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      一株γ-聚谷氨酸高產(chǎn)菌株的篩選鑒定及發(fā)酵培養(yǎng)基優(yōu)化

      2022-09-19 09:27:12張必松陳宇航薛慧欣張翊姿朱益波
      常熟理工學(xué)院學(xué)報 2022年5期
      關(guān)鍵詞:氯化鐵谷氨酸氮源

      張必松,陳宇航,張 璐,薛慧欣,張翊姿,朱益波

      (常熟理工學(xué)院 生物與食品工程學(xué)院,江蘇 常熟 215500)

      0 引言

      γ-聚谷氨酸(γ-PGA)是一種通過微生物將D型和L型谷氨酸單體縮合形成的生物兼容高分子聚合物[1].其分子量在10~10 000 KDa,最早發(fā)現(xiàn)于炭疽桿菌的莢膜組成成分[2].因為γ-PGA分子量不同會呈現(xiàn)不同的特點,從而展現(xiàn)優(yōu)異的吸水性、保濕性、生物相容性及可降解性等性質(zhì),被廣泛應(yīng)用于化妝品、食品、藥物載體、環(huán)境保護(hù)、農(nóng)業(yè)菌肥等行業(yè)[3-5].因微生物發(fā)酵法相較于其他方法具有生產(chǎn)周期短、反應(yīng)條件溫和、環(huán)境污染小及產(chǎn)量高等優(yōu)點[6-7],工業(yè)上廣泛應(yīng)用其生產(chǎn)γ-PGA.迄今為止多數(shù)生產(chǎn)γ-PGA的菌株均屬于芽孢桿菌,依照是否利用谷氨酸作為前體,分為谷氨酸非依賴型和依賴型[8].谷氨酸依賴型菌株(例如Bacillus lichensATCC 9945a,Bacillus subtilisN-2)需要向培養(yǎng)基中添加L-谷氨酸或其前體來提高γ-PGA產(chǎn)量[9-10].非谷氨酸依賴型菌株如Bacillus methylis nutritionSK19.001和Bacillus licheniformisPGA-N可以利用無谷氨酸的培養(yǎng)基生產(chǎn)γ-PGA[11-12].雖然該類菌株可以縮減原料成本,但因其產(chǎn)量低且提升空間小的缺點,而較少被應(yīng)用于大規(guī)模生產(chǎn).除了生產(chǎn)菌株,培養(yǎng)基成本也是制約γ-PGA工業(yè)化生產(chǎn)的重要影響因素.目前工業(yè)生產(chǎn)γ-PGA高成本的主要原因是原材料和產(chǎn)物回收過程的成本居高不下,而原材料成本甚至達(dá)到了生產(chǎn)成本的60%[13].綜上所述,要實現(xiàn)γ-PGA的大規(guī)模工業(yè)生產(chǎn),必須要有優(yōu)良的生產(chǎn)菌株以及搭配合理的低成本培養(yǎng)基.本研究旨在從發(fā)酵大豆產(chǎn)品中篩選獲得γ-PGA高產(chǎn)菌株,并利用響應(yīng)面法預(yù)測最佳發(fā)酵培養(yǎng)基以提高γ-PGA的產(chǎn)量.

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 樣品來源

      (1)12種不同品名或產(chǎn)商的發(fā)酵豆制品均從常熟理工學(xué)院東湖校區(qū)超市及電商平臺購買.

      (2)γ-PGA標(biāo)品(分子量700 KDa)由上海藍(lán)嫣化妝品有限公司提供.

      1.1.2 培養(yǎng)基

      LB ( Luria-Bertani ) 培養(yǎng)基:酵母提取物5 g/L、胰蛋白胨10 g/L、氯化鈉10 g/L,pH 7.4.

      種子培養(yǎng)基:丙三醇20 g/L、氯化銨 10 g/L、七水硫酸鎂5 g/L、L-谷氨酸10 g/L、酵母提取物10 g/L、磷酸氫二鉀 2 g/L,pH 7.4.

      初始發(fā)酵培養(yǎng)基:檸檬酸12 g/L、L-谷氨酸20 g/L、丙三醇80 g/L、氯化銨7 g/L、磷酸二氫鉀 0.5 g/L、一水合硫酸錳 0.1 g/L、七水硫酸鎂 0.5 g/L、氯化鈣 0.15 g/L、六水三氯化鐵0.04 g/L,pH 7.4.

