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      澳洲堅(jiān)果MiMYB2基因克隆及結(jié)構(gòu)與功能分析

      2020-03-05 04:05:26王文林陳海生鄭樹芳樊松樂王立豐譚秋錦覃振師黃錫云湯秀華
      植物研究 2020年6期
      關(guān)鍵詞:堅(jiān)果擬南芥澳洲

      王文林 陳海生* 鄭樹芳 樊松樂 王立豐 譚秋錦覃振師 黃錫云 賀 鵬 湯秀華 許 鵬

      (1. 廣西南亞熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,龍州 532400;2. 海南大學(xué)熱帶作物學(xué)院,海南省熱帶生物資源可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,???70228;3. 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部橡膠樹生物學(xué)與遺傳資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;省部共建國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地-海南省熱帶作物栽培生理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;農(nóng)業(yè)農(nóng)村部儋州熱帶作物科學(xué)觀測實(shí)驗(yàn)站;中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院橡膠研究所,海口 571101)

      澳洲堅(jiān)果(Macadamia integrifolia)是一種原產(chǎn)于澳大利亞的常綠喬木果樹,其果仁含有豐富的不飽和脂肪酸、蛋白質(zhì)、氨基酸、可溶性糖、膳食纖維和礦物質(zhì)等營養(yǎng)成分,具有藥用和保健等功能[1]。澳洲堅(jiān)果果仁可加工成飲品、食品和果油等[2-3]。澳洲堅(jiān)果副產(chǎn)品,比如果殼可用于制備活性炭[4]和吸附劑[5],油粕可用于生產(chǎn)動(dòng)物飼料[1]和多肽[6]等,經(jīng)加工后可提高其經(jīng)濟(jì)附加值。我國澳洲堅(jiān)果品種主要是經(jīng)過試種馴化的國外優(yōu)良品種。國外優(yōu)良品種在我國試種期間,經(jīng)常面臨產(chǎn)量及品質(zhì)降低的問題[7]。這是由于我國澳洲堅(jiān)果主要種植地域分布在廣西、云南、貴州和四川,隨著環(huán)境的變化,各種病蟲害如花疫病、枝枯病、炭疽病、蚜蟲和蛾類等[8],干旱[9]、磷[10]、低溫[11]等不可預(yù)測的非生物脅迫和生物脅迫對澳洲堅(jiān)果的生長發(fā)育、品質(zhì)和產(chǎn)量均有影響,制約了其產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。

      MYB轉(zhuǎn)錄因子是一個(gè)植物轉(zhuǎn)錄因子家族。其中MYB 家族成員R2R3-MYBs 參與了多種生物過程,包括生長發(fā)育、激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、代謝、生物脅迫和非生物脅迫等。例如,AtMYB77 和ARF7 相互作用參與擬南芥生長素的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)[12]。AtMYB32參與擬南芥花粉正常的發(fā)育[13]。楊樹MYB165 和MYB194屬于R2R3-MYB家族,啟動(dòng)子激活實(shí)驗(yàn)表明MYB194 和MYB165 抑制原花青素生物合成相關(guān)基因啟動(dòng)子激活,過表達(dá)MYB165 和MYB194 轉(zhuǎn)基因楊樹導(dǎo)致葉片花青素積累減少,根系原花青素含量降低[14]。R2R3-MYB 家族轉(zhuǎn)錄因子成員AtMYB102 對 昆 蟲 草 食 動(dòng) 物 菜 青 蟲 有 抗 性[15]。PbrMYB21 在耐旱性方面發(fā)揮著積極的作用[16]。迄今,澳洲堅(jiān)果轉(zhuǎn)錄調(diào)控方面的研究和MYB 家族轉(zhuǎn)錄因子成員的結(jié)構(gòu)與功能信息研究尚屬空白。研究R2R3-MYB 家族成員的結(jié)構(gòu)與功能為闡明澳洲堅(jiān)果抗逆機(jī)制和提高澳洲堅(jiān)果品質(zhì)和產(chǎn)量,促進(jìn)產(chǎn)業(yè)發(fā)展具有重要意義。本研究從“桂熱一號”品種的葉片中克隆MiMYB2 基因,利用生物信息學(xué)對其結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行分析。澳洲堅(jiān)果R2R3-MYB 家族轉(zhuǎn)錄因子成員的結(jié)構(gòu)和功能的深入研究,將為闡明澳洲堅(jiān)果生長發(fā)育和產(chǎn)量形成機(jī)制提供理論參考。

