李閃閃,張艷芳,謝豐華,李冬秀,黃 湘(.南方醫(yī)科大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院,廣州 50000;.南方醫(yī)科大學(xué)附屬中山博愛醫(yī)院產(chǎn)前診斷中心,廣東中山 58400)
染色體病是染色體異常引起的遺傳性疾病,可致先天性多發(fā)畸形,智力及身體發(fā)育障礙等嚴重臨床癥狀,我國每年約有3.6萬新生兒染色體異常[1,2]。故核型分析、染色體微陣列分析(chromosome microarray,CMA)、細菌人工染色體標(biāo)記-磁珠鑒別/分離技術(shù)(BAC-on-Beads ,BOBS)、熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)、多重連接介導(dǎo)的探針擴增技術(shù)(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)、全基因組測序和無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(non-invasive prenatal testing,NIPT)等染色體檢測技術(shù)飛速發(fā)展并應(yīng)用于臨床,但BOBS,F(xiàn)ISH,MLPA,NIPT和全基因組測序因為方法學(xué)和費用的限制而應(yīng)用受限,作為染色體異常檢測金標(biāo)準的核型分析和近年新興的高通量檢測策略CMA,成為廣泛使用的產(chǎn)前診斷項目[3]?,F(xiàn)為明確CMA和核型分析診斷染色體異常的臨床價值,基于前人研究結(jié)果,本研究擬對兩者檢出的胎兒染色體情況進行系統(tǒng)分析,望能指導(dǎo)臨床醫(yī)生合理使用產(chǎn)前診斷項目。
1.材料與方法
1.1 研究對象 選取2017年5~11月共347例在中山市博愛醫(yī)院進行產(chǎn)前咨詢并進行CMA和核型分析的孕婦為研究對象。研究對象應(yīng)至少滿足以下任意一個產(chǎn)前診斷指征:①超聲異常:包括羊水過多或過少,胎兒發(fā)育異?;蚩梢苫蔚?;②高齡(≥35歲);③不良妊娠史或夫妻任一方有遺傳病家族史;④孕早期有不良接觸史;⑤產(chǎn)前母血清篩查高風(fēng)險或無創(chuàng)性產(chǎn)前檢測(NIPT)高或臨界風(fēng)險。其中,孕婦年齡17~46歲,平均年齡32.29±6.089歲;孕周12~35周,平均孕周21.74±5.188周;胎兒性別:男:52.45%(182/347),女:47.55%(165/347)。本研究獲倫理委員會批準并簽署患者知情同意書。
1.2 試劑和儀器
1.2.1 核型分析:培養(yǎng)基、秋水仙素、植物血細胞凝集素、KCl溶液、胰蛋白酶液、冰乙酸和甲醇、Giemsa染色液、NaOH溶液、生理鹽水、細胞培養(yǎng)箱,GenetixGSL-120全自動染色體分析儀。
1.2.2 CMA:微陣列芯片(Affymetrix,CytoScan 750K),DNA提取試劑盒(QIAGEN,QIAamp DNA Blood Mini Kit),Agilent Genomic WorkbenchLite Edition7.0.4.0軟件分析結(jié)果,在OMIM,UCSC,DECIPHER,ISCA,DGV數(shù)據(jù)庫中查詢數(shù)據(jù)。
1.3 方法
1.3.1 有創(chuàng)操作獲取胎兒樣本:分別于孕8~11周,孕16~22周,孕18~24周時采集絨毛、羊水、臍靜脈血。對獲取的胎兒細胞進行CMA和培養(yǎng)后染色體核型分析。
1.3.2 核型分析:胎兒樣本在體外適宜條件下培養(yǎng),經(jīng)細胞收獲,制片,消化,G顯帶染色,掃描后進行分析并報告[4]。
