吳陽,霍崢,李剛,溫少紅
煙臺大學生命科學學院(煙臺 264000)
褐藻膠存在于褐藻細胞壁及細胞間質(zhì)中,約占其干重的40%。褐藻膠是酸性陰離子線性多糖,由β-D-甘露糖醛酸(β-D-mannuronate;M)和與其C-5差向異構(gòu)體α-L-古羅糖醛酸(α-L-guluronate;G)通過1,4糖苷鍵共價連接,以均聚或隨機的方式排列成同源多糖醛酸M殘基(Poly M)、G殘基(Poly G)以及雜多糖醛酸(Poly MG或Poly GM)[1]。除褐藻外,褐藻膠也由兩個細菌屬——固氮菌(例如葡萄固氮菌Azotobactersp.)和幾種假單胞菌產(chǎn)生(例如銅綠假單胞菌Pseudomonosasp.)。
褐藻寡糖(AOS)由褐藻膠降解產(chǎn)生,除保留褐藻膠的優(yōu)良特性外還具有特殊的化學特性及生物活性,具有更廣泛的應用價值。在食品方面作為食品添加劑,農(nóng)業(yè)方面作為植物生長促進劑和治療劑,醫(yī)藥方面具有抗氧化和抗腫瘤等特性,在能源方面將褐藻膠降解為寡糖是將其直接轉(zhuǎn)化為乙醇的關(guān)鍵步驟[2-5]。
褐藻膠的降解方法有物理法、化學法和酶解法。酶解法具有底物專一、反應條件溫和等優(yōu)點,還可以定向制備褐藻寡糖,相較于物理、化學法是一種理想且環(huán)保的方法。但是褐藻膠裂解酶的應用目前仍處于研究階段,無法投入工業(yè)大規(guī)模生產(chǎn)。
迄今為止,許多褐藻膠裂解酶已被鑒定、基因克隆和純化,其來源多種多樣,例如從海帶、馬尾藻、土壤中分離得到的海洋和陸地細菌、真菌、噬菌體和病毒(小球藻病毒)等,以褐藻為食的海洋軟體動物(鮑魚Haliotis spp.、海兔Aplysia kurodai、短濱螺Littorina brevicula等)的腸道中也存在著褐藻膠裂解酶。特別地,Stender等[6]從人腸道細菌—溶胞擬桿菌中分離得到褐藻膠裂解酶BeclPL6。
目前對細菌產(chǎn)的褐藻膠裂解酶的研究較為廣泛和深入,已鑒定出50000多個褐藻膠裂解酶氨基酸序列,其中47000個屬于細菌基因組,包括弧菌屬Vibriosp.[7-8]、吞噬性去氟弧菌Defluviitalea phaphyphila[9]、鞘氨醇單胞菌屬Sphingomonassp.[10]、銅綠假單胞菌屬Pseudomonas aeruginosa[11]、卡拉膠假單胞菌屬Pseudoalteromonas carrageenovora[12]、芽孢桿菌屬Paenibacillus[13]、溶胞擬桿菌Bacteroides cellulosilyticus[6]、微鱗球菌Microbulbifersp.[14-16]、志賀氏菌Shewanellasp.[17]、嗜鹽白蟻菌Zsoptericola halotoleransWX[18]等。
褐藻膠裂解酶通過β-消除的酸堿催化作用,以1,4O-糖苷鍵為目標,將褐藻膠降解為帶有不飽和雙鍵的寡糖,并在非還原末端形成不飽和殘基,用符號Δ表示[19]。褐藻膠裂解酶的β-消除作用如圖1所示。
圖1 褐藻膠裂解酶的β-消除
