轉(zhuǎn)座子
- 谷子、水稻與其野生種基因組轉(zhuǎn)座子比較
030801)轉(zhuǎn)座子(Transposable elements,TEs)最早由Barbara McClintock在玉米(Zeamays)中發(fā)現(xiàn),在細(xì)菌、病毒以及真核生物的基因組中廣泛分布[1-2]。轉(zhuǎn)座子類(lèi)似內(nèi)源性病毒,能夠在宿主基因組中“復(fù)制粘貼”、“剪切粘貼”自己的序列,以達(dá)到自我“繁殖”的目的[3-6]。按其復(fù)制方式可分為逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(Class I retrotransposons)和非逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(Class II DNA transposo
- 小麥幼苗活性LTR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子篩選及其對(duì)非生物脅迫的響應(yīng)
性LTR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子篩選及其對(duì)非生物脅迫的響應(yīng)周賓寒1楊 竹1王書(shū)平1方正武1胡贊民2徐兆師3張迎新1,*1長(zhǎng)江大學(xué)農(nóng)學(xué)院 / 主要糧食作物產(chǎn)業(yè)化湖北省協(xié)同創(chuàng)新中心, 湖北荊州 434025;2中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所, 北京 100101;3中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所 / 農(nóng)作物基因資源與基因改良國(guó)家重大科學(xué)工程 / 農(nóng)業(yè)部麥類(lèi)生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 北京 100081LTR (長(zhǎng)末端重復(fù), long terminal repeat)反轉(zhuǎn)
作物學(xué)報(bào) 2023年4期2023-02-27
- 紅毛丹基因組中MITEs轉(zhuǎn)座子的鑒定與演化分析
61801）轉(zhuǎn)座子（transposon）是動(dòng)植物基因組的重要組成成分[1]，是基因組演化過(guò)程中不可忽視的一部分[2]，它們可以通過(guò)復(fù)制或移位從基因組的一個(gè)位點(diǎn)轉(zhuǎn)移至另一個(gè)位點(diǎn)[3]，從而造成基因組重排，并對(duì)基因組大小、染色體結(jié)構(gòu)和附近基因的表達(dá)水平等有著不同程度的影響[4]。轉(zhuǎn)座子的含量和種類(lèi)在不同的生物基因組中存在較大的差異，根據(jù)其轉(zhuǎn)座的不同機(jī)制，大致可分為ClassⅠ和ClassⅡ兩大類(lèi)[5]。ClassⅠ型轉(zhuǎn)座子以RNA為中間媒介進(jìn)行轉(zhuǎn)座，可以自
- 云南原始地方種四路糯基因組中的MITE類(lèi)轉(zhuǎn)座子“124”
是玉米基因組中轉(zhuǎn)座子活動(dòng)造成的突變。其中-124是由MITE類(lèi)轉(zhuǎn)座子“124”插入基因的第六外顯子造成的突變。轉(zhuǎn)座子插入是造成基因突變的主要原因之一。轉(zhuǎn)座子是基因組中一段可移動(dòng)的DNA序列，可以通過(guò)切割、重新整合等一系列過(guò)程從基因組的一個(gè)位置“跳躍”到另一個(gè)位置。根據(jù)轉(zhuǎn)座子在基因組內(nèi)跳躍媒介的不同，可以將轉(zhuǎn)座子分為DNA轉(zhuǎn)座子和RNA轉(zhuǎn)座子，RNA轉(zhuǎn)座子又叫反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。RNA轉(zhuǎn)座子通過(guò)“復(fù)制—粘貼”的方式轉(zhuǎn)座，DNA轉(zhuǎn)座子通過(guò)“剪切—粘貼”的方式轉(zhuǎn)座。微
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年13期2022-07-18
- 牛亞科物種轉(zhuǎn)座子與串聯(lián)重復(fù)序列之間的進(jìn)化關(guān)系
高雪牛亞科物種轉(zhuǎn)座子與串聯(lián)重復(fù)序列之間的進(jìn)化關(guān)系張瑞，張?zhí)炝?，范婷婷，朱波，張路培，徐凌洋，高?huì)江，李俊雅，陳燕，高雪中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所，北京 100193【】重復(fù)序列是真核生物基因組中重要組成部分，對(duì)物種進(jìn)化、基因遺傳變異、轉(zhuǎn)錄調(diào)控等具有重要作用。研究旨在揭示牛亞科物種重復(fù)序列特征，研究轉(zhuǎn)座子和串聯(lián)重復(fù)序列間的進(jìn)化關(guān)系，為牛亞科物種重復(fù)序列的研究提供理論支撐。以普通牛、瘤牛、牦牛、水牛、野牛以及大額牛6個(gè)牛亞科物種的基因組序列為研究對(duì)象，利
中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年9期2022-05-17
- 轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)MYB在果樹(shù)花青素合成中的調(diào)控作用*
]，本文重點(diǎn)就轉(zhuǎn)座子調(diào)控重要果樹(shù)果實(shí)著色的相關(guān)分子機(jī)制進(jìn)展進(jìn)行綜述，以期為研究果樹(shù)花青素代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和改善果實(shí)品質(zhì)育種提供新的理論指導(dǎo)。1 花青素的生理功能花青素屬于水溶性黃酮類(lèi)色素，通常都以糖苷形式存在液泡中，不同水果成熟時(shí)花青苷含量和種類(lèi)不一樣，諸如影響蘋(píng)果和梨果皮的色苷主要為矢車(chē)菊素-3-O-半乳糖苷[4-6]，血橙和紅肉桃主要為矢車(chē)菊素-3-葡萄糖苷[7-8]，葡萄主要為二甲花翠素-3-葡萄糖苷與二甲花翠素-3-乙酰葡萄糖苷[9]，藍(lán)莓主要為錦花葵
中國(guó)果樹(shù) 2022年2期2022-04-20
- Tc1/Mariner轉(zhuǎn)座子超家族在褶皺臂尾輪蟲(chóng)中的進(jìn)化和表達(dá)分析?
