余 蘊(yùn),向 勇,李慶缽,劉 鵬,黎麗珍,廖 明,曹偉勝, 3, 4, 5, 6*
(1. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院,廣州 510642;2. 嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實(shí)驗(yàn)室,廣州 510642;3. 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部人獸共患病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣州 510642;4. 廣東省動(dòng)物源性人獸共患病預(yù)防與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣州 510642;5. 人獸共患病防控制劑國(guó)家地方聯(lián)合工程實(shí)驗(yàn)室,廣州 510642;6. 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部獸用疫苗創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣州 510642)
銅綠假單胞菌(Pseudomonasaeruginosa,PA)是一種分布廣泛的人獸共患條件致病菌,可以在人、動(dòng)物、環(huán)境中循環(huán)傳播[1-2],嚴(yán)重影響著人類(lèi)健康和畜禽養(yǎng)殖生產(chǎn)。研究人員對(duì)PA耐藥性的關(guān)注度從未降低,它是醫(yī)院臨床高度關(guān)注并愈發(fā)棘手的問(wèn)題,作為對(duì)抗PA最后一道有效防線的亞胺培南和美羅培南等碳青霉烯類(lèi)抗菌藥也逐漸失去其作用[3-4]。近年來(lái),有研究發(fā)現(xiàn)雞及其養(yǎng)殖環(huán)境當(dāng)中的PA中一些重要耐藥基因的檢出率逐漸升高,如金屬β內(nèi)酰胺酶(metallo-β-lactamases,MBLs)的相關(guān)耐藥基因MBLVIM-2和MBLSPM-1等[5-6]。張艷等[7]對(duì)從醫(yī)院分離到的100株P(guān)A進(jìn)行耐藥性分析,數(shù)據(jù)顯示,亞胺培南耐藥基因oprD2的檢出率為93.0%,顯著高于其他耐藥基因的檢出率,提示PA的耐藥性日漸嚴(yán)重,極大的危害臨床抗感染治療,在全球范圍內(nèi)均構(gòu)成極大的威脅[8-10]。但目前對(duì)種禽場(chǎng)孵化廳中PA的感染情況和耐藥性的相關(guān)報(bào)道仍然較少。因此,本研究旨在對(duì)廣東省種禽場(chǎng)孵化廳中PA的流行情況進(jìn)行調(diào)查,為預(yù)防和控制該病原菌提供理論依據(jù);其次,對(duì)分離到的PA進(jìn)行抗菌藥物敏感性分析及耐藥基因的檢測(cè),為種禽場(chǎng)的合理用藥提供參考。
LB瓊脂培養(yǎng)基、LB液體培養(yǎng)基、MH瓊脂培養(yǎng)基、MH培養(yǎng)基、銅綠假單胞菌ATCC27853、大腸桿菌ATCC25922均為廣東環(huán)凱微生物科技有限公司產(chǎn)品。NAC瓊脂培養(yǎng)基、NAC液體培養(yǎng)基、無(wú)菌均質(zhì)袋等均為青島海博生物技術(shù)有限公司產(chǎn)品。rTaqPCR Premix為上海翌圣生物科技有限公司產(chǎn)品;藥敏紙片為OXOID公司產(chǎn)品。SQ Tissue組織DNA提取試劑盒為OMEGA公司產(chǎn)品。
2018年3月—2019年1月,從廣東省5個(gè)不同規(guī)?;N禽場(chǎng)收集孵化廳內(nèi)21日齡仍未出殼且外殼完好的種蛋孵化死胚共655份,以及孵化機(jī)灰塵、污垢等環(huán)境樣本共24份,總計(jì)樣本679份。環(huán)境樣本用滅菌棉拭子采集并放入裝有適量的滅菌NAC液體培養(yǎng)基的15 mL離心管中,從樣品采集到運(yùn)送至實(shí)驗(yàn)室不超過(guò)8 h。
用75%酒精將死胚外殼充分消毒3次,無(wú)菌操作取出胚體并剪碎,尤其使胸腔、腹腔和卵黃囊充分暴露,隨后將整個(gè)胚體放入無(wú)菌均質(zhì)袋。接著加入適量的無(wú)菌NAC液體培養(yǎng)基到裝有樣品的無(wú)菌均質(zhì)袋中,37 ℃、120 r·min-1條件下選擇性增菌8 h, 增菌后移取1 mL增菌液轉(zhuǎn)種于10 mL新的無(wú)菌NAC液體培養(yǎng)基內(nèi),37 ℃、120 r·min-1進(jìn)行二次選擇增菌12~16 h。接著用接種環(huán)蘸取菌液劃線接種于NAC瓊脂培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)18~24 h,挑取疑似PA的綠色單菌落,參考文獻(xiàn)[11-12]進(jìn)行菌種16S rRNA基因和特異性基因oprI的PCR鑒定,并送至廣州擎科生物有限公司測(cè)序,引物序列見(jiàn)表1。
