丁亮,茆軍,梅偉,王培民 ,黃利佳,廖太陽
(1.南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院/江蘇省中醫(yī)院 骨傷科,江蘇 南京 210029;2.南京中醫(yī)藥大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,江蘇 南京 210029)
膝骨關(guān)節(jié)炎(knee osteoarthritis,KOA)是骨科常見病之一,它的主要病理特點為關(guān)節(jié)軟骨破壞、軟骨下骨硬化或囊性變、關(guān)節(jié)邊緣骨質(zhì)增生、滑膜病變、關(guān)節(jié)囊攣縮、韌帶松弛或攣縮、肌肉萎軟無力等[1]。流行病學(xué)調(diào)查研究顯示,我國癥狀性KOA(診斷明確,存在膝關(guān)節(jié)疼痛等癥狀且需要就診)的患病率為8.1%,隨著我國人口老齡化程度加劇,該比例還會持續(xù)上升[2]?,F(xiàn)代醫(yī)學(xué)多采取分級治療方式治療KOA,可根據(jù)患病程度分別采取基礎(chǔ)治療(患者教育、運動治療、物理治療、行動支持治療等)、藥物治療(口服鎮(zhèn)痛藥,關(guān)節(jié)腔藥物注射、口服中成藥等)、修復(fù)性治療(關(guān)節(jié)鏡手術(shù)、軟骨修復(fù)手術(shù)、力線矯正手術(shù)等)和重建性治療(單髁置換術(shù)、全膝關(guān)節(jié)置換術(shù)等)等方式治療,但都存在一定的局限性,包括藥物副作用、手術(shù)副作用、假體使用年限等[3]。中醫(yī)將KOA歸為“痹證”“骨痹”“筋痹”等范疇,現(xiàn)統(tǒng)稱為“膝痹”,證屬本虛標(biāo)實、本痿標(biāo)痹。主要病因病機為肝腎不足、風(fēng)寒濕邪侵襲機體,導(dǎo)致膝部筋絡(luò)氣血不通,故而為痛為腫。溫腎宣痹湯是王培民教授由多年臨床經(jīng)驗總結(jié)而來,該方以溫補腎陽、祛風(fēng)除濕之藥為主,補氣強骨、利水滲濕、行氣活血止痛之藥為輔,強筋健骨同時用以利水藥疏利關(guān)節(jié),補瀉并進,滋而不膩,諸藥合用共奏溫補腎陽、祛風(fēng)除痹之功[4]。盡管該方臨床取得了一定療效,然而具體作用機制尚待研究,本研究旨在通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,就溫腎宣痹湯治療KOA的潛在作用機制加以探討,為基礎(chǔ)研究提供思路。
本研究使用的數(shù)據(jù)庫及軟件如下:中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP),人類基因數(shù)據(jù)庫(The Human Gene Database,GeneCards),人類基因及遺傳疾病在線目錄(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM),DAVID生物信息學(xué)資源數(shù)據(jù)庫,蛋白互作與功能富集分析平臺(STRING),Cytoscape軟件,R語言軟件,Perl軟件。見表1。
表1 相關(guān)數(shù)據(jù)庫及軟件
登錄TCMSP數(shù)據(jù)庫,分別以附子、桂枝、牛膝、獨活、桑寄生、薏苡仁、白術(shù)、秦艽、黃芪、威靈仙、炙甘草為關(guān)鍵詞,檢索目前已知的每味中藥所含的有效成分,并進行初步篩選,條件為:口服生物利用度(OB)>30%,生物類藥性(DL)>0.18;構(gòu)建溫腎宣痹湯的有效成分庫,同時通過TCMSP數(shù)據(jù)庫查詢以上重要的有效成分的作用靶點,并通過Perl軟件構(gòu)建靶基因庫。
以knee osteoarthritis為關(guān)鍵詞,分別檢索GeneCards及OMIN數(shù)據(jù)庫,合并所查得的有關(guān)KOA相關(guān)的靶點,篩選并構(gòu)建KOA相關(guān)靶基因庫。
使用R語言軟件及Perl軟件,取得溫腎宣痹湯與KOA靶點基因的交集基因,并繪制Veen圖,得到溫腎宣痹湯-KOA共同靶點基因。
將通過上述步驟得到的溫腎宣痹湯-KOA共同靶點基因輸入STRING數(shù)據(jù)庫,選擇Multiple Proteins Search,限定物種為Homo sapiens,保存下載TSV格式的分析結(jié)果,繪制蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,并通過R語言計算每個靶點基因的度值(即靶點基因之間的相互連接數(shù)目),取大于平均度值的靶基因為核心靶基因。
