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      低表達(dá)抑癌環(huán)狀RNA在胃癌診斷及預(yù)后中作用的Meta分析

      2020-06-17 09:01:22劉云張曼玲彭洪嬌時(shí)昭紅
      天津醫(yī)藥 2020年5期
      關(guān)鍵詞:敏感度異質(zhì)性標(biāo)志物

      劉云,張曼玲,彭洪嬌,時(shí)昭紅

      胃癌是世界上嚴(yán)重的惡性腫瘤之一,在所有癌癥中其發(fā)病率及死亡率分別為第5 和第3 位[1]。但是,胃癌發(fā)病率和死亡率在世界范圍內(nèi)的分布并不均勻[2]。所有胃癌病例中有一半以上發(fā)生在東亞、歐洲中東部和中南美洲,尤其在日本和中國(guó)有著較高的發(fā)病率。胃癌起病隱匿,往往發(fā)現(xiàn)時(shí)已經(jīng)進(jìn)入晚期,早期診斷及手術(shù)根治性切除可能性低,術(shù)后5年生存率不足25%[3]。盡管現(xiàn)在臨床上糖類抗原(CA)199、癌胚抗原(CEA)[4]、CA724[5]等腫瘤標(biāo)志物已被廣泛使用,但是其特異度(SPE)及敏感度(SEN)均不理想,且無(wú)法預(yù)測(cè)預(yù)后[6]。目前急需一種新的分子生物標(biāo)志物用于更好地診斷胃癌及判斷預(yù)后。

      環(huán)狀RNA(circRNA)是一類特殊的內(nèi)源性非編碼RNA,主要通過(guò)兩外顯子的套索環(huán)化或內(nèi)含子的配對(duì)環(huán)化2種方式形成[7]。近年來(lái),隨著高通量測(cè)序技術(shù)和實(shí)驗(yàn)技術(shù)的發(fā)展和完善,有關(guān)circRNA 的研究不斷深入,發(fā)現(xiàn)其在腫瘤診斷及判斷預(yù)后方面有應(yīng)用前景[8]。多個(gè)研究表明,circRNA 可以作為miRNA 的分子海綿,起到調(diào)控基因表達(dá),調(diào)控增殖、遷移、侵襲等多種生物學(xué)過(guò)程的作用[9-10]。同時(shí)研究還發(fā)現(xiàn),circRNAs 在胃癌患者腫瘤組織和血清樣本中表達(dá)失調(diào),并與臨床病理結(jié)果相關(guān),提示circRNAs可能是胃癌進(jìn)展中的生物標(biāo)志物[11-13]。鑒于目前缺乏對(duì)circRNA 在胃癌診療中的系統(tǒng)評(píng)價(jià),本研究通過(guò)系統(tǒng)回顧和薈萃分析來(lái)評(píng)估低表達(dá)抑癌circRNA 與胃癌診斷及預(yù)后之間聯(lián)系,旨在闡明circRNA 作為診斷胃癌生物標(biāo)志物及判斷預(yù)后的可能性,為臨床決策提供幫助。

      1 資料與方法

      1.1 檢索策略 對(duì)PubMed、Embase、Web of Science 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,檢索2019年6月之前發(fā)表的文獻(xiàn)。檢索策略采用主題詞與自由詞相結(jié)合的方式,檢索式為:“circRNA”或“circular RNA”且“stomach neoplasm”或“gastric neoplasm”或“gnastric cancer”或“stomach cancer”或“GC”,篩 選 流 程見(jiàn)圖1。

      1.2 納入與排除標(biāo)準(zhǔn) 文獻(xiàn)納入標(biāo)準(zhǔn):(1)有關(guān)circRNA 低表達(dá)的病例對(duì)照研究或隊(duì)列研究。(2)患者被確診為胃癌。(3)文獻(xiàn)內(nèi)容包括關(guān)于circRNA 的表達(dá)、基礎(chǔ)臨床病理參數(shù)、預(yù)后參數(shù)及診斷參數(shù)。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)數(shù)據(jù)重復(fù)發(fā)表。(2)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)、會(huì)議摘要、病例報(bào)告及綜述。(3)無(wú)可提取數(shù)據(jù)。(4)非英語(yǔ)文獻(xiàn)。

