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      基于“任務(wù)驅(qū)動”的 “聚合酶鏈反應(yīng)及反應(yīng)條件的優(yōu)化”教學(xué)設(shè)計(jì)

      2018-08-15 05:16尚?;?/span>駱海玉陸祖軍
      廣西教育·C版 2018年5期
      關(guān)鍵詞:任務(wù)驅(qū)動教學(xué)設(shè)計(jì)

      尚常花 駱海玉 陸祖軍

      【摘 要】本文論述基于“任務(wù)驅(qū)動”的“聚合酶鏈反應(yīng)及其反應(yīng)條件的優(yōu)化”教學(xué)設(shè)計(jì),提出通過“任務(wù)驅(qū)動”指向核心概念的教學(xué)方法,在創(chuàng)設(shè)情境、師生互動、生生合作及教師引導(dǎo)等環(huán)節(jié)適當(dāng)引導(dǎo),讓學(xué)生從科研實(shí)際出發(fā),在教師指導(dǎo)下自主進(jìn)行PCR反應(yīng)的設(shè)計(jì)和實(shí)際操作,在實(shí)驗(yàn)的實(shí)踐中深刻領(lǐng)會相關(guān)理論知識,為課后直接進(jìn)行實(shí)驗(yàn)打下良好的基礎(chǔ)。

      【關(guān)鍵詞】聚合酶鏈反應(yīng) 任務(wù)驅(qū)動 教學(xué)設(shè)計(jì) 大學(xué)生物學(xué)

      【中圖分類號】G 【文獻(xiàn)標(biāo)識碼】A

      【文章編號】0450-9889(2018)05C-0141-03

      人民軍醫(yī)出版社出版的大學(xué)生物學(xué)專業(yè)教材《基因工程原理與方法》(孫樹漢主編)第七章第一節(jié)為“聚合酶鏈反應(yīng)及其反應(yīng)條件的優(yōu)化”。該節(jié)是第六章“基因工程載體及其選用”的延續(xù),在基因工程操作中選定合適的載體后,還需要獲取目的基因。聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)是基因工程中使用最廣泛的獲取目的基因的方法。其教學(xué)重點(diǎn)是聚合酶鏈反應(yīng)的原理及其反應(yīng)條件的優(yōu)化,教學(xué)難點(diǎn)是聚合酶鏈反應(yīng)的實(shí)際應(yīng)用。教學(xué)內(nèi)容比較抽象,選擇合適的教學(xué)方法,利用實(shí)例引導(dǎo)學(xué)生掌握聚合酶鏈反應(yīng)的應(yīng)用是本節(jié)教學(xué)的著眼點(diǎn)。本文嘗試以“任務(wù)驅(qū)動”進(jìn)行教學(xué),在創(chuàng)設(shè)情境、師生互動、生生合作及教師引導(dǎo)等環(huán)節(jié)引導(dǎo)學(xué)生從科研實(shí)際出發(fā),讓學(xué)生在實(shí)踐中加深理解相關(guān)理論,增強(qiáng)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和操作技能。本節(jié)教學(xué)內(nèi)容設(shè)計(jì)如下。

      一、教學(xué)目標(biāo)

      (一)知識目標(biāo)。了解聚合酶鏈反應(yīng)的原理,分析影響聚合酶鏈反應(yīng)的因素。

      (二)能力目標(biāo)。通過具體的實(shí)例分析,培養(yǎng)實(shí)際應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)進(jìn)行基因工程操作的能力。

      (三)情感態(tài)度與價(jià)值觀目標(biāo)。領(lǐng)悟生物學(xué)的科學(xué)價(jià)值,樹立利用聚合酶鏈反應(yīng)等基因工程技術(shù)加快我國科技發(fā)展的理念,形成科學(xué)的價(jià)值觀。

