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      灰鶴大腸桿菌的分離鑒定與致病性

      2022-11-17 08:30:04陳文東陳耀年何玉鵬葉文斌蘇滿春徐永平
      中國(guó)獸醫(yī)雜志 2022年9期
      關(guān)鍵詞:灰鶴進(jìn)化樹肺臟

      陳文東,陳耀年,何玉鵬,葉文斌,蘇滿春,徐永平

      (1.隴南師范高等??茖W(xué)校農(nóng)林技術(shù)學(xué)院,甘肅 成縣 742500;2.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,甘肅 蘭州 730000;3.西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,陜西 楊凌 712100)

      灰鶴(Grusgrus)屬鶴形目鶴科,又稱千歲鶴、番薯鶴、玄鶴等,為棲息在近水區(qū)域和沼澤地的大型遷徙涉禽,其為雜食性動(dòng)物,常選擇草洲、稻田、淺水區(qū)和泥灘生境作為棲息地,以植物根莖、植物嫩芽、草籽、蒲公英、農(nóng)作物種子等為食[1]。我國(guó)境內(nèi)灰鶴的分布廣泛,東起黑龍江撫遠(yuǎn)縣,西至新疆喀什地區(qū),南到四川若爾蓋草原,北達(dá)內(nèi)蒙古甘河流域,包括甘肅、吉林、內(nèi)蒙古、青海、黑龍江、新疆和寧夏等,分布范圍在東經(jīng)76°~135°,北緯32°20′~53°[2]。研究表明,甘肅地區(qū)灰鶴多為旅鳥或夏候鳥,少部分為冬候鳥,境內(nèi)隴南山地、蘭州黃河、甘南高原、祁連山地、黃土高原和河西走廊的灰鶴為遷徙灰鶴[3]。

      本試驗(yàn)從隴南受傷的灰鶴泄殖腔內(nèi)分離出1株大腸桿菌(Escherichiacoli,E.coli),對(duì)其進(jìn)行生化試驗(yàn)、16S rRNA基因測(cè)序和遺傳進(jìn)化樹分析,并通過藥敏試驗(yàn)和小鼠致病試驗(yàn)對(duì)其進(jìn)行耐藥性和致病性分析,為大腸桿菌引起灰鶴腹瀉的防治提供科學(xué)依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 主要試劑 麥康凱瓊脂培養(yǎng)基、伊紅美藍(lán)培養(yǎng)基(EMB)、鮮血瓊脂培養(yǎng)基、革蘭染液,均購(gòu)自青島海博生物技術(shù)有限公司;BGI D2 000 Plus DNA Ladder、BGI 2×Super PCR Mix,均購(gòu)自武漢華大基因科技有限公司;細(xì)菌基因組提取試劑盒,購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司;瓊脂糖,購(gòu)自廈門太陽(yáng)馬生物工程有限公司;磁珠法PCR清潔試劑盒,購(gòu)自上海碩美生物科技有限公司;18種藥敏紙片,購(gòu)自湖南比克曼生物科技有限公司。PCR引物合成及測(cè)序由武漢華大基因科技有限公司完成。

      1.2 主要儀器 PCR儀,伯樂生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品(上海)有限公司產(chǎn)品;高速冷凍離心機(jī),湖南湘儀實(shí)驗(yàn)室儀器開發(fā)有限公司產(chǎn)品;凝膠成像系統(tǒng),上海天能科技有限公司產(chǎn)品;超凈工作臺(tái),浙江孚夏醫(yī)療科技有限公司產(chǎn)品;恒溫恒濕培養(yǎng)箱,上海躍進(jìn)醫(yī)療器械有限公司產(chǎn)品;電熱式壓力蒸汽滅菌器,浙江新豐醫(yī)療器械有限公司產(chǎn)品。

