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      青島市霧天細(xì)菌氣溶膠群落結(jié)構(gòu)特征及健康風(fēng)險?

      2022-02-24 04:09:42王太恒祁建華李先國張大海
      關(guān)鍵詞:霧天晴天菌門

      張 婷, 王太恒, 祁建華, 李先國, 張大海??

      (1. 中國海洋大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院, 山東 青島 266100; 2. 中國海洋大學(xué)海洋環(huán)境與生態(tài)教育部重點實驗室, 山東 青島 266100)

      近年來,中國經(jīng)濟迅猛發(fā)展,隨之而來的副產(chǎn)物——霧霾,頻繁覆蓋全國各大城市,且多以“組合”的形式出現(xiàn)在大眾視野[1]。一方面雖然霧、霾產(chǎn)生的機理不同,但都伴隨著能見度低、風(fēng)速小、相對濕度高的特點。另一方面,均與大氣氣溶膠有密不可分的聯(lián)系[2],并且特定時間段內(nèi),隨著相對濕度的變化,二者可以相互轉(zhuǎn)化[3]。Meng等[4]研究發(fā)現(xiàn),霧滴可以促進細(xì)顆粒物在近地表層的積累,進而影響其時空分布。

      霾又稱灰霾和陰霾,其中PM2.5是霾發(fā)生的主要原因[5],霧霾天氣下生物氣溶膠群落結(jié)構(gòu)特征已經(jīng)有很多相關(guān)報道[6-7]。Wei等[8]利用紫外空氣動力學(xué)粒子光譜儀檢測霧霾環(huán)境下大氣生物氣溶膠,發(fā)現(xiàn)霧霾天氣下熒光粒子濃度是晴天的6倍以上,同時霧霾環(huán)境下生物氣溶膠中具有更多的致敏和致病性微生物。生物氣溶膠受霧霾天氣影響顯著,同時也有研究發(fā)現(xiàn),生物氣溶膠的群落結(jié)構(gòu)表現(xiàn)出明顯的季節(jié)變化。Du等[9]發(fā)現(xiàn),北京市霧霾期間生物氣溶膠群落結(jié)構(gòu)與污染水平?jīng)]有明顯的相關(guān)性,主要是由季節(jié)變化驅(qū)動。在天氣監(jiān)測與研究中,霧和霾是兩種不同的天氣現(xiàn)象[10]。霧是一種低層云,作為一種災(zāi)害性自然現(xiàn)象,會對交通運輸、農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和公共生活造成影響。霧天相對濕度高、光照較弱,不益于人們進行室外活動,容易造成胸悶、氣短和注意力不集中等不良反應(yīng)。但是微生物在這種生存條件下可以保持良好的活性及代謝能力[11]。霾是空氣中顆粒物增多,導(dǎo)致能見度降低的大氣污染現(xiàn)象[12]。霾天細(xì)顆粒物增多,為微生物提供了附著、傳播的載體,同時大氣中金屬離子、有機化合物(例如多環(huán)芳烴)和硝基衍生物等濃度發(fā)生顯著波動,某些成分對微生物的生存具有毒性作用,從而導(dǎo)致耐性差的物種消失[13]。簡而言之,以霧霾或顆粒物水平進行研究,會導(dǎo)致霧天生物氣溶膠的群落特征認(rèn)知模糊,健康風(fēng)險被忽視。由于霧、霾本質(zhì)上的差異,應(yīng)該在研究中對二者進行嚴(yán)格地區(qū)分。

      本研究排除采樣時間跨度帶來的影響,同時基于霧和霾本質(zhì)上的差異,采集青島市2020年7—9月空氣質(zhì)量指數(shù)(Air Quality Index,AQI)小于100且不同相對濕度下的生物氣溶膠樣品。分析霧天與晴天環(huán)境下細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)差異,結(jié)合BugBase細(xì)菌功能預(yù)測和人間傳染微生物的研究結(jié)果,評估了高相對濕度下生物氣溶膠給人體帶來的健康風(fēng)險。

      1 材料和方法

      1.1 采樣時間及地點

      采樣地點位于中國海洋大學(xué)嶗山校區(qū)氣象觀測站(36°10′N, 120°30′E)(見圖1)。于2020年7—9月采集不同相對濕度生物氣溶膠樣品,按AQI<100,相對濕度90.00%為標(biāo)準(zhǔn)[14]分為2個霧天(F1、F2)和2個晴天樣本(S1、S2)。

