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      2-甲基丁酰-輔酶A脫氫酶缺乏癥患者ACADSB基因變異分析

      2022-01-19 00:41:50李莉朱丹丹張鳳
      海南醫(yī)學(xué) 2022年1期
      關(guān)鍵詞:異亮氨酸輔酶蛋氨酸

      李莉,朱丹丹,張鳳

      1.瀘州市婦幼保健院兒科,四川 瀘州 646000;2.綿陽市第三人民醫(yī)院(四川省精神衛(wèi)生中心),四川 綿陽 621000

      2-甲基丁酰-輔酶A脫氫酶缺乏癥(2-methylbutyryl-CoA dehydrogenase deficiency,2-MBAD)是 由ACADSB基因變異引起的異亮氨酸分解代謝受損的隱性遺傳代謝性疾病,也稱短/支鏈?;o酶A脫氫酶缺乏癥(short/branched chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency,SBCADD)[1]。在新生兒疾病篩查開展前,多由出生后出現(xiàn)喂養(yǎng)困難、低血糖或在兒童期出現(xiàn)發(fā)育遲緩、智力障礙、癲癇、肌肉萎縮、肌張力減退、自閉癥等臨床表現(xiàn)進(jìn)行檢查而確診,但隨著串聯(lián)質(zhì)譜的開展,大部分患者在出現(xiàn)臨床表現(xiàn)前已被確診[2]。本研究對3例串聯(lián)質(zhì)譜篩查時發(fā)現(xiàn)異戊酰基肉堿(C5)升高患者進(jìn)行基因檢測,確診為2-MBAD,并進(jìn)行ACADSB基因變異分析,以明確其致病原因,為家系的遺傳咨詢提供依據(jù)。

      1 資料與方法

      1.1 一般資料 選取2018—2020年瀘州市婦幼保健院新生兒疾病篩查串聯(lián)質(zhì)譜發(fā)現(xiàn)異戊?;鈮A(C5)升高疑似2-MBAD的3例患者,收集串聯(lián)結(jié)果及臨床資料,并對其進(jìn)行遺傳代謝性疾病相關(guān)基因檢測。

      1.2 方法

      1.2.1 DNA提取 經(jīng)監(jiān)護(hù)人簽署知情同意書、并經(jīng)醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn)后,抽取患者及其父母靜脈血2 mL,EDTA抗凝,送北京博奧醫(yī)學(xué)檢驗所,使用天根生化科技(北京)有限公司的微量樣品基因組DNA提取試劑盒提取基因組DNA。

      1.2.2 高通量測序及Sanger測序驗證 采用探針法靶向捕獲3 877個已知的疾病基因,配合Illumina Next 500測序平臺獲得測序數(shù)據(jù),篩選出變異位點。再用Sanger測序方法驗證患者父母。

      1.2.3 變異位點的生物信息學(xué)分析 用SIFT、PolyPhen-2、MutationTaster等軟件對候選點變異進(jìn)行位點保守性預(yù)測、蛋白功能預(yù)測;用GnomAD、ExAC和1000Genomes數(shù)據(jù)庫對變異位點進(jìn)行人群頻率注釋;用ClinVar數(shù)據(jù)庫對變異位點的致病性判讀結(jié)果進(jìn)行注釋。選擇GnomAD等數(shù)據(jù)庫中東亞人群頻率低于0.01,并且位點保守性強、對蛋白結(jié)構(gòu)或功能影響劇烈,ClinVar中為非良性變異,且基因?qū)?yīng)的臨床表型與患者表型吻合的基因變異位點查閱文獻(xiàn)進(jìn)行變異位點的致病性分析。

