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      RRP15過表達對核糖體生物發(fā)生和細胞增殖的影響

      2019-10-15 07:57:28印熙娣董智雄朱長軍
      關(guān)鍵詞:核仁核糖體前體

      印熙娣,陳 瑾,戈 靖,董智雄,4,朱長軍,4

      (1.天津師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,天津 300387;2.天津師范大學(xué)天津市動植物抗性重點實驗室,天津 300387;3.中國科學(xué)院生物化學(xué)與細胞生物學(xué)研究所 中國科學(xué)院分子細胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心,上海 200031;4.天津師范大學(xué)分子細胞系統(tǒng)生物學(xué)重點實驗室,天津 300387)

      核仁(Nucleolus)是真核細胞內(nèi)無膜包被的亞細胞結(jié)構(gòu),是真核細胞核糖體生物發(fā)生的場所.核仁通過控制核糖體的生物發(fā)生和蛋白質(zhì)合成調(diào)控細胞的生長、增殖、分化、代謝及應(yīng)激等各項基本生命活動,核糖體生物發(fā)生的異常會引發(fā)貧血癥、腫瘤等多種人類疾病[1-4].核糖體RNA 加工蛋白15(Ribosome RNA processing protein 15,RRP15)的 cDNA 序列全長有849 個核苷酸,編碼283 個氨基酸,相對分子質(zhì)量約為45×103.RRP15 蛋白在生物進化中高度保守,如在酵母中,RRP15p 參與核糖體60S 大亞基的生物發(fā)生[5];在小鼠中,RRP15 可以調(diào)節(jié)細胞增殖和細胞凋亡,并在核糖體RNA 加工中發(fā)揮重要作用[6].有研究表明[7-8],RRP15 集中定位于核仁,散布于細胞質(zhì).RRP15 除了參與pre-RNA剪切加工以外,還參與調(diào)控rDNA 轉(zhuǎn)錄,抑制RRP15表達可導(dǎo)致細胞內(nèi)47S pre-rRNA 明顯降低,干涉掉RRP15后核仁出現(xiàn)彌散現(xiàn)象,核仁結(jié)構(gòu)遭到破壞.RRP15缺失會引起嚴重的核糖體壓力(Ribosome stress),導(dǎo)致p53 功能正常的非轉(zhuǎn)化二倍體細胞RPE1 的細胞周期阻滯在G1-G1/S 期,而p53 功能缺陷的腫瘤細胞HeLa和MCF7 阻滯在S-G2/M 期,最終走向凋亡[7-8].這些研究結(jié)果暗示RRP15 可能作為一個腫瘤治療的靶標,應(yīng)用于治療p53 缺陷腫瘤.通過Oncomine 數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn),RRP15 在宮頸鱗癌中的表達量明顯高于正常子宮頸組織中的表達量.

      以往研究多針對RRP15 表達缺失對腫瘤發(fā)生的影響,RRP15 過表達對核糖體生物發(fā)生及細胞生長增殖等的影響還不清楚.為此,本研究構(gòu)建RRP15 過表達的人宮頸癌細胞HeLa 穩(wěn)篩細胞株及其對照細胞株,利用細胞免疫熒光、核糖體前體提取、MTT 以及蛋白免疫印跡等技術(shù),研究RRP15 過表達對Hela 細胞的核仁結(jié)構(gòu)、核糖體生物發(fā)生、細胞生長增殖等的影響.

      1 材料與方法

      1.1 材料與儀器

      1.1.1 實驗材料

      人宮頸癌細胞株HeLa,購自美國模式菌種收集中心(ATCC);pFlag、pFlag-RRP15 質(zhì)粒為本實驗室所有.

      1.1.2 試劑

      DMEM 培養(yǎng)基,美國Gibco 公司;胎牛血清,美國Hyclone 公司;Opti-MEM、Lipofectamine 3000、P3000、熒光標記或辣根過氧化物酶(HRP)標記的二抗和DAPI,美國 Thermo Fisher Scientific 公司;特異性鼠抗α-Tubulin 單克隆抗體、特異性鼠抗Flag 單克隆抗體,美國Sigma 公司;特異性兔抗RRP15 多克隆抗體,由實驗室自制;特異性鼠抗UBF 單克隆抗體,美國Santa Cruz 公司;特異性鼠抗Nucleolin 單克隆抗體,英國 Abcam 公司;新霉素(G418),德國 Calbiochem 公司;NP-40、 二甲基亞砜,北京索萊寶科技有限公司;MTT,上海碧云天生物技術(shù)有限公司.