      1 材料與方法

      1.1 試驗(yàn)材料

      試驗(yàn)材料“桂熱一號”和“695”品種由廣西南亞熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所澳洲堅(jiān)果種質(zhì)圃(E106.79.84,N22.14.34)提 供。“桂 熱 一 號”和“695”澳洲堅(jiān)果品種嫁接苗種植于廣西南亞熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所中,2019 年3 月選取2008 年嫁接種植,樹齡為11 年兩品種澳洲堅(jiān)果成年樹健康植株的枝條、花、葉為材料進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析。

      1.2 試驗(yàn)方法

      1.2.1 提取總RNA和cDNA的合成

      按照總RNA 提取試劑盒提供的說明書,提取澳洲堅(jiān)果“桂熱一號”品種葉片的總RNA,RNA 和反轉(zhuǎn)錄得到cDNA 的濃度與純度由Thermo Fisher NanoDrop 2000 超微量核酸蛋白分析儀檢測(Gene Company Limited,上海)。按照TaKaRa 反轉(zhuǎn)錄試劑盒的說明書合成cDNA,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA完整性。

      1.2.2 克隆MiMYB2基因全長

      根據(jù)澳洲堅(jiān)果轉(zhuǎn)錄組測序序列,利用primer primer 6.0 軟 件 設(shè) 計(jì) 引 物MiMYB2F,5′-CGGTCCTTCTCAGTTTCTGC-3′,MiMYB2 R,5′-GCATCCTAACATCCCTGGAA-3′,引物序列由公司合成。以澳洲堅(jiān)果“桂熱一號”品種正常葉片的cDNA 為模板,利用PCR 擴(kuò)增MiMYB2 的全長序列,PCR 反應(yīng)體系20.0 μL:69 μg·L-1cDNA 模板1.0 μL,2×EX-Taq PCR Master Mix 10.0 μL,上、下游引物各0.5 μL,ddH2O 補(bǔ)足至20.0 μL。擴(kuò)增程序:95℃預(yù)變性3 min;95℃30 s,55℃50 s,72℃,80 s,32 個(gè)循環(huán);72℃10 min。將PCR 產(chǎn)物加到0.8%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳檢測,切割目的條帶后回收純化,目的片段連接pMD-18T 載體,16℃水浴 4 h 后,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)胞中,恢復(fù)培養(yǎng)后均勻涂布在含羧芐抗性的培養(yǎng)基上,經(jīng)PCR檢測后挑取陽性克隆測序。

      1.2.3 MiMYB2生物信息學(xué)分析

      利用在線分析工具ProtParam(https://web.expasy.org/protparam/)、TMPred(https://embnet.vitalit.ch/software/TMPRED_form.html)、SMART:Main page (http://smart. embl-heidelberg. de/smart/set_mode.cgi?NORMAL=1)、PHYRE、PlantmPLoc2、PSIPRED V4.0(http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/)、SignalP-5.0 Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)和 MEME(http://meme-suite. org/tools/meme)等對MiMYB2 進(jìn)行生物信息學(xué)預(yù)測分析。利用Clustal Omega 在線工具軟件進(jìn)行多序列比對。MEGAX 軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(neighbor-joining,bootstrap 值設(shè)為1 000)。用于系統(tǒng)進(jìn)化分析的擬南芥和其他物種的蛋白序列均下載自NCBI。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 MiMYB2基因克隆