      二、教學(xué)過程

      (一)創(chuàng)設(shè)情境?!痘蚬こ淘砼c方法》的課堂教學(xué)中,教師其實(shí)都在進(jìn)行情境教學(xué),只是部分教師沒有意識到“創(chuàng)設(shè)情境”這一概念。教育專家關(guān)于教學(xué)情境已有諸多論述。本節(jié)課以兩則新聞引導(dǎo)學(xué)生進(jìn)入“聚合酶鏈反應(yīng)及其反應(yīng)條件的優(yōu)化”的學(xué)習(xí)。第一則新聞是關(guān)于反轉(zhuǎn)基因人士崔永元赴美考察的報(bào)道。2014年,崔永元自費(fèi)100萬元赴美國考察,拍攝了一部關(guān)于揭露轉(zhuǎn)基因真相的紀(jì)錄片。然而,紀(jì)錄片發(fā)布后受到方舟子等人的公開質(zhì)疑。第二則新聞是農(nóng)業(yè)部首次主動召開有關(guān)轉(zhuǎn)基因的新聞發(fā)布會。2016年4月,農(nóng)業(yè)部新聞辦公室舉行了一場非常吸引眼球的新聞發(fā)布會,不是肉價(jià)上漲,也不是菜價(jià)上漲,而是“農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因”。截至2016年4月,我國共批準(zhǔn)發(fā)放7種轉(zhuǎn)基因作物安全證書,分別是耐儲存番茄、抗蟲棉花、改變花色矮牽牛、抗病辣椒、抗病番木瓜、轉(zhuǎn)植酸酶玉米和抗蟲水稻。但實(shí)現(xiàn)大規(guī)模商業(yè)化生產(chǎn)的只有抗蟲棉和抗病番木瓜。國務(wù)院2008年批準(zhǔn)設(shè)立了轉(zhuǎn)基因重大專項(xiàng),支持農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因技術(shù)研發(fā),我國科研人員克隆了100多個(gè)重要基因,取得了抗蟲棉、抗蟲玉米、耐除草劑大豆等一批重大成果,我國自主基因、自主技術(shù)、自主品種的研發(fā)能力顯著提升。由上述兩則新聞引出轉(zhuǎn)基因和克隆目的基因的概念,引導(dǎo)學(xué)生討論:在第六章“基因工程載體及其選用”選定載體后,如何獲得目的基因用于基因工程操作?學(xué)生帶著問題與懸念進(jìn)入“聚合酶鏈反應(yīng)及其反應(yīng)條件的優(yōu)化”的學(xué)習(xí)。

      設(shè)計(jì)意圖:通過熱點(diǎn)新聞吸引學(xué)生的注意力,直奔主題,激發(fā)學(xué)習(xí)興趣,讓學(xué)生帶著問題主動進(jìn)入新課的學(xué)習(xí)。

      (二)任務(wù)一:師生互動。教師組織學(xué)生思考聚合酶鏈反應(yīng)原理圖,通過形象的原理圖,讓學(xué)生說出一個(gè)模板DNA分子是如何通過PCR經(jīng)過n個(gè)循環(huán)得到2n-1個(gè)一樣的雙鏈DNA分子。通過師生互動,學(xué)生搞清楚PCR原理,方便后續(xù)內(nèi)容的掌握。

      設(shè)計(jì)意圖:通過形象的原理圖,學(xué)生更容易掌握抽象的PCR原理,為后續(xù)內(nèi)容的學(xué)習(xí)打下基礎(chǔ)。

      (三)任務(wù)二:生生合作及教師引導(dǎo)。思考、討論如下問題:(1)通過原理圖分析PCR反應(yīng)的兩個(gè)重要特征是什么?(2)典型的PCR包含哪些步驟?(3)PCR反應(yīng)體系由哪些組分構(gòu)成?PCR每一種組分在具體的實(shí)驗(yàn)中各有哪些注意事項(xiàng)?如何在PCR儀上設(shè)置程序?請學(xué)生分別回答上述問題。在學(xué)生回答問題時(shí),教師進(jìn)行適當(dāng)?shù)闹笇?dǎo)。

      有關(guān)問題一的探討。在學(xué)生回答的基礎(chǔ)上歸納出PCR反應(yīng)的兩個(gè)重要特征:(1)擴(kuò)增所得到的DNA片段大小由兩個(gè)引物結(jié)合位點(diǎn)之間的距離確定,即最終獲得的DNA片段是兩個(gè)引物之間的片段。(2)經(jīng)過n輪擴(kuò)增后理論上可以得到2n-1個(gè)一樣的雙鏈DNA分子。在學(xué)生回答后增加一個(gè)小問題:一般的PCR反應(yīng)需要擴(kuò)增多少個(gè)循環(huán)?在學(xué)生回答需要25-30個(gè)循環(huán)后,教師要及時(shí)提醒學(xué)生,書上所說的數(shù)字只是針對一般情況而言,實(shí)際上在某些特定PCR中需要20個(gè)循環(huán)(例如RACE第一輪PCR一般只需要20個(gè)循環(huán))或者有些擴(kuò)增效率較低的PCR需要30-35個(gè)循環(huán)。告訴學(xué)生設(shè)置PCR循環(huán)數(shù)需要綜合考慮三個(gè)因素:一是提供Taq酶的生物公司的說明書;二是某些特殊PCR的特定要求;三是結(jié)合瓊脂糖凝膠電泳的結(jié)果對循環(huán)數(shù)進(jìn)行動態(tài)的調(diào)整。讓學(xué)生樹立“不唯書”“實(shí)踐出真知”的科學(xué)意識。這樣有助于學(xué)生在將來的科研實(shí)驗(yàn)中可以迅速上手,而不是只知理論,遇到具體的實(shí)驗(yàn)很茫然。

