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      貴州省漢族人群類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者TRAF1/C5基因多態(tài)性研究*

      2015-03-21 05:39:58梁愛(ài)鳳
      關(guān)鍵詞:單倍體類風(fēng)濕等位基因

      梁愛(ài)鳳,費(fèi) 櫻

      (1.復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院青浦分院檢驗(yàn)科,上海 201700;2.貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院微生物免疫科,貴州 貴陽(yáng) 550004)

      貴州省漢族人群類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者TRAF1/C5基因多態(tài)性研究*

      梁愛(ài)鳳1,費(fèi) 櫻2△

      (1.復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院青浦分院檢驗(yàn)科,上海 201700;2.貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院微生物免疫科,貴州 貴陽(yáng) 550004)

      目的探討腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子1(TRAF1)/補(bǔ)體5(C5)單核苷酸多態(tài)性與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA)的相關(guān)性。方法提取300例RA患者(RA組)和300例健康者DNA(對(duì)照組),實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測(cè)TRAF1/C5基因rs3761847和rs10818488的單核苷酸多態(tài)性。結(jié)果TRAF1/C5存在基因多態(tài)性,但RA組與對(duì)照組比較基因多態(tài)性位點(diǎn)的單倍體基因型和等位基因頻率的差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)rs3761847與rs10818488之間存在強(qiáng)連鎖不平衡。rs3761847位點(diǎn)A等位基因與類風(fēng)濕因子(RF)陰性(P=0.001,OR=0.57,95%CI:0.41~0.79),抗CCP抗體(抗-CCP)陰性(P=0.001,OR=0.51,95%CI:0.35~0.76)及抗Sa抗體陰性均相關(guān)(P=0.02,OR=0.72,95%CI:0.55~0.94);rs10818488位點(diǎn)G等位基因僅與RF陽(yáng)性相關(guān)(P=0.01,OR=1.40,95%CI:1.09~1.81)。結(jié)論TRAF1/C5基因多態(tài)性可能與貴州漢族人群RA的遺傳易感性無(wú)關(guān)。

      腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子; 補(bǔ)體; 單核苷酸多態(tài)性; 類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎

      類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA)是一種系統(tǒng)性自身免疫性疾病,其病因尚不明確,遺傳、環(huán)境和免疫因素共同發(fā)揮作用。RA作為一種多基因遺傳疾病,目前已知的RA易感基因主要有腫瘤壞死因子(TNF)、人類白細(xì)胞抗原(HLA)-DR、白細(xì)胞介素(IL)及肽?;彼崦搧啺访福?(PADI4)等。已有報(bào)道表明位于9號(hào)染色體短臂33-34位點(diǎn)的腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子(TRAF1)/補(bǔ)體5(C5)基因是RA的易感基因,且與抗環(huán)瓜氨酸肽(CCP)抗體陽(yáng)性相關(guān)[1],而后者是RA早期診斷、病情評(píng)估和療效檢測(cè)的有效指標(biāo)之一。RA的遺傳異質(zhì)性使得不同人種之間的遺傳學(xué)研究結(jié)果常不一致。本研究首次以貴州漢族人群為研究對(duì)象,通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Real-time PCR)方法檢測(cè)TRAF1/C5基因多態(tài)性,并探討該基因與RA患者相關(guān)血清學(xué)指標(biāo)之間的關(guān)系,旨在探討該基因與貴州漢族人群RA患者遺傳易感性之間的關(guān)系。

      1 資料與方法

      1.1 一般資料 收集2011年10月至2013年1月貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院腎內(nèi)科門診及病房的300例RA患者全血,均為漢族,其中男性72例、女性228例,平均年齡(50.3±14.6)歲,所有RA病例均符合美國(guó)風(fēng)濕病學(xué)會(huì)(ACR)和歐洲抗風(fēng)濕聯(lián)盟(RULAR)2010年聯(lián)合推出的類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎診斷標(biāo)準(zhǔn)[2];按照民族、年齡和性別匹配的原則選取健康體檢者300例作為對(duì)照組,其中男性66例,女性234例,平均年齡(50.5±14.1)歲,均排除其他自身免疫性疾病及腫瘤等。所有納入對(duì)象均為無(wú)血緣關(guān)系的個(gè)體。

