宋啟飛,劉敏雪,李夢嬌,劉雅,鄧勁,謝軼
(四川大學(xué)華西醫(yī)院,四川 成都 610041)
血培養(yǎng)可有效檢測出導(dǎo)致血流感染的病原菌,是臨床診斷血流感染的金標(biāo)準(zhǔn)[1-3]。在菌血癥、膿毒血癥等嚴(yán)重感染患者中,及早使用敏感抗菌藥物可有效降低患者的病死率[4]。有研究顯示,血流感染病原菌鑒定報告時間每延遲1 h,患者存活率降低7.6%[5]。然而,目前的血培養(yǎng)檢驗流程中,血培養(yǎng)瓶報陽后,仍需36~48 h才能得到最終的菌種鑒定報告。本研究嘗試摸索一種血培養(yǎng)陽性標(biāo)本的快速、精準(zhǔn)鑒定方法,以縮短血培養(yǎng)陽性的周轉(zhuǎn)時間(turnaround time,TAT),為臨床醫(yī)生提供更為及時、精準(zhǔn)的用藥指導(dǎo)。
收集2016年7月—2016年11月四川大學(xué)華西醫(yī)院臨床送檢的非重復(fù)的血培養(yǎng)陽性標(biāo)本91份?;钚蕴垦囵B(yǎng)瓶(法國生物梅里埃公司),血平板(鄭州安圖生物技術(shù)有限公司),營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基(廣東環(huán)凱微生物科技有限公司),基質(zhì)液HCCA(德國Bruker Daltonic公司),75%酒精,75%甲酸。
Bact/Alert 3D血培養(yǎng)儀(法國生物梅里埃公司),MALDI-TOF MS檢測系統(tǒng)(德國Bruker Daltonic公司),二氧化碳孵箱(日本三洋公司),隔水式恒溫培養(yǎng)箱(上海恒一精密儀器有限公司),高速離心機(深圳市科力易翔儀器有限公司)。
1.3.1 血培養(yǎng)陽性標(biāo)本處理 將91份血培養(yǎng)陽性標(biāo)本(活性炭血培養(yǎng)瓶)放入Bact/Alert 3D血培養(yǎng)儀,系統(tǒng)自動孵育和檢測,陽性報警時取出血培養(yǎng)瓶,用75%酒精消毒血培養(yǎng)瓶口,抽取陽性瓶內(nèi)培養(yǎng)液進行涂片和革蘭染色。將血培養(yǎng)陽性瓶中的培養(yǎng)液分別轉(zhuǎn)種至肉湯和血平板。將100μl培養(yǎng)液轉(zhuǎn)種至2 ml肉湯管中混勻,振蕩孵育4 h,37℃、220 r/min離心,作為肉湯增菌組;同時將100μl培養(yǎng)液轉(zhuǎn)種至血平板,5%~10%二氧化碳孵箱,37℃培養(yǎng)4 h,作為血平板培養(yǎng)組;同時分別轉(zhuǎn)種另一塊血平板,5%~10%二氧化碳孵箱,37℃培養(yǎng)24 h,作為對照組。
1.3.2 基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時間質(zhì)譜(matrix-assisted laser-desorption/ionization time-offlight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)鑒定 ① 4 h肉湯增菌法:取經(jīng)4 h增菌培養(yǎng)的肉湯1 ml至EP管中,8 000 r/min離心5 min,棄上清液,取EP管底部1μl細(xì)菌沉淀,制備質(zhì)譜靶板;②4 h血平板培養(yǎng)法:挑取經(jīng)4 h血平板培養(yǎng)的菌膜1μl制備質(zhì)譜靶板。室溫干燥后,進樣至MALDI-TOF MS系統(tǒng)中進行菌種鑒定。用IVD細(xì)菌測試標(biāo)準(zhǔn)品進行質(zhì)譜分析前儀器參數(shù)校正,質(zhì)譜鑒定操作按照質(zhì)譜儀標(biāo)準(zhǔn)程序進行;③對照組:取培養(yǎng)24 h的血平板上菌落,按上述方法進行質(zhì)譜鑒定,將鑒定結(jié)果作為對照。
