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      Nat Commun:人工智能幫助找到導(dǎo)致胃癌的基因突變!

      2019-01-29 16:00:41
      智慧健康 2019年12期
      關(guān)鍵詞:基因突變基因組癌癥

      癌癥是全球最大的致死因之一,而胃癌是全球第四最致命的癌癥。癌癥由于DNA突變導(dǎo)致細(xì)胞異常生長所致。我們基因組中那2%的可編碼DNA已經(jīng)得到了充分的研究,但是其他98%的非編碼DNA仍然處于無人所知的狀態(tài)。非編碼DNA可以調(diào)節(jié)基因活性,而越來越多的證據(jù)表明這些基因區(qū)域的基因突變也會促使癌癥的發(fā)生發(fā)展。

      在這項(xiàng)研究中,研究人員創(chuàng)造了兩種AI方法掃描212個(gè)胃癌組織的全基因組,如果使用現(xiàn)有的標(biāo)準(zhǔn)模式計(jì)算機(jī),需要30年才能將數(shù)據(jù)分析完。通過使用GIS和新加坡國家超算中心(NSCC)的計(jì)算機(jī)群,研究人員成功的找到了基因組中的幾個(gè)新的癌癥相關(guān)基因突變,分析還顯示非編碼DNA突變可以通過改變基因組的三維結(jié)構(gòu)而引起癌癥。

      GIS研究員和該研究領(lǐng)導(dǎo)科學(xué)家Anders Skanderup博士說道:“我們聚焦于使用計(jì)算和數(shù)據(jù)驅(qū)使的方法來研究癌癥的根源,以幫助開發(fā)更有效的應(yīng)對策略。我們的分析顯示有11處非編碼基因的突變會調(diào)節(jié)基因組的三維結(jié)構(gòu),差不多每4個(gè)胃癌病人就有一個(gè)人的這些區(qū)域有突變?!?/p>

      他繼續(xù)說道:“這些非編碼基因突變在其他癌癥(如結(jié)直腸癌、胰腺癌和肝癌)中也有。因此這些基因突變可以作為檢測和監(jiān)控這些疾病進(jìn)展的生物標(biāo)記物?!?/p>

      GIS的常務(wù)董事Ng Huck Hui教授說道:“過去的研究只關(guān)注尋找編碼DNA,但是這類DNA只占我們基因組的2%。因此多年以來都有一個(gè)疑問:我們是否因?yàn)楹雎粤似溆嗟?8%的DNA而錯(cuò)過了重要信息?這是首個(gè)研究非編碼DNA對胃癌影響的研究,我們希望這項(xiàng)研究可以激發(fā)更多的研究人員參與類似的研究以揭示這些特殊突變的機(jī)理和影響?!?/p>

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