      按照試劑盒操作方法提取澳洲堅(jiān)果“桂熱一號”品種葉片的總RNA,從圖1 可見RNA 28S,18S和5S 條帶清晰完整且沒有發(fā)生降解(見圖1A)。以cDNA 為模板,采用PCR 擴(kuò)增目的基因,結(jié)果如圖1B 所示,擴(kuò)增出了與預(yù)期大小相符的特異性條帶。以澳洲堅(jiān)果“桂熱一號”品種正常葉片的cDNA 為模板,利用PCR 技術(shù)克隆得到MiMYB2 cDNA 基因全長,測序驗(yàn)證后,將cDNA 序列命名為MiMYB2。將MiMYB2 基因序列上傳至NCBI 數(shù)據(jù)庫,GenBank 登陸號為MN254976,MiMYB2 基因的cDNA 全長序列1 210 bp,包含1 002 bp 的開放閱讀框(ORF)如圖2 下劃線標(biāo)記序列,編碼333 個(gè)氨基酸。

      圖1 澳洲堅(jiān)果桂熱一號RNA檢測及基因克隆結(jié)果A.RNA電泳圖;B.MiMYB2基因PCR擴(kuò)增結(jié)果(M.Marker DL2000;1. 目的基因擴(kuò)增產(chǎn)物)Fig.1 Total RNA of M.ntegrifolia(GUIRE1)and the PCR amplification products of MiMYB2 geneA. Total RNA of M. integrifolia(GUIRE1);B. The PCR amplification products of MiMYB2 gene. M:Marker DL200;1. The objective gene amplification products

      2.2 MiMYB2蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)預(yù)測

      利用ProtParam 工具在線分析MiMYB2 蛋白質(zhì)的理化性質(zhì):分子式C1556H2477N447O511S19,總原子數(shù)5 010,分子量為36.231 61 kDa,等電點(diǎn)5.70,帶負(fù)電荷殘基總數(shù)(Asp+Glu)為42,帶正電殘基總數(shù)(Arg+Lys)為37,不穩(wěn)定系數(shù)為67.68(該蛋白屬于不穩(wěn)定蛋白),脂肪族氨基酸指數(shù)是67.09,總平均親水性為-0.507,推測MiMYB2蛋白是一個(gè)不穩(wěn)定的親水蛋白。

      2.3 MiMYB2蛋白質(zhì)的磷酸化位點(diǎn)、跨膜結(jié)構(gòu)及亞細(xì)胞定位預(yù)測

      圖2 MiMYB2基因測序結(jié)果Fig.2 Sequence result of MiMYB2 gene

      圖3 MiMYB2蛋白的磷酸化位點(diǎn)和跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果A.MiMYB2蛋白的磷酸化位點(diǎn)預(yù)測結(jié)果;B.MiMYB2跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測Fig.3 Prediction of phosphorylation sites and transmembrane structures of MiMYB2 proteinA.Prediction of phosphorylation site of MiMYB2 protein;B.Prediction of transmembrane domain of MiMYB2

      利用NetPhos 3.1 在線分析工具預(yù)測MiMYB2蛋白磷酸化位點(diǎn),結(jié)果表明,MiMYB2 氨基酸序列有可能發(fā)生磷酸化的氨基酸位點(diǎn)共有53 個(gè),絲氨酸磷酸化位點(diǎn)44個(gè),蘇氨酸磷酸化位點(diǎn)7個(gè),酪氨酸磷酸位點(diǎn)2 個(gè)(見圖3A)。根據(jù)MiMYB2 蛋白磷酸化位點(diǎn)預(yù)測結(jié)果,推測MiMYB2 蛋白以絲氨酸為主的磷酸化修飾,調(diào)控澳洲堅(jiān)果的生物功能。利用TMPred 在線工具分析預(yù)測MiMYB2 跨膜結(jié)構(gòu),結(jié)果表明MiMYB2 蛋白無跨膜結(jié)構(gòu),推測Mi-MYB2 是非跨膜蛋白。利用SignalP-5.0 Server 分析預(yù)測MiMYB2 蛋白存在信號肽的概率為0.09%(見圖3B),推測MiMYB2 是非分泌型蛋白。利用PlantmPLoc2 預(yù)測分析MiMYB2 蛋白亞細(xì)胞定位,預(yù)測結(jié)果顯示其定位于細(xì)胞核中,其進(jìn)一步證明MiMYB2 編碼一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子蛋白。