數(shù)據(jù)分析采用SPSS 20.0統(tǒng)計軟件,計數(shù)資料以率(%)表示,比較采用四格表χ2檢驗或Fisher確切概率法,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
4 h肉湯增菌法的質(zhì)譜鑒定到種的符合率為46.15%(42/91),4 h 血平板培養(yǎng)法為 89.01%(81/91),經(jīng)χ2檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=38.146,P=0.000),4 h血平板培養(yǎng)法細(xì)菌質(zhì)譜鑒定到種的符合率高于4 h肉湯增菌法。4 h肉湯增菌法中43株菌無質(zhì)譜鑒定結(jié)果,占47.25%,3株菌質(zhì)譜鑒定錯誤,占3.30%。4 h血平板培養(yǎng)法中3株菌無質(zhì)譜鑒定結(jié)果,占3.30%,4株菌質(zhì)譜鑒定錯誤,占4.40%。2種方法無鑒定結(jié)果率比較,經(jīng)χ2檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=46.547,P=0.000),4 h血平板培養(yǎng)法的無鑒定結(jié)果率低于4 h肉湯增菌法。2種方法錯誤鑒定率比較,經(jīng)Fisher確切概率法分析,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.500)。
91例血培養(yǎng)陽性瓶中,分離出革蘭陽性菌40株,革蘭陰性菌51株。40株革蘭陽性菌中,4 h肉湯增菌法質(zhì)譜鑒定到種的符合率為30.00%(12/40),4 h血平板培養(yǎng)法質(zhì)譜鑒定到種的符合率為82.50%(33/40)。51株革蘭陰性菌中,4 h肉湯增菌法質(zhì)譜鑒定到種的符合率為58.82%(30/51),4 h血平板培養(yǎng)法質(zhì)譜鑒定到種的符合率為94.12%(48/51)。4 h血平板培養(yǎng)法對革蘭陽性菌和革蘭陰性菌鑒定到種的符合率與4 h肉湯增菌組比較,經(jīng)χ2檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=4.943和17.654,P=0.026和0.000),4 h血平板培養(yǎng)法對革蘭陽性菌和革蘭陰性菌鑒定到種的符合率高于4 h肉湯增菌法。
革蘭陰性菌中腸桿菌科細(xì)菌41株,經(jīng)4 h肉湯增菌后質(zhì)譜正確鑒定到種28株,占68.29%(28/41);經(jīng)4 h血平板培養(yǎng)后質(zhì)譜正確鑒定到種41株,占100.00%(41/41)。4 h血平板培養(yǎng)法與4 h肉湯增菌法鑒定到種的符合率比較,經(jīng)χ2檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=15.449,P=0.000),4 h血平板培養(yǎng)法鑒定到種的符合率高于4 h肉湯增菌法。
6株鮑曼不動桿菌和5株金黃色葡萄球菌在4 h肉湯增菌法中均未鑒定出結(jié)果,在4 h血平板培養(yǎng)法中全部鑒定到種。在凝固酶陰性葡萄球菌、腸球菌和念珠菌中,4 h血平板培養(yǎng)法的鑒定符合率也高于4 h肉湯增菌法(χ2=18.114,P=0.000)。2種方法對1株具核酸桿菌和1株咽峽炎鏈球菌在4 h增菌后均未鑒定成功,但對1株產(chǎn)單李斯特菌,4 h肉湯增菌法可鑒定到種,4 h血平板培養(yǎng)法可鑒定到屬。