      1.3 數(shù)據(jù)提取 3名評(píng)閱人(劉云、張曼玲和彭洪驕)評(píng)估所有錄入文獻(xiàn),并獨(dú)立對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。此外,第4 名評(píng)閱人(時(shí)昭紅)在出現(xiàn)數(shù)據(jù)矛盾時(shí)解決分歧。數(shù)據(jù)提取內(nèi)容:(1)納入研究的基本特征,包括第一作者、發(fā)表年份、發(fā)表國(guó)家、研究人群來(lái)源、circRNA 名稱、病例數(shù)、檢測(cè)方法。(2)從文中直接提取或運(yùn)用Engauge Digitizer 4.1 軟件從生存曲線上獲取所需數(shù)據(jù),通過(guò)計(jì)算獲得總生存期(OS)的風(fēng)險(xiǎn)比,用于預(yù)后分析。(3)在診斷分析中,收集敏感度、特異度和曲線下面積(AUC)。(4)臨床病理資料包括年齡、性別、腫瘤大小、TNM分期、分化程度、淋巴轉(zhuǎn)移等。

      1.4 質(zhì)量評(píng)價(jià) 文獻(xiàn)質(zhì)量評(píng)價(jià)根據(jù)Newcastle-Ottawa Scale(NOS)進(jìn)行評(píng)估,如果評(píng)分≥7 分研究被認(rèn)為是高質(zhì)量文獻(xiàn)。本研究符合系統(tǒng)審查和Meta分析(PRISMA)聲明的首選報(bào)告項(xiàng)目。

      1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 所有統(tǒng)計(jì)分析均使用Stata 14.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行。合并優(yōu)勢(shì)比(OR)和95%置信區(qū)間(CI)用于評(píng)估臨床病理參數(shù),敏感度、特異度,危險(xiǎn)比(HR)用于評(píng)估OS。使用χ2檢驗(yàn)和I2統(tǒng)計(jì)量評(píng)估研究之間的異質(zhì)性。如果I2值<50%,則認(rèn)為不存在明顯的異質(zhì)性。當(dāng)存在明顯的異質(zhì)性時(shí),采用隨機(jī)效應(yīng)模型,否則使用固定效應(yīng)模型。在本研究中,采用隨機(jī)效應(yīng)模型量化合并的敏感度、特異度、診斷優(yōu)勢(shì)比(DOR)、陽(yáng)性似然比(PLR)、陰性似然比(NLR)和AUC,并計(jì)算相應(yīng)的95%CI。進(jìn)一步進(jìn)行敏感性分析,以檢測(cè)結(jié)果的穩(wěn)定性和潛在的異質(zhì)性來(lái)源。漏斗圖、Deeks’圖用于檢測(cè)發(fā)表偏倚。

      Fig.1 Flowchart of the study selection process圖1 文獻(xiàn)篩選流程及結(jié)果

      2 結(jié)果

      2.1 文獻(xiàn)檢索流程及結(jié)果 本次研究在數(shù)據(jù)庫(kù)共檢索到314篇相關(guān)文獻(xiàn),通過(guò)閱讀全文與摘要,依據(jù)本研究的納入和排除標(biāo)準(zhǔn),最終篩選出20篇[14-33]合格文獻(xiàn)進(jìn)行Meta 分析,其中7 篇文獻(xiàn)用于臨床病理特征分析,9篇文獻(xiàn)可用于預(yù)后分析,16篇文獻(xiàn)用于診斷分析,共計(jì)2 008例研究對(duì)象。

      2.2 納入文獻(xiàn)的質(zhì)量評(píng)價(jià) 采用NOS 評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)評(píng)價(jià)納入文獻(xiàn)的方法學(xué)質(zhì)量,該標(biāo)準(zhǔn)包括3 個(gè)方面的評(píng)價(jià):病例組與對(duì)照組選擇方法、病例組與對(duì)照組的可比性以及接觸暴露評(píng)估方法。評(píng)價(jià)后得分越多質(zhì)量越高,最高為10 分。20 篇文獻(xiàn)中7 篇文獻(xiàn)得分8分,10篇文獻(xiàn)得分7分,3篇文獻(xiàn)得分6分。