      1.2 方法

      1.2.1 基因組DNA的提取 酚-氯仿法提取受檢者外周血DNA,檢測(cè)純度和濃度后-20℃保存。

      1.2.2 Real-time PCR SNP分型 采用Taqman-MGB探針對(duì)TRAF1/C5基因rs3761847和rs10818488位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,所用Real-time PCR探針購(gòu)自ABI公司。在羅氏LightCycler?480Real-time PCR儀上進(jìn)行反應(yīng)。

      1.2.3 血清學(xué)指標(biāo)檢測(cè) 檢測(cè)RA組類風(fēng)濕因子(RF)、抗CCP抗體(抗-CCP)和抗Sa抗體(抗-Sa)三項(xiàng)血清學(xué)指標(biāo),采用RF膠乳凝集法測(cè)定試劑盒(購(gòu)自上海捷門生物技術(shù)合作公司)檢測(cè)RF水平,抗環(huán)瓜氨酸肽(CCP)抗體酶聯(lián)免疫檢測(cè)試劑盒(購(gòu)自上海科新生物技術(shù)股份有限公司)檢測(cè)抗-CCP水平,抗Sa抗體IgG酶聯(lián)免疫吸附法檢測(cè)試劑盒(購(gòu)自歐蒙醫(yī)學(xué)診斷技術(shù)有限公司)檢測(cè)抗-Sa水平。

      1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)結(jié)果進(jìn)行分析。計(jì)算兩組各個(gè)基因型及等位基因頻率,并進(jìn)行Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn),各組基因型及等位基因頻率的比較采用χ2檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,同時(shí)計(jì)算比值比(OR)和95%置信區(qū)間(95%CI)。用SHEsis在線分析軟件對(duì)TRAF1/C5基因rs3761847和rs10818488兩個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行連鎖不平衡分析。

      2 結(jié) 果

      2.1 TRAF1/C5基因與RA相關(guān)性分析 在貴州漢族RA患者中,TRAF1/C5基因的兩個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)位點(diǎn)均符合Hardy-Weinberg平衡。與對(duì)照組比較,RA組兩個(gè)SNPs位點(diǎn)基因型頻率分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見表1。

      2.2 連鎖不平衡和單倍體基因型分析 對(duì)rs3761847和rs10818488兩個(gè)SNPs位點(diǎn)的基因型信息在對(duì)照組中進(jìn)行連鎖不平衡分析,發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)位點(diǎn)存在高度連鎖不平衡(D′=1.000,r2=0.852),見附圖1(見《國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志》網(wǎng)站主頁(yè)“論文附件”)。理論上這兩個(gè)位點(diǎn)共可組成4種單倍體基因型,筆者對(duì)其中頻率大于0.03的3種單倍體基因型進(jìn)行了進(jìn)一步的分析比較:在對(duì)照組和RA組中3種單倍體基因型的分布無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05),見表2。

      2.3 TRAF1/C5基因與RF、抗-CCP、抗-Sa水平的相關(guān)性分析 與對(duì)照組相比,rs3761847位點(diǎn)A等位基因與RF陰性(P=0.001,OR=0.57,95%CI:0.41~0.79),抗-CCP陰性(P=0.001,OR=0.51,95%CI:0.35~0.76)及抗-Sa陰性相關(guān)(P=0.02,OR=0.72,95%CI:0.55~0.94),rs10818488位點(diǎn)G等位基因僅與RF陽(yáng)性組相關(guān)(P=0.01,OR=1.40,95% CI:1.09~1.81),見表3、4。