      2 結(jié)果

      2.1 臨床資料

      2.1.1 病例1 男,58 d,因新生兒疾病篩查C5升高就診,患者系G2P1,足月順產(chǎn),出生體質(zhì)量3.3 kg,無窒息、搶救病史,患者生后精神奶量可,大小便正常。父母體健,非近親結(jié)婚,否認(rèn)家族遺傳病史。查體:體質(zhì)量4.1 kg,身長53 cm,頭圍39 cm。前囟1.8 cm×1.4 cm,平軟,神清,皮膚彈性可,心肺腹無異常;四肢肌力、肌張力正常,神經(jīng)系統(tǒng)檢查無異常。輔助檢查:血常規(guī)、肝腎功能、心肌酶譜、電解質(zhì)、血糖、血氨、血乳酸未見異常。串聯(lián)結(jié)果:C5 0.56μmol/L,C5/C2 0.04,C5/C3 0.40(第一次);C5 0.60μmol/L,C5/C2 0.04,C5/C3 0.30(第二次)(參考范圍C5 0~0.4μmol/L,C5/C2 0~0.04,C5/C3 0~0.4)。

      2.1.2 病例2 女,21 d,因新生兒疾病篩查C5升高就診,患者系G1P1,足月順產(chǎn),出生體質(zhì)量2.8 kg,無窒息、搶救病史,患者生后精神奶量可,大小便正常。父母體健,非近親結(jié)婚,否認(rèn)家族遺傳病史。查體:體質(zhì)量3.2 kg,身長51 cm,頭圍36 cm。前囟1.8 cm×1.5 cm,平軟,神清,皮膚彈性可;心肺腹無異常;四肢肌力、肌張力正常,神經(jīng)系統(tǒng)檢查無異常。輔助檢查:血常規(guī)、肝腎功能、心肌酶譜、電解質(zhì)、血糖、血氨、血乳酸未見異常。串聯(lián)結(jié)果:C5 7.94μmol/L,C5/C2 0.19,C5/C3 1.82(第一次);C5 8.81μmol/L,C5/C2 0.91,C5/C3 5.99(第二次)。

      2.1.3 病例3 女,44 d,因新生兒疾病篩查C5升高就診,患者系G1P1,足月順產(chǎn),出生體質(zhì)量3.1 kg,無窒息、搶救病史,患者生后精神奶量可,大小便正常。父母體健,非近親結(jié)婚,否認(rèn)家族遺傳病史。查體:體質(zhì)量4.0 kg,身長51.6 cm,頭圍38 cm。前囟1.8 cm×1.4 cm,平軟,神清,皮膚彈性可;心肺腹無異常;四肢肌力、肌張力正常,神經(jīng)系統(tǒng)檢查無異常。輔助檢查:血常規(guī)、肝腎功能、心肌酶譜、電解質(zhì)、血糖、血氨、血乳酸未見異常。串聯(lián)結(jié)果:C5 1.37μmol/L,C5/C2 0.14,C5/C3 0.93(第一次);C5 1.54μmol/L,C5/C2 0.04,C5/C3 0.35(第二次)。

      2.2 基因檢測結(jié)果 病例1,ACADSB基因外顯子5,c.655G>A(p.V219M)(純合變異),分別來自父母;病例2,ACADSB基因外顯子10,c.1165 A>G(p.M389V)(純合變異),分別來自父母;病例3,ACADSB基因外顯子5,c.655G>A(p.V219M)(雜合變異),來自母親,外顯子10,c.1165 A>G(p.M389V)(雜合變異),來自父親,如圖1。通過Phyre2功能軟件可知655位纈氨酸及1165位蛋氨酸位于相對保守區(qū)域,如圖2。c.655G>A(p.V219M)及c.1165A>G(p.M389V)位點突變沒有導(dǎo)致氨基酸之間的氫鍵改變,如圖3。

      圖1 ACADSB基因變異測序圖(箭頭所指為變異位點)

