錢文丹 陳波利
(貴州大學(xué),貴州 貴陽 55000)
熒光原位雜交技術(shù)(Fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)是一種重要的非放射性原位雜交技術(shù)。其基本原理是如果被檢測(cè)的染色體或DNA纖維切片上的靶DNA與所用的核酸探針是同源互補(bǔ)的,二者經(jīng)變性—退火—復(fù)性,即可形成靶DNA與核酸探針的雜交體。將核酸探針的某一種核苷酸標(biāo)記上報(bào)告分子如生物素、地高辛,可利用該報(bào)告分子與熒光素標(biāo)記的特異親和素之間的免疫化學(xué)反應(yīng),經(jīng)熒光檢測(cè)體系在鏡下對(duì)待測(cè)DNA進(jìn)行定性、定量或相對(duì)定位分析[1]。與其他雜交技術(shù)進(jìn)行綜合比較發(fā)現(xiàn),熒光原位雜交技術(shù)(FISH)具有一些優(yōu)勢(shì):循環(huán)周期短,穩(wěn)定性高,非常安全;分辨率高,為3~20 Mb;探針能較長時(shí)間保存;多色標(biāo)記,簡單直觀;在熒光顯微鏡下在同一切片上同時(shí)觀察幾種DNA探針的定位,直接得到其相對(duì)序列和位置,從而大大加速生物基因組和功能基因組定位的研究。
FISH選用的標(biāo)本可以是分裂期細(xì)胞染色體,也可以是間期細(xì)胞。生物素、地高辛、Dinitrophenyl(DNP)、Aminoacetyl Fluorine(AAF)等均可用于探針標(biāo)記。近年來,大片段的DNA探針(100~400 kb)已被研制出來,由于控針較長,故可將熒光物質(zhì)直接標(biāo)記在核苷酸上,使雜交過程進(jìn)一步簡化,而且雜交信號(hào)更強(qiáng)。
熒光原位雜交可以通過CCD(電荷耦合器件)相機(jī)系統(tǒng)或激光共聚焦掃描成像系統(tǒng)將攝取的信號(hào)存儲(chǔ)在計(jì)算機(jī)中,經(jīng)過軟件特殊處理后顯示在屏幕上。使用數(shù)碼成像相機(jī)系統(tǒng)或CCD相機(jī)系統(tǒng),灰度圖像被拍攝幾次并存儲(chǔ)在計(jì)算機(jī)中,接下來通過一些人造色,軟件系統(tǒng)接收獲得的示例圖像,經(jīng)過軟件的綜合處理,最后以多色圖像顯示出來。此外,在G-帶狀染色體被75酒精或甲醇褪色后,F(xiàn)ISH可以更清楚地識(shí)別易位。
FISH技術(shù)和RFLP(Restrict Fragment Lenth Polymorphysim)結(jié)合,可以更準(zhǔn)確地描述染色體長短臂的結(jié)構(gòu)變化以及染色體梳子或復(fù)制品的性質(zhì)。FISH和細(xì)胞免疫技術(shù)結(jié)合,可以同時(shí)用多種顏色反應(yīng)檢測(cè)不同的核苷酸鏈和蛋白質(zhì)[2]。在基因圖譜繪制中,F(xiàn)ISH和連鎖圖譜結(jié)合起來,可以準(zhǔn)確確定具有高多態(tài)性的基因位點(diǎn)。
熒光原位雜交技術(shù)起源于1969年,自1990年以來,F(xiàn)ISH在方法上形成了從一種顏色到多種顏色、從中期染色體FISH到粗線染色體FISH再到纖維-FISH的發(fā)展趨勢(shì),靈敏度及分辨率有了大幅度提高。
多色熒光原位雜交(M-FISH),“M”分別代表“Multicolor”“Multiplex”和“Multitar get”3 種類型。M-FISH 的最大特點(diǎn)是可以在單個(gè)FISH實(shí)驗(yàn)中進(jìn)行多個(gè)繁瑣的FISH實(shí)驗(yàn)和多個(gè)不同基因的定位。以下5種方法是基于多色彩FISH基礎(chǔ)上開發(fā)的新技術(shù):染色體描繪、比較基因組雜交、光譜染色體自動(dòng)核型分析、交叉核素色帶分析及多彩色原位啟動(dòng)標(biāo)記[3]。
Wiegant等首先利用化學(xué)方法染色體進(jìn)行線性化,再以此線性化的染色體DNA作為載體進(jìn)行FISH,使FISH的分辨率顯著提高,就是最初的纖維-FISH。據(jù)一些文獻(xiàn)記載,逐漸改進(jìn)了DNA纖維舒展延伸的方法,使DNA纖維的伸展程度有了很大的變化。DNA纖維熒光原位雜交的關(guān)鍵在于如何制備具有高分辨率且高質(zhì)量的線性DNA纖維,能進(jìn)行定量分析。
微陣列可以在一個(gè)實(shí)驗(yàn)中檢測(cè)一個(gè)細(xì)胞中數(shù)百個(gè)基因的表達(dá)(減少和增加)。組織微陣列由組織微陣列區(qū)域中的500~1 000個(gè)單個(gè)腫瘤組織與管狀活組織檢查組成。細(xì)胞的組織和cDNA微陣列技術(shù)的組合可以提供一種有力的體內(nèi)鑒定基因的方法,可以對(duì)一些疾病及瘤的分子變化進(jìn)行重要評(píng)估。
FICTION是一種將熒光免疫核型分析和原位雜交相結(jié)合的方法,可以同時(shí)顯示異種細(xì)胞群中單個(gè)腫瘤細(xì)胞的免疫表型和一定的基因變化。FICTION具有診斷快速且可以再現(xiàn)的優(yōu)點(diǎn),適用于FISH分析前或后沒有所需以前細(xì)胞樣品的細(xì)胞學(xué)樣本。FICTION可用于分析血液腫瘤的系譜,更好地了解腫瘤病理組織。
據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,熒光原位雜交技術(shù)已經(jīng)被應(yīng)用于多個(gè)領(lǐng)域。例如,染色體結(jié)構(gòu)變異的檢測(cè),可以較容易地檢測(cè)出缺失、附加或替換的染色體;可用于產(chǎn)前診斷,近年來此項(xiàng)技術(shù)已用于診斷唐氏綜合征、膀胱癌等[4-5];可用于基因定位,即利用激光共聚焦和其他熒光透視法觀察基因的位置;還可以用于血液腫瘤檢測(cè)。也有很多文獻(xiàn)報(bào)道了熒光原位雜交與其他技術(shù)的聯(lián)用,如與免疫、量子點(diǎn)、微流控芯等技術(shù)聯(lián)用,提高了效率,縮短了周期。