      圖1 采樣位置

      1.2 采樣方法

      采用KC-1000型大流量TSP采樣器(青島嶗山電子儀器總廠有限公司)采集生物氣溶膠樣品,流量1 m3·min-1,采樣時間24 h,采樣膜采用石英纖維濾膜,采樣前用馬弗爐500 ℃灼燒4 h,采樣后用無菌錫箔紙包裹,放置在超低溫冰箱內(nèi)保存。氣象數(shù)據(jù)來源于青島市氣象局(http://qdqx.qingdao.gov.cn/),顆粒物和氣體污染物濃度來源于青島市環(huán)境保護局資料(http://www.qepb.gov.cn/m2/index.aspx)(見表1)。

      表1 采樣期間氣象參數(shù)、顆粒物及氣體污染物濃度

      1.3 DNA提取

      采用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法[15]對樣本的基因組DNA進行提取,通過瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的純度和濃度,取適量的樣本DNA于離心管中,使用無菌水稀釋。以稀釋后的基因組DNA作為聚合酶鏈?zhǔn)?PCR)反應(yīng)模板,對16SrRNA基因的V4-V5區(qū)域進行擴增。使用TruSeq?DNA PCR-Free Sample Preparation Kit建庫試劑盒進行文庫構(gòu)建,構(gòu)建好的文庫,經(jīng)過量子(Qubit)和定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Q-PCR)定量。文庫合格后,使用NovaSeq6000進行上機測序。根據(jù)Barcode序列和PCR擴增引物序列從下機數(shù)據(jù)中拆分出各樣本數(shù)據(jù),截去Barcode和引物序列后使用FLASH對每個樣本的測序讀段(Reads)進行拼接、過濾和去除嵌合體的處理,得到最終的有效數(shù)據(jù)(Effective Tags)。利用Uparse軟件對所有樣本的全部有效數(shù)據(jù)進行聚類,默認(rèn)以97.00%的一致性將序列聚類成為可操作分類單元(OTU),根據(jù)OTUs序列進行物種注釋[16]。

      1.4 功能注釋

      利用BugBase[17]對細(xì)菌進行功能注釋,以97.00%的一致性將序列聚類成為的OTU表作為輸入文件。首先通過預(yù)測的16S拷貝>數(shù)對OTU表進行標(biāo)準(zhǔn)化處理,然后使用預(yù)先處理好的數(shù)據(jù)庫和BugBase工具自動選擇的閾值來預(yù)測微生物表型。分為以下七類:革蘭氏陽性、革蘭氏陰性、生物膜形成、致病性、移動元件、氧需求(好氧型、厭氧型和兼性厭氧型)及氧化脅迫耐受。

      2 結(jié)果與討論

      2.1 Alpha多樣性分析

      兩組樣品經(jīng)拼接、質(zhì)控和去嵌合體后共得到有效數(shù)據(jù)124 466條,以97.00%的一致性聚類為352個OTU,注釋到34門、58綱、118目、163科、201屬和91種。兩組樣品覆蓋率均為1,說明測序深度已達(dá)到要求,樣品具有代表性。樣品韋恩圖(見圖2)顯示,霧天總OTUs數(shù)值為237、獨有OTUs數(shù)值為58,晴天總OTUs數(shù)值為294、獨有OTUs數(shù)值為115,均高于晴天。Dong等[18]研究發(fā)現(xiàn),霧天微生物的濃度為9.00×105cells·m-3,漲幅約為晴天的37.00%,采樣期間霧天PM2.5濃度為76.50μg·m-3,晴天為52.20μg·m-3,而本研究采樣期間霧天AQI,PM2.5和PM10等污染物濃度均低于晴天(見表1),顆粒物污染可能是導(dǎo)致研究結(jié)果相反的重要原因,說明本研究排除了類似霾天的顆粒物污染。