Gacesa[20]提出了一種褐藻膠裂解酶的新的催化假說,描述了β-消除反應的三個步驟:(1)去除羧酸鹽陰離子上的負電荷,通過鹽橋(組氨酸和賴氨酸)中和電荷,降低H-5質(zhì)子的pKa;(2)一般堿催化提取C-5上的質(zhì)子,其中可能需要一個殘基作為質(zhì)子提取者,另一個作為質(zhì)子供體或殘基同時充當質(zhì)子供體和受體,得到稀酸鹽中間體;(3)羧基的電子轉(zhuǎn)移導致C-4和C-5之間形成雙鍵,并最終裂解O-糖苷鍵。
根據(jù)分子質(zhì)量,將褐藻膠裂解酶分為三類:第一類分子質(zhì)量在20~35 kDa之間[13-14];第二類分子質(zhì)量約為40 kDa[21-22];第三類分子質(zhì)量約為60 kDa[10]。特別地,ZH0-Ⅰ分子質(zhì)量為91 kDa,ZH0-Ⅳ分子質(zhì)量為113 kDa[10]。
將褐藻膠裂解酶分為1,4-β-D-聚甘露糖醛酸裂解酶(EC 4.2.2.3),1,4-α-L-聚古羅糖醛酸裂解酶(EC 4.2.2.11),以及在兩者中均顯示活性的雙功能酶。目前已報道多種雙功能裂解酶,Tavafi等[11]在銅綠假單胞菌中發(fā)現(xiàn)了既能降解Poly M,又能降解Poly G的雙功能褐藻膠裂解酶。
褐藻膠裂解酶可被分為內(nèi)切酶和外切酶,外切酶也可稱為寡褐藻膠裂解酶(EC 4.2.2.26)。迄今為止大部分褐藻膠裂解酶為內(nèi)切酶,主要產(chǎn)物為不飽和寡糖(2-4糖)。不飽和寡糖無法直接轉(zhuǎn)化為生物燃料,而外切褐藻膠裂解酶作用于褐藻膠或褐藻寡糖的非還原末端,釋放出的不飽和殘基DEH,可用作生物燃料[5],生物燃料的生產(chǎn)突出了外切型褐藻膠裂解酶的意義。表1是近年發(fā)現(xiàn)的外切褐藻膠裂解酶。
表1 外切褐藻膠裂解酶
根據(jù)CAZy數(shù)據(jù)庫(www.CAZy.org/olysaccharide-Lyases.html),褐藻膠裂解酶分為12個多糖裂解酶家族(PLs),包括PL5,PL6,PL7,PL14,PL15,PL17,PL18,PL31,PL32,PL34,PL36和PL39。Helbert等[29]研究表明,PL32,PL34和PL36是新建立的,PL36包括39個細菌序列和一個真菌序列[30]。Ji等[9]從Defluviitalea phaphyphilaAlg1中分離出新的PL39家族的褐藻膠裂解酶。
大多褐藻膠裂解酶屬于PL-5和PL-7家族,且多為Poly M裂解酶。但PL-7家族中也包含一部分Poly G裂解酶,對于重組酶Aly1281[12],Poly G的裂解優(yōu)于Poly M。近年來PL-6家族的褐藻膠裂解酶也被廣泛分離出來。PL-6家族中多為Poly G裂解酶,例如Lyu等[8]從弧菌OU02中分離出的第一個單域結(jié)構(gòu)的褐藻膠裂解酶AlyF是Poly G裂解酶。但也有例外,如SHA-4是PL6家族中第一個對PolyMG有底物偏好性的外切型褐藻膠裂解酶[26],BeclPL6[6]為Poly M褐藻膠裂解酶。
褐藻膠裂解酶可分為3個折疊類型:β-jelly roll class(PL7,PL14,PL18和PL36)、(α/α)n環(huán)折疊(PL5,PL15和PL17)和β-螺旋(PL6)[31]。AlgNJU-03[7]及Aly36B[30]分別屬于PL-7和PL-36家族,結(jié)構(gòu)均為β-jelly roll。PL6家族的PsAly[13]及BeclPL6[6]均為β-螺旋結(jié)構(gòu)。