      2.4 MiMYB2 蛋白質(zhì)保守結(jié)構(gòu)域、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)分析

      利用SMART:Main page 分析預(yù)測MiMYB2 蛋白的保守結(jié)構(gòu)域,發(fā)現(xiàn)其存在2 個(gè)SANT 結(jié)構(gòu)域和5 個(gè)低復(fù)雜度其位置排序分別在13-63、66-114、128-143、168-179、214-226、235-246 和253-284 氨基酸處,MiMYB2 氨基酸序列具有兩個(gè)SANT 保守結(jié)構(gòu)域(見圖4B),推測其屬于R2R3-MYB 家族。利用SOPMA 分析MiMYB2 蛋白的二級結(jié)構(gòu),結(jié)果顯示α 螺旋占37.54%,延長鏈占10.81%,β 折疊占6.31%,無規(guī)卷曲占45.35%(見圖4A)。利用PHYRE 分析MiMYB2 的三級結(jié)構(gòu)如圖4C 所示。據(jù)此推測MiMYB2 是一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子并且屬于R2R3-MYB家族成員。

      圖4 MiMYB2結(jié)構(gòu)分析A.MiMYB2二級結(jié)構(gòu)預(yù)測;B.MiMYB2保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測;C.MiMYB2三級結(jié)構(gòu)預(yù)測Fig.4 Structural analysis of MiMYB2A.PredictionforthesecondarystructureofMiMYB2;B.PredictionoftheconserveddomainsofMiMYB2;C.PredictionforthetertiarystructureofMiMYB2

      2.5 MiMYB2系統(tǒng)進(jìn)化分析

      如圖5 所示,澳洲堅(jiān)果MiMYB2(M.integrifolia,MN254975)與荷花NnMYB3-like(Nelumbo nucifera,XP_010255443.1)、荷花Nnmyb-related protein 308-like(Nelumbo nucifera,XP_010273102.1)、醉 蝶 花 ThMYB6(Tarenaya hassleriana,XP_010523735.1)、麻 風(fēng) 樹JcMYB6(Jatropha curcas,XP_012083427.1)和哥倫比亞錦葵HuMYB41(Herrania umbratica,XP_021280626.1)進(jìn)行同源性分析,相似性分別為64.79%,65.99%,59.88%,58.08%和56.18%,其與荷花NnMYB3-like 同源性最高。Clustal 進(jìn)行多序列比對分析并根據(jù)圖4B分析的結(jié)果標(biāo)注MiMYB2 保守結(jié)構(gòu)域SANT(見圖5A)。利用MEME 分析澳洲堅(jiān)果MiMYB2 與其在NCBI數(shù)據(jù)庫中比對親緣性較高的MYB蛋白序列,預(yù)測了排名前三的motif 且標(biāo)注了其在相應(yīng)序列的位置,如圖5B 所示澳洲堅(jiān)果MiMYB2 a(77-126)、b(1-50)、c(339-367),同源性越高的序列,其motif 的大小及位置越接近。Motif 與植物的生物學(xué)功能息息相關(guān)。將MiMYB2 編碼的蛋白序列與BLAST 比對結(jié)果中相似性較高的已知其他植物的MYB 序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,表明MiMYB2 與荷花 NnMYB3-like (Nelumbo nucifera, XP_010255443.1)、荷花Nnmyb-related protein 308-like(Nelumbo nucifera,XP_010273102.1)親緣關(guān)系較近(見圖6A)。系統(tǒng)進(jìn)化分析澳洲堅(jiān)果MiMYB2與126個(gè)擬南芥R2R3-MYB家族成員的蛋白序列,如圖6B 結(jié)果顯示MiMYB2 與AtMYB17、AtMYB106、AtMYB91、AtMYB16 親緣關(guān)系較近,AtMYB17、At-MYB106、AtMYB16 屬于擬南芥S9 亞族[17],推測MiMYB2具有與S9亞族成員相似的功能。