      以上培養(yǎng)基成分誤差均控制在±0.01 g以內(nèi)且培養(yǎng)基以121 ℃滅菌20 min后待用.

      1.1.3 材料與試劑

      腐乳、磷酸氫二鉀、谷氨酸鈉、酵母提取物、檸檬酸、氯化銨、氯化鈉、磷酸二氫鉀、七水硫酸鎂、L-谷氨酸、MnSO4·H2O、酵母提取物、瓊脂粉、氯化鈣、氫氧化鈉、丙三醇、六水三氯化鐵、胰蛋白胨、濃硫酸、鹽酸、十六烷基三甲基溴化銨、薄層色譜板、DNA抽提試劑盒(上海生工生物工程有限公司)、8 000~14 000 Da透析袋(美國聯(lián)合碳化物公司)、KOD預(yù)混酶(愛必夢生物科技有限公司)、Gyra及16S rRNA引物(蘇州金唯智生物科技有限公司).

      1.1.4 儀器與設(shè)備

      恒溫水浴鍋、冷凍干燥機(jī)、電子天平、離心機(jī)、pH計、恒溫培養(yǎng)箱、往復(fù)式搖床、立式滅菌鍋、722分光光度計.

      1.2 方法

      1.2.1 菌種篩選

      參考Sui and Engineering[14]的方法,稱取2 g發(fā)酵豆制品于100 mL無菌蒸餾水中煮沸5 min,殺滅細(xì)胞營養(yǎng)體.靜置沉淀后取1 mL上清液于50 mL LB培養(yǎng)基中,220 r/min,30 ℃,培養(yǎng)24 h,10-4倍梯度稀釋后在LB固體培養(yǎng)基上均勻涂布100 μL培養(yǎng)液,30 ℃培養(yǎng)24 h.將具有濕潤光滑表面且挑起拉絲的單個菌落接種到種子培養(yǎng)基中,220 r/min,30 ℃培養(yǎng)20 h.然后在發(fā)酵培養(yǎng)基中接種6%(v/v)的種子液,220 r/min,30 ℃培養(yǎng)48 h.測定發(fā)酵液中γ-PGA產(chǎn)量并斜面保存產(chǎn)量最大的菌株.

      1.2.2 分析方法

      1.2.2.1 產(chǎn)物分離純化

      取一定量的發(fā)酵液并用6 mol/L HCl將pH調(diào)至4.0,離心機(jī)程序為12 000 r/min條件下離心5 min除去菌體沉淀;使用6 mol/L NaOH將上清液pH調(diào)至7.0后加入3倍體積預(yù)冷乙醇,混勻后于4 ℃醇沉過夜(10 h);在相同條件下離心,保留產(chǎn)物沉淀并靜置直至殘留乙醇完全揮發(fā);再將沉淀溶解于適量蒸餾水后,使用8 000~14 000 Da的透析袋于蒸餾水中過夜透析[15-16],并將透析液在 -42 ℃條件下冷凍干燥24 h后得到高純度γ-PGA.

      1.2.2.2 產(chǎn)量測定方法

      利用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)比色法快速檢測γ-PGA的產(chǎn)量[17-18].

      1.2.2.3 產(chǎn)物鑒定

      參照Song[19]的方法對產(chǎn)物進(jìn)行鑒定.使用蒸餾水溶解純化后的γ-PGA,加入等體積濃硫酸,密封后于高壓滅菌鍋中121 ℃加熱2.5 h水解γ-PGA.待冷卻至室溫后加入6 mol/L NaOH調(diào)pH至7.4.將γ-PGA標(biāo)品進(jìn)行相同處理,用薄層層析法分析其成分,以L-谷氨酸為對照,將正丁醇、蒸餾水、乙酸作為展開劑,體積比依次為3∶1∶1.

      1.2.3 菌種鑒定

      (1)菌落形態(tài)和革蘭氏染色鑒定

      按照微生物生物學(xué)實驗教程的方法[20],將菌種劃線接種于LB固體培養(yǎng)基后倒置于37 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)并記錄其菌落形態(tài),使用革蘭氏經(jīng)典染色法對目的菌株菌種染色并用油鏡觀察.

