楊青青 趙永強(qiáng) 劉燦玉 葛潔 陸信娟 張碧薇 楊峰 樊繼德
摘要:為了解大蒜PEX7基因及其編碼的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)特性,分析該基因?qū)Σ煌巧锩{迫的響應(yīng)情況,從大蒜品種徐紫1號(hào)的葉片RNA中克隆獲得AsPEX7基因。序列分析結(jié)果表明,AsPEX7基因含有1個(gè)長(zhǎng)度為951 bp的開放閱讀框(ORF),編碼316個(gè)氨基酸,其相對(duì)分子質(zhì)量為35.57 ku,理論等電點(diǎn)為5.55,為親水性蛋白。氨基酸組成中脂肪族氨基酸的比例最高,其次為堿性氨基酸,酸性氨基酸和芳香族氨基酸最低。AsPEX7蛋白含有25個(gè)磷酸化位點(diǎn),無(wú)信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu),二級(jí)結(jié)構(gòu)由α-螺旋、延伸主鏈和隨機(jī)卷曲組成,比例分別為5.06%、40.19%和4715%。實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-qPCR)結(jié)果顯示,在高溫(38 ℃)、低溫(4 ℃)、干旱(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù)為20%的PEG 6000)和高鹽(200 mmol/L NaCl)4種非生物脅迫處理?xiàng)l件下,AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平總體升高,表明該基因可能在抵抗非生物脅迫中發(fā)揮重要作用。本研究結(jié)果為深入解析PEX7基因調(diào)控大蒜生長(zhǎng)發(fā)育及非生物脅迫的分子機(jī)制提供了理論參考基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:大蒜;AsPEX7基因;基因克隆;非生物脅迫;表達(dá)分析
中圖分類號(hào): S633.401? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A
文章編號(hào):1002-1302(2022)06-0024-08
收稿日期:2021-06-16
基金項(xiàng)目:江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院探索性顛覆性創(chuàng)新計(jì)劃[編號(hào):XZ(21)1229];國(guó)家特色蔬菜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目(編號(hào):CARS-24-A-07);江蘇現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(編號(hào):JATS[2020]043)。
作者簡(jiǎn)介:楊青青(1994—),女,河南洛陽(yáng)人,碩士,研究實(shí)習(xí)員,主要從事大蒜分子生物學(xué)研究。E-mail:2521918664@qq.com。
通信作者:樊繼德,碩士,副研究員,主要從事大蒜育種與栽培研究。E-mail:fanjide@163.com。
大蒜(Allium sativum L.)屬于百合科蔥屬,喜好冷涼,是多年生宿根作物,其鱗莖、葉片均可作為食用蔬菜,在世界各地普遍種植[1]。在大蒜引種和栽培過程中,非生物脅迫是影響其生長(zhǎng)發(fā)育以及降低其產(chǎn)量和品質(zhì)的不利環(huán)境因子[2-3]。過氧化物酶體是在真核細(xì)胞中普遍存在且具有多種功能的單核細(xì)胞器,在保護(hù)植物細(xì)胞和增強(qiáng)植物對(duì)高鹽耐受性方面起著重要作用[4-5]。過氧化物酶體合成相關(guān)蛋白(peroxisome generate protein)是參與過氧化物酶體生物發(fā)生的一類蛋白質(zhì),這類蛋白總稱為Peroxin,其編碼基因?yàn)镻EX[6]。PEX基因是參與過氧化物酶體形成與增殖的基因,同時(shí)也是調(diào)控過氧化物酶體代謝活動(dòng)的重要基因[7]。近年來(lái),越來(lái)越多的研究證明,PEX基因也可以調(diào)節(jié)植物對(duì)非生物脅迫的反應(yīng)[8]。
