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      兩種提取細(xì)胞外泌體方法的比較

      2018-04-25 03:16:44周昌孌
      關(guān)鍵詞:泌體電鏡沉淀法

      周昌孌 ,譚 磊 ,謝 軍 ,丁 鏟

      (1.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所,上海200241;2.西北民族大學(xué),蘭州730030)

      外泌體是一種由細(xì)胞主動(dòng)分泌的具有脂質(zhì)雙分子層結(jié)構(gòu)的囊泡,直徑約在30~150 nm,其形狀類似于茶托或一側(cè)凹陷的半球形[1]。20世紀(jì)80年代外泌體發(fā)現(xiàn)初期,研究者認(rèn)為其僅僅用于攜帶細(xì)胞廢棄蛋白[2],但約十年后發(fā)現(xiàn),外泌體是另一種新型的細(xì)胞間通訊方式[3],且對(duì)腫瘤細(xì)胞的遷移與侵襲能力及腫瘤微環(huán)境有至關(guān)重要的影響,因而外泌體的相關(guān)研究呈現(xiàn)“噴井式”增加。近期研究發(fā)現(xiàn),外泌體內(nèi)容物極其豐富,包含RNA、蛋白和脂類。截止目前,據(jù)Exocarta數(shù)據(jù)庫(kù)統(tǒng)計(jì),已有9769種蛋白質(zhì)、3408種RNA、2838種microRNA和1116種脂類發(fā)現(xiàn)于外泌體中(http://www.exocarta.org/)。其中,一些蛋白質(zhì)如CD63、TSG101和Hsp70等可以用于外泌體的鑒定,因?yàn)樗鼈兪峭饷隗w表面的共有蛋白[4]。

      HeLa細(xì)胞來(lái)源于一位美國(guó)婦女海莉耶塔·拉克斯(Henrietta Lacks)子宮頸癌細(xì)胞的細(xì)胞系[5],因其增殖迅速、可連續(xù)傳代、生長(zhǎng)環(huán)境要求低、感染性強(qiáng)等特點(diǎn),廣泛應(yīng)用于腫瘤研究及其他生物實(shí)驗(yàn)。但目前HeLa細(xì)胞外泌體的相關(guān)研究仍較少,而得到高質(zhì)量有效的HeLa細(xì)胞外泌體是進(jìn)行HeLa細(xì)胞外泌體研究的第一步。

      商品化外泌體提取試劑盒良莠不齊,且昂貴的價(jià)格常常令研究者望而卻步。2016年Rider等[6]解析了PEG聚沉法分離外泌體的關(guān)鍵步驟,并優(yōu)化了一整套分離方法,極大降低了PEG聚沉法的成本,且相關(guān)成分與商品化外泌體提取試劑盒類似。因此,本文采用優(yōu)化之后的PEG沉淀法與經(jīng)典差速離心法提取HeLa細(xì)胞分泌的外泌體,利用電鏡比較兩種方法所提外泌體的形態(tài)學(xué)差異,蛋白印跡技術(shù)及動(dòng)態(tài)光散射技術(shù)分別從外泌體表面特有蛋白及顆粒大小與分布兩方面來(lái)鑒定兩種方法所提的外泌體,從而選取最為可靠有效的外泌體提取方法,為進(jìn)一步高效且經(jīng)濟(jì)地研究外泌體提供實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。

      1 材料和方法

      1.1 細(xì)胞、試劑及儀器 宮頸癌細(xì)胞株HeLa由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所水禽病毒病團(tuán)隊(duì)提供;DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清(fetal bovine serum,F(xiàn)BS)和0.25%胰蛋白酶(Trypsin-EDTA)均購(gòu)自Gibco公司;CD63抗體(EPR5702)購(gòu)自Abcam公司;PEG6000購(gòu)自Sangon公司;Optima L-100XP低溫差速離心機(jī)購(gòu)自美國(guó)Beckman公司;Tecnai G2 Spirit BIOTWIN透射電子顯微鏡購(gòu)自荷蘭FEI公司,納米粒徑電位分析儀(Malvern,Nano-ZS90)購(gòu)自英國(guó)馬爾文公司。