      (2)系統(tǒng)發(fā)育分析

      參照高陽[21]及Vet[22]的方法,取5 mL新鮮培養(yǎng)液,于10 000 r/min 離心2 min后收集細(xì)胞沉淀物,用細(xì)菌基因組提取試劑盒對Bacillus amyloliquefaciensYB-9菌株提取基因組DNA,然后對該菌株16S rRNA和gyrA基因進(jìn)行擴(kuò)增、測序和比對.?dāng)U增引物為通用引物,對27F和1492R及GyrAF(5'-GAGGGATAGCGGTTAGATGAGC-3')和GyrAR(5'-CCGTTCACCAGCAGGTTAGG-3')分別擴(kuò)增細(xì)菌的16S rRNA及gyrA基因.

      16S rRNA 反應(yīng)體系:50 μL,包括 KOD 預(yù)混酶 20 μL、上下游引物各 2 μL、模板 DNA 2 μL、H2O 24 μL.PCR 擴(kuò)增程序為:94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s;58 ℃ 30 s;72 ℃ 1 min 30 s;循環(huán) 35 次;72 ℃ 5 min.

      gyrA 擴(kuò)增反應(yīng)體系:50 μL, Phanta Max Master預(yù)混酶 20 μL、模板 DNA 2 μL、上下游引物各 2 μL、H2O 24 μL.PCR 擴(kuò)增程序為:94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s;58 ℃ 30 s;72 ℃ 1 min;35 個循環(huán);72 ℃ 5 min.

      用1%(m/v)的瓊脂糖凝膠電泳檢測擴(kuò)增產(chǎn)物.將PCR產(chǎn)物切膠回收后,委托蘇州金唯智生物科技有限公司完成 16S rRNA和gyrA基因測序.結(jié)果用DNA star進(jìn)行拼接,并上傳到NCBI數(shù)據(jù)庫中執(zhí)行核苷酸序列Blast,再使用MEGA 7軟件NJ(Neighbour Joining)方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹.

      1.3 發(fā)酵培養(yǎng)基優(yōu)化

      1.3.1 單因素試驗

      以γ-PGA產(chǎn)量為指標(biāo)優(yōu)化碳源、氮源、底物和無機(jī)鹽.分別選擇可溶性淀粉、蔗糖、葡萄糖、麥芽糖、丙三醇、甘蔗和糖蜜代替初始培養(yǎng)基中的丙三醇作為碳源,在獲得最優(yōu)碳源后優(yōu)化碳源濃度.選取5種有機(jī)氮源:黃豆粉、豆粕粉、胰蛋白胨、酵母提取物、牛肉膏和4種無機(jī)氮源:氯化銨、硫酸銨、檸檬酸銨、尿素代替初始培養(yǎng)基中的氯化銨作為氮源,得到最優(yōu)氮源后對其質(zhì)量濃度進(jìn)行優(yōu)化.對底物 L- 谷氨酸和谷氨酸鈉進(jìn)行優(yōu)化,梯度依次為:5,10,15,20,25,30,35 g/L.對檸檬酸的濃度進(jìn)行優(yōu)化,選取梯度依次為0,3,6,9,12,15 g/L.通過比較磷酸二氫鉀、七水硫酸鎂、一水合硫酸錳、氯化鈣、六水三氯化鐵、氯化鋅、七水硫酸亞鐵對γ-PGA產(chǎn)量的影響,選出影響最顯著的金屬離子.

      1.3.2 PB實驗設(shè)計

      在單因素優(yōu)化試驗的基礎(chǔ)上,通過選擇尿素、甘油、檸檬酸、谷氨酸、酵母提取物、七水硫酸鎂、磷酸二氫鉀、氯化鈣、FeCl3這9個參數(shù)進(jìn)行了N為12的PB實驗設(shè)計,各個參數(shù)應(yīng)用高(+)低(-)兩個水平(表1).

      表1 PB實驗設(shè)計表 單位:(g·L-1)

      1.3.3 最陡爬坡試驗

      按照PB試驗結(jié)果獲得對γ-PGA產(chǎn)量影響最為明顯的3個因素,并依照其正效應(yīng)和負(fù)效應(yīng)來設(shè)計步長長短及變動方向,迅速達(dá)到最佳響應(yīng)區(qū)域.根據(jù)PB實驗中估計值對產(chǎn)量的正或負(fù)影響選取高低水平.