572000)轉(zhuǎn)座子(Transposons)，又被稱(chēng)為轉(zhuǎn)座元件(Transposable elements, TEs)，是一段能通過(guò)非同源重組在宿主基因組內(nèi)或基因組間進(jìn)行移動(dòng)的散在分布的重復(fù)序列[1]。真核生物的轉(zhuǎn)座子按轉(zhuǎn)座機(jī)制可分為兩大類(lèi)：Ⅰ類(lèi)元件即逆轉(zhuǎn)錄元件，是通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄酶使用“復(fù)制-粘貼”的機(jī)制進(jìn)行轉(zhuǎn)座的RNA轉(zhuǎn)座子；Ⅱ類(lèi)元件DNA轉(zhuǎn)座子，則是使用基于DNA的“剪切-粘貼”轉(zhuǎn)座模式直接將轉(zhuǎn)錄子從原始位點(diǎn)整合至目標(biāo)位點(diǎn)的轉(zhuǎn)座子，其中最大的亞綱是兩端有
- 毛竹Mariner-like element自主轉(zhuǎn)座子的鑒定與生物信息學(xué)分析*
311300)轉(zhuǎn)座子廣泛分布在生物基因組內(nèi)，是生物基因組成的重要部分，在有些植物中轉(zhuǎn)座子含量可以高達(dá)80%以上(Sergeevaetal.，2011)，如在小麥(Triticumaestivum)基因中轉(zhuǎn)座子含量為88%(Chouletetal.，2010)，在玉米(Zeamays)基因中轉(zhuǎn)座子含量為84%(Schnableetal.，2009)。轉(zhuǎn)座子在基因組內(nèi)的活動(dòng)可以對(duì)生物基因組產(chǎn)生巨大的影響，主要表現(xiàn)為：轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)座活動(dòng)造成基因插入突變，同時(shí)，轉(zhuǎn)座
林業(yè)科學(xué) 2022年1期2022-03-23
- blaKPC耐藥基因在肺炎克雷伯菌中的傳播機(jī)制研究
的廣泛流行。2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的blaKPC耐藥基因傳播機(jī)制轉(zhuǎn)座子(Tn)是指能將自身基因插入基因組中任何一個(gè)序列的一組DNA序列，它可以在基因組上進(jìn)行自由移動(dòng)[15]。轉(zhuǎn)座子可以介導(dǎo)β-內(nèi)酰胺酶基因，通過(guò)水解β-內(nèi)酰胺類(lèi)抗生素，從而導(dǎo)致blaKPC耐藥基因的水平傳播[16]。據(jù)流行病學(xué)調(diào)查報(bào)告表明，轉(zhuǎn)座子Tn4401是歐美地區(qū)最常見(jiàn)的攜帶blaKPC的基因元件[17]。Tn4401轉(zhuǎn)座子全長(zhǎng)10 kb左右，其結(jié)構(gòu)組成包括blaKPC-2基因、轉(zhuǎn)座酶基因(tnp
海南醫(yī)學(xué) 2021年21期2021-12-07
- 重復(fù)序列對(duì)植物基因組大小進(jìn)化的影響
是LTR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的插入與刪除是造成基因組大小巨大差異的主要因素。種內(nèi)和種間基因組大小之間的差異都與重復(fù)序列的差異表現(xiàn)出了明顯相關(guān)性。該項(xiàng)研究將詳細(xì)地討論重復(fù)序列對(duì)基因組大小進(jìn)化的影響。2植物基因組中重復(fù)序列的分類(lèi)重復(fù)序列是指在基因組中不同位置重復(fù)數(shù)百次或數(shù)千次的DNA序列基序[16]，重復(fù)序列主要分為兩大類(lèi)：一類(lèi)是串聯(lián)重復(fù)序列，主要包括一些較短的重復(fù)，如衛(wèi)星DNA；另一類(lèi)是散在重復(fù)序列，主要指的是轉(zhuǎn)座元件，包括DNA轉(zhuǎn)座子和RNA轉(zhuǎn)座子[17]，具體分
- piggyBac轉(zhuǎn)座子AgoPLE1.1在黑腹果蠅種系轉(zhuǎn)化中的應(yīng)用
要作用的DNA轉(zhuǎn)座子有果蠅Drosophila的P因子、Tc1/Mariner家族的Minos、hAT家族的Hermes、Mariner家族的Mos1和piggyBac轉(zhuǎn)座子(PB)家族的IFP2。研究表明，果蠅P因子在天然宿主以外的生物中沒(méi)有活性(O′Brochta and Atkinson,1996)；Tc1/Mariner家族轉(zhuǎn)座子不僅轉(zhuǎn)座頻率較低(Drabeketal., 2003)，并且其攜帶外源基因的能力有限(Dingetal., 2005)；
昆蟲(chóng)學(xué)報(bào) 2021年6期2021-07-20
- 毛竹長(zhǎng)末端重復(fù)序列反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的全基因組特征及進(jìn)化分析
311300）轉(zhuǎn)座子(transposable elements, TEs)是一種自私的基因組“寄生蟲(chóng)”，能夠增加拷貝數(shù)并改變其在宿主基因組中的位置[1]。轉(zhuǎn)座子由于具有突變的可能，會(huì)對(duì)鄰近基因表達(dá)產(chǎn)生潛在的危害，并導(dǎo)致染色體重排，對(duì)基因組的穩(wěn)定性構(gòu)成威脅[2?4]。轉(zhuǎn)座子根據(jù)其轉(zhuǎn)座中間產(chǎn)物被分為2類(lèi)，其中Ⅰ類(lèi)轉(zhuǎn)座子包括復(fù)制黏貼式反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(retrotransposons, REs)[5]，Ⅱ類(lèi)轉(zhuǎn)座子包括剪切黏貼式轉(zhuǎn)座子[6]。Ⅰ類(lèi)轉(zhuǎn)座子根據(jù)其內(nèi)部的結(jié)
浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào) 2021年3期2021-07-12
- 轉(zhuǎn)座子沉默與DNA甲基化
311300）轉(zhuǎn)座子(transposable elements，TEs)被定義為能夠在生物體基因組中移動(dòng)的DNA序列，能在同一染色體的不同位點(diǎn)或者不同染色體之間轉(zhuǎn)移[1]。由于起源和進(jìn)化路徑的差異，TEs包含不同的家族。FINNEGAN[2]首次根據(jù)TEs的轉(zhuǎn)座中間體和轉(zhuǎn)座機(jī)制將轉(zhuǎn)座子分為Ⅰ類(lèi)RNA轉(zhuǎn)座子(retrotransposons)和Ⅱ類(lèi)DNA轉(zhuǎn)座子(DNA transposons)。Ⅰ類(lèi)通過(guò)RNA介導(dǎo)的復(fù)制-粘貼過(guò)程迅速增殖，RNA轉(zhuǎn)座子進(jìn)一步
浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào) 2021年3期2021-07-12
- 地熊蜂基因組中具有潛在活性的轉(zhuǎn)座子鑒定
100093）轉(zhuǎn)座子（TEs）是能夠從基因組一個(gè)位點(diǎn)轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位點(diǎn)，在此過(guò)程中通常會(huì)發(fā)生自我復(fù)制的DNA 片段[1]。轉(zhuǎn)座子可分為逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子和DNA 轉(zhuǎn)座子兩大類(lèi)。逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子借助轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄后產(chǎn)生的mRNA 而完成轉(zhuǎn)座過(guò)程，轉(zhuǎn)座后逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的拷貝數(shù)增加；而DNA 轉(zhuǎn)座子是借助自身的DNA 序列發(fā)生轉(zhuǎn)座，可以是復(fù)制或非復(fù)制型的轉(zhuǎn)座[2,3]。在幾乎所有生物的基因組中都發(fā)現(xiàn)了轉(zhuǎn)座子，通常數(shù)量很多。例如在脊椎動(dòng)物基因組中，轉(zhuǎn)座子含量的變化范圍從綠河豚的6%