過氧化物酶體蛋白根據(jù)蛋白的分布不同,可以分為合成蛋白、基質(zhì)蛋白、膜蛋白[9]。在生物體內(nèi),過氧化物酶體合成相關(guān)蛋白主要參與過氧化物酶體增殖、分化和蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)等過程,已在擬南芥(Arabidopsis thaliana)中鑒定出的PEX蛋白超過30多種[10]。過氧化物酶體的生物發(fā)生是由過氧化物酶介導(dǎo)[11]。植物過氧化物酶體含有多種酶,如過氧化氫酶、過氧化物酶和氧化酶[12]。過氧化物酶體也是乙醛酸循環(huán)、脂肪酸的β氧化分解、活性氧的調(diào)節(jié)和次級(jí)代謝產(chǎn)物合成的重要部位[13]。以往的研究證明,過氧化物酶體缺乏本身的基因組,因此過氧化物酶體所有的組成蛋白都被編碼在核基因組中,并在導(dǎo)入到過氧化物酶體之前被翻譯到胞質(zhì)核糖體上[14]。蛋白質(zhì)從細(xì)胞質(zhì)到過氧化物酶體的轉(zhuǎn)運(yùn)依賴于過氧化物酶體輸入受體蛋白,肽鏈上的定位信號(hào)(peroxisome targeting singal,簡(jiǎn)稱PTS)負(fù)責(zé)基質(zhì)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)[15]。目前,2種類型的過氧化物酶體靶向信號(hào)PTS1和PTS2已在過氧化物酶體基質(zhì)酶中鑒定[16]。PEX7是PTS2的受體,由PEX7基因編碼[17]。雖然PEX7在蛋白質(zhì)的運(yùn)輸過程中起著重要的作用,但其調(diào)節(jié)功能的機(jī)制尚不清楚。
在煙草中,轉(zhuǎn)基因植株在遭受H2O2脅迫后,過表達(dá)臘梅CpPEX22基因,植株內(nèi)CAT、POD、SOD的活性和MDA含量都顯著增加[18]。轉(zhuǎn)入細(xì)葉百合LpPEX7基因的擬南芥,其種子在鹽脅迫下發(fā)芽率明顯高于野生型擬南芥[19]。同樣,在擬南芥中,過表達(dá)胡楊PePEX11基因,植株抗氧化能力和耐鹽性增強(qiáng)[20]。在添加氯化鈉或者甘露醇的MS培養(yǎng)基上培養(yǎng)PEX5突變體轉(zhuǎn)基因擬南芥和野生型擬南芥,發(fā)現(xiàn)PEX5突變體幼苗的SOD和POD活性顯著低于野生型,表明PEX5參與調(diào)控?cái)M南芥的抗逆性[21]。大蒜是耐寒性作物,在冷涼的環(huán)境下生長(zhǎng)良好,高溫會(huì)造成大蒜的產(chǎn)量和品質(zhì)下降。目前的研究已經(jīng)證實(shí)PEX7蛋白是合成過氧化物酶體的關(guān)鍵蛋白,但PEX7基因是否參與大蒜對(duì)非生物脅迫響應(yīng)的過程還未有報(bào)道,因此研究大蒜AsPEX7基因與逆境脅迫之間是否有一定的應(yīng)答關(guān)系是本研究要解決的問題。本研究從大蒜品種中克隆得到AsPEX7基因,對(duì)該基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,利用RT-qPCR檢測(cè)AsPEX7基因在高溫、低溫、干旱及高鹽4種非生物脅迫下的相對(duì)表達(dá)水平,為進(jìn)一步研究AsPEX7基因在大蒜抗逆境方面的代謝途徑提供理論基礎(chǔ),并為深入了解AsPEX7基因在大蒜抵抗非生物脅迫中的功能提供依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 材料及處理
大蒜品種徐紫1號(hào)由江蘇徐淮地區(qū)徐州農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所園藝研究室保存。試驗(yàn)材料蒜瓣播種于蛭石和有機(jī)質(zhì)配成的混合基質(zhì)中,17 d之后將大蒜幼苗轉(zhuǎn)移到水培箱,營(yíng)養(yǎng)液為Hoagland標(biāo)準(zhǔn)營(yíng)養(yǎng)液配方。緩苗7 d后對(duì)大蒜植株進(jìn)行高溫(38 ℃)、低溫(4 ℃)、干旱(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù)為20%的PEG 6000)和高鹽(200 mmol/L)4種非生物脅迫處理,處理時(shí)間分別為0、1、4、8、24、48 h,對(duì)照組用ddH2O處理,每個(gè)處理3次重復(fù)。取大蒜葉片用于 RNA的提取以及cDNA的合成。
1.2 大蒜AsPEX7基因的克隆
