劉信平,聶光華,王 艷
(湖北民族學(xué)院化學(xué)與環(huán)境科學(xué)學(xué)院湖北省湖北民族學(xué)院生物資源保護(hù)與利用重點實驗室,恩施,445000)
抗癌特效藥紫杉醇因資源嚴(yán)重短缺、水溶性太差,臨床中存在諸多弊端,拓寬資源供應(yīng)、尋找高效低毒的新型紫杉醇類擬藥刻不容緩,化學(xué)半合成法成為當(dāng)前乃至今后相當(dāng)長時間內(nèi)紫杉醇類擬藥研發(fā)熱點,而對紫杉醇C13側(cè)鏈進(jìn)行結(jié)構(gòu)修飾改造是當(dāng)前半合成研發(fā)的重點課題之一.如Ojima研究組合成了對C-3’修飾的奧蘭索已進(jìn)入臨床試驗階段[1].Sang-H.L 等 用SH 取 代C-2’位[2],Gunda I.Georg 等用呋喃和吡啶取代C-3’位的Ph[3];目前的半合成實驗研究報道相對較多,但從微觀層面研究其結(jié)構(gòu)性能尚未見報道.為了更好促進(jìn)對C13側(cè)鏈結(jié)構(gòu)改造、修飾,得到有效的紫杉醇類擬藥,了解其分子離子的微觀結(jié)構(gòu)及其性能是必要的.本文用量子力學(xué)理論計算方法[4,5],得到了C13側(cè)鏈分子離子的微觀結(jié)構(gòu)及性能、前線分子軌道特征,并認(rèn)證了其IR 光譜圖,為更進(jìn)一步的結(jié)構(gòu)修飾改造提供必要的理論依據(jù)和實驗基礎(chǔ).
本文全部計算用Gaussian09 程序包,采取B3LYP方法,6-31+G*水平基組對所選體系進(jìn)行了幾何全優(yōu)化、NBO 計算、頻率計算等,收斂精度取程序內(nèi)定值.為討論方便,用M 代表C13側(cè)鏈.
用不同的初始構(gòu)型對所選體系結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化及頻率計算,振動分析表明,所得的優(yōu)化構(gòu)型對應(yīng)勢能面上能量最小點(即無虛頻振動頻率),Mn(n=0,1,-1)體系都具有一定的穩(wěn)定性,且穩(wěn)定平衡結(jié)構(gòu)基態(tài)的電子狀態(tài)為:M 是2A,M+為:3A,M-為:1A,結(jié)構(gòu)圖及其相關(guān)結(jié)構(gòu)參數(shù)如圖1~3和表1所示.
圖1 M(2 A)優(yōu)化結(jié)構(gòu)圖Fig.1 The optimized structures of M(2 A)
圖2 M+(3 A)優(yōu)化結(jié)構(gòu)圖Fig.2 The optimized structures of M+(3 A)
圖3 M-(1 A)優(yōu)化結(jié)構(gòu)圖Fig.3 The optimized structures of M-(1 A)
由表1可知,Mn(n=0,1,-1)穩(wěn)定構(gòu)型的能量EM-< EM< EM+,因此穩(wěn)定性順序為:M-(1A)>M(2A)>M+(3A),根據(jù)偶極矩數(shù)值得到 它 們 極 性 強(qiáng) 弱 是M+(3A)> M-(1A)>M(2A).在空 間 構(gòu) 型 上,M+(3A)的R(C1-C2)=0.5073nm 顯著大于M(2A)的0.1734nm,與C1、C2相連的其它原子間的平衡幾何R 都有一定程度的縮短,相應(yīng)的鍵角和二面角計算結(jié)果表明:A(C1,C2,C4):M(2A)的=114.0859o、M+(3A)的=69.5679°,A(C2,C1,O24):M(2A)的=107.2020°、M+(3A)的=14.4680°,D(22,1,2,20):M(2A)的=41.5480°、M+(3A)的=137.6445°,D(24,1,2,4):M(2A)的=161.0554°、M+(3A)的=-117.1791°,D(4,18,25,26):M(2A)的=-152.7716°、M+(3A)的=8.7640°,M+(3A)空間構(gòu)型隨著C1-C2拉長的同時羧基以C2為軸點向C2-C4連線靠近,使得相應(yīng)的鍵角、二面角發(fā)生較大的翻轉(zhuǎn).相對來說M-(1A)的空間構(gòu)型變化程度要緩和的多,從結(jié)構(gòu)圖也可清晰看出.表2給出了化合物部分原子的自然原子電荷數(shù).
