趙春鶴,郭業(yè)明,巫家盛
(1.東莞市公安局刑警支隊(duì),廣東東莞 523008;2.東莞市公安局交警支隊(duì),廣東東莞 523000)
自動(dòng)化高通量提取脫落細(xì)胞檢材DNA
趙春鶴1,郭業(yè)明2,巫家盛1
(1.東莞市公安局刑警支隊(duì),廣東東莞 523008;2.東莞市公安局交警支隊(duì),廣東東莞 523000)
法醫(yī)遺傳學(xué);提取法;高通量篩選分析;自動(dòng)化;脫落細(xì)胞
脫落細(xì)胞是目前法醫(yī)DNA檢驗(yàn)中的重要檢材之一,此類物證具有體積小、較為隱蔽、不易察覺、不易毀滅等特點(diǎn)。通過提取脫落細(xì)胞中的DNA,可以直接獲取犯罪現(xiàn)場(chǎng)人員信息,為案件偵破提供重要技術(shù)支持。但在現(xiàn)場(chǎng)檢材中通常僅能采集到微量的脫落細(xì)胞,且常常帶有擴(kuò)增抑制物,手工進(jìn)行DNA提取操作復(fù)雜,提取效果因人而異,給DNA檢驗(yàn)帶來了諸多困難。為有效提高脫落細(xì)胞的獲取量,必然要增加現(xiàn)場(chǎng)采樣的數(shù)量,這又大大增加了后續(xù)DNA提取的工作強(qiáng)度。目前,建立自動(dòng)化、高通量的提取脫落細(xì)胞檢材DNA的有效方法已經(jīng)成為法醫(yī)DNA檢驗(yàn)的重要研究方向。本研究以KingFisherTMFlex微量生物物證DNA自動(dòng)化提取純化系統(tǒng)(高通量版,以下簡稱KingFisher Flex系統(tǒng))為基礎(chǔ),建立自動(dòng)化高通量提取脫落細(xì)胞檢材DNA的方法。
1.1 樣本
收集實(shí)際檢案中的脫落細(xì)胞檢材274份,包括口腔黏膜上皮脫落細(xì)胞檢材60份,其中礦泉水瓶口33份、牙刷12份、食物咬痕8份、筷子牙簽等餐具7份;皮膚上皮脫落細(xì)胞檢材214份,其中電線插座插頭、欄桿、工具握柄及把手165份,手套32份,衣帽17份。
1.2 主要儀器與試劑
9700型PCR擴(kuò)增儀、3500型基因分析儀、3130xl型遺傳分析儀(美國AB公司),KingFisher Flex系統(tǒng)(美國Thermo Fisher Scientific公司),脫落細(xì)胞粘取器(東莞市公安局研發(fā));案件專用磁珠法DNA提取試劑盒(長春市博坤生物科技有限公司),Identifiler? Plus試劑盒(美國AB公司)。
1.3 脫落細(xì)胞DNA的提取
口腔黏膜上皮脫落細(xì)胞采用公安部物證鑒定中心研制的生物物證棉簽[1]提取,皮膚上皮脫落細(xì)胞采用脫落細(xì)胞粘取器[2]提取,在脫落細(xì)胞可能存在的部位反復(fù)粘取和擦拭(至少20次)。然后將剪下的棉簽頭或膜片放入1mL離心管中,加入400μL消化液(液面高度要超過棉簽或膜片)和10 μL蛋白酶K(質(zhì)量濃度20 mg/mL),56℃條件下消化1 h,以離心半徑5 cm,10 000 r/min,離心3 min,取上清液按照案件專用磁珠法DNA提取試劑盒說明書和KingFisher Flex系統(tǒng)預(yù)設(shè)程序進(jìn)行DNA提?。ò磧x器處理通量分3批次進(jìn)行提取)。DNA洗脫體積為40μL。
1.4 PCR擴(kuò)增及熒光檢驗(yàn)
用Identifier?Plus試劑盒進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)總體積為12.5 μL,含DNA模板5 μL、反應(yīng)混合液5μL、引物2.5μL。反應(yīng)在9700型PCR擴(kuò)增儀上進(jìn)行,95℃11 min;94℃20 s,59℃60 s,72℃60 s,34個(gè)循環(huán);60℃10min[3]。用3130xl型遺傳分析儀對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳分離,用GeneMapper ID 3.2軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析及等位基因分型。
從表1可以看出,本研究建立的自動(dòng)化高通量處理方法得到的DNA檢驗(yàn)總成功率約為50%。從提取時(shí)間來說,同時(shí)對(duì)90個(gè)裂解好的樣品進(jìn)行DNA提取,KingFisher Flex系統(tǒng)只需要50min。
表1 利用KingFisher Flex系統(tǒng)提取DNA檢驗(yàn)結(jié)果(份)