表1 PA的16S rRNA和oprI基因的PCR引物序列及產(chǎn)物片段大小
根據(jù)世界衛(wèi)生組織 (World health organziatio, WHO)推薦的 K-B 紙片擴(kuò)散法和美國(guó)臨床實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化委員會(huì)(Clinical and laboratory standards institute,CLSI)推薦的操作規(guī)程,以銅綠假單胞菌ATCC27853、大腸桿菌ATCC25922為藥敏試驗(yàn)質(zhì)控菌株,嚴(yán)格參照CLSI2019標(biāo)準(zhǔn)對(duì)試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行判定,測(cè)定所有PA分離株對(duì)22種抗菌藥物的敏感性??咕幬铮喊逼S西林(ampicillin,AMP)、復(fù)方新諾明(complex sulfamethoxazole,SXT)、萘啶酸(naphthyridic acid,NA)、卡那霉素(kanamycin,K)、四環(huán)素(tetracycline,TE)、氯霉素(chloramphenicol,C)、哌拉西林(piperacillin,PRL)、頭孢噻肟(cefotaxime,CTX)、頭孢吡肟(cefepime,F(xiàn)EP)、頭孢他啶(ceftazidime,CAZ)、頭孢哌酮(cefoperazone,CFP)、亞胺培南(imipenem,IPM)美羅培南(meropenem,MEM)、氨曲南(aztreonam,ATM)、哌拉西林/他唑巴坦(piperacillin/tazobactam,TZP)、頭孢哌酮/舒巴坦(cefoperazone/sulbactam,SCF)、妥布霉素(tobramycin,TOB)、阿米卡星(amikacin,AK)、慶大霉素(gentamicin,CN)、環(huán)丙沙星(ciprofloxacin,CIP)、左氧氟沙星(levofloxacin,LEV)和多黏菌素B(polymyxin B,PB)。
參照SQ Tissue組織DNA提取試劑盒(OMEGA)說(shuō)明書(shū)提取PA總DNA。參考文獻(xiàn)[13-14]中的PCR引物及反應(yīng)體系和條件對(duì)相應(yīng)28個(gè)耐藥基因(TEM、SHV、CTX、VEB、VIM、IMP、SPM、GIM、oprD2、NDM、DHA、OXA-10、OXA-23、qnrA、qnrD、qnrS、aac(3)-I、aac(3)-II、aac(6′)-Ib、aac(6′)-II、ant(3″)-I、tetA、tetB、catB、cmlA、qacE△1-sul1、mcr-1和NDM-1)進(jìn)行PCR檢測(cè)。PCR產(chǎn)物大于500 bp時(shí)反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性1 min,55 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min, 35個(gè)循環(huán);72 ℃后延伸8 min。PCR產(chǎn)物小于500 bp時(shí)反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性30 s,55 ℃ 退火30 s,72 ℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃后延伸8 min,退火溫度可根據(jù)引物合成的Tm值作適當(dāng)調(diào)整。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后,通過(guò)凝膠成像分析系統(tǒng)觀察并拍照保存。