      3 討 論

      TRAF1介導(dǎo)TNF受體1、2和CD40參與的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,而TNF是RA發(fā)病機(jī)制中的重要細(xì)胞因子[3]。TRAF1還與T細(xì)胞的活化增殖有關(guān)[4],TRAF1基因敲除的小鼠T細(xì)胞過(guò)度增殖或受到T細(xì)胞受體復(fù)合物刺激時(shí)過(guò)度增殖以應(yīng)答TNF。TRAF1在這些信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中起到負(fù)調(diào)節(jié)作用以維持炎癥反應(yīng)的環(huán)境[5],從而在RA中發(fā)揮作用。雖然TRAF1在多種受體介導(dǎo)的信號(hào)通路中起作用,但TRAF1的分子機(jī)制還沒(méi)有完全闡明,其在RA中作用有待于進(jìn)一步研究。補(bǔ)體途徑也參與了RA的發(fā)病,C5裂解成促炎癥反應(yīng)的C5a和C5b,進(jìn)而啟動(dòng)攻膜復(fù)合物的形成。RA患者關(guān)節(jié)滑液持續(xù)的炎癥反應(yīng)與高水平的C5a同時(shí)存在[6]。小鼠模型研究證實(shí)了C5基因是RA的候補(bǔ)基因,同時(shí)證明了C5缺陷的小鼠可抵抗炎性關(guān)節(jié)炎,表明了C5基因在炎癥反應(yīng)中的作用[7-8]。因此,C5在RA發(fā)病機(jī)制中可能通過(guò)上調(diào)RA患者關(guān)節(jié)腔內(nèi)補(bǔ)體活化程度來(lái)起作用。

      本研究發(fā)現(xiàn)TRAF1/C5的兩個(gè)SNPs存在基因多態(tài)性,但RA組與對(duì)照組相比差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),可能與貴州漢族人群RA易感性無(wú)關(guān),這一結(jié)果與其他人種研究結(jié)果不盡相同[1,9-10]。這一情況說(shuō)明了RA的遺傳異質(zhì)性,不同人種之間遺傳學(xué)研究結(jié)果常不相同。經(jīng)連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)TRAF1/C5兩個(gè)SNPs位點(diǎn)在對(duì)照組人群中呈現(xiàn)高度連鎖不平衡(D′=1.000,r2=0.852),與HapMap發(fā)布的數(shù)據(jù)基本一致(r2=1),但構(gòu)建的單倍體基因型則與RA發(fā)病不相關(guān)(P>0.05)。由于國(guó)內(nèi)外大量的病例-對(duì)照研究均局限于驗(yàn)證基因與RA患者的關(guān)聯(lián)性,較少涉及這些多態(tài)性位點(diǎn)的單倍體基因型,因此單倍體基因型與RA的關(guān)系有待于不同種族、大樣本量的研究證實(shí)。另外本研究還發(fā)現(xiàn)TRAF1/C5基因rs3761847位點(diǎn)A等位基因與RF陰性、抗-CCP陰性及抗-Sa陰性相關(guān),這表明該位點(diǎn)可能增加自身抗體陰性RA者的易感性;rs10818488位點(diǎn)G等位基因僅與RF陽(yáng)性相關(guān),表明該位點(diǎn)可能在RF陽(yáng)性者RA的發(fā)病中起重要作用,但是受到標(biāo)本量的影響,這些結(jié)果還有待于進(jìn)一步加大樣本量進(jìn)行分析,目前的研究結(jié)果也存在爭(zhēng)議[1,9]。

      本研究首次以貴州漢族人群為研究對(duì)象,結(jié)果顯示TRAF1/C5SNPs基因型或多態(tài)性位點(diǎn)可能與貴州漢族人群RA的發(fā)病無(wú)關(guān),可能是由于受到樣本量較小,TRAF1/C5 SNPs單倍體基因型及等位基因與RA患者血清學(xué)指標(biāo)之間的關(guān)系沒(méi)有得到很好的證實(shí)。

      [1]Plenge RM,Seielstad M,Padyukov L,et al.TRAF1-C5as a risk locus for rheumatoid arthritis-agenomewide study[J].N Engl J Med,2007,357(12):1199-1209.

      [2]Aletaha D,Neogi T,Silman AJ,et al.2010rheumatoid arthritis classification criteria:an American College of Rheumatology/European League Against Rheumatism collaborative initiative[J].Arthritis Rheum,2010,69(9):2569-2581.