      2.6 MiMYB2基因組織表達(dá)模式分析

      為研究MiMYB2 基因在“桂熱一號”和“695”品種不同組織中的表達(dá)模式,本研究從“桂熱一號”和“695”品種澳洲堅(jiān)果轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中提取了MiMYB2基因在枝條、花、和葉片的表達(dá)數(shù)據(jù),分析其在不同品種和不同組織的表達(dá)模式。如圖7 所示,“桂熱一號”品種,MiMYB2 主要在枝條和葉片中表達(dá),花中的表達(dá)量較低,葉片中MiMYB2 基因表達(dá)量是花的8 倍左右;“695”品種中,MiMYB2 主要在花中表達(dá),枝條和葉片中表達(dá)量較低,在花中的表達(dá)量是葉片的10 倍左右?!肮馃嵋惶枴焙汀?95”品種同一組織MiMYB2 基因的表達(dá)在花和葉片中相差較大,特別是其在花中的表達(dá)量“695”是“桂熱一號”的13倍左右。

      3 討論

      圖6 澳洲堅(jiān)果MiMYB2系統(tǒng)進(jìn)化分析A. 植物中部分MYB轉(zhuǎn)錄因子的系統(tǒng)進(jìn)化樹;B. 澳洲堅(jiān)果MiMYB2蛋白與擬南芥中126 R2R3-MYB家族成員蛋白序列的系統(tǒng)樹聚類分析Fig.6 Phylogenetic analysis of M.integrifolia MiMYB2A. Phylogenetic tree of MiMYB2 and other plant MYB transcription factors;B. Phylogenetic tree of MiMYB2 from M. integrifolia and 126 R2R3-MYB protein members from Arabidopsis with indicated GenBank accession numbers