      2.3 臨床病理參數(shù)Meta 分析 抑癌circRNA 表達(dá)水平降低與較差的臨床病理特征顯著相關(guān)(分化程度:OR=1.33,95%CI:1.14~1.55;TNM 分 期:OR=1.45,95%CI:1.24~1.70;淋巴轉(zhuǎn)移:OR=1.31,95%CI:1.14~1.48;腫瘤大?。篛R=1.28,95%CI:1.06~1.54);而抑癌circRNA 表達(dá)水平降低與年齡(OR=0.99,95%CI:0.86~1.12)、性 別(OR=0.98,95%CI:0.89~1.08)無(wú)關(guān)。

      2.4 預(yù)后Meta分析

      2.4.1 預(yù)后Meta 分析文獻(xiàn)的基線特征 預(yù)后Meta分析共納入9 篇文獻(xiàn),包括10 種circRNA,所有研究均在中國(guó)進(jìn)行。發(fā)表時(shí)間從2017—2019 年。每項(xiàng)研究的樣本量為51~112。此外,均采用實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)檢測(cè)circRNA 的表達(dá)水平,見(jiàn)表1。

      Tab.1 The main characteristics of included studies for prognosis analysis表1 納入預(yù)后Meta分析文獻(xiàn)主要臨床數(shù)據(jù)

      2.4.2 總生存率Meta 分析結(jié)果 通過(guò)匯總9 篇文獻(xiàn)[17-20,25,30-33],10 項(xiàng)總生存率數(shù)據(jù),各研究間無(wú)明顯異質(zhì)性(I2=0,P=0.811),采用固定效應(yīng)模型進(jìn)行分析得出抑癌circRNA 高表達(dá)與較好的OS 顯著相關(guān)(HR=0.37,95%CI:0.29~0.48)。見(jiàn)圖2。

      Fig.2 Forest plots for overall survival(OS)according to ow-expression of circRNAs圖2 低表達(dá)circRNA總生存期(OS)森林圖結(jié)果

      Fig.3 The funnel plot of publication bias of included studies圖3 納入研究文獻(xiàn)的發(fā)表偏倚漏斗圖

      2.4.3 預(yù)后Meta 分析納入文獻(xiàn)的發(fā)表偏倚和敏感性分析 對(duì)OS繪制漏斗圖評(píng)價(jià)發(fā)表偏倚,其結(jié)果顯示集中趨勢(shì)明顯,不存在發(fā)表偏倚,見(jiàn)圖3;采用敏感性分析檢測(cè)各項(xiàng)研究對(duì)合并HR 的影響,結(jié)果顯示合并后HR的結(jié)果穩(wěn)定性良好,見(jiàn)圖4。

      2.5 診斷Meta分析

      2.5.1 診斷Meta 分析文獻(xiàn)的基線特征 診斷Meta分析研究的基線特征見(jiàn)表2。診斷Meta分析共納入16篇文獻(xiàn),包括17種circRNA,所有研究均在中國(guó)進(jìn)行,發(fā)表時(shí)間從2017—2019年。納入研究的樣本量40~254。均采用qRT-PCR 測(cè)量circRNA 的表達(dá)水平,試驗(yàn)組的樣本均來(lái)自胃癌患者;對(duì)照組中,胃組織來(lái)源均為癌旁正常胃組織,此外對(duì)照組血清來(lái)源均來(lái)自正常人群。

      2.5.2 診斷Meta 分析結(jié)果 通過(guò)匯總16 篇文獻(xiàn)[14-29],21 項(xiàng)總診斷數(shù)據(jù),匯總后的敏感度為0.73(95%CI:0.66~0.79;I2=90.67%),特 異 度 為0.77(95%CI:0.68~0.84;I2=92.69%),AUC 為 0.81(95%CI:0.77~0.84);此外陽(yáng)性似然比(PLR)為3.13(95%CI:2.32~4.22;I2=84.87%),陰性似然比(NLR)為0.36(95%CI:0.30~0.42;I2=91.74%),DOR 為8.75(95%CI:6.37~12.03;I2=100.0%),見(jiàn)圖5。由于各項(xiàng)匯總數(shù)據(jù)均存在明顯異質(zhì)性,進(jìn)一步用亞組分析來(lái)分析異質(zhì)性來(lái)源,結(jié)果顯示血清circRNA 的診斷效能高于胃癌組織,見(jiàn)表3。