中國(guó)蜂業(yè) 2021年5期2021-05-22
- 高溫導(dǎo)致男性不育的研究進(jìn)展
雙鏈結(jié)構(gòu)受損和轉(zhuǎn)座子的激活。（一）睪丸溫度升高對(duì)氧化應(yīng)激加速的影響氧化應(yīng)激是由于體內(nèi)產(chǎn)生自由基導(dǎo)致的，身體細(xì)胞氧化和抗氧化失衡且傾向于氧化的一種狀態(tài)。短時(shí)間的睪丸溫度升高即可引起精母細(xì)胞的氧化應(yīng)激反應(yīng)加速。一方面，氧化應(yīng)激反應(yīng)可導(dǎo)致精子磷脂和脂肪酸快速氧化分解，影響精子活性[9]。研究表明精子膜脂質(zhì)過(guò)氧化會(huì)導(dǎo)致高粘度精液發(fā)生，而高粘度精液是精子功能不足，導(dǎo)致MI的因素之一[10]。另一方面，氧化應(yīng)激加速也可能會(huì)導(dǎo)致精子的DNA、RNA以及端粒受到損害，導(dǎo)致
中國(guó)男科學(xué)雜志 2021年5期2021-01-03
- 張麗課題組揭示心里美蘿卜花青苷合成的新機(jī)制
CACTA類(lèi)型轉(zhuǎn)座子插入。通過(guò)調(diào)查CACTA轉(zhuǎn)座子在111份蘿卜種質(zhì)中的分布，揭示了該CACTA轉(zhuǎn)座子對(duì)于心里美蘿卜紅肉形成必不可少。甲基化分析表明：CACTA轉(zhuǎn)座子在紅肉和白肉材料中均有較高的甲基化水平，但RsMYB1基因啟動(dòng)子的甲基化水平白肉材料明顯高于紅肉材料。愈傷組織過(guò)表達(dá)和VIGS互補(bǔ)試驗(yàn)驗(yàn)證了RsMYB1基因的功能，去甲基化試劑5-azaC處理白肉突變體能夠部分恢復(fù)花青苷的積累。綜上，研究人員認(rèn)為RsMYB1啟動(dòng)子區(qū)域的CACTA轉(zhuǎn)座子插入在心
蔬菜 2020年4期2020-12-14
- 櫛孔扇貝LTR逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的基因組分布特征及時(shí)空表達(dá)模式分析*
266237)轉(zhuǎn)座子又被稱(chēng)為跳躍因子(Mobile genetic elements)，最早是由Mc Clintock在玉米中發(fā)現(xiàn)[1]的。近幾十年的研究表明，轉(zhuǎn)座子存在于所有真核生物的基因組中，并對(duì)基因組的進(jìn)化起著重要的作用[2]。根據(jù)轉(zhuǎn)座方式的不同，轉(zhuǎn)座子主要被分為兩大類(lèi)，第一類(lèi)是過(guò)“剪切-黏貼”的方式進(jìn)行移動(dòng)的DNA類(lèi)型的轉(zhuǎn)座子，這種轉(zhuǎn)座的方式并不會(huì)影響基因組的大小；第二大類(lèi)是通過(guò)“復(fù)制-黏貼”的方式，以RNA為中介插入基因組的其它位置，這類(lèi)轉(zhuǎn)座子又
- 綠豆Copia類(lèi)反轉(zhuǎn)座子全基因組注釋及進(jìn)化分析
nts)，又叫轉(zhuǎn)座子，是基因組中可以移動(dòng)的DNA片段。根據(jù)轉(zhuǎn)座方式的不同，植物中的轉(zhuǎn)座子一般可分為2種類(lèi)型，即以RNA為媒介的反轉(zhuǎn)座子和以DNA為媒介的DNA轉(zhuǎn)座子。根據(jù)結(jié)構(gòu)的不同，反轉(zhuǎn)座子又可以分為L(zhǎng)TR(Long terminal repeat)類(lèi)反轉(zhuǎn)座子和非LTR類(lèi)反轉(zhuǎn)座子[1]。研究結(jié)果表明，LTR類(lèi)反轉(zhuǎn)座子是植物基因組的主要組成部分。在玉米中，LTR類(lèi)反轉(zhuǎn)座子的DNA含量可以達(dá)到75%[2]。根據(jù)序列相似性和轉(zhuǎn)座酶的先后順序，LTR類(lèi)反轉(zhuǎn)座子又可
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2020年4期2020-09-10
- 日本：科學(xué)家研究表觀遺傳對(duì)整個(gè)基因組的影響
”，抑制被稱(chēng)為轉(zhuǎn)座子的破壞性“跳躍基因”的活動(dòng)，否則它們會(huì)在基因組中跳躍并威脅其完整性?？茖W(xué)家們?nèi)栽谂忾_(kāi)細(xì)胞用來(lái)精確控制基因活動(dòng)的許多通路。現(xiàn)在，來(lái)自沖繩科學(xué)技術(shù)大學(xué)院大學(xué)（OIST）的研究人員通過(guò)觀察植物細(xì)胞如何抑制轉(zhuǎn)錄，發(fā)現(xiàn)了解開(kāi)這個(gè)謎團(tuán)的線索。他們最近發(fā)表在《自然通訊》（Nature Communications）上的發(fā)現(xiàn)，精確地指出了以前未知的DNA片段，這些片段因表觀遺傳調(diào)控而沉默，其中許多基因源自轉(zhuǎn)座子。這項(xiàng)研究提供了一個(gè)關(guān)于細(xì)胞如何以及在
國(guó)際種業(yè)前沿動(dòng)態(tài) 2020年14期2020-08-12
- 玉米花粉的高表達(dá)基因與鄰近轉(zhuǎn)座子協(xié)同調(diào)控花粉發(fā)育和受精（2020.4.5 萊肯生物）
育過(guò)程中存在著轉(zhuǎn)座子的動(dòng)態(tài)表達(dá)，不同轉(zhuǎn)座子會(huì)產(chǎn)生不同小RNA，調(diào)控不同的基因表達(dá)。在轉(zhuǎn)座子豐富的玉米中，轉(zhuǎn)座子在花粉發(fā)育過(guò)程中的表達(dá)動(dòng)態(tài)有待研究。美國(guó)俄勒岡州立大學(xué)John E.Fowler團(tuán)隊(duì)利用RNA-seq技術(shù)測(cè)量了玉米雄穗原基、小孢子、成熟花粉和精子細(xì)胞四個(gè)雄性生殖階段的基因轉(zhuǎn)錄譜。研究人員發(fā)現(xiàn)，與擬南芥花粉中轉(zhuǎn)座表達(dá)不同，玉米早在小孢子期就存在轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象，成熟花粉和精子細(xì)胞均存在高表達(dá)基因和鄰近轉(zhuǎn)座子間的協(xié)調(diào)表達(dá)。研究者測(cè)量了50多個(gè)在花粉營(yíng)
三農(nóng)資訊半月報(bào) 2020年7期2020-04-28
- Mutator超家族轉(zhuǎn)座子研究進(jìn)展
2綜 述超家族轉(zhuǎn)座子研究進(jìn)展從春生1，李玉斌1,21. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所，北京 100081 2. 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院，青島 266109轉(zhuǎn)座子是一類(lèi)可以在基因組中不同遺傳位點(diǎn)間移動(dòng)的DNA序列，在其轉(zhuǎn)移過(guò)程中有時(shí)會(huì)伴隨自身拷貝數(shù)的增加。作為基因組的重要組成部分，轉(zhuǎn)座子可以通過(guò)多種方式影響宿主基因及基因組的結(jié)構(gòu)與功能，進(jìn)而在宿主的演化過(guò)程中扮演重要角色。目前依據(jù)轉(zhuǎn)座過(guò)程中間體類(lèi)型的不同可以將其分為I類(lèi)轉(zhuǎn)座子和II類(lèi)轉(zhuǎn)座子。超家族轉(zhuǎn)座子是20世紀(jì)
遺傳 2020年2期2020-04-13
- 淅川烏骨雞全基因組轉(zhuǎn)座子的鑒定與分析
烏骨雞全基因組轉(zhuǎn)座子的鑒定與分析李東華，付亞偉，張晨曦，曹艷芳，李文婷，李轉(zhuǎn)見(jiàn)，康相濤，孫桂榮（河南農(nóng)業(yè)大學(xué)牧醫(yī)工程學(xué)院，鄭州 450046）【】通過(guò)分析淅川烏骨雞全基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)，獲取淅川烏骨雞轉(zhuǎn)座子的基本信息和特征分布，探究轉(zhuǎn)座子相關(guān)基因參與的通路。不僅對(duì)研究淅川烏骨雞轉(zhuǎn)座子的生物學(xué)功能具有重要的意義，而且為探索基因組擴(kuò)增、基因組功能及進(jìn)化研究提供重要基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。對(duì)淅川烏骨雞血液DNA進(jìn)行全基因組重測(cè)序，采用雙末端短序列比對(duì)基因組，運(yùn)用RepeatMo
