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      產(chǎn)κ-卡拉膠裂解酶菌株的篩選與鑒定

      2020-03-22 07:53:52吳家葳張文靜遲乃玉王曉輝
      食品與生物技術(shù)學(xué)報 2020年12期
      關(guān)鍵詞:卡拉膠產(chǎn)酶寡糖

      吳家葳, 張文靜, 遲乃玉, 王曉輝

      (大連大學(xué) 生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,遼寧 大連116622)

      卡拉膠(Carrageenan),又被稱為石花菜膠、鹿角菜膠、角叉菜膠等,是一種親水性較高的大分子多糖,它由半乳糖硫酸酯鉀、鈉、鎂和鈣以及3,6-脫水-D-半乳糖并聚物組成[1]。目前卡拉膠被大量應(yīng)用于食品行業(yè),如葡萄酒[2]、飲料[3]、果凍[4]、酸奶[5]等,其主要起雜質(zhì)凝聚、增稠和凝固的作用。 卡拉膠可被降解為有較高活性的卡拉膠寡糖,成為卡拉膠寡糖后, 分子鏈上的活性基團可以更大程度的暴露,因此相對于大分子聚合物的卡拉膠而言,有著更高的活性[6],且卡拉膠寡糖結(jié)構(gòu)多樣,物化性質(zhì)復(fù)雜,并且有著抗氧化[7]、免疫調(diào)節(jié)[8]和抗腫瘤[9]的性質(zhì),因此其被廣泛應(yīng)用于食品、醫(yī)藥、化妝品等行業(yè)[10-11]。 卡拉膠寡糖可通過物理降解[12]、化學(xué)降解[13]和酶降解[14]得到。 化學(xué)降解法和物理降解法反應(yīng)劇烈,且降解產(chǎn)物單一性差,反應(yīng)條件不易控制,排放廢物污染環(huán)境,因此應(yīng)用方面受到了諸多的限制。 相比之下由于酶具有專一性強、穩(wěn)定性強、反應(yīng)溫和等特點,并且微生物酶的活性相對較高,利用微生物產(chǎn)酶來降解卡拉膠得到卡拉膠寡糖能夠節(jié)約能源,有著更大的經(jīng)濟效益[15]。 越來越多的卡拉膠裂解酶對豐富卡拉膠寡糖的種類有著重要作用。

      卡拉膠酶屬于水解酶類,可特異性地將卡拉膠分子的β-1,4 糖苷鍵切斷,在酶的作用下大分子卡拉膠糖苷鍵斷裂產(chǎn)生卡拉膠寡糖。 卡拉膠酶種類繁多, 其中κ-卡拉膠酶可專一性的使κ-卡拉膠結(jié)構(gòu)單元中連接4-硫酸基-半乳糖和3,6-內(nèi)醚-D-半乳糖的β-1,4 糖苷鍵斷裂[16-17]。 目前研究表明已從假單胞菌[18]、鏈霉菌[19]、弧菌[20]等屬的細菌中發(fā)現(xiàn)了多種κ-卡拉膠酶,且大部分酶已經(jīng)在大腸桿菌[21-22]和畢赤酵母[23]中實現(xiàn)了重組表達,但卡拉膠酶依舊是制約卡拉膠寡糖構(gòu)效關(guān)系的重要因素,也是卡拉膠寡糖研究乃至進一步應(yīng)用開發(fā)的主要瓶頸因素[24-25]。當前市場酶解制備寡糖已經(jīng)逐漸開始替代酸解法,因此其研究具有深遠的理論意義和應(yīng)用價值。 本研究中從遼寧省大連市海底泥中篩選得到一株高產(chǎn)卡拉膠裂解酶菌株, 經(jīng)16S rDNA 測序鑒定為紅球菌屬。

      1 材料與方法

      1.1 材料與儀器

      1.1.1 樣品 采自13 個遼寧省大連市不同坐標位置的海泥。

      1.1.2 藥品與儀器 無機鹽母液:MgSO4·7H2O 5.0 g,F(xiàn)ePO4·4H2O 0.1 g,K2HPO4·12H2O 10.0 g,CaCl21.0 g,單蒸水1 000 mL。

      富集培養(yǎng)基:κ-卡拉膠2.0 g,NaNO320.0 g,無機鹽母液100 mL,海水900 mL;pH 7.5。

      κ-卡拉膠篩選培養(yǎng)基:κ-卡拉膠12.0 g,NaNO320.0 g,NaCl 15.0 g, 瓊脂15.0 g, 無機鹽母液100 mL,海水900 mL;pH 7.5。