      1.1.3 儀器

      蛋白電泳儀、 酶標儀,美國Bio-Rad 公司;Nikon TS-100 FL 倒置熒光顯微鏡,日本Nikon 公司;超聲波細胞粉碎儀,寧波新芝生物科技有限公司;5417R 高速離心機,德國 Eppendorf 公司;Optima L-80 XP 超速離心機,美國貝克曼公司;NanoDrop 2000 超微量分光光度計,美國Thermo Fisher Scientific 公司.

      1.2 實驗方法

      1.2.1 細胞培養(yǎng)及傳代

      用含有胎牛血清(體積分數(shù)為10%)的DMEM 培養(yǎng)基培養(yǎng)人宮頸癌細胞株HeLa,于37 ℃、CO2體積分數(shù)為5%的培養(yǎng)箱中培養(yǎng).2~3 d 后觀察細胞匯合度達到80%~90%,即可用含有EDTA(質(zhì)量分數(shù)為0.02%)的胰酶消化處理進行傳代培養(yǎng).

      1.2.2 細胞轉(zhuǎn)染

      在 24 孔板中,每孔加入 500 μL 的 DMEM 培養(yǎng)基,接種2×104個HeLa 細胞,混勻后置于細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h.按照說明書采用Lipofectamine 3000 轉(zhuǎn)染試劑分別轉(zhuǎn)染0.2 μg 的 pFlag-RRP15 或 pFlag 質(zhì)粒.混勻后置于細胞培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)24 h.

      1.2.3 G418 篩選

      細胞轉(zhuǎn)染24 h 后,用胰酶進行消化,收集細胞后轉(zhuǎn)移到10 cm 的培養(yǎng)皿中,每皿中加入含G418(750 μg/mL)的 DMEM 培養(yǎng)基.培養(yǎng) 5 d 后,更換新鮮的含G418 的DMEM 培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng).10 d 后在倒置熒光顯微鏡下挑取細胞單克隆,置于24 孔板中培養(yǎng),待細胞生長擴增后轉(zhuǎn)移至10 cm 培養(yǎng)皿中繼續(xù)擴增培養(yǎng).

      1.2.4 蛋白免疫印跡雜交(Western blot)

      收集細胞,用1×Sample Buffer 裂解,所得裂解液進行SDS-PAGE 電泳,之后轉(zhuǎn)移至PVDF 膜.用含有質(zhì)量分數(shù)為5%的脫脂奶粉的TBS 緩沖液室溫封閉30 min.隨后室溫一抗孵育2 h,二抗孵育1 h,最后加入ECL顯色液,室溫孵育2 min.暗室曝光,檢測目的條帶.

      1.2.5 細胞免疫熒光(Immunofluorescence,IF)

      向鋪有細胞爬片的35 mm 平板中接種1.5×105個細胞,置于細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h.取出爬片,每板用1 mL 的PBS 洗3 次.之后后用3 mL 福爾馬林固定液室溫固定細胞15 min,棄去固定液,用PBS 洗3 次,再用含有0.1 mol/L 甘氨酸的PBS 終止固定反應(yīng).加入100 μL 封閉液室溫封閉30 min,棄去封閉液.用含有Triton X-100(質(zhì)量分數(shù)為 0.1%)的 PBST 洗 3 次.隨后一抗室溫孵育2 h,熒光標記的二抗室溫避光孵育1 h,再用 1 μg/mL 的 DAPI 染色 3 min.封片,鏡檢.

      1.2.6 核糖體前體提取

      分別將3.7 mL 的質(zhì)量分數(shù)為30%、20%和10%的蔗糖依次緩慢加入到超速離心管(14 mm×89 mm)內(nèi),使用 SW41 Ti 轉(zhuǎn)子在 4 ℃、 230 000 r/min 下離心 3 h,建立提取核糖體前體所需的連續(xù)蔗糖密度梯度.用刮刀輕輕刮下 HeLa 細胞(3×106),收集到離心管中,4 ℃、500 r/min 下離心 5 min,用冰冷的 PBS 洗 3 次.用 2 mL低鹽緩沖液(LSB)輕柔重懸細胞,冰上靜置10 min,4 ℃、500 r/min 下離心 5 min.再用 2 mL LSB+(含蛋白酶抑制劑)重懸沉淀,補加66 μL 體積分數(shù)為10%的NP-40 和44 μL 體積分數(shù)為10%的脫氧膽酸鈉,劇烈震蕩 30 s,4 ℃、1 000 r/min 下離心 5 min.用 2 mL 的LSB+重懸沉淀,4 ℃、1 000 r/min 下離心 5 min.用500 μL 超聲裂解緩沖液重懸沉淀,用15%的功率超聲裂解細胞核,超聲 1 s 停止 10 s,超聲 3~5 次,4 ℃、15 000 r/min下離心15 min.將上清小心加入到已建立好的連續(xù)蔗糖密度梯度上,4 ℃、230 000 r/min 下離心3 h.