1.3.3 CMA檢測:本團隊進行有創(chuàng)操作獲取胎兒樣本,CMA檢測及報告由合作單位廣東省婦幼保健院進行[5]。
2結(jié)果
2.1 整體資料 本研究參與者349例,染色體檢測成功率:CMA:100%(349/349),核型分析:99.43%(347/349),2例CMA檢測結(jié)果正常但核型培養(yǎng)失敗,故后續(xù)分析中未納入統(tǒng)計。孕婦高齡(≥35歲):37.20%(129/347);標(biāo)本類型:羊水、臍血、絨毛分別為64.80%,34.30%,0.90%;CMA和核型分析結(jié)果相符率89.63%(311/347),兩者之一或均異常14.41%(50/347),CMA和核型分析的染色體異常檢出率分別為10.95%(38/347)和9.22%(32/347);對CMA和核型分析檢出染色體異常進行配對四格表資料的差異性比較顯示P=0.362,兩者的染色體異常檢出率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。
2.2 CMA和核型分析檢出染色體異常情況
2.2.1 CMA及核型分析結(jié)果:見表1。均異常20例,其中,相符14例,不符6例。分析CMA和核型分析的染色體均異常結(jié)果相符14例表明,CMA和核型分析均能檢出染色體數(shù)目異常及大片段的重復(fù)和缺失,如案例5中≥6.9Mb的缺失;6例兩者結(jié)果不符表明,CMA檢出染色體拷貝數(shù)變異(copy number variations,CNVs)的敏感度更高,核型分析能更敏感地檢出染色體倒位和嵌合,如案例9~11,CMA檢出染色體非整倍體異常和核型未檢出的8q21.2q21.3約1.5Mb的缺失,但未檢出核型分析檢出的染色體倒位;案例12,CMA檢出約19.3Mb的12q23.3q24.31的雜合性丟失,核型分析檢出19h+;案例13,CMA檢出10q23.33q26.3約30.6Mb的嵌合重復(fù),核型分析檢出9號染色體倒位和性染色體嵌合,兩者檢出的嵌合染色體和位點不同。
表1 核型和CMA檢測結(jié)果均異常結(jié)果(n=20)
2.2.2 CMA異常但核型分析正常:見表2。分析18例CMA異常但核型分析正常表明CMA能敏感地檢出CNVs,且部分微小CNVs具有明確的致病性。如表2中,案例3的244Kb重復(fù)經(jīng)查詢數(shù)據(jù)庫可知會導(dǎo)致Xq28微重復(fù)綜合征;對染色體雜合性丟失,無論片段大小,核型分析均未檢出。如案例11~15,其中案例11的7p12.3q11.22雜合性丟失明確可致Russell-Silver綜合征;另外,7例CMA結(jié)果異常可致患隱性遺傳病風(fēng)險增加或致病性尚不明確,如案例12和15中高至18Mb的2q14.3q22.3雜合性丟失和低至1.15Mb的7q36.1q36.2重復(fù)。
表2 CMA異常而核型分析正常結(jié)果(n=18)
2.2.3 核型分析異常但CMA結(jié)果正常:見表3。
表3 核型分析異常而CMA正常(n=12)
本研究中共12例核型分析異常而CMA檢測結(jié)果均正常,包括染色體易位、倒位、嵌合、多態(tài)、衍生染色體、異染色質(zhì),表明核型分析在檢出這些染色體異常方面較CMA更具優(yōu)越性。
3討論為明確CMA和核型分析對診斷染色體異常的臨床價值,本研究系統(tǒng)分析了中山市同時進行核型分析和CMA產(chǎn)前診斷的347例胎兒檢測結(jié)果,結(jié)果顯示,CMA和核型分析對可致病染色體異常的檢出率分別為10.95%,9.22%,表明有產(chǎn)前診斷指征的孕婦進行有創(chuàng)CMA和核型分析,能幫助臨床醫(yī)生及時發(fā)現(xiàn)胎兒染色體異常并采取針對措施,減少新生兒出生缺陷。