      固體種子培養(yǎng)基:葡萄糖40 g,酵母膏20 g,蛋白胨20 g,NaCl 20 g,瓊脂粉20.0 g,自來水1 000 mL;pH 7.0。

      液體種子培養(yǎng)基:葡萄糖40 g,酵母膏20 g,蛋白胨20 g,NaCl 20 g,陳海水1 000 mL;pH 7.0。

      發(fā)酵產(chǎn)酶培養(yǎng)基:κ-卡拉膠2 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.02 g,蛋白胨3 g,陳海水1 000 mL;pH 值自然。

      DNS 溶液(250 mL) :1.625 g DNS 溶于少量蒸餾水中,溶解后移入250 mL 容量瓶中,加入2 mol/L NaOH 65 mL,再加入11.25 g 甘油,搖勻,待其冷卻后定容至250 mL。

      BPC-150F 型培養(yǎng)箱: 上海茸研儀器有限公司產(chǎn)品;DK-600S 型電熱恒溫水浴鍋: 上海精宏實驗設(shè)備有限公司產(chǎn)品;ZWY-2102C 型恒溫培養(yǎng)振蕩器:上海智城分析儀器制造有限公司產(chǎn)品;全波長酶標儀:北京昊諾斯科技有限公司產(chǎn)品;顯微鏡:尼康儀器(上海)有限公司產(chǎn)品;自動微生物鑒定分析系統(tǒng):Biolog 公司產(chǎn)品;FP-1100-C 型Bioscreen C分析儀:Oy Growth Curves Ab Ltd 生產(chǎn)。

      1.2 實驗方法

      1.2.1 菌株的富集與篩選 稱取混合后的海泥10 g,放入盛有90 mL 富集培養(yǎng)基和玻璃珠的三角瓶中,25 ℃、160 r/min 過夜振蕩培養(yǎng),使樣品充分分散。再吸取10 mL 富集培養(yǎng)液于盛有90 mL 無菌水并有小玻璃珠的250 mL 三角瓶中, 振蕩15 min 使其搖勻。 梯度稀釋后每個梯度取100 μL 涂布于κ-卡拉膠篩選培養(yǎng)基平板上,30 ℃倒置培養(yǎng)2~3 d,挑取生長良好、在平板上產(chǎn)生透明圈或凹坑的形態(tài)不一的菌落進行多次劃線純化,得到單菌落。

      將分離得到的菌株挑取一環(huán), 接種于5 mL 發(fā)酵培養(yǎng)基中,25 ℃、200 r/min 條件下培養(yǎng)36 h 后,將其以1%的接種體積分數(shù)接于100 mL 發(fā)酵培養(yǎng)基,25 ℃、160 r/min 條件下培養(yǎng)(3 組平行)。 連續(xù)每2 h 取發(fā)酵液離心(10 000 r/min、4 ℃、10 min)去除沉淀細胞,取上清液制成粗酶液,測定卡拉膠降解酶活力。

      1.2.2 酶活力的測定 酶活力測定采用DNS(3,5-二硝基水楊酸)法,以質(zhì)量濃度為0.5 g/dL 的κ-卡拉膠(用50 mmol/L NaH2PO4-Na2HPO4、pH 7.0 的緩沖液溶解)作為底物。

      取50 μL 處理后的粗酶液(對照組1 的酶液以沸水浴5 min 后的50 μL 酶液代替), 添加550 μL質(zhì)量濃度為0.5 g/dL 的κ-卡拉膠溶液,35 ℃水浴20 min,沸水浴5 min 后加入0.9 mL DNS 溶液并沸水浴5 min,冷卻至室溫后加蒸餾水至5 mL,混勻,于520 nm 下測定吸光度值,以滅活酶液為對照組。利用實驗組和對照組吸光度的差值計算還原糖的產(chǎn)生量。

      1 個酶活力單位(U)定義為:在上述條件下,每分鐘產(chǎn)生1 μg 還原糖的酶的劑量。

      1.2.3 菌株的鑒定 對酶活力高的菌株進行形態(tài)學(xué)鑒定(菌落形態(tài)觀察和革蘭氏染色)、生理生化鑒定(Biolog 自動微生物鑒定分析系統(tǒng))和分子生物學(xué)鑒定(菌株的16S rDNA 序列測定由大連寶生物公司擴增、測序),并與NCBI 核酸數(shù)據(jù)庫進行比對,利用MEGA5 進行系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建。

