李鳳嬌,李艷芹 綜述,張 范,顧 雯,楊 敏,穆健康,俞 捷,楊興鑫 審校
(1.云南中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院,昆明 650500;2.云南省南藥可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,昆明 650500)
Parkin蛋白是激活E3泛素-蛋白連接酶活性的高效產(chǎn)物,研究表明,Parkin蛋白與帕金森病,腫瘤,肝臟、心臟、骨骼肌等疾病密切相關(guān)。Parkin蛋白在不同部位均有表達(dá),結(jié)構(gòu)多樣,Parkin的功能可能與這些部位編碼的蛋白質(zhì)相關(guān)。
在PDB數(shù)據(jù)庫(https://www.rcsb.org/)中檢索到Parkin蛋白的結(jié)構(gòu)共385個,其中有145個來源于人,37個來源于運(yùn)動發(fā)酵單胞菌,27個來源于歐洲水蛭,22個來源于大腸埃希菌,20個來源于牛,14個來源于熱保護(hù)芽孢桿菌,12個來源人體免疫缺陷病毒,108個來源于其他。這些蛋白根據(jù)蛋白分子庫名稱進(jìn)行分類有51個醛糖還原酶、37個Queuine tRNA-核糖基轉(zhuǎn)移酶,27個凝血酶原,24個E3泛素連接酶,23個碳酸酐酶2,20個水蛭素變體-1,5個Gag-Pol polyprotein。本文針對E3泛素連接酶Parkin的結(jié)構(gòu)功能,與人類疾病的關(guān)系及天然產(chǎn)物對Parkin的調(diào)節(jié)作用進(jìn)行簡要綜述。
Parkin基因,又稱PARK2,定位于染色體6q25-q27,包含12個外顯子,長約1.5 mb,編碼465個氨基酸,相對分子質(zhì)量為52×103,在健康人腦組織中呈散在分布,包括黑質(zhì)、新皮質(zhì)和海馬等部位。Parkin是一種環(huán)間E3泛素連接酶(E3 ubiquitin ligases),在泛素與特定底物的共價連接中發(fā)揮作用,Parkin的突變與帕金森病、癌癥和分枝桿菌感染有關(guān)。環(huán)間E3連接酶家族被認(rèn)為具有典型的環(huán)區(qū)和催化半胱氨酸殘基,通常局限于Hect E3連接酶,因此被稱為“環(huán)/Hect雜合酶”。在N端有1個泛素樣(UBL)功能區(qū)和1個靠近C端的RBR(RING-between-RING)功能區(qū)。RBR功能區(qū)調(diào)節(jié)鋅離子,由2個RING功能區(qū)組成。1個RING功能區(qū)已經(jīng)被鑒定是位于UBL和RBR的生物序列之間,具有鋅離子結(jié)合能力。Parkin蛋白可以定位于細(xì)胞質(zhì)和線粒體,依賴于線粒體膜電位的改變,具有E3泛素-蛋白連接酶活性,可連接并介導(dǎo)毒性蛋白發(fā)生泛素化,因此,毒性蛋白可以通過Parkin從泛素蛋白酶體通路降解。另外,Parkin蛋白還參與調(diào)控線粒體形態(tài)和功能維持,當(dāng)存在線粒體腫脹、線粒體嵴斷裂等明顯缺陷時,通過線粒體自噬途徑將其清除,從而達(dá)到提高線粒體功能的作用。
Parkin蛋白在不同部位的表達(dá)與人類疾病關(guān)系密切,Parkin蛋白在許多組織中均有表達(dá),包括腦、骨骼肌、心臟和肝臟中,多分布在胞質(zhì),在線粒體外膜、高爾基體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和突觸小泡中也存在,提示Parkin蛋白也可能與這些部位的功能相關(guān),具有廣泛的生理意義。
Parkin是一種E3泛素連接酶,它用泛素標(biāo)記特定的蛋白底物,并將它們靶向蛋白酶體或溶酶體[1-2]。基因突變導(dǎo)致的Parkin功能喪失是家族性早發(fā)性常染色體隱性遺傳性帕金森病(PD)最常見的原因[3]。帕金森病是一種神經(jīng)退行性疾病,其特征是黑質(zhì)致密部產(chǎn)生多巴胺的神經(jīng)元選擇性喪失,并出現(xiàn)富含α-突觸核蛋白和泛素的包涵體路易小體。與PD相關(guān)的Parkin突變通過催化損傷或降低Parkin溶解度和穩(wěn)定性導(dǎo)致Parkin功能喪失。在散發(fā)性帕金森病中,Parkin失活與淀粉樣蛋白的積累有關(guān),淀粉樣蛋白的積累改變了它的溶解性,從而改變了它的穩(wěn)定性[4],這表明Parkin喪失功能可導(dǎo)致疾病的發(fā)生。