分析表明,CMA和核型分析均能檢出染色體數(shù)目異常及大片段的不平衡重排,兩者對染色體異常的檢出具有互補性,CMA能檢出核型分析未檢出的微小CNVs,核型分析能檢出CMA未檢出的染色體平衡易位。兩者均檢出的染色體異常情況,見表1,均提示CMA和核型分析在檢出染色體非整倍體和大片段CNVs上具有同等效力。核型分析能更敏感地檢出如表3中的染色體易位、倒位等,但不能檢出小于5~10Mb的染色體異常,檢測敏感度低,如表2中案例10,CMA檢出約6.95Mb的13q21.2q21.33缺失,可能導(dǎo)致較輕的臨床效應(yīng),但核型未檢出此異常;CMA的分辨率和敏感度高,表2中案例3,CMA可檢出低至244Kb的微重復(fù),會導(dǎo)致Xq28微重復(fù)綜合征(DECIPHER),引起男性患者X連鎖智力低下(PMID:20004760);其次,CMA能區(qū)別染色體異常是否具有臨床意義,如表1案例8中,核型分析檢出7p12q14和8q1的缺失,CMA認為8q1的缺失為無義缺失,故僅報告7p14.3p12.3的缺失,表明CMA具有鑒別核型分析檢出的染色體無義突變的能力,能減少因檢出無義突變對臨床和準父母造成的困擾和壓力;在分析表3中核型異常但CMA結(jié)果正常案例時發(fā)現(xiàn),CMA不能檢出染色體易位、倒位、多態(tài)、衍生染色體、異染色質(zhì),檢出染色體嵌合的能力低于核型分析,表1中案例13兩者檢出染色體的不同異常也驗證了這一點,核型分析檢出9號染色體倒位和性染色體嵌合,而CMA檢出10q23.33-qter約39.6Mb的嵌合重復(fù),可能是嵌合比例低導(dǎo)致CMA未檢出核型分析檢出的嵌合,染色體倒位和10q23.33q26.3的嵌合因CMA和核型分析方法學(xué)限制而未檢出;表3中案例1,孕婦雙胎妊娠,有不良妊娠史,核型分析顯示兩胎兒均為inv(9)(p11q13),家系研究表明該遺傳來自父親,而CMA未檢出此染色體倒位。這與以往關(guān)于兩者的研究相符[6~8]。
產(chǎn)前診斷技術(shù)存在自身的缺陷。核型分析依賴于工作人員的經(jīng)驗,且存在細胞培養(yǎng)失敗,培養(yǎng)時間和檢測周期長等缺點,即使檢出染色體異常,也會使部分胎兒錯過最佳處理時間,導(dǎo)致患者失去選擇妊娠的權(quán)利,延遲繼續(xù)妊娠的染色體異常胎兒的孕期監(jiān)護和出生后處理等;CMA也存在一些缺陷,如CMA檢測敏感度的提高會增加臨床意義不明的CNVs的檢出率,這些CNVs對胎兒的影響尚不確定,學(xué)界對CNVs的認知存在局限性等,增加準父母的焦慮,甚至造成健康胎兒妊娠的終止。因此診斷實驗室應(yīng)嚴格遵循CMA報告原則發(fā)放報告,臨床醫(yī)生應(yīng)明確CMA和核型分析的優(yōu)缺點,綜合分析染色體異常的各種影響因素,將CMA和核型分析有機結(jié)合應(yīng)用于產(chǎn)前診斷,并做好產(chǎn)前咨詢工作,盡量使高危孕婦接受有創(chuàng)產(chǎn)前診斷,提高胎兒染色體異常檢出率,避免染色體異常漏診和診斷延遲造成的新生兒缺陷,減緩準父母的心理壓力[9];另外,科研工作者應(yīng)加強對染色體異常機制,臨床致病性及治療的研究,完善相關(guān)遺傳數(shù)據(jù)庫,使科研成果更好的轉(zhuǎn)化應(yīng)用于臨床。
綜上所述,CMA和核型分析在檢出染色體異常中各有優(yōu)勢,CMA能更敏感地檢出染色體微重復(fù)和微缺失,核型分析對檢出易位、倒位等更具優(yōu)越性。這要求產(chǎn)前診斷醫(yī)生明確掌握CMA和核型分析對染色體異常的檢出和適用情況,合理地為孕婦開展相應(yīng)的產(chǎn)前檢測項目并根據(jù)檢測結(jié)果采取相應(yīng)的針對措施,從而提高胎兒染色體病檢出率,減少新生兒出生缺陷,提高新生兒愈后和生存質(zhì)量,減輕患兒本人、家庭和社會的負擔(dān)。
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