中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年7期2020-04-11
- 轉(zhuǎn)座子引起的豬ktn1基因結(jié)構(gòu)變異及其與生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)分析
獸醫(yī)生物技術(shù)·轉(zhuǎn)座子引起的豬基因結(jié)構(gòu)變異及其與生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)分析陳才，陳偉，鄭堯，顧浩，王偉，王宵燕，高波，宋成義揚(yáng)州大學(xué) 動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，江蘇 揚(yáng)州 225009為探明轉(zhuǎn)座子對(duì)豬的基因及其側(cè)翼區(qū)結(jié)構(gòu)變異的貢獻(xiàn)，從全基因組測(cè)序(WGS) 數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取 14個(gè)豬基因組中的基因序列和側(cè)翼序列，通過(guò)ClustalX多序列比對(duì)和RepeatMasker轉(zhuǎn)座子注釋?zhuān)娼馕?span id="j5i0abt0b" class="hl">轉(zhuǎn)座子對(duì)的影響。通過(guò)PCR檢測(cè)到一個(gè)SINEA1轉(zhuǎn)座子插入多態(tài)，在蘇姜豬群體中與相關(guān)性狀進(jìn)
生物工程學(xué)報(bào) 2020年2期2020-03-11
- piRNAs在果蠅中使轉(zhuǎn)座子沉默
陳語(yǔ)摘 要：轉(zhuǎn)座子（TEs）是可以在基因組內(nèi)移動(dòng)的DNA序列。TEs可以通過(guò)多種機(jī)制大幅度地塑造基因組，轉(zhuǎn)錄本和宿主生物的蛋白組。但是，TEs通常干擾基因并且是宿主基因組不穩(wěn)定，這樣本質(zhì)上降低了宿主生物的適合度。理解TEs的基因組的干擾和進(jìn)化的動(dòng)態(tài)將大大地加深我們對(duì)TE介導(dǎo)的生物過(guò)程的理解。大部分TE插入在黑腹果蠅中是高度多態(tài)的，提供給我們一個(gè)很好的系統(tǒng)在群體水平來(lái)研究TEs的進(jìn)化。數(shù)十年的理論和實(shí)踐的研究已經(jīng)很好的建立起“轉(zhuǎn)座-選擇”群體基因模型，此模型
科學(xué)與財(cái)富 2019年15期2019-10-21
- 水稻轉(zhuǎn)座子受馴化選擇和在抗病抗逆中的調(diào)節(jié)功能
果——發(fā)現(xiàn)水稻轉(zhuǎn)座子受馴化選擇和在抗病抗逆中的調(diào)節(jié)功能。該項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)自然條件下一個(gè)活躍的反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子HUO（“活”），該轉(zhuǎn)座子廣泛存在于野生稻基因組中，部分存在于考古水稻樣本和農(nóng)家種，但在現(xiàn)代栽培稻中丟失。研究揭示HUO通過(guò)表觀遺傳學(xué)途徑影響基因組水平的功能基因，激活基因組的不穩(wěn)定性/防衛(wèi)反應(yīng)，這些都有利于野生稻適應(yīng)復(fù)雜多變的自然環(huán)境。但由于HUO的存在不利于對(duì)栽培稻高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)的需求，該轉(zhuǎn)座子在水稻馴化和育種過(guò)程中被逐步選擇性刪除。該研究首次提出轉(zhuǎn)座子元件也
糧食科技與經(jīng)濟(jì) 2019年7期2019-10-20
- 毛竹 Phyllostachys edulis retrotransposon 7（PHRE7）轉(zhuǎn)座子的克隆與鑒定
分重要的地位。轉(zhuǎn)座子是真核生物中一類(lèi)重要的轉(zhuǎn)座元件，在毛竹基因組中有廣泛分布。轉(zhuǎn)座子又可稱(chēng)跳躍因子，其實(shí)質(zhì)是基因組染色體上能自主復(fù)制和位移的一段脫氧核糖核酸（DNA）序列，可以直接從基因組內(nèi)的一個(gè)位點(diǎn)移到另一個(gè)位點(diǎn)［1］，其轉(zhuǎn)座的發(fā)生會(huì)導(dǎo)致自身堿基位置的改變和（或）拷貝數(shù)的增加。轉(zhuǎn)座子根據(jù)轉(zhuǎn)座方式不同可分為DNA轉(zhuǎn)座子（DNA transposon）和核糖核酸（RNA）反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（retrotransposon）。DNA轉(zhuǎn)座子是以DNA為中間媒介，通過(guò)
浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào) 2019年5期2019-09-25
- 禾谷鐮刀菌全基因組候選效應(yīng)因子預(yù)測(cè)與分析
菌全基因組內(nèi)的轉(zhuǎn)座子進(jìn)行分析，但未發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)座子存在，值得進(jìn)一步分析研究。本研究采用生物信息學(xué)分析方法預(yù)測(cè)出了禾谷鐮刀菌的候選效應(yīng)分子并查找其基因組內(nèi)轉(zhuǎn)座子情況，可為進(jìn)一步研究這些效應(yīng)分子的功能，了解禾谷鐮刀菌進(jìn)化奠定基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：禾谷鐮刀菌;全基因組;候選效應(yīng)因子;轉(zhuǎn)座子;生物信息學(xué);致病機(jī)制;進(jìn)化歷程禾谷鐮刀菌（Fusarium graminearum）屬半知菌類(lèi)叢梗孢目瘤座孢科鐮刀屬菌。在糧食上普遍存在，它與其他幾種鐮刀菌都能引起小麥、大麥、玉米等作物發(fā)
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年6期2019-09-25
- 棉鈴蟲(chóng)膨脹線粒體基因組的鑒定與分析
RNA解旋酶;轉(zhuǎn)座子中圖分類(lèi)號(hào)：S 435.622文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：ADOI：10.16688/j.zwbh.2018223線粒體是真核細(xì)胞中一種最基本的細(xì)胞器，一般認(rèn)為其起源于細(xì)菌在真核細(xì)胞中的內(nèi)共生作用[1]，且保留了一套獨(dú)立于細(xì)胞核基因組之外的遺傳系統(tǒng)，能夠進(jìn)行自我復(fù)制和表達(dá)。在植物和動(dòng)物中，盡管線粒體承擔(dān)的生物學(xué)功能相似，但其基因組卻向兩個(gè)極端對(duì)立的方向演化：植物線粒體基因組復(fù)雜、龐大，變異程度較大，富含大量非編碼序列和內(nèi)含子;而動(dòng)物的線粒體基因組較為保
植物保護(hù) 2019年1期2019-06-11
- 一個(gè)毛竹LTR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子結(jié)構(gòu)鑒定及表達(dá)模式分析
311300轉(zhuǎn)座子廣泛存在于真核生物基因組中，是基因組的主要組成成分。轉(zhuǎn)座子主要包括DNA轉(zhuǎn)座子和RNA轉(zhuǎn)座子，RNA轉(zhuǎn)座子又稱(chēng)為反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。長(zhǎng)末端重復(fù)序列 (Long terminal repeat，LTR) 轉(zhuǎn)座子屬于反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的一個(gè)大類(lèi)，包含有Ty1-Copia、Ty3-Gypsy、Bel/Pao、Retroviridae、Caulimoviridae、LARD (Large retrotransposons derivatives) 和TRI
生物工程學(xué)報(bào) 2019年3期2019-03-27
- 釀酒酵母中PiggyBac 轉(zhuǎn)座子篩選系統(tǒng)的構(gòu)建
