何紅星
摘 要:本文通過(guò)PCR技術(shù)中變性、復(fù)性、延伸三個(gè)環(huán)節(jié)及其循環(huán),應(yīng)用概念模型、物理模型及數(shù)學(xué)模型等方法構(gòu)建,將抽象微觀的知識(shí)通過(guò)親手構(gòu)建變成具體的模型,從而突破學(xué)習(xí)難點(diǎn).
關(guān)鍵詞:模型建構(gòu);PCR技術(shù);變性;復(fù)性;延伸
PCR技術(shù)(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))是高中生物人教版選修三基因工程中目的基因體外擴(kuò)增的重要學(xué)習(xí)內(nèi)容,在刑事偵破、古生物研究、基因序列分析、基因檢測(cè)等方面,只要提供微量的DNA分子就能通過(guò)PCR技術(shù)進(jìn)行體外擴(kuò)增,獲得大量的DNA分子,因此,應(yīng)用廣泛,為生物學(xué)命題提供大量的素材,更重要的是架起學(xué)生科學(xué)探究和理性思維的平臺(tái).學(xué)生已經(jīng)具備了DNA復(fù)制的相關(guān)知識(shí),但在平時(shí)教學(xué)和學(xué)生訓(xùn)練中,對(duì)于PCR技術(shù)學(xué)習(xí)的深度和廣度把握不好,對(duì)引物設(shè)計(jì)理解不到位,學(xué)校缺乏相應(yīng)儀器,學(xué)生常常感
到PCR技術(shù)內(nèi)容抽象,給學(xué)習(xí)帶來(lái)一定的困難.
模型構(gòu)建是學(xué)習(xí)生物學(xué)的一種重要的科學(xué)方法,有利于學(xué)生主動(dòng)學(xué)習(xí),體驗(yàn)科學(xué)探究過(guò)程,增加思維強(qiáng)度,延伸思維寬度,拓展思維深度,從而培養(yǎng)學(xué)生的理性思維,提高學(xué)習(xí)效率.
1 應(yīng)用概念模型厘清概念
活動(dòng)1:建立思維導(dǎo)圖,梳理知識(shí)脈絡(luò),引領(lǐng)學(xué)生對(duì)核心概念有序?qū)W習(xí).
2 物理模型體驗(yàn)PCR技術(shù)擴(kuò)增過(guò)程
活動(dòng)2:表1圖解為第一次循環(huán)結(jié)果,每?jī)扇艘唤M相互配合用卡紙剪出并用透明膠粘貼或根據(jù)引物、堿基互補(bǔ)關(guān)系畫(huà)出第一次循環(huán),依次構(gòu)建第二次循環(huán)、第三次循環(huán)結(jié)果,構(gòu)建過(guò)程中任務(wù)驅(qū)動(dòng)思考下列問(wèn)題:
①為何要引物?(DNA聚合酶無(wú)法單獨(dú)開(kāi)始復(fù)制,即無(wú)法憑空開(kāi)始往模板上添加對(duì)應(yīng)的核苷酸,它必須有一段引物與模板形成雙鏈后在DNA聚合酶的作用下繼續(xù)鏈的延伸.
②觀察DNA雙鏈一條是5′ → 3′方向,另一條是3′→5′方向得出什么結(jié)論?(DNA的兩條鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械模?/p>
③擴(kuò)增產(chǎn)物DNA片段和DNA復(fù)制是否完全相同,擴(kuò)增產(chǎn)物DNA片段是否等長(zhǎng),至少循環(huán)幾次后出現(xiàn)等長(zhǎng)的DNA片段.
④例如DNA模板鏈片段5′ATTGGCTAG-3′3′TAACCGATC-5′,DNA聚合酶只能從5′→ 3′方向延伸合成互補(bǔ)鏈(對(duì)應(yīng)模板3′→5′方向),有上下兩個(gè)引物相對(duì)而行的, 引物 DNA序列是按模板設(shè)計(jì)互補(bǔ)的寡核苷酸鏈,且引物 DNA序列一般很少和模板最端部堿基配對(duì),假設(shè)引物1堿基TG對(duì)應(yīng)模板AC,引物2堿基TA對(duì)應(yīng)模板AT,讓學(xué)生根據(jù)模板鏈和引物關(guān)系依次構(gòu)建3~4次循環(huán)相關(guān)的DNA序列.