      1.3 樣品采集及細(xì)菌分離純化 用無(wú)菌棉簽采集灰鶴泄殖腔內(nèi)容物,置于裝有無(wú)菌生理鹽水的離心管內(nèi),充分混勻后,離心,將上清液接種于麥康凱瓊脂平板上,37 ℃恒溫培養(yǎng)18 h后,用接種環(huán)挑取紅色菌落接種于另一麥康凱瓊脂平板,繼續(xù)37 ℃恒溫培養(yǎng)18 h,如此反復(fù)純化細(xì)菌5次,最后1次將菌株分別接種于鮮血瓊脂培養(yǎng)基和伊紅美藍(lán)培養(yǎng)基,觀察2種培養(yǎng)基上的菌落形態(tài)特征,再挑取單菌落進(jìn)行革蘭染色,顯微鏡下觀察細(xì)菌的染色特點(diǎn)和形態(tài)特征。

      1.4 生化鑒定 參照《獸醫(yī)微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)教程》[4]中生化試驗(yàn)培養(yǎng)基配制方法、操作步驟和結(jié)果判定方法,對(duì)分離菌進(jìn)行生化鑒定,觀察并記錄結(jié)果。

      1.5 16S rRNA基因PCR擴(kuò)增及系統(tǒng)進(jìn)化樹分析 常規(guī)提取分離菌株的基因組DNA,制備DNA模板并進(jìn)行16S rRNA的PCR擴(kuò)增,PCR所用引物序列見表1。PCR反應(yīng)體系(30 μL):1 μL DNA模板,15 μL 2×GC Buffer Ⅰ,2 μL引物(上、下游各1 μL),最后加ddH2O至30 μL。PCR反應(yīng)條件:96 ℃預(yù)變性5 min;96 ℃變性20 s,60 ℃退火20 s,72 ℃延伸30 s,共35個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸10 min,于4 ℃保存。參照磁珠法PCR清潔試劑盒說明書純化PCR產(chǎn)物,純化后進(jìn)行1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),觀察條帶大小,回收PCR產(chǎn)物后寄至武漢華大基因科技有限公司進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果進(jìn)行NCBI-BLAST比對(duì)并用鄰接法(Neighbor-Joining algorithm,N-J)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

      表1 引物信息

      1.6 藥敏試驗(yàn) 用紙片擴(kuò)散法(Kirby-Bauer,K-B)[5]對(duì)分離菌進(jìn)行藥物敏感性試驗(yàn),參照美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)標(biāo)準(zhǔn),調(diào)整菌液濃度至5×108CFU/mL,將菌液均勻涂布于普通瓊脂平板,靜置片刻后,用無(wú)菌鑷子將18種常用抗菌藥藥敏紙片貼于平板表面,37 ℃恒溫培養(yǎng)18 h,游標(biāo)卡尺測(cè)量抑菌圈直徑,結(jié)果按耐藥(R)、敏感(S)和中介(I)判定。

      1.7 致病性試驗(yàn) 將12只BALB/c小鼠(體重18~22 g,雌雄各半)隨機(jī)分成試驗(yàn)組和對(duì)照組,每組6只。試驗(yàn)組腹腔注射細(xì)菌懸液(生理鹽水將菌液調(diào)配至濃度為2.12×109CFU/mL),每只0.5 mL,對(duì)照組腹腔注射等量生理鹽水,觀察小鼠死亡情況,剖檢死亡小鼠,做剖檢記錄,并于病變明顯部位取樣分離病原菌。將剖檢小鼠的心臟、肝臟、脾臟、肺臟和腎臟固定于4%多聚甲醛內(nèi),制作病理組織切片,觀察各器官的組織形態(tài)學(xué)變化。

      2 結(jié)果

      2.1 細(xì)菌分離純化 分離菌株可在鮮血培養(yǎng)基上生長(zhǎng),無(wú)溶血環(huán);在麥康凱瓊脂培養(yǎng)基上生長(zhǎng)為紅色菌落,菌落呈圓形、半透明,表面濕潤(rùn)光滑,邊緣整齊;在伊紅美藍(lán)培養(yǎng)基上形成紫黑色菌落,菌落有金屬光澤,呈圓形,表面光滑濕潤(rùn),邊緣整齊。革蘭染色顯示菌體呈長(zhǎng)短不一的短桿狀,兩端鈍圓,紅色,散在分布。