酵母中使用基于轉(zhuǎn)座子的酵母突變基因組文庫(kù)進(jìn)行基因篩選[6]。在這個(gè)系統(tǒng)中，轉(zhuǎn)座子在大腸桿菌中通過(guò)轉(zhuǎn)座酶被插入含有酵母基因組的質(zhì)粒文庫(kù)中。隨后將突變的質(zhì)粒文庫(kù)轉(zhuǎn)入酵母并替換染色體上的等位基因，由此引起突變[7]。盡管這一方法適用于在酵母體內(nèi)進(jìn)行遺傳篩選，但仍然存在一些問(wèn)題，比如整合效率低，篩選覆蓋范圍有限以及突變文庫(kù)的保存比較困難。相比之下在酵母細(xì)胞內(nèi)使用轉(zhuǎn)座子進(jìn)行突變比轉(zhuǎn)座子文庫(kù)更高效。酵母本身有一種內(nèi)源性的反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子Ty1 可以高效地進(jìn)行轉(zhuǎn)座，使用這種
食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào) 2019年10期2019-02-06
- 基于植物轉(zhuǎn)座子的分子標(biāo)記研究進(jìn)展
07)1 植物轉(zhuǎn)座子植物轉(zhuǎn)座子是廣泛分布于植物基因組中的一類(lèi)能從染色體的一個(gè)位置跳躍到另一個(gè)位置或者另一條染色體的DNA序列。根據(jù)轉(zhuǎn)座機(jī)制的不同可分為DNA轉(zhuǎn)座子和反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。DNA轉(zhuǎn)座子是一類(lèi)由DNA介導(dǎo)，通過(guò)“剪切-復(fù)制”進(jìn)行轉(zhuǎn)座的可移動(dòng)元件，包括微型反向重復(fù)轉(zhuǎn)座元件(miniature inverted repeat transposable elements，簡(jiǎn)稱(chēng)MITEs)和Helitron，其插入位點(diǎn)多態(tài)性豐富、拷貝數(shù)多。MITEs兩端由末端
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年23期2019-01-09
- 中科院植物研究所在植物適應(yīng)性進(jìn)化方面取得新進(jìn)展
研究人員發(fā)現(xiàn)，轉(zhuǎn)座子在C.rubella里高度富集，其變異促進(jìn)了快速的表型變異，如轉(zhuǎn)座子插入到開(kāi)花時(shí)間相關(guān)基因FLC區(qū)域促進(jìn)開(kāi)花。研究表明，遺傳多樣性很低的物種能夠通過(guò)轉(zhuǎn)座子的大量擴(kuò)增，快速產(chǎn)生遺傳變異，并導(dǎo)致開(kāi)花時(shí)間等關(guān)鍵適應(yīng)性狀的變異，從而提高其適應(yīng)能力；其揭示了“生物入侵的遺傳悖論”一個(gè)可能原因，即轉(zhuǎn)座子的“爆發(fā)”產(chǎn)生的遺傳變異可以使遺傳多樣性很低的物種能夠快速適應(yīng)新生境。相關(guān)研究成果于2019年3月15日發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《PNAS》上。
蔬菜 2019年4期2019-01-04
- 生防解淀粉芽孢桿菌Bs—18 TnYLB—1突變體文庫(kù)的構(gòu)建
擊法構(gòu)建了攜帶轉(zhuǎn)座子TnYLB-1的穿梭質(zhì)粒pMarA轉(zhuǎn)化Bs-18的突變體文庫(kù)。通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)座溫度和轉(zhuǎn)座時(shí)間的篩選，篩選出50℃高溫誘導(dǎo)16 h可獲得最大轉(zhuǎn)座成功率，并對(duì)突變體進(jìn)行了PCR驗(yàn)證。Bs-18突變體文庫(kù)的構(gòu)建為研究其生防功能基因并深入揭示其生防作用機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：突變體文庫(kù)；轉(zhuǎn)座子；生防功能基因中圖分類(lèi)號(hào)：S476.1+Q785文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào)：A文章編號(hào)：1001-4942（2018）04-0012-04Abstract Bacillus a
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年4期2018-06-21
- 四倍體海島棉LTR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的數(shù)量與分布
LTR）反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子是真核生物基因組中普遍存在的一類(lèi)可移動(dòng)的DNA序列，它們以RNA為媒介，通過(guò)“復(fù)制-粘貼”的形式在基因組中不斷自我擴(kuò)增。LTR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的插入和刪除對(duì)基因組的進(jìn)化和物種的環(huán)境適應(yīng)能力都具有重要的意義［1］，此外，LTR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子、基因組重復(fù)和多倍化是導(dǎo)致植物基因組擴(kuò)增和收縮的三個(gè)主要原因［2，3］。LTR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子根據(jù)內(nèi)部編碼基因（gag，pol和int）排列順序的不同，分為Copia和Gypsy兩類(lèi)主要的超家族［4］。LTR末端
生物技術(shù)通報(bào) 2018年5期2018-06-07
- 睡美人轉(zhuǎn)座子在草魚(yú)CIK細(xì)胞中介導(dǎo)的高效基因整合
ty, SB)轉(zhuǎn)座子屬于Tc1/mariner轉(zhuǎn)座子家族, 普遍存在于脊椎動(dòng)物基因組中。但在生物體漫長(zhǎng)進(jìn)化過(guò)程中由于突變累積失去了活性。1997年Ivics等[1]在鮭科魚(yú)類(lèi)基因組中運(yùn)用生物信息學(xué)方法恢復(fù)了轉(zhuǎn)座子的活性。SB轉(zhuǎn)座子能攜帶外源DNA在轉(zhuǎn)座酶的催化作用下, 以“剪切和粘貼”的方式發(fā)生轉(zhuǎn)座, 偏向于隨機(jī)插入基因組中TA序列處[2]。2009年Mates等[3]通過(guò)高通量定點(diǎn)突變得到目前轉(zhuǎn)座活性最高的轉(zhuǎn)座酶SB100X,它能顯著提高SB轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座效
水生生物學(xué)報(bào) 2018年2期2018-03-30
- 植物中活性MITEs轉(zhuǎn)座子研究進(jìn)展
311300轉(zhuǎn)座子 (Transposons) 是染色體中一段可以跳躍的 DNA序列，可以從基因組的一個(gè)位置移動(dòng)到另一個(gè)位置，引起基因組的改變甚至染色體結(jié)構(gòu)的變異等[1]。根據(jù)轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)座機(jī)制不同，可將轉(zhuǎn)座子分為兩大類(lèi)：RNA類(lèi)轉(zhuǎn)座子和 DNA類(lèi)轉(zhuǎn)座子。RNA類(lèi)轉(zhuǎn)座子又稱(chēng)反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子，該類(lèi)轉(zhuǎn)座子先是轉(zhuǎn)錄成 RNA，然后再通過(guò)反轉(zhuǎn)錄成 DNA轉(zhuǎn)座到其他位置，整個(gè)過(guò)程以“DNARNA-DNA”的形式完成轉(zhuǎn)座，所以RNA類(lèi)轉(zhuǎn)座子是以“復(fù)制-粘貼”的方式轉(zhuǎn)座。R
生物工程學(xué)報(bào) 2018年2期2018-03-23
- 9種硬骨魚(yú)類(lèi)轉(zhuǎn)座組注釋