表1 Mn(n=0,1,-1)微觀結(jié)構(gòu)性質(zhì) Table 1 calculated results of micro-properties and structures for Mn(n=0,1,-1)
表2 部分原子的凈電荷布局 Table 2 The charge distributions of part atomic of Mn(n=0,1,-1)
由表2可知:M(2A)荷正電荷的主要原子為C1=0.5179、C2=0.7116、C4=0.3496、C25=1.274,荷負(fù)電荷的主要原子N18=-0.5767、O20=-0.3565、O22=-0.4246、O24=-0.4608、O26=-0.8531,從荷電數(shù)值可知,在中性分子中C1、C2、C25三個原子受親核試劑進(jìn)攻的可能性較大,難易順序為C25>C2>C1,N18、O20、O22、O24是親電試劑進(jìn)攻的原子,難易順序為N18>O24>O22>O20,即這7個原子為該物質(zhì)化學(xué)活動部位;
M+(3A):C1=1.1214、C2=0.3486、C4=0.3690、C25=1.2730,荷負(fù)電荷的主要原子N18=-0.1534、O20=0.2302、O22=-0.2048、O24=-0.8642、O26=-0.8691,因此兩個羰基的C1和C25是該陽離子主要正電荷原子,極易與親核試劑結(jié)合成鍵.C2上的羥基O20荷正電荷,而C1上的羥基O22荷負(fù)電降低但羰基O24升高,即C1、C2上兩個羥基的電子明顯流向羰基O24.從酰胺及與之鏈接的苯環(huán)電荷分布可以看出,氨基、?;?,苯環(huán)三者出現(xiàn)一定程度的共軛,電荷從氨基向酰基、苯環(huán)偏移,使得N18上荷負(fù)電減少而苯環(huán)、酰基O26增加;
M-(1A):C1=-0.0373、C2=0.5209、C4=-0.5259、C25=0.0440,荷負(fù)電荷的主要原子N18=0.1816、O20=-0.1431、O22=-0.2482、O24=-0.6711、O26=-0.4133,從這7個原子電荷布局可知,整個分子電荷由苯酰胺一側(cè)向另一端的C1、C2及與其相鏈接得羥基羧基轉(zhuǎn)移,結(jié)果使得氨基N18反而荷正電而C1、C4卻荷負(fù)電.
量子化學(xué)的前線軌道理論認(rèn)為[6-8],分子參與反應(yīng)分子軌道要發(fā)生變化,優(yōu)先起作用的是前線軌道,最低空軌道與最高占據(jù)軌道的能量差△E(ELUMO-EHOM0)是分子穩(wěn)定性的重要指標(biāo),其差值越大,分子穩(wěn)定性越強(qiáng);反之,分子越不穩(wěn)定,越易參與化學(xué)反應(yīng),因此研究前線軌道的性質(zhì)可以為確定活性部位以及探討作用機(jī)制等提供重要信息.根據(jù)所選基組及分子離子體系基態(tài)穩(wěn)定構(gòu)型,NBO 計算得到Mn(n=0,1,-1)分子軌道信息見表3 所示.由表3 可知,M-(1A)的△E 最大,M+(3A)的最小,即穩(wěn)定性順序是M-(1A)>M(2A)>M+(3A),結(jié)果與前面分析一致.
計算得到Mn(n=0,1,-1)體系的前線分子軌道的電子云如圖4~9所示.