      2.2 生化鑒定 分離菌株可發(fā)酵葡萄糖、乳糖、蔗糖和麥芽糖,對(duì)甘露醇、MR試驗(yàn)和吲哚試驗(yàn)呈陽(yáng)性反應(yīng),對(duì)硝酸鹽、尿素酶、硫化氫、V-P試驗(yàn)、檸檬酸鹽反應(yīng)呈陰性反應(yīng)。上述結(jié)果與《伯杰細(xì)菌鑒定手冊(cè)》[6]比對(duì),初步判定分離菌株為大腸桿菌,命名為HH1。

      2.3 16S rRNA基因PCR擴(kuò)增及系統(tǒng)進(jìn)化樹分析 將PCR產(chǎn)物進(jìn)行1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),樣品均可得到明亮的大小為1 500 bp的電泳條帶(圖1),與預(yù)期大小相符,符合測(cè)序條件。測(cè)序結(jié)果進(jìn)行NCBI-BLAST比對(duì),結(jié)果顯示,HH1與大腸桿菌的同源性達(dá)99%。用MEGA 7.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果顯示,HH1與大腸桿菌(MT424913.1.seq、MH111527.1.seq、MK729001.1.seq、OK325789.1.seq、MW175585.1.seq)聚為一簇,親緣關(guān)系最近(圖2)。PCR擴(kuò)增、系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果結(jié)合生化鑒定結(jié)果,判定HH1為大腸桿菌。

      圖1 分離菌16S rRNA的PCR擴(kuò)增

      圖2 分離菌16S rRNA序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹(N-J法)

      2.4 藥敏試驗(yàn) HH1對(duì)青霉素、紅霉素、多西環(huán)素和四環(huán)素耐藥,對(duì)慶大霉素、頭孢氨芐、頭孢哌酮、頭孢唑林、頭孢曲松、頭孢他啶、頭孢呋辛、哌拉西林、氨芐西林、卡那霉素、鏈霉素、阿米卡星、米諾環(huán)素和多黏菌素敏感(表2)。

      表2 藥敏試驗(yàn)結(jié)果

      2.5 致病性試驗(yàn) 試驗(yàn)組小鼠于腹腔接種細(xì)菌懸液8 h后開始出現(xiàn)死亡,至接種17 h后全部死亡,對(duì)照組小鼠未見異常。剖檢死亡小鼠,可見小鼠胃呈明顯臌氣狀,脾臟、腎臟出現(xiàn)輕微充血,肺臟有明顯淤血斑塊。從死亡小鼠的肺臟內(nèi)分離病原菌,經(jīng)鑒定為大腸桿菌,與攻毒菌株一致。病理組織切片觀察可見,死亡小鼠肺臟肺泡內(nèi)有明顯的滲出,其余內(nèi)臟組織未見明顯病理變化。

      死亡小鼠內(nèi)臟病理切片結(jié)果顯示,心臟未見明顯異常,可見縱切心肌纖維及部分心肌纖維斷面,心肌細(xì)胞和結(jié)締組織細(xì)胞胞核清晰可見,心肌內(nèi)毛細(xì)血管未見擴(kuò)張;肝臟中央靜脈和肝血竇內(nèi)見少量紅細(xì)胞,其他結(jié)構(gòu)未見明顯異常,肝細(xì)胞胞質(zhì)呈粉紅色,邊界清晰,胞核呈圓形,藍(lán)紫色,核仁清晰可見,肝細(xì)胞以中央靜脈為中心呈索狀排列,形成不規(guī)則的肝索;脾臟未見明顯異常,組織切片觀察可見明顯的白髓和紅髓區(qū),白髓內(nèi)可見中央動(dòng)脈及動(dòng)脈周圍淋巴鞘,紅髓內(nèi)含較多紅細(xì)胞,脾小梁清晰可見;肺臟切片可見呼吸性細(xì)支氣管和大部分肺泡內(nèi)有明顯滲出,部分肺泡外周見少量炎性細(xì)胞,肺泡壁略增厚(圖3);腎小管部分管腔及管腔之間有紅細(xì)胞聚集,腎小球未見明顯異常。

      圖3 分離菌致死小鼠肺臟病理切片觀察(200×)

