趙仲麟,頓文濤,李 燕,金顯春,楊國(guó)玉,蘇同福,袁 超
(1.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)理學(xué)院,河南 鄭州 450002;2.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)信息化管理處,河南 鄭州 450002;3.鄭州輕工業(yè)學(xué)院食品與生物工程學(xué)院,河南 鄭州 450002)
以蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能為基礎(chǔ),從分子水平上認(rèn)識(shí)生命現(xiàn)象已經(jīng)成為現(xiàn)代生物學(xué)發(fā)展的主要方向.研究蛋白質(zhì)首先要得到高度純化并具有生物活性的蛋白質(zhì),常用于純化蛋白質(zhì)的傳統(tǒng)方法有凝膠過(guò)濾和離子交換等,但是這些方法要求操作人員有較為豐富的經(jīng)驗(yàn).親和層析也是一種常用的蛋白純化方法,利用共價(jià)連接有特異配體的層析介質(zhì)分離蛋白質(zhì),具有高效、快速、簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn),缺點(diǎn)是親和標(biāo)簽可能對(duì)目的蛋白產(chǎn)生影響,常需要使用蛋白酶除去親和標(biāo)簽,而蛋白酶處理有時(shí)非特異,且效率較低,同時(shí)也將增加蛋白純化的步驟.內(nèi)含肽(intein)是類(lèi)似內(nèi)含子的蛋白質(zhì)等價(jià)物,通過(guò)翻譯后蛋白剪接過(guò)程催化其自身從宿主蛋白上脫離[1,2].由內(nèi)含肽介導(dǎo)的蛋白質(zhì)剪接原理發(fā)展出多種新技術(shù)已用于蛋白質(zhì)工程和化學(xué)生物學(xué)研究中[3~5].內(nèi)含肽介導(dǎo)的蛋白質(zhì)純化方法可通過(guò)親和層析的方法得到無(wú)親和標(biāo)簽的蛋白,剪切能夠在不使用蛋白酶的情況下切斷肽鍵.CHONG等[6]利用釀酒酵母 Sce VMA內(nèi)含肽進(jìn)行了蛋白純化.目的蛋白被融合在內(nèi)含肽的N端,內(nèi)含肽的C端連接到環(huán)狀芽胞桿菌的幾丁質(zhì)結(jié)合域(CBD)的親和尾上,硫醇誘導(dǎo)內(nèi)含肽N端的肽鍵的斷裂,從固定在柱上的融合蛋白上釋放目的蛋白.ZHAO等[7]利用雙內(nèi)含肽的方法對(duì)綠色熒光蛋白進(jìn)行了純化.內(nèi)含肽蛋白純化系統(tǒng)的優(yōu)點(diǎn)在于該方法簡(jiǎn)單、高效,可得到無(wú)載體來(lái)源氨基酸的蛋白質(zhì),分離蛋白質(zhì)不需要使用昂貴的蛋白酶切除親和標(biāo)簽.本研究利用來(lái)源于藍(lán)綠藻Synechocystis sp.PCC6803的DnaB內(nèi)含肽的剪切特性,純化綠色熒光蛋白.
載體pTWIN1和大腸桿菌E.coli ER2566由NEB公司徐明群博士惠贈(zèng).
限制性核酸內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶、幾丁質(zhì)樹(shù)脂均購(gòu)于NEB(北京)公司;高保真DNA聚合酶購(gòu)自全式金公司;其它試劑均為分析純.
根據(jù)gfp基因序列設(shè)計(jì)引物,分別加入位點(diǎn)EcoR I和Xho I(下劃線(xiàn)部分).引物由上海生物工程有限公司合成,分別為:gfpF:5’-CCAGAATTCAT GCGTAAAGGAGAAGAAC-3’,gfpR:5’-CCACTCGA GTCATTTGTATAGTTCATC-3’.以含 gfp基因的質(zhì)粒pG6th為模板,PCR擴(kuò)增出全長(zhǎng)的綠色熒光蛋白基因.PCR參數(shù)為:94℃預(yù)變性5 min,94℃變性30 s,58 ℃ 退火30 s,72 ℃延伸 50 s,共 30 個(gè)循環(huán),最后72℃補(bǔ)充延伸10 min.
將PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂凝膠電泳純化回收,用EcoR I和Xho I雙酶切,同時(shí)使用相同內(nèi)切酶對(duì)質(zhì)粒pTWIN1酶切.用T4 DNA連接酶將酶切后的pTWIN1和gfp于4℃連接過(guò)夜.將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌 ER2566,涂布在含100 mg·L-1的氨芐霉素抗性的LB平板上,37℃培養(yǎng)12 h,得到含重組質(zhì)粒pTWG的大腸桿菌.
將含重組質(zhì)粒pTWG的大腸桿菌轉(zhuǎn)化子接種于LB 液體培養(yǎng)基,37 ℃,200 r·min-1過(guò)夜培養(yǎng)后,按1%接種量轉(zhuǎn)接入100 mL LB培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)至 OD600為0.6,加入 IPTG使終濃度達(dá)到0.3 mmol·L-1,15 ℃培養(yǎng)16 h.離心收集菌體,用10 mL 緩沖液 B1(20 mmol·L-1Tris-HCl,pH 7.0,0.5 mol·L-1NaCl,1 mmol·L-1EDTA)將菌體重懸,超聲波破碎細(xì)胞,后19 000×g離心30 min,上清液即為澄清的細(xì)胞粗提物.
