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      甘肅甘南藏族人群21個(gè)非CODIS基因座的遺傳多態(tài)性

      2017-01-12 05:30:40臧麗麗雷亮王濤陶曉嵐聶笑聯(lián)劉賢海
      法醫(yī)學(xué)雜志 2016年6期
      關(guān)鍵詞:甘肅蘭州基因座甘南

      臧麗麗,雷亮,王濤,陶曉嵐,2,聶笑聯(lián),劉賢海

      (1.甘肅省公安廳刑事偵查局,甘肅蘭州 730046;2.甘肅政法學(xué)院甘肅證據(jù)科學(xué)技術(shù)研究與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,甘肅蘭州 730030)

      ·研究簡(jiǎn)報(bào)·

      甘肅甘南藏族人群21個(gè)非CODIS基因座的遺傳多態(tài)性

      臧麗麗1,雷亮1,王濤1,陶曉嵐1,2,聶笑聯(lián)1,劉賢海1

      (1.甘肅省公安廳刑事偵查局,甘肅蘭州 730046;2.甘肅政法學(xué)院甘肅證據(jù)科學(xué)技術(shù)研究與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,甘肅蘭州 730030)

      法醫(yī)遺傳學(xué);多態(tài)現(xiàn)象,遺傳;短串聯(lián)重復(fù)序列;甘肅;藏族

      本研究采用AGCU 21+1熒光標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)對(duì)515例甘肅甘南藏族健康無關(guān)個(gè)體的21個(gè)常染色體非CODIS基因座進(jìn)行遺傳多態(tài)性分析,旨在為法醫(yī)遺傳學(xué)研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

      1 材料與方法

      根據(jù)知情同意原則,隨機(jī)采集祖孫三代居住在甘肅甘南藏族自治州的藏族健康無親緣關(guān)系個(gè)體FTA卡血痕樣本515例,其中男性305例,女性210例。

      采用AGCU 21+1 STR熒光檢測(cè)試劑盒(無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司)直接擴(kuò)增血樣DNA,樣本DNA在GeneAmp?PCR系統(tǒng)9700(美國(guó)AB公司)上進(jìn)行擴(kuò)增,實(shí)驗(yàn)條件和步驟均嚴(yán)格按照試劑盒使用說明書操作。擴(kuò)增產(chǎn)物在3500基因分析儀(美國(guó)AB公司)上進(jìn)行毛細(xì)管電泳,用GeneMapper ID x1.2軟件進(jìn)行等位基因分型。

      根據(jù)基因分型結(jié)果,應(yīng)用HW-QuickCheck軟件進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)[1],利用PowerStats v12軟件對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,計(jì)算21個(gè)常染色體非CODIS基因座的等位基因頻率、雜合度(H)、個(gè)人識(shí)別率(DP)、非父排除率(PE)、匹配概率(Pm)和多態(tài)信息含量(PIC)等。

      2 結(jié)果與討論

      甘肅甘南藏族自治州515例藏族無關(guān)個(gè)體的21個(gè)常染色體非CODIS基因座等位基因頻率分布見表1,群體遺傳學(xué)參數(shù)統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果見表2。21個(gè)常染色體非CODIS基因座的累積非父排除率(CPE)和累積個(gè)人識(shí)別率(CDP)分別為0.999 997 828 805 19和0.999 999 999 999 99。515例藏族個(gè)體的21個(gè)非CODIS基因座基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。

      根據(jù)Gill等[2]提出的STR基因座選擇標(biāo)準(zhǔn),DP>0.9、H>0.7的基因座認(rèn)為是高鑒別能力基因座,由表2可見,除D11S4463和D19S433為高鑒別能力的基因座外,其他基因座均屬于中等鑒別能力基因座。綜上所述,D19S433等21個(gè)非CODIS基因座在甘肅甘南藏族自治州藏族人群中具有良好的遺傳多態(tài)性,可作為法醫(yī)學(xué)親權(quán)鑒定和個(gè)人識(shí)別中單親或出現(xiàn)突變可能的案件的補(bǔ)充。

      表1 甘南藏族人群21個(gè)常染色體非CODIS基因座等位基因頻率分布(n=515)

      續(xù)表1

      表2 甘南藏族人群21個(gè)常染色體非CODIS基因座的群體遺傳學(xué)參數(shù)(n=515)

      續(xù)表2

      [1]Kalinowski ST.HW-QUICKCHECK:an easy-to-use computer program for checking genotypes for agreement with Hardy-Weinberg expectations[J].Molecular Ecology Notes,2006,6(4):974-979.

      [2]Gill P,Urquhart A,Millican E,et al.A new method of STR interpretation using inferential logic--development of a criminal intelligence database[J].Int J Legal Med,1996,109(1):14-22.

      (本文編輯:李成濤)

      書訊

      《法醫(yī)病理數(shù)字化新技術(shù)理論與實(shí)踐》由司法部司法鑒定科學(xué)技術(shù)研究所劉寧國(guó)與陳憶九主編,于2015年1月出版。該書以當(dāng)前飛速發(fā)展的數(shù)字化技術(shù)為基礎(chǔ),結(jié)合作者多年從事法醫(yī)病理學(xué)鑒定的經(jīng)驗(yàn)和近年來開展的法醫(yī)虛擬解剖、計(jì)算機(jī)生物力學(xué)仿真、數(shù)字化快速三維現(xiàn)場(chǎng)圖、法醫(yī)骨學(xué)專家系統(tǒng)和全息數(shù)字病理切片等領(lǐng)域的研究和鑒定工作,并吸納了國(guó)內(nèi)外最新科研成果和工作實(shí)踐的報(bào)道編寫而成。本書分為六章。每章既有數(shù)字化法醫(yī)病理技術(shù)手段的最新概況,也有該技術(shù)手段所依據(jù)的基本理論和方法,同時(shí)還對(duì)相應(yīng)技術(shù)在法醫(yī)學(xué)各類鑒定的應(yīng)用進(jìn)行分別歸納、總結(jié),涵蓋了法醫(yī)病理數(shù)字化技術(shù)的相關(guān)領(lǐng)域基礎(chǔ)理論、應(yīng)用實(shí)踐和最新研究成果,可供從事法醫(yī)學(xué)鑒定和科學(xué)研究的公安、檢察、法院、高校和社會(huì)鑒定機(jī)構(gòu)等工作人員和學(xué)者閱讀參考,也可為司法審判人員、大中專院校相關(guān)專業(yè)學(xué)生以及法律工作者提供幫助。

      該書精裝、全彩版,定價(jià)為198元,包裝郵寄費(fèi)10元/本,共計(jì)208元/本。有意購書者請(qǐng)與本編輯部聯(lián)系。

      聯(lián)系地址:上海市普陀區(qū)(市西)光復(fù)西路1347號(hào)《法醫(yī)學(xué)雜志》編輯部郵編:200063

      聯(lián)系人(收款人):武勝男

      聯(lián)系電話:021-52361148-2319(發(fā)行),021-52360413(傳真)

      電子信箱:fyxzz@126.com

      DF795.2

      B

      10.3969/j.issn.1004-5619.2016.06.019

      1004-5619(2016)06-0461-03

      2015-05-26)

      甘肅省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(145RJZA038)

      臧麗麗(1982—),女,主檢法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)DNA檢驗(yàn)鑒定與研究;E-mail:124750200@qq.com

      陶曉嵐,女,主任法醫(yī)師,教授,主要從事法醫(yī)遺傳學(xué)檢案及研究;E-mail:taoxll1025@126.com

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