基于本課題組的大蒜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),通過與其他物種PEX7基因序列BLAST比對(duì)分析獲得大蒜AsPEX7基因的序列。根據(jù)開放閱讀框(ORF)序列設(shè)計(jì)克隆引物,AsPEX7基因正向引物AsPEX7-F:5′-ATCCCCAAATCCCAAGCCCTAAAAAATCAACAG-3′,反向引物AsPEX7-R:5′-AAAATATAAGCTTACCCAAGTGAGAAAA-3′。以徐紫1號(hào)的葉片為cDNA模版進(jìn)行PCR反應(yīng)。擴(kuò)增體系總體積 20 μL,包含cDNA模板1 μL、正向引物和反向引物各1 μL、ddH2O 7 μL以及Ex Taq酶10 μL。設(shè)置PCR反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s、54 ℃退火30 s、72 ℃延伸60 s,共34個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR反應(yīng)產(chǎn)物用質(zhì)量濃度12 g/L的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行分離檢測(cè),回收產(chǎn)物連接pMD19-T質(zhì)粒載體,并轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α中,挑取單菌落搖菌,經(jīng)PCR檢測(cè)后交由南京金斯瑞生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證。
1.3 序列分析
通過NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov)對(duì)獲得的目的基因片段的核苷酸和氨基酸序列進(jìn)行BLAST比較和保守域預(yù)測(cè);使用ExPASy蛋白質(zhì)組分析工具中的Prot-Param (http://www.expasy.ch/tools/protparam.html) 軟件對(duì)蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量、氨基酸構(gòu)成成分和理論等電點(diǎn)等進(jìn)行分析;采用DNAMAN軟件進(jìn)行ICE1序列的多重比對(duì)及蛋白質(zhì)的親水性/疏水性預(yù)測(cè);利用MEGA 5.2軟件構(gòu)建蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹[22];利用NCBI CDD數(shù)據(jù)庫(kù)大蒜AsPEX7氨基酸序列進(jìn)行保守域預(yù)測(cè);利用SignalP (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)軟件進(jìn)行信號(hào)肽分析預(yù)測(cè);利用SOPMA 軟件對(duì)大蒜AsPEX7蛋白進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)及分析;跨膜結(jié)構(gòu)域和信號(hào)肽預(yù)測(cè)分別采用TMHMM(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)[23]和SignalP 4.1(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)軟件進(jìn)行網(wǎng)上運(yùn)行分析[24]。
1.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
使用Real-Time PCR檢測(cè)系統(tǒng) (Bio-rad,CFX96,USA) 在96孔板中進(jìn)行實(shí)時(shí)定量PCR反應(yīng)。選用大蒜SNAD基因作為內(nèi)參基因,其正向引物BD-SAND-F:5′-GCGTCAACGAATGTTCCAATTACCA-3′,反向引物BD-SAND-R:5′-TCTCTTCAGTCTCAACTTCATCAGCAT-3′。用于AsPEX7基因表達(dá)分析的正向引物AsPEX7-qF:5′-ACTTCGGAATCCTCGGCAACGG-3′,反向引物AsPEX7-qR:5′-ATCGTAGATGGCGTCGGCTGTG-3′。內(nèi)參基因與目標(biāo)基因同時(shí)進(jìn)行擴(kuò)增,每個(gè)樣品分別設(shè)置3個(gè)生物學(xué)重復(fù)和3個(gè)技術(shù)重復(fù)。