將3 mL幾丁質(zhì)樹(shù)脂倒入柱中,30 mL B1緩沖液(pH 7.0),4℃進(jìn)行柱平衡.將澄清的細(xì)胞粗提物緩慢加入幾丁質(zhì)柱,流速約為1.0 mL·min-1.用50 mL的緩沖液徹底洗柱,流速為3 mL·min-1.停止柱流后,pH 7.0 條件下,20 ℃ 放置 12 h,后用10 mL B1緩沖液洗脫目的蛋白,SDS-PAGE電泳檢測(cè).
從含pTWG質(zhì)粒的大腸桿菌2566平板上挑取單菌落,接種到5 mL LB液體培養(yǎng)基(含氨芐100 mg·L-1),加入 IPTG,15 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng) 16 h后,5 000×g離心5 min,收集細(xì)胞,棄上清液.用無(wú)菌水洗菌體3次,取10 μL至于載玻片上,100倍油鏡鏡檢,使用德國(guó)Leica TCS SP2激光共聚焦掃描顯微鏡觀察,激發(fā)波長(zhǎng)為488 nm.
根據(jù)綠色熒光蛋白gfp基因序列設(shè)計(jì)引物,PCR擴(kuò)增出1條長(zhǎng)度約為720 bp的條帶(圖1),經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證表明基因無(wú)突變.
圖1 gfp基因PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1 PCR result of gfp gene
將PCR產(chǎn)物與酶切后的pTWIN1載體連接后,轉(zhuǎn)入大腸桿菌ER2566感受態(tài)細(xì)胞.通過(guò)氨芐霉素抗性篩選轉(zhuǎn)化子,經(jīng)PCR驗(yàn)證表明已成功將gfp基因連接到表達(dá)載體上,產(chǎn)生載體命名為pTWG(圖2).其中Ssp DnaB內(nèi)含肽融合于gfp基因的N端,幾丁質(zhì)親和域CBD融合于DnaB內(nèi)含肽的N端,作為親和純化標(biāo)簽.
本研究使用0.3 mmol·L-1的 IPTG誘導(dǎo)蛋白表達(dá).細(xì)胞粗提液通過(guò)親和層析柱時(shí),內(nèi)含肽-綠色熒光蛋白融合體結(jié)合于幾丁質(zhì)樹(shù)脂柱上.之后于20℃,pH 7.0條件下放置12 h誘導(dǎo)內(nèi)含肽的自剪切活性,將綠色熒光蛋白從融合前體上脫離,后用緩沖液B1洗脫目的蛋白.SDS-PAGE電泳檢測(cè)結(jié)果只出現(xiàn)1個(gè)條帶,大小約29 kD(圖3),符合綠色熒光蛋白的理論分子量,結(jié)果表明純化得到的綠色熒光蛋白具有正確的大小,且具有較高的純度.
綠色熒光蛋白較適合在低溫下、長(zhǎng)時(shí)間誘導(dǎo)其表達(dá)[8],因此本研究中采用15℃誘導(dǎo)16 h,取得了較好的表達(dá)效果.表達(dá)有綠色熒光蛋白的E.coli ER2566在488 nm激發(fā)下,菌體呈現(xiàn)明亮的綠色熒光.從菌體在明場(chǎng)中的光學(xué)影像(圖4-A)和熒光掃描圖像(圖4-B)可見(jiàn),所有大腸桿菌中均有綠色熒光蛋白表達(dá),表明綠色熒光蛋白經(jīng)內(nèi)含肽介導(dǎo)的純化后具有正確的功能和良好的活性,可作為細(xì)胞的分子影像標(biāo)記.
圖4 含綠色熒光蛋白表達(dá)的E.coli ER2566共聚焦顯微鏡圖像Fig.4 Confocal image of E .coli ER2566 strains with GFP expression
1)本研究利用內(nèi)含肽介導(dǎo)的蛋白質(zhì)剪切反應(yīng)純化綠色熒光蛋白.在細(xì)胞生物學(xué)與分子生物學(xué)領(lǐng)域中,綠色螢光蛋白經(jīng)常作為生物探針,是一種重要的標(biāo)記基因.其穩(wěn)定性好,顏色可見(jiàn),易于檢測(cè).基于以上的優(yōu)點(diǎn),本研究使用綠色熒光蛋白作為純化的目的蛋白.內(nèi)含肽催化的蛋白轉(zhuǎn)剪接反應(yīng)具有高效、反應(yīng)條件溫和等特點(diǎn),在離體和活體條件下均能進(jìn)行蛋白質(zhì)的剪接反應(yīng).
2)Ssp DnaB內(nèi)含肽的剪切與溫度和pH值有很大關(guān)系.在pH 7.0,溫度16~23℃有較好的剪切活性.本研究利用單步反應(yīng),采用20℃,pH 7.0條件下,誘導(dǎo)內(nèi)含肽自剪切活性的發(fā)生,從而純化目的蛋白.純化過(guò)程中無(wú)需添加任何其他試劑,系統(tǒng)中的作為親和標(biāo)簽的幾丁質(zhì)結(jié)合域仍留在親和柱上,得到的目的蛋白無(wú)親和標(biāo)簽,減少了親和標(biāo)簽對(duì)于蛋白質(zhì)的影響.
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