利用Cytoscape軟件對STRING網(wǎng)站得到的結(jié)果與溫腎宣痹湯有效成分以及共同靶點基因進行分析,構(gòu)建藥物成分-靶基因-疾病調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并對網(wǎng)絡(luò)圖中節(jié)點大小及顏色進行調(diào)整。
將所得到的溫腎宣痹湯-KOA共同靶標(biāo)基因輸入DAVID數(shù)據(jù)庫中進行分析計算,得出GO功能富集分析與KEGG富集分析的結(jié)果。
通過TCMSP數(shù)據(jù)庫,分別以附子、桂枝、牛膝、獨活、桑寄生、薏苡仁、白術(shù)、秦艽、黃芪、威靈仙、炙甘草為檢索詞,設(shè)置OB和DL參數(shù),篩選后共得到196個有效成分,對應(yīng)靶點222個。見表2(僅部分顯示)。
表2 篩選后溫腎宣痹湯有效成分及其OB、DL
以knee osteoarthritis為檢索詞,分別檢索GeneCards數(shù)據(jù)庫以及OMIM數(shù)據(jù)庫,共得到KOA相關(guān)靶點基因2 064個。
將上述檢索得到的222個中藥靶點基因與KOA相關(guān)靶點基因取交集,得到溫腎宣痹湯-膝骨性關(guān)節(jié)炎共同靶點基因116個,并使用R語言軟件繪制Veen圖。見圖1。
圖1 溫腎宣痹方與KOA靶點基因交集Venn圖
將上述得到的116個中藥-疾病共同靶點輸入“STRING”數(shù)據(jù)庫,設(shè)置相關(guān)條件后運行得到靶基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖,見圖2。同時以大于平均度值為條件,篩選得到57個核心靶點基因,見圖3。
圖2 溫腎宣痹方治療KOA靶基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖
圖3 蛋白互作核心靶點條圖
通過Cytoscape軟件整合分析中藥復(fù)方溫腎宣痹湯的核心有效成分以及對應(yīng)的藥物作用靶標(biāo)基因與股骨頭壞死疾病共同基因之間的關(guān)系,構(gòu)成溫腎宣痹湯-靶基因-KOA疾病調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。見圖4。
圖4 溫腎宣痹方-藥物成分-靶基因-疾病調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖
對核心靶基因進行GO本體論分析,得出溫腎宣痹湯治療KOA的核心分子功能主要涉及細(xì)胞因子活性、DNA結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、核激素受體結(jié)合、雌激素受體結(jié)合、RNA聚合酶Ⅱ特異性DNA結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、細(xì)胞因子受體結(jié)合、激素受體結(jié)合、核受體結(jié)合、生長因子受體結(jié)合等。見圖5、6。
圖6 GO基因本體論分析柱狀圖
KEGG富集分析顯示,共篩選出溫腎宣94條溫腎宣痹湯治療膝骨性關(guān)節(jié)炎的潛在通路。主要涉及AGE-RAGE信號通路、IL-17信號通路、TNF信號通路等,見圖7、8。
圖7 KEGG富集分析氣泡圖
溫腎宣痹湯是王培民教授在多年臨床實踐中探索而來的,該方由附子、桂枝、牛膝、獨活、桑寄生、薏苡仁、白術(shù)、秦艽、黃芪、威靈仙、炙甘草等組成。重用附子以溫腎扶陽、散寒止痛;桂枝辛溫,溫表陽以固衛(wèi)氣,又祛風(fēng)濕;白術(shù)健脾利濕化水,通經(jīng)絡(luò),配以薏苡仁增強其健脾利濕化水之功,緩解寒飲造成的疼痛;獨活辛苦微溫,祛伏邪之風(fēng),除蘊久之痹;秦艽、威靈仙共奏祛風(fēng)除濕、舒筋活絡(luò)、通利關(guān)節(jié)之效,桑寄生、牛膝補益肝腎而強壯筋骨,輔以甘草,調(diào)和諸藥,輔以補益中焦,助扶正祛邪之用。