      2.5.3 納入診斷Meta 分析文獻(xiàn)的發(fā)表偏倚 采用Deeks’漏斗圖對(duì)診斷分析各項(xiàng)研究進(jìn)行不對(duì)稱檢驗(yàn),未發(fā)現(xiàn)發(fā)表偏倚(P=0.55),見(jiàn)圖6。

      Fig.4 The sensitivity analysis of included studies圖4 納入研究文獻(xiàn)的敏感性分析圖

      Tab.2 The main characteristics of included studies for diagnosis analysis表2 納入診斷Meta分析文獻(xiàn)主要臨床數(shù)據(jù)

      3 討論

      目前雖然胃癌的病死率已經(jīng)逐步下降,但是卻對(duì)患者生活質(zhì)量造成了極大的影響[34],這主要是因?yàn)樵缙谖赴┌Y狀不顯著,常與其他胃腸疾病癥狀相似,因此延誤診治,從而使得大多數(shù)胃癌患者在診斷時(shí)已處于Ⅲ期或Ⅳ期末期階段,不可避免地要進(jìn)行胃切除手術(shù)[35]。而內(nèi)鏡檢查及病理檢查,雖然能及時(shí)發(fā)現(xiàn)早期胃癌,但由于其不可避免的侵入性及難以忍受的檢查過(guò)程,依然難以在臨床上廣泛開(kāi)展。因此,迫切需要理想的非侵入性生物標(biāo)志物來(lái)加強(qiáng)胃癌檢測(cè)。

      目前,有關(guān)尋找新型腫瘤生物標(biāo)志物的大量研究表明,胃癌患者和健康對(duì)照之間微小RNA(miRNA)表達(dá)水平有著明顯差異,提示miRNA 可能在癌癥抑制中起關(guān)鍵作用[36]。Wei 等[37]通過(guò)對(duì)48篇文獻(xiàn)進(jìn)行薈萃分析后得出,血清miRNA對(duì)于診斷胃癌的敏感度、特異度以及AUC分別為0.76、0.81以及0.86。隨后長(zhǎng)鏈非編碼RNA(LncRNA)的發(fā)現(xiàn)使研究重點(diǎn)發(fā)生轉(zhuǎn)移,相關(guān)研究發(fā)現(xiàn)LncRNA 不僅參與細(xì)胞生長(zhǎng)、代謝和凋亡等正常的生理過(guò)程[38],也在胃癌的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮著重要的生物學(xué)作用,不僅能促進(jìn)腫瘤血管生成[39],還參與了胃癌的侵襲和轉(zhuǎn)移等過(guò)程[39]。Hu等[40]通過(guò)對(duì)10篇文獻(xiàn)進(jìn)行薈萃分析發(fā)現(xiàn),LncRNA 診斷胃癌的敏感度為0.63,特異度為0.75,AUC為0.76。

      Fig.5 Forest plot of sensitivity and specificity of low-expression of circRNAs for the diagnosis圖5 低表達(dá)circRNA診斷分析敏感度、特異度森林圖

      Fig.6 The Deeks’funnel plot of diagnosis of included studies圖6 納入研究文獻(xiàn)的診斷分析Deeks’漏斗圖

      Tab.3 Results of subgroup diagnostic Meta-analysis of low-expression of circRNAs表3 低表達(dá)circRNA診斷Meta亞組分析

