳檢測,用GeneMapper ID v3.2軟件進行分析。該試劑盒可以對共15個STR基因座進行分型檢測,本次以獲得性別及13個以上STR基因座明確分型的為成功[2-5]。

      2 結果

      1552例生物檢材總STR檢測成功率為90.40%。其中肋軟骨、毛發(fā)成功率為100.00%;血痕、煙蒂、瓶口等檢材成功率也較高;頭套、手套、口罩、衣服、帽子、瓶口、杯口、果核、牙刷、觸摸類等多類接觸細胞平均檢出率為68.91%,其中觸摸類檢材成功率則較低(表1)。

      表1 采用自動化工作站提取生物檢材DNA的檢驗結果

      3 討論

      自動化工作站為常見生物性檢材的DNA提取提供了一個高效、精確、有用的平臺[6],已在人員血樣DNA數(shù)據(jù)庫建設中起著重要作用[7]。而基于功能磁性納米顆粒的樣本提取與處理技術(即磁珠分離技術)可以保證實驗結果的穩(wěn)定,避免人工操作引起的誤差[8]。將自動化工作站與磁珠法DNA提取技術相結合的磁珠DNA自動提取系統(tǒng)正逐步普及,已在法醫(yī)應用DNA數(shù)據(jù)庫建設和案件檢驗中得到應用。

      AutoLys STAR自動化工作站的試劑平臺和實驗程序均為開放式,可兼容包括市面上各種磁珠試劑在內的多種常見提取方法,未來DNA檢驗新方法同樣可在該平臺得到應用。本實驗案例檢驗采用的微量檢材DNA提取試劑盒中磁珠顆粒較小、吸附效率高,適用于法醫(yī)DNA實驗室常見生物檢材的提取。微量檢材DNA提取試劑盒配合AutoLys STAR自動化工作站可自動完成樣本裂解、磁珠吸附、洗滌和洗脫純化步驟,樣本完全閉蓋裂解,杜絕交叉污染,無需人工進行離心、過濾等操作,在本實驗中得到了較理想的檢出效率。隨著犯罪分子反偵查意識不斷增強,案件現(xiàn)場遺留的常規(guī)檢材越來越少,辦案人員逐漸將勘查重點轉向微量物證,而這類檢材的檢驗結果對案件定性乃至偵破起著關鍵作用。該工作平臺加入了超濾步驟,使模板得到充分富集、濃縮,在本實驗中針對接觸類檢材,特別是觸摸類檢材的檢出率同比本實驗室以往檢測、高林林等[4-5]檢測結果均有大幅提升。

      在使用該工作平臺中我們發(fā)現(xiàn),該平臺確能實現(xiàn)大通量檢驗的目的,對于現(xiàn)場大量生物檢材的送檢,操作人員只需將樣本檢材放入指定位置,啟動軟件即可自動完成DNA提取,實現(xiàn)了全系統(tǒng)的自動化,無需再行人工干預,有效節(jié)約了寶貴的人力;同時,該平臺還引入了二維碼,避免了人為差錯,可保證檢材從進入實驗室到得出DNA檢驗結果,中間每一步過程都有記錄,都可以得到追溯,適應了當前實驗室開展認可與資質認定工作的要求。

      綜上所述,本研究利用自動化工作站建立的標準化流程,可以批量提取常見案件中生物檢材DNA,特別是應用于侵財類案件普遍送檢接觸類檢材的提取,不僅具備高效、穩(wěn)定、操作簡便、有效防控污染等特點[9],減少人力資源,易于實現(xiàn)檢驗的標準化、規(guī)范化和自動化,且該自動化工作站為模塊化設計,便于后期根據(jù)工作需求進行升級,可在常規(guī)檢案之外的檢測工作中得到便捷應用。

      [1]匡金枝,聶同鋼,楊智,等.法醫(yī)物證DNA自動化檢驗技術體系的研究[J].中國法醫(yī)學雜志,2009,24(3):165-167.

      [2]中華人民共和國公安部.人類DNA熒光標記STR分型結果的分析及應用:GA/T 1163—2014[S].北京:中國標準出版社,2014.

      [3]劉亞舉,張麗娟.自動化工作站批量提取現(xiàn)場生物檢材DNA的應用[J].刑事技術,2014,(2):60-61.

      [4]高林林,洪亮,葉慧薇,等.脫落上皮細胞類生物檢材的自動化提取[J].刑事技術,2011,(2):14-15.

      [5]王琴,章申峰,李佑英,等.微量脫落細胞DNA檢驗方法的比較分析[J].刑事技術,2014,(4):54-55.

      [6]張瓊予,丁梅,王保捷,等.DNA提取自動化工作站在法醫(yī)學領域的應用[J].中國法醫(yī)學雜志,2010,25(1):40-42.

      [7]劉莉,王衛(wèi)華,唐劍鋒.磁珠法在自動化核酸提取工作站中的應用[J].法醫(yī)學雜志,2013,29(2):144.

      [8]易勇,敬華.免疫磁珠分離技術在醫(yī)學檢驗中的應用[J].總裝備部醫(yī)學學報,2010,12(4):239-241.

      [9]孫大成,孫善永,姜曜恒,等.應用自動化工作站批量提取生物檢材DNA[J].法醫(yī)學雜志,2011,27(1):54-55.

      DF795.2

      B

      10.3969/j.issn.1004-5619.2016.06.016

      1004-5619(2016)06-0455-02

      2016-05-10)

      (本文編輯:張素華)

      王永清(1973—),男,主任法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)物證學檢案和研究;E-mail:vt73@163.com

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