通過篩選我們共得到該方的有效成分196個,通過檢索得到其對應(yīng)靶點222個,通過與KOA疾病靶點取交集后得到了57個核心靶點,其中評分前3名的靶點基因依次為IL-16、蛋白激酶B(PKB/AKT1)、血管內(nèi)皮生長因子-A(VEGFA)。IL-6是一種炎癥介導(dǎo)因子,在人體各種炎癥過程中起到重要作用[5]。它由184個氨基酸組成,有兩種受體亞型,分別是mIL-6R-α和sIL-6R[6]。研究表明,KOA患者關(guān)節(jié)滑膜液與軟骨組織的IL-6表達(dá)水平較正常軟骨組織升高[7-8],且血清IL-6的濃度與KOA患者疼痛程度及影像學(xué)嚴(yán)重程度呈正相關(guān)[9],表明IL-6參與KOA的生理病理過程。絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(RAC-alpha serine/threonine-protein kinase,AKT)是磷脂酰肌醇激酶(PI3K)信號通路中重要的下游靶點,AKT1是其亞型之一。PI3K/AKT信號通路是軟骨細(xì)胞存活和凋亡的重要調(diào)節(jié)因子,除調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖,還可通過抑制軟骨細(xì)胞死亡來減少軟骨退變,是對抗軟骨細(xì)胞凋亡的重要途徑[10]。PI3K/AKT/mTOR是骨關(guān)節(jié)炎(OA)中軟骨下骨的關(guān)鍵代謝途徑。創(chuàng)傷后OA小鼠模型軟骨下骨中AKT磷酸化增加,促進成骨分化和成骨細(xì)胞增殖,導(dǎo)致異常骨形成[11]。VEGF是一種具有重要促血管生成活性的生長因子,它同時也是炎癥細(xì)胞因子。它作用于多種細(xì)胞類型,具有多種功能,其功能包括刺激血管生成、單核細(xì)胞趨化、增強血管通透性和血管舒張等[12]。在晚期OA的關(guān)節(jié)軟骨、滑膜、滑膜液、軟骨下等部位均可檢測出VEGF表達(dá),且與病情嚴(yán)重程度及疼痛程度呈正相關(guān)[13-15]。在VEGF家族中,VEGFA是在OA發(fā)病機制中被研究最多的亞型。有研究人員發(fā)現(xiàn),VEGFA可促進基質(zhì)金屬蛋白(MMPs)分泌,通過抑制蛋白聚糖和Ⅱ型膠原的合成和表達(dá)來抑制關(guān)節(jié)軟骨的變性[16]。
KEGG分析共得到94條相關(guān)通路,在排除與KOA關(guān)聯(lián)性較小的通路后,我們團隊認(rèn)為溫腎宣痹湯治療KOA主要通過IL-17信號通路、AGE-RAGE信號通路、TNF信號通路發(fā)揮作用。IL-17是多種炎癥細(xì)胞因子之一,存在于關(guān)節(jié)滑膜及軟骨細(xì)胞中。OA患者血清和滑液中IL-17水平升高,且與病變的X線圖像所示嚴(yán)重程度呈正相關(guān)[17-19]。IL-17能抑制軟骨細(xì)胞合成蛋白多糖,促進MMPs組酶的產(chǎn)生[20]。此外,IL-17影響其他細(xì)胞因子和化合物的分泌,進而影響OA進程[21]。晚期糖基化終產(chǎn)物受體(RAGE)是免疫球蛋白家族的成員,是晚期糖基化終產(chǎn)物(AGEs)的受體,多種細(xì)胞如巨噬細(xì)胞和肥大細(xì)胞均可表達(dá)[22],AGEs即高級糖基化終產(chǎn)物,是RAGE的配體,由蛋白質(zhì)與糖的糖基化而形成的[23],RAGE參與激活促炎反應(yīng)和各種炎癥基因有關(guān)的關(guān)鍵信號通路。一方面,AGEs通過激活包括軟骨細(xì)胞在內(nèi)的各種細(xì)胞的核因子(NF-κB)和絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)來誘導(dǎo)炎癥[24]。另一方面,AGEs可能通過MAPK途徑增加PGE2和NO水平,增強OA軟骨細(xì)胞的炎癥反應(yīng)[25]。腫瘤壞死因子(TNF)超家族在免疫、炎癥和控制細(xì)胞分化、增殖和凋亡中起著關(guān)鍵作用[26]。在OA患者中,滑液、滑膜、軟骨下骨和軟骨中的TNF水平均升高,現(xiàn)有研究表明,TNF可抑制軟骨細(xì)胞中蛋白多糖、連接蛋白和Ⅱ型膠原的合成,刺激MMP-1、MMP-3和MMP-13,28的釋放,誘導(dǎo)IL-6和趨化因子的產(chǎn)生[6,27]。
圖8 KEGG功能富集分析柱狀圖
通過以上分析,我們團隊認(rèn)為,溫腎宣痹湯治療KOA主要是通過通過AGE-RAGE信號通路、IL-17信號通路、TNF信號通路,作用于IL-6、AKT1、VEGFA等核心靶點,發(fā)揮控制炎癥反應(yīng)、調(diào)節(jié)免疫功能、抵抗氧化應(yīng)激等作用,從而控制疾病的發(fā)生發(fā)展,體現(xiàn)了多系統(tǒng)、多靶點、多方向的特點,這符合中醫(yī)學(xué)整體與系統(tǒng)論治的觀念。未來還需進一步進行嚴(yán)謹(jǐn)細(xì)致的實驗,以研究溫腎宣痹湯治療OA的確切分子作用機制。