      有關(guān)問題二的探討。在學(xué)生回答典型的PCR包含變性、退火和延伸三大步驟后,教師要及時(shí)提醒學(xué)生,常規(guī)PCR一般都是包含這三個(gè)步驟,但是有些特殊的PCR程序設(shè)置比較復(fù)雜(比如利用Genome Walking試劑盒進(jìn)行PCR的時(shí)候,程序設(shè)置就很復(fù)雜;進(jìn)行Touch-down PCR的時(shí)候,程序設(shè)置也比較復(fù)雜),因此進(jìn)行具體實(shí)驗(yàn)的時(shí)候一定要參照前人經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行合理設(shè)計(jì)程序,不能誤以為所有的PCR都只需要設(shè)置三步,這樣可以提前讓學(xué)生避免將來實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的誤區(qū)。

      有關(guān)問題三的探討。由于書上所講內(nèi)容非常偏理論化且非常陳舊,而且與實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)結(jié)合非常松散,因此計(jì)劃在這方面的教學(xué)通過學(xué)生探討在教師的引導(dǎo)下加以改進(jìn)。首先,在教師的引導(dǎo)下由學(xué)生回答PCR的組分包括10XPCR Buffer、DNA聚合酶、引物1、引物2、dNTP、去離子水及DNA模板。接著引導(dǎo)學(xué)生討論每一組分的注意事項(xiàng)。為了增強(qiáng)學(xué)生對每一種試劑的感性認(rèn)識,教師此時(shí)可以展示生物公司銷售的每一種組分的圖片,讓學(xué)生消除畏懼心和神秘感。同時(shí),為了使學(xué)生將來可以直接上手進(jìn)行實(shí)驗(yàn),可以在課堂給學(xué)生現(xiàn)場演示登錄寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司的官方網(wǎng)站http://www.takarabiomed.com.cn/(里面有很多比較實(shí)用的實(shí)驗(yàn)信息),依次點(diǎn)擊網(wǎng)站首頁的產(chǎn)品選擇指南—一般PCR相關(guān)制品—基本PCR:Taq系列-TaKaRa TaqTM下載Code No.R001A產(chǎn)品的說明書?,F(xiàn)場以說明書進(jìn)行講解,可以發(fā)現(xiàn)一般的PCR總的反應(yīng)體積都是50μL。其中對應(yīng)的10XPCR Buffer的終濃度為1X。dNTP的終濃度一般為0.2mM,由于生物公司銷售的dNTP一般有10mM和2.5mM兩種規(guī)格,所以一定要提醒學(xué)生配制PCR反應(yīng)體系的時(shí)候不僅要知道用的是什么物質(zhì),而且一定要看清楚濃度。引物1和引物2的濃度一般一樣,范圍均為0.2-1.0μM。在這里可以給學(xué)生現(xiàn)場展示從生物公司合成的引物會有一些粘在管壁上,因此要蓋緊蓋子首先離心2min,使得引物全部聚集于離心管底部。然后按照引物說明書上提示的體積加入去離子水,形成100μM的引物母液,在配置PCR反應(yīng)體系的時(shí)候,可以稀釋至20μM利用。同時(shí),給學(xué)生講述引物設(shè)計(jì)最常用的幾個(gè)規(guī)則,可以選取若干個(gè)具體基因的例子,在現(xiàn)場演示軟件使用方法的情況下,讓學(xué)生嘗試用常用生物軟件primer premier 5進(jìn)行引物設(shè)計(jì)。至于模板DNA,因?yàn)樯婕暗膬?nèi)容比較廣泛,既可以是基因組DNA,又可以是cDNA,還可以是質(zhì)?;蛘呒?xì)菌菌液,可以給學(xué)生布置課后作業(yè),讓學(xué)生課后到中國知網(wǎng)上搜索一篇相關(guān)的文章,詳細(xì)了解模板DNA的類型及各種DNA模板的制備方法。此外,告訴學(xué)生Taq酶的種類比較多,需要根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x擇不同的Taq酶,讓學(xué)生課后依次點(diǎn)擊網(wǎng)站首頁的產(chǎn)品選擇指南—一般PCR相關(guān)制品—PCR原理說明—PCR Enzymes的選擇詳細(xì)了解在何種場合選用何種具體的DNA聚合酶。同時(shí),現(xiàn)場向?qū)W生展示每一種成分的具體實(shí)物,配置PCR反應(yīng)體系所要用到的20μL和2μL移液器及0.2mL PCR管子,現(xiàn)場展示PCR反應(yīng)體系配置過程。然后,以一個(gè)具體的程序?yàn)槔?,現(xiàn)場講解PCR儀器中如何設(shè)置和運(yùn)行程序,雖然PCR儀器的廠家眾多,儀器界面各有差異,但是主流的PCR儀器設(shè)置和運(yùn)行程序大同小異。講解后讓學(xué)生現(xiàn)場操作設(shè)置相關(guān)的程序并運(yùn)行。最后,教師告知學(xué)生,雖然課本上講了很多影響因素,但是多數(shù)理論在實(shí)際中應(yīng)用很少,在實(shí)際的科研中PCR的反應(yīng)條件中最具有可調(diào)節(jié)性的就是退火溫度,一般可以在引物的Tm值上下波動5℃的范圍內(nèi)設(shè)定退火溫度,以獲得更好的PCR產(chǎn)物的特異性(由瓊脂糖凝膠電泳中目的條帶的特異性來體現(xiàn))。