      1.3.4 BBK(Box-Behnken)設(shè)計

      根據(jù)PB試驗和最陡爬坡試驗的分析結(jié)果確定的3個因素,設(shè)置γ-PGA的產(chǎn)量為響應(yīng)值且每個因子的3個水平用(-1, 0, +1)編碼,每個測試點平行3次,其他因素按照PB試驗的分析結(jié)果確定.表現(xiàn)出積極影響的因素采用高水平,表現(xiàn)出消極影響的因素采用低水平.BBK試驗設(shè)計的因素及水平見表2.

      表2 Box-Behnken 試驗因素水平

      2 結(jié)果與分析

      2.1 菌株的鑒定

      2.1.1 菌落及細(xì)胞形態(tài)

      經(jīng)過篩選和分離,由不同的發(fā)酵豆制品中分離出10株γ-PGA生產(chǎn)菌株,表現(xiàn)最優(yōu)的為編號YB-9的菌株.其在種子培養(yǎng)基上生長旺盛,并且菌落隨培養(yǎng)時間表現(xiàn)出不同的形狀:培養(yǎng)9 h時,菌落開始形成,形態(tài)類似水滴,表層光滑透明,呈圓形或橢圓形,挑起拉絲,見圖1(a).培養(yǎng)24 h時,菌落表面變成白色,中間突起形成包含黏液的囊泡,周圍褶皺,在培養(yǎng)過程中少量菌落囊泡破裂,囊泡中的無色黏液滴落,見圖1(b).

      圖1 (a)9 h時菌落形態(tài);(b)24 h時菌落形態(tài);(c)9 h時革蘭氏染色;(d)24 h時革蘭氏染色

      對培養(yǎng)9 h和24 h的細(xì)菌用革蘭氏染色法進(jìn)行染色和觀察,通過油鏡可以觀察到:培養(yǎng)9 h的細(xì)菌單體為桿狀,呈紫色,見圖1(c).可以初步判定 YB-9 為革蘭氏陽性桿菌;培養(yǎng)24 h的細(xì)菌出現(xiàn)前芽孢,見圖1(d),可以判定 YB-9 為芽孢桿菌.

      2.1.2 YB-9的系統(tǒng)發(fā)生樹分析

      將YB-9的16S rRNA和gyrA基因序列上傳至NCBI進(jìn)行BLAST序列比對和分析,使用MEGA7.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,如圖2所示.從YB-9的16S rRNA和gyrA基因的系統(tǒng)發(fā)生樹可知,YB-9與解淀粉芽孢桿菌相似度最高,并且和菌株Bacillus amyloliquefaciensstrain MPA 1034的相似性達(dá)到了100%.結(jié)合YB-9的形態(tài)特征可以確定其為解淀粉芽孢桿菌.

      圖2 YB-9的系統(tǒng)發(fā)生樹

      2.2 發(fā)酵產(chǎn)物分析

      按照1.2.2.3的方法對純化產(chǎn)物的水解液進(jìn)行薄層色譜分析,以γ-PGA標(biāo)品和L-谷氨酸為對照.結(jié)果表明,純化產(chǎn)物水解液中主要是L-谷氨酸,與γ-PGA標(biāo)品水解產(chǎn)物層析圖譜一致,并且與L-谷氨酸的相對遷移率相同(圖3).考慮到γ-PGA為L-谷氨酸均聚物,基于以上結(jié)果,可初步判斷YB-9發(fā)酵液純化產(chǎn)物為γ-PGA.

      圖3 水解產(chǎn)物薄層色譜圖

      2.3 培養(yǎng)基成分優(yōu)化

      2.3.1 單因素優(yōu)化

      在單因素試驗中,經(jīng)過比較6種碳源對菌株產(chǎn)γ-PGA的作用大小,得到最優(yōu)碳源為甘油,最適濃度是75 g/L(圖4).