表3 Mn(n=0,1,-1)的分子軌道特性Table 3 The properties parameters of the frontier molecular for Mn(n=0,1,-1)
圖4 M(2 A)的HOMO 電子云Fig.4 The electronic cloud of the HOMO for M(2 A)
圖5 M(2 A)的LUMO 電子云Fig.5 The electronic cloud of the LUMO for M(2 A)
圖6 M+(3 A)的HOMO 電子云Fig.6 The electronic cloud of the HOMO for M+(3 A)
由上圖可知,M(2A)的HOMO 電子云主要集中苯酰胺一端,LUMO 電子云主要集中在另一端的羰基及羧基上,既苯酰胺端是反應(yīng)時親電試劑進(jìn)攻部位,而另一端是親核試劑進(jìn)攻部位.M+(3A)的HOMO 電子云主要與C3鏈接的苯環(huán)及酰
圖7 M+(3 A)的LUMO 電子云Fig.7 The electronic cloud of the LUMO for M+(3 A)
圖8 M-(1 A)的HOMO 電子云Fig.8 The electronic cloud of the HOMO for M-(1 A)
圖9 M-(1 A)的LUMO 電子云Fig.9 The electronic cloud of the LUMO for M-(1 A)
胺基團(tuán)部位,LUMO 主要集中在苯酰胺基團(tuán)部位,M-(1A)的HOMO 電子云主要與C3-C2所鏈接的羰基及兩個羥基部位,LUMO 電子云在苯酰胺基團(tuán)部位.由此可知,Mn(n=0,1,-1)體系化學(xué)活性部位主要是苯酰胺基團(tuán)部位及C3-C2所鏈接的羧基和羥基位置.由此可證明Mn(n=0,1,-1)均屬兩性反應(yīng)體系,即可是電子供體也可是接受體,根據(jù)這一特性可以在設(shè)計目標(biāo)物結(jié)構(gòu)改造時有針對性地選擇反應(yīng)試劑,達(dá)到預(yù)期目的.
頻率計算得到其IR 吸收光譜數(shù)據(jù),并通過該計算方法和基組的校正因子校正后的IR 圖譜如圖10所示,對各峰的振動模式進(jìn)行了歸屬,譜進(jìn)行了詳細(xì)的指認(rèn).
本工作在B3LYP/6-311+G*水平基組上對Mn(n=0,1,-1)體系基態(tài)進(jìn)行了結(jié)構(gòu)優(yōu)化、頻率、自然鍵原子軌道計算,結(jié)果表明:分子、正負(fù)離子穩(wěn)定結(jié)構(gòu)的組態(tài)是2A、3A、1A,穩(wěn)定性順序為:M-(1A)>M(2A)>M+(3A),極性強(qiáng)弱是M+(3A)>M-(1A)>M(2A),M+(3A)的空間構(gòu)型與M(2A)相比在一些部位變化大,特別是在C1-C2位置,鍵長拉長很多而鍵角減小很多.凈電荷、分子軌道特征分析一致確定分子、正負(fù)離子體系的酰胺、羥基、羧酸基團(tuán)是參加化學(xué)反應(yīng)時的活性部位,能與親核或親電試劑反應(yīng),是關(guān)鍵藥效團(tuán)的活性部位,這一結(jié)論與紫衫醇實驗研究的構(gòu)效關(guān)系結(jié)論一致.得到了C13側(cè)鏈分子紅外光譜,并對譜圖中各峰進(jìn)行了振動模式歸屬及指認(rèn).本研究成果為進(jìn)一步研究紫衫醇C13側(cè)鏈的修飾改造,合成更多高效低毒的紫衫醇類擬物提供可參考的理論基礎(chǔ)和實驗依據(jù),具有很大的理論意義和應(yīng)用價值.
圖10 C13 側(cè)鏈子IR 譜圖(振動頻率:cm-1,紅外強(qiáng)度:Km/mol)Fig.10 IR spcctra of the taxol C13side chain(Frequcncy:cm-1,intensity:Km/mol)
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