      1.2 HeLa細(xì)胞培養(yǎng)上清收集 用含10% FBS的DMEM培養(yǎng)基于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)HeLa細(xì)胞,以0.25%胰蛋白酶消化傳代。待細(xì)胞生長(zhǎng)狀態(tài)良好且密度達(dá)到1×106~1×107個(gè)細(xì)胞時(shí),換成不含F(xiàn)BS的DMEM培養(yǎng)液繼續(xù)培養(yǎng)24 h后,收集細(xì)胞培養(yǎng)上清。

      1.3 差速離心法提取外泌體 具體方法參照外泌體分離的相關(guān)文獻(xiàn)[4],并進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整。即在4℃下,首先300×g離心10 min,吸取上清液,然后2 000×g離心10 min;吸取上清液后,10 000×g高速離心30 min,吸取上清液;140 000×g超速離心90 min;除去上清液,所獲得的沉淀即為外泌體。用PBS緩沖液洗滌沉淀并重懸后,140 000×g再次離心90 min,100 μL PBS緩沖液重懸沉淀,凍存于-80℃?zhèn)溆谩?/p>

      1.4 PEG沉淀法提取外泌體 具體步驟參照Rider等[6]的PEG沉淀法分離外泌體方法,并進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整。在4℃下,首先2 000×g離心30 min,吸取上清液,等體積加入8% PEG6000溶液混合均勻后4℃孵育過(guò)夜(至少12 h),10 000×g離心60 min,收集沉淀,加入1 mL PBS重懸沉淀,12 000×g離心30 min,棄上清,以100 μL PBS緩沖液重懸沉淀,凍存于-80℃?zhèn)溆谩?/p>

      1.5 外泌體的形態(tài)學(xué)分析 吸取15 μL樣品滴加于銅網(wǎng)上,沉淀2 min,用濾紙從銅網(wǎng)邊緣吸去多余液體,滴加10 μL 3% 磷鎢酸(pH7.0),2 min后,用濾紙從銅網(wǎng)邊緣吸去多余染液,最后滴加純水于銅網(wǎng),吸去多余純水,常溫干燥數(shù)分鐘后,于80 kV電鏡下成像。

      1.6 外泌體標(biāo)志蛋白鑒定 分別提取兩種方法所提外泌體的總蛋白,經(jīng)SDS-PAGE后,轉(zhuǎn)至PVDF膜上,脫脂乳室溫封閉2 h后,加入一抗(CD63,1∶3 000;CD81,1∶2 000)4 ℃孵育過(guò)夜,TBST洗脫3次后,加入二抗(兔),室溫孵育1 h,TBST洗脫3次,顯影、定影。

      1.7 外泌體顆粒大小分布分析 利用動(dòng)態(tài)光散射,將所提取的外泌體樣品用PBS稀釋至1 mL,添加至樣品池中,打開(kāi)Zetasizer軟件,設(shè)置溫度為25℃,溫度平衡時(shí)間為70 s、粘度為0.89 cP、折射率為1.330,同一樣本測(cè)量3次,而后得到樣品的粒徑大小與分布。

      2 結(jié)果

      2.1 外泌體形態(tài)學(xué)鑒定 利用差速離心法與PEG沉淀法提取HeLa細(xì)胞培養(yǎng)上清,均分離到一些泡狀物,所觀察到的樣品形態(tài)見(jiàn)圖1。結(jié)果顯示,差速離心法與PEG沉淀法提取的疑似外泌體樣品呈現(xiàn)典型的外泌體形態(tài)結(jié)構(gòu),即茶托樣雙層膜結(jié)構(gòu),直徑大小均在30~150 nm,兩種方法所提的泡狀物在形態(tài)上無(wú)明顯差異。沉淀法提取的樣品中均能檢測(cè)到外泌體標(biāo)志蛋白的表達(dá),其分子量分別為CD63(53 kDa)、CD81(26 kDa),進(jìn)一步證明了所提樣品可能為外泌體,見(jiàn)圖2。

      圖1 兩種不同方法提取的外泌體形態(tài)的電鏡觀察Fig.1 The exosome extracted with two methods under electron microscopy