3 數(shù)學(xué)模型
活動(dòng)3:模擬建構(gòu)過(guò)程,歸納推理得出N次循環(huán)后含有引物1和引物2的DNA分子數(shù)均為2n-1;既含有引物A又含有引物B的DNA分子數(shù)為2n-2;擴(kuò)增N次后DNA分子片段類(lèi)型歸納:如圖3出現(xiàn)五種類(lèi)型(類(lèi)型1:只含引物1,兩鏈不等長(zhǎng)既引物1延伸與母鏈互補(bǔ)無(wú)論循環(huán)多少次,始終只有1條;類(lèi)型2:只含引物2,兩鏈不等長(zhǎng),既引物2延伸與母鏈互補(bǔ),無(wú)論循環(huán)多少次始終也只有1條;類(lèi)型3:既含有引物1又含有引物2,含引物1鏈較含引物2鏈長(zhǎng),N次循環(huán)后有N-1條;類(lèi)型4:既含有引物1又含有引物2,含引物2鏈較含引物1鏈長(zhǎng),N次循環(huán)后也是有N-1條;類(lèi)型5:既含有引物1又含有引物2,兩鏈等長(zhǎng),N次循環(huán)后有2n-2n條.
結(jié)合物理模型分析可知,DNA復(fù)制結(jié)果一般形成等長(zhǎng)的DNA,復(fù)制結(jié)果DNA類(lèi)型只有一種,PCR技術(shù)一般要到第三輪才出現(xiàn)等長(zhǎng)的DNA,如果引物也從最端部開(kāi)始,則DNA類(lèi)型也只有一種.
4 拓展延伸:電泳DNA測(cè)序模型
循環(huán)產(chǎn)物也可以用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA類(lèi)型,不同DNA有自己相應(yīng)的條帶,不同大小的DNA有不同位置,越靠前的電泳速度快,通過(guò)比較,可進(jìn)行基因診斷、結(jié)合遺傳圖譜分析DNA親緣關(guān)系等遺傳學(xué)命題的熱點(diǎn).
5 課后提升:動(dòng)態(tài)模型設(shè)計(jì)
學(xué)生繼續(xù)查閱PCR技術(shù)相關(guān)資料(包括發(fā)展史、引物設(shè)計(jì)、熱穩(wěn)定性聚合酶作用機(jī)理),觀看PCR技術(shù)視頻,網(wǎng)上查閱電子、機(jī)械制作原理,結(jié)合科技創(chuàng)新活動(dòng),嘗試動(dòng)手設(shè)計(jì)制作PCR動(dòng)態(tài)模型,學(xué)生在課外科技活動(dòng)中熱情高,學(xué)習(xí)生物學(xué)興趣深厚,培養(yǎng)學(xué)生熱愛(ài)科學(xué)、尊重科學(xué),體驗(yàn)科技探究過(guò)程,享受創(chuàng)新成果.
通過(guò)模型建構(gòu),學(xué)生親身體會(huì)知識(shí)形成,加強(qiáng)了學(xué)生的思維訓(xùn)練,讓學(xué)生頭腦動(dòng)起來(lái),巧手動(dòng)起來(lái),課堂氣氛活起來(lái),真正感知科學(xué)本質(zhì),踐行核心素養(yǎng)的生命觀點(diǎn)、科學(xué)探究和理性思維,對(duì)微觀生命理解更加深刻透徹.
參考文獻(xiàn):
[1]顧瑩瑩. 建構(gòu)物理模型 突破結(jié)構(gòu)難點(diǎn)[J]. 中學(xué)生物教學(xué), 2016(12):23-24.
[2]楊菲菲. 物理模型建構(gòu)在 PCR 技術(shù)教學(xué)中的應(yīng)用[J]. 生物學(xué)教學(xué), 2015, 40(09):22-23.
[3]孟凡龍. 借助模型建構(gòu)突破基因工程二輪復(fù)習(xí)中的難點(diǎn)[J]. 實(shí)驗(yàn)教學(xué)與儀器,2016,33(12):20-22.
[4]沈靜丹. 淺談PCR技術(shù)[J]. 生物學(xué)教學(xué), 2014, 39(02):58-59.
(收稿日期:2019-04-02)