      [3]Firestein GS.Evolving concepts of rheumatoid arthritis[J].Nature,2003,423(6937):356-361.

      [4]Sabbagh L,Srokowski CC,Pulle G,et al.A critical role for TNF receptor-associated factor 1and Bim down-regulation in CD8 memory T cell survival[J].Proc Natl Acad Sci U S A,2006,103(49):18703-18708.

      [5]Tsitsikov EN,Laouini D,Dunn IF,et al.TRAF1is a negative regulator of TNF signaling:enhanced TNF signaling in TRAF1-deficient mice[J].Immunity,2001,15(4):647-657.

      [6]H?g?sen K,Mollnes TE,Harboe M,et al.Terminal complement pathway activation and low lysis inhibitors in rheumatoid arthritis synovial fluid[J].J Rheumatol,1995,22(1):24-28.

      [7]Wang Y,Kristan J,Hao L,et al.A role for complement in antibody-mediated inflammation:C5-deficient DBA/1mice are resistant to collagen-induced arthritis[J].J Immunol,2000,164(8):4340-4347.

      [8]Ji H,Gauguier D,Ohmura K,et al.Genetic influences on the end-stage effector phase of arthritis[J].J Exp Med,2001,194(3):321-330.

      [9]Zhu J,Zhang D,Wu F,et al.Single nucleotide polymorphisms at the TRAF1/C5locus are associated with rheumatoid arthritis in a Han Chinese population[J].BMC Med Genet,2011,12(1):53.

      [10]朱婷婷,趙東寶.腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子1基因多態(tài)性與上海市漢族人群類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者疾病易感相關(guān)性的研究[J].中華風(fēng)濕病學(xué)雜志,2011,15(1):22-25.

      Association of the TRAF1/C5 gene polymorphism with rheumatoid arthritis in Han population of Guizhou Province*

      Liang Aifeng1,F(xiàn)ei Ying2△
      (1.Department of Clinical Laboratory,Qingpu Branch of Zhongshan Hospital Affiliated to Fudan University,Shanghai 201700,China;2.Department of Clinical microbiology and Immunology,the Affiliated Hospital of Guiyang Medical College,Guiyang,Guizhou550004,China)

      ObjectiveTo explore the association between the tumor necrosis factor receptor-associated factor 1(TRAF1)/complement component 5(C5)single nucleotide polymorphism and rheumatoid arthritis patients.MethodsTwo groups of people were included in the study:300rheumatoid arthritis(RA)patients(RA group)and 300healthy individuals(control group).Real-time PCR was used to test the single nucleotide polymorphisms rs3761847and rs10818488of TRAF1/C5.ResultsThere was no significant difference(P>0.05)of TRAF1/C5rs3761847and rs10818488polymorphism between the two groups.The linkage disequilibrium analysis results showed that there was strong linkage disequilibrium between rs3761847and rs10818488.For the RF,anti-CCP and anti-Sa negative RA patients,the difference in the frequency of A allele of rs3761847between the RA patients and matched controls was statistically significant(P=0.001,OR=0.57,95%CI:0.41-0.79;P=0.001,OR=0.51,95%CI:0.35-0.76;P=0.02,OR=0.72,95%CI:0.55-0.94).Significant difference for the frequency of G allele of rs10818488between RF positive RA patients and control groups was observed(P=0.01,OR=1.40,95%CI:1.09-1.81).ConclusionTRAF1/C5gene polymorphism may not associate with susceptibility of RA patients in Han population in Guizhou.

      tumor necrosis factor receptor-associated factor; complement component; single nucleotide polymorphisms;rheumatoid arthritis

      10.3969/j.issn.1673-4130.2015.03.010

      A

      1673-4130(2015)03-0310-03

      2014-11-10)

      貴陽(yáng)市科技計(jì)劃項(xiàng)目[(2010)筑科農(nóng)合同第1-社-17號(hào)]。 作者簡(jiǎn)介:梁愛(ài)鳳,女,檢驗(yàn)技師,主要從事分子生物學(xué)檢測(cè)方面的研究。△

      ,Email:645903661@qq.com。

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