越來越多的證據(jù)表明,Parkin也是一種腫瘤抑制因子。已有報道稱其在人類多種癌癥中失活。Parkin在30%的人類腫瘤細(xì)胞中缺失,且Parkin缺陷的小鼠更容易發(fā)生腫瘤[5-6]。Parkin基因定位于人類染色體6q25-27,這是癌癥中經(jīng)常丟失的區(qū)域[4]。在乳腺癌、肺癌、結(jié)直腸癌和卵巢癌中已經(jīng)觀察到PARK2丟失[7-8]。Parkin基因的突變已經(jīng)在許多類型的癌癥中被報道,如,Parkin基因在乳腺癌、結(jié)直腸癌、肺鱗癌和胃癌中發(fā)生突變[9]。許多流行病學(xué)研究表明,PD與前列腺癌、肺癌、膀胱癌、胃癌、子宮癌和結(jié)直腸癌的風(fēng)險降低及黑色素瘤、腦癌和乳腺癌的風(fēng)險增加有關(guān)[10]。在一項研究中,Parkin促進(jìn)人癌細(xì)胞系異種移植物中的磷酸甘油酸脫氫酶降解,抑制絲氨酸合成并抑制腫瘤生長[11]。提示未來的研究還應(yīng)該觀察Parkin基因突變在介導(dǎo)PD和癌癥風(fēng)險之間的聯(lián)系中的潛在作用。
近年來,大量研究表明Parkin與肝臟疾病密切相關(guān),2013年P(guān)LOS PATHOGENS首次在慢性丙型肝炎患者的肝組織檢測到了Parkin誘導(dǎo)的線粒體自噬,這在慢性丙型肝炎相關(guān)的線粒體肝損傷中有重要貢獻(xiàn)[12]。隨后,WILLIAMS等[13]研究發(fā)現(xiàn)與正常小鼠相比,乙醇導(dǎo)致Parkin基因敲除小鼠肝損傷、氧化應(yīng)激和脂肪變性更嚴(yán)重,這可能是由于乙醇處理后,Parkin基因敲除小鼠肝臟的線粒體損傷和功能障礙比正常小鼠肝臟嚴(yán)重所致。PENG等[14]討論了調(diào)節(jié)Parkin介導(dǎo)的線粒體自噬可能是治療酒精性脂肪肝的途徑。YAMADA等[15]和LIU等[16]研究發(fā)現(xiàn)Pink1/Parkin介導(dǎo)的線粒體自噬能緩解非酒精性脂肪肝(NAFLD)。李相遷[17]研究發(fā)現(xiàn),隨NAFLD發(fā)展,線粒體損傷加重,Pink1/Parkin介導(dǎo)線粒體自噬降低,ROS釋放增加,炎性反應(yīng)加重,推測Pink1/Parkin介導(dǎo)的線粒體自噬途徑參與了NAFLD過程。2019年ZHOU等[18]研究發(fā)現(xiàn)Mst1通過AMPK途徑調(diào)節(jié)Parkin的表達(dá),阻斷AMPK抑制了Parkin介導(dǎo)的線粒體自噬,使肝細(xì)胞線粒體發(fā)生凋亡,研究證實(shí)非酒精性脂肪肝與Mst1上調(diào)導(dǎo)致的Parkin介導(dǎo)線粒體自噬密切相關(guān)。
2019年SUN等[19]報道了Parkin通過催化CypD的泛素化來抑制MPTP的開放,減輕心肌損傷,改善心臟功能。KAGEYAMA等[20]證明需要蛋白Drp1和Parkin協(xié)同維持小鼠心臟和大腦線粒體結(jié)構(gòu)和功能的完整性。缺乏Drp1的小鼠表現(xiàn)出致命的心臟缺陷。在Drp1基因敲除后,線粒體泛素化不依賴于Parkin,這會加重心臟缺陷。ZHANG等[21]通過研究Parkin蛋白在心肌梗死大鼠心功能和心室重構(gòu)中的作用發(fā)現(xiàn),經(jīng)Parkin治療后,心肌梗死大鼠相關(guān)mRNA水平降低,凋亡細(xì)胞數(shù)量減少,心肌纖維形態(tài)恢復(fù)正常,心肌梗死范圍縮小,心功能改善。證明Parkin對心肌梗死大鼠的心功能和心室重構(gòu)有積極的作用。QIAO等[22]研究發(fā)現(xiàn)利拉魯肽通過上調(diào)NAD依賴的蛋白去乙?;竤irtuin-1(SIRT1)的表達(dá),從而增加Parkin的表達(dá),激活線粒體自噬,進(jìn)而發(fā)揮心肌梗死的修復(fù)作用。Parkin過表達(dá)也能激活Nrf2/ARE信號通路,減少炎癥介導(dǎo)的心肌細(xì)胞凋亡。
2018年P(guān)EKER等[23]研究發(fā)現(xiàn),將體外培養(yǎng)的骨骼肌Parkin基因敲除后可導(dǎo)致肌小管萎縮,且Parkin基因敲除的肌肉中線粒體功能受損,肌纖維面積變小,這表明Parkin是骨骼肌生長發(fā)育所必需的。同年,GOUSPILLOU等[24]報道了在Park2-/-小鼠中發(fā)現(xiàn)Parkin消融導(dǎo)致肌肉比力降低,線粒體呼吸嚴(yán)重減少,線粒體解偶聯(lián),并增加了通透性轉(zhuǎn)換孔開放的敏感性。這些結(jié)果表明Parkin在維持骨骼肌的線粒體功能方面起著保護(hù)作用。