225009轉(zhuǎn)座子是一類(lèi)具有遷移特性的可移動(dòng)遺傳因子，又稱(chēng)轉(zhuǎn)座因子 (Transposable element，TE)，屬于散在重復(fù)序列的一種，也是在染色體上可移位和自主復(fù)制的基本單位，其本質(zhì)是具有不同結(jié)構(gòu)和換位機(jī)制的移動(dòng)基因序列[1]。轉(zhuǎn)座子幾乎存在于所有生物基因組中，依據(jù)轉(zhuǎn)座機(jī)制的不同，可以分為兩大類(lèi)：RNA轉(zhuǎn)座子 (Ⅰ類(lèi)轉(zhuǎn)座子，也稱(chēng)為逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子) 和 DNA 轉(zhuǎn)座子 (Ⅱ類(lèi)轉(zhuǎn)座子)。RNA轉(zhuǎn)座子通過(guò) RNA聚合酶Ⅱ先轉(zhuǎn)錄為mRNA，然后在反轉(zhuǎn)錄酶
生物工程學(xué)報(bào) 2018年1期2018-02-28
- 斑馬魚(yú)轉(zhuǎn)座子時(shí)空表達(dá)特性
225009)轉(zhuǎn)座子是染色體上可移位和自主復(fù)制的基本單位，其本質(zhì)是具有不同結(jié)構(gòu)和換位機(jī)制的移動(dòng)序列[1]。轉(zhuǎn)座子從原位點(diǎn)上單獨(dú)復(fù)制或斷裂下來(lái)，環(huán)化后插入到另一個(gè)位點(diǎn)，就像從基因組的一個(gè)位置“跳躍”到另一個(gè)位置，此基因切割整合的過(guò)程稱(chēng)為轉(zhuǎn)座[2]。轉(zhuǎn)座子依據(jù)轉(zhuǎn)座機(jī)制的不同，可以分為：反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(I類(lèi)轉(zhuǎn)座子)和DNA轉(zhuǎn)座子(II類(lèi)轉(zhuǎn)座子)[3]。反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子通過(guò)自身編碼的逆轉(zhuǎn)錄酶使用“copy-and-paste”機(jī)制實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)座，DNA轉(zhuǎn)座子則通過(guò)自身編碼的轉(zhuǎn)
生物信息學(xué) 2017年4期2018-01-17
- 一個(gè)可區(qū)分銀鯽F系和A+系BAC序列的特征、染色體定位和SCAR標(biāo)記篩選
bp, 富含轉(zhuǎn)座子序列, 包含1個(gè)具備完整結(jié)構(gòu)的Tc1-like轉(zhuǎn)座子, 以及不具備完整結(jié)構(gòu)的transposase-like、PIF/Harbinger、target-primed reversed transcription(TPRT) 和transponX-element等6個(gè)轉(zhuǎn)座子。用地高辛標(biāo)記F782-BAC質(zhì)粒得到的DNA探針進(jìn)行了銀鯽F和A+系有絲分裂中期相的染色體熒光原位雜交, 結(jié)果表明不論是在F系還是A+系的有絲分裂中期相中, 3個(gè)陽(yáng)性
水生生物學(xué)報(bào) 2017年6期2017-11-29
- 植物轉(zhuǎn)座子與基因表達(dá)調(diào)控
0007）植物轉(zhuǎn)座子與基因表達(dá)調(diào)控何虎翼 譚冠寧 唐洲萍 楊鑫 李麗淑 何新民（廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所，南寧 530007）植物轉(zhuǎn)座子是植物基因組中可移動(dòng)的DNA重復(fù)序列，在植物基因組進(jìn)化、基因表達(dá)調(diào)控、系統(tǒng)發(fā)育和遺傳多樣性評(píng)價(jià)方面具有重要作用。綜述了植物轉(zhuǎn)座子分類(lèi)、起源和轉(zhuǎn)座機(jī)制以及轉(zhuǎn)座子與宿主基因組間的表觀遺傳互作，闡述了不同轉(zhuǎn)座子對(duì)基因表達(dá)調(diào)控方式，并對(duì)今后研究前景進(jìn)行了展望，旨為全面了解植物轉(zhuǎn)座子的功能提供參考。轉(zhuǎn)座子；轉(zhuǎn)座機(jī)制；基因表達(dá)；調(diào)
生物技術(shù)通報(bào) 2017年4期2017-05-19
- 辣椒Ty3-gypsy逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子逆轉(zhuǎn)錄酶序列的克隆及分析
ypsy逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子逆轉(zhuǎn)錄酶序列的克隆及分析李寧，楊生保，楊濤，王柏柯，唐亞萍，王強(qiáng)，帕提古麗·艾斯木托拉，余慶輝(新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝作物研究所，烏魯木齊 830091)【目的】從辣椒基因組中克隆Ty3-gypsy逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子逆轉(zhuǎn)錄酶序列，分析其家族特性及進(jìn)化關(guān)系?！痉椒ā扛鶕?jù)Ty3-gypsy逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子逆轉(zhuǎn)錄酶保守區(qū)域設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物，通過(guò)PCR擴(kuò)增、回收、克隆、測(cè)序得到的目的基因序列?！窘Y(jié)果】克隆從辣椒基因組14條逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子逆轉(zhuǎn)錄酶序列，序列大小均為3
新疆農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年12期2017-01-09
- piggyBac轉(zhuǎn)座子在畜牧獸醫(yī)科學(xué)中應(yīng)用研究進(jìn)展
iggyBac轉(zhuǎn)座子在畜牧獸醫(yī)科學(xué)中應(yīng)用研究進(jìn)展林麗梅1周世業(yè)2白丁平*（1.福建農(nóng)林大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院福州350002；2.國(guó)家水禽品種資源基因庫(kù)福建石獅362700）piggyBac（PB）轉(zhuǎn)座子已被證明是一種高效的非病毒基因工程操作工具，現(xiàn)廣泛用于基因操作和轉(zhuǎn)基因動(dòng)物研究中。借助PB轉(zhuǎn)座子已獲得轉(zhuǎn)基因小鼠、雞、豬、山羊等動(dòng)物。文中重點(diǎn)就PB轉(zhuǎn)座子在畜牧獸醫(yī)科學(xué)研究中的應(yīng)用進(jìn)行綜述。piggyBac轉(zhuǎn)座子基因工程轉(zhuǎn)基因動(dòng)物PB轉(zhuǎn)座子是一種非病毒轉(zhuǎn)基因載體
福建畜牧獸醫(yī) 2016年4期2016-12-17
- 花葉矢竹轉(zhuǎn)錄組中的轉(zhuǎn)座子表達(dá)分析
矢竹轉(zhuǎn)錄組中的轉(zhuǎn)座子表達(dá)分析安苗苗，劉 靜，酈 元，周明兵（浙江農(nóng)林大學(xué) 亞熱帶森林培育國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地，浙江 臨安 311300）以花葉矢竹Pseudosasa japonica f.akebonosuji 10種不同顏色和不同發(fā)育階段的葉片轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，調(diào)查了花葉矢竹中轉(zhuǎn)座子的種類(lèi)、數(shù)量以及選擇性表達(dá)特性。結(jié)果表明：花葉矢竹轉(zhuǎn)錄組中轉(zhuǎn)座子類(lèi)型豐富、數(shù)量繁多，其中RNA轉(zhuǎn)座子明顯多于DNA轉(zhuǎn)座子，轉(zhuǎn)座子LTR/Copia類(lèi)型數(shù)量最多。綠葉的5個(gè)
浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào) 2016年6期2016-12-12
- 石刁柏Ty1—copia反轉(zhuǎn)座子逆轉(zhuǎn)錄酶序列克隆及異質(zhì)性分析