      圖2 ACADSB基因變異圖

      圖3 變異位點氫鍵連接

      3 討論

      異亮氨酸作為支鏈氨基酸(branched-chain amino acids,BCAAs)之一,在生長、免疫、蛋白質(zhì)代謝、脂肪酸代謝、葡萄糖轉(zhuǎn)運等全身生理功能中起著至關(guān)重要的作用[3]。研究發(fā)現(xiàn),異亮氨酸可以誘導(dǎo)宿主防御肽(β-防御素)的表達(dá),從而調(diào)節(jié)宿主的先天免疫和適應(yīng)性免疫,進(jìn)而改善免疫系統(tǒng),包括免疫器官、細(xì)胞和活性物質(zhì)。此外,異亮氨酸可通過增加抗菌素的表達(dá),恢復(fù)某些病原體對人和動物健康的影響[4]。異亮氨酸代謝異??芍露喾N代謝性疾病[5],2-MBAD就是其中之一,如圖4所示。2-MBAD是由ACADSB基因變異所致,發(fā)病率極低,目前全球發(fā)病率不詳,但在東南亞苗族和苗族后裔中較為常見,該區(qū)域發(fā)病率高達(dá)1/250~1/500,有文獻(xiàn)報道,我國泉州市發(fā)病率為1/30 379[1]。ACADSB基因(NG_008003.1)位于10號染色體(10q26.13),共11個外顯子,編碼432個氨基酸的2-甲基丁酰輔酶A脫氫酶,該酶在異亮氨酸(Isoleucine)代謝途徑中發(fā)揮重要作用,該基因缺陷導(dǎo)致2-甲基丁酰肉堿、2-甲基丁酰甘氨酸等代謝物異常蓄積[6]。

      圖4 異亮氨酸代謝

      研究發(fā)現(xiàn),苗族華人大部分2-MBAD病例無臨床癥狀,可能與其他短支鏈酰基輔酶A活性重疊,避免異亮氨酸有害代謝物的積累[7],但在感染和應(yīng)激情況下可能發(fā)生新生兒危象,嚴(yán)重者發(fā)生發(fā)育遲緩、智力障礙、癲癇、肌肉萎縮、肌張力減退、自閉癥等[8]。

      ACADSB基因c.655G>A(p.V219M)的變異不屬于多態(tài)性變化,發(fā)生頻率極低,目前尚無報道。該位點變異219位纈氨酸與235位苯丙氨酸之間的氫鍵沒有發(fā)生改變,但與220位的蛋氨酸形成二肽改變。有研究發(fā)現(xiàn),纈氨酸-蛋氨酸經(jīng)歷電子吸收,產(chǎn)生帶有SO鍵的陽離子,該陽離子可以在纈氨酸-蛋氨酸中性子上去質(zhì)子化,產(chǎn)生的中性自由基。但蛋氨酸-蛋氨酸二肽不能產(chǎn)生中性自由基,因此導(dǎo)致2-甲基丁酰輔酶A脫氫酶活性減低[9]。

      c.1165A>G(p.M389V)為熱點變異位點,位于親水口袋中[10],在美國威斯康星州該位點純合變異占所有變異位點中的1.3%,雜合子變異占21.8%[11];而在中國泉州該位點變異率占所有變異位點中的33.3%[1]。該位點由蛋氨酸變異為纈氨酸,氨基酸之間的氫鍵沒有改變,但分子遺傳學(xué)分析發(fā)現(xiàn)該位點使ACADSB基因在轉(zhuǎn)錄過程中外顯子10跳躍,導(dǎo)致2-甲基丁酰輔酶A脫氫酶活性減低[7]。

      2-MBAD的治療資料少且無統(tǒng)一的治療共識,目前治療措施以改善臨床癥狀、低蛋白飲食及補充肉堿為主,避免禁食。

      綜上所述,本文3例患者在新生兒疾病篩查時發(fā)現(xiàn)串聯(lián)質(zhì)譜異常,基因檢測診斷2-MBAD,予以低蛋白飲食及補充肉堿,目前尚未發(fā)生發(fā)育遲緩、智力障礙、癲癇、肌肉萎縮、肌張力減退等,但后期是否發(fā)生,需長時間追蹤隨訪。c.655G>A(p.V219M)目前暫無報道,新變異的檢出豐富了基因變異譜,為家系的遺傳咨詢提供了依據(jù)。

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