      圖2 樣本韋恩圖

      霾天細(xì)菌氣溶膠相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),霾發(fā)生時微生物總數(shù)增加[19],不同天氣下微生物總數(shù)呈現(xiàn):霾天>晴天>霧天。兩組樣品共有OTUs數(shù)為179,說明這些物種具有較強的適應(yīng)能力,可以在不同天氣條件下穩(wěn)定生存。隨著相對濕度的升高,樣品中OTUs呈現(xiàn)先下降后上升再下降的趨勢。當(dāng)相對濕度開始升高時,一些細(xì)菌物種不能適應(yīng)環(huán)境的改變而消失,OTUs降低;當(dāng)相對濕度高達(dá)90%(霧天)以上時,一些適應(yīng)高相對濕度環(huán)境的物種變多,OTUs升高;但當(dāng)相對濕度高達(dá)99%時,此時的生存環(huán)境對于微生物是比較苛刻的,導(dǎo)致OTUs再次下降。

      晴天香農(nóng)指數(shù)(3.63)、辛普森指數(shù)(0.72)、Chao1指數(shù)(222.01)均大于霧天(香農(nóng)指數(shù)(2.73)、辛普森指數(shù)(0.55)、Chao1指數(shù)(216.39)),說明晴天樣品的生物多樣性、豐富度和均勻度更高,這與霾天物種多樣性的變化趨勢相同。霧、霾天氣發(fā)生時,生物多樣性呈下降趨勢。相關(guān)研究表明,相對濕度與微生物多樣性呈顯著負(fù)相關(guān)[9,20],解釋了霧天生物多樣性的下降。霧天時,一些細(xì)菌不能適應(yīng)生存條件的改變而大規(guī)模消失,與此同時適應(yīng)霧天環(huán)境的物種增加,組內(nèi)親緣指數(shù)上升(霧天:26.115、晴天:19.611),說明霧天樣品的組內(nèi)親緣關(guān)系更復(fù)雜,晴天兩個樣本群落結(jié)構(gòu)更加相似,F(xiàn)2采樣期間相對濕度高達(dá)99%,與另一個樣品區(qū)別較大,說明相對濕度越高,生物多樣性變化幅度越大。

      2.2 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)

      由前十門相對豐度圖(見圖3(a))可知,前十門相對豐度差別較大,變形菌門占主導(dǎo)地位,具有絕對優(yōu)勢,是霧天和晴天樣品的優(yōu)勢菌門,霧天相對豐度為79.48%、晴天相對豐度為69.67%。斯皮爾曼相關(guān)性分析(見圖4(a))顯示,變形菌門與氣象因子并沒有明顯的相關(guān)性。相關(guān)研究表明,變形菌門是細(xì)菌中最大門類,也是不同地區(qū),不同生物氣溶膠樣本中優(yōu)勢菌門[21-22]。其次是放線菌門(霧天11.72%、晴天13.91%)和厚壁菌門(霧天2.67%、晴天3.80%)。霾天相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),變形菌門與厚壁菌門相對豐度差別不大[23-24]。然而本研究中二者相對豐度相差極大,變形菌門的相對豐度是厚壁菌門的20倍,采樣時平均相對濕度高達(dá)87%,同時厚壁菌門在霧天的相對豐度小于晴天,說明變形菌門受相對濕度變化影響較小,但厚壁菌門影響較大。當(dāng)霧發(fā)生時藍(lán)細(xì)菌門和脫硫菌門相對豐度明顯降低(藍(lán)細(xì)菌門:晴天5.38%、霧天0.55%;脫硫菌門:晴天相對0.17%、霧天小于0.01%)。由圖4(a)可以看出,以上兩個細(xì)菌門與相對濕度呈負(fù)相關(guān),說明藍(lán)細(xì)菌門與脫硫菌門不適應(yīng)高濕度的生存環(huán)境,相對濕度增加,兩種門類的一些菌種消失。擬桿菌門、綠彎菌門、酸桿菌門等在兩組樣品中差別不大,說明以上幾種菌門對環(huán)境的耐性較好,受環(huán)境影響較小。