以褐藻膠為唯一碳源,對褐藻膠裂解酶進行定性篩選,包括乙醇法、碘液法、CaCl2法、十六烷基氯化吡啶(CPC)等,未被水解的底物會被染色或形成白色沉淀。
Sawant等[32]首次提出用革蘭氏碘代替CPC:革蘭氏碘2~3 min即可清楚形成對比區(qū)域,而CPC法至少需要30~40 min,且培養(yǎng)基中的瓊脂會干擾CPC的作用。因此革蘭氏碘是目前使用平板篩選褐藻膠裂解酶產(chǎn)生菌的最佳方法。
復篩即定量測定,包括紫外吸光光度法[33]、硫代巴比妥酸法(TBA法)[24]、3,5-二硝基水楊酸法(DNS定糖法)、黏度法等。魏丹等[18]提出了改良版的DNS法,采用0.1 mL酶與1 mL底物反應,沸水滅活3 min,該方法可以減少發(fā)酵液中原本的還原糖對顯色的影響。近年來紫外法及DNS法應用較為廣泛,但因試驗條件的不確定性以及酶活單位定義的不同,各種測定方法之間還無法完全進行比較。
對發(fā)酵條件的優(yōu)化可以提高菌株產(chǎn)酶酶活。例如菌株大多需要褐藻膠誘導產(chǎn)酶;海洋細菌對NaCl含量要求較高,且大多褐藻膠裂解酶對Na+具有依賴性;另外金屬離子對酶與底物結(jié)合時的電荷有影響,使得部分金屬離子對酶活具有促進或抑制作用[18]。
由于部分野生菌的不穩(wěn)定性以及酶活較低,對其進行編碼重組可以獲得更高酶活的褐藻膠裂解酶。Hu等[33]將Aly7B重組為Aly7B-CDⅠ和Aly7B-CDⅡ,僅Aly7B-CDⅡ具有褐藻膠裂解酶的酶活,且酶活提高了近6倍。Li等[22]將重組褐藻膠裂解酶AlyPL6固定在MTOP上,可以提高其熱穩(wěn)定性和重復利用性,使其在工業(yè)上得到更充分的應用。因此,在編碼重組及固定化的基礎(chǔ)上進行發(fā)酵條件的優(yōu)化,可以得到更高酶活及優(yōu)良生物活性的褐藻膠裂解酶。
不同的褐藻膠裂解酶的酶學性質(zhì)不盡相同,對酶學性質(zhì)的研究可以使酶發(fā)揮出最大潛力。
研究表明褐藻膠裂解酶最適溫度范圍為30~50℃,但也有例外,高楊等[21]從印度尼西亞的熱泉樣品中分離出的褐藻膠裂解酶AlyB5的最適溫度為65 ℃,在70 ℃時仍保持75%以上的酶活;而Itoh等[13]克隆出的褐藻膠裂解酶PsAly的最適溫度在67 ℃,在37 ℃保存24 h,酶活仍保留50%以上,隨著溫度升高,其半衰期的出現(xiàn)時間越短。
褐藻膠裂解酶的最適pH約為6.0-8.0,特別的,Li等[22]克隆出的AlyPL6的最適pH為10;嚴芬等[34]篩選的褐藻膠裂解酶的最適pH為5.5,偏酸性。
不同金屬離子會對褐藻膠裂解酶的活性產(chǎn)生影響,少數(shù)幾個在多金屬離子條件下表現(xiàn)出高活性,還有部分受到某些金屬離子的抑制作用。He等[10]在鞘氨醇單胞菌中分離克隆了3個內(nèi)切酶及一個外切酶,Hg2+對這四種酶的活性均有促進作用,同時也存在其他金屬離子對克隆出的4個酶有促進或抑制作用。AlgNJU-03的酶活在含有Ca2+、Fe2+或Co2+環(huán)境中提高,特別是Ca2+對其酶活促進作用最為明顯[7]。Ca2+對較多的褐藻膠裂解酶的酶活具有促進作用,但也有例外,比如AlyF具有鈣不依賴性[8],Ca2+對Aly17B具有抑制作用[35]等。