PCR反應(yīng)體系總體積20.0 μL,包含ddH2O 7.2 μL,SYBR Green Ⅰ mix 10.0 μL,cDNA 2.0 μL以及正向熒光定量引物和反向熒光定量引物各0.4 μL。RT-qPCR反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性30 s;95 ℃變性5 s,60 ℃退火延伸 20 s,共40個(gè)循環(huán);通過從65 ℃至95 ℃逐步擴(kuò)增加熱獲得熔解曲線。采用 2-ΔΔCT 法計(jì)算 AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)量,并使用SPSS 20. 0 和 EXCEL 2019 軟件進(jìn)行差異顯著性分析[25]。
2 結(jié)果與分析
2.1 AsPEX7基因的克隆與序列分析
以大蒜未經(jīng)脅迫處理葉片的cDNA為模版,使用特異性引物AsPEX7-F和AsPEX7-R擴(kuò)增得到1條長(zhǎng)度約 950 bp的目的片段 (圖1),片段大小與預(yù)期一致。將回收產(chǎn)物依次進(jìn)行連接、轉(zhuǎn)化及測(cè)序,獲得AsPEX7基因開放閱讀框 (ORF)的序列。測(cè)序及分析結(jié)果顯示,克隆得到的AsPEX7基因含有1個(gè)長(zhǎng)度為 951 bp的開放閱讀框,編碼 316個(gè)氨基酸(圖2)。
2.2 AsPEX7基因的氨基酸序列分析
2.2.1 保守域結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè) 利用Blast Conserved Domains Search分析大蒜品種徐紫1號(hào)AsPEX7基因氨基酸序列的保守域,結(jié)果顯示,AsPEX7基因的氨基酸序列在第59位至第 306 位氨基酸間含有1個(gè)WD40結(jié)構(gòu)域(圖3)。
2.2.2 同源性比對(duì)分析 將大蒜AsPEX7基因與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中鐵皮石斛(Dendrobium catenatum,登錄號(hào):XP_020705736.1)、蝴蝶蘭(Phalaenopsis equestris,登錄號(hào):XP_020576756.1)、銀白楊
(Populus alba,登錄號(hào):XP_034920855.1)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula,登錄號(hào):XP_013462562.1)、香莢蘭(Vanilla planifolia,登錄號(hào):KAG0484672.1 )、藜麥(Chenopodium quinoa,登錄號(hào):XP_021724594.1)和建蘭(Cymbidium ensifolium,登錄號(hào):QEX51205.1)7種植物PEX7基因編碼的氨基酸序列通過DNAMAN進(jìn)行序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明,AsPEX7基因的氨基酸序列與鐵皮石斛、蝴蝶蘭和銀白楊等植物PEX7基因的氨基酸序列一致性較高(圖4),表明PEX7具有較高的保守性。
2.2.3 氨基酸組成及理化性質(zhì)的分析 將AsPEX7蛋白與不同植物PEX蛋白進(jìn)行氨基酸組成成分及理化性質(zhì)分析。結(jié)果顯示,大蒜品種徐紫1號(hào)AsPEX7蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量為35.57 ku,理論等電點(diǎn)(pI)為5.55。 AsPEX7蛋白和10種植物PEX蛋白氨基酸數(shù)量在316~320之間,相對(duì)分子質(zhì)量在35 ku左右,堿性氨基酸的比例總體上高于酸性氨基酸的比例,脂肪族氨基酸的比例明顯高于芳香族氨基酸的比例(表1)。
2.2.4 親水性和疏水性的分析 采用DNAMAN軟件對(duì)大蒜品種徐紫1號(hào)AsPEX7基因的氨基酸序列進(jìn)行親水性/疏水性分析(圖5)。結(jié)果表明,在親水性區(qū)域,第77位丙氨酸(Ala)的親水性最強(qiáng),第75位纈氨酸(Val)較強(qiáng);在疏水性區(qū)域,第115位亮氨酸 (Leu)的疏水性最強(qiáng),第201位酪氨酸(Tyr)、第199位天冬酰胺(Asn)和第142位苯丙氨酸(Phe)的疏水性較強(qiáng)??傮w來(lái)看,AsPEX7基因的氨基酸序列中的大部分氨基酸為親水性氨基酸,推測(cè)AsPEX7蛋白屬于親水性蛋白(圖5)。
2.3 AsPEX7的預(yù)測(cè)分析