      澳洲堅(jiān)果果仁具有豐富的脂肪酸,趙大宣等采用氣相色譜、質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)檢測到13 種脂肪酸成分,其中不飽和脂肪酸(油酸、異油酸、棕櫚酸)總量占了69.12%,飽和脂肪酸總量占30.87%,不飽和脂肪酸對冠心病、糖尿病等疾病具有效用[18]。楊為海等分析了不同種質(zhì)澳洲堅(jiān)果果仁礦質(zhì)元素含量,研究發(fā)現(xiàn)果仁中含有多種常量和微量元素,如K、Mg、Mn、Fe 平均含量分別為3.87、1.85、95.91和90.58 mg·kg-1[19]。澳洲堅(jiān)果果油含有生育酚、角鯊烯等多種抗氧化物質(zhì)[1]。澳洲堅(jiān)果青皮提取的多酚,以Trolox 為陽性對照評價(jià)其抗氧化性,研究發(fā)現(xiàn)其可用于制備天然抗氧化劑[20]。寧平等研究表明澳洲堅(jiān)果果殼可用于制備活性炭。涂行浩等利用微波輻照澳洲堅(jiān)果果殼制備的活性碳產(chǎn)品,其吸附性能超過國家一級標(biāo)椎[4,21]。楊雯等以澳洲堅(jiān)果果殼等為原料,利用超聲-7 堿組合技術(shù)制備的吸附劑可用于處理印染廢水[5]。澳洲堅(jiān)果及其副產(chǎn)品具有較高的營養(yǎng)價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。我國澳洲堅(jiān)果品種主要是經(jīng)過試種馴化的國外優(yōu)良品種,優(yōu)良品種離開本土后其產(chǎn)量和品質(zhì)均有下降,不可預(yù)測的生物和非生物脅影響著澳洲堅(jiān)果的品質(zhì)和產(chǎn)量。迄今,澳洲堅(jiān)果的研究主要集中在栽培管理和雜交育種、誘變育種等,然而澳洲堅(jiān)果如何調(diào)控高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)的機(jī)制及抗逆機(jī)制尚不清楚且研究較少。分子標(biāo)記育種技術(shù)結(jié)合雜交育種是選育澳洲堅(jiān)果優(yōu)良新品種的重要方法。宮麗丹等[22]研究澳洲堅(jiān)果耗水規(guī)律及灌溉制度,結(jié)果表明不同時(shí)期合理灌溉可提高產(chǎn)量和品質(zhì)。譚秋錦等[23]研究發(fā)現(xiàn)土壤養(yǎng)分因子(氮、鉀、pH、有機(jī)碳)對澳洲堅(jiān)果果實(shí)的品質(zhì)有影響,適當(dāng)提高土壤氮、鉀含量合理控制施肥種類可以提高其品質(zhì)。唐瑩瑩等[24]建立的澳洲堅(jiān)果RAPD 標(biāo)記反應(yīng)體系可用于分析澳洲堅(jiān)果遺傳多樣性及鑒定種質(zhì)資源。孔廣紅等[25]利用Co-γ 射線輻照不同種質(zhì)澳洲堅(jiān)果種子,篩選出了4 株性狀優(yōu)良的突變單株。Nock 等對廣泛種植的澳洲堅(jiān)果品種741 的基因組和轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了測序,將澳洲堅(jiān)果測序結(jié)果與其他5 種真雙子葉植物的基因家族比較,發(fā)現(xiàn)了13 689 個(gè)含有澳洲堅(jiān)果基因的簇和1 005 個(gè)澳洲堅(jiān)果特異簇。通過對參與氰苷生物合成的澳洲堅(jiān)果基因的分析,發(fā)現(xiàn)了幾個(gè)高表達(dá)的候選基因,為病原識別、植物防御和單萜合成中基因家族的功能研究打下了基礎(chǔ)[26]。Abubaker等[27]對埃及栽培的澳洲堅(jiān)果進(jìn)行了DNA 指紋圖譜分析,在DNA 指紋圖譜研究中記錄了16個(gè)不同的RAPD片段。

      圖7 MiMYB2基因在不同品種和組織中的表達(dá)分析各柱形圖上用不同大寫字母標(biāo)識表示數(shù)據(jù)間差異極顯著(P<0.01)Fig.7 MiMYB2 expression in different cultivars and tissuesDifferent uppercase letters above each column means significant at P<0.01 level

      R2R3-MYB 家族轉(zhuǎn)錄因子成員與植物的生長發(fā)育、生物脅迫和非生物脅迫密切相關(guān)。研究澳洲堅(jiān)果R2R3-MYB 家族成員的結(jié)構(gòu)與功能,將為闡明澳洲堅(jiān)果產(chǎn)量調(diào)控機(jī)制具有重要的意義。本研究通過PCR技術(shù)從澳洲堅(jiān)果“桂熱一號”的葉片克隆了MiMYB2 基因,測序分析cDNA 序列全長為1 210 bp,推導(dǎo)的氨基酸序列為1 002 bp ORF,編碼333 個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),MiMYB2具有兩個(gè)SANT保守結(jié)構(gòu)域,推測屬于屬于澳洲堅(jiān)果R2R3-MYB 家族;MiMYB2 定位于細(xì)胞核是一個(gè)無跨膜結(jié)構(gòu)、無信號肽的不穩(wěn)定親水蛋白。