      圖4 碳源對γ-PGA產(chǎn)量的影響

      選擇了5種有機(jī)氮源和4種無機(jī)氮源進(jìn)行實驗,最佳的有機(jī)氮源為酵母提取物,無機(jī)氮源為尿素,尿素和酵母提取物的最適濃度分別為5 g/L和1 g/L(圖5).由圖5(c)還可以看出YB-9的生物量隨著酵母提取物濃度的增加而增大,且γ-PGA的產(chǎn)量達(dá)到最大前的變化趨勢與YB-9的生物量變化趨勢一致.可以推測酵母提取物應(yīng)該是通過促進(jìn)YB-9的生長進(jìn)而影響γ-PGA生產(chǎn)的.由圖6(a)可見,對γ-PGA產(chǎn)量促進(jìn)作用較大的底物是谷氨酸,其最佳濃度為35 g/L.由圖6(b)可以看出,當(dāng)發(fā)酵培養(yǎng)基不含檸檬酸時,γ-PGA產(chǎn)量處于一個很低的水平,并且隨著檸檬酸含量的增多,γ-PGA產(chǎn)量呈拋物線變化的趨勢,在濃度為12 g/L時上升到峰值.

      圖5 氮源對γ-PGA產(chǎn)量的影響

      圖6 前體及檸檬酸對γ-PGA產(chǎn)量的影響

      2.3.2 Plackett-Burman試驗結(jié)果

      在單因素優(yōu)化試驗的基礎(chǔ)上,通過Design Expert 10.0.4軟件對尿素、甘油、檸檬酸、谷氨酸、酵母提取物、七水硫酸鎂、磷酸二氫鉀、氯化鈣、FeCl3這9個參數(shù)進(jìn)行了N為12的PB實驗設(shè)計,結(jié)果如表3所示.對表3的數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析結(jié)果表明模型的P值遠(yuǎn)小于0.01(表4),說明該模型影響十分顯著.谷氨酸濃度、檸檬酸濃度和六水三氯化鐵濃度3個因素通過F檢驗后P值均小于0.01,說明該3個因素對YB-9產(chǎn)生γ-PGA的影響最為顯著,其影響大小順序為:谷氨酸>檸檬酸>六水三氯化鐵,因此選取這3個因素作為顯著影響因素.此外,由表3還能看出谷氨酸和檸檬酸呈現(xiàn)正效應(yīng),六水三氯化鐵呈現(xiàn)負(fù)效應(yīng).

      表3 Plackett-Burman 試驗設(shè)計及結(jié)果

      表4 Plackett-Burman 試驗的方差回歸模型分析

      2.3.3 最陡爬坡試驗結(jié)果

      基于 PB 試驗的結(jié)果,選擇谷氨酸、檸檬酸、六水三氯化鐵作為最陡爬坡試驗的3個因素.依據(jù)谷氨酸、檸檬酸、六水三氯化鐵三因素估計值中的正負(fù)符號來確定各因素的步長以及方向,然后通過最陡爬坡試驗確定中心點.具體試驗設(shè)計和結(jié)果見表5.γ-PGA的產(chǎn)量隨著3個顯著因子谷氨酸、檸檬酸、六水三氯化鐵的變化出現(xiàn)類拋物線趨勢,在第3組試驗時出現(xiàn)峰值,因此選取谷氨酸、檸檬酸、六水三氯化鐵的濃度分別為 35,16,0.006 g/L 作為 BBK 試驗設(shè)計的中心點.

      表5 最陡爬坡試驗設(shè)計結(jié)果 單位:(g·L-1)

      2.3.4 BBK Design 試驗結(jié)果

      試驗結(jié)果見表6、表7.根據(jù)表7可知,模型F值為 255.37(P>0.000 1),試驗誤差很小,失擬項的F值為5.22(P=0.720>0.01),說明回歸模型顯著.綜上,該實驗?zāi)P涂捎糜陬A(yù)測γ-PGA最大產(chǎn)量.通過Design Expert 10.0.4對表6中的測試數(shù)據(jù)執(zhí)行二次多項式回歸擬合后獲得以下方程式:Y=18.69+1.3A-0.36B-0.2C-3.15AB-1.52AC+1.27BC-6.5A2-7.02B2-6.02C2.式中:Y為γ-PGA 產(chǎn)量(g/L);A為L-谷氨酸濃度(g/L);B為檸檬酸濃度(g/L);C為六水三氯化鐵濃度(g/L).