2.3.1 二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)分析 用SOPMA軟件對(duì)AsPEX7基因的蛋白質(zhì)進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),結(jié)果表明,該轉(zhuǎn)錄因子是由5.06%的α螺旋(alpha helix)、40.19%的延伸主鏈(extended chain)和47.15%的無(wú)規(guī)則卷曲(random coil)構(gòu)成(圖6)??傮w上看,AsPEX7蛋白主要的二級(jí)結(jié)構(gòu)是延伸主鏈和無(wú)規(guī)則卷曲。
2.3.2 跨膜結(jié)構(gòu)和信號(hào)肽的預(yù)測(cè) 大蒜AsPEX7蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果表明,AsPEX7基因的氨基酸可能不存在跨膜結(jié)構(gòu)(圖7)??缒そY(jié)構(gòu)分析的結(jié)果顯示,AsPEX7 蛋白序列不存在信號(hào)肽,表明可能不是膜結(jié)合蛋白(圖8)。研究表明,構(gòu)成蛋白質(zhì)跨膜結(jié)構(gòu)的氨基酸大部分為疏水性氨基酸,預(yù)測(cè)結(jié)果也表明AsPEX7蛋白屬于親水性蛋白。
2.3.3 磷酸化位點(diǎn)的預(yù)測(cè) 大蒜AsPEX7磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果表明,AsPEX7基因的氨基酸序列中共有25個(gè)磷酸化位點(diǎn),包括第25、28、67、82、99、119、122、124、139、152、154、156、167、243位共14個(gè)絲氨酸磷酸化位點(diǎn),第6、93、128、142、147、171、195、208、297位共9個(gè)蘇氨酸磷酸化位點(diǎn),第148位和第304位共2個(gè)酪氨酸磷酸化位點(diǎn)(圖9)。
2.4 非生物脅迫下AsPEX7基因的表達(dá)
為了分析AsPEX7基因在非生物脅迫下的表達(dá)特性,采用熒光定量PCR檢測(cè)該基因在高溫、干旱、低溫和高鹽下的表達(dá)情況,AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平見圖10。 結(jié)果表明,不同非生物脅迫處理下AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平存在差異。
高溫處理1、4、24、48 h時(shí),AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平與處理0 h相比顯著升高,分別為處理 0 h 的10.31倍、4.74倍、4.05倍、3.78倍,其中,高溫處理 1 h 時(shí)AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平最高。但在處理8 h 時(shí),AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平與處理0 h相比略有降低。
干旱處理1、4、8、24 h時(shí),與處理0 h相比AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平逐漸升高,并在處理24 h時(shí)達(dá)到峰值,分別為處理0 h的1.24倍、2.25倍、446倍、6.80倍;干旱處理48 h,AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平與處理0 h相比明顯降低。
低溫處理1、4、8 h時(shí),AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平與處理0 h相比顯著升高, 分別為處理0 h的3.59倍、5.05倍、8.93倍;低溫處理24 h AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平與處理0 h相比無(wú)明顯變化。
高鹽處理1、8、24 h 時(shí),AsPEX7基因的相對(duì)表
達(dá)水平與處理0 h相比有不同程度的升高,分別為處理0 h的1.98倍、4.46倍、1.07倍,其中,高鹽處理8 h 時(shí)AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平最高。高鹽處理4、48 h時(shí),AsPEX7基因的相對(duì)表達(dá)水平較處理0 h均略有降低。