Parkin還在通過吞噬異種來防御病原體方面起著關(guān)鍵作用,這是一種與線粒體自噬相關(guān)的途徑。在異源吞噬中,細(xì)菌被泛素鏈標(biāo)記,這些泛素鏈招募泛素結(jié)合的自噬適配器,導(dǎo)致自噬小體的形成,并最終與溶酶體融合。這一途徑涉及的泛素化底物和連接酶目前了解甚少。基因組研究證實(shí)Parkin是細(xì)胞內(nèi)麻風(fēng)分枝桿菌病原體的易感因素。近年來,已經(jīng)證明Parkin是通過自噬依賴的機(jī)制來抵抗細(xì)胞內(nèi)的病原體,如結(jié)核分枝桿和腸沙門菌[25]。線粒體和細(xì)菌的共同作用表明了Parkin介導(dǎo)的自噬的共同機(jī)制,但異種吞噬是否需要PINK1或相關(guān)激酶尚不清楚。
天然產(chǎn)物富含眾多活性成分,其特點(diǎn)是可從多環(huán)節(jié)、多靶點(diǎn)調(diào)節(jié)機(jī)體功能,從而達(dá)到綜合治療的目的。當(dāng)前,從天然產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)可調(diào)節(jié)Parkin蛋白進(jìn)而緩解相關(guān)疾病的活性物質(zhì)/藥物已成為研究熱點(diǎn),其對于天然產(chǎn)物資源的開發(fā)具有重大意義。研究發(fā)現(xiàn),一些天然產(chǎn)物對Parkin蛋白有調(diào)節(jié)作用并能有效緩解相關(guān)病癥(表1),這些天然產(chǎn)物主要是通過調(diào)節(jié)Parkin蛋白表達(dá)量以發(fā)揮藥效。
表1 天然產(chǎn)物調(diào)節(jié)Parkin蛋白、緩解疾病的作用
續(xù)表1 天然產(chǎn)物調(diào)節(jié)Parkin蛋白、緩解疾病的作用
Parkin蛋白是線粒體自噬調(diào)控的關(guān)鍵靶位,Parkin功能異常將會引發(fā)線粒體自噬異常,進(jìn)而誘發(fā)帕金森、腫瘤等相關(guān)疾病發(fā)生、發(fā)展。然而當(dāng)前已發(fā)現(xiàn)的可調(diào)節(jié)Parkin表達(dá)量的小分子配體仍非常少,且仍未見報道可調(diào)節(jié)Parkin活力的小分子配體;此外,雖然當(dāng)前已發(fā)現(xiàn)一些天然產(chǎn)物可調(diào)節(jié)Parkin蛋白表達(dá)而調(diào)節(jié)線粒體自噬,進(jìn)而緩解相關(guān)病癥,但已報道的可調(diào)節(jié)Parkin蛋白表達(dá)的單體成分仍較少,且通過調(diào)節(jié)Parkin活力而防治疾病的天然產(chǎn)物當(dāng)前仍未見報道。因此,應(yīng)廣泛開展Parkin配體的篩選研究,以期發(fā)現(xiàn)更多Parkin配體(尤其是小分子配體),為新藥研發(fā)提供新思路;同時,應(yīng)加強(qiáng)天然產(chǎn)物對Parkin蛋白表達(dá)量/活力的調(diào)節(jié)作用及相關(guān)機(jī)制的研究,為揭示天然產(chǎn)物發(fā)揮藥效的本質(zhì)提供科學(xué)依據(jù)。
此外,當(dāng)前對于天然產(chǎn)物調(diào)節(jié)Parkin蛋白而緩解疾病的大量研究仍停留在實(shí)驗(yàn)室階段,未能較好地指導(dǎo)臨床用藥。廣大科研工作者仍需將天然產(chǎn)物調(diào)節(jié)Parkin蛋白相關(guān)作用機(jī)制運(yùn)用到疾病防治中,為臨床探索防治疾病的有效方法提供新途徑。
可以相信,隨著Parkin蛋白與人類疾病關(guān)系,以及天然產(chǎn)物對Parkin蛋白調(diào)節(jié)等研究的不斷深入,將會發(fā)現(xiàn)眾多可通過調(diào)節(jié)Parkin蛋白而緩解疾病的天然藥品或健康產(chǎn)品,并將明確天然產(chǎn)物調(diào)節(jié)Parkin作用機(jī)制,不僅有助于闡明天然產(chǎn)物復(fù)雜體系的抗病機(jī)制,還能提高新藥研發(fā)及臨床治療水平,同時也為其他疾病的防治提供依據(jù)。