      在離心后的離心管底部打適當大小的孔,將樣品以等體積的量(600~700 μL)收集到 1.5 mL 離心管中.檢測260 nm 處的吸光值A(chǔ)260確定RNA 含量,從而確定核糖體前體在每一管中的豐度大小.根據(jù)測量得到的每一管樣品的A260繪制相對應(yīng)的曲線圖.

      1.2.7 MTT 實驗

      在96 孔板中每孔接種3 000 個細胞,每種細胞5 個重復(fù).待細胞貼壁完成后,每孔加入20 μL 體積分數(shù)為0.5%的MTT 溶液,37 ℃避光培養(yǎng)4 h 后終止培養(yǎng),小心吸棄孔內(nèi)的培養(yǎng)液.每孔加入100 μL 二甲基亞砜(DMSO),37 ℃孵育30 min,用酶標儀檢測492 nm波長下每孔的吸光值.

      2 結(jié)果與分析

      2.1 HeLa-Flag RRP15過表達穩(wěn)篩細胞株的構(gòu)建

      通過質(zhì)粒轉(zhuǎn)染和G418 篩選,收集挑選的陽性克隆細胞并進行裂解,利用Western blot 檢測細胞內(nèi)源和外源的RRP15 表達水平.在所挑選的18 個克隆中,有6 個克隆表達外源性Flag-RRP15 蛋白,其中,6#克隆表達的外源性Flag-RRP15 蛋白與內(nèi)源性RRP15 水平相近,如圖1(a)所示.經(jīng)過灰度值測定得出,外源RRP15 的表達量是內(nèi)源的1.13 倍;而對照細胞(HeLa-Flag)不表達外源性Flag-RRP15 蛋白.

      為進一步確定篩選的穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細胞中外源性Flag-RRP15 蛋白在細胞內(nèi)的定位,利用純化的兔抗RRP15 抗體和鼠抗Flag 抗體對細胞進行免疫熒光染色,結(jié)果如圖1(b)所示.在低倍鏡下,HeLa-Flag 和HeLa-Flag RRP15 細胞均可以被Flag 染色,表明所有細胞均表達了外源性蛋白;在高倍鏡下,對照細胞HeLa-Flag 中Flag 染色均勻分散在整個細胞中,無特異性定位,而Flag-RRP15 過表達細胞株中Flag(外源性Flag-RRP15)與內(nèi)源性RRP15 共定位,主要集中定位于核仁,少量散布于細胞質(zhì)中,與本課題組的前期報道一致[8].由此證實,穩(wěn)定過表達外源Flag-RRP15的細胞株構(gòu)建成功.

      圖1 RRP15 過表達穩(wěn)篩細胞株的鑒定Fig.1 Establishment of the RRP15-overexpressed stable cell lines

      2.2 RRP15過表達對細胞核仁結(jié)構(gòu)的影響

      本課題組前期研究發(fā)現(xiàn),干涉細胞內(nèi)RRP15 的表達后,核仁結(jié)構(gòu)被破壞,核仁定位的蛋白質(zhì)出現(xiàn)彌散現(xiàn)象[8],但是RRP15 過表達對核仁的影響并不明確.因此利用構(gòu)建的HeLa-Flag 和HeLa-Flag RRP15 細胞株,分析RRP15 過表達對核仁產(chǎn)生的影響,結(jié)果如圖2 所示.

      圖2 過表達RRP15 對核仁的影響Fig.2 Effect of RRP15 overexpression on nucleolus

      HeLa-Flag 和HeLa-Flag RRP15 細胞分別固定后,利用鼠抗nucleolin 抗體分別對2 種細胞進行染色,結(jié)果如圖2(a)所示.由圖2(a)可以看出,RRP15 過表達后,Hela-Flag RRP15 細胞內(nèi)核仁的數(shù)量明顯增加.對HeLa-Flag 和HeLa-Flag RRP15 細胞的核仁數(shù)量進行統(tǒng)計,結(jié)果如圖2(b)所示.由圖2(b)可以看出,HeLa-Flag RRP15 細胞的核仁數(shù)量顯著超過HeLa-Flag 細胞的核仁數(shù)量,與免疫熒光檢測的結(jié)果一致.檢測核仁相關(guān)蛋白的表達水平,結(jié)果如圖2(c)所示,RRP15 過表達導(dǎo)致細胞內(nèi)核仁相關(guān)蛋白(Nucleolin 和UBF)的表達水平顯著升高.這些結(jié)果均表明,RRP15 的過表達可導(dǎo)致細胞內(nèi)的核仁數(shù)量顯著增加.