      1.2.4 菌株生長曲線及產(chǎn)酶活性曲線的測定 挑取一環(huán)菌株于液體種子培養(yǎng)基中,160 r/min、25 ℃培養(yǎng)至OD600=0.5 后,以1%的接種體積分數(shù)接種于液體種子培養(yǎng)基中, 使用FP-1100-C 型Bioscreen C 分析儀(每孔300 μL,25 ℃震蕩培養(yǎng),每2 h 檢測一次OD600,連續(xù)檢測3 d)檢測菌株生長情況,繪制菌株生長曲線。

      挑取一環(huán)菌株接種于5 mL 的發(fā)酵培養(yǎng)基中,再以1%的接種體積分數(shù)接種100 mL 于發(fā)酵培養(yǎng)基中,25 ℃、160 r/min 條件下培養(yǎng),每2 h 取樣測其酶活, 連續(xù)檢測3 d, 并設(shè)酶活最高時相對酶活為100%,繪制菌株產(chǎn)酶活性曲線。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 產(chǎn)酶菌株的篩選

      采用以κ-卡拉膠為唯一碳源的平板從海泥中分離出產(chǎn)卡拉膠酶的菌株,由于卡拉膠酶會使卡拉膠降解為還原糖,故會在平板上產(chǎn)生凹坑或水解透明圈。 接著再將初篩得到的菌株接入發(fā)酵培養(yǎng)基中,利用DNS 法檢測是否產(chǎn)生還原糖,再次確定其是否有卡拉膠酶活力,并篩選出酶活力最強的菌株進行下一步試驗。

      通過初篩, 從13 個海泥樣品中獲得了4 株在培養(yǎng)基上產(chǎn)生透明圈或凹坑的菌株,并將其分別標注為LG-1、LG-2、LG-3、LG-4(見圖1)。 將初篩得到的4 個菌株, 接種于卡拉膠發(fā)酵液體培養(yǎng)基中,利用DNS 法測定每個菌株的酶活力,以每株菌最高產(chǎn)酶酶活作圖進行比較如圖2 所示,通過DNS 法測定酶活進行復(fù)篩,可見4 個菌株都具備卡拉膠酶活力,并且得到LG-2 號菌株酶活力最強為34 U/mL,對其進行下一步試驗。

      圖1 篩選培養(yǎng)基菌落Fig. 1 Colony map of screening media

      圖2 菌株產(chǎn)酶活性的篩選Fig. 2 Screening of enzyme activity in strains

      2.2 LG-2 菌落及菌株形態(tài)觀察

      LG-2 號菌在固體種子培養(yǎng)基和卡拉膠培養(yǎng)基上生長良好,單菌落近似圓形,邊緣整齊,中間隆起,呈金黃色,不透明,用接種環(huán)易于挑取,表面光滑,較濕潤。 經(jīng)革蘭氏染色,于光學(xué)顯微鏡下觀察,其呈革蘭氏陽性,單個菌呈球狀,單個散生或多個聚集(見圖3)。

      圖3 菌株LG-2 顯微形態(tài)(×1 000)Fig. 3 The micrograph of LG-2 strains

      2.3 LG-2 號菌株生理生化鑒定

      采用Biolog 自動微生物鑒定分析系統(tǒng)檢測該菌對碳源的利用嗜好和對化學(xué)物質(zhì)的敏感程度。 接入GenⅢ微孔板于33 ℃培養(yǎng)24 h, 使用Biolog Microstation 儀器進行讀數(shù)。 并根據(jù)最終獲得的表型同Biolog 數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)進行比較,以判斷微生物的種屬。

      根據(jù)該菌對碳源的利用嗜好性和對化學(xué)物質(zhì)的敏感程度結(jié)果,Biolog 自動微生物鑒定分析系統(tǒng)的鑒定結(jié)果為Rhodococcus fasciansB 菌(帶化紅球菌),SIM 值 為0.516,PROB 值 為0.870,Organism Type 為GP-Rod(革蘭氏陽性桿菌),該結(jié)果與革蘭氏染色結(jié)果一致。