PA在NAC瓊脂培養(yǎng)基及LB瓊脂培養(yǎng)基上均呈現(xiàn)出圓形、光滑、濕潤(rùn)的綠色菌落,并帶有特殊芳香氣味,生化分析結(jié)果顯示其均符合PA的生化特性(表2)。對(duì)分離到的疑似PA菌株的16S rRNA及oprI基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示其擴(kuò)增出大小約為470和214 bp左右的片段(圖1),結(jié)合測(cè)序結(jié)果確認(rèn)為PA。本研究分離鑒定出PA共77株(77/679,11.3%),其中,2株來(lái)源于環(huán)境樣本中的孵化機(jī)污垢(2/24,8.3%),75株來(lái)源于死胚(75/655,11.5%)(表3)。
表2 PA分離株的生化鑒定
M. DNA相對(duì)分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn);1. PA分離株;2. 陽(yáng)性對(duì)照;3. 陰性對(duì)照M. DNA marker; 1. PA isolates; 2. Positive control; 3. Negative control圖1 PA的16S rRNA和oprI基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳Fig.1 Agarose gel electrophoresis of PCR product for 16S rRNA and oprI gene
藥物敏感性試驗(yàn)結(jié)果顯示,除天然耐藥的AMP、K和NA之外,PA對(duì)TE、SXT、C的耐藥性較強(qiáng),耐藥率分別為100%、100%、75.4%,其次為CTX(11.7%)、CIP(9.1%)、LEV(9.1%)、CN(7.9%)、TOB(7.8%);另外,PA對(duì)PRL、CFP和AK也表現(xiàn)出了較低的耐藥率;未檢測(cè)到對(duì)FEP、CAZ、IPM、MEM、ATM、TZP、SCF和PB耐藥的PA菌株。除天然耐藥外,耐3類(lèi)或3類(lèi)以上抗菌藥的PA占比為74.1%(57/77),表現(xiàn)出多重耐藥性,其中,耐3類(lèi)抗菌藥的菌株數(shù)量最多,占62.3%(48/77);耐4類(lèi)抗菌藥的菌株占比為3.9%(3/77);耐6類(lèi)抗菌藥的菌株占比為7.8%(6//77)。耐藥譜分析顯示(表4),所有分離菌株100%表現(xiàn)出耐4種及以上抗菌藥,最廣耐14種抗菌藥,其中6耐菌株最多。
77株P(guān)A的28種耐藥基因檢測(cè)結(jié)果顯示,18種耐藥基因檢測(cè)陽(yáng)性(表5),其中磺胺類(lèi)的qacE△1-sul1檢出率最高,對(duì)應(yīng)的耐藥表型是SXT;而碳青霉烯類(lèi)耐藥基因oprD2的檢出率達(dá)到11.7%,對(duì)應(yīng)的耐藥表型主要是IPM;質(zhì)粒介導(dǎo)誘導(dǎo)產(chǎn)生氟喹諾酮類(lèi)耐藥的qnr基因qnrA、qnrD和qnrS的檢出率均為9.1%;氨基糖苷類(lèi)的aac(3)-II和ant(3″)-I耐藥基因檢出率最高;氯霉素類(lèi)耐藥基因檢出率最高為cmlA(2.6%);四環(huán)素類(lèi)耐藥基因以tetA(3.9%)為主?;前奉?lèi)的耐藥基因qacE△1-sul1陽(yáng)性率為13.73%,而5種常見(jiàn)的MBLs耐藥基因(VIM、IMP、SPM、GIM、NDM)及氨基糖苷類(lèi)的aac(3)-I和mcr-1檢測(cè)結(jié)果均為陰性。
表3 種雞場(chǎng)中PA分離株的數(shù)量及分離率
表4 PA的耐藥譜及相應(yīng)數(shù)量
表5 PA耐藥基因的檢出率
當(dāng)前,PA是醫(yī)院內(nèi)重要的條件致病菌,常引起免疫力低下或有外傷傷口患者的嚴(yán)重感染,而且是導(dǎo)致重癥病房患者死亡的罪魁禍?zhǔn)譡15-16]。關(guān)于醫(yī)院及其環(huán)境中PA的流行情況有太多的文獻(xiàn)報(bào)道,相比之下,關(guān)于動(dòng)物源PA的流行情況卻較少報(bào)道,缺乏該方面的流行病學(xué)數(shù)據(jù)。本研究共分離到77株P(guān)A,總體分離率為11.3%,其中,2株來(lái)源于環(huán)境樣本(2/24,8.3%),75株來(lái)源于死胚(75/655,11.5%);數(shù)據(jù)表明,不僅在死胚中發(fā)現(xiàn)有不同程度的PA感染,而且種禽場(chǎng)周?chē)h(huán)境中也有一定比例的PA污染。有研究表明,種禽場(chǎng)環(huán)境當(dāng)中的PA是污染種蛋的一個(gè)重要因素,尤其是孵化箱內(nèi)環(huán)境[17-19]。