3 討論與結(jié)論
非生物脅迫是造成陸生植物生長(zhǎng)發(fā)育不良和產(chǎn)量下降的主要因素[25-26]。在高溫下,植物細(xì)胞膜的通透性、抗氧化物系統(tǒng)、滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)、呼吸作用以及蒸騰作用均會(huì)發(fā)生改變,且高溫下植物通常會(huì)出現(xiàn)葉片變黃、壞死、花果脫落等熱害病癥[27-29]。高鹽脅迫會(huì)造成土壤中的鹽分升高,降低植物根系的吸水能力,造成植物體內(nèi)水分減少,進(jìn)而出現(xiàn)萎蔫和死亡的癥狀[30]。大蒜喜好冷涼的環(huán)境條件,其生長(zhǎng)適宜溫度為12~25 ℃,因此,非生物脅迫會(huì)嚴(yán)重影響大蒜的正常生長(zhǎng)發(fā)育、產(chǎn)量和品質(zhì)[31]。
本研究從大蒜品種徐紫1號(hào)葉片中克隆獲得AsPEX7基因,該基因的開放閱讀框編碼316個(gè)氨基酸,其氨基酸序列的第 59位至第 306位氨基酸間含有1個(gè)WD40保守域。研究表明,WD40結(jié)構(gòu)域介導(dǎo)蛋白質(zhì)之間的相互作用,形成復(fù)合體結(jié)構(gòu)從而調(diào)控下游的基因表達(dá)[32]。因此推測(cè),AsPEX7基因可能在非生物脅迫中通過調(diào)控下游基因的表達(dá)來(lái)提高大蒜的抗逆性。與其他植物PEX蛋白的氨基酸序列的多重比對(duì)結(jié)果表明,PEX蛋白在進(jìn)化上具有保守性。AsPEX7基因共有25個(gè)磷酸化位點(diǎn),這些磷酸化位點(diǎn)可能在維持蛋白質(zhì)空間穩(wěn)定性和調(diào)控植物生理生化反應(yīng)過程中發(fā)揮重要作用??缒そY(jié)構(gòu)和信號(hào)肽預(yù)測(cè)表明,AsPEX7蛋白是不含跨膜結(jié)構(gòu)和信號(hào)肽的親水性蛋白,據(jù)此推測(cè)AsPEX7蛋白可能是非分泌蛋白。
在真核生物細(xì)胞中,過氧化物酶體是一類在物質(zhì)代謝方面起著重要作用的單核細(xì)胞器[33]。植物遭受非生物脅迫時(shí),會(huì)產(chǎn)生過量的活性氧,造成氧化損傷,而過氧化物酶體能夠通過清除過量的活性氧來(lái)調(diào)節(jié)氧化還原平衡[34]。所有過氧化物酶體基質(zhì)蛋白都在核基因組中進(jìn)行編碼,由胞質(zhì)核糖體合成并在PEX蛋白的幫助下轉(zhuǎn)運(yùn)到過氧化物酶體中[35]?;|(zhì)蛋白靠自身序列所具有的過氧化物酶體定位信號(hào)(PTS)而被識(shí)別和轉(zhuǎn)運(yùn)到過氧化物酶體,PEX5蛋白和PEX7蛋白是分別識(shí)別不同的過氧化物酶體靶向信號(hào)PTS1和PTS2的受體[34-35]。因此,AsPEX7蛋白作為帶有PTS2信號(hào)基質(zhì)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,對(duì)過氧化物酶體的形成起著重要的作用,研究AsPEX7基因的表達(dá)特性,對(duì)研究大蒜的抗鹽堿和高溫具有重要的意義。本研究對(duì)大蒜進(jìn)行高溫(38 ℃)、低溫(4 ℃)、干旱(質(zhì)量體積分?jǐn)?shù)為20%的PEG 6000)和高鹽(0.2 mol/L NaCl)4種非生物脅迫處理,從 AsPEX7基因在脅迫處理后的大蒜葉片中的表達(dá)情況來(lái)看,AsPEX7基因分別在高溫處理的1 h和高鹽處理8 h的表達(dá)量達(dá)到峰值,并且在不同時(shí)間AsPEX7基因的表達(dá)量總體呈現(xiàn)上調(diào)趨勢(shì),說明大蒜在受到逆境脅迫時(shí),AsPEX7基因可以啟動(dòng)程序表達(dá)來(lái)應(yīng)對(duì)環(huán)境的改變。
目前,PEX基因在其他作物中大多處于基因克隆分析層面上。并且大蒜的分子遺傳研究較為緩慢,因此本試驗(yàn)通過在分子水平上對(duì)大蒜AsPEX7基因進(jìn)行研究,并分析該基因?qū)Σ煌巧锩{迫的響應(yīng),為了解AsPEX7基因在大蒜抗逆境脅迫中發(fā)揮的作用提供了參考。
參考文獻(xiàn):
[1]梅四衛(wèi),朱涵珍. 大蒜研究進(jìn)展[J]. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào),2009,25(8):154-158.