      由前十屬相對豐度圖(見圖3(b))可以看出,羅爾斯通氏菌在兩組樣品中相對豐度均超過50%(霧天64.29%、晴天51.28%),是兩組樣品的絕對優(yōu)勢菌屬。羅爾斯通氏菌又名青枯菌,是一種已知的植物病原體,被稱為植物“癌癥”,會造成農(nóng)作物減產(chǎn)[25],屬水平相關(guān)性分析熱圖(見圖4(b))。圖4(b)顯示,羅爾斯通氏菌屬與O3呈正相關(guān),采樣時霧天O3平均濃度高于晴天,因此相對濕度高的環(huán)境下需要對農(nóng)作物進行青枯病的防治。除羅爾斯通氏菌屬外,其他菌屬相對豐度較為均勻,丙酸菌(7.89%)和副球菌(4.39%)是晴天優(yōu)勢菌屬(相對豐度>2%),短桿菌(4.33%)、丙酸菌(2.91%)和短波單胞菌(2.10%)是霧天優(yōu)勢菌屬。丙酸菌是皮膚病原菌,暴露于高濃度的丙酸桿菌,會引起面部以及軀干皮膚疾病[26],丙酸菌與NO2呈正相關(guān)與相對濕度呈負(fù)相關(guān),副球菌屬與溫度呈負(fù)相關(guān),因此以上兩種菌屬在晴天相對豐度較高。短桿菌屬與溫度呈現(xiàn)正相關(guān),不動桿菌屬與NO2呈現(xiàn)負(fù)相關(guān),因此兩種菌屬在霧天相對豐度較高。

      圖3 不同天氣下物種相對豐度圖

      圖4 Spearman相關(guān)性分析熱圖

      通過實驗結(jié)果發(fā)現(xiàn):霧天微生物幾乎來源于本土,這一點與霾天相關(guān)研究有很大區(qū)別。霾天顆粒物增多,會帶來顆粒物源區(qū)的微生物菌屬[27-29],同時不同地區(qū)研究發(fā)現(xiàn),霾發(fā)生時微生物群落變化較大,且優(yōu)勢菌屬具有很大差異[30]。但是霧天相對濕度高,不利于微生物的擴散和釋放[31],出現(xiàn)新物種的概率較低,與晴天的細(xì)菌在屬水平上差異性較小,只是相對豐度有所不同。

      2.3 基因功能注釋及健康風(fēng)險

      生物氣溶膠是微生物病原體(內(nèi)毒素、過敏原)的已知來源[32],會對人類及動植物的健康造成不良影響[33-36]。國內(nèi)外對于生物氣溶膠健康風(fēng)險的評估方式大體分為四種:動物實驗、沉積動力學(xué)、大數(shù)據(jù)和平均日暴露劑量率模型推算。其中最常用的還是1999年美國環(huán)境保護署提出的平均日劑量率(ADD)模型[37],但可培養(yǎng)類微生物在空氣中微生物總數(shù)的占比不到1%,隨著高通量技術(shù)的發(fā)展,基因功能預(yù)測開始被應(yīng)用于環(huán)境樣本的研究中。

      由BugBase預(yù)測的細(xì)菌7種表型豐度圖(見圖5)可以看出,兩種天氣中好氧細(xì)菌相對豐度高達(dá)85%以上,晴天好氧細(xì)菌比霧天相對豐度高(晴天93.64%、霧天84.75%),同時霧天厭氧細(xì)菌占比高于晴天(霧天0.80%、晴天0.47%)。霧天相對濕度高,空氣中聚集大量水珠,使氣溶膠粒子散射吸濕增長、消光特性增強[38],從而導(dǎo)致霧天紫外線照射空氣透過率低,植物光合作用不充分,氧氣含量低于晴天。氧氣含量的降低使得一些對氧氣需求比較大的好氧型細(xì)菌物種消失,導(dǎo)致其豐度低于晴天。兩組樣品中兼性厭氧型細(xì)菌相差不大,相對豐度約為4%。霧天樣品中移動原件型細(xì)菌相對豐度70.13%,高于晴天樣品(56.55%),移動原件型細(xì)菌可以使細(xì)菌進行表型進化,從而最大限度地獲得和適應(yīng)環(huán)境,并生存繁殖出所必須的功能,霧天相對豐度高是因為一部分細(xì)菌進行了表型的進化,適應(yīng)了高相對濕度的環(huán)境。兩種天氣中革蘭氏陰性菌占比均高于陽性菌,豐度相差不大。革蘭氏陰性菌相對豐度為85%左右,革蘭氏陽性菌相對豐度為13%左右。常見的藍(lán)細(xì)菌和大多數(shù)致病性芽孢桿菌均呈現(xiàn)革蘭氏陰性反應(yīng),如:傷寒桿菌、百日咳桿菌、霍亂桿菌等。相關(guān)研究表明,革蘭氏陰性菌細(xì)胞壁外層特有的結(jié)構(gòu)——內(nèi)毒素[39],作為外源性致熱源會影響體溫調(diào)節(jié)中樞,引起宿主發(fā)熱、發(fā)炎,同時很容易附著在顆粒上造成肺擴散能力降低[40-41]。葡萄球菌、肺炎雙球菌、破傷風(fēng)等致病菌呈革蘭氏陽性反應(yīng),產(chǎn)生外毒素從而感染疾病。霧天潛在性致病菌相對豐度高達(dá)73.42%,高于晴天(59.95%),霧天生物氣溶膠中的致病性細(xì)菌更多,給人體帶來的健康風(fēng)險更大。