      2.3 RRP15過表達對核糖體生物發(fā)生的影響

      通過蔗糖密度梯度離心方法分別提取HeLa-Flag和HeLa-Flag RRP15 細胞中的核糖體大小亞基前體,分析RRP15 過表達對2 種細胞核糖體生物發(fā)生的影響,結(jié)果如圖3 所示.由圖3 可以看出,RRP15 過表達后,與 Hela-Flag 細胞相比,Hela-Flag RRP15 細胞的核糖體大亞基前體(pre-60S)和核糖體小亞基前體(pre-40S)的水平均明顯提高,這一結(jié)果表明RRP15 過表達明顯促進了細胞的核糖體生物發(fā)生.

      圖3 RRP15 過表達對核糖體生物發(fā)生的影響Fig.3 Effect of RRP15 overexpression on ribosome biogenesis

      2.4 RRP15過表達對細胞生長增殖的影響

      將同樣數(shù)量的HeLa-Flag 和HeLa-Flag RRP15 細胞分別鋪在96 孔板中,在不同時間內(nèi)檢測2 種細胞的增殖速率,結(jié)果如圖4(a)所示.由圖4(a)可以看出,與Hela-Flag 細胞相比,RRP15 過表達后,Hela-Flag RRP15 細胞的增殖速率明顯提高,隨著培養(yǎng)時間的延長,二者差距增大,120 h 時Hela-Flag RRP15 細胞的增殖量為對照細胞的1.6 倍.利用Western blot 進一步分析細胞周期相關(guān)蛋白的表達,結(jié)果如圖4(b)所示.HeLa-Flag RRP15 中細胞周期蛋白cyclin D1 和cyclin B1 的表達水平明顯高于HeLa-Flag 細胞的表達水平.由此證實,RRP15 過表達導(dǎo)致細胞增殖能力增強.

      圖4 RRP15 過表達對細胞生長增殖的影響Fig.4 Effect of RRP15 overexpression on cell proliferation

      3 討論與結(jié)論

      核仁是真核細胞內(nèi)核糖體生物發(fā)生的場所,核糖體負責(zé)細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的合成.核糖體生物發(fā)生的異常與人類多種疾病尤其是腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),如髓增生異常綜合癥[9]、先天性再生障礙性貧血[10]、結(jié)腸癌等[11].有研究表明,RPL11、RPL5 以及 5S rRNA 可形成蛋白核酸復(fù)合體,抑制癌基因Mdm2 的E3 泛素連接酶活性,Mdm2 可作為E3 泛素連接酶泛素化抑癌基因p53,從而使細胞內(nèi)的p53 蛋白表達維持在較低水平[12-15].這一代謝調(diào)節(jié)通路的異常會導(dǎo)致多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展[11,16-17]:細胞受到外界刺激時會發(fā)生應(yīng)激反應(yīng),產(chǎn)生核糖體壓力,在核糖體壓力條件下,RPL11 和RPL5 從核仁釋放到細胞核基質(zhì)中,與5S rRNA 以及Mdm2 形成復(fù)合體,抑制Mdm2 對p53 的泛素化,使細胞內(nèi)p53 的蛋白水平升高(RP-Mdm2-p53 通路),從而激活細胞周期檢驗點,引起細胞周期的阻滯[18-19].RRP15的缺失也會引起嚴重的核糖體壓力,影響p53 的正常表達[8].

      為了解RRP15 過表達與腫瘤發(fā)生發(fā)展的關(guān)系,本課題組構(gòu)建了穩(wěn)定過表達RRP15 的HeLa 細胞株HeLa-Flag RRP15 及其對照細胞株HeLa-Flag。 研究發(fā)現(xiàn)RRP15 在子宮頸癌細胞中的過表達不僅可以使核仁數(shù)量增多,核仁蛋白的表達量上調(diào),還可以使細胞的核糖體大小亞基前體的水平上調(diào),細胞生長增殖速率加快,細胞周期相關(guān)蛋白的表達量增加.這些結(jié)果意味著RRP15 的過表達對腫瘤的發(fā)生發(fā)展具有潛在促進作用.在今后研究中,本課題組將進一步收集子宮頸癌的病例樣本,詳細分析RRP15 與子宮頸癌發(fā)病的關(guān)系,為最終明確RRP15 在腫瘤發(fā)生中的作用機制提供理論依據(jù).

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