      表6 Box-Behnken Design 試驗設(shè)計與結(jié)果 單位:(g·L-1)

      表7 方差回歸模型分析

      2.4 最優(yōu)條件的預(yù)測及驗證

      使用Design-Expert 10.0.4 根據(jù)回歸方程得出相對應(yīng)的等高線、響應(yīng)面圖.若等高線的形狀越類似于橢圓形,那么相應(yīng)的兩個因素的相互作用就越顯著,反之越不顯著;響應(yīng)表面的三維圖坡度越陡,影響越大,反之越小.

      由圖7~圖9知:檸檬酸濃度和谷氨酸濃度之間的相互作用對 YB-9產(chǎn)生γ-PGA 的影響最為顯著;谷氨酸和六水三氯化鐵濃度的交互作用、檸檬酸濃度和六水三氯化鐵濃度的交互作用依次降低.在一定范圍內(nèi),γ-PGA的產(chǎn)量隨著各因素濃度的增大呈拋物線趨勢.由響應(yīng)面模型能夠觀察到,3個因素之間彼此相互影響,表明它們之間對γ-PGA的產(chǎn)率是多因素共同影響而非簡單的線性關(guān)系.根據(jù)二次多項回歸方程運算結(jié)果得出:谷氨酸、檸檬酸和六水三氯化鐵的最佳濃度分別為35.00,16.00,0.006 g/L.在上述條件下,γ-PGA 的最大預(yù)測產(chǎn)量為18.87 g/L.使用響應(yīng)面確定的最佳培養(yǎng)基進(jìn)行了3個平行實驗,獲得的γ-PGA平均產(chǎn)量為19.39±0.75 g/L,與預(yù)測值接近,表明該模型能較好地反映培養(yǎng)基成分對解淀粉芽孢桿菌YB-9產(chǎn)生γ-PGA的實際情況.

      圖7 谷氨酸和檸檬酸濃度對γ-PGA產(chǎn)量交互影響的響應(yīng)面及等高線圖

      圖8 六水三氯化鐵和檸檬酸濃度對γ-PGA產(chǎn)量交互影響的響應(yīng)面及等高線圖

      圖9 六水三氯化鐵和谷氨酸濃度對γ-PGA產(chǎn)量交互影響的響應(yīng)面及等高線圖

      3 結(jié)語

      本實驗的主要目的是研究解淀粉芽孢桿菌YB-9發(fā)酵生產(chǎn)γ-PGA的培養(yǎng)基的優(yōu)化.通過PB實驗設(shè)計,篩選出谷氨酸、檸檬酸和六水三氯化鐵的濃度對γ-PGA產(chǎn)量的影響最顯著.然后通過最陡爬坡試驗確定其濃度范圍.最后經(jīng)過BBK試驗完成了響應(yīng)面設(shè)計,得到了發(fā)酵培養(yǎng)基的最優(yōu)配比:檸檬酸16 g/L、L-谷氨酸35 g/L、丙三醇80 g/L、尿素5 g/L、酵母提取物1 g/L、七水硫酸鎂0.5 g/L、磷酸二氫鉀0.5 g/L、氯化鈣0.15 g/L、一水合硫酸錳 0.1 g/L、六水三氯化鐵0.006 g/L,pH7.4,發(fā)酵條件220 r/min,30 ℃培養(yǎng)48 h,γ-PGA的產(chǎn)量最終為19.39±0.75 g/L,與優(yōu)化前相比提高了132.25%.

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      基于正交設(shè)計的谷氨酸發(fā)酵條件優(yōu)化
      N-月桂酰基谷氨酸鹽性能的pH依賴性
      問:如何鑒定谷氨酸能神經(jīng)元
      無機(jī)氮源對紅曲霉調(diào)控初探
      中國釀造(2016年12期)2016-03-01 03:08:11
      氧自由基和谷氨酸在致熱原性發(fā)熱機(jī)制中的作用與退熱展望
      鐵與氯氣反應(yīng)實驗的環(huán)保型設(shè)計
      中藥渣生產(chǎn)蛋白飼料的氮源優(yōu)化研究
      中國釀造(2014年9期)2014-03-11 20:21:03
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