      3 討論

      灰鶴是國(guó)家二級(jí)保護(hù)野生動(dòng)物,被列入《瀕危野生動(dòng)植物種國(guó)際貿(mào)易公約》(CITES)附錄Ⅱ中[7],據(jù)報(bào)道,截至21世紀(jì)初,我國(guó)分布的灰鶴總數(shù)為21 632~22 401只[3]。張成林等[8]對(duì)我國(guó)鶴類疾病發(fā)生情況進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,發(fā)現(xiàn)引起鶴類發(fā)病的主要原因?yàn)榧?xì)菌感染、寄生蟲感染和營(yíng)養(yǎng)因素,細(xì)菌感染因素中大腸桿菌為引起鶴類發(fā)病的主要病原菌之一。張偉木等[9]證實(shí),引起3例幼灰鶴死亡的致病性大腸桿菌血清型為O111B14。此外,在孔雀、蓑羽鶴和丹頂鶴等珍稀飛禽中均有因感染大腸桿菌而死亡的病例,因此,大腸桿菌正嚴(yán)重威脅著野生飛禽的生命健康[10-11],給保護(hù)珍稀野生飛禽工作帶來(lái)諸多挑戰(zhàn)。

      藥敏試驗(yàn)結(jié)果顯示,HH1對(duì)青霉素、紅霉素、多西環(huán)素和四環(huán)素具有耐藥性。Dou等[12]報(bào)道,國(guó)內(nèi)東部地區(qū)的243株禽致病性大腸桿菌中,有98%的菌株對(duì)四環(huán)素耐藥;胡紫萌等[13]分離鑒定的禽致病性大腸桿菌對(duì)四環(huán)素的耐藥率更是高達(dá)100%;郭長(zhǎng)明等[14]分離的大腸桿菌對(duì)多西環(huán)素的耐藥率為100%;彭嚴(yán)嚴(yán)等[15]分離的9株鵝源大腸桿菌全部含β-內(nèi)酰胺類耐藥基因;陳文靜等[16]研究表明,鴨源致病性大腸桿菌100%對(duì)紅霉素耐藥,上述研究結(jié)果與本試驗(yàn)分離大腸桿菌的耐藥性結(jié)果一致,這可能是灰鶴在采食或遷徙的過程中與家禽接觸產(chǎn)生的相互感染。野生飛禽幾乎不使用抗菌藥,但其所攜帶致病菌卻表現(xiàn)多重耐藥性(對(duì)3種或3種以上抗菌藥耐藥),這可能會(huì)嚴(yán)重危害公共衛(wèi)生安全,值得高度重視[17]。本試驗(yàn)為救治灰鶴的臨床用藥提供理論依據(jù),并取得了較好的治療效果。

      本試驗(yàn)16S rRNA基因測(cè)序結(jié)果顯示,分離菌株與大腸桿菌同源性最高,達(dá)99%。系統(tǒng)發(fā)育樹分析結(jié)果顯示,本試驗(yàn)分離菌株與大腸桿菌(MT424913.1.seq、MH111527.1.seq、MK729001.1.seq、OK325789.1.seq、MW175585.1.seq)為同一聚類,親緣關(guān)系最近,而MH111527.1.seq和OK325789.1.seq均為來(lái)自于人類腸道內(nèi)的大腸桿菌,表明該分離菌株有成為人獸共患病病原體的潛在性。

      本試驗(yàn)小鼠致病性試驗(yàn)結(jié)果顯示,分離菌株HH1主要引起小鼠肺泡腔內(nèi)明顯滲出,而對(duì)其他器官(心、肝、脾、腎)無(wú)明顯致病作用。研究發(fā)現(xiàn),禽類等多種動(dòng)物的肺炎、敗血癥和腸炎等疾病多是因腸外致病性大腸桿菌引起的[18],近年來(lái)大腸桿菌引起動(dòng)物呼吸系統(tǒng)病變死亡的報(bào)道較多,有學(xué)者分別從水貂肺臟[19]、狐貍肺臟[20]及因患呼吸系統(tǒng)疾病而死亡的水貂肺臟[21]內(nèi)分離出致病性大腸桿菌。由此可見,本試驗(yàn)分離到的大腸桿菌極有可能為禽腸外致病性大腸桿菌,且該菌具有一定的器官侵害傾向。

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