      近年來(lái)circRNA 在癌癥中的重要作用得到了廣泛的認(rèn)可。從2012 年至今,大量研究報(bào)道了circRNA 起源、結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能以及其在細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移和腫瘤復(fù)發(fā)中的作用[9]。同時(shí),circRNAs作為胃癌生物標(biāo)志物的研究明顯增加。Wang 等[41]初步對(duì)9 種circRNA 在胃癌中的診斷效能進(jìn)行薈萃分析,敏感度、特異度以及AUC 分別為0.73、0.72 以及0.78。鑒于circRNA研究的不斷深入,以及上述Meta分析文獻(xiàn)數(shù)量的局限性,本研究共納入16 篇文獻(xiàn),17 種circRNA 再次進(jìn)行薈萃分析,探討了抑癌circRNA 作為胃癌診斷生物標(biāo)志物的可行性。薈萃分析結(jié)果顯示:低表達(dá)抑癌circRNA 的診斷敏感度為0.73,特異度為0.77,AUC 為0.81,具有較理想的診斷效能,有望成為胃癌的診斷標(biāo)志物;同時(shí),筆者還進(jìn)行了亞組分析,在胃癌組織中circRNA 敏感度為0.73,特異度為0.74,AUC 為0.79,而胃癌患者血清circRNA 敏感度為0.73,特異度為0.84,AUC 為0.85,提示與胃癌組織提取的circRNA 相比,血清circRNA 有著較高的診斷效能;同時(shí),血清circRNA診斷效能接近血清miRNA,由于circRNA 為環(huán)形結(jié)構(gòu),與miRNA相比,不易被RNA酶降解,具有更好的穩(wěn)定性,因此更易作為一種理想的胃癌檢測(cè)標(biāo)志物。在各項(xiàng)研究中,circ_PSMC3 具有最佳的診斷效能,其敏感度為0.86,特異度為0.95,AUC 為0.93,并且circ_PSMC3 可通過(guò)血液檢查獲得,具有較好的臨床可操作性,可作為胃癌診斷標(biāo)志物在更多的臨床試驗(yàn)中進(jìn)一步驗(yàn)證。

      晚期胃癌雖然經(jīng)過(guò)手術(shù)治療,但仍然有40%~65%患者出現(xiàn)腫瘤遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移和局部復(fù)發(fā)[42],因此臨床上同樣需要更好的生物指標(biāo)對(duì)術(shù)后患者預(yù)后做出判斷。本研究評(píng)估了抑癌circRNA作為胃癌生物預(yù)后標(biāo)志物的意義。在臨床病理特征上,抑癌circRNA 的低表達(dá)與較差的臨床病理特征相關(guān),如腫瘤分化程度、TMN分期、淋巴轉(zhuǎn)移以及腫瘤大小。在預(yù)后價(jià)值方面,在研究中共對(duì)9 篇文獻(xiàn),10 種circRNA 進(jìn)行了薈萃分析,研究結(jié)果提示,低表達(dá)抑癌circRNA 的OS 僅為高表達(dá)抑癌circRNA 患者的37%。此外,本研究中circ_PVRL3[17]、circ_KIAA1244[18]、circ_PSMC3[19]、circ_0000467[20]、circ_0001017[25]、circ_0061276[25]可作為診斷和預(yù)后標(biāo)志物,其中circ_0001017 不但預(yù)示著較差的總生存期(HR=0.29),還具有較好的診斷效能(敏感度=0.76,特異度=0.62,AUC=0.85),是具有臨床意義的胃癌標(biāo)志物。

      然而,本研究具有一些局限性:首先,由于circRNA 作為一種較新的非編碼RNA,目前所發(fā)表的文獻(xiàn)依舊不足;此外,同一種circRNA未被不同學(xué)者在多個(gè)研究中驗(yàn)證,因此獲得的數(shù)據(jù)可能存在偏倚;在診斷薈萃分析中存在異質(zhì)性,這可能是由于circRNA 檢測(cè)方法,樣本量大小,樣本病理特征不一等原因造成的,因此需要更詳細(xì)的數(shù)據(jù)進(jìn)行亞組分析來(lái)解釋異質(zhì)性來(lái)源;其次,納入的研究均為隊(duì)列研究及病例對(duì)照研究,文獻(xiàn)證據(jù)等級(jí)有著一定局限性;最后,本研究?jī)H納入英文文獻(xiàn),不能排除發(fā)表偏倚。

      綜上所述,本研究從Meta 分析角度揭示了低表達(dá)抑癌circRNA與胃癌患者的臨床病理特征和預(yù)后之間的關(guān)系。低表達(dá)抑癌circRNA可作為一種有效的輔助診斷胃癌的生物標(biāo)志物。本研究的結(jié)論仍需高質(zhì)量的臨床試驗(yàn)證實(shí)。

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