[2]楊獻(xiàn)光,梁衛(wèi)紅,齊志廣,等. 植物非生物脅迫應(yīng)答的分子機(jī)制[J]. 麥類作物學(xué)報(bào),2006,26(6):158-161.
[3]齊 琪,馬書榮,徐維東. 鹽脅迫對(duì)植物生長(zhǎng)的影響及耐鹽生理機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 分子植物育種,2020,18(8):2741-2746.
[4]高飛雁,李 玲,王教瑜,等. PEX基因在過氧化物酶體形成及真菌致病性中的作用[J]. 遺傳,2017,39(10):908-917.
[5]An C J,Gao Y F,Li J Y,et al. Alternative splicing affects the targeting sequence of peroxisome proteins in Arabidopsis[J]. Plant Cell Reports,2017,36(7):1027-1036.
[6]孫 艷,孫雪培,姜玲玲,等. 過氧化物酶體生物發(fā)生研究進(jìn)展[J]. 生物學(xué)雜志,2015,32(2):83-86.
[7]Hu J P,Aguirre M,Peto C,et al. A role for peroxisomes in photomorphogenesis and development of Arabidopsis[J]. Science,2002,297(5580):405-409.
[8]Islinger M,Voelkl A,F(xiàn)ahimi H D,et al. The peroxisome:an update on mysteries 2.0[J]. Histochemistry and Cell Biology,2018,150(5):443-471.
[9]Koch J,Pranjic K,Huber A,et al. PEX11 family members are membrane elongation factors that coordinate peroxisome proliferation and maintenance[J]. Journal of Cell Science,2010,123(Pt 19):3389-3400.
[10]田國(guó)忠,李懷方,裘維蕃. 植物過氧化物酶研究進(jìn)展[J]. 武漢植物學(xué)研究,2001,19(4):332-344.
[11]Cui S K,F(xiàn)ukao Y,Mano S,et al. Proteomic analysis reveals that the rab GTPase RabE1c is involved in the degradation of the peroxisomal protein receptor PEX7 (peroxin 7)[J]. Journal of Biological Chemistry,2013,288(8):6014-6023.
[12]Platta H W,Erdmann R. Peroxisomal dynamics[J]. Trends in Cell Biology,2007,17(10):474-484.
[13]Platta H W,Hagen S,Erdmann R.The exportomer:the peroxisomal receptor export machinery[J]. Cellular and Molecular Life Sciences:CMLS,2013,70(8):1393-1411.
[14]Rodrigues T A,Alencastre I S,F(xiàn)rancisco T,et al. A PEX7-centered perspective on the peroxisomal targeting signal type 2-mediated protein import pathway[J]. Molecular and Cellular Biology,2014,34(15):2917-2928.
[15]Francisco T,Rodrigues T A,F(xiàn)reitas M O,et al. A cargo-centered perspective on the PEX5 receptor-mediated peroxisomal protein import pathway[J]. Journal of Biological Chemistry,2013,288(40):29151-29159.