      該菌對蔗糖、D-果糖、肌醇、L-蘋果酸、丙酸、乙酸、D-麥芽糖、明膠、檸檬酸、果膠等碳源利用較佳;化學(xué)物質(zhì)敏感性試驗結(jié)果表明該菌微弱耐受萘啶酮酸和氨曲南,對高鹽環(huán)境、低pH 值、醋竹桃霉素和利福霉素SV 等不耐受,見表1。

      表1 菌株LG-2 生理生化鑒定結(jié)果Table 1 Results of physiological and biochemical identification of strain LG-2

      2.4 16S rDNA 序列分析與系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建

      菌落LG-2 經(jīng)16S rDNA 測序大小為1 440 bp,如圖4 所示,其PCR 產(chǎn)物電泳在1 000~2 000 bp 的條帶之間且更靠近1 000 bp 的條帶,與測序結(jié)果一致。將16S rDNA 測序結(jié)果與NCBI 數(shù)據(jù)庫基因序列進行比較, 搜索得到同源性達到99%以上的菌株,均為紅球菌。 結(jié)合形態(tài)學(xué)特征、培養(yǎng)特征和生理生化結(jié)果綜合比較,確定菌株LG-2 為紅球菌菌屬,利用MEGA5 構(gòu)建Rhodococcussp. LG-2 的系統(tǒng)發(fā)育樹如圖5 所示。 結(jié)合以往的報道,大多數(shù)產(chǎn)卡拉膠酶的菌屬多為假單胞菌和弧菌,很少有關(guān)于紅球菌屬產(chǎn)卡拉膠酶的報道,因此該菌可進行進一步的研究與開發(fā)。

      圖4 LG-2 的16S rDNA 電泳圖Fig. 4 Electrophoresis pattern of 16S rDNA PCR product of strain LG-2

      圖5 Rhodococcus sp.LG-2 的16S rDNA 的序列系統(tǒng)發(fā)育樹Fig. 5 Phylogenetic tree based on 16S rDNA sequence of Rhodococcus sp. LG-2

      2.5 LG-2 號菌株生長曲線及產(chǎn)酶活性曲線

      根據(jù)鑒定結(jié)果選擇合適培養(yǎng)基, 利用FP-1100-C 型Bioscreen C 分析儀測LG-2 菌株的生長曲線,并設(shè)酶活最高時的相對酶活為100%,繪制產(chǎn)酶活性曲線如圖6 所示。 可見該菌潛伏期較短,可迅速進入對數(shù)生長期,且對數(shù)生長期較長,在培養(yǎng)36 h 后該菌逐漸進入穩(wěn)定期,在培養(yǎng)54 h 后進入衰退期。 該菌隨著菌株生長進入對數(shù)生長期其產(chǎn)酶活性快速上升,在培養(yǎng)22 h 時有最大產(chǎn)酶活性,且穩(wěn)定性較好, 在培養(yǎng)20~28 h 內(nèi)仍可保持相對酶活在80%以上,在培養(yǎng)48 h 后酶活急劇下降,并且隨著菌株進入衰亡期產(chǎn)酶活性也降低至20%以下,該菌的特性有利于進行工業(yè)生產(chǎn), 并且在培養(yǎng)20~26 h內(nèi)最適合進行酶的提取。

      圖6 LG-2 菌株生長曲線與產(chǎn)酶活性曲線Fig. 6 Growth curve and enzyme production curve of LG-2 strain

      3 結(jié) 語

      本實驗中用唯一碳源法, 從13 種來自大連不同坐標地區(qū)的海泥樣品中分離產(chǎn)κ-卡拉膠酶的菌株,得到一株高產(chǎn)酶菌株LG-2,酶活為34 U/mL。后通過其形態(tài)學(xué)分析、 生理生化鑒定和16S rDNA 系統(tǒng)發(fā)育同源分析,初步鑒定LG-2 為紅球菌屬,革蘭氏陽性菌。 根據(jù)菌株生長曲線及產(chǎn)酶活性曲線進行分析,可知該菌在培養(yǎng)22 h 后即可達到最高產(chǎn)酶活性,有利于卡拉膠酶的工業(yè)化生產(chǎn)。

      本實驗中篩選出的菌株為紅球菌菌屬,其產(chǎn)卡拉膠酶的報道較少,該菌株酶活性相對較高,經(jīng)有效的重組表達后,可將其廣泛地應(yīng)用于卡拉寡糖的食品、藥物研發(fā)與工業(yè)生產(chǎn)中,降低生產(chǎn)成本。

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