      設(shè)計(jì)意圖:貫徹將課堂還給學(xué)生的教育理念,同時(shí)為了解決我國大學(xué)生普遍存在的眼高手低和實(shí)驗(yàn)?zāi)芰^差的缺點(diǎn),大膽拋棄書中一些比較瑣碎但是對具體的科研意義不大的理論講解。以現(xiàn)實(shí)中的產(chǎn)品說明書、各種組分、加樣品的移液器、最后在其中實(shí)際進(jìn)行PCR反應(yīng)的PCR儀器及相關(guān)的生物軟件的實(shí)操,讓學(xué)生在討論和實(shí)踐中真正地掌握本節(jié)課的理論知識和實(shí)際的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和操作技能。

      三、結(jié)論

      “任務(wù)驅(qū)動”是一種建立在建構(gòu)主義教學(xué)理論基礎(chǔ)上的教學(xué)方法,它強(qiáng)調(diào)“任務(wù)”的目標(biāo)性和教學(xué)情境的創(chuàng)建,這種教學(xué)方式能為學(xué)生創(chuàng)造實(shí)踐及感悟問題的情境。這期間,學(xué)生在教師的幫助和引導(dǎo)下,圍繞任務(wù)在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和操作中領(lǐng)會理論知識的學(xué)習(xí)過程。本節(jié)課首先以兩則社會上的熱點(diǎn)新聞引入轉(zhuǎn)基因的話題,進(jìn)一步涉及轉(zhuǎn)基因操作中目的基因的獲取這一步驟及實(shí)現(xiàn)獲取目的基因最常見的PCR方法,自然地將話題從新聞轉(zhuǎn)入正軌。然后,在“師生互動”及“生生合作,教師引導(dǎo)”兩個(gè)任務(wù)的驅(qū)動下,將生物網(wǎng)站、生物產(chǎn)品說明書、生物軟件、PCR反應(yīng)體系各種組分及PCR儀器引入課堂,讓學(xué)生在動手實(shí)踐中加深理解相關(guān)理論,增強(qiáng)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和操作技能。這種教學(xué)方法一改部分教師在上面高談闊論、學(xué)生在下面聽得昏昏欲睡的沉悶“灌輸式”課堂教學(xué),使得學(xué)生能積極參與到課堂中,通過實(shí)驗(yàn)獲得成就感,增強(qiáng)學(xué)習(xí)基因工程原理與方法課程的積極性。并非學(xué)生不愛學(xué)習(xí),而是部分教師過于脫離實(shí)驗(yàn)實(shí)際的空洞降解扼殺了學(xué)生學(xué)習(xí)的積極性。當(dāng)然,本節(jié)課程的設(shè)計(jì)還可以在將來的教學(xué)實(shí)踐中不斷加以完善。

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      (下轉(zhuǎn)第145頁)

      (上接第142頁)

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      【基金項(xiàng)目】廣西科協(xié)資助青年科技工作者專項(xiàng)課題(桂科協(xié)[2017]ZC-41);廣西高等教育本科教學(xué)改革工程項(xiàng)目(2018JGA136,2017JGB161)

      (責(zé)編 盧 雯)

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