      MiMYB2 蛋白序列提交到NCBI 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行BLAST 比對分析,結(jié)果表明其與荷花NnMYB3-like(Nelumbo nucifera,XP_010255443.1)同源性最高(見圖5A)。Deng 等對荷花(Nelumbo nucifera)中116個(gè)R2R3 MYB基因的基因結(jié)構(gòu)、表達(dá)模式等進(jìn)行分析,R2R3-MYB基因可分為4組并利用熒光定量PCR 分析了13 個(gè)與類黃酮生物合成相關(guān)的MYB 基因在荷花不同組織中的表達(dá)模式[28]。Sun等[29]利用酵母雙雜交試驗(yàn)證明,NnMYB5 與Nnb-HLH1、NlbHLH1 和NnTTG1 相互作用,NnTTG1 也與NnbHLH1 和NlbHLH1 相互作用。在擬南芥中過表達(dá)NnMYB5 導(dǎo)致擬南芥未成熟種子和花梗中的花青素積累,TT19表達(dá)上調(diào),證明NnMYB5是花青素合成的轉(zhuǎn)錄激活因子。Peng 等[30]對麻瘋樹MYB 家族的全基因組鑒定,鑒定了128 個(gè)MYB 基因包括123 R2R3-MYBs,4 R1R2R3-MYBs 和1 4RMYB,選取JcMYB2 基因進(jìn)行功能研究,發(fā)現(xiàn)過表達(dá)JcMYB2 植物比野生型更耐鹽、耐冷脅迫。Mi-MYB2 氨基酸序列與126 個(gè)擬南芥R2R3-MYB 家族成員的系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,MiMYB2 與At-MYB17、AtMYB106、AtMYB91、AtMYB16親緣關(guān)系較近(見圖6B),AtMYB17、AtMYB106、AtMYB16屬于擬南芥S9 亞族,將MiMYB2 聚類為S9 亞族。R2R3-MYB 家族轉(zhuǎn)錄因子成員,AtMYB17 與早期花序發(fā)育和種子萌發(fā)相關(guān)[31]。成熟擬南芥表皮毛的轉(zhuǎn)錄譜分析表明,NOECK 編碼MIXTA-Like 轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子MYB106 與細(xì)胞生長有關(guān)[32]。白樺中一種新的R2R3-MYB 轉(zhuǎn)錄因子BpMYB106 通過上調(diào)光合作用和氧化磷酸化途徑相關(guān)基因表達(dá),提高光合作用和生長速率[33]。擬南芥R2R3-MYB 家族成員MYB16 和MYB106 在生殖器官、營養(yǎng)器官和表皮毛中調(diào)控角質(zhì)層形成[34]。擬南芥S9 亞族成員主要與植物的生長發(fā)育相關(guān)。通過系統(tǒng)進(jìn)化分 析 將MiMYB2 與AtMYB17、AtMYB106、At-MYB16 聚類為S9 亞族。分析“桂熱一號”和“695”品種澳洲堅(jiān)果轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中MiMYB2 基因在不同組織的表達(dá)模式。從圖7可知,“桂熱一號”中,Mi-MYB2 在花中的表達(dá)量最低,然而“695”中花中的表達(dá)量最高。花屬于植物的生殖器官,其形成與生長屬于生殖生長,成花的遲早接的影響了果樹的產(chǎn)量。Cao 等[35]通過熒光定量PCR 檢測了20 個(gè)可能參與木質(zhì)素生物合成的PbMYB 基因的表達(dá)模式,推測PbMYB25 和PbMYB52 是梨果實(shí)發(fā)育過程中參與木質(zhì)素合成調(diào)控的候選基因。蘋果MYB轉(zhuǎn)錄因子MdMYB3 參與花青素生物合成和花發(fā)育的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,MdMYB39L 與花粉管生長相關(guān)[36-37]。在煙草中過表達(dá)桃子轉(zhuǎn)錄因子MYB10.1 導(dǎo)致了NtMYB305 的抑制,而NtMYB30 是花發(fā)育所必需的[38]。綜上,推測MiMYB2 參與調(diào)控澳洲堅(jiān)果生長發(fā)育及產(chǎn)量形成機(jī)制,有待深入研究。

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