      圖2 外泌體標(biāo)志蛋白的表達(dá)Fig. 2 Expression of exosome marker protein

      2.3 外泌體顆粒大小分布分析 采用動(dòng)態(tài)光散射檢測(cè)差速離心法與PEG沉淀法獲得的外泌體的粒徑及分布,結(jié)果顯示,差速離心法所提外泌體粒徑=(58.4 ±23.17)nm,PEG沉淀法所提外泌體粒徑=(59.43±21.31)nm,且都呈單峰,占據(jù)樣品組分100%,該結(jié)果表明兩種方法所提外泌體粒徑及分布無(wú)明顯差異,見(jiàn)圖3。

      圖3 DLS檢測(cè)HeLa細(xì)胞外泌體粒徑及分布Fig.3 Particle size and distribution of the exosomes derived from HeLa cells measured by DLS

      2.2 外泌體標(biāo)志蛋白CD63、CD81的表達(dá)鑒定Western blot實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,利用超速離心法與PEG

      3 討論

      一直以來(lái),外泌體作為“蛋白垃圾包”不受重視,在2007年,mRNA與microRNA在外泌體中被發(fā)現(xiàn)[7],從而改變了大家對(duì)外泌體的認(rèn)識(shí),使其成為當(dāng)前生物學(xué)研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)。外泌體作為細(xì)胞間通訊方式之一,在生長(zhǎng)發(fā)育、感染、腫瘤發(fā)生與轉(zhuǎn)移等多種生理病理過(guò)程中扮演著重要角色,而外泌體的載體性質(zhì)也為藥物的靶向研究開(kāi)辟了新天地[8]。

      HeLa細(xì)胞作為一種重要的細(xì)胞模型,在腫瘤研究、病毒感染等眾多實(shí)驗(yàn)中廣泛應(yīng)用。如今,各種類型細(xì)胞來(lái)源外泌體的相關(guān)研究不斷更新,但關(guān)于HeLa分泌的外泌體研究卻鮮有報(bào)道。不同細(xì)胞來(lái)源的外泌體,甚至同一類型細(xì)胞在不同生理狀態(tài)下分泌的外泌體常常存在差異,因此,采用什么方法獲取有效的HeLa細(xì)胞外泌體成為了困擾我們的難題之一。

      我們參考了經(jīng)典離心法提供的具體實(shí)驗(yàn)步驟,在超離步驟時(shí)發(fā)現(xiàn),當(dāng)使用100 000×g離心,所提的HeLa外泌體數(shù)量極少,電鏡下觀察時(shí),多個(gè)網(wǎng)格中僅能找到1~2個(gè)呈現(xiàn)經(jīng)典茶托樣雙層膜結(jié)構(gòu)的外泌體,但將此步驟提高至150 000×g后,發(fā)現(xiàn)外泌體其他地方出現(xiàn)數(shù)量明顯增加,但雙層膜結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)部分破損的現(xiàn)象,最終發(fā)現(xiàn)140 000×g進(jìn)行超離時(shí),電鏡下觀察到的外泌體數(shù)量增加且結(jié)構(gòu)完整。

      PEG沉淀法在過(guò)去的幾十年里,一直作為病毒富集的經(jīng)典方法[9],而外泌體的顆粒大小與病毒相仿且部分理化性質(zhì)相似,因而該方法已成為提取外泌體的另一種新途徑[6,10],國(guó)內(nèi)已將該方法應(yīng)用于血清中胎盤來(lái)源的外泌體[11]及精液外泌體提取[12]。因而受此啟發(fā),利用該方法提取HeLa細(xì)胞來(lái)源的外泌體,且電鏡下觀察到的外泌體形態(tài)與經(jīng)典離心法差異不顯著,都呈現(xiàn)經(jīng)典的外泌體雙層膜結(jié)構(gòu),直徑約30~150 nm。經(jīng)典離心法與PEG法提取的外泌體中都表達(dá)標(biāo)志蛋白CD63和CD81。PEG法比經(jīng)典離心法步驟更簡(jiǎn)單,耗時(shí)更短。若從便捷角度看,PEG沉淀法比經(jīng)典離心法好,但PEG分子的引入,是否會(huì)影響外泌體的生物學(xué)活性,我們還尚未知曉,需要進(jìn)一步研究驗(yàn)證。因此,為保證所提外泌體的質(zhì)量,差速離心法是一種更可靠的有效提取Hela細(xì)胞中的外泌體的方法。

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