而在G場(chǎng)的死胚和環(huán)境樣本中均分離到了PA,因此作者推斷環(huán)境中的PA可能是導(dǎo)致種蛋感染的重要原因,即胚胎可能被孵化箱內(nèi)的PA污染,并侵入蛋殼,致其死亡;另一方面,即便是在死胚和環(huán)境樣本中均分離到了PA,但也不能將雞胚死亡或孵化率較低的結(jié)果全部歸因于PA的感染,因?yàn)樵趥€(gè)別養(yǎng)殖場(chǎng)的死胚中也分離到了沙門(mén)菌[20];所以,孵化率受影響是多種因素共同作用的結(jié)果。但在F場(chǎng)中并未分離到PA,說(shuō)明其飼養(yǎng)管理和生物安全措施實(shí)施得較好,推測(cè)這也是該場(chǎng)孵化率稍高于其他養(yǎng)殖場(chǎng)的原因。所以在家禽養(yǎng)殖過(guò)程中,不應(yīng)該繼續(xù)忽視PA的存在,應(yīng)當(dāng)重視起來(lái),需要加強(qiáng)飼養(yǎng)管理及生物安全措施,防止PA污染種蛋,避免損失。
本研究選取了常用的22種抗菌藥進(jìn)行藥物敏感性試驗(yàn),其中,IPM、PRL、FEP、CAZ等都是醫(yī)院臨床治療PA感染性疾病的一線藥物[21-22],但部分PA分離株也對(duì)其表現(xiàn)出了耐藥現(xiàn)象,即便其耐藥率較低,但也應(yīng)當(dāng)引起重視,特別是醫(yī)院臨床抗感染的一線藥物亞胺培南。而在所調(diào)查的11個(gè)養(yǎng)殖場(chǎng)中,均未使用上述抗菌藥,這也從側(cè)面反映出PA在群體遺傳進(jìn)化過(guò)程中,其耐藥性越來(lái)越強(qiáng),推測(cè)與全球范圍內(nèi)醫(yī)院中多重耐藥PA菌株的暴發(fā)流行有關(guān);反觀AMP、K、NA這3種抗菌藥,在養(yǎng)殖場(chǎng)中的使用率極高,但PA對(duì)其天然耐藥,因此不具備預(yù)防治療意義。而PA對(duì)SXT、TE、C三者的耐藥率也很高,因此養(yǎng)殖場(chǎng)需要更換其他抗菌藥使用。另外,耐藥譜分析顯示,最廣耐14種抗菌藥;其中多重耐藥PA占比高達(dá)為62.3%,這些數(shù)據(jù)表明禽源PA的耐藥情況同樣不容樂(lè)觀,且日漸嚴(yán)重。耐藥基因oprD2對(duì)應(yīng)的耐藥表型是亞胺培南,且醫(yī)院內(nèi)的PA分離株對(duì)IPM表現(xiàn)出較強(qiáng)的耐藥性[23-24]。而在本研究中,雖然未檢測(cè)到對(duì)IPM耐藥的菌株,但其oprD2基因的陽(yáng)性率高達(dá)11.7%,推斷可能是因?yàn)閛prD2耐藥基因沒(méi)有表達(dá)或表達(dá)量不夠,不足以引起對(duì)應(yīng)的耐藥表型,同時(shí)也提示種禽場(chǎng)PA分離株對(duì)IPM的耐藥性轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)水平較高。雖然本研究中分離到的PA并未被檢測(cè)到MBLs耐藥基因,但仍然不能掉以輕心,畢竟已表現(xiàn)出對(duì)碳青霉烯類(lèi)耐藥性轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn),并且有必要進(jìn)行動(dòng)物源PA耐藥基因的監(jiān)測(cè)。
PA目前的流行情況(尤其是醫(yī)院內(nèi)的流行情況)已經(jīng)十分嚴(yán)峻,而醫(yī)院中PA的流行在某種程度上對(duì)動(dòng)物源PA的流行造成了一定的威脅,醫(yī)院內(nèi)的PA傳播至ICU病人,病人將PA帶入到家庭環(huán)境,最終導(dǎo)致其寵物感染PA并發(fā)病,這都是有依據(jù)可言的。另一方面,由于PA強(qiáng)大的耐藥性和對(duì)環(huán)境的適應(yīng)性,使其本身就具有較強(qiáng)的流行性。在面對(duì)動(dòng)物源PA的逐漸流行時(shí),應(yīng)該趁早將其扼殺在搖籃里。
通過(guò)對(duì)5個(gè)不同種雞場(chǎng)中的種蛋孵化死胚和環(huán)境樣本進(jìn)行銅綠假單胞菌的分離鑒定,發(fā)現(xiàn)其死胚中均存在不同程度的感染,且個(gè)別種雞場(chǎng)的死胚和環(huán)境樣本中均分離到了該菌。這些PA分離株具有多重耐藥性,提示種雞場(chǎng)一方面應(yīng)做好生物安全措施,加強(qiáng)飼養(yǎng)管理,及時(shí)對(duì)種蛋、孵化機(jī)及其周邊環(huán)境進(jìn)行清潔和消毒;另一方面應(yīng)定期進(jìn)行藥敏試驗(yàn),根據(jù)結(jié)果合理選擇并交替使用抗菌藥,如阿米卡星、哌拉西林、頭孢哌酮等可作為銅綠假單胞菌較好的預(yù)防或治療藥物。