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      Pooling PCR技術(shù)用于發(fā)現(xiàn)病程早期HIV感染者的研究

      2019-07-31 08:06:44唐翼龍易志強劉麗萍靳廷麗張娜丁晨廖清華
      實驗與檢驗醫(yī)學(xué) 2019年4期
      關(guān)鍵詞:就診者感染者核酸

      唐翼龍 ,易志強 ,劉麗萍 ,靳廷麗 ,張娜 ,丁晨 ,廖清華

      (1.江西省疾病預(yù)防控制中心,江西 南昌 330029;2.深圳市疾病預(yù)防控制中心,廣東 深圳 518055)

      在艾滋病防治中,找到HIV感染者并加以有效管理是控制艾滋病流行的科學(xué)方法之一。在病程早期(急性感染期),感染者體內(nèi)的艾滋病病毒復(fù)制活躍,其通過性行為等途徑感染配偶/性伴的效率最高,如能在這個階段就將這些HIV感染者診斷出來,有利于感染者本人通過自身行為改變或疾病防控部門采取適當(dāng)措施切斷傳播途徑,可以減少”二代病例”的產(chǎn)生,非常有利于艾滋病疫情的控制。第3版《國家免費艾滋病抗病毒藥物治療手冊》據(jù)此推薦急性感染期HIV攜帶者應(yīng)當(dāng)接受治療[1]。實際工作中,常使用WB法抗體檢測技術(shù)診斷高危行為者是否感染HIV病毒。但是,人體從接觸病毒到產(chǎn)生較高滴度的抗體,一般要4周左右的時間,所以HIV抗體檢測技術(shù)難以發(fā)現(xiàn)病程早期的HIV感染者。而Pooling PCR是一種核酸檢測技術(shù),它利用核酸的體外高效指數(shù)擴增原理,在急性感染期即可檢測出艾滋病高危行為者的血樣中是否存在HIV病毒RNA,在病程早期就可以對就診者/求詢者的艾滋病病毒的感染狀況做出診斷[2];同時,這種技術(shù)也適合用于處理大批量的臨床樣本。國內(nèi)已有單位將Pooling PCR技術(shù)應(yīng)用于獻血員的血液篩查[3],但未見有在男男同性戀(MSM)、性病門診就診者、其他就診者等等人群中應(yīng)用的報道。本項目聯(lián)合江西省內(nèi)4家醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu),在男男同性戀者、性病門診就診者、其他就診者等人群中開展Pooling PCR檢測技術(shù)的應(yīng)用性研究,探討該技術(shù)在醫(yī)療機構(gòu)各就診人群中應(yīng)用的可行性,現(xiàn)報告如下。

      1 材料與方法

      1.1 對象 2016年7月-12月,在南昌市轄區(qū)內(nèi)收集4家醫(yī)療機構(gòu)留存的男男同性戀人群 (疾控中心VCT門診)、性病門診就診者(??漆t(yī)院,部分樣本)、其他就診者(省級綜合性醫(yī)院,部分樣本)、體檢人群(省級綜合性醫(yī)院,部分樣本)的HIV抗體陰性血樣;從艾滋病防治信息系統(tǒng)中導(dǎo)出相應(yīng)單位同時期的檢測數(shù)據(jù)。

      1.2 儀器與試劑 儀器為羅氏cobas AmpliPrep/TaqMan全自動核酸檢測系統(tǒng);試劑為配套的COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan HIV-1 Test,v2.0。

      1.3 方法 集合核酸法[4]

      1.3.1 樣品集合程序 在登記表格上記錄一級和二級集合及對應(yīng)的原始樣品編號;吸取130μl樣品,移入標(biāo)記二級集合的離心管中;10例樣品形成一個1300μl的二級集合樣品,充分渦旋震蕩混勻;從5個二級集合管中分別吸取210μl樣品,移入標(biāo)記有一級集合的離心管中,形成由50例樣品1050μl體積組成的一級集合樣品,充分渦旋震蕩混勻;從每個一、二級集合管中吸取1000μl集合樣品,分裝至另一相應(yīng)標(biāo)記的S-tube管,用羅氏病毒載量檢測試劑進行檢測;制備陰性集合外部質(zhì)控品:使用50例HIV抗體和核酸陰性樣品,按上述步驟,分別集合成5個陰性二級集合外部質(zhì)控品和1個一級集合外部質(zhì)控品;制備陽性集合外部質(zhì)控品:從9例HIV抗體和核酸陰性樣品和一份至少含有HIV RNA103c/ml陽性樣品中,分別移取130μl加入離心管中,形成一個1300μl的陽性二級集合外部質(zhì)控品。再分別從4個已制備好的陰性二級集合外部質(zhì)控品和上述陽性二級集合外部質(zhì)控品中,移取210μl至標(biāo)記為一級陽性集合外部質(zhì)控品的離心管中,形成一級陽性集合外部質(zhì)控品;一級和二級陰、陽性集合外部質(zhì)控品分別用于RT-PCR中每一輪一級和二級集合樣品的檢測。

      1.3.2 樣品的分解檢測程序 用羅氏CTM96病毒載量儀及配套的試劑盒對一級集合樣品進行檢測,陽性反應(yīng)的一級集合樣品進入下一檢測步驟;用上述檢測方法對所有組成陽性一級集合的二級集合樣品進行檢測,陽性反應(yīng)的二級集合樣品進入下一檢測步驟;用上述檢測方法檢測所有組成陽性二級集合樣品的的10例單個樣品,確定核酸陽性的單個樣品。