      圖5 微生物預(yù)測表型豐度圖

      兩種天氣條件下均檢測出棒狀桿菌、沙雷氏菌、葡萄球菌、奈瑟菌、不動桿菌和摩根氏菌6種人間傳染致病性微生物,霧天總相對豐度為6.51%,晴天為4.42%。其中棒狀桿菌、沙雷氏菌和葡萄球菌在兩種天氣下相對豐度相差不大,梭狀芽孢桿菌是棒狀桿菌屬中最需要關(guān)注的菌種,是引起傳染性疾病——白喉的病原體[42]。沙雷氏菌和不動桿菌廣泛分布于環(huán)境中,屬于條件性致病菌和醫(yī)院獲得性病原體,粘質(zhì)沙雷氏菌會引發(fā)術(shù)后病人敗血癥,鮑曼不動桿菌會引起肺炎、心內(nèi)膜炎、皮膚和軟組織感染及腦膜炎等。葡萄球菌分為兩大類:金黃色葡萄球菌和非金黃色葡萄球菌。金黃色葡萄球菌是社區(qū)和醫(yī)院獲得性感染的主要原因之一,會引起淺表膿腫和傷口感染、深部和全身性感染,例如骨髓炎和中毒性休克綜合征等疾病,在非金黃色葡萄球菌中,表皮葡萄球菌會造成導(dǎo)管的相關(guān)感染[43]。奈瑟菌在晴天含量較高(1.63%),霧天相對豐度小于0.01%。不動桿菌以及摩根氏菌在霧天相對豐度較高(>1.5%),晴天相對豐度小于0.01%,致病性奈瑟氏菌(淋病奈瑟氏球菌和腦膜炎奈瑟氏球菌)具有改變表面結(jié)構(gòu)從而在人類黏膜組織上定殖的能力,進而導(dǎo)致淋病和流行性腦膜炎[44]。摩根氏菌常見于糞便中,是一種機會性致病菌。兩種天氣下潛在病原體與人間傳染微生物相對豐度變化結(jié)果表明,霧天致病性以及傳染性菌種更為豐富,需要更加引起關(guān)注。

      3 結(jié)論

      (1) 霧天OTUs、物種多樣性及豐富度均低于晴天,組內(nèi)親緣復(fù)雜度高于晴天。相對濕度越高,物種多樣性變化幅度越大。羅爾斯通氏菌、短桿菌、丙酸菌和短波單胞菌是霧天優(yōu)勢菌屬。霧天微生物幾乎來源于本土,與晴天存在的細(xì)菌屬水平上幾乎相同,只是相對豐度上有一定差異性。

      (2) 革蘭氏陰性菌與革蘭氏陽性菌在兩組樣品中差別不大,霧天潛在致病性細(xì)菌相對豐度(73.42%)高于晴天(59.95%)。兩種天氣條件下均檢測出棒狀桿菌、沙雷氏菌、葡萄球菌、奈瑟菌、不動桿菌和摩根氏菌6種人間傳染致病性微生物,霧天總相對豐度為6.51%,晴天為4.42%。其中棒狀桿菌、沙雷氏菌和葡萄球菌在兩種天氣下相對豐度相差不大,奈瑟菌在晴天含量較高,不動桿菌和摩根氏菌在霧天相對豐度較高。

      (3) 結(jié)合潛在病原體和人間傳染微生物分析,結(jié)果表明霧天生物氣溶膠給人體帶來的健康風(fēng)險高于晴天。

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