[16]Kiel J A K W,van der Klei I J.Proteins involved in microbody biogenesis and degradation in Aspergillus nidulans[J]. Fungal Genetics and Biology,2009,46(1):S62-S71.
[17]Singh T,Hayashi M,Mano S,et al. Molecular components required for the targeting of PEX7 to peroxisomes in Arabidopsis thaliana[J]. Plant Journal,2009,60(3):488-498.
[18]趙亞虹. 蠟梅過氧化物酶體生成蛋白基因CpPEX22的克隆及功能初步分析[D]. 重慶:西南大學(xué),2013.
[19]何 好,朱國(guó)慶,陳詩(shī)雅,等. 細(xì)葉百合LpPEX7基因克隆及鹽脅迫下的表達(dá)特性分析[J]. 植物研究,2020,40(2):274-283.
[20]姚 琨,練從龍,王菁菁,等. 胡楊PePEX11基因參與調(diào)節(jié)鹽脅迫下擬南芥的抗氧化能力[J]. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2018,40(5):19-28.
[21]詹 爽,梁綺雯,羅為桂,等. PEX5參與調(diào)控?cái)M南芥根系抗逆性的初步研究[J]. 激光生物學(xué)報(bào),2019,28(4):336-342.
[22]Tamura K,Peterson D,Peterson N,et al. MEGA5:molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood,evolutionary distance,and maximum parsimony methods[J]. Molecular Biology and Evolution,2011,28(10):2731-2739.
[23]Ikeda M,Arai M,Lao D M,et al. Transmembrane topology prediction methods:a re-assessment and improvement by a consensus method using a dataset of experimentally-characterized transmembrane topologies[J]. In Silico Biology,2002,2(1):19-33.
[24] Dyrlv Bendtsen J,Nielsen H,von Heijne G,et al. Improved prediction of signal peptides:SignalP 3.0[J]. Journal of Molecular Biology,2004,340(4):783-795.
[25]江海燕,杜菊花,毛 戀,等. 植物響應(yīng)高溫脅迫轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 分子植物育種,2020,18(10):3251-3258.
[26]Gao Y,Jiang W,Dai Y,et al. A maize phytochrome-interacting factor 3 improves drought and salt stress tolerance in rice[J]. Plant Molecular Biology,2015,87(4/5):413-428.
[27]徐 海,宋 波,顧宗福,等. 植物耐熱機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2020,36(1):243-250.
[28]李 麗,劉雙清,楊遠(yuǎn)航,等. 熱激轉(zhuǎn)錄因子在植物抗非生物脅迫中的功能研究進(jìn)展[J]. 生物技術(shù)進(jìn)展,2018,8(3):214-220.
[29]宋有金,吳 超. 高溫影響水稻穎花育性的生理機(jī)制綜述[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2020,48(16):41-48.
[30]Parihar P,Singh S,Singh R,et al. Effect of salinity stress on plants and its tolerance strategies:a review[J]. Environmental Science and Pollution Research International,2015,22(6):4056-4075.
[31]侯進(jìn)慧,劉春雷. 我國(guó)大蒜資源深加工與產(chǎn)業(yè)化研究進(jìn)展[J]. 生物資源,2020,42(1):36-42.
[32]嚴(yán) 莉,陳建偉,王翠平,等. 基于轉(zhuǎn)錄組信息的黑果枸杞WD40蛋白質(zhì)家族分析[J]. 核農(nóng)學(xué)報(bào),2019,33(3):482-489.
[33]Hu J P. Plant peroxisomes:small organelles with versatility and complexity[J]. Journal of Integrative Plant Biology,2019,61(7):782-783.
[34]Mittler R,Vanderauwera S,Gollery M,et al. Reactive oxygen gene network of plants[J]. Trends in Plant Science,2004,9(10):490-498.
[35]Kunze M,Malkani N,Maurer-Stroh S,et al. Mechanistic insights into PTS2-mediated peroxisomal protein import[J]. Journal of Biological Chemistry,2015,290(8):4928-4940.