近年來新發(fā)展起來的MALDI-TOF MS相對傳統(tǒng)細(xì)菌培養(yǎng)鑒定流程,可以更快速、準(zhǔn)確地鑒定出血培養(yǎng)陽性標(biāo)本中的細(xì)菌,縮短血培養(yǎng)陽性的實驗TAT時間,為臨床醫(yī)生提供更為及時的用藥指導(dǎo)。血培養(yǎng)送檢規(guī)范中要求在抗生素使用前進行血液采集,然而在菌血癥、膿毒血癥等嚴(yán)重感染的救治過程中患者可能已使用抗生素,之后才采集血培養(yǎng)。采集的血液中含有抗生素會降低血培養(yǎng)陽性率[6]。因而,血培養(yǎng)瓶中往往添加抗生素吸附劑(如樹脂或活性炭),可有效吸附一定量的抗生素,從而提高血培養(yǎng)陽性率。然而,血培養(yǎng)瓶中的活性炭成分會干擾質(zhì)譜的鑒定結(jié)果,不利于血培養(yǎng)陽性瓶中病原菌的質(zhì)譜鑒定。本研究嘗試用MALDI-TOF MS對血培養(yǎng)陽性標(biāo)本經(jīng)肉湯和血平板增菌4 h后直接質(zhì)譜鑒定,摸索血培養(yǎng)陽性標(biāo)本的質(zhì)譜快速鑒定流程,為臨床縮短血培養(yǎng)陽性標(biāo)本病原菌鑒定時間提供參考方法。
本研究血培養(yǎng)陽性標(biāo)本檢出的細(xì)菌中大腸埃希菌、肺炎克雷伯菌及表皮葡萄球菌占前3位,是患者感染最普遍的細(xì)菌。腸桿菌科細(xì)菌和凝固酶陰性葡萄球菌比例與高麗欽[7]、徐修禮[8]等的報道基本一致。腸桿菌科細(xì)菌、葡萄球菌是菌血癥和敗血癥的主要病原菌[7]。本研究探索的4 h血平板培養(yǎng)法對腸桿菌科細(xì)菌鑒定到種的符合率達100.00%(41/41),對凝固酶陰性葡萄球菌鑒定到種的符合率也可達83.33%(20/24)。該方法能夠快速、準(zhǔn)確地鑒定出腸桿菌科細(xì)菌,對臨床醫(yī)生避免經(jīng)驗用藥,減少患者并發(fā)癥,提高治愈率具有重要的臨床意義。
2種方法對革蘭陰性菌鑒定符合率均優(yōu)于革蘭陽性菌,與國內(nèi)外研究報道基本一致[9-12]。其原因可能與革蘭陰性菌比革蘭陽性菌更易生長,革蘭陽性菌對生長條件要求苛刻,不易生長等因素有關(guān)。6株鮑曼不動桿菌和5株金黃色葡萄球菌在4 h肉湯增菌后均未鑒定出結(jié)果,但在4 h血平板培養(yǎng)后全部鑒定成功,可能是血平板相比肉湯,更有利于鮑曼不動桿菌和金黃色葡萄球菌的生長和質(zhì)譜鑒定,需進一步實驗予以證實。
運用MALDI-TOF MS對細(xì)菌進行鑒定時,細(xì)菌培養(yǎng)基類型、樣品制備方法、離心速度、分析軟件等的標(biāo)準(zhǔn)不一樣,會對細(xì)菌質(zhì)譜鑒定的結(jié)果產(chǎn)生影響[13,14]。本研究中,4 h肉湯增菌法的細(xì)菌質(zhì)譜鑒定符合率較低,這可能與肉湯培養(yǎng)基的營養(yǎng)成分(如蛋白質(zhì))、培養(yǎng)基性質(zhì)及培養(yǎng)方式有關(guān),還需進一步改善該方法的實驗流程。
本研究中,4 h血平板培養(yǎng)法細(xì)菌質(zhì)譜鑒定到種的總符合率為89.01%,可快速鑒定血培養(yǎng)陽性標(biāo)本中的病原菌,并有高鑒定符合率。但本研究存在一定局限性,僅收集91例樣本,樣本量過少,可能對結(jié)果產(chǎn)生偏移,需增加樣本數(shù)量及菌種的多樣性。而該方法對腸桿菌科、葡萄球菌等生長較快的細(xì)菌快速鑒定更具優(yōu)勢,對有特殊培養(yǎng)要求的革蘭陽性菌等的鑒定符合率相對較低。