      2 結(jié)果

      2.1 不同人群HIV核酸陽性率情況 本研究共收集樣本2644例,其中,男男同性戀人群全部樣本做了核酸檢測;其它3類人群因研究經(jīng)費所限,只抽取了部分抗體陰性的樣本做核酸檢測。但HIV抗體陽性的樣本通過給病人做HIV病毒載量的途徑全部做了核酸檢測。男男同性戀人群HIV核酸陽性率為554.27/萬,根據(jù)徐紅等人報道,感染率更高[5];性病門診就診者人群次之,為不低于119.13/萬,數(shù)據(jù)高于古彩虹[6]等人報道,低于鄭伯敏[7]報道,與李桂英[8]等人報道接近;體檢人群沒有發(fā)現(xiàn)HIV核酸陽性;醫(yī)療機構(gòu)1的其他就診者人群核酸陽性率(≥85.54/萬)要高于醫(yī)療機構(gòu)2的其他就診者人群(≥21.04/萬)。4個醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)所留存的4類人群的抗體檢測陰性樣本中有2類人群檢出HIV病毒核酸陽性,共檢出病程早期感染(HIV抗體陰性,但核酸陽性)樣本3例,其中男男同性戀人群檢出2例、性病門診就診者人群檢出1例。見表1。

      2.2 Pooling PCR檢測技術(shù)成本分析 一般國產(chǎn)第三代酶聯(lián)HIV抗體檢測試劑均價5元/人份左右;發(fā)光法檢測試劑則成本稍高,為25元/人份左右。對于Pooling PCR方法,1份檢測試劑價格在500元左右。但是,如果混合50例樣本做一個Pool,則相當(dāng)于10元/人份樣本,如混合100例樣本做一個Pool,則檢測試劑成本低至5元/人份樣本。集合的大小可以根據(jù)工作經(jīng)費情況來定。工作經(jīng)費充足,則可以做小集合(50例樣本),用于發(fā)現(xiàn)更低HIVRNA拷貝數(shù)的患者;工作經(jīng)費相對不足,則可以做較大的集合(100份樣本)。

      表1 4個醫(yī)療機構(gòu)中4類就診人群HIV核酸陽性率情況

      3 討論

      在艾滋病防制中,找到病毒感染者并加以有效管理是控制艾滋病流行的有效方法。最理想的情況是,在病程早期即急性感染階段即將HIV病人診斷出來,從而避免配偶/性伴之間的傳播[9]。因方法本身的局限性,用抗體檢測技術(shù)篩查高危人群時,會導(dǎo)致“漏掉”病程早期(急性感染期)的那一部分感染者;因為,人體免疫系統(tǒng)接觸到病毒后一般要4周左右的時間才能產(chǎn)生較高滴度的抗體,所以,使用HIV抗體檢測方法難以發(fā)現(xiàn)早期艾滋病病毒感染者。而Pooling PCR方法正好可以解決這個問題。它是一種核酸檢測技術(shù),它可以檢測出有高危行為者的血樣中的HIV病毒RNA,在疾病早期就可以對就診病人的艾滋病病毒的感染狀況做出診斷。本研究提示男男同性戀(MSM)[10]、性病門診就診者(STD)人群檢HIV核酸陽性率分別排第一、第二位。其中男男同性戀人群HIV核酸陽性率為 554.27/萬,與李東民等人報道接近[11];性病門診就診者人群次之,為不低于 119.13/萬[12,13]。 這2類人群均檢出急性感染期的HIV病毒攜帶者。另外,即使同為“其他就診者”人群,兩個醫(yī)療機構(gòu)的這個人群的核酸陽性率也有差異,原因在于,“醫(yī)療機構(gòu)1”為結(jié)核病收治醫(yī)院,艾滋病病毒感染者更有可能因發(fā)熱、皮膚疾病、咳嗽 (結(jié)核病引起)、腹瀉等非特異性傳染病癥狀而去傳染病醫(yī)院求診,進而被診斷出來[14]。理論上來說,在傳染病醫(yī)院或感染科/發(fā)熱門診也更有可能發(fā)現(xiàn)早期HIV攜帶者[15]。眾所周知,在HIV感染的早期階段即開始抗病毒治療,有利于感染者的免疫重建,從而有利于病人的救治;更為重要的是,因為病程早期(急性感染期)艾滋病病毒感染者體內(nèi)病毒復(fù)制活躍,其通過性行為等途徑感染配偶/性伴的效率最高,如能在此時將這些感染者診斷出來,非常有利于感染者本人通過行為改變及衛(wèi)生防疫部門采取適當(dāng)措施切斷傳播途徑,以減少二代病例的產(chǎn)生,非常有利于艾滋病疫情的防控。

      綜上可見,Pooling PCR技術(shù)較抗體檢測方法更為敏感。本人早前的研究表明,自愿咨詢檢測者及其他就診者是江西省HIV感染者病例報告數(shù)多且感染率高的人群[16],預(yù)期使用Pooling PCR技術(shù)能在這兩類人群中發(fā)現(xiàn)早期HIV感染者,后續(xù)可以做擴大樣本的研究。建議將該方法推廣應(yīng)用于男男同性戀、性病門診就診者、自愿咨詢檢測者及其他就診者(感染科病人),作為這幾類人群的常規(guī)檢測手段,用于診斷病程早期(HIV抗體陰性但核酸陽性)的艾滋病病毒感染者。另外,應(yīng)用Pooling PCR檢測技術(shù)檢測的是混合樣本,人均檢測成本并不高。所以,這方法用于就診的其他人群也是可行的。在實驗室人員技術(shù)能力、設(shè)備條件都具備的情況下,可以考慮用Pooling PCR檢測技術(shù)取代HIV抗體檢測方法。

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