KingFisher Flex微量生物物證DNA自動(dòng)化提取純化系統(tǒng),在同一批次內(nèi)可同時(shí)進(jìn)行96個(gè)樣品的純化,除去陰陽性對(duì)照樣品外,每次可完成92個(gè)樣品的DNA提取純化。
應(yīng)用KingFisher Flex系統(tǒng)結(jié)合ML案件專用磁珠法DNA提取試劑盒,對(duì)脫落細(xì)胞檢材進(jìn)行自動(dòng)化高通量提取純化方法的適用面非常廣,本研究收集的檢材種類包括紡織物、金屬表面、木器表面等,基本涵蓋了大部分的現(xiàn)場(chǎng)檢材。
本研究建立的方法是以KingFisher Flex系統(tǒng)為基礎(chǔ),優(yōu)化了脫落細(xì)胞檢材的采集、處理和DNA提取等各個(gè)環(huán)節(jié)的技術(shù)操作。主要表現(xiàn)在:(1)在采集環(huán)節(jié),對(duì)皮膚上皮脫落細(xì)胞廣泛應(yīng)用脫落細(xì)胞粘取器進(jìn)行采集,與傳統(tǒng)的棉簽提取方式相比,操作直觀簡單,基層技術(shù)人員運(yùn)用難度低,獨(dú)立的包裝盒防污染、防霉效果好,細(xì)胞轉(zhuǎn)移效率較高且穩(wěn)定[2];(2)為消除在細(xì)胞粘取過程中夾帶的雜質(zhì)對(duì)擴(kuò)增的抑制,本研究選擇了新型的案件專用磁珠法DNA提取試劑盒,該試劑盒提取靈敏度能夠達(dá)到30pg,適合微量、污染和降解檢材提取純化使用;(3)KingFisher Flex系統(tǒng)使用的是磁珠轉(zhuǎn)移的提取方式,與液體轉(zhuǎn)移提取方式相比,提取效率和純化效率有明顯優(yōu)勢(shì),與手工提取基本一致。本研究結(jié)果表明,通過以上優(yōu)化方法,結(jié)合自動(dòng)化高通量提取儀器建立的自動(dòng)化批量處理脫落細(xì)胞檢材的方法非常有效地解決了各種檢材脫落細(xì)胞提取的難題,為DNA分析技術(shù)在刑事案件偵破中發(fā)揮重大作用提供了強(qiáng)有力的支持。
本方法中KingFisher Flex系統(tǒng)所需的提取時(shí)間比手工操作提取縮短數(shù)十倍,并且適用檢材范圍廣,在保證提取質(zhì)量的前提下,降低了操作人員的工作強(qiáng)度和難度,縮短了工作時(shí)間,減少了人工操作的失誤,極大地提升了工作效率。
[1]張璐.微量DNA檢驗(yàn)技術(shù)及應(yīng)用——微量DNA檢驗(yàn)技術(shù)及展望[J].警察技術(shù),2012,(2):3-6.
[2]趙春鶴,郭業(yè)明,江煜靈,等.利用自研新型脫落細(xì)胞粘取器提取接觸類檢材DNA[J].刑事技術(shù),2014,(4):51-53.
[3]陳連康,王德明,顧麗華,等.PCR擴(kuò)增循環(huán)數(shù)與低拷貝模板DNA的STR分型[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2005,20(3):149-151.
(本文編輯:李成濤)
書訊
由司法部司法鑒定科學(xué)技術(shù)研究所黃平、鄒冬華主編的《法醫(yī)病理學(xué)研究前沿》已于2015年2月由科學(xué)出版社出版發(fā)行。該書綜合了國內(nèi)外大量文獻(xiàn)資料中的法醫(yī)病理學(xué)研究熱點(diǎn)和難點(diǎn),論述了一大批新技術(shù)、新方法、新理論在法醫(yī)病理學(xué)研究、鑒定中的應(yīng)用情況,對(duì)相關(guān)研究成果進(jìn)行了及時(shí)總結(jié)、歸納與提煉,系統(tǒng)闡述了皮膚損傷時(shí)間推斷、紅外光譜技術(shù)、過敏性休克死亡、虛擬解剖、損傷生物力學(xué)與交通傷重建、國外法醫(yī)病理學(xué)體制、國外尸體解剖標(biāo)準(zhǔn)、國外法醫(yī)學(xué)體制、國外尸體解剖鑒定文書賞析等內(nèi)容,這些相關(guān)技術(shù)的提出及應(yīng)用將有助于促進(jìn)法醫(yī)病理學(xué)鑒定和科研水平的整體進(jìn)步。
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DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2016.06.017
1004-5619(2016)06-0457-02
2016-02-24)
趙春鶴(1976—),女,副主任法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)DNA檢驗(yàn)鑒定;E-mail:13929218636@139.com