Zhu等[14]從Microbulbifersp.ALW1中分離出的褐藻膠裂解酶在0.5 mol/L Na+作用下酶活提高5.1倍。重組酶Aly1281[12]具有明顯的耐鹽性,使其可以應用于褐藻的工業(yè)酶法加工而無需進行水密集的脫鹽處理。
褐藻膠裂解酶可應用于食品、農(nóng)業(yè)、制藥及能源等方面,其不僅可以降解褐藻膠,定向制備褐藻寡糖,也可用于闡明褐藻膠的細微結(jié)構(gòu)、制備海藻原生質(zhì)體、發(fā)酵生產(chǎn)乙醇、降解生物膜等。
褐藻膠內(nèi)切酶是將褐藻膠生產(chǎn)為功能性低聚糖(2-5糖)的關(guān)鍵工具,不同聚合度的褐藻寡糖的應用也不盡相同。低分子質(zhì)量(500~3000 Da)和較高的M/G比(>1)的褐藻寡糖能更好地促進植物的生長[2]。Zhang等[3]和Zhu等[14]發(fā)現(xiàn)的褐藻膠裂解酶產(chǎn)的二糖均具有抗氧化活性。Chen等[4]分離出4個不同聚合度(DPs)的寡糖,但在這些寡糖中僅五糖對骨肉瘤細胞顯示抗腫瘤功能。
褐藻膠裂解酶也可用于分析或修飾褐藻膠的精細結(jié)構(gòu)。Aarstad等[1]采用H-1 NMR,HPAEC-PAD和SEC-MALLS等方法分析降解的反應產(chǎn)物和分離的褐藻膠片段,實現(xiàn)褐藻膠的測序。褐藻膠裂解酶也可以制備藻類的原生質(zhì)體,應用于基因工程和獲得再生植株。Inoue等[36]發(fā)現(xiàn)褐藻膠裂解酶可以分解凝膠結(jié)構(gòu),進而有效地從日本粳稻葉片中分離出原生質(zhì)體。
褐藻膠作為生產(chǎn)生物乙醇的可再生資源,已引起越來越多的關(guān)注。褐藻膠、甘露醇和葡萄糖的分解代謝產(chǎn)生了丙酮酸鹽,可以從中合成大量的燃料,Wargacki等[5]建立了生產(chǎn)乙醇的微生物平臺,其產(chǎn)量可以達到理論值的80%。目前僅在實驗室條件下采用工程菌株生產(chǎn)乙醇,還無法完全應用于工業(yè)生產(chǎn)。
褐藻膠裂解酶能夠降解細菌分泌的褐藻膠形成的生物被膜,增強抗生素的滲透性。部分抗生素(妥布霉素、頭孢克肟)與褐藻膠裂解酶具有協(xié)同作用,可以促進生物膜的根除,相反也有的抗生素(環(huán)丙沙星)與褐藻膠裂解酶的結(jié)合顯示拮抗作用[11]。褐藻膠裂解酶在囊性纖維化的治療中也顯示出巨大的潛力,Wan等[37]創(chuàng)建了銀納米復合材料,遞送兩種藥物化合物(褐藻膠裂解酶和頭孢他啶)以降解褐藻膠并從肺部根除銅綠假單胞菌。
目前已經(jīng)分離并鑒定了各種來源的褐藻膠裂解酶,這些酶具有不同的結(jié)構(gòu)、作用方式和底物特異性,其酶學性質(zhì)也是多種多樣的,可應用于食品、農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥和能源等領(lǐng)域。
雖然目前關(guān)于褐藻膠裂解酶的研究有很大進展,但仍有許多工作要做。目前發(fā)現(xiàn)的褐藻膠裂解酶的穩(wěn)定性較低,使其僅處于實驗室水平,很少應用于工業(yè)中,因此分離出活性高和穩(wěn)定性好的新型酶對于褐藻膠裂解酶的研究和工業(yè)發(fā)展都具有重要意義。