818的兩個(gè)反轉(zhuǎn)座子逆轉(zhuǎn)錄酶序列進(jìn)行了PCR擴(kuò)增并對(duì)其在基因組中的異質(zhì)性進(jìn)行了分析。結(jié)果表明，s101366和s107518兩個(gè)轉(zhuǎn)座子序列均屬于Ty1-copia反轉(zhuǎn)座子，是Ty1-copia反轉(zhuǎn)座酶的部分保守區(qū)序列，其長(zhǎng)度分別為636和653 bp。對(duì)隨機(jī)獲得的兩個(gè)反轉(zhuǎn)座子測(cè)序表明兩個(gè)反轉(zhuǎn)座子存在一定的異質(zhì)性，其突變主要是由于發(fā)生了堿基置換，其中堿基轉(zhuǎn)換分別占到80.4%和80.0%，T？圮C和G？圮A轉(zhuǎn)換的比例差異不顯著。通過(guò)對(duì)兩個(gè)石刁柏品種 （TD8
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年18期2016-12-08
- PiggyBac轉(zhuǎn)座系統(tǒng)在轉(zhuǎn)mCherry基因斑馬魚(yú)上的應(yīng)用
iggyBac轉(zhuǎn)座子供體質(zhì)粒5'-PTK-3'，將紅色熒光蛋白基因（mCherry）定向插入其中，構(gòu)建得到了基因捕獲載體質(zhì)粒：PTK-mCherry。通過(guò)顯微注射，將PiggyBac 轉(zhuǎn)座子供體質(zhì)粒與PiggyBac轉(zhuǎn)座酶mRNA共注射于斑馬魚(yú)受精卵中，篩選得到了mCherry的表達(dá)在時(shí)間及空間上均不同的轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)，統(tǒng)計(jì)表明mCherry在F0代中有8.2%的表達(dá)率，PiggyBac轉(zhuǎn)座子能夠在斑馬魚(yú)中進(jìn)行有效轉(zhuǎn)座且捕獲到不同基因，有效實(shí)現(xiàn)突變體的篩選。
生物技術(shù)通報(bào) 2016年2期2016-10-13
- 北京地區(qū)草莓灰霉病菌的轉(zhuǎn)座子及其分布頻率
草莓灰霉病菌的轉(zhuǎn)座子及其分布頻率張佳,張曉歌,張璨,張國(guó)珍*(中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)植物病理學(xué)系,農(nóng)業(yè)部植物病理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 北京100193)為了解北京地區(qū)草莓灰霉病菌的轉(zhuǎn)座子類(lèi)型及其分布,本研究用轉(zhuǎn)座子Boty和Flipper的特異性引物對(duì)北京地區(qū)2012-2013年從12個(gè)草莓園采集和分離的60株草莓灰霉病菌進(jìn)行PCR擴(kuò)增。結(jié)果表明,北京地區(qū)草莓灰霉病菌群體中共存在3種轉(zhuǎn)座子類(lèi)型:transposa型、Boty型和Flipper型。其中,以transposa
植物保護(hù) 2016年2期2016-09-14
- 植物活性長(zhǎng)末端重復(fù)序列反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子研究進(jìn)展
重復(fù)序列反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子研究進(jìn)展梁琳琳，周明兵浙江農(nóng)林大學(xué) 亞熱帶森林培育國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地，浙江 臨安311300梁琳琳, 周明兵. 植物活性長(zhǎng)末端重復(fù)序列反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子研究進(jìn)展. 生物工程學(xué)報(bào), 2016, 32(4): 409–429.Liang LL, Zhou MB. Plant active LTR retrotransposons: a review. Chin J Biotech, 2016, 32(4): 409–429.摘要:長(zhǎng)末端重復(fù)序
生物工程學(xué)報(bào) 2016年4期2016-07-04
- 利用AhMITEI轉(zhuǎn)座子分子標(biāo)記鑒定栽培花生雜交F1代種子真?zhèn)?/a>
子；雜種鑒定；轉(zhuǎn)座子；AhMITE1；分子標(biāo)記中圖分類(lèi)號(hào)：S565.203.7 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào)：A 文章編號(hào)：1001-4942（2015）12-0001-05花生常規(guī)育種方法主要包括引種、系統(tǒng)育種、雜交育種和誘變育種等，其中雜交育種是目前最重要、最有效的育種方法。為培育適宜不同地區(qū)種植的優(yōu)良花生品種，需要采用雜交轉(zhuǎn)育的方法使一些種質(zhì)的優(yōu)異性狀更加有效地得以利用。理論上講，通過(guò)現(xiàn)有的人工去雄授粉雜交技術(shù)獲得品種間真雜種F1的概率應(yīng)該很大，但在實(shí)際操作過(guò)程中，由
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年12期2016-02-05
- 昆蟲(chóng)轉(zhuǎn)座子在轉(zhuǎn)基因技術(shù)中的應(yīng)用
0044?昆蟲(chóng)轉(zhuǎn)座子在轉(zhuǎn)基因技術(shù)中的應(yīng)用許軍1,2， 張宏波3， 韓民錦3， 譚安江1， 黃勇平1， 張澤3*1中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所，昆蟲(chóng)發(fā)育與進(jìn)化生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，上海 200032；2中國(guó)科學(xué)院大學(xué)，北京 100049；3重慶大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，重慶 400044摘要:轉(zhuǎn)座子是基因組中一段可移動(dòng)的DNA重復(fù)片段。越來(lái)越多的研究表明，轉(zhuǎn)座子是真核生物基因組的主要組成成分，是基因組和表型進(jìn)化的主要?jiǎng)恿χ唬⑶覍?duì)基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的進(jìn)
生物安全學(xué)報(bào) 2015年2期2015-12-16
- 害蟲(chóng)遺傳防治的研究歷史與現(xiàn)狀
傳定性品系； 轉(zhuǎn)座子History and status of the genetic control of insect pestYing YAN1,2,3, Fang-hao WAN1,4*20世紀(jì)30~40年代，害蟲(chóng)遺傳防治(Genetic pest management,GPM)的設(shè)想被提出，即將不育性引入野生種群從而通過(guò)遺傳手段控制害蟲(chóng)，當(dāng)時(shí)也稱(chēng)作不育昆蟲(chóng)技術(shù)(Sterile insect technique,SIT)。60年代后，SIT被不同國(guó)
生物安全學(xué)報(bào) 2015年2期2015-12-16
- 轉(zhuǎn)座子：一個(gè)可移動(dòng)的防御武器
陳軼翔/編譯轉(zhuǎn)座子：一個(gè)可移動(dòng)的防御武器陳軼翔/編譯轉(zhuǎn)座子構(gòu)成了多達(dá)90%的玉米基因組，并導(dǎo)致玉米粒顏色的差異。這是造成多樣性免疫防御體系的根本原因●在病原體和宿主之間的進(jìn)化軍備競(jìng)賽中，被稱(chēng)為轉(zhuǎn)座子的遺傳因素常常發(fā)揮著細(xì)胞防御的攻擊性武器之功效。研究人員現(xiàn)在意識(shí)到，遺傳物質(zhì)一旦簡(jiǎn)化為整齊的有機(jī)體包，就不僅限于個(gè)體，甚至物種——當(dāng)包內(nèi)的遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)化為穩(wěn)定的感染性病毒微粒后，可以將部分或全部基因?qū)胨拗骰蚪M，即使病毒本身已經(jīng)離開(kāi)，但殘留物依然存在。在較小范圍
世界科學(xué) 2015年5期2015-12-02
- 轉(zhuǎn)座子中關(guān)于轉(zhuǎn)座機(jī)制及相關(guān)技術(shù)的探究
464000）轉(zhuǎn)座子中關(guān)于轉(zhuǎn)座機(jī)制及相關(guān)技術(shù)的探究尹洋（信陽(yáng)師范學(xué)院 生命科學(xué)學(xué)院，河南 信陽(yáng) 464000）轉(zhuǎn)座子是基因組上可自主復(fù)制和移動(dòng)的DNA片段，廣泛存在于生物界.轉(zhuǎn)座子及相關(guān)技術(shù)在后基因組時(shí)代是研究基因組功能的重要手段和強(qiáng)大武器.概述轉(zhuǎn)座子的基本性質(zhì)、類(lèi)型、調(diào)控機(jī)制及相關(guān)技術(shù)手段.轉(zhuǎn)座子；調(diào)控機(jī)制；相關(guān)技術(shù)轉(zhuǎn)座子即跳躍基因，它是存在于染色體DNA上可自主復(fù)制和位移的基本單位，是基因組中可移動(dòng)的一段DNA序列，可以從基因組的一個(gè)位置“跳躍”到另一
- 轉(zhuǎn)座子在植物XY性染色體起源與演化過(guò)程中的作用
龍斗，高武軍?轉(zhuǎn)座子在植物XY性染色體起源與演化過(guò)程中的作用李書(shū)粉，李莎，鄧傳良，盧龍斗，高武軍河南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，新鄉(xiāng) 453007XY性染色體決定系統(tǒng)是決定植物性別的主要方式，但是對(duì)于其起源與演化機(jī)制卻知之甚少。目前認(rèn)為，攜帶控制雌蕊或雄蕊發(fā)育基因的一對(duì)常染色體由于某種未知原因的突變形成早期的neo-Y或neo-X性染色體，隨著演化的進(jìn)行，早期XY性染色體之間的重組逐漸受到抑制，非重組區(qū)域擴(kuò)展最終形成異型的性染色體。研究發(fā)現(xiàn)，重復(fù)序列的累積以及D
遺傳 2015年2期2015-02-12
- 轉(zhuǎn)座酶的人工改造與修飾
311300轉(zhuǎn)座子 (Transposable elements, TEs)是指在基因組上能從同一條染色體的一個(gè)位置轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位置或者從一條染色體轉(zhuǎn)移到另一條染色體上的一段DNA序列，20世紀(jì)40年代美國(guó)遺傳學(xué)家 McClintock[1]首次在玉米中發(fā)現(xiàn)。此后科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了多種類(lèi)型的轉(zhuǎn)座子，它們廣泛存在于細(xì)菌、酵母和高等動(dòng)植物基因組中。轉(zhuǎn)座子依據(jù)轉(zhuǎn)座方式的不同分為DNA轉(zhuǎn)座子和反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子兩類(lèi)。DNA轉(zhuǎn)座子以“剪切-粘貼”的方式轉(zhuǎn)座，其轉(zhuǎn)座只是位置的
生物工程學(xué)報(bào) 2014年10期2014-10-31
- PiggyBac轉(zhuǎn)座子:人類(lèi)基因編碼研究的新工具
研究已經(jīng)證明，轉(zhuǎn)座子是多種生物中極為有價(jià)值的遺傳工具，這種自然的基因轉(zhuǎn)移因子不但可以抑制基因的活性，而且可以在果蠅或簡(jiǎn)單生物中插入或突變基因以了解單個(gè)基因的功能［1］。在低等生物實(shí)驗(yàn)中，轉(zhuǎn)座子十分有效，且已被大規(guī)模地用于轉(zhuǎn)基因和基因誘變分析，在酵母、線蟲(chóng)和果蠅等低等生物類(lèi)模式生物的基因功能研究中起到了重要作用。然而，在過(guò)去由于缺少可在哺乳動(dòng)物中高效作用的轉(zhuǎn)座系統(tǒng)，在哺乳動(dòng)物中的轉(zhuǎn)座子運(yùn)用仍極其有限。1 轉(zhuǎn)座子的作用機(jī)制轉(zhuǎn)座指一段DNA序列從原位上單獨(dú)斷裂或
醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào) 2014年2期2014-03-08
- 利用Tol2 轉(zhuǎn)座子構(gòu)建轉(zhuǎn)基因草金魚(yú)初探
100068）轉(zhuǎn)座子（transposon）是基因組上的一段具有一定長(zhǎng)度的DNA 序列，其在自身編碼的轉(zhuǎn)座酶或逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下，以“剪切/復(fù)制-粘貼”的方式在基因組中進(jìn)行移動(dòng)［1］。自1951 年McClintock［2］首次在玉米中發(fā)現(xiàn)AC/Ds（Activator/Dissociator）轉(zhuǎn)座子以來(lái)，在細(xì)菌及多種真核生物中均發(fā)現(xiàn)有轉(zhuǎn)座子的存在［3-6］。但是長(zhǎng)期以來(lái)，對(duì)脊椎動(dòng)物中轉(zhuǎn)座子的研究和應(yīng)用都還是空白。直到近十幾年才有青鳉Tol1 和Tol2［7
生物技術(shù)通報(bào) 2014年5期2014-01-14
- 轉(zhuǎn)座子PiggyBac在哺乳動(dòng)物中的應(yīng)用
1）轉(zhuǎn)座元件或轉(zhuǎn)座子是指宿主基因組內(nèi)發(fā)生基因座位置的改變的遺傳元件。當(dāng)對(duì)轉(zhuǎn)座子進(jìn)行基因工程改造，使之?dāng)y帶一段外源基因，當(dāng)在轉(zhuǎn)座過(guò)程中插入基因的內(nèi)部或是鄰近位置，會(huì)對(duì)被插入基因造成基因功能的突變或失活，用以研究基因的功能［1］。轉(zhuǎn)座子一般由轉(zhuǎn)座酶和轉(zhuǎn)座酶所識(shí)別一段DNA序列 （轉(zhuǎn)座識(shí)別序列）所組成，轉(zhuǎn)座序列能夠在轉(zhuǎn)座酶的作用下完成轉(zhuǎn)座反應(yīng)。按轉(zhuǎn)座過(guò)程是否經(jīng)過(guò)RNA中間體而分為I型轉(zhuǎn)座子和II型轉(zhuǎn)座子。I型轉(zhuǎn)座子（或稱(chēng)逆轉(zhuǎn)座子），需要先被轉(zhuǎn)錄成RNA，然后在由
中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志 2012年1期2012-02-01
- 豬鏈球菌四環(huán)素耐藥性與Tn916接合型轉(zhuǎn)座子的關(guān)系＊
n916接合型轉(zhuǎn)座子的關(guān)系＊白雪梅,趙愛(ài)蘭,張少敏,王憶婷,孫 暉,葉長(zhǎng)蕓目的 研究我國(guó)分離的血清2型豬鏈球菌四環(huán)素耐藥性與 Tn916接合型轉(zhuǎn)座子的關(guān)系。方法采用微量稀釋法進(jìn)行藥物敏感性檢測(cè),PCR方法檢測(cè)四環(huán)素耐藥基因及Tn916接合型轉(zhuǎn)座子。結(jié)果我們檢測(cè)了56株我國(guó)分離的血清2型豬鏈球菌及12株國(guó)外分離的血清2型豬鏈球菌,56株我國(guó)分離株均對(duì)四環(huán)素耐藥并且攜帶四環(huán)素耐藥基因tet(M),我國(guó)豬鏈球菌攜帶的tet(M)基因位于接合型轉(zhuǎn)座子 Tn916上
中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào) 2010年12期2010-01-24
- 紫糯玉米遺傳與育種探析
玉米色素遺傳與轉(zhuǎn)座子、市場(chǎng)需求與紫糯玉米的遺傳、紫糯玉米育種方法以及花糯玉米形成的原因等內(nèi)容,對(duì)市場(chǎng)開(kāi)拓各色品種寄予瞻望,同時(shí)指出紫糯玉米的育種方法是值得研究的課題。關(guān)鍵詞紫糯玉米;糊粉層;轉(zhuǎn)座子;遺傳與育種中圖分類(lèi)號(hào)S513文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A文章編號(hào) 1007-5739(2009)21-0043-02近年糯玉米市場(chǎng)爭(zhēng)奪日益激烈,市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)的導(dǎo)向已進(jìn)入玉米育種的領(lǐng)域?？上驳氖?一批優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)的白色糯玉米雜交種領(lǐng)先問(wèn)世,贏得消費(fèi)者的贊揚(yáng),育種家也獲得相當(dāng)豐厚的回報(bào)。
現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技 2009年21期2009-07-07